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文檔簡介
1、1)分子生物學(xué)從分子水平上研究生命現(xiàn)象物質(zhì)基礎(chǔ)的學(xué)科。 研究細(xì)胞成分的物理、 化學(xué)的性質(zhì)和變化以及這些性質(zhì)和變化與生命現(xiàn)象的關(guān)系,如遺傳信息的傳遞,基因的結(jié)構(gòu)、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、表達(dá)調(diào)控和表達(dá)產(chǎn)物的生理功能,以及細(xì)胞信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)等。2) 移動基因:又稱轉(zhuǎn)座子。 由于它可以從染色體基因組上的一個位置轉(zhuǎn)移到另一個位置, 是指在不同染 色體之間躍遷,因此也稱跳躍基因。3)假基因:有些基因核苷酸序列與相應(yīng)的正常功能基因基本相同, 但卻不能合成出功能蛋白質(zhì), 這些失活的基因稱為假基因。4)重疊基因:所謂重疊基因是指兩個或兩個以上的基因共有一段DNA 序列,或是指一段DNA 序列成為兩個或兩個以上基因的組成
2、部分。5)基因家族:是真核生物基因組中來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的一組基因。6)基因:能夠表達(dá)和產(chǎn)生蛋白質(zhì)和RNA 的 DNA 序列,是決定遺傳性狀的功能單位.7)基因組:細(xì)胞或生物體的一套完整單倍體的遺傳物質(zhì)的總和.8) 端粒:以線性染色體形式存在的真核基因組DNA 末端都有一種特殊的結(jié)構(gòu)叫端粒.該結(jié)構(gòu)是一段 DNA 序列和蛋白質(zhì)形成的一種復(fù)合體,僅在真核細(xì)胞染色體末端存在.9)操縱子:是指數(shù)個功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起 ,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動子和操縱基因 ) 以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號所構(gòu)成的基因表達(dá)單位,所轉(zhuǎn)錄的 RNA 為多順反子 .10) 順式作用元件:是指那些
3、與結(jié)構(gòu)基因表達(dá)調(diào)控相關(guān),能夠被基因調(diào)控蛋白特異性識別和結(jié)合的特異 DNA 序列 .包括啟動子,上游啟動子元件,增強子 ,加尾信號和一些反應(yīng)元件等 .11)反式作用因子: 是指真核細(xì)胞內(nèi)含有的大量可以通過直接或間接結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性的蛋白質(zhì)因子.12)啟動子:是 RNA 聚合酶特異性識別和結(jié)合的 DNA 序列 .13)增強子:位于真核基因中遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點,能明顯增強啟動子轉(zhuǎn)錄效率的特殊DNA 序列 .它可位于被增強的轉(zhuǎn)錄基因的上游或下游,也可相距靶基因較遠(yuǎn).14)轉(zhuǎn)錄因子:直接結(jié)合或間接作用于基因啟動子、形成具有RNA 聚合酶活性的動態(tài)轉(zhuǎn)錄 復(fù)合體的蛋白質(zhì)因子。有通用轉(zhuǎn)錄因子、序
4、列特異性轉(zhuǎn)錄因子、輔助轉(zhuǎn)錄因子等。15)絕緣子:一種順式作用元件。長約數(shù)百個核苷酸對,通常位于啟動子正調(diào)控元件或負(fù)調(diào)控元件之間的一種調(diào)控序列。16)基因表達(dá): 是指生物基因組中結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄,翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定的生物學(xué)功能和生物學(xué)效應(yīng)的全過程.17) 信息分子 : 調(diào)節(jié)細(xì)胞生命活動的化學(xué)物質(zhì). 其中由細(xì)胞分泌的調(diào)節(jié)靶細(xì)胞生命活動的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞間信息分子;而在細(xì)胞內(nèi)傳遞信息調(diào)控信號的化學(xué)物質(zhì)稱為細(xì)胞內(nèi)信息分子.18)受體:是存在于靶細(xì)胞膜上或細(xì)胞內(nèi)能特異識別生物活性分子并與之結(jié)合,進(jìn)而發(fā)生生物學(xué)效應(yīng)的的特殊蛋白質(zhì).19)分子克隆: 在體外對
5、DNA 分子按照即定目的和方案進(jìn)行人工重組,將重組分子導(dǎo)入合適宿主,使其在宿主中擴增和繁殖, 以獲得該 DNA 分子的大量拷貝 .20)朊病毒:又稱蛋白質(zhì)侵染因子(又稱毒阮) 。朊病毒是一類能侵染動物并在宿主細(xì)胞內(nèi)復(fù)制的小分子無免疫性疏水蛋白質(zhì)。21) SD 序列:原核生物基因含有核糖體結(jié)合位點 (ribosome-binding site, RBS) , 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的富含嘌呤的序列可以與核糖體16S rRNA3 -端富含嘧啶的序列互補配對,幫助翻譯的正確起始。22) C 值矛盾:生物體的單倍體基因組所含 DNA 總量稱為 c 值。 每種生物各有其特定的 C 值,不同物種的 c 值之間有很大差別
6、。 C 值矛盾是指真核生物中 DNA 含量的反常現(xiàn)象。主要表現(xiàn)為: ( 1) C 值不隨生物的進(jìn)化程度和復(fù)雜性而增加,如肺魚的C 值為112.2,而人的是 3.2, 與牛相近。 (2) 親緣關(guān)系密切的生物 C 值相差甚大,如豌豆為14,而蠶豆為 2。( 3)高等真核生物具有比用于遺傳高得多的 C 值 ,如人的染色體組DNA 含量在理論上包含300萬個基因,但實際有用途的基因只有4 萬左右23)管家基因:又稱持家基因,是指所有細(xì)胞中均要表達(dá)的一類基因 ,其產(chǎn)物是對維持細(xì)胞基本生命活動 所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因與核糖體蛋白基因等。24)擺動假說:即當(dāng) tRNA 的反密碼子與mRNA
