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DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用前景及其檢測方法的研究進(jìn)展
Summary:DNA甲基化檢測法在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用前景廣闊,主要涉及到親權(quán)鑒定的工作,在特殊案例中DNA甲基化檢測法的應(yīng)用具有一定價(jià)值,尤其可以解決同卵雙生的鑒定問題,為法醫(yī)學(xué)的個(gè)體甄別提供新思路,同時(shí)還能借助甲基化狀態(tài)與SNP“二等位基因”類似性的特點(diǎn),實(shí)現(xiàn)法醫(yī)學(xué)多態(tài)性標(biāo)記目的,給法醫(yī)學(xué)的發(fā)展帶來更多新的機(jī)遇。為了充分發(fā)揮DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用價(jià)值和優(yōu)勢,下文分析和研究DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)中的檢測方法,提出幾點(diǎn)檢測方面的建議,旨在為法醫(yī)學(xué)中DNA甲基化檢測法的合理應(yīng)用與長遠(yuǎn)發(fā)展提供幫助。Keys:DNA甲基化;法醫(yī)學(xué);應(yīng)用前景;檢測方法;研究進(jìn)展DNA甲基化屬于表現(xiàn)遺傳學(xué)中的一部分,是研究DNA不變的狀況下,基因表達(dá)出現(xiàn)可遺傳變化的一門遺傳學(xué)分支學(xué)科,和印記基因形成、基因沉默等存在直接的聯(lián)系,并且DNA甲基化也屬于表現(xiàn)遺傳學(xué)中較為主要的遺傳修飾形式,主要指的就是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的作用之下,將S-腺苷甲硫氨酸當(dāng)做是甲基供體,將甲基添加到上面,最終出現(xiàn)5-甲基胞嘧啶。通常情況下認(rèn)為,DNA甲基化在基因方面的表達(dá)具有抑制性特點(diǎn),可以應(yīng)用在法醫(yī)學(xué)的基因鑒定中,有著一定的應(yīng)用價(jià)值和優(yōu)勢。1DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用前景陳雨專家在研究中發(fā)現(xiàn),利用印記基因中的甲基化差異區(qū)域能夠?yàn)榉ㄡt(yī)學(xué)中的二聯(lián)體親權(quán)鑒定提供明確親本來源等位基因的重要證據(jù),針對(duì)印記基因之內(nèi)的SNP或者是可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列親本印記等位基因,在相關(guān)的二聯(lián)體親權(quán)鑒定還有某些較為特殊的案件中,能夠?qū)崿F(xiàn)探索性的應(yīng)用目的,可以將DNA甲基化在相關(guān)案例中的應(yīng)用優(yōu)勢凸顯出來[1]。例如:目前在甄別部分同卵雙生個(gè)體案件的過程中還存在一些難題,而在研究中可以發(fā)現(xiàn),DNA甲基化的差異性,很有可能就是導(dǎo)致遺傳物質(zhì)抑制的同卵雙生體現(xiàn)出差異性的主要原因,在同卵雙生子相互之間,DNA甲基化甚至還存在位點(diǎn)之間甲基化程度的差異性,可以為法醫(yī)學(xué)鑒定工作的實(shí)施和開展提供更多幫助。除此之外,專家聶燕釵,俞麗娟,管樺等研究在法醫(yī)學(xué)中應(yīng)用DNA甲基化,還可以利用標(biāo)記的形式,準(zhǔn)確鑒定孕婦外周血之內(nèi)胎兒的DNA,能夠在生產(chǎn)之前就可以提供非入侵類型的親權(quán)鑒定證據(jù)[2]。可見在法醫(yī)學(xué)的領(lǐng)域中,DNA甲基化有著廣闊的應(yīng)用前景,應(yīng)該予以一定的重視。