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生物化學(xué)酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)化學(xué)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響酶的抑制作用溫度、pH及激活劑對(duì)酶反應(yīng)的影響目的與要求
重點(diǎn)掌握酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué):米氏方程、溫度、pH、激活劑、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響;掌握三種可逆抑制作用的動(dòng)力學(xué)特點(diǎn)。化學(xué)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)各級(jí)反應(yīng)的特征1一級(jí)反應(yīng)t1/2≈0.693/k2二級(jí)反應(yīng)t1/2=1/ka3零級(jí)反應(yīng)t1/2=a/2k
酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)是研究酶促反應(yīng)速度及其影響因素的科學(xué)。酶促反應(yīng)的影響因素主要包括酶的濃度、底物的濃度、pH、溫度、抑制劑和激活劑等。
1902年,Henri用蔗糖酶水解蔗糖的實(shí)驗(yàn)中觀察到:在蔗糖酶酶的濃度一定的條件下測(cè)定底物(蔗糖)濃度對(duì)酶反應(yīng)速度的影響,它們之間的關(guān)系呈現(xiàn)矩形雙曲線(rectangularhyperbola)。如下圖所示:一、底物濃度對(duì)反應(yīng)速度的影響(一)單底物的酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)
在底物濃度很低時(shí),反應(yīng)速度隨底物濃度的增加而急驟加快,兩者呈正比關(guān)系,表現(xiàn)為一級(jí)反應(yīng)。隨著底物濃度的升高,反應(yīng)速度不再呈正比例加快,反應(yīng)速度增加的幅度不斷下降。如果繼續(xù)加大底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級(jí)反應(yīng)。此時(shí),無(wú)論底物濃度增加多大,反應(yīng)速度也不再增加,說(shuō)明酶已被底物所飽和。所有的酶都有飽和現(xiàn)象,只是達(dá)到飽和時(shí)所需底物濃度各不相同而已。為解釋酶被底物飽和現(xiàn)象,Michaelis和Menten做了大量的定量研究,積累了足夠的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),提出了酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程:1、米氏方程的推導(dǎo)根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō):E+SESE+P
k1k2k3k4米氏方程是在三個(gè)假設(shè)的基礎(chǔ)上建立的:1、反應(yīng)初期,產(chǎn)物的生成量極少,E+P→ES可忽略不計(jì);2、〔S〕>>〔E〕,[S]-[ES]≈[S]3、反應(yīng)系統(tǒng)處于穩(wěn)態(tài)平衡狀態(tài),即〔ES〕的形成速度等于〔ES〕的分解速度:d〔ES〕/dt=-d〔ES〕/dtES的形成速度:d〔ES〕/dt=k1〔E〕〔S〕ES的分解速度:-d〔ES〕/dt=(k2+k3)〔ES〕穩(wěn)態(tài)平衡下,k1〔E〕〔S〕=(k2+k3)〔ES〕即:〔E〕〔S〕/〔ES〕=(k2+k3)/k1=Km而〔E〕=[E]t-〔ES〕代入得:
而酶促反應(yīng)的生成速度即是產(chǎn)物的生成速度:VO
=k3〔ES〕=k3[E]t〔S〕/(Km+〔S〕)=Vmax〔S〕/(Km+〔S〕)其中:Vmax=k3[E]t即為酶促反應(yīng)可達(dá)到的最大反應(yīng)速度V=Vmax[S]Km+[S]Vmax指該酶促反應(yīng)的最大速度,[S]為底物濃度,Km是米氏常數(shù),VO是在某一底物濃度時(shí)相應(yīng)的反應(yīng)速度。從米氏方程可知:
當(dāng)?shù)孜餄舛群艿蜁r(shí)[S]<<Km,則V≌Vmax[S]/Km,反應(yīng)速度與底物濃度呈正比;
當(dāng)?shù)孜餄舛群芨邥r(shí),[S]>>Km,此時(shí)V≌Vmax,反應(yīng)速度達(dá)最大速度,底物濃度再增高也不影響反應(yīng)速度。2.米氏常數(shù)的意義(1).物理意義:Km值等于酶反應(yīng)速度為最大速度一半時(shí)的底物濃度。(2).Km值愈大,酶與底物的親和力愈??;Km值愈小,酶與底物親和力愈大。酶與底物親和力大,表示不需要很高的底物濃度,便可容易地達(dá)到最大反應(yīng)速度。(3).Km值是酶的特征性常數(shù),只與酶的性質(zhì),酶所催化的底物和酶促反應(yīng)條件(如溫度、pH、有無(wú)抑制劑等)有關(guān),與酶的濃度無(wú)關(guān)。酶的種類不同,Km值不同,同一種酶與不同底物作用時(shí),Km值也不同。各種酶的Km值范圍很廣,大致在10-1~10-6M之間。3.Km在實(shí)際應(yīng)用中的重要意義(1).鑒定酶:通過(guò)測(cè)定可以鑒別不同來(lái)源或相同來(lái)源但在不同發(fā)育階段、不同生理狀態(tài)下催化相同反應(yīng)的酶是否屬于同一種酶。(2).判斷酶的最佳底物:如果一種酶可作用于多個(gè)底物,就有幾個(gè)Km值,其中Km最小對(duì)應(yīng)的底物就是酶的天然底物。如蔗糖酶既可催化蔗糖水解(Km=28mmol/L),也可催化棉子糖水解(Km=350mmol/L),兩者相比,蔗糖為該酶的天然底物。(3).計(jì)算一定速度下的底物濃度:如某一反應(yīng)要求的反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度的99%,則[S]=99Km(4).了解酶的底物在體內(nèi)具有的濃度水平:一般地,體內(nèi)酶的天然底物的[S]體內(nèi)≈Km,如果[S]體內(nèi)<<Km,那么VO
<<Vmax,細(xì)胞中的酶處于“浪費(fèi)”狀態(tài),反之,[S]體內(nèi)>>Km,那么VO
≈Vmax,底物濃度失去生理意義,也不符合實(shí)際狀態(tài)。(5).判斷反應(yīng)方向或趨勢(shì):催化正逆反應(yīng)的酶,其正逆兩向的反應(yīng)的Km不同,可以根據(jù)底物和產(chǎn)物的濃度推測(cè)其反應(yīng)的方向,如果正逆反應(yīng)的底物濃度相當(dāng),則反應(yīng)趨向于Km小對(duì)應(yīng)底物的反應(yīng)方向。4.Km求法:A。B.。稱為L(zhǎng)ineweaver-Buck方程(或雙倒數(shù)方程)(doublereciprocalplotorLineweaverBurkplot)方程:
用1/V0對(duì)1/[S]的作圖得一直線,其斜率是Km/Vmax,,在縱軸上的截距為1/Vmax,橫軸上的截距為-1/Km。此作圖除用來(lái)求Km和Vmax值外,在研究酶的抑制作用方面還有重要價(jià)值。雙倒數(shù)作圖法(二)雙底物的反應(yīng)雙底物反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)1乒乓反應(yīng)動(dòng)力學(xué)2序列反應(yīng)動(dòng)力學(xué)二.酶濃度的影響在一定溫度和pH下,酶促反應(yīng)在底物濃度大大超過(guò)酶濃度時(shí),速度與酶的濃度呈正比。酶濃度對(duì)速度的影響機(jī)理:酶濃度增加,[ES]也增加,而V0=k3[ES],故反應(yīng)速度增加。三.溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響酶促反應(yīng)與其它化學(xué)反應(yīng)一樣,隨溫度的增加,反應(yīng)速度加快?;瘜W(xué)反應(yīng)中溫度每增加10℃反應(yīng)速度增加的倍數(shù)稱為溫度系數(shù)Q10。一般的化學(xué)反應(yīng)的Q10為2~3,而酶促反應(yīng)的Q10為1~2。在一定范圍內(nèi),反應(yīng)速度達(dá)到最大時(shí)對(duì)應(yīng)的溫度稱為該酶促反應(yīng)的最適溫度(optimumtemperatureTm).