7、 的密碼子配對時前兩對嚴(yán)格遵守堿基互補配對法則,但第三對堿基有一定的自由度可以“擺動” 。25)端粒酶:是基本的核蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶,可將端粒 DNA 加至真核細(xì)胞染色體末端。對于保持染色體穩(wěn)定性和細(xì)胞活性有重要作用, 端粒酶能延長縮短的端粒, 從而增強體外細(xì)胞的增殖能力。 端 粒酶在正常人體組織中的活性被抑制,在腫瘤中被重新激活,端粒酶可能參與惡性轉(zhuǎn)化。26)阻遏蛋白:負(fù)調(diào)控系統(tǒng)中由調(diào)節(jié)基因編碼的調(diào)節(jié)蛋白,它本身或與輔阻遏物(corepressor)一起結(jié)合于操縱基因,阻遏操縱子結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。27)光活化修復(fù):DNA 光解酶可切開嘧啶二聚體的環(huán)丁烷恢復(fù)其DNA 的原初結(jié)構(gòu)。光解酶含有可吸收藍(lán)光為
8、反應(yīng)提供所需能量的色素分子。28) SOS 修復(fù):指細(xì)胞在受到潛在致死性壓力 (如 UV 輻射、胸腺嘧啶饑餓、絲裂霉素C 作用、 DNA 復(fù)制必需基因失活等因素)之后,出現(xiàn)有利于細(xì)胞生存、 以突變?yōu)榇鷥r的代謝預(yù)警反應(yīng)。 誘導(dǎo) DNA聚合酶活性,涉及近 20個sos基因的表達(dá),整個反應(yīng)受到阻遏蛋白 -LexA和激活蛋白-RecA 的調(diào)節(jié)。29) DNA 損傷由輻射或藥物等引起的 DNA 結(jié)構(gòu)的改變。包括 DNA 結(jié)構(gòu)的扭曲和點突變。 DNA 結(jié)構(gòu)的扭曲會造成對復(fù)制、轉(zhuǎn)錄的干擾;而點突變則會擾亂正常的堿基配對,通過DNA 序列的改變而對后代產(chǎn)生損傷效應(yīng)。小的 DNA 損傷通??赏ㄟ^DNA 修復(fù)糾正
9、,而程度廣泛的損傷可引起細(xì)胞程序性死亡。30)氧化損傷在所有需氧細(xì)胞中由于超氧化物、 氫過氧化物及最重要的羥基自由基等活性氧( ROS ) 的存在,會在正常條件下發(fā)生氧化損傷,這些自由基可在許多位點上攻擊DNA ,產(chǎn)生一系列特性變化了的氧化產(chǎn)物。31)烷基化烷化劑是可將烷基 (如甲基) 加入到核酸上各種位點的親電化學(xué)試劑, 但其加入的位點有別于正常甲基化酶的甲基化位點,常見的烷基化試劑有MMS 和 ENU 。32)加合物紫外線照射可使DNA 鏈上相鄰嘧啶形成嘧啶二聚體,結(jié)果不能與其相對應(yīng)的鏈進(jìn)行堿基配對,導(dǎo)致DNA 局部變性,產(chǎn)生破壞復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的大塊損傷。33) DNA 的自發(fā)損傷由 DNA
10、內(nèi)在的化學(xué)活性以及細(xì)胞中存在的正?;钚曰肿铀碌膿p傷稱為自發(fā)性損傷。34)轉(zhuǎn)氨作用:胞嘧啶會自發(fā)地水解脫氨變成尿嘧啶而造成點突變形成損傷。35)脫嘌呤作用:在弱酸性條件下,核酸,尤其是DNA 分子上的嘌呤堿基被脫除的過程。36)脫嘧啶作用:核酸分子上的嘧啶堿基也可能發(fā)生脫除,但頻率很低。37) DNA 修復(fù):對受損傷的 DNA 進(jìn)行糾正結(jié)構(gòu)和功能的過程。38)光活化修復(fù):DNA 光解酶課切開嘧啶二聚體的環(huán)丁烷恢復(fù)其DNA 的原初結(jié)構(gòu)。光解酶含有可吸收藍(lán)光為反映提供所需能量的色素分子。39)烷基轉(zhuǎn)移酶在細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)有一種 O6 甲基鳥嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶,能直接將甲基從DNA 鏈鳥嘌呤 O6 位上的甲
11、基移到蛋白質(zhì)的半胱氨酸殘基上而修復(fù)損傷的 DNA 。這個酶的修復(fù)能力并不很強,但在低劑量烷化劑作用下能誘導(dǎo)出此酶的修復(fù)活性。40)切割修復(fù)是一種普遍存在的修復(fù)機制,有兩種形式,即核苷酸切除修復(fù)(NER )和堿基切除修復(fù)( BER ) 。(一)細(xì)胞內(nèi)有多種特異的核酸內(nèi)切酶,可識別 DNA 的損傷部位,在其附近將DNA 單鏈切開, 再由外切酶將損傷鏈切除, 由聚合酶以完整鏈為模板進(jìn)行修復(fù)合成, 最后有連接酶封口。(二)堿基脫氨形成的尿喀咤、黃喋吟和次黃喋吟可被專一的N-糖甘酶切除,然后用 AP(缺嘌呤或缺嘧啶)核酸內(nèi)切酶打開磷酸二酯鍵,進(jìn)行切除修復(fù)。(三) 切除修復(fù)不需光照,也稱暗修復(fù)。41)錯配
12、修復(fù)在含有錯配堿基的 DNA 分子中,使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。這種修復(fù)方式的過程是:識別出下正確地鏈,切除掉不正確鏈的部分,然后通過DNA 聚合酶和 DNA 連接酶的作用,合成正確配對的雙鏈DNA 。42)細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)的信號SOS 反應(yīng)指細(xì)胞在受到潛在致死性壓力(如 UV 輻射、胸腺嘧啶饑餓、絲裂霉素C 作用、DNA 復(fù)制必需基因失活等因素)之后,出現(xiàn)有利于細(xì)胞生存、 以突變?yōu)榇鷥r的代謝預(yù)警反應(yīng)。43)機制:細(xì)胞內(nèi)原少量表達(dá)的RecA-p (激活蛋白)與 ssDNA結(jié)合激活RecA-p的蛋白酶活性- LexA-p (阻遏蛋白)降解f SOS openfRecA-p高效表達(dá)渡過難關(guān)以后
13、, RecA-p 不表現(xiàn)蛋白酶活性,很快消失, LexA 在細(xì)胞內(nèi)積累并與SOS 盒(SOS 基因上游一段操縱基因)結(jié)合,關(guān)閉SOS 反應(yīng)mRNA 相比,其間含不能編碼為蛋46)斷裂基因: 對可表達(dá)為蛋白質(zhì)的基因,如其初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物與成熟 白質(zhì)的間隔序列,則這個基因稱斷裂基因。47)內(nèi)含子:斷裂基因中, 轉(zhuǎn)錄但通過將兩端的序列 (外顯子) 剪接在一起而被去除的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物所對應(yīng) 的 DNA 片段。48)外顯子:斷裂基因中,在成熟mRNA 產(chǎn)物中存在的任何片段。49)重疊基因:具有獨立性,但使用部分共同序列的基因。50)管家基因:是指所有細(xì)胞中均要表達(dá)的一類基因,其產(chǎn)物是對維持細(xì)胞基本生命活動所必需的
14、。51)奢侈基因:特定類型細(xì)胞中為其執(zhí)行特定功能而表達(dá)的基因?;蛑亟M:DNA 片段在細(xì)胞內(nèi)、細(xì)胞間,甚至在不同物種之間進(jìn)行交換,交換后的片段仍然具有復(fù)制和表達(dá)的功能。52)同源重組發(fā)生在 DNA 同源序列之間、有相同或近似堿基序列的 DNA 分子之間的遺傳交換。同源重組是將外源基因定位導(dǎo)人受體細(xì)胞染色體上的方法, 因為在該座位有與導(dǎo)人基因同源的序列,通過單一或雙交換,新基因片段可替換有缺陷的基因片段,達(dá)到修正缺陷基因的目的。53)位點特異重組位點特異性重組是發(fā)生在兩條DNA 鏈特異位點上的重組,重組的發(fā)生需一段同源序列即特異性位點(又稱附著點)和位點特異性的蛋白因子即重組酶參與催化。54)轉(zhuǎn)
