醫(yī)學(xué)信息檢索與利用概論課件

《醫(yī)學(xué)信息檢索與利用》概論整理課件1《醫(yī)學(xué)信息檢索與利用》概論整理課件1Whereisthewisdomwehavelostinknowledge?

Whereistheknowledgewehavelostininformation?

——T.S.Eliot(1888-1965)

我們?cè)谛畔⒗锩媸サ闹R(shí)，到哪里去了？我們?cè)谥R(shí)里面失去的智慧，到哪里去了？艾略特（1888-1965）整理課件2Whereisthewisdomwehavelo第一節(jié)基本概念1信息（Information)英國科學(xué)家K.Popper認(rèn)為信息可分為：有關(guān)客觀物質(zhì)世界的信息有關(guān)人類主觀精神世界的信息有關(guān)概念世界的信息整理課件3第一節(jié)基本概念1信息（Information)整理課件3基本概念2知識(shí)(knowledge)人類在認(rèn)識(shí)世界、改造世界的過程中，不斷接受客觀事物發(fā)出的信息，經(jīng)過思維加工，獲得對(duì)事物本質(zhì)及其運(yùn)動(dòng)規(guī)律的認(rèn)識(shí)，由此信息轉(zhuǎn)化為知識(shí)。國際經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織提出知識(shí)的4W概念：know-what;know-why;know-how;know-who整理課件4基本概念2知識(shí)(knowledge)整理課件4基本概念3情報(bào)（Information)當(dāng)人們?yōu)榱私鉀Q某一特定問題去搜尋所需要的知識(shí)，那一部分知識(shí)就是情報(bào)，是被傳遞的知識(shí)或事實(shí)。情報(bào)的三個(gè)基本屬性：知識(shí)性、傳遞性、效用性整理課件5基本概念3情報(bào)（Information)整理課件5基本概念4文獻(xiàn)（document,literature)文獻(xiàn)是記錄有知識(shí)的一切載體。整理課件6基本概念4文獻(xiàn)（document,literature)整理4個(gè)概念之間的關(guān)系信息知識(shí)系統(tǒng)化文獻(xiàn)記錄情報(bào)交流整理課件74個(gè)概念之間的關(guān)系信息知識(shí)系統(tǒng)化文獻(xiàn)記錄情報(bào)交流整理課件7網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源1電子信息資源文本型(text)多媒體型(multimedia)超文本型(hypertext)整理課件8網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源1電子信息資源整理課件8網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源2傳統(tǒng)文獻(xiàn)印刷型縮微型聲像型整理課件9網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源2傳統(tǒng)文獻(xiàn)整理課件9按文獻(xiàn)發(fā)布的類型分類圖書期刊特種文獻(xiàn)整理課件10按文獻(xiàn)發(fā)布的類型分類圖書整理課件10按揭示文獻(xiàn)內(nèi)容程度分類一次文獻(xiàn)二次文獻(xiàn)三次文獻(xiàn)整理課件11按揭示文獻(xiàn)內(nèi)容程度分類一次文獻(xiàn)整理課件11第二節(jié)計(jì)算機(jī)檢索與數(shù)據(jù)庫計(jì)算機(jī)檢索：利用計(jì)算機(jī)從文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫或因特網(wǎng)上查尋所需文獻(xiàn)信息的過程。包括：聯(lián)機(jī)檢索、光盤檢索、網(wǎng)絡(luò)檢索整理課件12第二節(jié)計(jì)算機(jī)檢索與數(shù)據(jù)庫計(jì)算機(jī)檢索：利用計(jì)算機(jī)從文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫計(jì)算機(jī)檢索發(fā)展簡(jiǎn)史脫機(jī)檢索(off-lineretrieval)聯(lián)機(jī)檢索(on-lineretrieval)光盤檢索(opticaldiscretrieval)網(wǎng)絡(luò)檢索整理課件13計(jì)算機(jī)檢索發(fā)展簡(jiǎn)史脫機(jī)檢索(off-lineretriev數(shù)據(jù)庫的類型與結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫是指有計(jì)算機(jī)進(jìn)行處理的一定數(shù)量同類信息的有序集合，是用來存儲(chǔ)和查找文獻(xiàn)的電子化檢索工具。整理課件14數(shù)據(jù)庫的類型與結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫是指有計(jì)算機(jī)進(jìn)行處理的一定數(shù)量同類信數(shù)據(jù)庫的類型書目型數(shù)據(jù)庫(bibliographicdatabase)事實(shí)型數(shù)據(jù)庫(factdatabase)數(shù)值型數(shù)據(jù)庫(numericdatabase)全文數(shù)據(jù)庫(fulltextdatabase)圖像型數(shù)據(jù)庫(imagedatabase,atlasonline)整理課件15數(shù)據(jù)庫的類型書目型數(shù)據(jù)庫(bibliographicdat書目數(shù)據(jù)庫(BibliographicDatabase)存儲(chǔ)的是二次文獻(xiàn),包括文獻(xiàn)的外部特征、題錄、文摘和主題詞等，檢索結(jié)果是所需文獻(xiàn)的線索而非原文。許多書目數(shù)據(jù)庫是印刷型文獻(xiàn)檢索工具的機(jī)度版，如MEDLINE、CBMDISC等整理課件16書目數(shù)據(jù)庫(BibliographicDatabase)存數(shù)值數(shù)據(jù)庫（NumericDatabase)

