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文檔簡介
【醫(yī)學ppt課件】核酸的化學【醫(yī)學ppt課件】核酸的化學1
本章主要內(nèi)容
核苷酸
DNA
RNA
核酸的性質
本章主要內(nèi)容
核苷酸
DNA
RNA
核酸的性質
21868年F.Miescher首先從傷員繃帶的膿細胞中分離得到稱為“核素”的核酸1944年O.N.Avery通過轉化實驗證實DNA是主要的遺傳物質1953年J.D.Watson和F.H.C.Crick提出DNA雙螺旋結構模型1958Crick提出遺傳信息傳遞的中心法則1970s建立DNA重組技術1980s后分子生物學、分子遺傳學等學科突飛猛進發(fā)展,提出并完成HGP核酸化學的發(fā)展過程上頁
下頁
章首1868年F.Miescher首先從傷員繃帶的膿細胞中分離3
一、概述
概念
核酸(nucleicacid)是由堿基(嘌呤和嘧啶)、戊糖和磷酸組成的高分子物質,是生物體的基本組成。種類:
DNA(脫氧核糖核酸)RNA(核糖核酸)
一、概述
概念核酸(nucleicacid)是由堿4“四核苷酸假說”:核酸由四種核苷酸組成的單體構成的,缺乏結構方面的多樣性,不大可能有重要的生理功能?!八暮塑账峒僬f”:核酸由四種核苷酸組成的單體構成的,缺乏51928年,英國S型肺炎球菌:有莢膜,菌落表面光滑R型肺炎球菌:沒有莢膜,菌落表面粗糙
著名的肺炎球菌實驗
結果說明?1928年,英國著名的肺炎球菌實驗結果說明?6結果說明:加熱殺死的S型肺炎球菌中一定有某種特殊的生物分子或遺傳物質,可以使無害的R型肺炎球菌轉化為有害的S型肺炎球菌這種生物分子或遺傳物質是什么呢?
著名的肺炎球菌實驗
紐約洛克非勒研究所Avery從加熱殺死的S型肺炎球菌將蛋白質、核酸、多糖、脂類分離出來,分別加入到無害的R型肺炎球菌中,結果發(fā)現(xiàn),惟獨只有核酸可以使無害的R型肺炎球菌轉化為有害的S型肺炎球菌。1944年結論:DNA是生命的遺傳物質結果說明:加熱殺死的S型肺炎球菌中一定有某種特殊的生物分子或7分布:
DNA:主要在細胞核中,是染色體的主要成分。此外在線粒體、葉綠體.
RNA:主要在細胞質中,此外在線粒體、細胞核——核仁;分布:DNA:主要在細胞核中,是染色體的主8二、核酸的組成成分核酸是一種線形多聚核苷酸(polynucleotide),其基本結構單位是核苷酸(nucleotide)。戊糖堿基磷酸核苷核苷酸核酸
二、核酸的組成成分核酸是一種線形多聚核苷酸(polynu9核苷酸的基
本結構核苷酸的基
本結構10組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為β-D-2-脫氧核糖;RNA所含的糖則為β-D-核糖。(一)、核酸中的戊糖RiboseDeoxyribose組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為11從兩類核酸的水解產(chǎn)物可看到它們組成的差別?從兩類核酸的水解產(chǎn)物可看到它們組成的差別?12(二)堿基尿嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶核酸中的堿基分兩類:1、嘧啶堿(pyrimidine):是嘧啶的衍生物。(二)堿基尿嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶核酸中的堿基分兩類:13NNHHHH嘧啶123456NNHHHHNH2OH胞嘧啶Cytosine(C)NNHHHHOOHH尿嘧啶uracil(U)NNHHHHOOHHCH3胸腺嘧啶thymine(T)NNHHHH嘧啶123456NNHHHHNH2OH胞嘧啶C142、嘌呤堿(purine):由嘌呤衍生而來。2、嘌呤堿(purine):由嘌呤衍生而來。15NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH2腺嘌呤adenine(A)NNNNHHHHOH2N鳥嘌呤guanine(G)NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH2163、稀有堿基:一些修飾堿基,因含量甚少而稱之。大多為甲基化堿基,多在tRNA中。3、稀有堿基:一些修飾堿基,因含量甚少而17(三)核苷:
(nucleoside)
核苷:戊糖與堿基縮合而成,并以糖苷鍵相連接。糖苷鍵:
二者的連接是C-N鍵,稱N-糖苷鍵。(三)核苷:
(nucleoside)核苷:戊糖與堿基縮18OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNNHHHH9腺嘌呤腺苷OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNN19OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH2COHOH1′2′3′4′5′核糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷(ψ)OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH20核苷的表示:核苷:A、G、C、U脫氧核苷:dA,dG,dC,dT修飾核苷:如5-甲基胞嘧啶:m5dC。核苷的表示:核苷:A、G、C、U21(四)核苷酸(nucleotide,nt)1、種類:1)按酯化位點:可在核糖的2’-,3’-,5’-;2)按核糖類型:
