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原核基因的表達與調(diào)控第1頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
物質(zhì)代謝調(diào)控與基因表達調(diào)控的關(guān)系物質(zhì)代謝調(diào)控的實質(zhì)就是對酶的調(diào)節(jié)。調(diào)節(jié)水平:細胞水平激素水平:激素調(diào)節(jié)整體調(diào)節(jié):神經(jīng)體液調(diào)節(jié)酶分子結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)細胞內(nèi)酶的分隔分布酶分子降解調(diào)節(jié)酶含量的調(diào)節(jié)第2頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四ControlofGeneExpressioninProkaryotesE.colihasabout4,000genes.Somegenesareonlyactiveundercertainconditions.Howdoesthecellregulatewhichgenesare“on”andwhichgenesare“off”?Transcriptionalcontrol第3頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四在細胞內(nèi)有許多種蛋白質(zhì)其數(shù)量幾乎不受外界環(huán)境的影響,這些蛋白質(zhì)稱為組成蛋白質(zhì)(constitutiveproteins);另一類型則被稱為適應型或調(diào)節(jié)型,因為這類蛋白蛋白質(zhì)的合成明顯受環(huán)境的影響而改變。第4頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四組成型表達(constitutiveexpression):幾乎不受環(huán)境變動影響的一類基因表達,其中某些基因表達產(chǎn)物是細胞或生物體整個生命過程中都持續(xù)需要而必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeepinggene)。適應型表達(adaptiveexpression):環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達。第5頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第一節(jié)
原核基因表達調(diào)控總論基因表達調(diào)控的水平:轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控包括:mRNA加工水平調(diào)控;
翻譯水平的調(diào)控第6頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四原核生物基因表達調(diào)控的各個水平第7頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四原核生物基因調(diào)控與外部信號:營養(yǎng)狀況和環(huán)境因素
除光合自養(yǎng)細菌外,一般細菌如大腸桿菌所需的碳源首先是葡萄糖,利用葡萄糖發(fā)酵獲得能量,維持生存。在缺乏葡萄糖時,細菌也可以利用其它糖類如乳糖作為碳源,維持生活。第8頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四應環(huán)境條件變化基因表達水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(induction),這類基因被稱為可誘導的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。第9頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四一、原核基因調(diào)控機制的類型和特點正轉(zhuǎn)錄調(diào)控,負轉(zhuǎn)錄調(diào)控調(diào)節(jié)蛋白(regulatoryprotein)是一些特殊蛋白質(zhì),它們決定著其他蛋白質(zhì)的合成。有兩種基本類型:即正調(diào)節(jié)蛋白(positiveregulator)及負調(diào)節(jié)蛋白(negativeregulator)。負調(diào)節(jié)蛋白或稱阻遏蛋白(repressor),會使其靶蛋白的合成受到抑制,即不表達。正調(diào)節(jié)蛋白是激活蛋白(activator)。對靶蛋白的合成有促進作用。因此,激活蛋白存在時被控制的基因可表達。第10頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Regulationcanbenegativeorpositive NegativeControl–mRNA在不存在調(diào)控因素的時候合成較快PositiveControl–mRNA的合成需要調(diào)控因素的存在第11頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四負控下的基因的表達可以由阻遏蛋白所關(guān)閉。通常阻遏蛋白可以與DNA結(jié)合以阻止轉(zhuǎn)錄發(fā)生,也可以與mRNA結(jié)合阻止翻譯起始。Structuralgeneclustersarecoordinatelycontrolled.第12頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四正控下的基因的表達只能發(fā)生在調(diào)節(jié)蛋白有活性的情況下。阻遏蛋白可以與DNA結(jié)合以阻止轉(zhuǎn)錄發(fā)生。正調(diào)節(jié)蛋白與DNA及RNA聚合酶相互作用,協(xié)助轉(zhuǎn)錄起始的發(fā)生。正調(diào)控蛋白通常稱為激活蛋白(activator)。第13頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四1、負控誘導和負控阻遏在負控誘導系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物(誘導物)結(jié)合時,阻遏蛋白失效,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄;在負控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物結(jié)合時,調(diào)節(jié)基因不轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白作用的部位是操縱區(qū)。第14頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四2、正轉(zhuǎn)錄調(diào)控調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白。可以根據(jù)激活蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導系統(tǒng)和正控阻遏系統(tǒng)在正控誘導系統(tǒng)中,效應物的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);在正控阻遏系統(tǒng)中,效應物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)第15頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第16頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四調(diào)節(jié)蛋白
