第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第1頁(yè)
第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第2頁(yè)
第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第3頁(yè)
第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第4頁(yè)
第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第5頁(yè)
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第十章原核生物基因表達(dá)的調(diào)控生物的遺傳信息是以基因的形式儲(chǔ)藏在細(xì)胞內(nèi)的DNA(或RNA)分子中的。隨著個(gè)體的發(fā)育,DNA有序地將遺傳信息,通過轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程轉(zhuǎn)變成蛋白質(zhì),執(zhí)行各種生理生化功能,完成生命的全過程。從DNA到蛋白質(zhì)的過程,叫做基因表達(dá)(geneexpression),對(duì)這個(gè)過程的調(diào)節(jié)就稱為基因表達(dá)調(diào)控(generegulation或genecontrol)?;蛘{(diào)控是現(xiàn)階段分子生物學(xué)研究的中心課題。要了解生物生長(zhǎng)發(fā)育的規(guī)律、形態(tài)結(jié)構(gòu)特征和生物學(xué)功能,就必須弄清楚基因表達(dá)調(diào)控的時(shí)間和空間概念?;虮磉_(dá)調(diào)控在兩個(gè)水平上體現(xiàn)(1)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation);(2)轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation),包括①mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript);②翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)。無(wú)論原核還是真核生物,其基因調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平上,包括在轉(zhuǎn)錄的起始階段和終止階段。對(duì)于原核生物,以營(yíng)養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmentalfactor)為主要的基因表達(dá)影響因素。在真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormonelevel)和發(fā)育階段(developmentalstage)是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段,而營(yíng)養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)基因表達(dá)調(diào)控取決于DNA的結(jié)構(gòu)、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用?;靖拍畈倏v子(operon)很多功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因在染色體上串連排列,由一個(gè)共同的控制區(qū)來(lái)操縱這些基因的轉(zhuǎn)錄。包含這些結(jié)構(gòu)基因和控制區(qū)的整個(gè)核苷酸序列就稱為操縱子(operon)。一個(gè)完整的操縱子主要包括啟動(dòng)子、操縱基因、結(jié)構(gòu)基因和終止子。2.阻遏物和激活物(reperssorandactivator)結(jié)構(gòu)基因:編碼蛋白質(zhì)或RNA的基因。調(diào)節(jié)基因:參與其它基因表達(dá)調(diào)控的RNA和蛋白質(zhì)的編碼基因。其編碼的調(diào)節(jié)蛋白稱為阻遏物或激活物。調(diào)節(jié)蛋白具有與其它DNA結(jié)合蛋白類似的結(jié)構(gòu)特征:螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix,HTH)。兩個(gè)螺旋分別由7-9個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成,其間間隔4個(gè)氨基酸殘基。兩個(gè)螺旋之間約為直角,螺旋2嵌入DNA雙螺旋大溝內(nèi),負(fù)責(zé)與DNA的特異性結(jié)合,稱為“識(shí)別螺旋”;螺旋1中的氨基酸與DNA的磷酸戊糖骨架非特異性結(jié)合,基本上平行于雙螺旋。CⅠ蛋白的N端含有5個(gè)螺旋,第2和第3個(gè)螺旋形成HTH(螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋)3.負(fù)調(diào)控和正調(diào)控(negativeandpositiveregulation)調(diào)節(jié)蛋白與DNA特定位點(diǎn)的相互作用,啟動(dòng)或增強(qiáng)操縱子的轉(zhuǎn)錄活性,這種調(diào)控方式叫做正調(diào)控,如激活物參與的調(diào)控。調(diào)節(jié)蛋白與DNA特定位點(diǎn)的相互作用,關(guān)閉或降低操縱子的轉(zhuǎn)錄活性,這種調(diào)控方式叫做負(fù)調(diào)控,如阻遏物參與的調(diào)控。4.誘導(dǎo)物和共阻遏物(inducerandcorepressor)效應(yīng)物(effector):能與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合并改變其性質(zhì)的小分子化合物。誘導(dǎo)物:與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合后啟動(dòng)操縱子轉(zhuǎn)錄的效應(yīng)物。共阻遏物:與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合后關(guān)閉操縱子轉(zhuǎn)錄的效應(yīng)物。第一節(jié)轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控一、轉(zhuǎn)錄的起始