核苷酸、脫氧核苷酸核苷中戊糖的羥基被磷酸酯化,即為核苷酸。(四)核苷酸(nucleotide,nt)1、種類:核苷中戊222、結構:2、結構:233、表示:與一個磷酸結合——MP:(d)AMP、(d)GMP、(d)CMP、(d)TMP、UMP與二個磷酸結合——DP:如:ADP與三個磷酸結合——TP:如:ATP
核苷酸3、表示:與一個磷酸結合——MP:(d)AMP、(d)GMP24AMPADPATPAMPADPATP254、特殊核苷酸:環(huán)核苷酸:
核糖3’-,5’-成環(huán)。
cAMP、cGMP功能:第二信使第二信使:通常把激素稱為第一信使,激素與靶位受體結合后,生成某些物質,這些物質是聯(lián)系激素引起生物學效應的重要物質,稱為第二信使。例如:cAMP、cGMP等。核苷酸cAMPcGMP4、特殊核苷酸:環(huán)核苷酸:核苷酸cAMPcGMP26肌苷酸及鳥苷酸(強力味精)酶的輔助因子的結構成分NAD、NADP、FMNIMP
GMP肌苷酸及鳥苷酸(強力味精)酶的輔助因子的結構成分IMP27(五)核苷酸的連接方式1、3’-,5’磷酸二酯鍵將核苷酸連接成核酸大分子。一、核苷酸(五)核苷酸的連接方式1、3’-,5’磷酸二酯鍵將核苷酸28OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-OO—CH2GO=P—O-3′5′OHOO—CH2OHOHAO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTAOHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-292、核酸的一級結構:多核苷酸鏈中各核苷酸殘基的排列順序稱~。2、核酸的一級結構:多核苷酸鏈中各核苷酸殘基的排列順序30OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-OO—CH2GO=P—O-3′5′OHOO—CH2OHOHAO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTA1)一級結構表示方法如上:OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-312)讀向:
堿基序列從左到右表示5’——3’,由3’-,5’磷酸二酯鍵連接。若兩鏈反向平行,則需注明每條鏈的走向。如:
5’A-T-G-C-C-T-G-A3’
3’T-A-C-G-G-A-C-T5’核苷酸2)讀向:堿基序列從左到右表示5’——332三、DNA(一)DNA的一級結構:由數(shù)量龐大的4種脫氧核苷酸通過3’-,5’磷酸二酯鍵連接成的直線形或環(huán)形多聚體。三、DNA(一)DNA的一級結構:33(二)DNA的雙螺旋二級結構1、雙螺旋結構模型建立的依據(jù):1)根據(jù)DNA堿基組成的定量分析提出chargaff堿基配對原則:A=T,G=C2)根據(jù)對DNA纖維和晶體的x-衍射分析。3)電位滴定證明。DNA(二)DNA的雙螺旋二級結構1、雙螺旋結構模型建立的依據(jù):D34(實用課件)核酸的化學35雙螺旋中的堿基對(basepair,bp)雙螺旋中的堿基對(basepair,bp)362,雙螺旋結構的特點:(Watson-Crick模型)1)形成:兩條鏈反向平行;右手螺旋。DNA2,雙螺旋結構的特點:(Watson-Crick模型)1)形372)結構:A、核糖-磷酸以3’-,5’磷酸二酯鍵連接成骨架;堿基在內(nèi);B、大溝、小溝。DNA2)結構:A、核糖-磷酸以3’-,5’磷酸二酯鍵連接成D383)尺寸:DNAA、直徑:2nm;B、堿基距離:0.34nm;C、一周10個核苷酸;D、螺距:3.4nm。3)尺寸:DNAA、直徑:2nm;B、堿基距離394)雙螺旋的穩(wěn)定性:A、依靠堿基堆積力B、氫鍵C、離子鍵4)雙螺旋的穩(wěn)定性:A、依靠堿基堆積力403.DNA的二級結構類型上頁
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章首
節(jié)首B型結構兩條鏈反向平行,右手螺旋堿基在內(nèi)(A=T,G≡C)堿基平面垂直于螺旋軸戊糖在外,雙螺旋每轉一周為10堿基對(bp)A型結構堿基平面傾斜20o,螺旋變粗變短,螺距2~3nm。Z型結構左手螺旋,只有小溝3.DNA的二級結構類型上頁下頁章首節(jié)首B型結構41幾種DNA螺旋主要構象參數(shù)
