計算機(jī)輔助藥物設(shè)計智慧樹知到期末考試答案2024年

計算機(jī)輔助藥物設(shè)計智慧樹知到期末考試答案2024年計算機(jī)輔助藥物設(shè)計同源模建的可行性在于：同源蛋白是由（）由同一祖先蛋白趨異進(jìn)化而產(chǎn)生的蛋白質(zhì)。

A:三個B:兩個或兩個以上C:零個D:一個答案:兩個或兩個以上同源模建的基本流程大致可分為6步。第一步是

A:構(gòu)建蛋白可變區(qū)B:蛋白結(jié)構(gòu)的評價C:構(gòu)建蛋白保守區(qū)D:同源蛋白的搜索答案:同源蛋白的搜索利用測試集驗證藥效團(tuán)模型，主要的方法為

A:牛頓拉普森法B:偏最小二乘回歸（PLS回歸）C:排列組合法D:疊加法答案:偏最小二乘回歸（PLS回歸）分子對接分類中適合考察比較大的體系是

A:剛體對接B:半剛體對接C:柔性對接D:半柔性對接答案:剛體對接從頭預(yù)測法從理論上為理想的方法，它要求方法本身可以只根據(jù)（）來預(yù)測蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)和高級結(jié)構(gòu)，但是現(xiàn)在的所有方法還不能完全達(dá)到這個要求。

A:氨基酸的種類B:氨基酸的序列C:氨基酸殘基D:氨基酸的數(shù)目答案:氨基酸的種類蛋白結(jié)構(gòu)保守區(qū)是指在生物進(jìn)化或者一個蛋白家族中（），他們一般具有重要的功能。

A:具有不變或相同的結(jié)構(gòu)域B:可變的結(jié)構(gòu)域C:不同的結(jié)構(gòu)域D:單一的結(jié)構(gòu)域答案:具有不變或相同的結(jié)構(gòu)域同源模建其實屬于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測技術(shù)的其中一個方法，另外還有從頭預(yù)測法和（）。

A:反向折疊法B:參比構(gòu)建法C:片段法D:特定構(gòu)型法答案:反向折疊法地西泮具有以下哪類結(jié)構(gòu)母核

A:丁酰苯類B:環(huán)丙二酰脲類C:苯并二氮卓類D:吩噻嗪類答案:苯并二氮卓類.以下哪一個藥物不屬于非甾體類抗炎藥物。

A:吲哚美辛B:布洛芬C:美洛昔康D:地塞米松答案:地塞米松序列比較時，兩個蛋白質(zhì)具有的性質(zhì)不包括

A:差異性B:一致性C:同源性D:相似性答案:差異性在得到初步的藥效團(tuán)模型后，對于這個初步模型，還需要依據(jù)受體-配體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)，分析配體-受體相互作用關(guān)鍵位點，對藥效團(tuán)模型進(jìn)行

A:簡化B:驗證和優(yōu)化C:歸類D:拆分答案:驗證和優(yōu)化藥效團(tuán)模型中，不同顏色的球代表不同的藥效特征元素，其中芳環(huán)中心的顏色是

A:紫色B:綠色C:紅色D:黃色答案:黃色氫鍵給體：氫鍵給體主要包括氫原子以及與之相連的氧原子和氮原子，以下屬于氫鍵給體的是

A:氨基酸B:二硫鍵C:非酸性羥基；氨基；但不包括三氟甲基磺酰胺和四唑中的次氨基D:巰基答案:非酸性羥基；氨基；但不包括三氟甲基磺酰胺和四唑中的次氨基實現(xiàn)藥效特征簡化所采用的方法是

A:共軛梯度法B:聚類分析C:隨機(jī)搜索法D:模擬退火法答案:聚類分析分子對接方法的兩大課題是分子之間的空間識別和

A:片斷生長B:模擬退火C:能量識別D:格點計算答案:能量識別在配體和受體相互作用時，在配體的某些取代位置上存在某些原子或原子團(tuán)可能會和受體產(chǎn)生不利的原子碰撞，這些位置上的原子或原子團(tuán)占有的位置就構(gòu)成

A:電荷中心B:疏水中心C:靜電中心D:排斥體積答案:排斥體積計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的應(yīng)用可以加快靶點發(fā)現(xiàn)的速度,

