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文檔簡介
1、多肽合成技術(shù)精品資料多肽化學(xué)已經(jīng)走過了一百多年的光輝歷程,1902年,Emil Fischer首先開始關(guān)注 多肽合成,由于當(dāng)時(shí)在多肽合成方面的知識(shí)太少,進(jìn)展也相當(dāng)緩慢當(dāng)時(shí)合成采 用了苯甲酰,乙酰保護(hù),脫去相當(dāng)困難,而且容易導(dǎo)致肽鏈斷裂。直到 1932 年,Max Bergmann等人開始使用甲氧染基(Z)來保護(hù)a-氨基,該保護(hù)基可以 在催化氫化或氫澳酸的條件下定量脫除,多肽合成才開始有了一定的發(fā)展。到 了 20世紀(jì)50年代,隨著越來越多的生物活性多肽的發(fā)現(xiàn),大大推動(dòng)了有機(jī)化 學(xué)家們對(duì)多肽合成方法以及保護(hù)基的研究,因此這一階段的研究成果也非常豐 富,人們合成了大量的生物活性多肽,包括催產(chǎn)素(ox
2、ytocin),胰島素等,同 時(shí)在多肽合成方法以及氨基酸保護(hù)基上面也取得了不少成績,這為后來的周相合成方法的出現(xiàn)也提供了實(shí)驗(yàn)和理論基礎(chǔ)。也就是這個(gè)階段,F(xiàn)red Sange發(fā)明了氨基酸序列測(cè)定方法,并為此獲得了 1958年的Nobel化學(xué)獎(jiǎng)。還是他后來發(fā) 明了 DNA序列檢測(cè)方法,并于1980年再次獲得了 Nobel化學(xué)獎(jiǎng),成為到目前 為止唯一獲得兩次Nobel化學(xué)獎(jiǎng)的科學(xué)家。1963年,Merrfield提出了固相多肽 合成方法(SPPS),這個(gè)在多肽化學(xué)上具有里程碑意義的合成方法,一出來, 就由于其合成方便,迅速,現(xiàn)在已經(jīng)成為多肽合成的首選方法,隨后的發(fā)展也 證明了該方法不僅僅是一種合成方
3、法,而且也帶來了有機(jī)合成上的一次革命, 并成為了一支獨(dú)立的學(xué)科,固相有機(jī)合成(SPOS)。當(dāng)然,Merrifield也因此 榮獲了 1984年的Nobel化學(xué)獎(jiǎng)。也正是Merrifield ,他經(jīng)過了反復(fù)的篩選,最 終屏棄了甲氧城基(Z)在固相上的使用,首先將叔丁氧染基(BOC)用于保 護(hù)e氨基并在固相多肽合成上使用,其可以在酸性條件下定量的脫除,反應(yīng)也 非常迅速,在30min就可以反應(yīng)完全。由于叔丁氧族基(BOC)方法中,氨基 酸側(cè)鏈的保護(hù)基團(tuán)大多基于甲基(Bzl),因此也稱為BOC-Bzl策略。同時(shí), Merrifield在20世紀(jì)60年代末發(fā)明了第一臺(tái)全自動(dòng)多肽合成儀,并首次合成生 物蛋
4、白酶,核糖核酸酶(124個(gè)氨基酸)。隨后的多肽化學(xué)研究主要集中在固 相合成樹脂,多肽縮合試劑,氨基酸保護(hù)基的研究。1972, Lou Carpino首先將9-方甲氧染基(FMOC)用于保護(hù)華氨基,其在堿性條件下可以迅速脫除,10min就可以反應(yīng)完全,而且由于其反應(yīng)條件溫和,迅速得到廣泛使用,到了 20世紀(jì)80年代取代了叔丁氧染基(BOC),成為了周相多肽合成中的首選合 成方法。該方法中氨基酸的側(cè)鏈大多基于叔丁基(But),因此,也稱為FMOC-But策略。同時(shí),在多肽合成樹脂,縮合試劑以及氨基酸保護(hù),包括合 成環(huán)肽的氨基酸正交保護(hù)上也取得了豐碩的成果。進(jìn)入21世紀(jì),隨著蛋白質(zhì)組學(xué)的研究深入,對(duì)
