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文檔簡介
1、蛋白質化學等電點(isoelectric point, pI):當氨基酸在溶液中凈電荷為零的pH。在等電點時,氨基酸主要以兩性離子形式存在肽鍵(peptide bond):由一個氨基酸的a-羧基與另一個氨基酸的a-氨基脫水縮合而形成的化學鍵。肽:由二個或兩個以上氨基酸通過肽鍵相連而形成的化合物。蛋白質的一級結構:指多肽鏈中氨基酸的排列順序與鍵合方式。二級結構:蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構,即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側鏈的構象。肽單元:參與組成肽鍵的6個原子位于同一平面,又叫酰胺平面或肽鍵平面。它是蛋白質構象的基本結構單位。a-螺旋 ( a -helix )
2、 :是蛋白質中最常見的一種二級結構,多肽鏈主鏈圍繞中心軸形成右手螺旋-折疊:若干條肽鏈或一條肽鏈的若干肽段平行排列,相鄰肽鏈之間靠氫鍵維持。 超二級結構(supersecondary struture):蛋白質分子中,由若干相鄰的二級結構單元組合在一起,形成有規(guī)則的、在空間上能辨認的二級結構組合體結構域(domain):在超二級結構基礎上組裝成的相對獨立的三維實體。折疊得較為緊密,各行使其功能。蛋白質的變性:在某些物理和化學因素作用下,蛋白質分子特定空間構象被破壞,導致其理化性質改變和生物活性的喪失。復性:若蛋白質變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質仍可恢復或部分恢復其原有的構象和功能。酶化學
3、全酶:對結合酶而言,酶蛋白與輔助因子結合之后所形成的復合物,稱為全酶,只有全酶才有催化活性,將酶蛋白和輔助因子分開后均無催化作用。全酶 = 酶蛋白 + 輔助因子酶原:某些酶在細胞內合成或初分泌時沒有活性,這些沒有活性的酶的前身稱為酶原酸堿催化:通過瞬時地向反應物提供質子或從反應物接收質子以穩(wěn)定過渡態(tài)、達到降低反應活化能、加速反應的一種催化機制。共價催化:通過與底物形成反應活性很高的共價過渡物降低反應活化能,從而提高反應速度的過程。酶的活性部位:有些必需基團雖然在一級結構上可能相距很遠,但在形成空間結構時彼此靠近,集中在一起,形成具有一定空間結構的區(qū)域,并能與底物特異地結合,將底物轉化為產物。這
4、一區(qū)域,稱為酶的活性部位(Active site)。米氏常數(Km):反應速率達最大反應速率一半時的底物濃度。單位是:mol/L或mmol/L競爭性抑制作用:抑制劑在化學結構上與底物相似,能與底物競爭酶的活性中心,從而阻礙酶-底物復合物的形成,降低酶促反應速度。 此時這種作用叫做競爭性作用。非競爭性抑制作用:有些抑制劑可與酶活性中心以外的必需基團結合,不影響酶與底物的結合,抑制劑和底物可同時結合在酶分子上,形成酶-底物-抑制劑復合物,不能釋放出產物,使酶活性喪失,這種抑制劑稱為非競爭性抑制劑,這種抑制作用稱為非競爭性作用。 反競爭性抑制作用:抑制劑僅與酶和底物形成的中間產物結合,使ES的量下降
5、。該抑制劑與單獨的酶不結合。這種抑制作用稱為反競爭性作用。酶的輔助因子:主要包括金屬離子和小分子有機化合物,在酶促反應中主要決定反應的種類和性質,在反應中起到傳遞電子、原子或某些化學基團的作用。輔酶:把那些與酶蛋白結合比較松弛,用透析法可以除去的小分子有機化合物,稱為輔酶。輔基:輔基是指以共價鍵和酶蛋白結合的小分子有機物質,不能通過透析或超濾的方法除去。激活劑:凡是能提高酶活性的物質。抑制劑:能使酶分子的某些必需基團發(fā)生變化,從而引起酶活性的下降,甚至消失,使酶反應下降的物質酶活力(酶活性)是指:酶催化底物化學反應的能力。酶的專一性:絕對專一性:酶只作用于特定結構的底物,進行一種專一的反應,生
