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代測序與二代測序的區(qū)別與聯(lián)系Sanger法測序(一代測序)Sanger法測序利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。 直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成, 每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸 (ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-0H基團,使延長的寡聚核苷酸選擇性地在 G、A、T或C處終止。終止點由反應中相應的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調整,使反應得到一組長幾百至幾千堿基的鏈終止產物。 它們具有共同的起始點, 但終止在不同的的核苷酸上,可通過高分辨率變性凝膠電泳分離大小不同的片段,凝膠處理后可用 X-光膠片放射自顯影或非同位素標記進行檢測。高通量測序(二代測序)高通量測序技術(High-throughputsequencing,HTS是對傳統(tǒng)Sanger測序(稱為一代測序技術)革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定 ,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing,NGS)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能 ,所以又被稱為深度測序(Deepsequencing)。第一代和第二代測序技術第X代公司平臺名稱測序方法檢測方法大約讀長(堿基數(shù))優(yōu)點相對局限性ABI/3130桑格-熒光高讀長,準確度一通量低;樣品制備第 生命xL-3毛細管/光600-次性達標率咼,能成本咼,使之難以技術730x電泳測1000很好處理重復序做大量的平行測代公司L序法學列和多聚序列序第貝克GeXP桑格-熒光/600-高讀長,準確度一通量低;單個樣品-~一遺傳毛細管次性達標率咼,能的制備成本相對曼光學1000代分析電泳測很好處理重復序較高
系統(tǒng)序法列和多聚序列;易小型化
第代羅氏/454基因組測序儀FLX系統(tǒng)焦磷酸測序法光學230400在第二代中最高讀長;比第一代的測序通量大樣品制備較難;難于處理重復和同種堿基多聚區(qū)域;試劑沖洗帶來錯誤累積;儀器昂貴HiSe可逆鏈第以魯q200終止物熒光/2x15儀器昂貴;用于數(shù) 很高測序通量據(jù)刪節(jié)和分析的米那0/mi和合成光學0代Seq測序法費用很高很高測序通量;在測序運行時間長;5500廣為接受的幾種第ABI/xlSO連接測熒光/25-3第二代平臺中,所讀長短,造成成本-~二SOLiLiD序法光學5要拼接出人類基高,數(shù)據(jù)分析困難代D系統(tǒng)因組的試劑成本和基因組拼接困難;儀器昂貴最低讀長短,推高了測第赫利Heli單分子熒光/25-3高通量;在第二代序成本,降低了基 scop合成測中屬于單分子性克斯光學0因組拼接的質量;代e序法質的測序技術儀器非常昂貴 資料來源于文獻
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