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1、案例色盲的遺傳學模型研究隨機調(diào)查1000人,按性別和是否色盲將這1000人分類。分類結果如下:男性正常、女 性正常、男性色盲和女性色盲各有442、514、38、6人。按遺傳學的理論,有如下結論:性別決定于兩個染色體,女性是XX,男性是XY,人群中女性和男性,也就是有 XX和XY染色體的人所占的比例都是1/2;染色體X與非色盲遺傳因子A,或與色盲遺傳因子a成對出現(xiàn),而染色體Y不可 能與A,或與a成對出現(xiàn)。A和a與X成對出現(xiàn)的概率分別為P和q , P + q = 1;遺傳因子有顯性和隱性之分,非色盲遺傳因子A是顯性因子,色盲遺傳因子a是 隱性因子。因而,對男性來說,(XA)Y的情況沒有色盲,其概率
2、為P/2 ; (Xa)Y的情況有色盲,其概 率為q;2。對女性來說,(XA)(XA)、(XA)(Xa)和(Xa)(XA)三種情況都沒有色盲,它們的概 率之和為P2.;2 + pq ; (Xa)(Xa)的情況有色盲,其概率為q*2。即男性正常、女性正常、 男性色盲和女性色盲這四類人所占的比例分別為P/2、p*2+ pq、q2和q2,;2,其中p 未知,q =1p。將男性正常、女性正常、男性色盲和女性色盲這四類人分別記為,a4,并記類A. 所占的比例為Pj(i = 1,,4)。則P1 = P/2,p2 = p2 .2 + pq,p3 = q/2,p4 = q2 , 2.這些Pt都依賴一個未知參數(shù)P
3、。若上述模型是對的,試求類4所占比例Pj(i = 1,,4)的極大似然估計(相當于求p的 極大似然估計)解:參數(shù)似然函數(shù)為q )38 ()6J)514 z + pqJ Ix p956(2 - p)514(1-p)50從而有對數(shù)似然方程a ln L( p) 956 51450 八=0dpp2 p 1 p即1520p2 3482p +1912 = 0。據(jù)此求得p的極大似然估計p - 0.91,從而得p.的極大似然估計 P. = Pi(P),i = 1,4。它們分別為 0.455、0.49595、0.045 和 0.00405。(由此得各類的期望頻數(shù)的估計值np., i = 1, ,4。它們分別為4
4、55、495.95、45和4.05)使用Excel軟件,由數(shù)值迭代算法求得參數(shù)p的極大似然估計,使得似然函數(shù),或使得 對數(shù)似然函數(shù)達到極大值。如何設定P的初始值是數(shù)值迭代算法能否正確求解的關鍵。對 本例來說,可通過以下一些途徑設定P的初始值。由于(XA)Y是男性沒有色盲,所以沒有 色盲的男性只有A,沒有a。由于在隨機調(diào)查1000人中沒有色盲的男性有442人,所以A 與X成對出現(xiàn)的概率p不可能小于0.442。其次由于在沒有色盲的人中才有A,色盲的人中 沒有A,并由于在隨機調(diào)查1000人中有442 + 514 = 956人沒有色盲,所以A與X成對出現(xiàn) 的概率p不可能大于0.956。故由調(diào)查數(shù)據(jù)知,
5、p的初始值應設定在0.442與0.956之間。 另外,由于男性沒有色盲的概率為p 2,在隨機調(diào)查1000人中男性沒有色盲有442人,所 以p的初始值應設定在0.442x2 = 0.884附近。類似地,由男性色盲、女性沒有色盲和女性 色盲的概率,以及在隨機調(diào)查的人中男性色盲、女性沒有色盲和女性色盲各有多少人,也可 以推得p的初始值應設定在什么值附近。本例,我們?nèi)的初始值為0.85。下面介紹利用統(tǒng)計軟件Excel求參數(shù)的極大似然估計的方法。建立Excel工作表格:將p的初始值0.85輸入到例如A1單元格;將目標函數(shù),即對數(shù)似然函數(shù) “ =956*ln(。1) + 514*ln(2 一。1) +
6、50*ln(1 一。1) ” 輸入到例如 A3單元格;p滿足約束條件:0 p 1,為此將0和1分別輸入到例如B1和C1單元格;按下面的步驟求參數(shù)的極大似然估計:1.選擇Tools(X具)下拉菜單;.選擇Solver Parameters(規(guī)劃求解)選項;.在Solver Parameters(規(guī)劃求解參數(shù))對話框中:在Set Target Cell(設置目標單元格)欄中鍵入A3;在Equal to(等于)欄中選擇Max(最大值);在By Changing Cells(可變單元格)欄中鍵入A 1;在Subject to the Constraints(約束)欄中選擇Add(添加)選項:.在Add Constraint(添加約束)對話框中:在Cell Reference(單元格引用位置)欄中鍵入A1;在Constraint (約束)欄中鍵入B1;在 =下拉菜單,選擇=;再一次選擇Add(添加);5 .在Add Constraint(添加約束)對話框中:在Cell Reference(單元格引用位置)欄中鍵入A1;在Constraint (約束)欄中鍵入C1;在 =
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