6、成一種特定結構的產物 。相對專一性:酶作用于一類化合物或一種化學鍵。立體異構專一性: 酶僅作用于立體異構體中的一種。誘導契合學說:該學說認為酶與底物相互接近時,其結構相互誘導、相互變形和相互適應,進而相互結合。中間產物學說: 中間產物學說認為,酶在催化反應時,首先酶與底物形成不穩(wěn)定的中間物,然后再分解成酶與產物。即酶將原來活化能很高的反應分成兩個活化能較低的反應來進行,因而加快了反應速率。糖類化學醛糖:一類單糖,該單糖中氧化數最高的C原子(指定為C-1)是一個醛基酮糖:一類單糖,該單糖中氧化數最高的C原子(指定為C-2)是一個酮基。變旋現象:一個旋光溶液放置后其比旋度自行改變的現象。糖苷:單糖
7、半縮醛上的羥基可與其它含羥基的化合物(醇、酚)縮合失水形成的縮醛衍生物。如杏仁苷、強心苷等,是多種中藥的有效成分。糖苷鍵:一個糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O糖苷鍵和N糖苷鍵。 還原糖:醛糖的半縮醛羥基、酮糖的半縮酮羥基在堿性溶液中具有還原性。所有單糖都是還原糖,易被氧化成酸。常用費林試劑判斷還原糖。同多糖:由許多單糖分子或其衍生物縮合而成的高聚物稱為多糖,又稱為高聚糖??煞譃橥嗵呛彤惗嗵莾深悺S梢环N單糖縮合形成的多糖稱為同多糖。異多糖:由一種以上單糖縮合形成的多糖稱為異多糖。脂類物質必需脂
8、肪酸:不飽和脂肪酸中亞油酸與亞麻酸人體不能自行合成,必須從食物中攝取,稱為必需脂肪酸。磷脂:含磷酸的復合脂,包括甘油磷脂和神經鞘磷酯脂肪酸:脂肪酸(Fatty acid)是一類羧酸化合物,由碳氫組成的烴類基團連結羧基所構成。三個長鏈脂肪酸與甘油形成三酸甘油酯(Triacylglycerols),為脂肪的主要成分。生物膜:是構成細胞所有膜的總稱,包括圍在細胞質外圍的質膜和細胞器的內膜系統(tǒng)。 流動鑲嵌模型(Mosaic fluid model):將膜描述為由蛋白質在粘滯的流體狀脂質雙層中所形成的鑲嵌物。被動運輸:順濃度梯度,不需要消耗能量的穿膜運輸。主動運輸:物質逆濃度梯度的穿膜運輸,需消耗代謝能
9、,并需專一性的載體蛋白。如Na+、K+-泵 協(xié)助擴散(facilitated diffusion):從高濃度到低濃度(順濃度梯度),需借助載體蛋白的物質運輸。包括親水性分子如糖、氨基酸等的運輸。酸?。禾?然 油 脂 長 時 間 暴露在空氣中產生難聞 的氣味,這 種 現 象 稱 為 酸 敗。核酸化學核苷酸:由核苷戊糖上的羥基與磷酸縮合而成的磷酸酯。磷酸二脂鍵:一種化學基團,指一分子磷酸與兩個醇(羥基)酯化形成的兩個酯鍵DNA雙螺旋:DNA雙螺旋(DNA double helix)是一種核酸的構象,在該構象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結構.DNA變性的本質:維持雙螺旋穩(wěn)
10、定性的氫鍵斷裂,堿基間堆積力遭到破壞,但不涉及到其一級結構的改變。 DNA的溶解溫度(milting temperature):通常把DNA熱變性引起物化性質改變一半時的溫度稱為DNA的溶解溫度。增色效應:(hyperchromic effect):由于核酸變性而引起紫外光吸收增加的現象。減色效應 (hypochromic effect ):由于核酸復性而引起紫外光吸收減少的現象。分子雜交:指不同來源的單鏈核酸之間可通過堿基互補形成雙螺旋結構。 退火(annealing):使熱變性DNA緩慢冷卻,則可發(fā)生復性,此過程稱為退火。新陳代謝與生物氧化呼吸電子傳遞鏈:按嚴格的方向和順序,即電子從氧化還
11、原電位較低的傳遞體依次通過氧化還原電位較高的傳遞體逐步流向氧分子。氧化磷酸化:代謝物在生物氧化過程中釋放出的自由能用于合成ATP(即ADP+PiATP),即在呼吸鏈電子傳遞過程中偶聯ADP磷酸化,生成ATP,這種氧化放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯的過程稱氧化磷酸化。化學滲透理論:主要認為在電子傳遞和ATP形成之間起耦聯作用的是H+濃度。電子經呼吸鏈傳遞時,可將質子(H+)從線粒體內膜的基質側泵到內膜胞漿側,產生膜內外質子電化學梯度儲存能量。當質子順濃度梯度回流時驅動ADP與Pi生成ATP。P/O比:呼吸過程中無機磷酸(Pi)消耗量和原子氧(O2)消耗量的比值稱為磷氧比。由于在氧化磷酸化過程中