15、座轉(zhuǎn)座的機制依賴 DNA 的交錯剪切和復(fù)制,但不依賴于同源序列。轉(zhuǎn)座涉及轉(zhuǎn)座酶,解離酶和 DNA 聚合酶, 共分為復(fù)制型、 非復(fù)制及保守型三種類型。 轉(zhuǎn)座的過程中會形成共合體。兩個轉(zhuǎn)座因子之間的重組會引起缺失和倒位。55)原核基因轉(zhuǎn)錄過程轉(zhuǎn)錄開始不需要引物,鏈的延長方向也是5' f 3'。每次被轉(zhuǎn)錄的DNA只是一個小區(qū)段,而且是其中的一條鏈。 將用作 RNA 合成的模板的鏈叫做反義鏈;另一條不做模板的鏈叫有義鏈。 對于整個 DNA 雙鏈,每條鏈上有的區(qū)段用作有義鏈,有的區(qū)段用作反義鏈。56)轉(zhuǎn)錄的啟動:轉(zhuǎn)錄是由 RNA 聚合酶全酶結(jié)合于啟動子而被啟動的。57)轉(zhuǎn)錄起始:轉(zhuǎn)錄的起
16、始就是生成由 RNA 聚合酶,模板和轉(zhuǎn)錄5'端首位核苷酸組成的起始復(fù)合物。原核生物 RNA5' 端是嘌呤核苷酸(A 、 G) ,而且保留三磷酸核苷的結(jié)構(gòu),所以其起始復(fù)合物是:pppG-DNA-RNA 聚合酶。58)轉(zhuǎn)錄延長:轉(zhuǎn)錄的延長是以首位核苷酸的 3'-OH 為基礎(chǔ)逐個加人 NTP 即形成磷酸二醋鍵,使RNA逐步從 5'向 3'端生長的過程。在原核生物,因為沒有細(xì)胞膜的分隔,轉(zhuǎn)錄未完成即已開始翻譯,而且在同一 DNA 模板上同時進(jìn)行多個轉(zhuǎn)錄過程。59)轉(zhuǎn)錄終止:轉(zhuǎn)錄的終止在原核生物分為依賴Rho 因子與非依賴Rho 因子兩類。 Rho 因子有 ATP
17、 酶和解螺旋酶兩種活性,因此能結(jié)合轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3'末端區(qū)并使轉(zhuǎn)錄停頓及產(chǎn)物RNA 脫離 DNA模板。 非依賴 Rho 因子的轉(zhuǎn)錄終止, 其 RNA 產(chǎn)物3'-端往往形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),其后又有一串寡聚 U 。莖環(huán)結(jié)構(gòu)可使因子聚合酶變構(gòu)而不再前移,寡聚U 則有利于 RNA 不再依附 DNA 模板鏈而脫出。因此無論哪一種轉(zhuǎn)錄終止都有RNA 聚合酶停頓和RNA 產(chǎn)物脫出這兩個必要過程。60) RNA 聚合酶轉(zhuǎn)錄需要RNA聚合酶。原核生物的 RNA聚合酶由多個亞基組成: “23 3 '稱為核心酶, 轉(zhuǎn)錄延長只需核心酶即可。 a 2 3 3 ' b稱為全酶,轉(zhuǎn)錄起始前需要 b亞基
18、辨認(rèn)起始點,所以 全酶是轉(zhuǎn)錄起始必需的。61)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:是 RNA 聚合酶及其輔助因子與DNA 模板相結(jié)合的區(qū)域。62)10 序列:含有一段共有序列 TATAAT ,其前兩個和最后一個堿基最為保守,對DNA 解旋很重要。63)35 序列:含有一段共有序列TTGACA ,前三個堿基最為保守,能增強與聚合酶b因子相識別和相互作用的識別區(qū)。64) 蛋白激酶 :是指能夠?qū)⒘姿峒瘓F(tuán)從磷酸供體分子轉(zhuǎn)移到底物蛋白的氨基酸受體上的一大類酶 .65)蛋白磷酸酶:是具有催化已經(jīng)磷酸化的蛋白質(zhì)分子發(fā)生去磷酸化反應(yīng)的一類酶分子,與蛋白激酶相對應(yīng)存在,共同構(gòu)成了磷酸化和去磷酸化這一重要的蛋白質(zhì)活性的開關(guān)系統(tǒng).66
19、)基因工程:有目的的通過分子克隆技術(shù),人為的操作改造基因,改變生物遺傳性狀的系列過程 .67)載體:能在連接酶的作用下和外源DN* 段連接并運送DNA 分子進(jìn)入受體細(xì)胞的 DNA分子 .68)轉(zhuǎn)化:指質(zhì)粒 DNA 或以它為載體構(gòu)建的重組 DNA 導(dǎo)入細(xì)菌的過程69)感染:以噬菌體,粘性質(zhì)粒和真核細(xì)胞病毒為載體的重組 DNA 分子 ,在體外經(jīng)過包裝成具有感染能力的病毒或噬菌體顆粒,才能感染適當(dāng)?shù)募?xì)胞,并在細(xì)胞內(nèi)擴增.70)轉(zhuǎn)導(dǎo):指以噬菌體為載體,在細(xì)菌之間轉(zhuǎn)移 DNA 的過程,有時也指在真核細(xì)胞之間通過逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)移和獲得細(xì)胞DNA 的過程 .71)轉(zhuǎn)染:指病毒或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入真核細(xì)
20、胞的過程.72) DNA 變性 :在物理或化學(xué)因素的作用下,導(dǎo)致兩條 DNA 鏈之間的氫鍵斷裂,而核酸分子中的所有共價鍵則不受影響.73) DNA 復(fù)性 :當(dāng)促使變性的因素解除后,兩條DNA 鏈又可以通過堿基互補配對結(jié)合形成DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu).74) 退火 : 指將溫度降至引物的 TM 值左右或以下,引物與DNA 摸板互補區(qū)域結(jié)合形成雜交鏈.75)筑巢PCR:先用一對外側(cè)引物擴增含目的基因的大片段,再用內(nèi)側(cè)引物以大片段為摸板擴增獲取目的基因 .可以提高 PCR 的效率和特異性 .76)原位PCR: 以組織固定處理細(xì)胞內(nèi)的 DNA 或 RNA 作為靶序列 ,進(jìn)行 PCR 反應(yīng)的過程.77)定量P
21、CR: 基因表達(dá)涉及的轉(zhuǎn)錄水平的研究常需要對mRNA 進(jìn)行定量測定,對此采用的PCR 技術(shù)就叫定量PCR.78)基因打靶:是指通過 DNA 定點同源重組,改變基因組中的某一特定基因 ,從而在生物活體內(nèi)研究此基因的功能.79) DNA 芯片:指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA 探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標(biāo)記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息.由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為 DNA 芯片 .80)錯義突變:DNA 分子中堿基對的取代,使得mRNA 的某一密碼子發(fā)生變化,由它所編碼的氨基酸就變成另一種的氨基酸,使得多
