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文檔簡介
關(guān)于維生素與輔助因子第一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三本章主要內(nèi)容
酶的一般概念酶的組成與維生素酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系酶的催化機(jī)理酶反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)酶活性的調(diào)節(jié)
第二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1.酶的概述
酶是生物催化劑。絕大部分酶是蛋白質(zhì),還有一些核糖核酸RNA具有催化作用,稱為核酶(ribozyme)。1.1定義
細(xì)胞的代謝由成千上萬的化學(xué)反應(yīng)組成,幾乎所有的反應(yīng)都是由酶(enzyme)催化的。酶對(duì)于動(dòng)物機(jī)體的生理活動(dòng)有重要意義,不可或缺。酶在生產(chǎn)實(shí)踐中有廣泛應(yīng)用。第三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1.2酶的命名(1)習(xí)慣命名——依據(jù)所催化的底物(substrate)、反應(yīng)的性質(zhì)、酶的來源等命名。例如,胃蛋白(水解)酶、堿性磷酸酶。(2)系統(tǒng)命名——根據(jù)底物與反應(yīng)性質(zhì)命名反應(yīng):葡萄糖+ATP葡萄糖-6-磷酸+ADP
命名:葡萄糖:ATP磷?;D(zhuǎn)移酶(習(xí)慣名稱,葡萄糖激酶)第四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1.3酶的分類
氧化還原酶AH2+BA+BH2
轉(zhuǎn)移酶Ax+CA+Cx
水解酶AB+H2OAH+BOH
裂解酶AB+C
異構(gòu)酶AB
合成酶A+BC,需要ATP第五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1961年酶學(xué)委員會(huì)(EnzymeCommission,EC)規(guī)定酶的表示法:
EC.X.X.X.X例如:乳酸脫氫酶
第六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1.4酶活性(enzymeactivity)酶活性的表示方法:
酶活性指的是酶的催化能力,用反應(yīng)速度來衡量,即單位時(shí)間里產(chǎn)物的增加或底物的減少。
V=dP/dt=-dS/dt
測定方法:吸光度測定、氣體分析、電化學(xué)分析等。第七頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三酶活性的計(jì)量:
EC1961年規(guī)定:在指定的條件下,1分鐘內(nèi),將1微摩爾的底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物所需要的酶量為1個(gè)酶活國際單位(IU)。
比活性(specificityofenzyme)指的是每毫克酶蛋白所具有的酶活性單位數(shù)。比活性=活性單位數(shù)/酶蛋白重量(mg)比活性反映了酶的純度與質(zhì)量。第八頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三酶促反應(yīng)的速度曲線
隨著酶催化的反應(yīng)進(jìn)行,反應(yīng)速度會(huì)變慢,這是由于產(chǎn)物的反饋?zhàn)饔?、酶的熱變性或副反?yīng)引起的。但是,在反應(yīng)起始不久,在酶促反應(yīng)的速度曲線上通??梢钥匆娨欢涡甭什蛔兊牟糠?,這就是初速度。在酶的動(dòng)力學(xué)研究中,一般使用初速度的(V0)概念。第九頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三高效性
酶的催化作用可使反應(yīng)速度比非催化反應(yīng)提高108-1020倍。比其他催化反應(yīng)高106-1013倍
例如:過氧化氫分解
2H2O22H2O+O2Fe3+
催化,效率為6×104
mol/mol.S過氧化氫酶催化,效率為6×106
mol/mol.S專一性
即對(duì)底物的選擇性或特異性。一種酶只催化一種或一類底物轉(zhuǎn)變成相應(yīng)的產(chǎn)物。1.5酶的特點(diǎn)第十頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
絕對(duì)專一性一種酶只催化一種底物轉(zhuǎn)變?yōu)橄鄳?yīng)的產(chǎn)物。例如,脲酶只催化尿素水解成CO2
和NH3。
相對(duì)專一性一種酶作用于一類化合物或一類化學(xué)鍵。例如,不同的蛋白水解酶對(duì)于所水解的肽鍵兩側(cè)的基團(tuán)有不同的要求。
立體專一性指酶對(duì)其所催化底物的立體構(gòu)型有特定的要求。例如,乳酸脫氫酶專一地催化L-乳酸轉(zhuǎn)變?yōu)楸幔雍魉嶂蛔饔糜诜词降难雍魉幔ǚ炊∠┒幔?。立體專一性保證了反應(yīng)的定向進(jìn)行。
