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第2章生命的化學(xué)特征ChemicalPropertiesofLife1本章主要內(nèi)容1.組成生命有機(jī)體的元素2.生物大分子3.生命有機(jī)體中的化學(xué)鍵4.生物能量學(xué)5.水在生命化學(xué)中的作用
2
重點(diǎn)與難點(diǎn):生物大分子與化學(xué)鍵生物能量學(xué)
31.生命中的元素生命與非生命物質(zhì)在化學(xué)組成上有很大的差異,然而組成生命物質(zhì)的元素都是存在于非生命界的元素。
天然存在的90多種大約30多種是生命所必須的。
4是組成生命體最基本的元素,生命體總質(zhì)量的99%,是構(gòu)成糖類、脂類、蛋白質(zhì)和核酸的主要元素。外層軌道上有一個(gè)或1個(gè)以上未成對(duì)電子,可以形成單鍵、雙鍵和三鍵。
(1)C、H、O和N56生物分子中的共價(jià)鍵與鍵能類型鍵能(kJ/mol)類型鍵能*(kJ/mol)單鍵雙鍵
O-H
458
C=O
708
H-H
433
C=N
612
P-O
416
C=C
608
C-H
413
P=O
500
C-O
350三鍵**
C-C
346
C≡C
813
S-H
338
C-N
297
C-S
258
N-O
220
S-S
2127(2)S和P可以形成相對(duì)比較弱的化學(xué)鍵,在化學(xué)基團(tuán)和能量轉(zhuǎn)移中有重要作用。
巰基(-SH):用于攜帶和轉(zhuǎn)移脂?;?/p>
三磷酸酰苷(ATP):用于貯存和轉(zhuǎn)移化學(xué)能。8維持細(xì)胞滲透壓、細(xì)胞容積、離子平衡、細(xì)胞電位。
Na+、K+離子:滲透壓的平衡,神經(jīng)肌肉正常興奮性,糖原合成和蛋白質(zhì)代謝。
Mg+:300多種酶的輔因子。
Ca2+:骨骼的主要成分,參與廣泛的細(xì)胞生理活動(dòng),如物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)與分泌,血液凝固,是細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)的第二信使等。(3)K、Na、Cl、Ca、Mg9
主要有鐵與銅:化學(xué)價(jià)可(Cu2+/Cu+
,F(xiàn)e3+/Fe2+),在生物氧化過程中作為電子遞體,是許多酶的輔因子。
(4)其它的微量元素102生物分子(biologicalmacromolecules)(1)生物大分子
參與生命有機(jī)體活動(dòng)的許多分子是非常巨大的,我們把生物機(jī)體中這些巨大的分子稱為生物大分子。血紅蛋白的空間結(jié)構(gòu)11
生物大分子通過組成它們的單體之間的非共價(jià)相互作用,形成特定的空間結(jié)構(gòu),從而具有了不同的生物學(xué)功能。
生物大分子是表現(xiàn)生命特征的基本物質(zhì)。
12(2)有機(jī)小分子
細(xì)胞中還存在許多具有獨(dú)特功能的有機(jī)小分子物質(zhì),也是合成較大分子的前體。核苷酸、氨基酸、葡萄糖脂肪酸、膽堿、甘油等13(3)核酸、蛋白質(zhì)和多糖等主要生物大分子14蛋白質(zhì)的功能催化功能結(jié)構(gòu)組成儲(chǔ)存運(yùn)輸功能運(yùn)動(dòng)功能防御功能營(yíng)養(yǎng)功能調(diào)節(jié)功能遺傳信息15(4)類脂
類脂(如磷脂)是富含碳?xì)湓氐囊蛔迳镄》肿?,其在水溶液中溶解性較差、兼具親水和親脂特性。細(xì)胞的膜結(jié)構(gòu)就是大量磷脂分子的聚合體。
16173.生命有機(jī)體中的化學(xué)鍵
在生物大分子之間主要存在的非共價(jià)的相互作用力包括氫鍵、離子鍵、范德瓦爾力、疏水力。
(1)氫鍵(hydrogenbonds):
存在于帶電荷的和不帶電荷的分子之間。由兩個(gè)原子來分享一個(gè)氫原子,具有高度定向性,一個(gè)是氫供體(O、N),另一個(gè)是氫受體(帶部分負(fù)電荷)。18(2)離子鍵(ionicbonds)正、負(fù)電荷之間的靜電引力(3)范德瓦爾力(VanderWaalsbonds)一定距離內(nèi)(0.3-0.4nm)的原子之間通過偶極發(fā)生的相互作用,本質(zhì)上也是靜電引力。19(4)疏水力(hydrophobicinteraction)非極性分子或基團(tuán)在水相環(huán)境中相互吸引、聚集的作用力。蛋白質(zhì)折疊、生物膜形成、酶對(duì)底物的催化。(5)二硫鍵(disulfidebond)