一般動(dòng)物組織中的酶其最適溫度為35~40℃,植物與微生物中的酶其最適溫度為30~60℃,少數(shù)酶可達(dá)60℃以上,如細(xì)菌淀粉水解酶的最適溫度90℃以上。溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響機(jī)理:1.溫度影響反應(yīng)體系中的活化分子數(shù):溫度增加,活化分子數(shù)增加,反應(yīng)速度增加。2.溫度影響酶的活性:過(guò)高的溫度使酶變性失活,反應(yīng)速度下降。最適溫度不是酶的特征常數(shù),因?yàn)橐环N酶的最適溫度不是一成不變的,它要受到酶的純度、底物、激活劑、抑制劑、酶反應(yīng)時(shí)間等因素的影響。因此,酶的最適溫度與其它反應(yīng)條件有關(guān)。四.pH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響大多數(shù)酶的活性受pH影響顯著,在某一pH下表現(xiàn)最大活力,高于或低于此pH,酶活力顯著下降。酶表現(xiàn)最大活力的pH稱為酶的最適pH(optimumpHpHm)。典型的酶速度-pH曲線是較窄的鐘罩型曲線,但有的酶的速度-pH曲線并非一定呈鐘罩型。如胃蛋白酶和木瓜蛋白酶的速度-pH曲線。胃蛋白酶的速度-溫度曲線如下圖:胃蛋白酶和葡萄糖-6-磷酸酶的pH活性曲線:
pH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響機(jī)理:1、pH影響酶和底物的解離:酶的活性基團(tuán)的解離受pH影響,底物有的也能解離,其解離狀態(tài)也受pH的影響,在某一反應(yīng)pH下,二者的解離狀態(tài)最有利于它們的結(jié)合,酶促反應(yīng)表現(xiàn)出最大活力,此pH稱為酶的最適pH;當(dāng)反應(yīng)pH偏離最適pH時(shí),酶促反應(yīng)速度顯著下降。2、pH影響酶分子的構(gòu)象:過(guò)高或過(guò)低pH都會(huì)影響酶分子活性中心的構(gòu)象,或引起酶的變性失活。
動(dòng)物體內(nèi)多數(shù)酶的最適pH值接近中性,但也有例外,如胃蛋白酶的最適pH約1.8,肝精氨酸酶最適pH約為9.8(見(jiàn)下表)。一些酶的最適pH五.激活劑對(duì)酶反應(yīng)速度的影響能使酶活性提高的物質(zhì),都稱為激活劑(activator),其中大部分是離子或簡(jiǎn)單的有機(jī)化合物。如Mg++是多種激酶和合成酶的激活劑,動(dòng)物唾液中的α-淀粉酶則受Cl-的激活。
通常,酶對(duì)激活劑有一定的選擇性,且有一定的濃度要求,一種酶的激活劑對(duì)另一種酶來(lái)說(shuō)可能是抑制劑,當(dāng)激活劑的濃度超過(guò)一定的范圍時(shí),它就成為抑制劑。
六、抑制劑對(duì)反應(yīng)速度的影響凡能使酶的活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱為酶的抑制劑(inhibitor)。使酶變性失活(稱為酶的鈍化)的因素如強(qiáng)酸、強(qiáng)堿等,不屬于抑制劑。通常抑制作用分為可逆性抑制和不可逆性抑制兩類。
(一)不可逆性抑制作用
不可逆性抑制作用的抑制劑,通常以共價(jià)鍵方式與酶的必需基團(tuán)進(jìn)行不可逆結(jié)合而使酶喪失活性。常見(jiàn)的不可逆抑制劑如下圖所示。按其作用特點(diǎn),又分專一性及非專一性兩種。
1.非專一性不可逆抑制抑制劑與酶分子中一類或幾類基團(tuán)作用,不論是必需基團(tuán)與否,皆可共價(jià)結(jié)合,由于其中必需基團(tuán)也被抑制劑結(jié)合,從而導(dǎo)致酶的抑制失活。某些重金屬(Pb++、Cu++、Hg++)及對(duì)氯汞苯甲酸等,能與酶分子的巰基進(jìn)行不可逆適合,許多以巰基作為必需基團(tuán)的酶(通稱巰基酶),會(huì)因此而遭受抑制,屬于此種類型。用二巰基丙醇(britishantilewisite,BAL)或二巰基丁二酸鈉等含巰基的化合物可使酶復(fù)活。2.專一性不可逆抑制