22、肽鏈中的氨基酸順序也相應(yīng)的發(fā)生改變的突變.81)無義突變: 由于堿基對的取代,使原來可以翻譯某種氨基酸的密碼子變成了終止密碼子的突變 .82)同義突變:堿基對的取代并不都是引起錯義突變和翻譯終止,有時雖然有堿基被取代,但在蛋白質(zhì)水平上沒有引起變化 ,氨基酸沒有被取代 ,這是因為突變后的密碼子和原來的密碼子 代表同一個氨基酸的突變.83)移碼突變:在編碼序列中 ,單個堿基 ,數(shù)個堿基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可以使突變位點之后的三聯(lián)體密碼閱讀框發(fā)生改變,不能編碼原來的蛋白質(zhì)的突變.84)癌基因:是細(xì)胞內(nèi)控制細(xì)胞生長的基因,具有潛在的誘導(dǎo)細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的特性.當(dāng)癌基因結(jié)構(gòu)或表達(dá)發(fā)生異常時,
23、其產(chǎn)物可使細(xì)胞無限制增殖 ,導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生.包括病毒癌基因和細(xì)胞癌基因 .85)細(xì)胞癌基因:存在于正常的細(xì)胞基因組中,與病毒癌基因有同源序列 ,具有促進(jìn)正常細(xì)胞生長,增殖,分化和發(fā)育等生理功能.在正常細(xì)胞內(nèi)未激活的細(xì)胞癌基因叫原癌基因 ,當(dāng)其受到某些條件激活時,結(jié)構(gòu)和表達(dá)發(fā)生異常,能使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化.86)病毒癌基因:存在于病毒(大多是逆轉(zhuǎn)錄病毒)基因組中能使靶細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化的基因它不編碼病毒結(jié)構(gòu)成分,對病毒無復(fù)制作用,但是當(dāng)受到外界的條件激活時可產(chǎn)生誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生的作用 .87)基因診斷: 以 DNA 或 RNA 為診斷材料,通過檢查基因的存在,結(jié)構(gòu)缺陷或表達(dá)異常,對人體的狀態(tài)和疾病作出診
24、斷的方法和過程.88) RFLP: 即限制性片段長度多態(tài)性,個體之間 DNA 的核苷酸序列存在差異,稱為DNA 多態(tài)性 .若因此而改變了限制性內(nèi)切酶的酶切位點則可導(dǎo)致相應(yīng)的限制性片段的長度和數(shù)量發(fā) 生變化 ,稱為 RFLP.89)基因治療: 一般是指將限定的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入患者特定的靶細(xì)胞,以最終達(dá)到預(yù)防或改變特殊疾病狀態(tài)為目的治療方法.90)反義RNA: 堿基序列正好與有意義的 mRNA 互補的 RNA 稱為反義 RNA. 可以作為一種調(diào)控特定基因表達(dá)的手段.91)核酶:是一種可以催化RNA 切割和 RNA 剪接反應(yīng)的由 RNA 組成的酶,可以作為基因表達(dá)和病毒復(fù)制的抑制劑 .92)三鏈DNA:
25、 當(dāng)某一 DNA 或 RNA 寡核苷酸與DNA 高嘌呤區(qū)可結(jié)合形成三鏈 ,能特異地結(jié)合在 DNA 的大溝中 ,并與富含嘌呤鏈上的堿基形成氫鍵 .93) SSCP:單鏈構(gòu)象多態(tài)性檢測是一種基于DNA構(gòu)象差別來檢測點突變的方法.相同長度的單鏈 DNA, 如果堿基序列不同 ,形成的構(gòu)象就不同 ,這樣就形成了單鏈構(gòu)象多態(tài)性.94) 細(xì)胞全能性:指同一種生物的所有細(xì)胞都含有相同的DNA, 即基因的數(shù)目和種類是一樣的 ,但在不同階段,同一個體的不同組織和器官中基因表達(dá)的種類和數(shù)目是不同的.95) SD 序列 :轉(zhuǎn)錄出的mRNA 要進(jìn)入核糖體上進(jìn)行翻譯,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列與大腸桿菌 16S rRN
26、A3, 末端富含嘧啶的序列互補 ,是核糖體的識別位點 .96)反義核酸技術(shù):是通過合成一種短鏈且與DNA 或 RNA 互補的 ,以 DNA 或 RNA 為目標(biāo)抑制翻譯的反義分子 ,干擾目的基因的轉(zhuǎn)錄,剪接 ,轉(zhuǎn)運 ,翻譯等過程的技術(shù).97) 核酸探針:探針是指能與某種大分子發(fā)生特異性相互作用,并在相互作用之后可以檢測出來的生物大分子.核酸探針是指能識別特異堿基順序的帶有標(biāo)記的一段DNA 或 RNA 分子 .98)周期蛋白: 是一類呈細(xì)胞周期特異性或時相性表達(dá),累積與分解的蛋白質(zhì),它與周期素依賴性激酶共同影響細(xì)胞周期的運行.99) CAP: 是大腸桿菌分解代謝物基因活化蛋白,這種蛋白可將葡萄糖饑
27、餓信號傳遞個許多操縱子 ,使細(xì)菌在缺乏葡萄糖時可以利用其他碳源.1)什么是“ RNA 世界”假說?列舉支持該假說的主要生化及分子生物學(xué)證據(jù)?答:生命進(jìn)化的早期,沒有蛋白質(zhì),某些RNA 可催化 RNA 的復(fù)制,也就是說RNA 是唯一的遺傳物質(zhì),是生命的盡頭。支持該假說的主要生化及分子生物學(xué)證據(jù): RNA 分子比較簡單,只有一條鏈, DNA 分子卻很復(fù)雜,有兩條鏈,按照進(jìn)化規(guī)律,簡單的分子總是最先出現(xiàn)。其次, DNA 分子自我復(fù)制時離不開酶,酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì),在原始地球上,在蛋白質(zhì)沒有產(chǎn)生以前, DNA 分子是無法完成自我復(fù)制的,然而有些RNA 分子本身就有酶的活性,在原始地球條件下,即使沒有蛋白
28、質(zhì), RNA 也可以完成自我復(fù)制。2)簡述錯配修復(fù)過程?答:在含有錯配堿基的 DNA 分子中,使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。修復(fù)的過程是:識別出正確的鏈,切除掉不正確的部分,然后通過DNA 聚合酶和 DNA 連接酶的作用,合成正確配對的雙鏈DNA 。3)什么是信號肽,其主要特點有哪些?答:某種分泌蛋白質(zhì)及細(xì)胞膜蛋白質(zhì)等,以前體物質(zhì)多肽的形式合成,其N 末端含有作為通過膜時之信號的氨基酸序列, 這種氨基酸序列稱信號肽或信號序列 (起始密碼子后, 有一段編碼疏水性氨基酸序列的 RNA 區(qū)域,這個氨基酸序列就被稱為信號序列。 )三個特點: ( 1 )一般帶有10-15 個疏水氨基酸;(2)常常在靠