阻遏蛋白激活蛋白游離時無活性(正控誘導)游離時有活性(正控阻遏)游離時無活性(負控阻遏)游離時有活性(負控誘導)負誘活正誘死第17頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四ThelacoperonisanexampleThelacgenesarecontrolledbyarepressor.Thelacoperoncanbeinduced.3、可誘導調(diào)節(jié):是指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來的關(guān)閉狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導下使基因活化。第18頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四aregulatorysysteminE.colithatcontrolsthesynthesisofenzymesrequiredforthemetabolismoflactoseLacoperonwasdiscoveredbyFrancoisJacobandJaquesMonodinthe1960'sdisaccharideFirstmodelforcontrolofgeneexpression-thelacoperoninE.coli-第19頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四E.coligrowingonglucoseCellsstopgrowingwhenallglucoseisusedup第20頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四E.coligrowingonglucoseandlactoseCellsstopgrowingwhenallglucoseisusedupAftera
"lagperiod",
thecellsstartto
growon
lactoseLagperiod第21頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四4、可阻遏調(diào)節(jié):這類基因平時是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將關(guān)閉。Tryptophan
operonisanexampleHistidineoperon
第22頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四二、弱化子對基因活性的影響大腸桿菌:trp操縱子,phe操縱子,thr操縱子,ile操縱子,ala操縱子沙門氏菌:his操縱子,嘧啶合成操縱子弱化子:第23頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四三、降解物對基因活性的影響葡萄糖效應(降解物抑制作用):有葡萄糖存在的情況下,即使在細菌培養(yǎng)基中加入乳糖、半乳糖、阿拉伯糖或麥芽糖等誘導物,與其相對應的操縱子也不會啟動,不會產(chǎn)生出代謝這些糖的酶類。降解物基因激活蛋白(CAP,cataboliteactivatorprotein,or,cyclicAMPreceptorprotein,環(huán)腺苷酸受體蛋白,CRP):葡萄糖降解物抑制腺苷酸環(huán)化酶活性,cAMP-CAP對細菌糖代謝發(fā)揮正調(diào)控作用。第24頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四四、細菌的應急反應細菌在面臨營養(yǎng)物質(zhì)(如氨基酸)全面匱乏時,細菌會啟動一個應急反應,包括生產(chǎn)各種RNA、糖、脂肪和蛋白質(zhì)在內(nèi)的幾乎全部生物化學反應過程均停止。這一過程要有鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)作為信號。第25頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Whatisthestringentresponse?Aminoacidstarvation(stringentconditions)leadstorapiddropinstableRNA(tRNAandrRNA)synthesis(10-20fold)Total[mRNA]alsodrops(~3fold)SomemRNAsincrease–e.g.aminoacidoperons第26頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Whatstimulatesthestringentresponse?AnunchargedtRNAenteringtheacceptor(A)sitecausingtheribosometostallAsitemRNAaminoacylatedtRNAAsitemRNAunchargedtRNAstallAminoacidstringentSignaltoshutdownstableRNAsynthesis第27頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)pppGpp、ppGpp等幾種鳥苷多磷酸,可降低rRNA和tRNA合成的速度,這是在氨基酸缺乏時細菌的一種適應性反應,稱為嚴謹反應。在大腸桿菌,當氨基酸貧乏時,ppGpp與RNA聚合酶結(jié)合,形成ppGpp—RNA聚合酶復合物,并使RNA聚合酶構(gòu)象改變,活性降低,rRNA和tRNA合成減少或停止第28頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)作用范圍十分廣泛,超級調(diào)控因子AminoacidstarvationinducessynthesisofphosphorylatedguaninenucleotidespppGppandppGppGTPATPpppGppppGppmajorpathwayminorpathwayGDPATP++(p)ppGppsynthetaseUnchargretRNA(+)RNApolymeraseppGpp-RNApolymerasecomplex(inactived)(+)第29頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第二節(jié)操縱子和負控誘導系統(tǒng)操縱子學說:是法國巴斯德研究所Jacob和Monod在研究E.coli乳糖代謝調(diào)節(jié)時被發(fā)現(xiàn)的。JacquesMonod
FrancoisJacob第30頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Operonisaunitofbacterialgeneexpressionandregulation,includingstructuralgenesandcontrolelementsinDNArecognizedbyregulatorgeneproduct(s).OperatoristhesiteonDNAatwhicharepressorproteinbindstopreventtranscriptionfrominitiatingattheadjacentpromoter.RepressorproteinbindstooperatoronDNAorRNAtopreventtranscriptionortranslation,respectively.StructuralgenecodesforanyRNAorproteinproductotherthanaregulator.第31頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四SUGARMETABOLISMINE.coliTheoperonsforthegal,lacandaragenesareorganizedinthesamefashion,intandem.第32頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四ProkaryoticGeneRegulation第33頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Duringthelagperiod,newenzymesaresynthesised
