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文檔簡(jiǎn)介
地中海貧血電泳及結(jié)果分析1、本實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/p>
學(xué)習(xí)與掌握DNA電泳的技術(shù)方法,利用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)和凝膠成像系統(tǒng)判斷α地貧的基因類型。2、實(shí)驗(yàn)原理:
電泳概念及種類影響瓊脂糖電泳遷移的主要因素原理DNA分子是兩性電解質(zhì),在高于其等電點(diǎn)的溶液(pH8.0~pH8.3)中,堿基幾乎不解離,磷酸基團(tuán)全部解離,DNA分子帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。電泳時(shí)DNA分子顆粒在電場(chǎng)中通過(guò)凝膠介質(zhì)而泳動(dòng)。顆粒帶凈電荷多,直徑小而接近于球形,則在電場(chǎng)中泳動(dòng)速度快,反之則泳動(dòng)速度慢。瓊脂糖是從海藻中提取的、由D-和L-半乳糖殘基通過(guò)α和β糖苷鍵交替構(gòu)成的線狀聚合物。瓊脂糖鏈形成螺旋纖維,然后再聚合成半徑為20-30nm的超螺旋結(jié)構(gòu)。
干的瓊脂糖懸浮于緩沖液中,加熱煮沸變?yōu)槌吻澹覝乩鋮s、凝聚,即成瓊脂糖凝膠。原理瓊脂糖凝膠的孔徑可以通過(guò)瓊脂糖的最初濃度來(lái)控制,低濃度的瓊脂糖形成較大的孔徑,而高濃度的瓊脂糖形成較小的孔徑。凝膠濃度
DNA分子大小
DNA分子的構(gòu)象緩沖液電泳電壓主要檢測(cè):分子量,含量及有無(wú)影響DNA在瓊脂糖凝膠中遷移率的因素瓊脂糖濃度
相同大小的線狀DNA片斷在不同濃度的瓊脂糖凝膠中遷移率不同.
瓊脂糖濃度(%)分離范圍(kb)
0.3
5-60
0.6
1-20
0.7
0.8-10
0.9
0.5-7
1.2
0.4-6
1.5
0.2-4
2.0
0.1-3DNA分子的大小雙鏈DNA分子在凝膠中遷移的速率與其堿基數(shù)的常用對(duì)數(shù)成反比。分子越大,遷移越慢。一是摩擦阻力越大,二是大分子通過(guò)凝膠孔徑的效率低于較小的分子。DNA的構(gòu)象DNA的構(gòu)象不同構(gòu)象DNA分子在電場(chǎng)中移動(dòng)的距離不同。具有相同分子量的線狀、開(kāi)環(huán)狀和超螺旋DNA在瓊脂糖凝膠中移動(dòng)速度不同。遷移速度:超螺旋的DNA>線狀DNA>開(kāi)環(huán)DNA。
電泳電壓低壓條件下,線狀DNA在瓊脂糖凝膠上泳動(dòng)速度和電壓成正比。隨著電壓升高,高分子量的DNA片段泳動(dòng)速度和電壓不成正比關(guān)系,分辯率下降了,因此為了得到良好的分離效果,電場(chǎng)電壓不要超過(guò)5V/CM。
緩沖液DNA的泳動(dòng)受緩沖液的組成和離子強(qiáng)度的影響。最常用的緩沖也是TAE(Tris-醋酸-EDTA)和TBE(Tris-硼酸-EDTA)。指示劑常用的電泳上樣緩沖液含溴酚藍(lán),有的還含有二甲苯青,這些指示劑可以指示電泳的速度,也可以利用其遷移率大致估計(jì)DNA的分子量,而與瓊脂糖濃度無(wú)關(guān)。染色溴化乙淀(EB)是核酸的染色劑,能插入DNA分子中形成熒光結(jié)合物,EB在紫外線照射下的發(fā)射熒光。熒光的強(qiáng)度與DNA的含量成正比,從而可以確定DNA片段在凝膠中的位置及估計(jì)出待測(cè)樣品的濃度。EB是強(qiáng)致癌劑。染色吖啶橙(AO)是一種熒光色素,可與核酸親和的熒光活體染料。熒光顯微鏡下核呈綠色,細(xì)胞質(zhì)呈黃色。吖啶橙AO常與溴化乙啶EB合用雙染.吖啶橙染液有毒,操作時(shí)要戴手套,需避光。電泳操作步驟(整個(gè)過(guò)程要求帶一次性手套)1、膠槽準(zhǔn)備
①取出膠板和梳子,將膠板放入膠槽中;②將梳子垂直插入到膠槽的小凹槽內(nèi),梳齒底端和板面有1mm的間隙;③將膠槽放在調(diào)整好的水平臺(tái)上。
2、凝膠準(zhǔn)備
用1×TAE配制1%瓊脂糖凝膠。①稱0.15g瓊脂糖置三角瓶中,加15ml1×TAE;②微波爐加熱大約1分鐘,熔化瓊脂糖;③熔化的瓊脂糖自然冷卻到60~70℃時(shí),加入EB5μl(0.5mg/ml
),并輕輕混勻。
3、鋪膠:將冷卻致60℃的凝膠倒入準(zhǔn)備好的膠槽內(nèi),凝膠厚度3~5mm,室溫下靜置半小時(shí)左右,凝膠固化。4、輕輕拔出固定在凝膠中的梳子。將帶凝膠的膠板置于電泳槽中,并使樣品孔位于電場(chǎng)負(fù)極,向電泳槽中加入1×TAE電泳緩沖液,越過(guò)凝膠表面即可。5、原梳齒處(樣品孔)即被緩沖液充滿,如發(fā)現(xiàn)有氣泡,應(yīng)設(shè)法去除。
6、樣品準(zhǔn)備:向核酸樣品中加入約為樣品體積1/10的上樣緩沖液,用加樣器輕輕混勻。
7、上樣:用加樣器吸取樣品,輕輕的加入到凝膠的樣品孔中。9、電泳結(jié)束后,切斷電源,取出凝膠。8、蓋上電泳槽,接通電源,開(kāi)始電泳
開(kāi)始電泳前,再次確認(rèn)凝膠樣品孔處于電場(chǎng)的負(fù)極。電泳條件:電壓5v/cm;時(shí)間40-60分鐘左右10、電泳結(jié)果分析:
①紫外檢測(cè)儀直接觀察電源條帶②攝影記錄
電泳結(jié)果分析電泳完畢,關(guān)上電源,在凝膠成像儀上觀察電泳帶及其位置,并與核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)Marker比較被擴(kuò)增產(chǎn)物的大小。
α地貧電泳結(jié)果分析電泳條
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