主要包含的是數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)，如各種統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)、科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、科學(xué)測(cè)量數(shù)據(jù)等。例如醫(yī)學(xué)上使用的化學(xué)制劑、藥物的各種理化參數(shù)、人體生理上的各種數(shù)值，人口統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)都可收入數(shù)值數(shù)據(jù)庫。美國國立醫(yī)學(xué)圖書館編制的化學(xué)物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫RTECS，包含10萬多種化學(xué)物質(zhì)的急、慢性毒理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。整理課件17數(shù)值數(shù)據(jù)庫（NumericDatabase)

主要包含的是事實(shí)數(shù)據(jù)庫（FactDatabase)存儲(chǔ)的是用來描述人物、機(jī)構(gòu)、事物等信息的情況、過程、現(xiàn)象的事實(shí)數(shù)據(jù)。如名人錄、機(jī)構(gòu)指南、大事記等，均可歸入事實(shí)數(shù)據(jù)庫。美國MEDLARS系統(tǒng)的醫(yī)生咨詢數(shù)據(jù)庫（PDQ），能提供有關(guān)癌癥治療和臨床實(shí)驗(yàn)的相關(guān)病因、診斷標(biāo)準(zhǔn)、治療方案以及最新研究進(jìn)展等信息。整理課件18事實(shí)數(shù)據(jù)庫（FactDatabase)存儲(chǔ)的是用來描述人物全文數(shù)據(jù)庫（FullTextDatabase)存儲(chǔ)的是原始文獻(xiàn)的全文，如雜志論文、報(bào)紙新聞、法院案例等。全文檢索可直接獲取原始資料，而不是書目檢索時(shí)的線索，提高了用戶的檢索效率。在DIALOG中有48種醫(yī)藥期刊全文數(shù)據(jù)庫，我國有《中國學(xué)術(shù)期刊》數(shù)據(jù)庫、萬方數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫等全文數(shù)據(jù)庫。整理課件19全文數(shù)據(jù)庫（FullTextDatabase)存儲(chǔ)的是原圖像數(shù)據(jù)庫（ImageDatabase)以圖像為信息主體，配有文字解釋，如：解剖圖譜、中藥圖譜、診斷圖譜、手術(shù)圖譜等。如：NLM的ThevisibleHumanProject;哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院的TheWholeBrainAtlas等。整理課件20圖像數(shù)據(jù)庫（ImageDatabase)以圖像為信息主體，數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔(file)記錄(record)字段(field)整理課件21數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔(file)整理課件21數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔（file)數(shù)據(jù)是能滿足某種特定目的或某一特定數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)需要的一種數(shù)據(jù)集合，由一個(gè)或多個(gè)文檔構(gòu)成現(xiàn)期文檔、回溯文檔（如MEDLINE）順排文檔、倒排文檔整理課件22數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔（file)整理課件22記錄（record)數(shù)據(jù)庫中基本文獻(xiàn)單元一個(gè)記錄在數(shù)據(jù)庫中通常記錄著一篇文獻(xiàn)的相關(guān)信息整理課件23記錄（record)數(shù)據(jù)庫中基本文獻(xiàn)單元整理課件23字段（field)組成記錄的基本信息單元。每一個(gè)字段都描述文獻(xiàn)的某一方面特征，包括外表特征和內(nèi)容特征。每個(gè)字段有自己的名稱和縮寫，如：題名(ti)、著者(au)、文摘(ab)、出版年(py)等整理課件24字段（field)組成記錄的基本信息單元。整理課件24整理課件25整理課件25整理課件26整理課件26計(jì)算機(jī)檢索的途徑檢索途徑是指用記錄的某一特征為檢索切入點(diǎn)進(jìn)行檢索。整理課件27計(jì)算機(jī)檢索的途徑檢索途徑是指用記錄的某一特征為檢索切入點(diǎn)進(jìn)行自由詞檢索自由詞又稱文本詞（textword),是作者寫文章時(shí)所使用的自然詞語，包括：標(biāo)題詞(titleword)關(guān)鍵詞(keyword)文摘詞(abstractword)全文詞(fulltextword)整理課件28自由詞檢索自由詞又稱文本詞（textword),是作者寫文主題詞檢索主題詞（subject,subjectheadings)又稱敘詞，是一種規(guī)范化的檢索語言。主題詞的規(guī)范作用在于：對(duì)同義詞、近義詞、異形詞、全稱與縮寫進(jìn)行歸并，以保證一詞輸入，多詞命中。規(guī)范的依據(jù)：醫(yī)學(xué)主題詞表（MESH）例：renalfailureseekidneyfailure整理課件29主題詞檢索主題詞（subject,subjectheadi分類檢索分類法（Classification):利用學(xué)科、專業(yè)、概念之間的邏輯關(guān)系建立起來的一種等級(jí)體系。分類號(hào)：由數(shù)字或數(shù)字加字母構(gòu)成，代表一個(gè)個(gè)概念；概念間有上下隸屬關(guān)系，也有同位間的并列關(guān)系。國內(nèi)常用的分類法是：《中國圖書資料分類法》整理課件30分類檢索分類法（Classification):整理課件30著者檢索著者（author)檢索是用文獻(xiàn)上署名的作者或編者的姓名作為檢索入口詞。檢索時(shí)注意著者姓名的處理：姓前，名后；姓用全稱，名用首字母。如：CharlesGreenberg處理為:Greenbergc