?-galactosidase
(lacZ)-splitslactoseintoglucoseandgalactoselactosepermease
(lacY)-transportslactoseacrossthecellmembranelactosetransacetylase
(lacA)-inactivatestoxicgalactosides乳糖操縱子控制細菌對碳源乳糖的利用第34頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Howdoesthecellknowlactoseispresent?Howdoesitswitchonenzymeproduction?Howdoesitswitchontheproductionofallthreeenzymescoordinately?Thethreeenzymesareproducedonlywhenthecellneedstouselactoseasacarbonsource.酶的誘導合成第35頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:Thelacoperonoccupies~6000bpofDNA.AttheleftthelacIgenehasitsownpromoterandterminator.TheendofthelacIregionisadjacenttothepromoter,P.Theoperator,O,occupiesthefirst26bpofthelonglacZgene,followedbythelacYandlacAgenesandaterminator.Structuralgeneclustersarecoordinatelycontrolled第36頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:RepressorandRNApolymerasebindatsitesthatoverlaparoundthestartpointofthelacoperon.第37頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四大腸桿菌乳糖操縱子(lactoseoperon)包括3個結(jié)構(gòu)基因:lacZ、lacY和lacA,以及啟動子、控制子和阻遏子等。第38頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四LACTOSEOPERONINE.coliThelactoseoperontranscribesapolycistronicmRNA.ItistranscribedasasinglemRNAchainthatissubjectedtocoordinateregulationi.e.thatallgenesareexpressedatthesametime.第39頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四β-半乳糖苷酶:β-半乳糖苷鍵的專一性酶,能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。β-半乳糖苷透過酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細胞壁和原生質(zhì)膜進入細胞內(nèi)。β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶:把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。第40頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
誘導
Definition:resultsinsynthesisofanenzymeifE.coliis grownontheappropriatesubstrate.
ifE.coligrowsonglucose
nob-galactosideinthemedium noneedfortheb-galactosidaseenzyme <5molecules/cell ifE.coliisswitchedfromglucosetolactose (lactoseisab-galactosidemadeupofglucose+galactose) rapidsynthesisofb-galactosidase in2-3min.>5000molecules/cell 5-10%oftotalproteinsinthecell一、酶的誘導-lac體系受調(diào)控的證據(jù)第41頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四誘導物INDUCERDefinition:smallmoleculethatcausesthesynthesisof enzymesabletometabolizeit.第42頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四在不含乳糖及β-半乳糖苷的培養(yǎng)基中,lac+基因型每個大腸桿菌細胞內(nèi)大約只有1-2個酶分子。如果在培養(yǎng)基中加入乳糖,酶的濃度很快達到細胞總蛋白量的6%或7%,每個細胞中可有超過105個酶分子。第43頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四INDUCERATTHEMOLECULARLEVEL
discoveredbyJacobandMonodin1960usingbacteriawithmutationsinthelacZ,lacYandlacIgenes.1.Therepressoristranslatedfromtheinducibilitygene(I).Itisatetramericprotein.2.Therepressorbindswithgreataffinitytotheoperator(O)regionofthepromoter.3.Oncebound,itpreventsthebindingoftheRNApolymeraseandtranscriptionofthedownstream
genes.1.Ifasmallmoleculesuchaslactose(THEINDUCER)ispresent,itbinds
withgreataffinitytotherepressor.2.Thecomplexedrepressorcannolongerbindtotheoperatorregion.3.RNApolymerasebindstothe
promoterandtranscribesthegenes.EXCELLENTEXAMPLEOFNEGATIVEREGULATION第44頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四ORGANIZATIONOFTHEPROMOTERREGION第45頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四LABORATORYEXPERIMENTSGrowthofE.coliwithandwithoutinduction.Youwillmakeuseofainduceri.e.IPTG:IPTGcaninduce