第十一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三R1:Lys,ArgR2:不是ProR3:Tyr,Trp,PheR4:不是Pro第十二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
酶容易變性這是酶的化學(xué)本質(zhì)(蛋白質(zhì))所決定的。酶的可調(diào)節(jié)性抑制和激活(activationandinhibition)反饋控制(feedback)
酶原激活(activationofproenzyme)
變構(gòu)酶(allostericenzyme)
化學(xué)修飾(chemicalmodification)
多酶復(fù)合體(multienzymecomplex)
酶在細(xì)胞中的區(qū)室化(enzymecompartmentalization)
第十三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三已知的上千種酶絕大部分是蛋白質(zhì)單純酶:少數(shù),例如:溶菌酶
結(jié)合酶:大多數(shù)
結(jié)合酶=酶蛋白+輔因子輔因子包括:輔酶、輔基和金屬離子。2.酶的組成與維生素2.1酶的化學(xué)本質(zhì)第十四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
酶蛋白的作用:與特定的底物結(jié)合,決定反應(yīng)的專一性。
輔酶、輔基的作用:參與電子的傳遞、基團(tuán)的轉(zhuǎn)移等,決定了酶所催化反應(yīng)的性質(zhì)。有十幾種.
輔酶與輔基的異同點(diǎn):它們都是耐熱的有機(jī)小分子,結(jié)構(gòu)上常與維生素和核苷酸有關(guān)。但是輔酶與酶蛋白結(jié)合不緊,容易經(jīng)透析除去,而輔基通常與酶蛋白共價(jià)相連。
金屬離子的作用:它們是酶和底物聯(lián)系的“橋梁”;穩(wěn)定酶蛋白的構(gòu)象;酶的“活性中心”的部分。
第十五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
結(jié)合酶舉例,()內(nèi)為輔因子:
乳酸脫氫酶(輔酶I,NAD)異檸檬酸脫氫酶(輔酶I,NAD)醇脫氫酶(輔酶I,NAD)葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(輔酶II,NADP)琥珀酸脫氫酶(FAD)乙酰輔酶A羧化酶(生物素,ATP,Mg++)脂酰輔酶A合成酶(輔酶A,CoA)第十六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三維生素(Vitamin)是動(dòng)物和人類生理活動(dòng)所必需的,從食物中獲得的一類有機(jī)小分子。它們并不是機(jī)體的能量來源,也不是結(jié)構(gòu)成分,大多數(shù)以輔酶、輔基的形式參與調(diào)節(jié)代謝活動(dòng)。脂溶性維生素:A視黃醇(維生素A原——胡蘿卜素)
D鈣化醇
E生育酚
K凝血維生素水溶性維生素:B族維生素和維生素C
(以下主要介紹B族維生素與輔酶、輔基的關(guān)系)2.2維生素與輔酶和輔基的關(guān)系第十七頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三表7?2B族維生素及其輔酶形式B族維生素輔酶形式酶促反應(yīng)中的主要作用硫胺素(B1)硫胺素焦磷酸酯(TPP)α-酮酸氧化脫羧酮基轉(zhuǎn)移作用核黃素(B2)黃素單核苷酸(FMN)黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)氫原子轉(zhuǎn)移氫原子轉(zhuǎn)移尼克酰胺(PP)尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+)氫原子轉(zhuǎn)移氫原子轉(zhuǎn)移吡哆醇(醛、胺)(B6)磷酸吡哆醛氨基轉(zhuǎn)移泛酸輔酶A(CoA)?;D(zhuǎn)移葉酸四氫葉酸"一碳基團(tuán)"轉(zhuǎn)移生物素(H)生物素羧化作用鈷胺素(B12)甲基鈷胺素5′-脫氧腺苷鈷胺素甲基轉(zhuǎn)移第十八頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三VB1,硫胺素經(jīng)焦磷酸化轉(zhuǎn)變?yōu)門PP,焦磷酸硫胺素。它是酮酸脫氫酶的輔酶。以VB2,核黃素為基礎(chǔ)形成兩種輔基FMN黃素單核苷酸和FAD黃素腺嘌呤二核苷酸。作用是傳遞氫和電子。第十九頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三泛酸(維生素B3)是CoA(輔酶A)的組成成分。CoA是脂?;妮d體。
吡哆醛和吡哆胺(吡哆素),維生素B6。磷酸吡哆醛是氨基酸轉(zhuǎn)氨酶、脫羧酶等的輔酶。
第二十頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
尼克酸,煙酸(維生素Vpp)NAD+/NADH,煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(氧化/還原)NADP+/NADPH,煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(氧化/還原)。煙酰胺衍生物,傳遞氫和電子,氧化還原酶的輔酶。