5、于多肽化學(xué)的要求不僅僅是合成 方法,而更多的集中在多肽標(biāo)記與修飾方法,以及蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽的 合成以及長肽或蛋白合成。?多肽化學(xué)合成的基本介紹多肽化學(xué)合成方法,包括液相和固相兩種方法。液相合成方法現(xiàn)在主要采用 BOC和Z兩種保護(hù)方法,現(xiàn)在主要應(yīng)用在短肽合成,如阿斯巴甜,力肽,催產(chǎn) 素等,其相對(duì)與固相合成,具有保護(hù)基選擇多,成本低廉,合成規(guī)模容易放大 的許多優(yōu)點(diǎn)。與周相合成比較,液相合成主要缺點(diǎn)是,合成范圍小,一般都集 中在10個(gè)氨基酸以內(nèi)的多肽合成,還有合成中需要對(duì)中間體進(jìn)行提純,時(shí)間 長,工作量大。固相合成方法現(xiàn)在主要采用 FMOC和BOC兩種方法,它具有 合成方便,迅速,容易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)
6、化,而且可以比較容易的合成到30個(gè)氨基酸左右多肽。1.1.氨基酸保護(hù)基20種常見氨基酸,根據(jù)側(cè)鏈可以分為幾類:脂肪族氨基酸( Ala, Gly, Val, Leu, Ile,),芳香族氨基酸(Phe, Tyr, Trp, His),酰胺或竣基側(cè)鏈氨基酸 (Asp, Glu, Asn, Gln),堿性側(cè)鏈氨基酸(Lys, Arg),含硫氨基酸 (Cys, Met),含醇氨基酸(Ser, Thr),亞氨型基酸(Pro)。多肽化學(xué)合成中氨基酸的保護(hù)非常關(guān)鍵,直接決定了合成能夠成功的關(guān)鍵。因?yàn)槌R姷?0中氨基酸中有很多都是帶有活性側(cè)鏈的,需要進(jìn)行保護(hù),一般要求,這些保護(hù)基 在合成過程中穩(wěn)定,無副反應(yīng),
7、合成結(jié)束后可以完全定量的脫除。合成中需要 進(jìn)行保護(hù)的氨基酸包括:Cys, Asp, Glu, His, Lys, Asn, Gln, Arg , Ser, Thr, Trp, Tyr。需要進(jìn)行保護(hù)的基團(tuán):羥基,竣基,琉基,氨基,酰胺基,胴 基,呷咪,咪唾等。其中Trp也可以不保護(hù),因?yàn)檫冗湫再|(zhì)比較穩(wěn)定。當(dāng)然在 特殊的情況下,有些氨基酸也可以不保護(hù),象, Asn, Gln , Thr, Tyr。表1常見3種氨基脫除條件FMOCTFAHBr/TFAH2/Pd-CPiperidine/DMFBocyynnZnyynFmocnyny僅供學(xué)習(xí)與交流,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站刪除 謝謝5圖1常見3種氨基保護(hù)基結(jié)
8、構(gòu)氨基酸側(cè)鏈保護(hù)基團(tuán)非常多,同一個(gè)側(cè)鏈有多種不同的保護(hù)基,可以在不同的 條件下選擇性的脫除,這點(diǎn)在環(huán)肽以及多肽修飾上具有很重要的意義。而且側(cè) 鏈保護(hù)基和選擇的合成方法有密切的關(guān)系,液相和固相不一樣,固相中 BOC和FMOC策略也不一樣,從某種意義上看,多肽化學(xué)就是氨基酸保護(hù)基的靈活運(yùn) 用與搭配。關(guān)于側(cè)鏈保護(hù)基的使用,請(qǐng)參考王德心的固相有機(jī)合成原理及應(yīng)用指南第四章,我們這里主要介紹 Cys, Lys, Asp的幾種保護(hù)基及其脫 除方法。Cys最常見的保護(hù)基有三種,Trt, Acm, Mob,這三個(gè)保護(hù)基可以完 成多對(duì)二硫鍵多肽的合成。Lys最常見的保護(hù)基有:Boc, Fmoc, Trt, Dde