聞?dòng)衩诽幚頌椋簑enym整理課件31著者檢索著者（author)檢索是用文獻(xiàn)上署名的作者或編者的引文檢索參考文獻(xiàn)：在學(xué)術(shù)論文、綜述、專著文獻(xiàn)后面，列有的著者撰文借鑒利用過的書目清單。引用文獻(xiàn)：列有參考文獻(xiàn)的文獻(xiàn)。參考文獻(xiàn)又稱為被引用文獻(xiàn)。引文檢索：以被引用文獻(xiàn)為檢索起點(diǎn)來查找引用文獻(xiàn)的過程。整理課件32引文檢索參考文獻(xiàn)：在學(xué)術(shù)論文、綜述、專著文獻(xiàn)后面，列有的著者機(jī)構(gòu)檢索以機(jī)構(gòu)名稱為檢索詞，來查找該機(jī)構(gòu)學(xué)者發(fā)表的文獻(xiàn)。整理課件33機(jī)構(gòu)檢索以機(jī)構(gòu)名稱為檢索詞，來查找該機(jī)構(gòu)學(xué)者發(fā)表的文獻(xiàn)。整理刊名檢索檢索指定刊物上發(fā)表的文章。有的數(shù)據(jù)庫提供刊名瀏覽，只需點(diǎn)擊刊名鏈接即可有的數(shù)據(jù)庫則需輸入刊名：刊名全稱或刊名縮寫刊名縮寫全稱轉(zhuǎn)換可查Pubmed的JournalDatabase()整理課件34刊名檢索檢索指定刊物上發(fā)表的文章。整理課件34默認(rèn)檢索默認(rèn)檢索又稱缺省檢索、隱含檢索，是指在檢索系統(tǒng)預(yù)先設(shè)定的多個(gè)字段中進(jìn)行檢索。如：在WinSPIRS系統(tǒng)的MEDLINE數(shù)據(jù)庫中，Search狀態(tài)為默認(rèn)檢索所有非限制字段，包括：ti,ab,MH等字段。CBMdisc中的“缺省”檢索是在中文標(biāo)題、文摘、主題詞、關(guān)鍵詞、特征詞、刊名等6個(gè)字段中搜詞檢索。整理課件35默認(rèn)檢索默認(rèn)檢索又稱缺省檢索、隱含檢索，是指在檢索系統(tǒng)預(yù)先設(shè)限定檢索不少數(shù)據(jù)庫提供limit檢索功能,用來對(duì)檢出結(jié)果進(jìn)行數(shù)量限制.常用的限定檢索有:語種(language)、文獻(xiàn)類型(publicationtype)、出版日期(publicationdate)、只要含有全文的記錄(fulltextonly)、限于臨床醫(yī)學(xué)期刊(clinicaljournals)等。整理課件36限定檢索不少數(shù)據(jù)庫提供limit檢索功能,用來對(duì)檢出結(jié)果進(jìn)行其他檢索途徑專利號(hào)、國際連續(xù)出版物編號(hào)、化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)檢索，分子式檢索、特征詞檢索、記錄順序號(hào)檢索等。整理課件37其他檢索途徑專利號(hào)、國際連續(xù)出版物編號(hào)、化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)檢索，計(jì)算機(jī)檢索途徑的另一劃分法簡(jiǎn)單檢索復(fù)合檢索高級(jí)檢索目錄檢索導(dǎo)航檢索專家檢索整理課件38計(jì)算機(jī)檢索途徑的另一劃分法簡(jiǎn)單檢索整理課件38簡(jiǎn)單檢索(SimpleSearch)也稱初級(jí)檢索、自由詞檢索、基本檢索。指在數(shù)據(jù)庫首頁的檢索詞輸入框（查詢提問框）內(nèi)輸入一個(gè)單詞或詞組，提交檢索工具查詢的一種檢索方式。整理課件39簡(jiǎn)單檢索(SimpleSearch)也稱初級(jí)檢索、自由詞檢基本檢索說明基本檢索說明檢索字段基本檢索整理課件40基本檢索說明基本檢索說明檢索字段基本檢索整理課件40復(fù)合檢索（CombineSearch)也稱布爾邏輯組配檢索（BooleanSearch)，或簡(jiǎn)稱組配檢索。