轉(zhuǎn)錄是原核生物基因表達(dá)的主要調(diào)控點(diǎn),主要涉及兩個(gè)方面:1、RNA合成的酶系;2、RNA合成起始和終止信號(hào),即DNA分子上的特定序列。通過RNA聚合酶、轉(zhuǎn)錄因子和啟動(dòng)子的相互作用實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄調(diào)控,改變細(xì)胞的表型,從而實(shí)現(xiàn)細(xì)胞生理狀態(tài)和環(huán)境的變化。1.RNA聚合酶(RNApolymerase):

大腸桿菌的RNA聚合酶:由5個(gè)亞基組成,即α2ββ’σ,有時(shí)還有2個(gè)ω亞基。以α2ββ’σ組成的酶稱全酶。σ亞基與其他亞基結(jié)合較松弛,易從全酶上解離;其余部分α2ββ’稱為核心酶(coreenzyme)。在大腸桿菌中還發(fā)現(xiàn)一種新的σ因子,稱為σ’因子,因此將含有σ亞基的全酶稱為全酶I,含有σ’亞基的稱為全酶Ⅱ。二者的不同在于:全酶Ⅱ可以利用雙鏈DNA為模板合成po1y〔A)。σ亞基作用:參與啟動(dòng)子的識(shí)別和結(jié)合以及轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的異構(gòu)化。細(xì)胞內(nèi)哪條DNA鏈被轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄方向與轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的選擇都與σ亞基有關(guān)。離體實(shí)驗(yàn)表明:全酶所轉(zhuǎn)錄的RNA和細(xì)胞內(nèi)所轉(zhuǎn)錄出的RNA,其起始點(diǎn)相同,序列相同,若僅用核心酶進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,則模扳鏈和起始點(diǎn)的選擇都有很大的隨意性,而且往往同一段DNA的兩條鏈都被轉(zhuǎn)錄。由此可見:σ亞基對(duì)識(shí)別DNA鏈上的轉(zhuǎn)錄信號(hào)是不可缺少的,它是核心酶和啟動(dòng)子之間的橋梁。σ因子的取代在細(xì)胞發(fā)育和對(duì)環(huán)境應(yīng)答的反應(yīng)中起主導(dǎo)作用。2.啟動(dòng)子(promotor):

轉(zhuǎn)錄的起始是基因表達(dá)的關(guān)鍵階段,啟動(dòng)子就是連接在基因5’端上游的DNA序列,其長(zhǎng)度從100bp到200bp不等,是轉(zhuǎn)錄起始時(shí)RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合的特定部位,但其本身并不被轉(zhuǎn)錄。此外,啟動(dòng)子還包括與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的位點(diǎn)。在啟動(dòng)子與終止子之間是一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,通常將mRNA開始的一個(gè)核苷酸定為起點(diǎn)(即+1).由此向右常稱為下游(downstream),其核苷酸依次編為正序號(hào);起始點(diǎn)左例稱為上游(upstream).其核苷酸則依次以負(fù)號(hào)表示.緊接起始點(diǎn)左側(cè)的核昔酸為-1。啟動(dòng)子區(qū)的上游激活序列和操縱基因啟動(dòng)子區(qū)中與正調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的位點(diǎn),叫做上游激活序列(upstreamactivatingsequence,UAS),一般位于-35區(qū)上游;與負(fù)調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的位點(diǎn)稱操縱基因(operator),一般與啟動(dòng)子重疊。具有UAS序列的啟動(dòng)子,一般沒有典型的-35區(qū),因此RNA聚合酶不能很好地與之結(jié)合。只有當(dāng)激活蛋白結(jié)合在UAS上后,通過與RNA聚合酶在空間上相互作用或改變啟動(dòng)子區(qū)中與RNA聚合酶結(jié)合部位的DNA的構(gòu)型,從而提高啟動(dòng)子的活性。如大腸桿菌中依賴cAMP-CAP激活的乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等操縱子。有時(shí),一個(gè)基因或操縱子需要2個(gè)相互分開的操縱基因,一個(gè)位于轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)附近,另一個(gè)在距離啟動(dòng)子區(qū)約幾百bp的上游或下游。其中每個(gè)操縱基因都與一個(gè)阻遏物結(jié)合,然后兩個(gè)阻遏物在空間上相互作用,形成一個(gè)DNA環(huán),從而抑制RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合。二、σ因子與轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控---