螺旋類型每圈螺旋中的堿基對數(shù)每個堿基旋轉的角(度)每個堿基對的垂直高度(nm)螺距(nm)螺旋直徑(nm)A11+32.70.2560.82.3B10+36.00.3383.42.0Z12-30.00.3714.51.8幾種DNA螺旋主要構象參數(shù) 螺旋類型每圈螺旋中的堿基對數(shù)每42B-DNA與A-DNAB-DNA與A-DNA43幾種DNA鈉鹽的特點:B-DNA:生理狀態(tài)下多為此種;92%相對濕度A-DNA:右手螺旋;75%相對濕度;生理狀態(tài)下多見dsRNA、DNA-RNAZ-DNA:人工合成、左手螺旋;嘧啶、嘌呤交替;有m5dC;與基因表達調控有關;此外,還發(fā)現(xiàn)有C、D、E等型。幾種DNA鈉鹽的特點:B-DNA:生理狀態(tài)下多為此種;9244
DNA分子間三股螺旋結構模型
DNA分子間三股螺旋結構模型45(三)DNA的三級結構DNA雙螺旋進一步扭曲即成三級結構。天然DNA有雙鏈DNA(dsDNA),有的病毒為單鏈DNA(ssDNA)在dsDNA中:
線形分子(大多數(shù))
環(huán)狀分子(dcDNA):質粒、線粒體、葉綠體、病毒、細菌DNA(三)DNA的三級結構DNA雙螺旋進一步扭曲即成DNA461、超螺旋結構特點:可將長鏈壓縮在一較小體內(nèi);密度大;凝膠電泳中移動速度快。DNA1、超螺旋結構特點:DNA47(實用課件)核酸的化學482、核小體中的
扭曲方式在真核細胞染色質中,DNA雙螺旋分子盤繞在組蛋白上形成核小體。許多核小體由DNA連成念珠狀結構,再盤繞壓縮成高層次的結構———染色體。DNA2、核小體中的
扭曲方式在真核細胞染色質中,DN49真核生物:DNA和蛋白質組裝成染色體,染色體的基本單位是核小體。核小體由DNA和組蛋白構成。組蛋白有H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B,H3和H4各兩分子構成核小體的核心,稱為組蛋白八聚體。DNA雙螺旋分子纏繞在八聚體上構成核小體的核心顆粒。核小體的核心顆粒之間再由DNA和組蛋白H1構成的連接區(qū)連接起來形成串珠狀結構。核小體進一步旋轉折疊形成棒狀染色體,將近1m長的DNA分子容納于直徑只有數(shù)微米的細胞核中。真核生物:DNA和蛋白質組裝成染色體,染色體的基本單位是核小50(四)DNA的功能1、DNA一級結構的特點基因:是含特定遺傳信息的核苷酸序列
(DNA或RNA)是遺傳物質的最小功能單位。若干bp多個基因pr+DNA染色體染色質是核中由DNA和蛋白質組成并可被蘇木精等染料染色的物質,染色質DNA含有大量基因片段,是生命的遺傳物質。DNA(四)DNA的功能1、DNA一級結構的特點DNA51弄清幾個概念
基因:基因是DNA片段的核苷酸序列,DNA分子中最小的功能單位。轉錄:DNA分子中的遺傳信息轉移到RNA分子中過程。翻譯:把以mRNA為模板合成蛋白質的過程。結構基因:為RNA或蛋白質編碼的基因.調節(jié)基因:只有調節(jié)作用,并不能轉錄生成RNA的片段.基因組:某生物體所含的全部基因稱該生物體的。弄清幾個概念521)原核生物基因組:
基因在同一染色體上。
A、除調節(jié)序列和信號序列外,多為結構基因;B、功能相關的基因常連在一起,并轉錄在同一mRNA中;DNA1)原核生物基因組:基因在同一染色體上。DNA53(實用課件)核酸的化學54C、基因有重疊;
同一核苷酸順序中包含多種生物信息。C、基因有重疊;
同一核苷酸順序中包含多種生物信552)真核生物基因組:
一般基因分布在若干染色體上。
A、有重復序列;B、有斷裂基因:即有內(nèi)含子。
內(nèi)含子(intron):DNA分子中不編碼的序列。
外顯子(exons):DNA分子中可表達的序列。DNA2)真核生物基因組:一般基因分布在若干染色體上。56內(nèi)含子與外顯子內(nèi)含子與外顯子572、DNA是遺傳信息的載體半保留復制保證了親代性狀傳到子代,保證了親代與子代的相似性。DNA2、DNA是遺傳信息的載體半保留復制DNA583、DNA是變異的物質基礎變異是生物進化的基礎。變異的發(fā)生:1)DNA復制時出錯;2)理化因素等引起堿基變化或缺失,使DNA堿基序列改變,從而發(fā)生性狀變異。DNA3、DNA是變異的物質基礎變異是生物進化的基礎。變異的發(fā)生:59四、RNA(一)RNA的結構組成:4種核苷酸,有稀有堿基;連接:同DNA形成:一般以DNA為模板合成,有例外。結構:單鏈線形分子,局部區(qū)域有雙螺旋。四、RNA(一)RNA的結構60(二)RNA的類型三種:
信使RNA(messengerRNA,mRNA)
核糖體RNA(ribosomelRNA,rRNA)
轉運RNA(transferRNA,tRNA)RNA(二)RNA的類型三種:RNA61此外,在真核細胞中還有少量:核內(nèi)小RNA(snRNA):參與核糖體的組成。不均一RNA(hnRNA):mRNA的前體。反義RNA(asRNA):可與mRNA部分或全部序列互補;抑制DNA復制、轉錄;抑制mRNA翻譯。此外,在真核細胞中還有少量:核內(nèi)小RNA(snRNA):621、tRNA約占全部RNA的15%;由70-90個核苷酸組成許多種類;沉降系數(shù)4S。RNA1、tRNA約占全部RNA的RNA631)tRNA結構:一級結構多已清楚,含較多稀有堿基;二級結構為三葉草有:aa臂、二氫嘧啶環(huán)、