9、, Allyl ,這對(duì)于周相合成環(huán)肽提供了很多正交的保護(hù)策略。Asp最常見的保護(hù)基有:Otbu, OBzl, OMe, OAll , OFm,同樣也提供了多種正交的保護(hù)策略。表2琉基常見保護(hù)基結(jié)構(gòu)脫除條件簡稱TrtAcmMobTFA HCl/HOAc I2/MeOHMeOH, Hg2+HF, TFMSA Hg2+表3氨基常見保護(hù)基-moc脫除條件TFA HOAc HCOOHHCl/HOAc TFA/DCMDdePip/DMF, NaOH/MeOHH2NNH2/DMFPd (Ph3P)4,嗎琳/THF表3竣基常見保護(hù)基精品資料簡稱,構(gòu).脫除條件Otbu3千TFA HOAc HCOOHOBzlA。
10、一器H2/Pd, HF, TFMSAOMe50 -CHNaOH/MeOHOAllIPd (Ph3P)4,嗎咻/THFOFm1名Pip/DMF, DBU/DMF1.2.多肽縮合試劑目前多肽合成中,主要采用竣基活化方法來完成接肽反應(yīng),最早使用的是將氨 基酸活化為酰氯,疊氮,對(duì)稱酸酊以及混合酸酊的方法,但是由于這些條件 下,存在氨基酸消旋,以及反應(yīng)試劑危險(xiǎn)以及制備比較復(fù)雜,逐漸被后來的縮 合試劑取代,按照其結(jié)構(gòu)可以分為兩種:縮合試劑主要有:碳二亞胺型,金翁鹽 型(Uronium)。121 .碳二亞胺型主要包括:DCC, DIC, EDC.HCl等。采用DCC進(jìn)行反應(yīng),由于反應(yīng)中生成的 DCU,在DM
11、F中溶解度很小,產(chǎn)生白色沉淀,所以一般不用在固相合成中, 但是由于其價(jià)格便宜,在液相合成中,可以通過過濾除去,應(yīng)用仍然相當(dāng)廣泛。EDC.HCl因?yàn)槠渌芙庑缘奶攸c(diǎn),在多肽與蛋白的連接中使用比較多,而 且也相當(dāng)成功。但是該類型的縮合試劑的一個(gè)最大的缺點(diǎn),就是如果單獨(dú)使 用,會(huì)有比較多的副反應(yīng),但是研究表明如果在活化過程中添加HOBt, HOAt等試劑,可以將其副反應(yīng)控制在很低的范圍。其反應(yīng)機(jī)理如下:- 4鹵IH O-Acylisoureaor in 匚dsa of OAt:N-Acyiu晌uMesirdd 筌汨白 product not acti帕 tor couplingflcliv? o
12、171;lAr圖2 DIC活化反應(yīng)機(jī)理122 .金翁鹽型金翁鹽型縮合試劑反應(yīng)活性高,速度快,現(xiàn)在使用非常廣泛,主要包括:HBTU, TBTU , HATU , PyBOP等。該試劑使用過程中需要添加有機(jī)堿,如, 二異丙基乙胺(DIEA) , N-甲基嗎咻(NMM ),該試劑加入后,才能活化氨 基酸。其反應(yīng)機(jī)理如下:圖3 TBTU活化反應(yīng)機(jī)理13多肽合成方法比較僅供學(xué)習(xí)與交流,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站刪除謝謝7精品資料1.3.1. 液相多肽合成(solution phase synthesis液相多肽合成現(xiàn)在仍然廣泛的使用,在合成短肽和多肽片段上具有合成規(guī)模 大,合成成本低的顯著優(yōu)點(diǎn),而且由于是在均相