σ因子的替代可以控制起始1.在E.coli,不同類型的啟動(dòng)子需要不同類型的σ因子在正常的溫度和環(huán)境下,大腸桿菌主要依靠σ70進(jìn)行基因的轉(zhuǎn)錄。當(dāng)環(huán)境溫度升高時(shí),許多原核和真核生物都會(huì)產(chǎn)生熱激狀態(tài),正常表達(dá)的基因會(huì)關(guān)閉或表達(dá)水平下降,而編碼熱激蛋白(heatshockprotein)的基因開始表達(dá),這些蛋白質(zhì)能提高菌體對(duì)高溫的抵抗力,此即謂熱激反應(yīng)。在大腸桿菌中,編碼熱激蛋白的基因有30多種,其中絕大多數(shù)熱激基因的啟動(dòng)子是σ32。2.枯草芽孢桿菌中σ亞基的更替與生活周期的轉(zhuǎn)變目前已從枯草芽孢桿菌中發(fā)現(xiàn)至少10種σ因子,其中正常生活的RNA聚合酶的σ因子為σ43,識(shí)別與σ70相同的啟動(dòng)子保守序列。大部分σ因子轉(zhuǎn)換的例子都發(fā)生在孢子形成(sporulation)中。孢子形成分為三個(gè)階段(1)DNA復(fù)制;(2)在細(xì)胞的一端基因組被分離;(3)分離的基因組外包上一層子外殼。細(xì)菌孢子的形成和釋放

F對(duì)E的活性控制在前孢子中由早期基因產(chǎn)生

G,G使RNA聚合酶在前孢子中轉(zhuǎn)錄晚期孢子形成基因。另一個(gè)早期孢子形成基因產(chǎn)物負(fù)責(zé)和母細(xì)胞中的成分聯(lián)系,

F激活SpoⅡR,SpoⅡR由前孢子分泌,然后它激活膜結(jié)合蛋白SpoⅡGA?;罨腟poⅡGA在母細(xì)胞中剪切失活的前體物Pro-E使其成為活化因子E。三、轉(zhuǎn)錄的終止和抗終止1.終止子的結(jié)構(gòu)