第二十一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三葉酸,其還原衍生物四氫葉酸是一碳基團(tuán)轉(zhuǎn)移酶的輔酶。一碳基團(tuán),如甲基、乙烯基、甲?;?。生物素,維生素H。噻吩和脲縮組成,CO2
的載體,羧化酶的輔酶,且有戊酸側(cè)鏈。
第二十二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三硫辛酸,含硫脂肪酸,有氧化和還原兩種形式,既可以傳遞氫和電子,又能轉(zhuǎn)移脂酰基。
維生素B12中心鈷原子結(jié)合5’-脫氧腺苷基稱輔酶B12
,為一些變位酶和轉(zhuǎn)甲基酶的輔酶。第二十三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三單體酶
只有三級(jí)結(jié)構(gòu),一條多肽鏈的酶。如129個(gè)氨基酸的溶菌酶,分子量14600。寡聚酶
含2-60個(gè)亞基,有復(fù)雜的高級(jí)結(jié)構(gòu)。常通過變構(gòu)效應(yīng)在代謝途徑中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。多酶復(fù)合體
由多個(gè)功能上相關(guān)的酶彼此嵌合而形成的復(fù)合體。它可以促進(jìn)某個(gè)階段的代謝反應(yīng)高效、定向和有序地進(jìn)行。3.酶的分子結(jié)構(gòu)第二十四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三酶的活性中心(activesite)
活性中心的必需基團(tuán)
必需基團(tuán)
活性中心以外的必需基團(tuán)
結(jié)合基團(tuán)(與底物結(jié)合,決定專一性)
活性中心
催化基團(tuán)(影響化學(xué)鍵穩(wěn)定性,決定催化能力)第二十五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三酶的活性中心示意圖活性中心是酶分子上由催化基團(tuán)和結(jié)合基團(tuán)構(gòu)成的一個(gè)微區(qū)第二十六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
化學(xué)反應(yīng)是由具有一定能量的活化分子相互碰撞發(fā)生的。分子從初態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榧せ顟B(tài)所需的能量稱為活化能。無論何種催化劑,其作用都在于降低化學(xué)反應(yīng)的活化能,加快化學(xué)反應(yīng)的速度。一個(gè)可以自發(fā)進(jìn)行的反應(yīng),其反應(yīng)終態(tài)和始態(tài)的自由能的變化(?G’)為負(fù)值。這個(gè)自由能的變化值與反應(yīng)中是否存在催化劑無關(guān)。4.酶的催化機(jī)理4.1活化能第二十七頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
催化劑降低了反應(yīng)物分子活化時(shí)所需的能量非催化反應(yīng)和酶催化反應(yīng)活化能的比較
Ea,活化能;ΔG,自由能變化第二十八頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
S+EESP+E中間產(chǎn)物
反應(yīng)過程
S+EESES*EPP+E過渡態(tài)復(fù)合物4.2中間產(chǎn)物學(xué)說第二十九頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
酶介入了反應(yīng)過程。通過形成不穩(wěn)定的過渡態(tài)中間復(fù)合物,使原本一步進(jìn)行的反應(yīng)分為兩步進(jìn)行,而兩步反應(yīng)都只需較少的能量活化。從而使整個(gè)反應(yīng)的活化能降低。第三十頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三誘導(dǎo)契合學(xué)說認(rèn)為,酶和底物都有自己特有的構(gòu)象,在兩者相互作用時(shí),一些基團(tuán)通過相互取向,定位以形成中間復(fù)合物。4.3誘導(dǎo)契合學(xué)說(inducedfit)第三十一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三鄰近與定向效應(yīng):增加了酶與底物的接觸機(jī)會(huì)和有效碰撞。張力效應(yīng):誘導(dǎo)底物變形,扭曲,促進(jìn)了化學(xué)鍵的斷裂。酸堿催化:活性中心的一些基團(tuán),如His,Asp作為質(zhì)子的受體或供體,參與傳遞質(zhì)子。共價(jià)催化:酶與底物形成過渡性的共價(jià)中間體,限制底物的活動(dòng),使反應(yīng)易于進(jìn)行。疏水效應(yīng):活性中心的疏水區(qū)域?qū)λ肿拥呐懦?、排斥,有利于酶與底物的接觸。4.4催化機(jī)理第三十二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
影響酶促反應(yīng)速度的因素與酶作為生物催化劑的特點(diǎn)密切有關(guān)。這些因素有:溫度、酸堿性、底物(substrate)濃度、酶濃度、激活劑(activators)和抑制劑(inhibitors)等。