13、中進(jìn)行反應(yīng),可以選擇的反應(yīng) 條件更加豐富,象一些催化氨化,堿性水解等條件,都可以使用,這在固相 中,使用卻由于反應(yīng)效率低,以及副反應(yīng)等原因,無法應(yīng)用。液相多肽合成中 主要采用BOC和Z兩種反應(yīng)策略。00加c=o I1 NaOH/MeOH2 HCIjUOAc圖4液相合成Glu-Trp1.3.2. 周相多肽合成Glu-Trp圖5 FMOC固相合成Glu-Trp周相多肽合成現(xiàn)在使用的主要有兩種策略:BOC和FMOC兩種。BOC萬法合成過程中,需要反復(fù)使用TFA脫BOC,而且在最后從樹脂上切割下來需要使 用HF,由于HF必須使用專門的儀器進(jìn)行操作,而且切割過程中容易產(chǎn)生副反 應(yīng),因此現(xiàn)在使用受到實(shí)驗(yàn)條
14、件限制,使用也逐漸減少。FMOC方法反應(yīng)條件溫和,在一般的實(shí)驗(yàn)條件下就可以進(jìn)行合成,因此,也得到了非常廣泛的應(yīng) 用。1.321. 周相合成中常用樹脂-二乙烯苯材料,大小在 75-150pm,交聯(lián)1%,因?yàn)檫@種交聯(lián)度下,樹脂在 DMF,周相合成中樹脂,一般都是聚苯乙烯 度在1-2%之間,現(xiàn)在使用的大多是DCM中具有很好的溶脹性能,立體上是一個(gè)空間網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),反應(yīng)物分子可以在 樹脂內(nèi)部自由移動(dòng)。樹脂中最關(guān)鍵的部分是連接手臂,它一端連接在樹脂上, 一端作為反應(yīng)位點(diǎn)。目前廣泛使用的樹脂有:PAM, MBHA, Wang, 2-Cl-Trt, Rink-Amide-MBHA 等。其中PAM, MBHA是用
15、在BOC策略中,因?yàn)槠?對(duì)酸非常穩(wěn)定,需要在HF, TFMSA等強(qiáng)酸條件下才能夠切割下來。WfingPAM二 C LT rtRitik-Amidi圖6周相合成常用樹脂1.322. 西三酮檢測(cè)周相多肽合成中,主要是通過檢測(cè)樹脂上游離氨基來判斷連接效率,檢測(cè)方法 稱為Kaiser方法,其檢測(cè)結(jié)果,如果有游離氨基的時(shí)候,顯示蘭色,或紅褐色(pro, ser, His)。Kaiser試劑包括:A, 6%西三酮的乙醇溶液僅供學(xué)習(xí)與交流,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站刪除 謝謝11精品資料B, 80%苯酚的乙醇溶液C, 2% 0.001M KCN的叱噬溶液配制中的叱噬需要經(jīng)過西三酮處理后,重蒸后再使用。檢測(cè)過程,取少
16、量樹脂,加入A, B, C各2-3滴,100c下加熱1-2min,如果溶液有蘭色,或樹脂 出現(xiàn)蘭色,紅褐色,表明還有游離氨基,否則說明連接完全。還有其它檢測(cè)游離氨基的方法:三硝基苯磺酸法,苦味酸法,澳芬蘭法等。圖7西三酮檢測(cè)原理1.323. 周相合成切割方法 周相合成完成之后,必須選擇合適的切割試劑將多肽從樹脂上切割下來,然后 經(jīng)過冰乙醴沉淀,離心收集沉淀,經(jīng)過 HPLC分離純化,冷凍干燥得到最后產(chǎn) 品。由于選擇的樹脂不同,氨基酸序列不同,在切割時(shí)候,選擇的切割方法也 不完全相同,一般都是選擇酸性條件下切割的條件,對(duì)于 PAM, MBHA樹 脂,一月采用HF切割,切割過程中需要添加對(duì)甲苯酚,對(duì)
17、琉基苯酚,苯甲醴 等試劑。而對(duì)于 Wang, Rink-Amide, Trt樹脂,一般采用TFA切割,切割過程 中加入,乙二硫醇,苯甲硫醴,水,三異丙基硅烷,苯酚等。這些添加試劑主 要作為碳正離子俘獲試劑使用,目的是俘獲切割反應(yīng)過程中生成的碳正離子, 減少這些碳正離子對(duì)部分氨基酸側(cè)鏈的進(jìn)攻導(dǎo)致的副反應(yīng),比較容易產(chǎn)生副反應(yīng)的氨基酸有:Trp, Tyr0切割試劑用量一般10-15ml/g樹脂。常用的切割配 比:HF/p-cresol/p-thiocresol (90/5/5) , TFA/TIS/EDT/H2O (94/1/2.5/2.5),反 應(yīng)一般是在室溫條件下2h-4h01.3.3. 多肽合