反密碼環(huán)、可變環(huán)、TΨ環(huán)P198RNA1)tRNA結構:一級結構多已清楚,RNA64主要特征:1.四臂四環(huán);2.氨基酸臂3′端有CCAOH的共有結構;3.D環(huán)上有二氫尿嘧啶(D);4.反密碼環(huán)上的反密碼子與mRNA相互作用;5.可變環(huán)上的核苷酸數(shù)目可以變動;6.TψC環(huán)含有T和ψ;7.含有修飾堿基和不變核苷酸。主要特征:65tRNA三級結構為倒L型tRNA66A、在pr合成中轉運aa;B、在pr合成的起始、DNA反轉錄合成及其它代謝調節(jié)中起作用。2)tRNA功能:A、在pr合成中轉運aa;2)tRNA功能:672、mRNA和hnRNA1)合成:以DNA為模板(核內(nèi))合成hnRNA(含內(nèi)含子和外顯子)加工成熟的mRNA入細胞質蛋白質合成RNA2、mRNA和hnRNA1)合成:以DNA為模板(核內(nèi))R68合成mRNA合成mRNA69切除內(nèi)含子切除內(nèi)含子702)mRNA結構特點:3‘末端有polyA結構:與mRNA從核入質有關。5‘末端有帽子結構:G被甲基化,此可能與pro合成的起始有關。2)mRNA結構特點:3‘末端有polyA結構:與mRNA713)功能:是蛋白質合成的模板3)功能:是蛋白質合成的模板723、rRNA1)占RNA總量的80%,是構成核糖體的骨架。2)核糖體功能:
pr合成的部位.3)結構:分大、小亞基一、二級結構多已確定,但功能不清。RNA3、rRNA1)占RNA總量的80%,是構成核糖體的骨架。R73原核細胞:70S核糖體;真核細胞:80S核糖體;原核細胞:70S核糖體;74核糖體RNA自我剪切1983年在四膜蟲中發(fā)現(xiàn)RNA有催化功能核糖體RNA自我剪切1983年在四754、RNA的功能1)在DNA復制、轉錄、翻譯中起重要調控作用;2)有催化作用;3)可作為遺傳物質(如逆轉錄病毒)。RNA4、RNA的功能1)在DNA復制、轉錄、翻譯中起重要調控RN76(實用課件)核酸的化學77五、核酸的性質(一)一般理化性質1、兩性電解質:2、溶解性:微溶于水,不溶于一般有機試劑(乙醇沉淀核酸),鈉鹽易溶于水。0.14摩爾法:分離DNA蛋白和RNA蛋白的方法DNA蛋白:在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度最低.RNA蛋白:在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度較大.3、粘度高:一般DNA比RNA粘度高。4、水解性:可被酸、堿或酶水解,DNA比RNA對稀堿穩(wěn)定。核酸的性質五、核酸的性質(一)一般理化性質核酸的性質785、顏色反應:1)核糖與濃鹽酸和苔黑酚(甲基間苯二酚)共熱呈綠色,在670nm處可測RNA;2)2-脫氧核糖與酸和二苯胺共熱呈藍紫色,在595nm處可測DNA。二種反應可作定性試驗,定量試驗靈敏度低、準確性差,但快、簡便。核酸的性質5、顏色反應:1)核糖與濃鹽酸和苔黑酚(甲基間苯二酚)共熱呈79(二)紫外吸收性質堿基具共軛雙鍵強烈吸收260-290nm波段紫外光,最大吸收峰在260nm附近。應用:1、不同核苷酸有不同吸收特性,可用紫外分光光度計進行定性、定量測定。
1OD相當于:50μg/mlDNA40μg/mlRNA
核酸的性質(二)紫外吸收性質堿基具共軛雙鍵強烈吸收260-29802、確定所提取的核酸是否純品。
1)DNA:OD260/OD280≈1.8純品
2)RNA:OD260/OD280≈2.0純品在純化DNA時,通常用A260/A280=1.8-2.0作為純度標準,若大于此值,表示有RNA污染;若小于此值,則有pro或酚污染.核酸的性質2、確定所提取的核酸是否純品。核酸的性質81(三)核酸結構的穩(wěn)定性1、堿基堆積力:雙螺旋內(nèi)部堿基形成的疏水區(qū);2、堿基間的氫鍵:3、磷酸基與介質中陽離子形成的離子鍵核酸的性質(三)核酸結構的穩(wěn)定性1、堿基堆積力:雙螺旋內(nèi)部堿基形成的疏82(四)核酸的變性1、變性的概念1)現(xiàn)象:雙螺旋DNA和具雙螺旋區(qū)的RNA氫鍵斷裂,空間結構被破壞,形成單鏈無規(guī)則線團狀的過程。核酸的性質(四)核酸的變性1、變性的概念核酸的性質832)結果:A、增色效應:260nm紫外吸收增加;B、粘度下降;C、生物學性能部分或全部喪失。3)引起變性的因素:溫度、pH、尿素、甲醛等。核酸的性質2)結果:A、增色效應:核酸的性質842、熱變性與TmTm:在熱變性中,紫外吸收增加的中點值所對應的溫度,稱該DNA的熔解溫度(meltingtemperature,Tm);又稱熱解鏈溫度。(G+C)%=(Tm-69.3)*2.44核酸的性質2、熱變性與TmTm:在熱變性中,紫外吸收增加的中點值所對應853、影響Tm的因素:1)G-C含量:Tm與G-C含量成正比。2)介質中的離子強度:離子強度低,Tm低,在純水中,DNA在室溫下即可變性。3)溶液的pH.4)變性劑核酸的性質3、影響Tm的因素:1)G-C含量:Tm與G-C含量成正比。