iGEM和BIOMODPPT學(xué)習(xí)教案

1、會計(jì)學(xué)1iGEM和和BIOMODiGEM-國際遺傳工程機(jī)器大賽BIOMOD-國際生物分子設(shè)計(jì)大賽第1頁/共15頁 國際遺傳工程機(jī)器設(shè)計(jì)大賽（國際遺傳工程機(jī)器設(shè)計(jì)大賽（International Genetically Engineered Machine，iGEM）是一年一度的世界級合成生物學(xué)競賽。）是一年一度的世界級合成生物學(xué)競賽。該競賽由麻省理工學(xué)院（該競賽由麻省理工學(xué)院（MIT）首創(chuàng)，旨在培養(yǎng)合成生物學(xué)人才，促進(jìn)各）首創(chuàng)，旨在培養(yǎng)合成生物學(xué)人才，促進(jìn)各國大學(xué)本科生在該領(lǐng)域的學(xué)習(xí)、交流與合作國大學(xué)本科生在該領(lǐng)域的學(xué)習(xí)、交流與合作.每年，大賽主辦方提供給各每年，大賽主辦方提供給各參賽隊(duì)伍一份

2、參賽隊(duì)伍一份DNA標(biāo)準(zhǔn)樣本庫，各隊(duì)自行選題并通過設(shè)計(jì)和模型分析，標(biāo)準(zhǔn)樣本庫，各隊(duì)自行選題并通過設(shè)計(jì)和模型分析，將所需樣本導(dǎo)入現(xiàn)有的生物體系，合成全新的生物工程系統(tǒng)（即將所需樣本導(dǎo)入現(xiàn)有的生物體系，合成全新的生物工程系統(tǒng)（即“基因基因工程機(jī)器工程機(jī)器”）。）。第2頁/共15頁標(biāo)準(zhǔn)化（標(biāo)準(zhǔn)化（Standardization） 為了實(shí)現(xiàn)元件“即插即用”的性能，需要定義不同組件之間的標(biāo)準(zhǔn)化連接，并開發(fā)各種基本生物功能（如啟動子活性）、實(shí)驗(yàn)測量（如蛋白質(zhì)濃度）、系統(tǒng)操作（如遺傳背景、發(fā)酵液、生長速度、環(huán)境條件等）等的標(biāo)準(zhǔn)。只有這些標(biāo)準(zhǔn)被廣泛采用，才能保證不同研究人員設(shè)計(jì)和構(gòu)建的單元能夠相互匹配。解耦（解

3、耦（Decoupling） 將一個復(fù)雜問題分解成許多相對簡單的、可以獨(dú)立處理的問題（如把復(fù)雜的“生物系統(tǒng)”解耦成許多套相互獨(dú)立的裝置如標(biāo)準(zhǔn)化的細(xì)胞、標(biāo)準(zhǔn)化的核苷酸序列等），便于用已有的標(biāo)準(zhǔn)化部件來加速開發(fā)過程，最終合成具有特定功能的統(tǒng)一整體的過程。抽象（抽象（Abstraction） 生物工程中主要涉及以下兩種抽象方式： 利用抽象的層次模型，以不同水平的復(fù)雜程度描述生物功能的信息； 對于合成生物系統(tǒng)的部件和裝置進(jìn)行重新設(shè)計(jì)和構(gòu)建，使其適當(dāng)簡化以方便模擬和組合，如轉(zhuǎn)錄啟動子、核糖體結(jié)合位點(diǎn)和開放讀碼架的重新設(shè)計(jì)和嶄新組合等。第3頁/共15頁第4頁/共15頁第5頁/共15頁第6頁/共15頁第7頁/共15頁第8頁/共15頁第9頁/共15頁第10頁/共15頁第11頁/共15頁第12頁/共15