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1、熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2腎上腺素能受體基因mRNA表達(dá)【摘要】 目的建立熒光實(shí)時(shí)定量PCR法檢測(cè)老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2腎上腺素能受體(AR)基因mRNA表達(dá)。方法隨機(jī)選擇ASA級(jí)老年患者30例,分離外周靜脈血淋巴細(xì)胞,采用熒光實(shí)時(shí)定量PCR法檢測(cè)1和2AR基因mRNA表達(dá),并與半定量PCR檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較。結(jié)果30例患者外周血淋巴細(xì)胞熒光實(shí)時(shí)定量PCR均檢出1和2AR mRNA表達(dá),不同性別組同一基因表達(dá)量無(wú)顯著差異(P>0.05);熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)2AR mRNA表達(dá)量顯著高于1AR mRNA(P<0.001),而半定量PCR隨著
2、循環(huán)次數(shù)增加,1和2ARmRNA表達(dá)差異減小。結(jié)論所建立的熒光實(shí)時(shí)定量PCR成功檢測(cè)老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2AR基因mRNA表達(dá),有較高的靈敏性及特異性;半定量PCR擴(kuò)增平臺(tái)期影響試驗(yàn)結(jié)果判斷。 【關(guān)鍵詞】 熒光實(shí)時(shí)定量PCR 腎上腺素能受體mRNA 淋巴細(xì)胞 老年人Abstract: ObjectiveTo establish a realtime quantatitive polymerase chain reaction (PCR) method for the detection of 1and 2AR mRNA expression in elderly patientsperip
3、heral lymphocytes. MethodsThirty elderly patients with ASA grade2 / 17-were recruited. Their blood was collected and the lymphoctes were isolated. The expressions of 1and 2AR mRNA were detected with fluorescent quantitative realtime PCR and semiquantitive PCR.ResultsThere were expressions of 1 and 2
4、AR mRNA in all the subjects with realtime PCR, and the latter was significally more abundant than the former (P<0.001). Also, there was no difference between different genders (P>0.05). With semiquantive PCR, the ratio of 2AR mRNA/1AR mRNA decreased when the cycles increased (P<
5、0.05).ConclusionSemiquantatitive PCR is not perfect at the platform stage, but fluorescent realtime quantitative PCR is more accurate and sensitive than semiquantitive PCR for the detection of 1 and 2AR mRNA expressions in elderly patientsperipheral lymphocytes.Key words: realtime polymerase chain r
6、eaction (PCR); adrenergic receptor; lymphocyte; elderly patient人外周血淋巴細(xì)胞與心肌細(xì)胞表面AR密度成顯著正相關(guān)1。以淋巴細(xì)胞為模型,間接反應(yīng)各種病理生理狀態(tài)下心肌細(xì)胞AR表達(dá)變化,被多數(shù)研究所證實(shí)。然而,淋巴細(xì)胞AR亞型分布存在較大爭(zhēng)議:早期研究認(rèn)為,淋巴細(xì)胞僅表達(dá)2AR2。最新研究發(fā)現(xiàn),人外周血淋巴細(xì)胞存在1、2和3AR三種亞型,且1和2AR mRNA豐度相近3。既往檢測(cè)淋巴細(xì)胞AR基因表達(dá)多采用半定量PCR,該方法屬終點(diǎn)檢測(cè)法,比較目的基因起始拷貝量準(zhǔn)確度較低。本研究采用熒光實(shí)時(shí)定量PCR,檢測(cè)老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2AR