86(五)核酸的復性概念:變性DNA在適當條件下(緩慢降溫),可使兩條彼此分開的鏈重新締合成雙螺旋結構的過程。復性后,許多物化性質可得到恢復,生物學活性部分恢復。影響因素:溫度、DNA片段大小、DNA濃度、堿基重復序列多少、離子濃度。核酸的性質(五)核酸的復性概念:變性DNA在適當條件下(緩慢降溫),可87DNA變性與復性DNA變性與復性88六、分子生物學技術(一)分子雜交與探針技術1、概念:1)分子雜交(hybrization):在退火條件下,不同來源的DNA互補區(qū)形成氫鍵,或DNA單鏈和RNA鏈的互補區(qū)形成DNA-RNA雜合雙鏈的過程。DNA-DNA:DNA-RNA:分子生物學技術六、分子生物學技術(一)分子雜交與探針技術分子生物學技術892)探針(probe)用放射性同位素或熒光標記的DNA或RNA片段.確診病人細胞中提取的DNA;病毒DNA;腫瘤組織提取的DNA。分子生物學技術2)探針(probe)用放射性同位素或熒光標記的DNA或RN90(二)限制性內(nèi)切酶:1、核酸的工具酶有:
水解酶類;聚合酶類;連接酶;反轉錄酶等;分子生物學技術(二)限制性內(nèi)切酶:1、核酸的工具酶有:分子生物學技術912、水解酶:水解磷酸二酯鍵1)按專一性分:DNA水解酶、RNA水解酶2)按作用方式分:外切酶:從核酸鏈3’或5’一個個水解。內(nèi)切酶:作用于核酸鏈內(nèi)部。分子生物學技術2、水解酶:水解磷酸二酯鍵1)按專一性分:分子生物學技術923、限制性內(nèi)切酶在核苷酸鏈內(nèi)特定序列切開DNA雙鏈的酶。因切法不同,產(chǎn)生二種產(chǎn)物:交錯切——產(chǎn)生粘性末端:平切——產(chǎn)生平頭末端:分子生物學技術3、限制性內(nèi)切酶在核苷酸鏈內(nèi)特定序列切開DNA雙鏈的酶。分子93粘性末端分子生物學技術粘性末端分子生物學技術94分子生物學技術分子生物學技術95(三)Southern印跡法分子生物學技術用于檢測DNA方法:如圖(三)Southern印跡法分子生物學技術用于檢測DNA96Northern印跡法:用于檢測RNANorthern印跡法:用于檢測RNA97(四)聚合酶鏈
式反應(polymeerasechainreaction,PCR)(四)聚合酶鏈
式反應(polyme98
聚合酶鏈式反應(PCR)每一輪聚合酶鏈式反應可使目的基因片段增加一倍30輪循環(huán)可獲得——230(1.07×109)個基因片段聚合酶鏈式反應(PCR)每一輪聚合酶鏈式反應可使目的基因99應用:廣泛用于克隆、測序、產(chǎn)生特異突變、醫(yī)學診斷和法醫(yī).應用:廣泛用于克隆、測序、產(chǎn)生特異突變、醫(yī)學診斷和法醫(yī).100原理:堿基配對;聚合酶可催化在試管內(nèi)合成與模板互補的DNA新鏈;雙脫氧核苷酸無3’-OH,合成到此終止;可電泳分離隨機得到的大小不等的片段。(五)核酸序列測定原理:(五)核酸序列測定101核酸序列測定核酸序列測定102【醫(yī)學ppt課件】核酸的化學【醫(yī)學ppt課件】核酸的化學103
本章主要內(nèi)容
核苷酸
DNA
RNA
核酸的性質
本章主要內(nèi)容
核苷酸
DNA
RNA
核酸的性質
1041868年F.Miescher首先從傷員繃帶的膿細胞中分離得到稱為“核素”的核酸1944年O.N.Avery通過轉化實驗證實DNA是主要的遺傳物質1953年J.D.Watson和F.H.C.Crick提出DNA雙螺旋結構模型1958Crick提出遺傳信息傳遞的中心法則1970s建立DNA重組技術1980s后分子生物學、分子遺傳學等學科突飛猛進發(fā)展,提出并完成HGP核酸化學的發(fā)展過程上頁
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章首1868年F.Miescher首先從傷員繃帶的膿細胞中分離105
一、概述
概念
核酸(nucleicacid)是由堿基(嘌呤和嘧啶)、戊糖和磷酸組成的高分子物質,是生物體的基本組成。種類:
DNA(脫氧核糖核酸)RNA(核糖核酸)
一、概述
概念核酸(nucleicacid)是由堿106“四核苷酸假說”:核酸由四種核苷酸組成的單體構成的,缺乏結構方面的多樣性,不大可能有重要的生理功能?!八暮塑账峒僬f”:核酸由四種核苷酸組成的單體構成的,缺乏1071928年,英國S型肺炎球菌:有莢膜,菌落表面光滑R型肺炎球菌:沒有莢膜,菌落表面粗糙
著名的肺炎球菌實驗
結果說明?1928年,英國著名的肺炎球菌實驗結果說明?108結果說明:加熱殺死的S型肺炎球菌中一定有某種特殊的生物分子或遺傳物質,可以使無害的R型肺炎球菌轉化為有害的S型肺炎球菌這種生物分子或遺傳物質是什么呢?
著名的肺炎球菌實驗
紐約洛克非勒研究所Avery從加熱殺死的S型肺炎球菌將蛋白質、核酸、多糖、脂類分離出來,分別加入到無害的R型肺炎球菌中,結果發(fā)現(xiàn),惟獨只有核酸可以使無害的R型肺炎球菌轉化為有害的S型肺炎球菌。1944年結論:DNA是生命的遺傳物質結果說明:加熱殺死的S型肺炎球菌中一定有某種特殊的生物分子或109分布:
DNA:主要在細胞核中,是染色體的主要成分。此外在線粒體、葉綠體.