DNA上提供轉(zhuǎn)錄停止信號(hào)的一段序列稱為終止子(terminator),是一個(gè)基因的末端或是一個(gè)操縱子的末端的一段特定序列。與啟動(dòng)子不同,終止子能被轉(zhuǎn)錄成mRNA。類型:強(qiáng)終止子和弱終止子強(qiáng)終止子:不依賴于Rho蛋白質(zhì)輔助因子而能實(shí)現(xiàn)終止作用,這類終止子屬于強(qiáng)終止子;弱終止子:依賴于Rho因子才能實(shí)現(xiàn)終止作用,這類終止子屬于弱終止子。蛋白質(zhì)輔助因子稱為釋放因子,通常稱為ρ因子。所有原核生物的終止子共同的序列特征:即在轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)之前有一段回文結(jié)構(gòu),因而所產(chǎn)生的mRNA可形成莖環(huán)狀的發(fā)夾結(jié)構(gòu),它可使RNA聚合酶的移動(dòng)停止或減緩。強(qiáng)終止子回文結(jié)構(gòu)中富含GC對(duì),在回文序列的下游常有6—8個(gè)A,因此這段終止子轉(zhuǎn)錄后形成的RNA具有與A相對(duì)應(yīng)的寡聚U,是使RNA聚合酶脫離模板的信號(hào)。依賴于ρ因子的終止子其回文序列中GC對(duì)含量較少,回文序列下方?jīng)]有固定結(jié)構(gòu),其AU對(duì)含量也較低;由于其莖環(huán)結(jié)構(gòu)常較短,在沒有ρ因子時(shí)這種莖環(huán)結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。如果沒有ρ因子存在,RNA聚合酶會(huì)繼續(xù)轉(zhuǎn)錄下去,產(chǎn)生通讀(readthrough),當(dāng)ρ因子存在時(shí),轉(zhuǎn)錄才能終止。在強(qiáng)終止子中,轉(zhuǎn)錄的RNA在終止子部位形成的發(fā)夾結(jié)構(gòu)破壞了轉(zhuǎn)錄泡中RNA-DNA雜合鏈的形成,而RNA-DNA雜合鏈能幫助RNA聚合酶固定在DNA鏈上,因此轉(zhuǎn)錄泡中的RNA-RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)使RNA聚合酶變得不穩(wěn)定,結(jié)果RNA聚合酶和RNA都從DNA鏈上脫離,轉(zhuǎn)錄終止。ρ因子輔助的終止作用ρ因子結(jié)合于正在合成的RNA的rut(rhoutilizationsite)位點(diǎn)(如果rut位點(diǎn)被核糖體翻譯,則ρ因子不能與之結(jié)合),利用其依賴于RNA的ATP酶活性水解ATP獲得能量沿RNA按5’-3’方向移動(dòng);當(dāng)RNA聚合酶遇到終止子而暫停轉(zhuǎn)錄時(shí),ρ因子得以在終止子處追上RNA聚合酶并進(jìn)入轉(zhuǎn)錄泡的RNA-DNA雜合鏈中;其RNA-DNA解旋酶活性使雜合雙鏈解旋,釋放RNA聚合酶,轉(zhuǎn)錄終止。2.基因表達(dá)的極性效應(yīng)在正常情況下原核基因表達(dá)時(shí),其轉(zhuǎn)錄出來(lái)的mRNA隨即進(jìn)行翻譯,這時(shí)整個(gè)mRNA都覆蓋著核糖體,ρ因子無(wú)法接近mRNA,而RNA聚合酶早已越過前面的基因的依賴ρ因子的終止子,所以轉(zhuǎn)錄實(shí)際上并不停止,而是繼續(xù)轉(zhuǎn)錄后續(xù)基因。如果在某一基因的依賴于ρ的終止子之前發(fā)生無(wú)義突變,核糖體便從無(wú)義密碼子上解離下來(lái),翻譯停止,于是ρ就可以自由進(jìn)入RNA并移動(dòng),直到趕上停留在終止子上的RNA聚合酶,結(jié)果使RNA聚合酶釋放,不能再轉(zhuǎn)錄下游基因?;虮磉_(dá)的極性現(xiàn)象:在某些情況下同一轉(zhuǎn)錄單元里,由于一個(gè)基因的無(wú)義突變,阻礙了下游相鄰基因表達(dá)的效應(yīng),就稱為基因表達(dá)的極性現(xiàn)象。除了無(wú)義突變可以導(dǎo)致極性現(xiàn)象外,插入序列IS1、IS2等DNA片段插入到操縱子的基因中也會(huì)發(fā)生極性現(xiàn)象。3.抗終止作用(anti-termination)ρ因子的作用可以被抗終止因子所抵消,這樣,RNA聚合酶便可通過終止子(依賴于ρ因子的)繼續(xù)轉(zhuǎn)錄后面的基因,這種現(xiàn)象稱為抗終止作用(anti-termination)。第二節(jié)操縱子類型可誘導(dǎo)負(fù)控制系統(tǒng)可誘導(dǎo)正控制系統(tǒng)可阻遏負(fù)控制系統(tǒng)可阻遏正控制系統(tǒng)操縱子調(diào)控系統(tǒng)的基本類型原核生物結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的4種調(diào)控類型一、大腸桿菌乳糖操縱子1)大腸桿菌的乳糖利用系統(tǒng)大腸桿菌的乳糖代謝需要有β-半乳糖苷酶(β-galactosidase)的催化,這種酶能把乳糖水解為半乳糖和葡萄糖,或轉(zhuǎn)化為異乳糖作為誘導(dǎo)物。另外有β-半乳糖苷透性酶和β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙酰酶,前者協(xié)助乳糖分子穿膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),后者可將乙?;鶑囊阴]o酶A上轉(zhuǎn)移至β-半乳糖苷上。三種酶協(xié)同作用,使得乳糖得以分解和利用。乳糖操縱子的負(fù)調(diào)控β-半乳糖苷酶催化乳糖的兩種反應(yīng)誘導(dǎo)物

