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文檔簡(jiǎn)介
1、葡聚糖凝膠測(cè)蛋白質(zhì)分子量 目的要求:1、學(xué)習(xí)凝膠過(guò)濾法的操作方法2、學(xué)習(xí)使用凝膠過(guò)濾法測(cè)定蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量 實(shí)驗(yàn)原理: 凝膠層析法(即凝膠過(guò)濾法,gelfiltration)是以具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠顆粒作為固定相,葡聚糖凝膠是由線性葡聚糖和交聯(lián)劑組成的有不同孔隙度的立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),根據(jù)物質(zhì)在凝膠顆粒的微孔中擴(kuò)散的速率進(jìn)行分離,大分子移動(dòng)的速度快,先被洗脫出來(lái),而小分子物質(zhì)移動(dòng)的速度慢,后被洗脫出來(lái)。 不同規(guī)格型號(hào)的葡聚糖用英文字母G表示,G后面的阿拉伯?dāng)?shù)為凝膠得水值的10倍。例如,G-25為每克凝膠膨脹時(shí)吸水克,同樣G-200為每克干膠吸水20克。因此,“G”反映,凝膠的交聯(lián)程度,膨脹程度及分部
2、范圍。 在洗脫過(guò)程中,大分子不能進(jìn)入凝膠內(nèi)部而沿凝膠顆粒間的空隙最先流出柱外,而小分子可以進(jìn)入凝膠內(nèi)部,流速緩慢,以致最后流出柱外,從而使樣品中分子大小不同的物質(zhì)得到分離。 將凝膠裝柱后,柱床體積稱為“總體積”,以Vt(totalvolume)表示。Vt是由三部分組成,包括內(nèi)水容積Vi、外水體積V0 和凝膠本身的體積Vg 。內(nèi)水容積Vi是凝膠孔隙所占的體積,即凝膠顆粒內(nèi)部所含水相的體積,它可從干凝膠顆粒重量和吸水后的重量求得。外水體積V0指凝膠顆粒間的自由空間所占的體積,即存在于柱床內(nèi)凝膠顆粒外面空隙之間的水相體積。利用有顏色以便于觀察的蛋白質(zhì),分子量約200萬(wàn)的藍(lán)色葡聚糖-2000通過(guò)實(shí)際測(cè)
3、量求出 。 當(dāng)樣品流經(jīng)凝膠柱時(shí),大于孔隙的大分子完全不滲入到凝膠內(nèi)部,只需V0體積的洗脫液便可將其由一端洗脫到另一端;相反,如果樣品體積小于孔隙,則需要V0Vi體積的洗脫液,才能將它們由一端洗脫到另一端。中等分子(分子大小在上述兩種極限之間)所需洗脫液體積介于兩者之間,VeV0KdVi(0Kd1), Kd為分配系數(shù),它表示一種物質(zhì)在孔隙內(nèi)的滲透程度,相當(dāng)于這種物質(zhì)在孔隙內(nèi)所占體積和孔隙總體積的比值。 對(duì)某一凝膠介質(zhì),如果兩種分子全排出,即Kd都等于零,雖然分子大小有差別,但沒有分離效果。同樣兩種分子如都能進(jìn)入內(nèi)部空隙,即Kd都等于1,它們雖然分子大小有不同,但也沒有分離效果。因此不同型號(hào)的凝膠
4、介質(zhì),有它一定的使用范圍。 實(shí)際工作時(shí),有時(shí)Kd1,表示凝膠對(duì)組分有吸附作用,此時(shí)VeVo+Vi,例如一些芳香族化合物的洗脫體積遠(yuǎn)超出理論計(jì)算的最大值。 不同大小分子量的蛋白質(zhì),進(jìn)入凝膠篩孔的程度不同,其洗脫體積決定于分子大小,蛋白質(zhì)在葡聚糖凝膠柱上層析的洗脫體積和分子量的對(duì)數(shù)呈直線關(guān)系。若用已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)在一定型號(hào)葡聚糖凝膠柱上層析,精確測(cè)其洗脫體積,并以洗脫體積Ve對(duì)分子量的對(duì)數(shù)logMW作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。未知分子量的蛋白質(zhì)在相同條件下層析,根據(jù)其洗脫體積即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。 試劑和材料洗脫液:0.05M Tris-HCl緩沖液(),0.1M KCl溶液:稱取12.
5、12g Tris,15g KCl,先用少量去離子水溶解,再加入濃HCl,用去離子水定容至2L。 藍(lán)色葡聚糖2000(10mg/ml);Sephsdex G-100;牛血清白蛋白(2mg/ml)(Mr 67 000);細(xì)胞色素c(Mr 12 800) 器材 層析柱 蠕動(dòng)泵 核酸蛋白檢測(cè)儀 自動(dòng)部分收集器 記錄儀 實(shí)驗(yàn)步驟: 一、溶脹凝膠 取Sephadex G-100 3g,加200mL蒸餾水,沸水浴中溶脹5小時(shí)。待溶脹平衡后,傾去上層清液,包括細(xì)顆粒,然后再放些蒸餾水?dāng)噥y,靜置使凝膠下沉,再傾去上層清液,至無(wú)細(xì)顆粒為止。溶脹平衡和漂洗凈的凝膠經(jīng)減壓抽氣除去氣泡,即可準(zhǔn)備裝柱。 二、裝柱 層析柱
6、必須粗細(xì)均勻,通常柱愈長(zhǎng),分離效果愈好,但柱過(guò)長(zhǎng),反而分離效果不好。 裝柱時(shí),將柱垂直至于鐵架上。在柱中加約1/3柱容積的洗脫液,并趕凈尼龍膜下方氣泡,完全使柱子底部充滿液體,將柱的出口關(guān)閉。將凝膠上面過(guò)多的溶液傾出。把已經(jīng)溶脹好的凝膠調(diào)成薄漿,傾入柱內(nèi),膠粒逐漸擴(kuò)散下沉。當(dāng)沉積的膠床至23cm高時(shí),打開柱的出口,并注意控制流速均勻直到膠裝完。待沉集的膠面上升到離柱的頂端約5cm處時(shí)停止裝柱,關(guān)閉出水口,再以洗脫液平衡柱層,直至層析的膠床高不變。 柱裝得是否均勻,可用藍(lán)色葡聚糖上柱檢驗(yàn);如果色帶均勻下移,說(shuō)明柱子已裝好,可以使用。 三 上樣 保持床面的穩(wěn)定,打開柱的出口,待柱中洗脫液流至距床表
7、面12mm時(shí),關(guān)閉出口,用滴管將樣品慢慢地至柱床表面,打開出口,當(dāng)樣品滲入床中接近床表面1mm時(shí)關(guān)閉出口,加入少量洗脫液,再打開柱的出口,使床表面的樣品也全部滲入柱內(nèi)。這時(shí)在床表面再加洗脫液,使高出床表面35cm。 四 洗脫和收集 用L-1氯化鉀溶液以每管3ml/10min流速洗脫,用自動(dòng)部分收集器收集流出液。 將各標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)測(cè)得的洗脫體積Ve對(duì)它們的分子量對(duì)數(shù)作圖,則應(yīng)獲得一線性的標(biāo)準(zhǔn)曲線。 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 洗脫體積與分子量關(guān)系的示意圖 思考題: 凝膠層析的定義是什么?凝膠層析又稱凝膠過(guò)濾,是一種按分子量大小分離物質(zhì)的層析方法。該方法是把樣品加到充滿著凝膠顆粒的層析柱中,然后用緩沖液洗脫。大分子不能進(jìn)入凝膠
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