A:發(fā)現(xiàn)更多的靶點B:增加藥物的靶點C:提高靶點發(fā)現(xiàn)的準(zhǔn)確度D:提高靶點的包容度答案:提高靶點發(fā)現(xiàn)的準(zhǔn)確度同源建模模型評價的方法不包括（）

A:平面化學(xué)B:RMSDC:PROSA程序評價D:Veerify3D答案:平面化學(xué)藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實施的，以下屬于藥效團(tuán)的構(gòu)建的方法的是

A:偏最小二乘法B:基于藥效團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法和假想受點點陣C:反射法D:蒙特卡羅（MonteCarlo）方法答案:基于藥效團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法和假想受點點陣在藥物和受體之間的識別中起重要作用的非鍵相互作用的主要有：

A:疏水場B:立體相互作用C:共價鍵D:包括離子-偶極作用在內(nèi)的靜電作用答案:共價鍵藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實施的，以下哪些方法適用于藥效團(tuán)構(gòu)建

A:假想受點點陣B:活性類似物法C:距離幾何法D:基于藥效基團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法答案:距離幾何法;假想受點點陣;活性類似物法;基于藥效基團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法柔性對接的方法

A:遺傳算法和進(jìn)化規(guī)劃B:構(gòu)象的系綜方法C:片段的方法D:基于分子模擬的方法答案:構(gòu)象的系綜方法;片段的方法;遺傳算法和進(jìn)化規(guī)劃;基于分子模擬的方法分子對接的重要原則

A:特異性B:能量最低性C:互補(bǔ)性D:預(yù)組織性答案:互補(bǔ)性###預(yù)組織性目前計算機(jī)輔助藥物設(shè)計存在的問題

A:設(shè)計的分子能否進(jìn)行化學(xué)合成B:藥物體內(nèi)轉(zhuǎn)運、代謝和體內(nèi)毒副作用問題C:受體-配體相互作用的方式問題D:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)三維結(jié)構(gòu)的真實性和可用性問題答案:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)三維結(jié)構(gòu)的真實性和可用性問題###受體-配體相互作用的方式問題###設(shè)計的分子能否進(jìn)行化學(xué)合成###藥物體內(nèi)轉(zhuǎn)運、代謝和體內(nèi)毒副作用問題分子對接是基于受體結(jié)構(gòu)進(jìn)行的藥物設(shè)計,其具體應(yīng)用有

A:研究配體-受體復(fù)合物的結(jié)合模式B:指導(dǎo)先導(dǎo)化合物的合成改造和優(yōu)化C:尋找和發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物D:預(yù)測受體-配體的結(jié)合能力答案:預(yù)測受體-配體的結(jié)合能力;研究配體-受體復(fù)合物的結(jié)合模式;指導(dǎo)先導(dǎo)化合物的合成改造和優(yōu)化;尋找和發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物下列哪些是QSAR常用的參數(shù)

A:疏水性參數(shù)B:指示變量C:電性參數(shù)D:立體參數(shù)答案:立體參數(shù);電性參數(shù);指示變量;疏水性參數(shù)蛋白與小分子的相互作用之一的靜電作用包括

A:離子-誘導(dǎo)偶極相互作用B:離子-偶極鍵C:離子鍵D:偶極-偶極相互作用答案:離子鍵###離子-偶極鍵###偶極-偶極相互作用###離子-誘導(dǎo)偶極相互作用在操作分子對接的過程中，活性位點的確定方法有：

A:基于配體生成B:基于能量計算生成C:自動生成D:基于關(guān)鍵氨基酸殘基生成答案:自動生成;基于配體生成;基于關(guān)鍵氨基酸殘基生成以下哪些屬于藥效團(tuán)模型評價參數(shù)

A:CDQB:FEATSC:SpecifityD:PARETO答案:Specifity###PARETO###FEATS主要應(yīng)用于loop及氨基酸側(cè)鏈建模的基于知識的蛋白質(zhì)的建模方法包括

A:匹配補(bǔ)充法B:空間限制滿足法C:基于片段裝配法D:艾迪莎法答案:空間限制滿足法內(nèi)部檢驗的方法有

A:擬和相關(guān)系數(shù)B:交互檢驗C:Y隨機(jī)D:sample法答案:擬和相關(guān)系數(shù);交互檢驗;Y隨機(jī);sample法下列屬于同源模建模型評價方法的有

A:碳骨架二面角B:PROSA程序評價C:SMDD:Veerify3D答案:PROSA程序評價;Veerify3D;碳骨架二面角分子力學(xué)的能量最小化算法有哪些