的加入

和去除

對(duì)lacmRNA及LacZ合成

的影響項(xiàng)目功能結(jié)構(gòu)基因3個(gè)不同結(jié)構(gòu)基因能夠產(chǎn)生3種不同的酶。(lacZ、Y、A)操縱基因(O)是結(jié)構(gòu)基因的開關(guān).通過對(duì)RNA聚合酶阻抑與否來(lái)控制結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄或停止。啟動(dòng)子(P)是RNA聚合酶與DNA結(jié)合的部位,可識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)。調(diào)節(jié)基因(I)有自己獨(dú)立的轉(zhuǎn)錄單位,能產(chǎn)生阻遏蛋白,通過與操縱基因的結(jié)合與否來(lái)控制操縱基因的關(guān)閉和開啟。乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)和功能2)乳糖操縱子的負(fù)調(diào)控(可誘導(dǎo))誘導(dǎo)因子:異乳糖、?-半乳糖苷、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPDG)。機(jī)制:沒有誘導(dǎo)物時(shí),具有活性的阻遏物和操縱基因結(jié)合,轉(zhuǎn)錄不能進(jìn)行。有誘導(dǎo)物時(shí),乳糖與阻遏物結(jié)合,使阻遏物發(fā)生構(gòu)象變化而失活,不能與操縱子結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因正常轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而再翻譯出蛋白質(zhì)。IPTG:有極強(qiáng)的誘導(dǎo)效應(yīng),本身又不被分解,稱為非底物誘導(dǎo)誘導(dǎo)物和阻遏

蛋白結(jié)合的模型3)乳糖代謝的突變型1961年Jacob&Monod等通過對(duì)突變體的研究,證明了調(diào)節(jié)基因和操縱基因的存在。通過構(gòu)建部分二倍體,如:F’lacI-lacZ+Y-A+XF-lacI+lacZ-Y+A-lacI-lacZ+Y-A+/lacI+lacZ-Y+A-,發(fā)現(xiàn)了以下突變:lacI