29、近該序列 N-端疏水氨基酸區(qū)上游帶有1個或數(shù)個帶正電荷的氨基酸;(3)在其C-末端靠近蛋白酶切割位點處常常帶有數(shù)個小分子極性氨基酸,離切割位點最近的那個氨基酸往往帶有很短的側(cè)鏈( Ala 或 Gly ) 。4)原核生物和真核生物核糖體的RNA 結(jié)構(gòu)組成?答:原核生物的核糖體RNA 結(jié)構(gòu): 70S 核糖體由一個50S 大亞基和一個30S 小亞基組成,大亞基包括31 種不同蛋白以及5SRNA 、 23SRNA 、 ,小亞基包含 16SRNA 分子和 21 種不同蛋白。真核生物的核糖體 RNA 結(jié)構(gòu): 80S 核糖體由一個60S 大亞基和一個40S 小亞基組成。40S小亞基包含一個 18SrRNA分
30、子和大約 30種蛋白,而60S大亞基包含 5SrRNA、5.8SrRNA 和 28SrRNA 各一個以及大約 45 種蛋白。5)核糖體的主要功能部位答: 1.A 部位 (acceptor site, A site), 即氨酰 tRNA 結(jié)合部位,也稱為受體部位2 .P部位(peptidal site, P site),即肽酰tRNA結(jié)合部位,也稱為供體部位(donor site)3 . E 部位 (exit site, E site), 即空載 tRNA 在離開核糖體之前與核糖體臨時結(jié)合的部位4 .肽酰轉(zhuǎn)移酶(peptidyl transferase)活性部位,該部位負(fù)責(zé)催化肽鍵的形成5 .m
31、RNA 結(jié)合部位6 . 多肽鏈離開通道 (exit channel)7 .一些可溶性蛋白質(zhì)因子(起始因子、延伸因子和終止因子)的結(jié)合部位6)簡述真核基因在原核生物中表達(dá)要注意的問題?答:若將真核基因在原核細(xì)胞中表達(dá),對該目的基因的基本要求是: “無內(nèi)含子" ,原核細(xì)胞的基因中沒有內(nèi)含子,而真核細(xì)胞的基因中有內(nèi)含子.若將含有內(nèi)含子的真核基因移入原核細(xì)胞,則原核細(xì)胞會把內(nèi)含子也表達(dá)出來,就破壞了原有的基因結(jié)構(gòu).7)維持DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的四種力答:堿基對間的氫鍵堿基的堆積作用: 1 氫鍵的相互作用 2 范德華力電荷偶極作用堿基的分子間內(nèi)能8)細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)的信號答:細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng):當(dāng)
32、細(xì)菌生長過程中,氨基酸全面缺乏時,細(xì)菌將會產(chǎn)生應(yīng)急反應(yīng),停止全部基因的表達(dá)。產(chǎn)生應(yīng)急反應(yīng)的信號是鳥昔四磷酸(ppGpp)和鳥昔五磷酸(pppGpp),是由空載的 tRNA 所引起的 。 空載 tRNA 會激活焦磷酸轉(zhuǎn)移酶, 使 ppGpp 大量合成, ppGpp的出現(xiàn)會關(guān)閉許多基因, PpGpp 與 pppGpp 的作用能夠影響一大批操縱子,所以稱他們是超級調(diào)控子或稱為魔斑。9) DNA 是遺傳物質(zhì)的主要實驗證明答: 證明 DNA 是遺傳物質(zhì)的兩個關(guān)鍵性實驗是肺炎球菌感染小鼠、 T2 噬菌體感染大腸桿菌。10)核小體概念及其對基因表達(dá)的調(diào)控答:核小體核心是染色體結(jié)構(gòu)的基本單位,由組蛋白八聚體即
33、含四種核心組蛋白各兩分子。146bp 的 DNA 一左手方式環(huán)繞八聚體 1.8 圈。核小體的形成及其在染色質(zhì)上的精確定位有以下兩方面的作用:(1) 提供一個框架(scaffold), 使轉(zhuǎn)錄因子之間的信息傳遞更有效;(2) 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的不均一性,即其某些區(qū)域不形成核小體, 從而保證了轉(zhuǎn)錄因子易于接近染色質(zhì)模板。11)啟動子、增強子和絕緣子的概念答: 啟動子 (promoter): 啟動子是位于基因轉(zhuǎn)錄起始點上游的一段特定的 DNA 順序, 是 RNA聚合酶與之相識別、結(jié)合的部位,從而啟動基因的轉(zhuǎn)錄。原核啟動子區(qū):兩個保守序列 -35 序列和 -10 序列。真核啟動子區(qū): TATA 框、 CAA
34、T 框、 GC 框等。增強子 (enhancer): 增強子是指能夠增強基因轉(zhuǎn)錄作用的一段特定的 DNA 順序, 其作用是增強啟動子效應(yīng), 與基因的轉(zhuǎn)錄啟動無關(guān)。 增強子的位置比較靈活, 它可以位于轉(zhuǎn)錄起始點的上游, 也可以位于轉(zhuǎn)錄起始點的下游。 它通過與特異性的蛋白質(zhì)結(jié)合而促進(jìn)基因的轉(zhuǎn)錄。絕緣子:絕緣子(insulator)長約幾百個核甘酸對,是通常位于啟動子同正調(diào)控元件(增強子 )或負(fù)調(diào)控因子(為異染色質(zhì))之間的一種調(diào)控序列。絕緣子本身對基因的表達(dá)既沒有正效應(yīng),也沒有負(fù)效應(yīng),其作用只是不讓其他調(diào)控元件對基因的活化效應(yīng)或失活效應(yīng)發(fā)生作用。絕緣子的作用是有方向性的12) RNA 聚合酶羧基端結(jié)
35、構(gòu)域的作用答:在RNA聚合酶n的竣基端含有一段7氨基酸的序列,這一七肽序列為tyr-ser-pro-thr-ser-pro-ser ,被稱為羧基末端結(jié)構(gòu)域( CTD ) 。 CTD 是轉(zhuǎn)錄延伸過程中特異激活的一個重要靶標(biāo)。TFH H導(dǎo)致RNA聚合酶的CTD磷酸化,這種磷酸化的結(jié)果導(dǎo)致了RNA聚合酶復(fù)合體的形成,并且允許RNA 聚合酶離開啟動子區(qū)域,向前進(jìn)。13)質(zhì)粒DNA 的制備答:含質(zhì)粒細(xì)菌懸于等滲溶液中, EDTA 破壞細(xì)胞外膜,去污劑 SDS 溶解球形體,使質(zhì)粒從細(xì)菌內(nèi)部釋放出來; 通過堿處理(PH 12 NaOH) 使細(xì)菌染色體 DNA 變性, 但閉狀質(zhì)粒 DNA鏈由于處于拓?fù)淅p繞狀態(tài)
36、而不能彼此分開, 當(dāng) pH 恢復(fù)正常時, 質(zhì)粒 DNA 鏈迅速準(zhǔn)確配置,重新形成完全天然的超螺旋分子,而較大的細(xì)菌染色體DNA 則纏繞在細(xì)胞碎片上,經(jīng)過離心可與細(xì)胞碎片、蛋白質(zhì)等大分子物質(zhì)一起被除去,從而得到封閉的環(huán)狀DNA 。14) DNA 復(fù)制基本原理:半保留復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制答:從親代DNA 合成子代 DNA 的過程。根據(jù)沃森-克里克提出的DNA 雙螺旋模型和DNA的復(fù)制機制:親代DNA 的兩條鏈解開,每條鏈作為新鏈的模板,從而形成兩個子代DNA分子,其中每一個子代DNA 分子包含一條親代鏈和一條新合成的鏈。15)切割修復(fù)答:是一種普遍存在的修復(fù)機制,有兩種形式,即核苷酸切除修復(fù)( NE