18、成中主要問題1.3.3.1. 消旋及其反應(yīng)機(jī)理多肽合成過程中,部分氨基酸在活化的過程中會(huì)導(dǎo)致不同程度的消旋,特別容 易消旋的氨基酸有:Cys, His, Phe,當(dāng)然這些消旋化還和溶劑,溫度以及合成 中的有機(jī)堿等因素有關(guān)。對(duì)于這些氨基酸,可以通過采用高效縮合試劑,減少 反應(yīng)時(shí)間,可以減少消旋的比例,一般條件選擇適當(dāng),消旋化都可以控制在5%以內(nèi)。消旋反應(yīng)機(jī)理如下:圖8消旋反應(yīng)機(jī)理1.3.3.2. 二酮哌嗪(DKP)反應(yīng)DKP副反應(yīng)出現(xiàn)在FMOC-Wang樹脂合成過程中,主要出現(xiàn)在第一個(gè)氨基酸為 Pro的時(shí)候,當(dāng)?shù)诙€(gè)氨基酸脫FMOC的時(shí)候,e氨基被游離出來之后,立即 對(duì)Wang樹脂的葦酯鍵進(jìn)行分
19、子內(nèi)胺解,生成六元環(huán)二酮哌嗪衍生物,同時(shí)從 Wang樹脂上釋放出來,導(dǎo)致反應(yīng)終止。該反應(yīng)非常迅速,文獻(xiàn)報(bào)道采用 50%Pip/DMF,脫1min, 4min的條件,但是我們實(shí)驗(yàn)證明在多數(shù)情況下,即使 是1min左右反應(yīng)就超過了 20%。因此一般在末端第一個(gè)氨基酸為 Pro的時(shí)候, 建議采用2-Cl-Trt樹脂合成,由于該樹脂巨大的空間阻力,可以完全消除該副 反應(yīng)。這個(gè)副反應(yīng)在BOC策略合成過程中,卻可以完全避免,因?yàn)?BOC在使 用TFA脫除后,使氨基以TFA鹽的形式存在,從而失去了親核性,不能進(jìn)攻 葦酯鍵。圖9 DKP反應(yīng)機(jī)理1.3.33困難序列多肽合成周相多肽合成中也經(jīng)常遇到多肽合成失敗或
20、合成效率很低的問題,這里面的主 要原因是由于多肽序列引起的,因?yàn)橛行┒嚯男蛄性跇渲闲纬?amp;折疊,改變了樹脂的溶脹性能,還有可能將反應(yīng)的活性位點(diǎn)埋藏在樹脂里面,這樣使得反 應(yīng)很難進(jìn)行,目前報(bào)道使用的主要方法有:?使用混合溶劑,DMSO/DMF , 6N月瓜呢/DMF溶液?提高反應(yīng)溫度,或采用微波方法?使用高離液鹽,LiCl , NaClO4等。?使用溶脹性能更好的PEG-PS樹脂,同時(shí)減少樹脂擔(dān)載量(0.05- 0.2mmol/g)1.4, 合成多肽分析鑒定方法多肽的分析鑒定方法有多肽一級(jí)結(jié)構(gòu),二級(jí)結(jié)構(gòu)鑒定,多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)包括:質(zhì) 譜分析,氨基酸組成分析,氨基酸序列分析。二級(jí)結(jié)構(gòu)包括:圓二
21、色譜(CD) , NMR, X-衍射等方法。1.4.1. 純度分析多肽的純度分析,一般都采用 HPLC進(jìn)行分析,選擇RP-C18,粒徑5小,孔徑 300A, 4.6 X50mm,流動(dòng)相:A, 0.1% TFA/H2O; B, 0.1% TFA/ACN ,洗脫梯 度,5%B-65%B,時(shí)間30min。也有些多肽,特別是短肽,由于親水性強(qiáng),在 C18上保留很弱,需要改變條件,這里主要有兩種方法:一個(gè)改變分析梯度, 可以將起始梯度改為2%,等度或小梯度洗脫;另外一個(gè)方法是在流動(dòng)相中加入 強(qiáng)離子對(duì)試劑,如七氟丁酸,十八烷基磺酸鈉等。1.42. 一級(jí)結(jié)構(gòu)分析1.421. 質(zhì)譜分析質(zhì)譜分析的目的主要是確證