S

阻遏蛋白不可誘導(dǎo)性突變,阻遏蛋白失去誘導(dǎo)物結(jié)合位點(diǎn),始終作用于結(jié)構(gòu)基因,為超阻遏突變型。lacI

-

阻遏蛋白不能形成寡聚物,對(duì)lacI+隱性。lacI

-d

阻遏蛋白不能和DNA結(jié)合,且呈負(fù)互補(bǔ)(反式顯性)Oc

操縱基因的組成型突變,只對(duì)同一染色體上的結(jié)構(gòu)基因起作用,為順式顯性。關(guān)于lacI-d阻遏蛋白上具有兩種不同類型的結(jié)合位點(diǎn):DNA-結(jié)合位點(diǎn)識(shí)別操縱基因,誘導(dǎo)物結(jié)合位點(diǎn)與小分子誘導(dǎo)物結(jié)合。一旦與誘導(dǎo)物作用使其構(gòu)象發(fā)生改變而失去與操縱基因DNA結(jié)合的能力。DNA-結(jié)合位點(diǎn)的突變是組成型的(因?yàn)樽瓒粑锊荒芎虳NA結(jié)合來(lái)阻斷轉(zhuǎn)錄)。誘導(dǎo)物結(jié)合位點(diǎn)的突變是不可誘導(dǎo)性的(由于誘導(dǎo)物不能減少阻遏物和DNA的親和力)。阻遏物功能的一個(gè)重要的特點(diǎn)是形成多聚體蛋白。在細(xì)胞中阻遏蛋白的亞基隨機(jī)結(jié)合成四聚體。當(dāng)不同的lacI

等位基因存在時(shí),它們的產(chǎn)物作為亞基結(jié)合成異聚四聚體,其特性和同聚四聚體不同。這種亞基之間的作用類型具有多聚體蛋白的性質(zhì),被稱為等位基因間的互補(bǔ)(interalleliccomplementation)。阻遏蛋白的結(jié)構(gòu):N端:1~59aa,頭部片段,為HTH,與操縱基因DNA大溝結(jié)合;核心區(qū):有6個(gè)折疊,誘導(dǎo)物就結(jié)合在兩個(gè)核心區(qū)之間的裂縫中;C端:為兩組亮氨酸拉鏈,形成四聚體。阻遏蛋白單體

的三級(jí)結(jié)構(gòu)負(fù)的互補(bǔ)(negativecomplementation):此lacI-d的突變導(dǎo)致阻遏蛋白不能和操縱基因結(jié)合。因此它像lacI

-等位基因一樣,使操縱子呈組成型表達(dá)。由于lacI-類型的突變產(chǎn)生的阻遏物沒有活性,它相對(duì)于野生型基因是隱性的,而“-d”這個(gè)符號(hào)表示負(fù)互補(bǔ)這種突變類型是顯性的。這種突變稱反式顯性(trans-dominant),也稱為顯性失活(dominantnegatives)。這種顯性的原因是由于lacI-d等位基因產(chǎn)生一個(gè)“壞”的亞基,減少了與DNA結(jié)合位點(diǎn)的數(shù)目,使四聚體和操縱基因的親和力減少。不僅它本身不能結(jié)合操縱基因的DNA,而且它還通過作為四聚體的一部分阻止四聚體中“好”的亞基與DNA結(jié)合。這就意味著阻遏蛋白四聚體是作為一個(gè)總體,而不是單個(gè)單體的簡(jiǎn)單的集合,這對(duì)完成阻遏來(lái)說是很必要的。在體外將“好”的亞基和“壞”的亞基混合起來(lái)也會(huì)產(chǎn)生破壞作用。2.乳糖操縱子的正調(diào)控1)cAMP-CAP的正調(diào)控作用cAMP由腺苷環(huán)化酶(adenylatecyclase)催化合成。CAP(cataboliteactivatorprotein,分解代謝物激活蛋白)22.5kD,是原核生物基因表達(dá)的一種正調(diào)節(jié)蛋白。乳糖啟動(dòng)子的-70到-50區(qū)是cAMP-CAP的結(jié)合位點(diǎn)。cAMP-CAP以兩種方法來(lái)激活轉(zhuǎn)錄:(1)它可能直接和RNAPol相互作用;(2)作用于DNA,改變其結(jié)構(gòu),從而幫助RNAPol結(jié)合。cAMP-CAP可結(jié)合于相對(duì)于啟動(dòng)子的不同位點(diǎn)2)分解代謝產(chǎn)物阻遏作用當(dāng)培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時(shí),即使有乳糖存在,也不誘導(dǎo)靶基因表達(dá)。這種現(xiàn)象稱為葡萄糖效應(yīng)或分解代謝產(chǎn)物阻遏,這樣的操縱子稱葡萄糖敏感操縱子。葡萄糖抑制操縱子的原理:cAMP-CAP復(fù)合物的形成取決于AMP的濃度,當(dāng)以葡萄糖為能源時(shí),由于其抑制腺苷酸環(huán)化酶的活性,ATP不能轉(zhuǎn)化為cAMP,cAMP濃度下降,不能形成cAMP-CAP復(fù)合物,RNA聚合酶無(wú)法結(jié)合在DNA上,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)。3)代謝物阻遏與誘導(dǎo)的關(guān)系受CAP調(diào)控的操縱子,其轉(zhuǎn)錄必須滿足2個(gè)條件:培養(yǎng)基中缺少葡萄糖;有操縱子的誘導(dǎo)物存在。乳糖操縱子:兩個(gè)開關(guān)第一:cAMP-CAP復(fù)合物——受葡萄糖影響第二:異乳糖復(fù)合物——受乳糖影響二、半乳糖操縱子(galactoseoperon)大腸桿菌半乳糖操縱子包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:

異構(gòu)酶(UDP-galactose-epimerase,galE)

半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactosetransferase,galT)

半乳糖激酶(galactosekinase,galK)這3個(gè)酶的作用是使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。因?yàn)榘肴樘堑睦眯时绕咸烟堑?,人們猜想葡萄糖存在時(shí)半乳糖操縱子不被誘導(dǎo),但實(shí)際上有葡萄糖存在時(shí),gal操縱子仍可被誘導(dǎo)。現(xiàn)已分離到一些突變株,其中一類突變株能在不含葡萄糖的培養(yǎng)基中高水平合成半乳糖代謝酶類(gal結(jié)構(gòu)基因高效表達(dá));而另一類突變株中g(shù)al基因的表達(dá)完全依賴于葡萄糖,培養(yǎng)基中如無(wú)葡萄糖存在,這些細(xì)菌的gal基因不表達(dá),不合成半乳糖代謝酶類。分析gal操縱子P-O區(qū)的DNA序列發(fā)現(xiàn),該操縱子確實(shí)存在兩個(gè)相距僅5bp的啟動(dòng)子,可以分別起始mRNA的合成。每個(gè)啟動(dòng)子擁有各自的RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)S1和S2。從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在培養(yǎng)基中無(wú)葡萄糖時(shí),才能順利進(jìn)行,RNA聚合酶與S1的結(jié)合需要半乳糖、CAP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉(zhuǎn)錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的cAMP-CAP能抑制由這個(gè)啟動(dòng)子起始的轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有cAMP-CAP時(shí),轉(zhuǎn)錄從S1開始,當(dāng)無(wú)cAMP-CAP時(shí),轉(zhuǎn)錄從S2開始。結(jié)構(gòu)特點(diǎn)

(1)雙啟動(dòng)子:P1依賴于cAMP-CAP,轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)為+1,-10順序位于-12~-6,稱為-10S1;P2不依賴于cAMP-CAP,轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)為-5,-10順序位于-17~-11,稱為-10S2;

(2)雙操縱基因:OE位于CAP位點(diǎn)內(nèi),OI在galE內(nèi)部;

(3)無(wú)-35順序。

Gal既可為碳源,同時(shí)UDP-Gal又是合成細(xì)菌細(xì)胞壁的重要前體。gal操縱子的結(jié)構(gòu)(1)有GalP1啟動(dòng)K,T,E轉(zhuǎn)錄無(wú)Glc無(wú)GalP1不啟動(dòng)無(wú)GalOE與OI