7、基因mRNA表達(dá),并與半定量PCR結(jié)果比較。1材料與方法1.1試驗(yàn)對(duì)象隨機(jī)選擇擬全麻下行擇期手術(shù)的老年患者30例,其中男、女各15例,年齡6580歲(平均73.2歲),ASA級(jí),既往無(wú)心血管系統(tǒng)及血液系統(tǒng)疾病。1.2主要試劑及儀器人淋巴細(xì)胞分離液(美國(guó)Sigma公司)、 TrizolTMRNA Isolation Reagent(美國(guó)Invitrogen公司),G.oTaq、Reverse Transcription System (美國(guó)Promega公司), SYBR Green (日本Takara公司)。BIORAD iCycler iQ Muhicolor Realtime PCR De
8、tection System(美國(guó)BioRad公司); GeneAmp PCR System 2400(美國(guó)ABI公司);高速冷凍離心機(jī)(德國(guó)Heraeus公司);DNA電泳儀(Hoefer公司);FluorS凝膠成像儀(美國(guó)BioRad公司);紫外分光光度計(jì)UV240(日本)。1.3引物設(shè)計(jì)與合成根據(jù)NCBI Genbank中人類1AR、2AR和actin mRNA全長(zhǎng)序列(登錄號(hào):NM000684、NM000024和NM001101)采用Primer 3軟件(http://cgibin/primer3/primer3wwwcgi)進(jìn)行引物設(shè)計(jì)(表1)。引物由上
9、海生工生物工程有限公司合成。引物合成后用超純水溶解,每條引物濃度均為20 mol,等比例混合后-20 保存?zhèn)溆谩1?1AR、2AR、actin cDNA的引物序列(略)1.4總RNA提取與cDNA合成1.4.1外周血淋巴細(xì)胞分離術(shù)晨8:009:00抽取所選病例靜脈肝素抗凝血5ml,Boyum法分離淋巴細(xì)胞(參照人淋巴細(xì)胞分離液使用說明)。1×PBS液調(diào)整細(xì)胞濃度為(58)×106cell/ml,經(jīng)Gimsa Wright和Trypan blue染色鑒定,淋巴細(xì)胞純度>90%,活力>98%。本過程均于采血后2 h 內(nèi)完成。1.4.2總RNA提取與定
10、量Trizol法提取5×106個(gè)淋巴細(xì)胞總RNA(參照TrizolTMRNA Isolation Reagent使用說明)。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA完整性,可見明亮的28S、18S及較淡5S三條帶,無(wú)DNA污染條帶;紫外分光光度計(jì)測(cè)定RNA濃度及純度,OD260/2801.782.0;所提取RNA-70 儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?.4.3cDNA 的合成采用Oligo(dT)15引物,參照Reverse Transcription System說明書進(jìn)行操作,所得 cDNA-20 儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?.5半定量PCR檢測(cè)目的基因mRNA表達(dá)50 l的反應(yīng)體系組分為:5×green Go Ta
11、q Flexi Buffer 10 l,MgCl2(25 mmol)3 l,dNTP 1 l,上、下游引物(10 mol)各0.5 l,Go Taq DNA聚合酶(5 U/l)0.25 l,cDNA2 l,雙蒸去離子水補(bǔ)足至總體系。1AR、2AR和actin PCR反應(yīng)條件相同:95 預(yù)變性3 min,然后95 30 s,57 40 s, 72 45 s,分別進(jìn)行30、35和40個(gè)循環(huán),最后72 延伸6 min。各取10 l PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定(100 V×30 min),F(xiàn)LUORS凝膠儀成像。圖像經(jīng)Quantity One軟件計(jì)算各區(qū)帶灰度值,公式如下:目的基
12、因mRNA相對(duì)含量=目的基因區(qū)帶灰度值內(nèi)參基因區(qū)帶砂度值·100%。半定量PCR重復(fù)2次。1.6熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)目的基因mRNA表達(dá)1.6.11、2AR和actin的熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備:采用TakaRa公司的SYBRR Premix ExTaqTM熒光定量PCR試劑盒,取一提取的cDNA樣品,分別作cDNA樣品原液的1/8、1/4、1/2、1和1.5倍五個(gè)cDNA含量的1、2AR和actincDNA的PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線,以判斷熒光定量PCR的擴(kuò)增效率。在12.5 l 反應(yīng)體系中,其中前三個(gè)倍比稀釋濃度的cDNA樣品和原液各加入1 l,1.5倍含量的則加入原液1.5 l,加
