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文檔簡介
1、NCBI序列提交方法NCBI提交序列有兩大類方式,一個是批量提交一個是單個序列提交。下面說的就是單個序列提交方式,這是最新的提交方式,由于NCBI更新很快,也許過段時間又不一樣了,主要是按鈕位置可能會變。首先要注冊一個自己的NCBI賬號:點擊此處注冊然后登陸賬號:在已登陸狀態(tài)下點擊Submit:點擊圖中標記處選擇GengBank:點擊GO:選擇:Banklt:建議認真閱讀填寫要求等:點擊Sign in to use Banklt點擊New Sub,下面是你提交的記錄,即使你提交過程中中斷了,也可以Continue!以下是具體提交過程:一.填寫基本信息二1. 圖中1是作者名字,可以添加作者名,F(xiàn)
2、irst和Last Name,填了就可以,其他可以不填。2. 圖中2是填是否出版,有三個選項:未出版,正在出版,已經(jīng)出版。需要注意的是,如果選則未出版,需要在Title中注明,否則無法提交。3. 可以添加作者,然后Continue即可。三.這是選擇是用生么測序方法后的的序列1. 現(xiàn)在我們用的一次只能測一條序列的都是Sanger測序,下面的454等都代表儀器型號,是我們現(xiàn)在說的高通量測序,簡單的書不同型號靈敏度不同。2. 這是選擇你測序是一個反應還是幾個反應,就是你這條序列是一個測序結果就出來了,還是幾個測序結果拼在一起得到的結果,一代測序一個反應最可信的測序范圍是50-750bp,根據(jù)實際選擇
3、,然后繼續(xù)。四 填寫序列信息:1.選擇什么時候公布你的序列信息,你可以選怎立刻,也可以選擇在以后的某一時間,如果你選擇了時間,那么即使你已經(jīng)上傳序列,有了序列號,在時間未到的時候你也是找不到的。2.選擇你的序列是不是16SrRNA基因是細菌上編碼rRNA相對應的DNA序列,可能有一個專門的庫,所以一般選擇NO3.選擇你的序列類型,1.我選了cDNA ,然后選擇是什么類型:是線性,我們一般的都是線狀的,還是環(huán)狀一般想線粒體,葉綠體或者各種質(zhì)粒都是現(xiàn)狀的。4.然后填寫你上傳了多少個序列,黏貼序列,注意序列一定要是FASTA格式。你也可以選擇上傳文檔,這個自己學。然后繼續(xù)兩次繼續(xù)。五填寫你上傳序列所
4、屬物種。然后即使繼續(xù)。六選擇你要你的序列式原始序列,就是你自己測序的序列,還是為已有序列做注釋。然后繼續(xù)。七序列信息1. 填寫你基因所屬細胞器2. 填寫你對基因的注釋,可以添加選項,根據(jù)自己實際情況添加。3. 最下面可以添加你的PCR引物,然后繼續(xù),會讓你檢查,你檢查后繼續(xù)即可。八信息補充1. 填加序列信息,可以上傳文件,也可以選項填寫,建議用選項。2. 選擇你的信息,可以添加,然后繼續(xù)在上圖中選擇添加選項,會讓你填寫模板是正鏈還是負鏈,如果是部分序列,是哪一端,產(chǎn)物是指你把序列通過BlastP比對后的到的序列號(qualifiers)和相似度(Value),然后Accept。跳轉(zhuǎn)后然后繼續(xù)。九最后會讓你最終檢
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