結(jié)合形成環(huán),僅轉(zhuǎn)有錄20bp有GalP2啟動(dòng)S2

轉(zhuǎn)錄galE,組成型(2)CAP-cAMP對(duì)P1正調(diào)節(jié),對(duì)P2

抑制(3)阻遏物對(duì)P1,P2

都是負(fù)調(diào)控,CAP-cAMP含量少時(shí)P2可轉(zhuǎn)錄(機(jī)制不清)(4)P1與RNAPol親和力>>P2與RNAPol親和力,所以在沒有Glc而有Gal存在時(shí),P1轉(zhuǎn)錄,而P2不轉(zhuǎn)錄。2.調(diào)節(jié)沒有葡萄糖的條件下有Gal存在時(shí),galR(位于62ˊ)編碼的阻遏物失活,CAP結(jié)合在-47~23區(qū)域,RNAPol結(jié)合在-10S1區(qū),CAP和RNAPol直接相互作用,使P1順利轉(zhuǎn)錄;無(wú)Gal時(shí),GalR結(jié)合在OE上,OE離啟動(dòng)子有一段距離,當(dāng)GalR結(jié)合在OE上時(shí)不大可能像lac操縱子中l(wèi)acI阻遏那樣去阻礙RNAPol的結(jié)合,它阻斷S1的轉(zhuǎn)錄可能有兩種方式:影響cAMP-CAP和RNA聚合酶的作用;或通過干擾cAMP-CAP與DNA的相互作用來(lái)阻斷。有葡萄糖存在的情況下,cAMP-CAP含量少當(dāng)Gal存在時(shí),P1不能啟動(dòng)而P2啟動(dòng),RNA聚合酶結(jié)合在-10S2順序上,-10S2(TATGCTA)和-10S1(TATGGTT)順序相似,從S2開始轉(zhuǎn)錄galE而不轉(zhuǎn)錄另外的2個(gè)基因galT和galK。若無(wú)Gal存在,GalR可結(jié)合在OE和OI上,并使DNA彎曲形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)。S2位點(diǎn)阻遏作用和S1的阻遏機(jī)制完全不同,在上述條件下,即使有GalR存在,P2仍不受阻遏開始轉(zhuǎn)錄(組成型),但由于OI上也有GalR的結(jié)合并且成環(huán),故轉(zhuǎn)錄只進(jìn)行20bp便停止,這個(gè)過程如何發(fā)生尚不清楚。為什么gal操縱子需要兩個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)?半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細(xì)胞生長(zhǎng),而且與之相關(guān)的物質(zhì)--尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大腸桿菌細(xì)胞壁合成的前體。在沒有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過半乳糖差向異構(gòu)酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產(chǎn)物。生長(zhǎng)過程中的所有時(shí)間里細(xì)胞必須能夠合成差向異構(gòu)酶。假如只有S1一個(gè)啟動(dòng)子,那么由于這個(gè)啟動(dòng)子的活性依賴于cAMP-CAP,當(dāng)培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時(shí)就不能合成異構(gòu)酶。假如唯一的啟動(dòng)子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情況下,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導(dǎo)狀態(tài),這無(wú)疑是一種浪費(fèi)。無(wú)論從必要性或經(jīng)濟(jì)性考慮,都需要一個(gè)不依賴于cAMP-CAP的啟動(dòng)子(S2)對(duì)高水平合成進(jìn)行調(diào)節(jié)。三、阿拉伯糖操縱子參與阿拉伯糖代謝的酶基因分為3個(gè)操縱子,即araBAD、araE和araF,它們位于染色體的不同位置,但都由一個(gè)共同的調(diào)節(jié)基因araC進(jìn)行調(diào)控。這種由一個(gè)調(diào)節(jié)基因同時(shí)控制幾個(gè)操縱子的系統(tǒng),稱為調(diào)節(jié)子(regulon)。1.結(jié)構(gòu):具有正負(fù)調(diào)節(jié)功能的操縱子。2.特點(diǎn):(1)araC和araBAD有各自的啟動(dòng)子PC、PBAD,它們的轉(zhuǎn)錄方向相反。(2)AraC有雙重功能,既可起正調(diào)控作用,又可起負(fù)調(diào)控作用;(3)O:O1,位于-140~-110之間,阻遏蛋白AraC結(jié)合后對(duì)araBAD只表現(xiàn)輕微的阻遏作用

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