galactosidasesynthesisbutwillnotmetabolizeit,since
galactosidasecannotcleavea-S-linkage.第46頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
乳糖操縱子在現(xiàn)代分子生物學試驗技術(shù)的應用galactosidase可以用作一些實驗的指示物Inmolecularcloning:bacteriaaregrownonmedium+IPTGandX-gal(chromophore).ThegalactosidaseactivitybreaksdowntheX-gal.Noinsert:bacteriaareblue+insert:
itwillinterruptthecodingregionofthe
-galactosidase,thereforenoenzymewillbeproduced.Thebacteriawillremainwhite.第47頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四載體帶有一個大腸桿菌的DNA的短區(qū)段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的調(diào)控序列和前146個氨基酸的編碼信息。在這個編碼區(qū)中插入了一個多克隆位點(MCS),它并不破壞讀框,但可使少數(shù)幾個氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影響功能,這種載體適用于可編碼β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主細胞。因此,宿主和質(zhì)粒編碼的片段雖都沒有酶活性,但它們同時存在時,可形成具有酶學活性的蛋白質(zhì)。這樣,lacZ基因在缺少近操縱基因區(qū)段的宿主細胞與帶有完整近操縱基因區(qū)段的質(zhì)粒之間實現(xiàn)了互補,稱為α-互補。由α-互補而產(chǎn)生的LacZ+細菌在誘導劑IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在時產(chǎn)生藍色菌落,因而易于識別。然而,當外源DNA插入到質(zhì)粒的多克隆位點后,幾乎不可避免地導致無α-互補能力的氨基端片段,使得帶有重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落。這種重組子的篩選,又稱為藍白斑篩選。如用藍白斑篩選則經(jīng)連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化的鈣化菌平板37℃溫箱倒置培養(yǎng)12-16hr后,有重組質(zhì)粒的細菌形成白色菌落。第48頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四安慰誘導物第49頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四二、操縱子模型及影響因子Jacob與Monod所提出的關(guān)于基因表達調(diào)控的操縱子學說可以簡述如下:有一個專一的阻遏分子(蛋白質(zhì))結(jié)合在靠近β半乳糖苷酶基因上面,這段DNA他們稱之為操縱基因。由于阻遏分子結(jié)合在DNA的操縱基因上,從而阻止了RNA聚合酶合成β半乳糖苷酶的mRNA。乳糖為誘導物,當乳糖結(jié)合到阻遏分子上時,即阻止阻遏分子與操縱基因的結(jié)合,mRNA就可以轉(zhuǎn)錄出來。如果去掉乳糖時,阻遏分子又恢復其活力,與操縱基因DNA結(jié)合,將乳糖基因關(guān)閉。第50頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四1、lac
操縱子ThreesetsofgenesnexttoeachotheronchromosomePlusDNAtranscriptionalelements第51頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四lac
轉(zhuǎn)錄元件Promoter,aDNAsequencerecognizedandbindedbyRNAPolymeraseTellsitwheretostarttranscriptionoftheDNAOperator,lacO,asequencethathelpsregulatetranscriptionofageneRegulatoryelement,lacI,aseparatetranscriptionunitConstitutively(always)expressed,unregulatedProducesthelacrepressorproteinRegulatesspecificallythelacoperon第52頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四lac
操縱子的功能Whennolactoseispresent:Don'tneedtomakeenzymestometabolizelactoseRepressorproteinsfromlacIgenebindthepromoterandlacO(Operator)DNAsequenceofthelacOperonRNAPolymeraseisunabletobindthelacpromoterDNAsequenceTheexpressionofthelacoperonisrepressedNoPermeaseorβ-galactosidaseenzymesareproduced第53頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Nolactosepresent第54頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四LactosePresentLactosepresent:expressionofoperonisneededNeedtoeliminaterepressorblockingSomeofthelactosebindstherepressorproteinsNolongerbindstheoperatorDNAsequenceTherepressorisanallostericprotein:Changesshapeonbindinganothermolecule第55頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四LactosePresent第56頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四InducibleOperon–NegativeControlTherepressorproteinInhibitstranscriptionandgeneexpressionTheoperonisoffinabsenceofexternalinducerButLactoseactstostimulatetranscriptionandexpressionofthegeneTherefore,TheoperonisinducibleAndthelactoseistheinducer第57頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四AdditionofinducerresultsinrapidinductionoflacmRNA,andisfollowedafterashortlagbysynthesisoftheenzymes;removalofinducerisfollowedbyrapidcessationofsynthesis.Repressoriscontrolledbyasmallmoleculeinducer第58頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Repressoriscontrolledbyasmallmoleculeinducer