5.酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)及其影響因素第三十三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
一般來說,隨著溫度升高,化學(xué)反應(yīng)的速度加快。在較低溫度條件下,酶促反應(yīng)也遵循這個(gè)規(guī)律。但是,溫度超過一定數(shù)值時(shí),酶會(huì)因熱變性,導(dǎo)致催化活性下降。
最適溫度(optimumT):使酶促反應(yīng)速度達(dá)到最大時(shí)的溫度。最適溫度因不同的酶而異,動(dòng)物體內(nèi)的酶的最適溫度在37-400C左右。5.1溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響第三十四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三酶反應(yīng)的溫度曲線和最適溫度第三十五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三5.2溶液pH值對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響最適pH(optimumpH):使酶促反應(yīng)速度達(dá)到最大時(shí)溶液的pH。酶的最適pH與酶的性質(zhì)、底物和緩沖體系有關(guān)第三十六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
在其他條件確定時(shí),反應(yīng)速度與酶的濃度成正比。5.3酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響酶濃度對(duì)反應(yīng)速度的影響第三十七頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三5.4底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響
在其他條件確定的情況下,在低底物濃度時(shí),反應(yīng)速度與底物濃度成正比,表現(xiàn)為一級(jí)反應(yīng).當(dāng)?shù)孜餄舛容^高時(shí),v也隨著[S]的增加而升高,但變得緩慢,表現(xiàn)為混合級(jí)反應(yīng)。當(dāng)?shù)孜餄舛冗_(dá)到足夠大時(shí),反應(yīng)速度也達(dá)到最大值(Vmax),此時(shí)再增加底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級(jí)反應(yīng)。反應(yīng)速度對(duì)于底物濃度的變化呈雙曲線,稱為米氏雙曲線.其數(shù)學(xué)表達(dá)式為米氏方程.第三十八頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三米氏雙曲線第三十九頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
米氏方程的推導(dǎo)
首先假設(shè):
1.反應(yīng)在最適條件下進(jìn)行
2.pH、溫度和酶的濃度是固定的,變化的是底物濃度
3.反應(yīng)在起始階段,逆反應(yīng)可忽略
4.反應(yīng)體系處在穩(wěn)態(tài)(stablestate)第四十頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
E+SESE+Pk+1k-1k+2
根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說,在穩(wěn)態(tài)時(shí),ES的生成速度與其分解速度相等。有以下關(guān)系式:
V1=V-1+V+2(1)k+1
[E]
[S]=k-1
[ES]+k+2[ES]
=[ES]
(k-1+k+2
)
[E][S]=
[ES](k-1+k+2
)/k+1
(2)
令(k-1+k+2)/k+1=Km(米氏常數(shù))[E][S]=
[ES]Km(3)第四十一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
[Et]是自由酶E的濃度與結(jié)合酶ES的濃度之和,即[Et]=[ES]+[E](4)
總的反應(yīng)速度V應(yīng)該等于V+2=k+2[ES](5)
將(4),(5)代入(3),整理得到米氏方程:V=Vm[S]/(Km+[S])V速度
Vm最大速度
[S]底物濃度
Km米氏常數(shù)第四十二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三米氏常數(shù)是反應(yīng)最大速度一半時(shí)所對(duì)應(yīng)的底物濃度當(dāng)S<<Km時(shí),v正比于[S],呈一級(jí)反應(yīng)當(dāng)S>>Km時(shí),v=Vm,呈零級(jí)反應(yīng)
米氏雙曲線第四十三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三由米氏方程可知,米氏常數(shù)是反應(yīng)最大速度一半時(shí)所對(duì)應(yīng)的底物濃度,即當(dāng)v=1/2Vm時(shí),Km=S