12、,每傳遞一對電子消耗一個氧原子,而每生成一分子ATP消耗一分子Pi,因此P/O的數值相當于一對電子經呼吸鏈傳遞至氧所產生的ATP分子數。高能化合物:指水解可釋放的能量,能驅動ADP磷酸化生成ATP的化合物。生物氧化:糖類、脂肪、蛋白質等有機物質在細胞中進行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過程。呼吸鏈阻斷劑:能夠阻斷呼吸鏈中某一部位電子流的物質稱為電子傳遞阻斷劑或呼吸鍵阻斷劑。解偶聯劑:凡能破壞氧化與磷酸化相偶聯的作用。能引起解偶聯作用的物質稱為解偶聯劑。糖代謝糖酵解:指在氧氣不足條件下,葡萄糖或糖原分解為丙酮酸或乳酸的過程,此過程中伴有少量ATP的生成。發(fā)酵:無氧等外源氫受體的條件下,
13、底物脫氫后所產生的還原力H未經呼吸鏈傳遞而直接交某一內源性中間代謝物接受,以實現底物水平磷酸化產能的一類生物氧化反應。乳酸發(fā)酵:指糖經無氧酵解而生成乳酸的發(fā)酵過程,乙醇發(fā)酵同為生物體內二種主要的發(fā)酵形式。底物水平磷酸化:物質在生物氧化過程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯ATP或GTP的合成,這種產生ATP等高能分子的方式稱為底物水平磷酸化三羧酸循環(huán):是用于將乙酰CoA中的乙?;趸啥趸己瓦€原當量的酶促反應的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA與草酰乙酸縮合形成檸檬酸。磷酸戊糖途徑:葡萄糖氧化分解的一種方式。由于此途徑是由6-磷酸葡萄糖(G6P)開始,故亦稱為己糖
14、磷酸旁路。糖異生作用:由簡單的非糖前體轉變?yōu)樘堑倪^程。底物循環(huán):一對催化兩個途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應。糖的有氧氧化無氧氧化:萄糖在有氧條件下,氧化分解生成二氧化碳和水的過程稱為糖的有氧氧化(aerobicoxidation),并釋放出能量。有氧氧化是糖分解代謝的主要方式,大多數組織中的葡萄糖均進行有氧氧化分解供給機體能量。無氧氧化是指在缺氧或供氧不足的情況下,組織細胞內的糖原,能經過一定的化學變化,產生乳酸和水或乙醇和二氧化碳和水,并釋放出一部分能量的過程,也稱糖酵解。脂類代謝脂肪酸的-氧化途徑:脂酰CoA在線粒體基質中進入氧化要經過四步反應,即脫氫、加水、再脫氫
15、和硫解,生成一分子乙酰CoA和一個少兩個碳的新的脂酰CoA. 。酰基載體蛋白:從頭合成脂肪酸,是由含有多種酶的復合體的脂肪酸合成系統(tǒng)的催化下進行的,而在它的?;s合的階段,酰基CoA不是作為直接底物,而是被轉移至復合體中的酰基載體蛋白起反應的。肉毒堿穿梭系統(tǒng):由于酸的-氧化作用是在線粒體的基質中進行的,而在細胞液中形成的長鏈脂酰CoA不能通過線粒體內膜,需要內膜上的載體肉堿攜帶,以脂酰基的形式跨越內膜而進入基質。蛋白質的酶促降解及氨基酸的代謝尿素循環(huán):肝臟中2分子氨和1分子CO2生成1分子尿素的環(huán)式代謝途徑。氧化脫氨基作用:是指氨基酸在酶的作用下伴有氧化的脫氨基反應。轉氨:一個-氨基
16、酸的-氨基借助轉氨酶的催化作用轉移到一個-酮酸的過程。生糖氨基酸:能通過代謝轉變成葡萄糖的氨基酸。聯合脫氨基作用:轉氨基與谷氨酸氧化脫氨或是嘌呤核苷酸循環(huán)聯合脫氨,以滿足機體排泄含氮廢物的需求。核酸生物合成半保留復制: DNA生物合成時,母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對規(guī)律,合成與模板互補的子鏈。子代細胞的DNA,一股單鏈從親代完整地接受過來,另一股單鏈則完全重新合成。兩個子細胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。復制叉:是DNA復制時在DNA鏈上通過解旋、解鏈和SSB蛋白的結合等過程形成的Y字型結構稱為復制叉。DNA聚合酶: DNA聚合酶 , 以DNA為復制模板,從將DNA由