1.1同卵雙胞胎的鑒定據(jù)調(diào)查,目前我國同卵雙胞胎的發(fā)生率約為0.3%,法醫(yī)學(xué)鑒定中的案例也很多,而同卵雙胞胎在DNA的序列方面處于完全一致的狀態(tài),使用常規(guī)檢測技術(shù)很難區(qū)分,采用DNA甲基化檢測法,就可以通過檢測同卵雙胞胎DNA序列之內(nèi)的表觀遺傳學(xué)差異實(shí)現(xiàn)法醫(yī)學(xué)鑒定的目的。從表觀遺傳學(xué)的角度來講,同卵雙胞胎鑒定期間,DNA甲基化在一定程度上可以將環(huán)境對(duì)基因組所產(chǎn)生的影響表現(xiàn)出來,也就說明,就算是同卵雙胞胎,受到飲食習(xí)慣、生活習(xí)慣和其他外部環(huán)境因素的影響,DNA甲基化也會(huì)出現(xiàn)一定的差異。1.2年齡的鑒定近年來在分子生物學(xué)發(fā)展的過程中,法醫(yī)學(xué)中年齡鑒定也開始發(fā)展到分子水平,可以通過DNA損傷累積鑒定方式、晚期糖基化末終產(chǎn)物鑒定方式等推斷年齡,但是,此類方法在應(yīng)用期間存在一定的誤差。而孟航專家研究DNA甲基化發(fā)現(xiàn),其有著隨著年齡變化而改變的特點(diǎn),主要的原因就是人體在生長期間,累積DNA甲基化發(fā)生改變、基因組之內(nèi)的特定位點(diǎn)也會(huì)在基因表達(dá)的過程中改變甲基化的形態(tài)[3]。所以,在人類年齡增長之后,DNA甲基化也會(huì)發(fā)生改變,法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中就可以應(yīng)用DNA甲基化的形式鑒定年齡。1.3組織體液來源的鑒定法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中針對(duì)組織體液來源進(jìn)行鑒定,能夠更加準(zhǔn)確將犯罪現(xiàn)場刻畫出來,使得犯罪過程重組,為案件偵破提供更多證據(jù),找到破案的線索。目前在組織體液來源鑒定的工作中,主要采用形態(tài)學(xué)檢測法、DNA甲基化檢測法,通常情況下,形態(tài)學(xué)檢測法在應(yīng)用期間很容易受到檢測原材料的限制,不能確保檢測的準(zhǔn)確性與科學(xué)性,而DNA甲基化檢測法在應(yīng)用期間,可以通過分析基因表達(dá)差異性的形式檢測組織體液之間的差異,不僅可以確保組織體液來源鑒定的準(zhǔn)確性與便利性,還能為破案工作的實(shí)施提供更多幫助。上述分析可以發(fā)現(xiàn),DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用前景廣闊,不僅可以應(yīng)用在年齡鑒定和同卵雙胞胎的鑒定工作中,還能為犯罪現(xiàn)場的法醫(yī)學(xué)檢測提供組織體液來源的準(zhǔn)確鑒定依據(jù)。2DNA甲基化的檢測方法分析2.1修飾沒有甲基化的胞嘧啶在采用DNA甲基化針對(duì)還沒有甲基化的胞嘧啶修飾過程中,可以將表現(xiàn)遺傳學(xué)信息的差異轉(zhuǎn)變成為DNA序列差異,例如:可以使用重亞硫酸鹽材料針對(duì)DNA處理,然后將沒有甲基化的胞嘧啶C全面轉(zhuǎn)變成為尿嘧啶U,其中已經(jīng)發(fā)生甲基化的胞嘧啶,就不會(huì)再有所轉(zhuǎn)變。在之后的PCR變化中,尿嘧啶U還會(huì)被轉(zhuǎn)變成胸腺嘧啶T,在經(jīng)過轉(zhuǎn)變以后,片段一般情況下能夠通過一代測序技術(shù)處理,用來針對(duì)特定片段中的DNA甲基化進(jìn)行檢測[4]。在此期間,此類方式還能夠應(yīng)用在全基因組甲基化的檢測工作中,其中主要為:①可以實(shí)現(xiàn)甲基化芯片陣列的檢測目的。此類檢測方式在應(yīng)用的過程中,就是在芯片陣列上面設(shè)置可以識(shí)別甲基化還有非甲基化的探針,將其中的探針和已經(jīng)采用重亞硝酸鹽轉(zhuǎn)變以后的DNA片段擴(kuò)增相互結(jié)合,這樣可以做到甲基化位點(diǎn)的檢測[5-9]。②能夠?qū)崿F(xiàn)全基因組亞硝酸氫鹽序列的檢測目的。