13、入SYBR熒光定量PCR混合試劑6.25 l 及上、下游引物混合液0.25 l,最后各加滅菌超純水補(bǔ)足至12.5 l。PCR反應(yīng)條件均為:94 預(yù)變性10 s;94 變性45 s,57 退火45 s,72 延伸45 s 的條件下循環(huán)45次,95 保溫1 min 后制作熔點(diǎn)曲線,確定擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性。1.6.2熒光實(shí)時(shí)定量PCR分析分別測(cè)定每個(gè)樣品1、2AR和actin mRNA的Ct值,每個(gè)樣品均作復(fù)孔以減少操作誤差。Ct值表示每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。采用相對(duì)定量方式表示各樣品1、2
14、AR的Ct,Ct= Ct目的基因Ct內(nèi)參基因。再依據(jù)Ct=Ct目的基因Ct參照因子,計(jì)算2-Ct。當(dāng)目的基因與內(nèi)參基因的擴(kuò)增效率接近時(shí),2-Ct表示所檢測(cè)樣品相對(duì)于作為參照因子樣品的目的基因的表達(dá)倍數(shù)。1.7統(tǒng)計(jì)學(xué)方法數(shù)據(jù)采用SPSS11.5統(tǒng)計(jì)軟件分析處理,計(jì)量資料以x±s表示,組間差異比較用ANOVE及t檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2結(jié)果2.11和2AR mRNA表達(dá)半定量PCR結(jié)果瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見圖1。35和40個(gè)PCR循環(huán)組所有樣品均可見一特異性條帶,與預(yù)期擴(kuò)增片斷大小相符,無(wú)引物二聚體及非特異性條帶。30個(gè)PCR循環(huán)組部分樣品未見1ARmRNA擴(kuò)
15、增條帶。FluorS凝膠呈像系統(tǒng)掃描區(qū)帶灰度值,統(tǒng)計(jì)圖見圖2。3個(gè)循環(huán)組1AR mRNA/2AR mRNA比值均數(shù)兩兩比較均有差別(P<0.05),30個(gè)循環(huán)組檢出1和2AR mRNA表達(dá)差異較其他兩組大,隨著PCR循環(huán)次數(shù)增加,表達(dá)差異減小。2.21和2AR mRNA表達(dá)熒光實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果見圖37。actin、1和2AR mRNA標(biāo)準(zhǔn)曲線圖可見相關(guān)系數(shù)及擴(kuò)增效率分別為0.986、91.6%;0.989、112.4%;0.973、98.0%,基本符合熒光實(shí)時(shí)定量PCR試驗(yàn)優(yōu)化指標(biāo)。擴(kuò)增曲線圖可見,2AR擴(kuò)增平臺(tái)期為3040個(gè)循環(huán),而該循環(huán)次數(shù)仍為1AR指數(shù)增長(zhǎng)期。熔點(diǎn)曲線可見
16、三簇波峰, actin、1和2AR Tm值分別為89 、94 和85.5 。統(tǒng)計(jì)分析見表2,所有樣品均檢出1和2AR mRNA表達(dá),不同性別組同一基因表達(dá)量無(wú)顯著差別(P>0.05)。老年人外周血淋巴細(xì)胞2AR mRNA表達(dá)顯著高于1mRNA (Ct=8.10±0.73,18.61±1.69; n=30,P<0.001)。表2老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2AR mRNA表達(dá)(略)3討論熒光實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)即是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)整個(gè)PCR過程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。確定樣品起始模板拷貝數(shù)的方法
17、包括絕對(duì)定量及相對(duì)定量。與絕對(duì)定量不同,相對(duì)定量不關(guān)心每個(gè)樣品中目的基因表達(dá)產(chǎn)物(mRNA)的具體拷貝數(shù),而關(guān)注目的基因在不同的細(xì)胞類型、不同的發(fā)育周期等條件下不同的轉(zhuǎn)錄效率,即基因的差異化表達(dá)。就研究目的而論,該方法比絕對(duì)定量的應(yīng)用范圍更廣泛、更符合研究的目的4。熒光實(shí)時(shí)定量PCR按熒光產(chǎn)生的原理分為染料法(SYBR Green法)及探針法。染料法的優(yōu)點(diǎn):(1)無(wú)需設(shè)計(jì)、合成探針,實(shí)驗(yàn)成本低;(2)使用方便,與常規(guī)PCR的操作幾乎相同。由于SYBR Green和雙鏈DNA是非特異性結(jié)合,反應(yīng)過程中如產(chǎn)生非特異產(chǎn)物、引物二聚體將影響結(jié)果的準(zhǔn)確性。因此,反應(yīng)時(shí)要設(shè)定熔解曲線分析?!叭埸c(diǎn)曲線”基于