22、分子量,當(dāng)然采用MS/MS可以部分的了解多肽序列的信息,但是這個(gè)需要比較全的數(shù)據(jù)庫作為基礎(chǔ),分析才能比較準(zhǔn)確。由于 多肽性質(zhì)不穩(wěn)定,需要采用軟電離技術(shù),目前多肽分析主要使用了電噴霧(ESI-MS),基質(zhì)輔助激光解吸(MALDI-MS )。其中ESI-MS通常會(huì)給出多 電荷峰,電荷數(shù)目和多肽序列上氨基,胴基,咪唾基的數(shù)目有關(guān),因此,經(jīng)常 給出了雙電荷,三電荷等離子峰。 MALDI-MS可以分析蛋白大分子,而且通常 情況下很少帶多電荷,因此數(shù)據(jù)直接對(duì)應(yīng)了分子離子峰,容易分析。止匕外,通 常在分析長肽或蛋白過程中,需要添加 NH4, Na, K等離子,提高靈敏度,所 以一般在 MS中出現(xiàn)一組峰,分別
23、對(duì)應(yīng):(M+H) +, (M+NH4) +,(M+Na) +, (M+K) +。1.422. 氨基酸組成分析氨基酸組成分析一般需要產(chǎn)品的純度較高,它可以給出多肽中氨基酸的種類, 數(shù)目。分析過程首先通過酸水解破壞肽鍵,典型酸水解的條件是:真空條件 下,110C,用6M鹽酸水解16至72小時(shí)。酸水解雖然很有用,但酸水解條件 下不能獲得完整的氨基酸分析,因?yàn)榇蠖0泛凸劝滨0返膫?cè)鏈含有酰胺鍵, 用于切斷蛋白質(zhì)肽鍵的酸也可以將大冬酰胺轉(zhuǎn)換為大冬氨酸,谷氨酰胺轉(zhuǎn)換為 谷氨酸。由于水解溫度比較高,色氨酸的呷珠環(huán)容易被空氣氧化,即使在密封 的管中,色氨酸的呷珠環(huán)也幾乎都被破壞了。因此蛋白質(zhì)的色氨酸含量往往是
24、 通過它的紫外吸收光譜估計(jì)的,也可以通過堿水解分析色氨酸的含量。半胱氨 酸在酸水解中也不能精確測(cè)定,要精確測(cè)量需要在蛋白質(zhì)水解之前進(jìn)行氧化或 竣甲基化,形成的衍生物在酸水解之后才能定量。1.423. 氨基酸序列分析氨基酸序列分析的基本原理是 Edman降解,主要涉及耦聯(lián)、水解、萃取和轉(zhuǎn)換 等4個(gè)過程。首先使用苯異硫氟酸酯(PITC)在pH9.0的堿性條件下對(duì)蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行處理,PITC與肽鏈的N-端的氨基酸殘基反應(yīng),形成苯氨基硫甲酰 (PTC)衍生物,即PTC-肽。然后PTC-肽用三氟乙酸處理,N-端氨基酸殘基 肽鍵被有選擇地切斷,釋放出該氨基酸殘基的曝晚咻酮苯胺衍生物。接下來將 該衍生物用
25、有機(jī)溶劑(例如氯丁烷)從反應(yīng)液中萃取出來,而去掉了一個(gè)N-端氨基酸殘基的肽仍留在溶液中。萃取出來的嚷晚咻酮苯胺衍生物不穩(wěn)定,經(jīng)酸 作用,再進(jìn)一步環(huán)化,形成一個(gè)穩(wěn)定的苯乙內(nèi)酰硫腑( PTH)衍生物,即PTH- 氨基酸。留在溶液中的減少了一個(gè)氨基酸殘基的肽再重復(fù)進(jìn)行上述反應(yīng)過程, 整個(gè)測(cè)序過程現(xiàn)在都是通過測(cè)序儀自動(dòng)進(jìn)行。1.4.3. 二級(jí)結(jié)構(gòu)分析1.4.3.1. 圓二色譜(CD)圓二色譜是一種特殊的吸收譜,它通過測(cè)量蛋白質(zhì)等生物大分子的圓二色光 譜,從而得到生物大分子的二級(jí)結(jié)構(gòu),簡單、快捷,廣泛應(yīng)用在蛋白質(zhì)折疊, 蛋白質(zhì)構(gòu)象研究,酶動(dòng)力學(xué)等領(lǐng)域。圓二色譜紫外區(qū)段(190-240nm),主要 生色團(tuán)