RNA:主要在細胞質中,此外在線粒體、細胞核——核仁;分布:DNA:主要在細胞核中,是染色體的主110二、核酸的組成成分核酸是一種線形多聚核苷酸(polynucleotide),其基本結構單位是核苷酸(nucleotide)。戊糖堿基磷酸核苷核苷酸核酸
二、核酸的組成成分核酸是一種線形多聚核苷酸(polynu111核苷酸的基
本結構核苷酸的基
本結構112組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為β-D-2-脫氧核糖;RNA所含的糖則為β-D-核糖。(一)、核酸中的戊糖RiboseDeoxyribose組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為113從兩類核酸的水解產(chǎn)物可看到它們組成的差別?從兩類核酸的水解產(chǎn)物可看到它們組成的差別?114(二)堿基尿嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶核酸中的堿基分兩類:1、嘧啶堿(pyrimidine):是嘧啶的衍生物。(二)堿基尿嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶核酸中的堿基分兩類:115NNHHHH嘧啶123456NNHHHHNH2OH胞嘧啶Cytosine(C)NNHHHHOOHH尿嘧啶uracil(U)NNHHHHOOHHCH3胸腺嘧啶thymine(T)NNHHHH嘧啶123456NNHHHHNH2OH胞嘧啶C1162、嘌呤堿(purine):由嘌呤衍生而來。2、嘌呤堿(purine):由嘌呤衍生而來。117NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH2腺嘌呤adenine(A)NNNNHHHHOH2N鳥嘌呤guanine(G)NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH21183、稀有堿基:一些修飾堿基,因含量甚少而稱之。大多為甲基化堿基,多在tRNA中。3、稀有堿基:一些修飾堿基,因含量甚少而119(三)核苷:
(nucleoside)
核苷:戊糖與堿基縮合而成,并以糖苷鍵相連接。糖苷鍵:
二者的連接是C-N鍵,稱N-糖苷鍵。(三)核苷:
(nucleoside)核苷:戊糖與堿基縮120OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNNHHHH9腺嘌呤腺苷OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNN121OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH2COHOH1′2′3′4′5′核糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷(ψ)OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH122核苷的表示:核苷:A、G、C、U脫氧核苷:dA,dG,dC,dT修飾核苷:如5-甲基胞嘧啶:m5dC。核苷的表示:核苷:A、G、C、U123(四)核苷酸(nucleotide,nt)1、種類:1)按酯化位點:可在核糖的2’-,3’-,5’-;2)按核糖類型:
核苷酸、脫氧核苷酸核苷中戊糖的羥基被磷酸酯化,即為核苷酸。(四)核苷酸(nucleotide,nt)1、種類:核苷中戊1242、結構:2、結構:1253、表示:與一個磷酸結合——MP:(d)AMP、(d)GMP、(d)CMP、(d)TMP、UMP與二個磷酸結合——DP:如:ADP與三個磷酸結合——TP:如:ATP
核苷酸3、表示:與一個磷酸結合——MP:(d)AMP、(d)GMP126AMPADPATPAMPADPATP1274、特殊核苷酸:環(huán)核苷酸:
核糖3’-,5’-成環(huán)。
cAMP、cGMP功能:第二信使第二信使:通常把激素稱為第一信使,激素與靶位受體結合后,生成某些物質,這些物質是聯(lián)系激素引起生物學效應的重要物質,稱為第二信使。例如:cAMP、cGMP等。核苷酸cAMPcGMP4、特殊核苷酸:環(huán)核苷酸:核苷酸cAMPcGMP128肌苷酸及鳥苷酸(強力味精)酶的輔助因子的結構成分NAD、NADP、FMNIMP
GMP肌苷酸及鳥苷酸(強力味精)酶的輔助因子的結構成分IMP129(五)核苷酸的連接方式1、3’-,5’磷酸二酯鍵將核苷酸連接成核酸大分子。一、核苷酸(五)核苷酸的連接方式1、3’-,5’磷酸二酯鍵將核苷酸130OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-OO—CH2GO=P—O-3′5′OHOO—CH2OHOHAO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTAOHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-1312、核酸的一級結構:多核苷酸鏈中各核苷酸殘基的排列順序稱~。2、核酸的一級結構:多核苷酸鏈中各核苷酸殘基的排列順序132OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-OO—CH2GO=P—O-3′5′OHOO—CH2OHOHAO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTA1)一級結構表示方法如上:OHO-OO—CH2TO=P—O-3′5′OHOHO-1332)讀向:
堿基序列從左到右表示5’——3’,由3’-,5’磷酸二酯鍵連接。若兩鏈反向平行,則需注明每條鏈的走向。如:
5’A-T-G-C-C-T-G-A3’
3’T-A-C-G-G-A-C-T5’核苷酸2)讀向:堿基序列從左到右表示5’——3134三、DNA(一)DNA的一級結構:由數(shù)量龐大的4種脫氧核苷酸通過3’-,5’磷酸二酯鍵連接成的直線形或環(huán)形多聚體。三、DNA(一)DNA的一級結構:135(二)DNA的雙螺旋二級結構1、雙螺旋結構模型建立的依據(jù):1)根據(jù)DNA堿基組成的定量分析提出chargaff堿基配對原則:A=T,G=C2)根據(jù)對DNA纖維和晶體的x-衍射分析。3)電位滴定證明。DNA(二)DNA的雙螺旋二級結構1、雙螺旋結構模型建立的依據(jù):D136(實用課件)核酸的化學137雙螺旋中的堿基對(basepair,bp)雙螺旋中的堿基對(basepair,bp)1382,雙螺旋結構的特點:(Watson-Crick模型)1)形成:兩條鏈反向平行;右手螺旋。DNA2,雙螺旋結構的特點:(Watson-Crick模型)1)形1392)結構:A、核糖-磷酸以3’-,5’磷酸二酯鍵連接成骨架;堿基在內(nèi);B、大溝、小溝。DNA2)結構:A、核糖-磷酸以3’-,5’磷酸二酯鍵連接成D1403)尺寸:DNAA、直徑:2nm;B、堿基距離:0.34nm;C、一周10個核苷酸;D、螺距:3.4nm。3)尺寸:DNAA、直徑:2nm;B、堿基距離1414)雙螺旋的穩(wěn)定性:A、依靠堿基堆積力B、氫鍵C、離子鍵4)雙螺旋的穩(wěn)定性:A、依靠堿基堆積力1423.DNA的二級結構類型上頁
下頁
章首
節(jié)首B型結構兩條鏈反向平行,右手螺旋堿基在內(nèi)(A=T,G≡C)堿基平面垂直于螺旋軸戊糖在外,雙螺旋每轉一周為10堿基對(bp)A型結構堿基平面傾斜20o,螺旋變粗變短,螺距2~3nm。Z型結構左手螺旋,只有小溝3.DNA的二級結構類型上頁下頁章首節(jié)首B型結構143幾種DNA螺旋主要構象參數(shù)
螺旋類型每圈螺旋中的堿基對數(shù)每個堿基旋轉的角(度)每個堿基對的垂直高度(nm)螺距(nm)螺旋直徑(nm)A11+32.70.2560.82.3B10+36.00.3383.42.0Z12-30.00.3714.51.8幾種DNA螺旋主要構象參數(shù) 螺旋類型每圈螺旋中的堿基對數(shù)每144B-DNA與A-DNAB-DNA與A-DNA145幾種DNA鈉鹽的特點:B-DNA:生理狀態(tài)下多為此種;92%相對濕度A-DNA:右手螺旋;75%相對濕度;生理狀態(tài)下多見dsRNA、DNA-RNAZ-DNA:人工合成、左手螺旋;嘧啶、嘌呤交替;有m5dC;與基因表達調控有關;此外,還發(fā)現(xiàn)有C、D、E等型。幾種DNA鈉鹽的特點:B-DNA:生理狀態(tài)下多為此種;92146
DNA分子間三股螺旋結構模型
DNA分子間三股螺旋結構模型147(三)DNA的三級結構DNA雙螺旋進一步扭曲即成三級結構。天然DNA有雙鏈DNA(dsDNA),有的病毒為單鏈DNA(ssDNA)在dsDNA中:
線形分子(大多數(shù))
環(huán)狀分子(dcDNA):質粒、線粒體、葉綠體、病毒、細菌DNA(三)DNA的三級結構DNA雙螺旋進一步扭曲即成DNA1481、超螺旋結構特點:可將長鏈壓縮在一較小體內(nèi);密度大;凝膠電泳中移動速度快。DNA1、超螺旋結構特點:DNA149(實用課件)核酸的化學1502、核小體中的
扭曲方式在真核細胞染色質中,DNA雙螺旋分子盤繞在組蛋白上形成核小體。許多核小體由DNA連成念珠狀結構,再盤繞壓縮成高層次的結構———染色體。DNA2、核小體中的
扭曲方式在真核細胞染色質中,DN151真核生物:DNA和蛋白質組裝成染色體,染色體的基本單位是核小體。核小體由DNA和組蛋白構成。組蛋白有H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B,H3和H4各兩分子構成核小體的核心,稱為組蛋白八聚體。DNA雙螺旋分子纏繞在八聚體上構成核小體的核心顆粒。核小體的核心顆粒之間再由DNA和組蛋白H1構成的連接區(qū)連接起來形成串珠狀結構。核小體進一步旋轉折疊形成棒狀染色體,將近1m長的DNA分子容納于直徑只有數(shù)微米的細胞核中。真核生物:DNA和蛋白質組裝成染色體,染色體的基本單位是核小152(四)DNA的功能1、DNA一級結構的特點基因:是含特定遺傳信息的核苷酸序列
(DNA或RNA)是遺傳物質的最小功能單位。若干bp多個基因pr+DNA染色體染色質是核中由DNA和蛋白質組成并可被蘇木精等染料染色的物質,染色質DNA含有大量基因片段,是生命的遺傳物質。DNA(四)DNA的功能1、DNA一級結構的特點DNA153弄清幾個概念
基因:基因是DNA片段的核苷酸序列,DNA分子中最小的功能單位。轉錄:DNA分子中的遺傳信息轉移到RNA分子中過程。翻譯:把以mRNA為模板合成蛋白質的過程。結構基因:為RNA或蛋白質編碼的基因.調節(jié)基因:只有調節(jié)作用,并不能轉錄生成RNA的片段.基因組:某生物體所含的全部基因稱該生物體的。弄清幾個概念1541)原核生物基因組:
基因在同一染色體上。
A、除調節(jié)序列和信號序列外,多為結構基因;B、功能相關的基因常連在一起,并轉錄在同一mRNA中;DNA1)原核生物基因組:基因在同一染色體上。DNA155(實用課件)核酸的化學156C、基因有重疊;
同一核苷酸順序中包含多種生物信息。C、基因有重疊;
同一核苷酸順序中包含多種生物信1572)真核生物基因組:
一般基因分布在若干染色體上。