復(fù)合檢索指在任意字段情況下在檢索詞輸入框中輸入復(fù)合邏輯檢索式提交檢索工具查詢的一種檢索方式。整理課件41復(fù)合檢索（CombineSearch)也稱布爾邏輯組配檢索高級(jí)檢索(AdvancedSearch)高級(jí)檢索指在已設(shè)定的高級(jí)檢索窗口中輸入多個(gè)檢索詞，運(yùn)用邏輯組配關(guān)系，查找同時(shí)滿足多個(gè)檢索條件的數(shù)據(jù)，在高級(jí)檢索界面上一次性實(shí)現(xiàn)本應(yīng)多次檢索的結(jié)果的一種檢索方式。整理課件42高級(jí)檢索(AdvancedSearch)高級(jí)檢索指在已設(shè)定高級(jí)檢索多欄復(fù)合檢索詞表查詢多欄邏輯組配整理課件43高級(jí)檢索多欄復(fù)合檢索詞表查詢多欄邏輯組配整理課件43目錄檢索（CategorySearch)或稱分類檢索，有些檢索工具如雅虎、萬方，提供分類目錄檢索。目錄檢索指按類名分類，每類又分為若干子類目，層層逐級(jí)展開，最后點(diǎn)擊末級(jí)類名，顯示網(wǎng)頁名鏈接和簡(jiǎn)短內(nèi)容提要，點(diǎn)擊鏈接，顯示相關(guān)網(wǎng)頁內(nèi)容（如雅虎），或顯示該類的文獻(xiàn)記錄（如萬方、維普）。整理課件44目錄檢索（CategorySearch)或稱分類檢索，有些整理課件45整理課件45導(dǎo)航檢索（NavigationSearch)或稱瀏覽檢索（BrowseSearch)，與目錄檢索類似。指在系統(tǒng)設(shè)置的導(dǎo)航區(qū)內(nèi)按檢索樹格式逐級(jí)展開和進(jìn)行瀏覽選擇的檢索方式。導(dǎo)航檢索有學(xué)科分類導(dǎo)航和刊名導(dǎo)航檢索。整理課件46導(dǎo)航檢索（NavigationSearch)或稱瀏覽檢索（NGC的導(dǎo)航檢索導(dǎo)航檢索整理課件47NGC的導(dǎo)航檢索導(dǎo)航檢索整理課件47專家檢索（ExpertSearch)指系統(tǒng)在檢索界面設(shè)置的一個(gè)較大的提問框供用戶輸入檢索策略。用戶可根據(jù)檢索課題的需要，調(diào)用相應(yīng)的檢索技術(shù)編制比較細(xì)致復(fù)雜的檢索提問式，以一次達(dá)到比較滿意的檢索結(jié)果。這種方式適用于有豐富檢索經(jīng)驗(yàn)的用戶。整理課件48專家檢索（ExpertSearch)指系統(tǒng)在檢索界面設(shè)置的專家檢索整理課件49專家檢索整理課件49計(jì)算機(jī)檢索的步驟分析檢索課題，明確檢索要求選擇數(shù)據(jù)庫和檢索途徑確定檢索標(biāo)識(shí)，構(gòu)筑檢索提問式上機(jī)檢索操作整理檢索結(jié)果，獲取原始文獻(xiàn)整理課件50計(jì)算機(jī)檢索的步驟分析檢索課題，明確檢索要求整理課件50計(jì)算機(jī)信息檢索技術(shù)布爾邏輯檢索位置檢索截詞檢索指定字段檢索整理課件51計(jì)算機(jī)信息檢索技術(shù)布爾邏輯檢索整理課件51布爾邏輯檢索檢索系統(tǒng)中應(yīng)用最為廣泛的檢索技術(shù)理論基礎(chǔ)是集合論與布爾邏輯采用布爾邏輯表達(dá)式來表達(dá)用戶的檢索要求通過布爾邏輯運(yùn)算符來連接檢索詞,以及表示運(yùn)算優(yōu)先級(jí)的括號(hào)組成的一種表達(dá)檢索要求的算式整理課件52布爾邏輯檢索檢索系統(tǒng)中應(yīng)用最為廣泛的檢索技術(shù)整理課件52