此屬抑制劑專一地作用于酶的活性中心或其必需基團(tuán),進(jìn)行共價(jià)結(jié)合,從而抑制酶的活性。有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑能專一作用于膽堿酯酶活性中心的絲氨酸殘基,使其磷?;豢赡嬉种泼傅幕钚?。當(dāng)膽堿酯酶被有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑抑制后,乙酰膽堿不能及時(shí)分解成乙酸和膽堿,引起乙酰膽堿的積累,使一些以乙酰膽堿為傳導(dǎo)介質(zhì)的神經(jīng)系統(tǒng)處于過(guò)度興奮狀態(tài),引起神經(jīng)中毒癥狀。解磷定等藥物可與有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑結(jié)合,使酶和有機(jī)磷殺蟲(chóng)劑分離而復(fù)活。(二)可逆性抑制
抑制劑與酶以非共價(jià)鍵結(jié)合,在用透析等物理方法除去抑制劑后,酶的活性能恢復(fù),即抑制劑與酶的結(jié)合是可逆的。這類抑制劑大致可分為以下二類:
1.競(jìng)爭(zhēng)性抑制(competitiveinhibition)(1)含義和反應(yīng)式抑制劑I和底物S對(duì)游離酶E的結(jié)合有競(jìng)爭(zhēng)作用,互相排斥,已結(jié)合底物的ES復(fù)合體,不能再結(jié)合I。同樣已結(jié)合抑制劑的EI復(fù)合體,不能再結(jié)合S。(2)特點(diǎn):①抑制劑I與底物S在化學(xué)結(jié)構(gòu)上相似,能與底物S競(jìng)爭(zhēng)酶E分子活性中心的結(jié)合基團(tuán).例如,丙二酸、蘋(píng)果酸及草酰乙酸皆和琥珀酸的結(jié)構(gòu)相似,是琥珀酸脫氫酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。
②抑制程度取決于抑制劑與底物的濃度比、〔ES〕和〔EI〕的相對(duì)穩(wěn)定性;③加大底物濃度,可使抑制作用減弱甚至消除。(3)競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑的動(dòng)力學(xué)方程
E+SESE+Pk1k2k3由米氏方程得:Km=①Ki=②〔E〕=〔E〕t-〔ES〕-〔EI〕③〔Ef〕〔S〕〔ES〕〔Ef〕〔I〕〔EI〕EI+Iki1ki2Ki=ki2/ki1解方程①②③得:〔ES〕=〔E〕t
(1+)+1Km〔S〕〔I〕Ki又因v=k3〔ES〕,代入上式得:V=
(1+)+〔S〕Km〔I〕KiVmax〔S〕競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑雙倒數(shù)曲線,如下圖所示:有競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑存在的曲線與無(wú)抑制劑的曲線相交于縱坐標(biāo)I/Vmax處,但橫坐標(biāo)的截距,因競(jìng)爭(zhēng)性抑制存在變小,說(shuō)明該抑制作用,并不影響酶促反應(yīng)的最大速度Vmax,而使Km值變大。1v=(1+)KmVmax〔S〕1+Vmax1〔I〕Ki很多藥物都是酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。例如磺胺藥與對(duì)氨基苯甲酸具有類似的結(jié)構(gòu),而對(duì)氨基苯甲酸、二氫喋呤及谷氨酸是某些細(xì)菌合成二氫葉酸的原料,后者能轉(zhuǎn)變?yōu)樗臍淙~酸,它是細(xì)菌合成核酸不可缺少的輔酶。由于磺胺藥是二氫葉酸合成酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,進(jìn)而減少細(xì)菌體內(nèi)四氫葉酸的合成,使核酸合成障礙,導(dǎo)致細(xì)菌死亡??咕鲂?甲氧芐氨嘧啶(TMP)能特異地抑制細(xì)菌的二氫葉酸還原為四氫葉酸,故能增強(qiáng)磺胺藥的作用?;前匪幬锏囊志饔?.非競(jìng)爭(zhēng)性抑制(non-competitiveinhibition)(1)含義和反應(yīng)式抑制劑I和底物S與酶E的結(jié)合完全互不相關(guān),既不排斥,也不促進(jìn)結(jié)合,抑制劑I可以和酶E結(jié)合生成EI,也可以和ES復(fù)合物結(jié)合生成ESI。底物S和酶E結(jié)合成ES后,仍可與I結(jié)合生成ESI,但一旦形成ESI復(fù)合物,再不能釋放形成產(chǎn)物P。(2)特點(diǎn):
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