A、有重復序列;B、有斷裂基因:即有內(nèi)含子。
內(nèi)含子(intron):DNA分子中不編碼的序列。
外顯子(exons):DNA分子中可表達的序列。DNA2)真核生物基因組:一般基因分布在若干染色體上。158內(nèi)含子與外顯子內(nèi)含子與外顯子1592、DNA是遺傳信息的載體半保留復制保證了親代性狀傳到子代,保證了親代與子代的相似性。DNA2、DNA是遺傳信息的載體半保留復制DNA1603、DNA是變異的物質基礎變異是生物進化的基礎。變異的發(fā)生:1)DNA復制時出錯;2)理化因素等引起堿基變化或缺失,使DNA堿基序列改變,從而發(fā)生性狀變異。DNA3、DNA是變異的物質基礎變異是生物進化的基礎。變異的發(fā)生:161四、RNA(一)RNA的結構組成:4種核苷酸,有稀有堿基;連接:同DNA形成:一般以DNA為模板合成,有例外。結構:單鏈線形分子,局部區(qū)域有雙螺旋。四、RNA(一)RNA的結構162(二)RNA的類型三種:
信使RNA(messengerRNA,mRNA)
核糖體RNA(ribosomelRNA,rRNA)
轉運RNA(transferRNA,tRNA)RNA(二)RNA的類型三種:RNA163此外,在真核細胞中還有少量:核內(nèi)小RNA(snRNA):參與核糖體的組成。不均一RNA(hnRNA):mRNA的前體。反義RNA(asRNA):可與mRNA部分或全部序列互補;抑制DNA復制、轉錄;抑制mRNA翻譯。此外,在真核細胞中還有少量:核內(nèi)小RNA(snRNA):1641、tRNA約占全部RNA的15%;由70-90個核苷酸組成許多種類;沉降系數(shù)4S。RNA1、tRNA約占全部RNA的RNA1651)tRNA結構:一級結構多已清楚,含較多稀有堿基;二級結構為三葉草有:aa臂、二氫嘧啶環(huán)、
反密碼環(huán)、可變環(huán)、TΨ環(huán)P198RNA1)tRNA結構:一級結構多已清楚,RNA166主要特征:1.四臂四環(huán);2.氨基酸臂3′端有CCAOH的共有結構;3.D環(huán)上有二氫尿嘧啶(D);4.反密碼環(huán)上的反密碼子與mRNA相互作用;5.可變環(huán)上的核苷酸數(shù)目可以變動;6.TψC環(huán)含有T和ψ;7.含有修飾堿基和不變核苷酸。主要特征:167tRNA三級結構為倒L型tRNA168A、在pr合成中轉運aa;B、在pr合成的起始、DNA反轉錄合成及其它代謝調節(jié)中起作用。2)tRNA功能:A、在pr合成中轉運aa;2)tRNA功能:1692、mRNA和hnRNA1)合成:以DNA為模板(核內(nèi))合成hnRNA(含內(nèi)含子和外顯子)加工成熟的mRNA入細胞質蛋白質合成RNA2、mRNA和hnRNA1)合成:以DNA為模板(核內(nèi))R170合成mRNA合成mRNA171切除內(nèi)含子切除內(nèi)含子1722)mRNA結構特點:3‘末端有polyA結構:與mRNA從核入質有關。5‘末端有帽子結構:G被甲基化,此可能與pro合成的起始有關。2)mRNA結構特點:3‘末端有polyA結構:與mRNA1733)功能:是蛋白質合成的模板3)功能:是蛋白質合成的模板1743、rRNA1)占RNA總量的80%,是構成核糖體的骨架。2)核糖體功能:
pr合成的部位.3)結構:分大、小亞基一、二級結構多已確定,但功能不清。RNA3、rRNA1)占RNA總量的80%,是構成核糖體的骨架。R175原核細胞:70S核糖體;真核細胞:80S核糖體;原核細胞:70S核糖體;176核糖體RNA自我剪切1983年在四膜蟲中發(fā)現(xiàn)RNA有催化功能核糖體RNA自我剪切1983年在四1774、RNA的功能1)在DNA復制、轉錄、翻譯中起重要調控作用;2)有催化作用;3)可作為遺傳物質(如逆轉錄病毒)。RNA4、RNA的功能1)在DNA復制、轉錄、翻譯中起重要調控RN178(實用課件)核酸的化學179五、核酸的性質(一)一般理化性質1、兩性電解質:2、溶解性:微溶于水,不溶于一般有機試劑(乙醇沉淀核酸),鈉鹽易溶于水。0.14摩爾法:分離DNA蛋白和RNA蛋白的方法DNA蛋白:在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度最低.RNA蛋白:在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度較大.3、粘度高:一般DNA比RNA粘度高。4、水解性:可被酸、堿或酶水解,DNA比RNA對稀堿穩(wěn)定。核酸的性質五、核酸的性質(一)一般理化性質核酸的性質1805、顏色反應:1)核糖與濃鹽酸和苔黑酚(甲基間苯二酚)共熱呈綠色,在670nm處可測RNA;2)2-脫氧核糖與酸和二苯胺共熱呈藍紫色,在595nm處可測DNA。二種反應可作定性試驗,定量試驗靈敏度低、準確性差,但快、簡便。核酸的性質5、顏色反應:1)核糖與濃鹽酸和苔黑酚(甲基間苯二酚)共熱呈181(二)紫外吸收性質堿基具共軛雙鍵強烈吸收260-290nm波段紫外光,最大吸收峰在260nm附近。應用:1、不同核苷酸有不同吸收特性,可用紫外分光光度計進行定性、定量測定。
1OD相當于:50μg/mlDNA40μg/mlRNA
核酸的性質(二)紫外吸收性質堿基具共軛雙鍵強烈吸收260-291822、確定所提取的核酸是否純品。
1)DNA:OD260/OD280≈1.8純品
2)RNA:OD260/OD280≈2.0純品在純化DNA時,通常用A260/A280=1.8-2.0作為純
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