37、R )和堿基切除修( BER ) 。(一)細(xì)胞內(nèi)有多種特異的核酸內(nèi)切酶,可識別 DNA 的損傷部位,在其附近將DNA 單鏈切開, 再由外切酶將損傷鏈切除, 由聚合酶以完整鏈為模板進(jìn)行修復(fù)合成, 最后有連接酶封口。(二)堿基脫氨形成的尿喀咤、黃喋吟和次黃喋吟可被專一的N-糖甘酶切除,然后用 AP(缺嘌呤或缺嘧啶)核酸內(nèi)切酶打開磷酸二酯鍵,進(jìn)行切除修復(fù)。(三)切除修復(fù)不需光照,也稱暗修復(fù)。16) RNA 自我剪接答:in類內(nèi)含子,帶有這些內(nèi)含子的 RNA本身具有催化活性,能進(jìn)行內(nèi)含子的自我剪接,而無需借助于形成剪接體(主要是原核生物) ,其實就是發(fā)生兩次磷酸二酯鍵的轉(zhuǎn)移( -OH攻擊磷酸二酯鍵使其
38、斷裂) 。17) RNA 可變剪接答: 在高等真核生物中, 在個體發(fā)育或細(xì)胞分化時可以有選擇性地越過某些外顯子或某個剪接點進(jìn)行變?yōu)榧艚?,產(chǎn)生出組織或發(fā)育階段特異性mRNA ,稱為內(nèi)含子的可變剪接。18)亞克隆的概念和實施方法答:分為分子克隆和細(xì)胞克隆細(xì)胞克隆:從原有的克隆中,再篩選出具有某種特性的細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)分子克隆 : 從大片段吃的克隆中選取特定小片段再克隆1,目的DNA 片段和載體的制備2,目的DNA 片段和載體的連接3,連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化4,重組子篩選19)質(zhì)粒DNA 的制備答: 堿裂解分離質(zhì)粒DNA 是基于染色體 DNA 與質(zhì)粒 DNA 的變性與復(fù)性的差異而達(dá)到分離的目的。當(dāng)細(xì)胞在NaOH
39、 和 SDS 溶液中裂解時,蛋白質(zhì)與染色體 DNA 發(fā)生變性,加入醋酸鉀中和液,進(jìn)行離心后,它們隨細(xì)胞碎片沉淀下來,而變性的質(zhì)粒 DNA 又恢復(fù)到原來的構(gòu)型留在上清中,再經(jīng)酚/氯仿抽提乙醇沉淀等步驟獲得質(zhì)粒DNA20)質(zhì)粒載體和噬菌體載體的特點及其應(yīng)用答: 1具有自主復(fù)制能力2攜帶易于篩選的選擇標(biāo)記3含有多種限制酶的單一識別序列,以供外源基因插入4除保留必要序列外,載體盡可能小,便于導(dǎo)入和繁殖5使用安全。質(zhì)粒載體:克隆DNA 片段大小小于10kb ,用于外源基因的克隆和表達(dá),以及各種基因操作和分析入噬菌體:克隆 DNA片段大小小于 23kb,優(yōu)點易于使細(xì)胞感染,提高 DNA導(dǎo)入細(xì)胞 的效率,能
40、裝配成噬菌體顆粒,用于建基因文庫和 cDNA 文庫。1)什么是操縱子調(diào)控模型?其結(jié)構(gòu)組成?其發(fā)現(xiàn)的科學(xué)意義?答:通過調(diào)節(jié)基因編碼的調(diào)節(jié)蛋白或與誘導(dǎo)物、輔阻遏物協(xié)同作用,開啟(增強或啟動)或關(guān)閉(減弱或阻止)操縱基因,對操縱子結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)進(jìn)行正、負(fù)控制。結(jié)構(gòu)組成:操縱子(operon):由啟動子(promoter, P)、結(jié)構(gòu)基因(structural gene)、操縱基因 (operator, O) 和調(diào)節(jié)基因 (regulator gene) 組成。啟動子: 被 RNA pol 識別、 結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列。 一個 operon 通常只有一個啟動子,一般位于第一個結(jié)構(gòu)基因的
41、上游。結(jié)構(gòu)基因: operon 中被調(diào)控的編碼蛋白質(zhì)的基因。一個operon 含有 2 個以上的結(jié)構(gòu)基因,多的可達(dá)十幾個。每個結(jié)構(gòu)基因是一個連續(xù)的開放閱讀框。操縱基因:指能被調(diào)節(jié)蛋白特異性結(jié)合的一段DNA 序列,常與啟動子相鄰或與啟動子序列重疊,當(dāng)調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合其上,會影響其下游基因的轉(zhuǎn)錄。調(diào)節(jié)基因:編碼與操縱基因結(jié)合的調(diào)節(jié)蛋白,分為阻遏蛋白和激活蛋白??茖W(xué)意義:1.開創(chuàng)了從分子水平認(rèn)識基因表達(dá)調(diào)控機制的新領(lǐng)域。2.操縱子模型預(yù)言了mRNA 的存在,直接導(dǎo)致mRNA 的發(fā)現(xiàn)。3.啟動了氨基酸密碼子的研究,建立和完善了分子遺傳學(xué)體系。2)乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)組成及調(diào)控方式?答:結(jié)構(gòu)組成:啟動子(Pla
42、c) ;結(jié)構(gòu)基因:Lac Z、 Lac Y 、 Lac A ;調(diào)節(jié)基因(阻遏蛋白)( Lac I ) ;操縱基因( Lac O )1 、阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒有乳糖存在時, I 基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列 O處,乳糖操縱子處于阻遏狀態(tài), 不能合成分解乳糖的三種酶; 有乳糖存在時,乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu), 不能結(jié)合于操縱序列, 乳糖操縱子被誘導(dǎo)開放合成分解乳糖的三種酶。所以,乳糖操縱子的這種調(diào)控機制為可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。2、CAP的正性調(diào)節(jié):在啟動子上游有CAP (激活蛋白或cAMP受體蛋白)結(jié)合位點,當(dāng)大腸桿菌從以葡萄糖為碳源的環(huán)境轉(zhuǎn)變?yōu)橐匀樘菫樘荚吹沫h(huán)境時(乳糖和葡萄糖同時存在,乳