米氏常數(shù)Km=(k-1+k+2)/k+1在反應(yīng)的起始階段,k+2<<k-1,Km≈k-1/k+1≈1/K平≈K解離此時(shí),Km越大,說明E和S之間的親和力越小,ES復(fù)合物越不穩(wěn)定。當(dāng)Km越小時(shí),說明E和S的親和力越大,ES復(fù)合物越穩(wěn)定,也越有利于反應(yīng)。米氏常數(shù)Km對(duì)于酶是特征性的。每一種酶對(duì)于它的一種底物只有一個(gè)米氏常數(shù)。米氏常數(shù)及其意義第四十四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三米氏常數(shù)的求法雙倒數(shù)作圖法雙倒數(shù)方程和雙倒數(shù)曲線第四十五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三5.5抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響
酶的抑制劑(inhibitor):凡能使酶的活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)。
酶抑制作用分為可逆抑制作用和不可逆抑制作用兩大類。第四十六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三(一)可逆抑制作用(reversibleinhibition)
抑制劑與酶蛋白以非共價(jià)方式結(jié)合,引起酶活性暫時(shí)性喪失。抑制劑可以通過透析、超濾等物理方法被除去,并且能部分或全部恢復(fù)酶的活性。根椐抑制劑與酶結(jié)合的情況,又可以分為競爭性抑制、非競爭性抑制、反競爭性抑制和混合抑制等。第四十七頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三1、競爭性抑制(competitiveinhibitor)
競爭性抑制劑因具有與底物相似的結(jié)構(gòu),與底物競爭酶的活性中心,與酶形成可逆的EI復(fù)合物,減少的酶與底物結(jié)合的機(jī)會(huì),使酶的反應(yīng)速度降低的作用。這種抑制作用可通過增加底物濃度來解除。第四十八頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三競爭性抑制的動(dòng)力學(xué)特點(diǎn)是Vmax不變,而Km增大第四十九頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
在可逆的競爭性抑制中,抑制劑通常是酶的天然底物結(jié)構(gòu)上的類似物,兩者競爭酶的活性中心。第五十頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三磺胺類藥物的抑菌機(jī)理第五十一頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三2、非競爭性抑制(non-competitiveinhibitor)非競爭性抑制劑與酶的活性中心以外的集團(tuán)結(jié)合,形成EI或ESI復(fù)合物,不能進(jìn)一步形成E和P,使酶反應(yīng)速度減低的抑制作用。不能通過增加底物濃度的方法來解除第五十二頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
在可逆的非競爭性抑制作用中:抑制劑結(jié)合在活性中心以外;抑制劑的結(jié)合阻斷了反應(yīng)的發(fā)生。第五十三頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三
非競爭性抑制作用的動(dòng)力學(xué)特點(diǎn)是Vmax變小,而Km不變。第五十四頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三(二)不可逆抑制(irreversibleinhibition)抑制劑與酶反應(yīng)中心的活性基團(tuán)以共價(jià)形式結(jié)合,從而抑制酶活性。用透析、超濾等物理方法,不能除去抑制劑使酶活性恢復(fù)。
例如:有機(jī)磷農(nóng)藥中毒
(敵百蟲、敵敵畏、樂果殺蟲劑1605、1059等)
乙酰膽堿酯酶是羥基酶,與有機(jī)磷農(nóng)藥共價(jià)結(jié)合后失活,使興奮性神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿不能及時(shí)清除降解。第五十五頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三金屬離子如Mg++
對(duì)磷?;D(zhuǎn)移酶,Cu++對(duì)一些氧化酶,Cl-對(duì)淀粉酶有激活作用。一些有機(jī)小分子如VitC,谷胱甘肽,巰基乙醇等對(duì)巰基酶有激活作用。5.5激活劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響第五十六頁,共六十五頁,編輯于2023年,星期三終產(chǎn)物P對(duì)途徑開頭和分支點(diǎn)上的關(guān)鍵酶活性的調(diào)節(jié)。字母e表示酶。+表示激活,-表示抑制。6.1反饋控制(feedBack)6.
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