18、如下原理:不同的PCR擴(kuò)增片段(dsDNA)具有不同的Tm值,Tm值由擴(kuò)增片斷大小及堿基構(gòu)成共同決定5。本試驗(yàn)中1和2AR擴(kuò)增片段均為209 bp,而Tm值分別為94 和85.5 ,與該理論相符合。本組圖7示熔點(diǎn)曲線均為單一波峰,并且形狀銳利,表明相關(guān)基因擴(kuò)增產(chǎn)物具有特異性。此外,實(shí)時(shí)定量 PCR技術(shù)通過2-Ct 方法分析相對(duì)基因表達(dá)差異6,必須使標(biāo)準(zhǔn)曲線中相關(guān)系數(shù)接近1、擴(kuò)增效率為90%110%7。本試驗(yàn)actin、1和2AR mRNA相關(guān)系數(shù)及擴(kuò)增效率分別為0.986、91.6%;0.989、112.4%; 0.973、98.0%,基本符合熒光實(shí)時(shí)定量PCR試驗(yàn)優(yōu)化指標(biāo)。PCR反應(yīng)過程中產(chǎn)
19、生的DNA拷貝數(shù)最初呈指數(shù)方式增加,隨著反應(yīng)循環(huán)數(shù)的增加,最終經(jīng)線性期進(jìn)入平臺(tái)期。半定量PCR在擴(kuò)增結(jié)束后利用EB等染料染色來判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的多少,屬終點(diǎn)檢測(cè)法,間接判斷目的基因起始拷貝量,準(zhǔn)確度較低。熒光實(shí)時(shí)定量PCR采用參數(shù)Ct值,定量的根本原理是Ct值與樣品中起始模板的拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)成線性反比關(guān)系。由于Ct值是反映實(shí)際PCR反應(yīng)過程中擴(kuò)增即將進(jìn)入指數(shù)期的參數(shù),該參數(shù)幾乎不受試劑消耗等因素的影響,因此利用Ct值可精確判斷起始模板拷貝數(shù)。文獻(xiàn)報(bào)道3,半定量PCR檢測(cè)的外周血淋巴細(xì)胞2和1AR mRNA豐度相近(采用40個(gè)循環(huán))。本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)2和1AR mRNA表達(dá)差異顯著(
20、P<0.001),而半定量PCR檢測(cè)2AR mRNA/1AR mRNA比值大小與循環(huán)次數(shù)成負(fù)相關(guān)。本組圖6可見,3540個(gè)循環(huán)為2AR擴(kuò)增平臺(tái)期,而該循環(huán)范圍仍為1AR指數(shù)增長(zhǎng)期,到達(dá)平臺(tái)期所需的循環(huán)次數(shù)取決于樣品中目的基因的起始拷貝數(shù)。結(jié)果提示,半定量PCR擴(kuò)增平臺(tái)期影響試驗(yàn)判斷,而熒光實(shí)時(shí)定量PCR具有更高的準(zhǔn)確性及靈敏度??傊夏耆送庵苎馨图?xì)胞存在1AR mRNA低豐度表達(dá),不同性別組間無(wú)顯著差異。本試驗(yàn)成功建立熒光實(shí)時(shí)定量PCR法檢測(cè)1和2AR mRNA基因表達(dá),將為后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。第3期熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)老年人外周血淋巴細(xì)胞1和2腎上腺素能受體基因mRNA表達(dá)
21、吳壇光,等【參考文獻(xiàn)】 1Nduna D,Chona B, Azadali M,et al. Characterization of lymphocyte 2adrenoceptor signaling in patients with ventricular volume overload diseaseJ. Clin Exp Pharmacol, 2002,29:181-188.2Brodde OE, Kretsch R, Ikezono K,et al. Human betaadrenoceptors: relation of myocardial and lymphocyte betaadrenoceptor densityJ.Science,1986,231:1584-1585.3Yu XiYong, Lin ShuGuang, Wang Xia
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