具體的檢測過程中,要求做好文庫制備工作還有測序工作,將其中的基因組打斷,使其成為片段,在末端區(qū)域加A修飾以后,和甲基化連接頭之間相互連接,之后篩選片段的大小,使用重亞硝酸鹽進(jìn)行轉(zhuǎn)化處理,最后可以按照具體狀況通過PCR擴(kuò)增、測序[10]。2.2SMS直接檢測法對(duì)于SMS技術(shù)而言,又被稱作是第三代測序技術(shù),在檢測的過程中不需要PCR的擴(kuò)增處理,能夠單獨(dú)測序每一條DNA分子,在此類檢測方法應(yīng)用期間,主要包括SMRT技術(shù)(單分子合成測序技術(shù))、納米孔測序技術(shù)等等,可以按照具體的狀況使用各種檢測方法。①SMRT技術(shù)。此類技術(shù)在應(yīng)用的過程中,主要是通過零模波導(dǎo)芯片合成測序技術(shù)開展工作。通常情況下,的孔徑要比激光波長小很多,所以激光不能直接在小孔中穿過,主要是利用衍射形式形成熒光信號(hào)檢測區(qū),在這個(gè)區(qū)域之內(nèi)錨定DNA聚合酶[11]。在開展測序工作期間,可以將準(zhǔn)確配對(duì)的堿基設(shè)置在區(qū)域之內(nèi),停留幾十毫秒以后,激光就會(huì)激發(fā)堿基磷酸基團(tuán)中的標(biāo)記熒光分子,然后發(fā)出相應(yīng)的熒光信號(hào),最后獲取到其中的序列信息。在采用SMRT技術(shù)的過程中,分析其中的熒光信號(hào)特征可以發(fā)現(xiàn),不僅會(huì)涉及到顏色與波長,還需要了解熒光信號(hào)之間的持續(xù)時(shí)間和每個(gè)信號(hào)的間隔情況,屬于DNA合成動(dòng)力學(xué)中的重要信息[12]。②納米孔測序技術(shù)。此類技術(shù)是將電信號(hào)測序的原理當(dāng)做是基礎(chǔ),在應(yīng)用的過程中,DNA分子經(jīng)過與核酸外切酶相互結(jié)合的納米孔,經(jīng)過通道的堿基成分就會(huì)被剪切,出現(xiàn)阻斷現(xiàn)象,形成阻斷電流,可以按照阻斷電流的情況準(zhǔn)確反映出堿基種類,最后獲取到DNA序列信息[13]。從實(shí)際情況來講,SMS技術(shù)在應(yīng)用的過程中,能夠?yàn)镈NA甲基化的檢測提供更多新的機(jī)遇,但是,DNA甲基化具有多態(tài)性的特征,在使用相關(guān)技術(shù)檢測期間,可能會(huì)出現(xiàn)檢測數(shù)據(jù)的問題,有著低、中、高甲基化的現(xiàn)象,與此同時(shí)也可能會(huì)受到技術(shù)本身額影響出現(xiàn)通量錯(cuò)誤的現(xiàn)象,而納米空側(cè)技術(shù)在應(yīng)用期間,無法重復(fù)測序處理,當(dāng)前還沒有應(yīng)用在法醫(yī)學(xué)的領(lǐng)域中。要想確保法醫(yī)學(xué)中能夠合理采用DNA甲基化檢測法,就必須要強(qiáng)化SMS技術(shù)的研究力度,在先進(jìn)技術(shù)的支持下促使各方面工作的高效化實(shí)施。3結(jié)論綜上所述,DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用前景廣闊,不僅可以鑒定同卵雙胞胎,還能準(zhǔn)確推斷年齡,檢測組織體液來源,為案件的偵查提供準(zhǔn)確證據(jù)。因此在未來的工作中,應(yīng)該重視DNA甲基化檢測法的應(yīng)用,積極使用先進(jìn)的檢測技術(shù),改善當(dāng)前的檢測現(xiàn)狀,充分發(fā)揮DNA甲基化在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的積極作用和優(yōu)勢。Reference:[1]陳雨.DNA甲基化及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J].生物技術(shù)世界,2016,.15(03):303-303.[2]聶燕釵,俞麗娟,管樺,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