蛋白質(zhì)學(xué)Proteomics優(yōu)秀公開(kāi)課

蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)

proteome一詞于1994年提出，源于proteins和genome,意思是proteinsexpressedbyagenome。

蛋白質(zhì)組學(xué)（proteomics)研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)

蛋白質(zhì)組的廣義含義：

指某種細(xì)胞或組織中基因組所表達(dá)的所有的蛋白質(zhì)。但與基因組不同的是，蛋白質(zhì)組是一個(gè)動(dòng)態(tài)的概念，因此有人用功能蛋白質(zhì)組的概念，指的是細(xì)胞在一定階段或與某一生理現(xiàn)象相關(guān)的所有蛋白質(zhì)。

蛋白質(zhì)組的狹義含義：

可以指不同類(lèi)型細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的變化，如正常細(xì)胞和異常細(xì)胞之間、細(xì)胞用藥或不用藥之間的蛋白質(zhì)水平差異、不同組織細(xì)胞間的蛋白質(zhì)類(lèi)型的差異。人類(lèi)基因組計(jì)劃的實(shí)施和不足

1.人類(lèi)基因組計(jì)劃的提出是為了從根本上解決人們對(duì)生命本質(zhì)的認(rèn)識(shí)問(wèn)題。2.但實(shí)際情況并未達(dá)到理想地步，雖然人類(lèi)已經(jīng)完成數(shù)種基因組計(jì)劃，但并未弄清所有基因與相應(yīng)蛋白質(zhì)的關(guān)系。這可能與蛋白質(zhì)在翻譯后的修飾是無(wú)法從mRNA水平來(lái)判斷的原因。蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的直接行使者

作為生命功能的行使者，蛋白質(zhì)的功能是不言而喻的，它比基因更能直接地反映生命活動(dòng)的功能和變化。許多生命活動(dòng)是通過(guò)蛋白的活動(dòng)來(lái)體現(xiàn)的，也只有通過(guò)對(duì)這些蛋白質(zhì)的直接研究才能真正解開(kāi)生命之謎。

對(duì)生物信息的反向思維在生命科學(xué)的研究中，人們一般的思路是按中心法則的順序來(lái)進(jìn)行設(shè)計(jì)，即知道基因后再找蛋白質(zhì)，然后再找其功能。但在有的情況下這種經(jīng)驗(yàn)不能奏效。蛋白組學(xué)可從另一方面來(lái)進(jìn)行探索。即找到蛋白再來(lái)找其基因。傳統(tǒng)蛋白質(zhì)研究與蛋白質(zhì)組研究的比較傳統(tǒng)研究通常是針對(duì)一種或一類(lèi)蛋白質(zhì)的研究；后者對(duì)蛋白質(zhì)的研究是在細(xì)胞水平上進(jìn)行，往往要在一次進(jìn)行上千種蛋白質(zhì)的研究。蛋白質(zhì)組的研究體現(xiàn)了

整體性動(dòng)態(tài)性系統(tǒng)性蛋白質(zhì)組研究主要分兩個(gè)步驟蛋白質(zhì)組分離技術(shù)蛋白質(zhì)組分析技術(shù)蛋白質(zhì)的分離將各種蛋白進(jìn)行分離是進(jìn)行后續(xù)分析的基礎(chǔ)。分離的越細(xì)、分辨率越高將會(huì)為分析創(chuàng)造更好的條件。常用的蛋白質(zhì)分離手段有：

親和層析分子篩離子交換毛細(xì)管電泳一向電泳雙向電泳equilibrium雙向電泳的原理

Twodimensionalelectrophoresis1、合成載體兩性電解質(zhì)（SCA）2、非平衡pH梯度電泳（NEPHGE）3、固相pH梯度等電聚焦（IPGIEF）1、線(xiàn)性SDS2、非線(xiàn)性SDSpH310MW100Kd10Kd2DmapofHL-60celltreatedwithATRA對(duì)膠的染色考馬斯亮蘭染色銀染最為理想的是熒光染色三色熒光染料染色的效果圖象分析和處理蛋白組樣品處理工作站EttanSpotHandlingW