26、是肽鏈,這一波長范圍的 CD譜包含了生物大分子主鏈構(gòu)象的信息。0- 螺旋構(gòu)象的CD譜在222nm、208nm處呈負(fù)峰,在190nm附近有一正峰。&折 疊構(gòu)象的CD譜,在217-218nm處有一負(fù)峰,在195-198nm處有一強(qiáng)的正峰。 無規(guī)則卷曲構(gòu)象的CD譜在198nm附近有一負(fù)峰,在220nm附近有一小而寬的 正峰。1.4.32 核磁共振(NMR)隨著二維、三維以及四維NMR的應(yīng)用,分子生物學(xué)、計(jì)算機(jī)處理技術(shù)的發(fā) 展,使NMR逐漸成為大分子結(jié)構(gòu)物質(zhì)分析的主要方法之一。NMR可用于確定氨基酸序列、分布以及構(gòu)象。目前,NMR在分析分子中含少于30個(gè)氨基酸的 小肽時(shí)是非常有用的,分析結(jié)果快
27、速準(zhǔn)確。1.4.3.3. X-衍射X-衍射可獲得有關(guān)化合物品型的直接信息,而且可以判斷相對(duì)與絕對(duì)構(gòu)型。?多肽標(biāo)記及修飾目前多肽標(biāo)記及修飾的內(nèi)容非常多,廣泛應(yīng)用在多肽藥物,多肽生物學(xué),多肽 抗體以及多肽試劑的研究中。目前應(yīng)用廣泛的有:非放射性核素標(biāo)記(C13,H2),熒光標(biāo)記(FAM , FITC),生物素標(biāo)記,磷酸化修飾等。2.1. 非放射性核素標(biāo)記目前在非放射性核素標(biāo)記中,使用廣泛的仍然是 C13, H2,因?yàn)槠涫褂冒踩?放射性小?,F(xiàn)在有比較完全的非放射性標(biāo)記的氨基酸,可以按照正常的多肽合 成方法將標(biāo)記好的氨基酸直接連接到多肽上。22熒光標(biāo)記熒光標(biāo)記由于沒有放射性,實(shí)驗(yàn)操作簡單。因此,目前
28、在生物學(xué)研究中熒光標(biāo) 記應(yīng)用非常廣泛,熒光標(biāo)記方法與熒光試劑的結(jié)構(gòu)有關(guān)系,對(duì)于有游離竣基的 采用的方法與接肽反應(yīng)相同,也采用 HBTU/HOBt/DIEA方法連接。但是對(duì)于 FITC標(biāo)記,需要在連接FITC前,增加一個(gè)氨基己酸,避免在切割的過程中被 TFA切割掉。2.3. 生物素標(biāo)記生物素-親合素系統(tǒng)(biotin-avidin system, BAS),是70年代后期應(yīng)用于免疫 學(xué),并得到迅速發(fā)展的一種新型生物反應(yīng)放大系統(tǒng)。由于它具有生物素與親合 素之間高度親和力及多級(jí)放大效應(yīng),并與熒光素、酶、同位素等免疫標(biāo)記技術(shù) 有機(jī)地結(jié)合,使各種示蹤免疫分析的特異性和靈敏度進(jìn)一步提高。主要有用于 標(biāo)記多
29、肽氨基的生物素N-羥基丁二酰亞胺酯(BNHS)和生物素對(duì)硝基酚酯 (pBNP),其中以BNHS最常用,當(dāng)然,也可以直接使用生物素也可以標(biāo)記,因 為其結(jié)構(gòu)上有個(gè)游離的竣基,采用 HBTU/HOBt/DIEA方法縮合,由于生物素的 溶解度低,使用DMSO/DMF的混合溶劑增加溶解度。2.4. 磷酸肽合成磷酸肽在生命過程中發(fā)揮重要作用,磷酸化的位置在多肽上的Ser, Thr, Tyr。目前磷酸肽合成一般都采用磷酸化氨基酸,目前使用的都是單甲基磷酸化氨基 酸,Tyr也可以直接使用磷酸化氨基酸。磷酸化氨基酸的連接一般采用 HBTU/HOBt/DIEA方法,但是目前采用該方法合成磷酸化也有缺點(diǎn),特別是在