第59頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:Repressormaintainsthelacoperonintheinactiveconditionbybindingtotheoperator;additionofinducerreleasestherepressor,andtherebyallowsRNApolymerasetoinitiatetranscription.第60頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Cis-actingandtrans-acting
順式作用與反式作用Cis-acting:affectsgenesonlyonthesameDNAmoleculeDNAsequenceTrans-acting:affectsgenesonsameordifferentDNAmoleculesProtein(diffusible)第61頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Cis-actingDNAsequencesOcLacZ-
/
O+
LacZ+:inducibleEcolioperatormutated第62頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Trans-actingproteinsLacI+
LacZ–
/LacI–
LacZ+:inducible**第63頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第64頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四RepressorblocksthebindingofRNApolymerasetotheadjacentpromoterRNApolymeraseandrepressorcanbindtogethertothelacpromoter.Repressormaylockthepolymeraseintoanonproductivestate(morelikelytoberight)第65頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四DNA-Bindingproteins“Helix-turn-helixmotif”:alpha-helicalregionsseparatedbyaturnintheproteinstructureFitsintomajorgrooveofDNAMostrepressorproteinsareHTHs第66頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四ThecrystalstructureofamonomerofLacrepressorHTHheadpiececoreC-terminalOligomeriationInducerbidingOperatorbiding第67頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第68頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第69頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四DNAbindingbytetramersoflacrepressorThelacoperatorsequenceisanearlyperfectinvertedrepeatcenteredaroundtheGCbasepairatposition+11.第70頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
Figure10.16Whenarepressortetramerbindstotwooperators,thestretchofDNAbetweenthemisforcedintoatightloop.(ThebluestructureinthecenteroftheloopedDNArepresentsCAP,anotherregulatorproteinthatbindsinthisregion).PhotographkindlyprovidedbyMitchellLewis.第71頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四三、乳糖操縱子的其它影響因子葡萄糖對lac操縱子的影響:讓大腸桿菌生長在葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上,細菌生長曲線如右圖:第72頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Cataboliterepressiondescribesthedecreasedexpressionofmanybacterialoperonsthatresultsfromadditionofglucose.ItiscausedbyadecreaseinthelevelofcyclicAMP,whichinturninactivatestheCAPregulator.
代謝物阻遏效應與操縱子的正調(diào)控有關(guān)第73頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
Figure:CyclicAMPhasasinglephosphategroupconnectedtoboththe3¢and5¢positionsofthesugarring.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第74頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四cAMPandCataboliteRepressioncyclicAMP(cAMP)在無葡萄糖時積累.Adenylcyclase被葡萄糖抑制.cAMP磷酸二酯酶(phosphodiesterase
)可被glucose激活ATPcAMPAMPAdenylcyclasePhosphodiesteraseGlucose(-)(+)第75頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Whathappenswhenbothglucoseandlactosearepresent?BacteriawillnotactivatelacoperonwhenglucoseisstillavailablecAMPsensesthedepletionofglucoselevelcAMPactsbybindingto
cataboliteactivatorprotein
(CAP)
or
cAMPreceptorprotein
(CRP).Adenylcyclase第76頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:GlucosecausescataboliterepressionbyreducingthelevelofcyclicAMP.
CataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromotercAMP-CAP復合物,該復合物與啟動子區(qū)結(jié)合是lacmRNA合成所必需的。cAMP第77頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:TheCAPproteincanbindatdifferentsitesrelativetoRNApolymerase.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第78頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第79頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:TheconsensussequenceforCAPcontainsthewellconservedpentamerTGTGAand(sometimes)aninversionofthissequence(TCANA).第80頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四CooperativebindingofcAMP-CAPandRNAPonthelacpromoter第81頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第82頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四90oC第83頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Figure:
CAPbendsDNA>90°aroundthecenterofsymmetry.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第84頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四CAPCAPRNAP第85頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四葡萄糖通過其某個代謝產(chǎn)物影響cAMP的形成,cAMP-CAP復合物可與lac操作子結(jié)合第86頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四葡萄糖+,乳糖-:lacmRNA-第87頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四葡萄糖+,乳糖+:lacmRNA-第88頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四葡萄糖-,乳糖+:lacmRNA+第89頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第三節(jié)
色氨酸操縱子與負控阻遏體系Tryptophan(trp)operon:合成代謝途徑的調(diào)控
E.coli
可以在需要時合成tryptophantryptophan存在,trpoperon的表達下降第90頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第91頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四色氨酸操縱子(tryptophaneoperon)負責色氨酸的生物合成;當培養(yǎng)基中有足夠的色氨酸時,這個操縱子自動關(guān)閉,缺乏色氨酸時操縱子被打開,trp基因表達;色氨酸或與其代謝有關(guān)的某種物質(zhì)在阻遏過程(而不是誘導過程)中起作用,在這個意義上講,它是一個負調(diào)控阻遏系統(tǒng)。trp體系參與生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CAP的調(diào)控。第92頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四trpE基因是第一個被翻譯的基因,和trpE緊臨的是啟動子區(qū)和操縱區(qū),前導區(qū)和弱化子區(qū)為trpL和trpa。trp操縱子中產(chǎn)生阻遏物的基因是trpR,該基因距trp基因簇很遠。第93頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第94頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四阻遏作用使轉(zhuǎn)錄水平下降70倍,但是色氨酸操縱子的調(diào)控能力在700倍左右阻遏機制對色氨酸來說是一個一級開關(guān),主管轉(zhuǎn)錄是否啟動,相當于粗調(diào)開關(guān)。trp操縱子中對應于色氨酸生物合成的還有另一個系統(tǒng)進行細調(diào)控,弱化作用。弱化作用是通過轉(zhuǎn)錄達到第一個結(jié)構(gòu)基因之前的過早終止來實現(xiàn)的,由色氨酸的濃度來調(diào)節(jié)。弱化子與前導肽第95頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四L區(qū)編碼了前導肽,當有高濃度Trp存在時,由于弱化子a的作用,轉(zhuǎn)錄迅速減弱停止,生成140核苷酸的前導RNA;當Trp濃度較低時,弱化子不起作用,轉(zhuǎn)錄得以正常進行,生成長約7kb的mRNA,操縱子中第一個結(jié)構(gòu)基因的起始密碼子AUG在+163處.前導肽第96頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四前導RNA結(jié)構(gòu)
前導RNA結(jié)構(gòu)包含4個互補的區(qū)(序列1,2,3,4)第97頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第98頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四第四節(jié)
阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)第99頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四Thearabinoseoperonfeaturesasingleproteinwhichactsasbothapositiveandanegativetranscriptionalregulator,dependinguponthebindingofparticularligands(Figure26.39).阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon),在葡萄糖饋乏時,它能利用阿拉伯糖作為能源。阿拉伯糖C基因編碼一種C蛋白,它能激活阿拉伯糖BAD操縱子的轉(zhuǎn)錄,此操縱子由araB,araA及araD基因組成。第100頁,共109頁,2023年,2月20日,星期四
第五節(jié)阻遏蛋白LexA的降解與細菌的SOS應答當細菌DNA遭到較大破壞時,細菌細胞內(nèi)會啟動一個稱為SOS的誘導型DNA修復系統(tǒng)
。參與SOSDNA修復系統(tǒng)的許多基因分散在染色體的各個部位,同時受LexA阻遏蛋白的抑制,平時表達水平很低。SOS體系的誘導
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