43、糖操縱子不被激活,處于被抑制的狀態(tài)) , cAMP (環(huán)腺苷酸)濃度升高,與CAP結(jié)合, 使 CAP 發(fā)生變構(gòu), CAP 結(jié)合于乳糖操縱子啟動序列附近的 CAP 結(jié)合位點, 激活 RNA聚合酶活性, 促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄, 調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合于操縱子后促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄, 對乳糖操縱子實行正調(diào)控,加速合成分解乳糖的三種酶。3 、協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):乳糖操縱子中的I 基因編碼的阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控與CAP 的正調(diào)控兩種機制,互相協(xié)調(diào)、互相制約。3)詳述色氨酸的弱化子調(diào)控?答:弱化子:在trpE (第一個結(jié)構(gòu)基因)與操縱基因(Otrp)之間有一段前導(dǎo)序列L (162bp),它能編碼出一個內(nèi)含兩個并連的 trp 的 14
44、肽,由于這兩個trp 的合成速度能控制核糖體在mRNA 上的移動, 使得前導(dǎo)序列的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 mRNA 可形成特殊的結(jié)構(gòu), 類似轉(zhuǎn)錄終止信號,因此編碼該結(jié)構(gòu)區(qū)域的基因被稱為弱化子。弱化子結(jié)構(gòu)特點:一個不依賴于p因子的終止子區(qū)域在一小段富含 GC 的回文結(jié)構(gòu)之后是8 個連續(xù)的 U 殘基,是否形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)決定轉(zhuǎn)錄是否終止TrpR 單獨是不能與操縱基因結(jié)合的,只有與色氨酸結(jié)合后,構(gòu)象發(fā)生改變,成為具有活性的阻遏物與操縱基因結(jié)合,使RNA Pol 不能和啟動子結(jié)合而抑制了轉(zhuǎn)錄。無色氨酸時,核糖體在trp 密碼子處停留,形成2 、 3 莖環(huán),阻止了3、 4 莖環(huán)的形成,轉(zhuǎn)錄繼續(xù)有色氨酸時,核糖體的移動阻止
45、了 2 、 3 莖環(huán)的形成,但3、 4 莖環(huán)形成,終止轉(zhuǎn)錄4) DNA 損傷修復(fù)答: DNA 修復(fù)是細(xì)胞對DNA 受損傷后的一種反應(yīng),這種反應(yīng)可能使DNA 結(jié)構(gòu)恢復(fù)原樣,重新能執(zhí)行它原來的功能;但有時并非能完全消除DNA 的損傷,只是使細(xì)胞能夠耐受這種DNA 的損傷而能繼續(xù)生存。( 1 )回復(fù)修復(fù)這是較簡單的修復(fù)方式,一般都能將DNA 修復(fù)到原樣。1 .光修復(fù): DNA 光解酶可切開嘧啶二聚體的環(huán)丁烷恢復(fù)其DNA 的原初結(jié)構(gòu)。 光解酶含有可吸收藍(lán)光為反應(yīng)提供 所需能量的色素分子。2 .單鏈斷裂的重接3 .堿基的直接插入4 .烷基的轉(zhuǎn)移( 2 ) 切除修復(fù)是修復(fù) DNA 損傷最為普遍的方式, 對
46、多種 DNA 損傷包括堿基脫落形成的無堿基位點、嘧啶二聚體、堿基烷基化、 單鏈斷裂等都能起修復(fù)作用。 普遍存在于各種生物細(xì)胞中,是人體細(xì)胞主要的 DNA 修復(fù)機制。( 3 )錯配修復(fù)在含有錯配堿基的 DNA 分子中,使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。修復(fù)的過程是:識別出正確的鏈,切除掉不正確的部分,然后通過DNA 聚合酶和 DNA 連接酶的作用,合成正確配對的雙鏈DNA 。( 4 ) 重組修復(fù)切除修復(fù)在切除損傷段落后是以原來正確的互補鏈為模板來合成新的段落而做到修復(fù)的。但在某些情況下沒有互補鏈可以直接利用,例如在DNA 復(fù)制進(jìn)行時發(fā)生DNA 損傷,此時DNA 兩條鏈已經(jīng)分開,其修復(fù)可用 DNA
47、重組方式。( 5 ) SOS 修復(fù) 指細(xì)胞在受到潛在致死性壓力 (如 UV 輻射、胸腺嘧啶饑餓、絲裂霉素C作用、 DNA 復(fù)制必需基因失活等因素)之后,出現(xiàn)有利于細(xì)胞生存、以突變?yōu)榇鷥r的代謝預(yù)警反應(yīng)。誘導(dǎo)DNA聚合酶活性,涉及近20個sos基因的表達(dá),整個反應(yīng)受到阻遏蛋白-LexA 和激活蛋白 -RecA 的調(diào)節(jié)。5)三類RNA 聚合酶及其作用的啟動子的特點答:RNA聚合酶I:存在于核仁中,負(fù)責(zé)前 rRNA的合成。結(jié)合的啟動子有核心啟動子、上游控制元件(UCE) 。核心啟動子: 位于 -31 到+6,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的起始。上游控制元件( UCE ) ,從起始上游大約 100bp 處起始,可增加核心元
48、件的轉(zhuǎn)錄起始的效率。轉(zhuǎn)錄開始時上游結(jié)合因子( UBF )與 UCE 結(jié)合,同時接結(jié)合到核心元件上游的不同位點上,是兩位點間的 DNA 形成環(huán)狀結(jié)構(gòu), 然后選擇因子1 (SL1)與UBF-DNA復(fù)合物結(jié)合并使其穩(wěn)定,然后RNApol I結(jié)合進(jìn)來開始轉(zhuǎn)錄。RNA聚合酶H :存在于核質(zhì)中,負(fù)責(zé)前 mRNA的合成。結(jié)合的啟動子有TATA框、上游調(diào)控元件和InR 序列。核心元件: TATA 框 -25 -30 與 Inr 共同決定轉(zhuǎn)錄位點; GC 框;起始子( initiator , Inr):位于-3+5, -1為C, +1為A,可能提供 RNA pol n識別。上游調(diào)控元件:CATT框,OCT框等;
49、遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū):增強子,減弱子,沉默子。TF n D結(jié)合到TATA框上,然后TF n A與TF n D結(jié)合,并增強 TF n D與TATA框的結(jié)合,然后 TF n B結(jié)合到TF n D上, 同時TFH B與RNAPol n結(jié)合,RNA聚合酶結(jié)合后,另三個轉(zhuǎn)錄因子TF n E、J、H迅速結(jié)合到復(fù)合物上,TFIIH同時激活RNA聚合酶的竣基末端結(jié)構(gòu)域(CTD),使其磷酸化,轉(zhuǎn) 錄開始。RNA聚合酶出:存在于核質(zhì)中,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄5SrRNA的前體、前t RNA的合成。結(jié)合的啟動子有內(nèi)部啟動子和上游控制元件。tRNA :稱作 A 框和 B 框的兩個轉(zhuǎn)錄控制區(qū)位于轉(zhuǎn)錄單位內(nèi)的起始點的下游,TFniC與tRNA啟