30、合成多磷酸化多肽或長肽的時(shí)候,連接效率低,最后產(chǎn)品純度很低,對(duì)于這種 磷酸化多肽,我們考慮采用后磷酸化方法,其合成過程就是在多肽合成結(jié)束后,選擇性脫去要標(biāo)記的氨基酸的側(cè)鏈保護(hù)基,對(duì)于Tyr, Thr可以直接使用側(cè)鏈不保護(hù)的氨基酸進(jìn)行反應(yīng),而 Ser可以采用Fmoc-Ser (trt),在1%TFA/DCM條件下可以定量的脫除。后磷酸化,采用雙甲基亞磷酰胺,四氮晚 生成亞磷酰胺四晚活性中間體,連接到羥基上,隨后在過氧酸下氧化生成磷酰 基,完成反應(yīng)。?蛋白結(jié)構(gòu)與功能模擬多肽多肽在與蛋白受體結(jié)合發(fā)揮功能的時(shí)候,總是先折疊出某些特殊的結(jié)構(gòu),多肽 類似物合成主要是為了模擬這些結(jié)構(gòu),保持或提高生物活性,同
31、時(shí)也為了改變 多肽的穩(wěn)定性,提高其抗酶解能力。3.1. o-螺旋多肽e螺旋是蛋白結(jié)構(gòu)中最為普通的一種,但是一般多肽在溶液中大多是無規(guī)卷曲 的,目前使用最多的方法是多肽保持 為螺旋結(jié)構(gòu)就是在多肽表面通過共價(jià)鍵將 處在e螺旋結(jié)構(gòu)的兩個(gè)氨基酸連接起來,選擇的位點(diǎn)(i, i+4或i, i+7),選 擇的化學(xué)鍵包括:二硫鍵,硫醴鍵,酰胺鍵,烯姓鍵( RCM)等方法。3.1.1. 二硫鍵二硫鍵廣泛存在與蛋白結(jié)構(gòu)中,對(duì)穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)具有非常重要的意義,二硫鍵 一般是通過序列中的2個(gè)Cys的琉基,經(jīng)氧化形成。形成二硫鍵的方法很多: 空氣氧化法,DMSO氧化法,過氧化氫氧化法等。二硫鍵的合成過程,可以通 過日lm
32、an檢測(cè)以及HPLC檢測(cè)方法對(duì)其反應(yīng)進(jìn)程進(jìn)行監(jiān)測(cè)。1.1.1. 鍵硫醴鍵的形成可以通過序列中的 Lys,將澳乙酸連接到Lys的側(cè)鏈氨基上,利 用其和琉基的特異性反應(yīng),反應(yīng)在緩沖溶液中進(jìn)行,迅速高效。3.1.3. 酰胺鍵 多肽的內(nèi)酰胺環(huán)肽的合成一般是利用 Lys, Asp (Glu)的選擇性保護(hù),在固相 上直接環(huán)化。BOC策略中可以采用 BOC-Lys (Fmoc) , BOC-Asp (OFm), FMOC 策略中可以采用 FMOC-Lys (Aloc) , FMOC-Asp (Allyl)。對(duì)于首尾 環(huán)肽,還可以先合成保護(hù)的多肽,然后在液相中環(huán)化生成目標(biāo)多肽。3.1.4. 烯I鍵(RCM)RCM反應(yīng)是一個(gè)過渡金屬催化反應(yīng),其反應(yīng)中使用催化劑:(Cy3P)2Cl2Ru=CHPh,可以催化烯姓環(huán)化,過程中脫去一分子乙烯Fmc-X-Resin1.20M pip/DMFIFmoc-Xl/HBTU/HOBt/DlEAm Xn*X-Re sin僅供學(xué)習(xí)與交流,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系網(wǎng)站刪除 謝謝19(Cy3P)2a2Ru=CHPh. DCM.rcfluicXtn . Xu-X-5-Csincleavage rea
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