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ICS11.220CCSB41ICS11.220CCSB41山 東 省 地 方 標(biāo) 準(zhǔn)DB37/T4362—2021RT-PCR測(cè)方法Duplexreal-timeRT-PCRdetectionmethodforinfluenzavirusandcanineDuplexreal-timeRT-PCRdetectionmethodforinfluenzavirusandcaninedistempervirus2021031120210411山東省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布前 言本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。本文件由山東省畜牧業(yè)專業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)歸口。流感病毒與犬瘟熱病毒雙重?zé)晒釸T-PCR檢測(cè)方法范圍RT-PCR(GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求GB/T27401實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范動(dòng)物檢疫本文件沒(méi)有需要界定的術(shù)語(yǔ)和定義。本文件沒(méi)有需要界定的術(shù)語(yǔ)和定義。4縮略語(yǔ)下列縮略語(yǔ)適用于本文件。RT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RNA:核糖核酸PBS:磷酸鹽緩沖生理鹽水5試劑或材料GB/T6682使用無(wú)RNA酶的容器進(jìn)行分裝。TRIzol,2~80.1DEPC氯仿,445.675A.3,應(yīng)-20TEA.4——陽(yáng)性對(duì)照:帶有流感病毒M基因和犬瘟熱病毒N基因的質(zhì)粒。——陰性對(duì)照:為已知流感病毒和犬瘟熱病毒陰性的動(dòng)物組織懸液。PCR()13000r/min。6.3冰箱,2~8-205μL、10μL、100μL1000μL。1.5mL樣品121℃,15min——棉拭子;——剪刀、鑷子;1.5mL——研缽或組織研磨儀。有咽喉拭子樣品和肛門拭子樣品:3~51.0mLPBS1.5mL肛門拭子采樣,采樣時(shí)將拭子深入肛門轉(zhuǎn)一圈并沾取少量糞便;然后將拭子插入裝有1.0PBS1.5mL用無(wú)菌剪刀、鑷子采集不少于2.0g的肺臟等組織臟器,裝入一次性自封袋或其它滅菌容器,編號(hào)備用。h302.010mLB4300r/in離心15min1.5mL或者用專用儀器設(shè)備處理待檢組織樣品。2℃824h0凍急性感染且出現(xiàn)病毒血癥的動(dòng)物可采集全血分離血清或血漿進(jìn)行檢測(cè)。熒光RT-PCRGB19489和GB/T274012504RNA樣品病毒核酸RNARNARNA1.5mL200TRIzol110min200μL10min413000r/min15min(10min413000r/min15min1.0mL7548000r/min、10min5min50μLTERNA,-20RNARNART-PCRPCR+1+2μL熒光RT-PCR反應(yīng)液。按B.2配制反應(yīng)液,為避免移液器取樣損失,建議按n+1個(gè)反應(yīng)PCR20μL,加樣在樣品處理區(qū)進(jìn)行。分別向上述PCR管中加入樣本核酸提取步驟8.2.7中制備的RNA溶液各5μL,蓋500r/min30RT-PCRPCRPCR/1594℃/3/15℃/10℃/30共40402min60PCRFAMCy5CtCt28。注:Ct陰性雙檢測(cè)通道均無(wú)Ct值,且無(wú)特征性擴(kuò)增曲線,表明樣品中無(wú)禽流感、犬瘟熱病毒核酸。陽(yáng)性犬瘟熱病毒的核酸。9.3.2.2犬瘟熱病毒的核酸。9.3.2.2FAMCt30.0Cy5CtCy5Ct30.0FAMCt9.3.3可疑Ct30.0~38.0附錄A(0.5mol/LTris-HCl(pH8.0)稱取6.055gTris100mL80mL0.1%DEPCHClpH值至8.0100mL,0.5mol/LEDTA(pH8.0)溶液稱取18.61gNa2EDTA·2H2O置于100mL燒杯中,加入80mL0.1%DEPC水,用10NaOH溶液,調(diào)節(jié)pH8.0100mL75量取75mL25mL0.1DEPCTE將0.5mL10mmolTris-HCl(pH8.0)、0.1mL的0.5mol/LEDTA(pH8.0pH8.0,加0.1%DEPC50mL,4附錄B(資料性)引物探針序列及熒光RT-PCR反應(yīng)液配方引物和探針序列表見(jiàn)表B.1。表B.1引物和探針序列表病毒名稱序列名稱序列流感病毒上游引物ACCAGTCAACAAACTCCACAG下游引物GATTTGTTGCACACAGCATTCC探針FAM-GATTTGTTGCACACAGCATTCC-BHQ犬瘟熱病毒上游引物GCAAGCGAGGATTGAGGGTAT下游引物GGCCTATGGGACACACTCAAA探針Cy5-CACCGACCATCCAGACGTTGCTCCT-BHQRT-PCR熒光RT-PCR反應(yīng)液配方見(jiàn)表B.2。表B.2熒光RT-PCR反應(yīng)液配方組分1個(gè)檢測(cè)體系的加入量5×RT緩沖液5.0μLM-MLV反轉(zhuǎn)錄酶(200U/μL)0.5μLdNTPs(10mmol/L)1.0μLMgCl2(25mmol/L)3.0μL流感病毒上游引物(10μmol/L)0.5μL流感病毒下游引物(10μmol/L)0.5μL流感病毒探針(10μmol/L)0.5μL犬瘟熱病毒上游引物(10μmol/L)0.5μL犬瘟熱病毒下游引物(10μmol/L)0.5μL犬瘟熱病毒探針(10μmol/L)0.5μLRNA酶抑制劑(40U/μL)0.25μLExTaqHS酶(40U/μL)0.25μLDEPC水7.0
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