17、5'端點開始復制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、引物、dNTP等的情況下)及其相輔的活性。前導鏈:與復制叉移動的方向一致,通過連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈:與復制叉移動的方向相反,通過不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段:相對比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段。單鏈結合蛋白:于螺旋酶沿復制叉方向向前推進產生的單鏈區(qū),防止新形成的單鏈DNA重新配對形成雙鏈DNA或被核酸酶降解的蛋白質。轉錄:遺傳信息由DNA轉換到RNA的過程。作為蛋白質生物合成的第一步,轉錄是mRNA
18、以及非編碼RNA(tRNA、rRNA等)的合成步驟。核心酶:大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由5個亞基組成(2,),沒有基的酶叫核心酶。內含子:在轉錄后的加工中,從最初的轉錄產物除去的內部的核苷酸序列。模板鏈:可作為模板轉錄為RNA的那條鏈,該鏈與轉錄的RNA堿基互補(A-U,G-C)。在轉錄過程中,RNA聚合酶與模板鏈結合,并沿著模板鏈的3'5'方向移動,按照5'3'方向催化RNA的合成。編碼鏈:DNA中,不能進行轉錄的那一條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉錄生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。聚合酶鏈式反應:簡稱PCR,在體外對特定的DNA
19、片段進行高效擴增的技術,可看作生物體外的特殊DNA復制。蛋白質的合成中心法則:指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再從RNA傳遞給蛋白質,即完成遺傳信息的轉錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復制過程。這是所有有細胞結構的生物所遵循的法則。在某些病毒中的RNA自我復制(如煙草花葉病毒等)和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉錄成DNA的過程(某些致癌病毒)是對中心法則的補充。翻譯是根據遺傳密碼的中心法則,將成熟的信使RNA分子(由DNA通過轉錄而生成)中“堿基的排列順序”(核苷酸序列)解碼,并生成對應的特定氨基酸序列的過程。遺傳密碼決定蛋白質中氨基酸順序的核苷酸順序 ,由3個連續(xù)的核苷酸組成的密碼子所構成 。由于脫氧核糖核酸(DNA)雙鏈中一般只有一條單鏈(稱為有義鏈或編碼鏈)被轉錄為信使核糖核酸(mRNA),而另一條單鏈(稱為反義鏈)則不被轉錄,所以即使對于以雙鏈 DNA作為遺傳物質的生物來講,密碼也用核糖核酸(RNA)中的核苷酸順序而不用DNA中的脫氧核苷酸順序表示。起始密碼子:被認為對應于AUG。其中原核生物的起始密碼子AUG翻譯對應的是甲酰甲硫氨酸(fMet),真核生物的起始密碼子AUG翻譯對應的是甲硫氨酸(Met)。密碼子: 信使RNA鏈上決定一個氨基酸的相鄰的三個堿基。信號肽:常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質的跨膜轉移(定位)
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