50、動子中 A框和B框結(jié)合;TFmB與TFmC-DNA 復(fù)合體結(jié)合,并與 TF出 C結(jié)合位點上有的 DNA相互作用,引導(dǎo) RNAPol出的結(jié)合而起始轉(zhuǎn)錄。5SrRNA : 稱作 A 框和 C 框的兩個轉(zhuǎn)錄控制區(qū)位于轉(zhuǎn)錄單位內(nèi)的起始點的下游,TFmA與C框啟動子序列緊密結(jié)合;TFmC與TFmA-DNA復(fù)合體結(jié)合,并與 A框序列相互作用,這一復(fù)合體形成后TFIIIB才能結(jié)合進(jìn)來,引導(dǎo) RNAPol出的結(jié)合而起始轉(zhuǎn)錄 6)基本轉(zhuǎn)錄因子、激活劑、輔激活劑和應(yīng)答元件的概念答:基本轉(zhuǎn)錄因子:又稱通用轉(zhuǎn)錄因子。通過與反式作用因子、 RNA 聚合酶相互作用刺激轉(zhuǎn)錄,這些相互作用促進(jìn)起始復(fù)合物的形成,是轉(zhuǎn)錄開始的基
51、本機制。激活劑:在分子生物學(xué)中,能增加一個或多個基因轉(zhuǎn)錄速率的 DNA 結(jié)合蛋白。輔激活劑:通常與一般轉(zhuǎn)錄因子締合在一起,是真核細(xì)胞激活性轉(zhuǎn)錄因子的輔助因子,能增加序列特異性轉(zhuǎn)錄因子對基因轉(zhuǎn)錄的激活。應(yīng)答元件: 是位于基因上游能被轉(zhuǎn)錄因子識別和結(jié)合, 從而調(diào)控基因?qū)R恍员磉_(dá)的 DNA 序列。7)轉(zhuǎn)錄因子與DNA 結(jié)合相關(guān)的結(jié)構(gòu)域答:反式作用因子含有兩個結(jié)構(gòu)域: DNA 激活結(jié)構(gòu)域和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。反式作用因子通過 DNA 特定順序結(jié)構(gòu),通過后者發(fā)揮轉(zhuǎn)錄活化功能。DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域大體有4 種形式:螺旋-轉(zhuǎn)交-螺旋結(jié)構(gòu)域、鋅指結(jié)構(gòu)域、亮氨酸拉鏈以及螺旋 -環(huán)-螺旋二聚體結(jié)構(gòu)域。螺旋 -轉(zhuǎn)交 -螺
52、旋這樣的結(jié)構(gòu)域存在于原核生物的DNA 結(jié)合蛋白如乳糖阻抑蛋白同源異型框序列編碼的60個氨基酸的結(jié)構(gòu)域中,兩個 a -螺旋由一個特定角度的3 轉(zhuǎn)角分開,其中用于識別的a-螺旋與DNA發(fā)生相互作用。鋅指結(jié)構(gòu)域有兩種,一種是通過二個半胱氨酸和兩個組氨酸殘基與鋅離子結(jié)合形成的C2H2 型,另一種是通過 4 個半胱氨酸殘基與鋅離子相連的 C4 型。 C2H2 型的鋅指與 DNA結(jié)合需要三個或更多的“手指” ,而 C4 型則成對出現(xiàn),以二聚體的形式與DNA 結(jié)合。堿性結(jié)構(gòu)域是與亮氨酸拉鏈以及螺旋-環(huán)-螺旋二聚體結(jié)構(gòu)域相結(jié)合的,堿性結(jié)構(gòu)域一般以二聚體的形式與DNA 結(jié)合。8)染色體重建和異染色質(zhì)的概念答:染
53、色體重建:指發(fā)生在基因活化轉(zhuǎn)錄時核小體能量-依賴型的排列或重排。異染色質(zhì):在細(xì)胞周期中,間期、早期或中、晚期,某些染色體或染色體的某些部分的固縮常較其他的染色質(zhì)早些或晚些, 其染色較深或較淺, 具有這種固縮特性的染色體稱為異染色質(zhì)。具有強嗜堿性,染色深,染色質(zhì)絲包裝折疊緊密,與常染色質(zhì)相比,異染色質(zhì)是轉(zhuǎn)錄不活躍部分,多在晚S 期復(fù)制。異染色質(zhì)分為結(jié)構(gòu)異染色質(zhì)和功能異染色質(zhì)兩種類型:結(jié)構(gòu)異染色質(zhì)是指各類細(xì)胞在整個細(xì)胞周期內(nèi)處于凝集狀態(tài)的染色質(zhì),多定位于著絲粒區(qū)、端粒區(qū),含有大量高度重復(fù)順序的脫氧核糖核酸( DNA ) ,稱為衛(wèi)星DNA 。功能異染色質(zhì)只在一定細(xì)胞類型或在生物一定發(fā)育階段凝集,如雌
54、性哺乳動物含一對X染色體,其中一條始終是常染色質(zhì),但另一條在胚胎發(fā)育的第1618天變?yōu)槟癄顟B(tài)的異染色質(zhì),該條凝集的 X 染色體在間期形成染色深的顆粒,稱為巴氏小體。9)啟動子、增強子和絕緣子的概念答:啟動子:是基因轉(zhuǎn)錄精確和特異性啟動所必需的 DNA 序列。決定轉(zhuǎn)錄的啟動和方向。增強子:是一種能大幅度增強基因轉(zhuǎn)錄效率的順式作用元件。其特點是:具有遠(yuǎn)距離效應(yīng)。無方向性。順式調(diào)節(jié)。無物種和基因的特異 性,具組織的特異性。 有相位性,其作用和 DNA的構(gòu)象有關(guān)。 有的增強子可以對外部信號產(chǎn)生反應(yīng)。絕緣子: 長約幾百個核苷酸對, 是通常位于啟動子和增強子或負(fù)調(diào)控因子之間的一種調(diào)控序列。 絕緣子本身對
55、基因的表達(dá)既沒有正效應(yīng)也沒有負(fù)效應(yīng), 其作用只是不讓其他調(diào)控元 件對基因的活化效應(yīng)或失活效應(yīng)發(fā)生作用10)組蛋白的甲基化和乙酰化、 DNA 的甲基化對基因的調(diào)控答: ( 1 ) 組蛋白的甲基化對基因的調(diào)控組蛋白甲基化與轉(zhuǎn)錄的激活或抑制相關(guān), 依賴于其發(fā)生甲基化的位點及程度的不同而不同。組蛋白賴氨酸的甲基化在異染色質(zhì)的形成、 x 染色體的失活、基因組印跡、 DNA 修補及基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中有重要作用。有研究表明組蛋白 H3的第 4 、 36 、 79 位賴氨酸的甲基化使常染色質(zhì)區(qū)的轉(zhuǎn)錄激活,而第 9、 27 和 H4 的第 20 位 賴氨酸的甲基化則對轉(zhuǎn)錄有抑制作用 。( 2) 組蛋白的乙?;瘜虻恼{(diào)控在真核細(xì)胞中, DNA 與組蛋白是染色質(zhì)的主要成分。 染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與基因活性密切相關(guān), 染色體的乙?;墒购诵◇w的結(jié)構(gòu)改變, 并促進(jìn)轉(zhuǎn)錄相關(guān)因子結(jié)合到染色體DNA 上。由于乙?;瘻p弱了組蛋白與DNA 的結(jié)合,從而使染色質(zhì)構(gòu)象處于開放狀態(tài),有利于DNA 的基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。一般情況下,轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)的核小體組蛋白呈高乙?;?,而不活躍區(qū)
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