邏輯或（OR）

AORB：記錄中出現(xiàn)檢索詞A或檢索詞B或兩詞同時(shí)出現(xiàn)在一條記錄中。其作用是擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率AORB如查有關(guān)維生素C方面的文獻(xiàn)，檢索式可寫成：

VitaminCorAscorbicacid整理課件53邏輯或（OR）AORB如查有關(guān)維生素C方面的文獻(xiàn)，邏輯與（AND）AANDB：檢索詞A和檢索詞B同時(shí)出現(xiàn)在一條記錄中。其作用是縮小檢索范圍，提高查準(zhǔn)率。AandB例如查有關(guān)“婦女吸煙”的文獻(xiàn)，檢索式可寫成：Womenandsmoking整理課件54邏輯與（AND）AandB例如查有關(guān)“婦女吸煙”的文獻(xiàn)，邏輯非（NOT）ANOTB：記錄必須包含檢索詞A但不能包含檢索詞B。即在含有A檢索詞的文獻(xiàn)中去除含有B檢索詞的文獻(xiàn)。其作用是縮小檢索范圍，提高查準(zhǔn)率。ANOTB例如查找有關(guān)“非兒童白血病”的文獻(xiàn)，檢索式可寫成：Leukemianotchild*整理課件55邏輯非（NOT）ANOTB例如查找有關(guān)“非兒童白血病布爾邏輯算符的運(yùn)算次序：NOT>AND>OR()號(hào)里的部分運(yùn)算優(yōu)先整理課件56布爾邏輯算符的運(yùn)算次序：NOT>AND>OR整理課件位置檢索With同字段檢索

AwithBAB同時(shí)出現(xiàn)在一個(gè)字段中Near相鄰檢索Anear4BAB出現(xiàn)在一個(gè)句中相隔n-1個(gè)單詞整理課件57位置檢索With同字段檢索整理課件57截詞檢索截詞（Truncation):檢索者將檢索詞在他認(rèn)為合適的地方截?cái)?。截詞檢索：檢索時(shí)針對(duì)檢索詞附加一個(gè)截?cái)喾?hào)，指明該檢索詞在與數(shù)據(jù)庫中的詞比較時(shí)，采取完整匹配還是部分匹配。整理課件58截詞檢索截詞（Truncation):檢索者將檢索詞在他認(rèn)為無限截?cái)鄼z索詞串與被檢索詞實(shí)現(xiàn)部分一致的匹配，被截?cái)嗟牟糠譀]有限定有多少個(gè)字符。左截?cái)啵?leukemia：preleukemia、leukemia右截?cái)啵簂eukocyt*：leukocyteleukocyticleukocythemia中間截?cái)啵簂euk*ic：leukemicleukaemicleukemogenicleukocytoctastic左右截?cái)啵?leukemia*：leukemiapreleukemialeukemias整理課件59無限截?cái)鄼z索詞串與被檢索詞實(shí)現(xiàn)部分一致的匹配，被截?cái)嗟牟糠譀]有限截?cái)鄼z索詞串與被檢索詞只在指定的位置可以不一致。每個(gè)被屏蔽的字符通常都有“？”來替代。如：leukemi?:leukemialeukemidleukemic