指2個(gè)硫原子之間的共價(jià)鍵,對(duì)穩(wěn)定蛋白質(zhì)的構(gòu)象起重要作用。204種非共價(jià)作用力的示意圖
21224.生物能量學(xué)(bioenergetics)
生物能量學(xué):研究生命有機(jī)體傳遞和消耗能量的過程,闡明能量的轉(zhuǎn)換和交流的基本規(guī)律。氧化方式吸收能量太陽光吸收能量
23(1)自由能自由能(G):指在一個(gè)體系的總能量中,在恒溫恒壓條件下能夠做功的那一部分能量。
自由能是一種狀態(tài)函數(shù),但變化(ΔG):AB
ΔG=GB–
GA
ΔG<0,放能,可以做功,自發(fā)進(jìn)行。
ΔG>0,吸能,非自發(fā)進(jìn)行,必須供能才能進(jìn)行。
ΔG=0,平衡狀態(tài)。24體內(nèi)能量的產(chǎn)生、轉(zhuǎn)移和利用25
分解代謝釋放的能量并不能直接被細(xì)胞利用,必須經(jīng)一類高能物質(zhì),其中最主要的是ATP暫時(shí)儲(chǔ)存(能量載體和遞體)起來,用于細(xì)胞的生命活動(dòng)。細(xì)胞直能接利用的是腺苷三磷酸(ATP)中所儲(chǔ)存的能量。(2)ATP(腺苷三磷酸)26
ATP在3個(gè)磷酸基團(tuán)中含有兩個(gè)磷酸酐鍵,成為高能分子AMP2HHOCCN-OHOHHHOHHOCH2OO-OOOP--POOOPOCNCHHCCNNNαβγATPADP(A-P~P~P),~~-27
ATP的水解
①
ATP的三個(gè)磷酸基團(tuán),使它pH7.0時(shí)帶有4個(gè)負(fù)電荷(ATP4-),由負(fù)電荷相距較近,形成斥力,使磷酰基團(tuán)易于水解。
ATP水解ADP和Pi,AMP和PPi28
②
當(dāng)ATP水解為ADP3-和HPO42-時(shí),斥力得到緩和,電子可降到最低能水平而促使ATP釋放較多的自由能(共振穩(wěn)定性)。ATP+H2OADP
+PiATP具有較高的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移潛勢(shì)29
ATP+UDPADP+UTP(三磷酸尿苷)ATP+CDPADP+CTP(三磷酸胞苷)ATP+GDPADP+GTP(三磷酸鳥苷)有一些反應(yīng)需要UTP、CTP和GTP3031
ATP循環(huán)
ATP是生物界普遍使用的供能物質(zhì),有“通用貨幣”(generalcurrencyofenergy)之稱。
ATP水解為ADP并供出能量之后,又可通過氧化磷酸化重新合成,從而形成ATP循環(huán)。
32ATP循環(huán)ATP
ADP
肌酸
磷酸肌酸
氧化磷酸化底物水平磷酸化
~P
~P
機(jī)械能(肌肉收縮)滲透能(物質(zhì)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn))化學(xué)能(合成代謝)電能(生物電)熱能(維持體溫)33
在生命有機(jī)體中一個(gè)放能的反應(yīng)可以與一個(gè)耗能的反應(yīng)偶聯(lián)以推動(dòng)原本不能進(jìn)行的反應(yīng)。
葡萄糖+磷酸葡萄糖-6-磷酸(耗能,ΔG>0,為
14kJ/mol)ATPADP+Pi(放能,ΔG<0,為-31kJ/mol)葡萄糖+ATP葡萄糖-6-磷酸+ADP(放能,ΔG<0,為-17kJ/mol)(3)能量偶聯(lián)反應(yīng)34(4)細(xì)胞是一個(gè)高效率的能量轉(zhuǎn)換器
細(xì)胞是一個(gè)高效率的能量轉(zhuǎn)換器,生命有機(jī)體中的能量轉(zhuǎn)換是通過電子流動(dòng)來實(shí)現(xiàn)的。光合細(xì)胞非光合細(xì)胞35
水是生命有機(jī)體中含量最多的物質(zhì),一般占體重的60%-70%。
水有自由水和結(jié)合水,前者流動(dòng)性大,含量可變,后者主要存在在膠體中,相對(duì)穩(wěn)定。
(5)水是生命的介質(zhì)
36水分子是極性分子,既是氫鍵的受體,又是氫鍵的供體。水分子的極性和形成氫鍵的能力使其具有高度反應(yīng)性。
37水有高的介電常數(shù)(80),因此是
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