A:共軛梯度法B:分子場分析法C:牛頓拉普森方法D:最速下降法答案:最速下降法###共軛梯度法###牛頓拉普森方法QSAR模型的內(nèi)部驗證擬和相關(guān)系數(shù)包括

A:F檢驗值B:P值C:相關(guān)系數(shù)（R）D:標(biāo)準(zhǔn)偏差（S）答案:相關(guān)系數(shù)(R)###標(biāo)準(zhǔn)偏差(S)###F檢驗值定量構(gòu)效關(guān)系研究中，電場類型包括

A:靜電場B:疏水場C:氫鍵場D:立體場答案:立體場###靜電場###疏水場###氫鍵場對接方法尚需解決的問題

A:溶劑化效應(yīng)B:分子的柔性C:打分函數(shù)D:構(gòu)象選擇答案:溶劑化效應(yīng)###分子的柔性###打分函數(shù)QSAR模型的內(nèi)部驗證交互檢驗除了隨機(jī)模型檢驗法，還有以下哪些方法

A:Leave-many(group)–out(LMO)B:Out-of-train(OOT)C:BootstrappingD:leave-one-out答案:leave-one-out;Leave-many(group)–out(LMO);Bootstrapping;Out-of-train(OOT)下列哪些是定量構(gòu)效關(guān)系CoMFA方法用到的參數(shù)

A:疏水性參數(shù)B:指示變量C:結(jié)構(gòu)參數(shù)D:立體參數(shù)E:電性參數(shù)答案:立體參數(shù)###結(jié)構(gòu)參數(shù)###指示變量###電性參數(shù)分子對接的基本步驟

A:計算復(fù)合物的結(jié)合能B:最佳受體－配體復(fù)合物構(gòu)象C:調(diào)整受體或配體的構(gòu)象D:確定活性位點答案:確定活性位點;調(diào)整受體或配體的構(gòu)象;計算復(fù)合物的結(jié)合能;最佳受體－配體復(fù)合物構(gòu)象能使機(jī)體生理、生化功能加強(qiáng)的藥物作用稱為興奮，如腎上腺素對心肌收縮力的加強(qiáng)作用。

A:錯B:對答案:對將保守突變的因素考慮在內(nèi)，就可以定義各種打分方案(scoringschemes))對兩序列的相似程度打分，所得分值即代表其相似的程度

A:正確B:錯誤答案:正確蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)依靠不同氨基酸之間的C=O和N-H基團(tuán)間的氫鍵形成的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，主要為α螺旋、β折疊β－轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲。

A:錯誤B:正確答案:錯誤疏水相互作用是配體與受體相互識別的重要作用方式。

A:正確B:錯誤答案:正確Y隨機(jī)檢驗，將響應(yīng)值如生物活性隨機(jī)打亂順序，而保持描述符的順序不變，從而建立新的QSAR模型。

A:正確B:錯誤答案:正確體內(nèi)能與受體特異性結(jié)合的物質(zhì)，稱為配體或配基

A:對B:錯答案:對序列比對的統(tǒng)計學(xué)檢驗是評價序列相似性的關(guān)鍵。

A:錯B:對答案:對現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)也有其局限性，其研究對象為“藥物-疾病”關(guān)系而非“靶點-藥物”關(guān)系。

A:正確B:錯誤答案:錯誤SAMPLE法確定留一法的交叉驗證r2是依據(jù)樣本距離偏最小二乘法

。

A:對B:錯答案:對先導(dǎo)化合物是通過各種途徑、方法、手段獲得的具有某種藥理學(xué)或生物學(xué)活性的化合物。其不一定為實用的優(yōu)良藥物,可能因其藥效不強(qiáng)、特異性不高、毒性較大等而不能直接藥用,需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)修飾和改造,使之成為實用的高效、低毒、可控的優(yōu)良藥物,這一過程稱為先導(dǎo)化合物的優(yōu)化.

A:對B:錯答案:對最小抑菌濃度（MIC）指在體外培養(yǎng)細(xì)菌8~12小時后能一直培養(yǎng)基內(nèi)病原菌生長的最低藥物濃度。

A:錯B:對答案:對多序列比對問題其實是雙序列比對問題的推廣。

A:對B:錯答案:對同源模建第三步到第五步為序列比對、loop區(qū)和氨基酸側(cè)鏈。

A:錯誤B:正確答案:錯誤QSAR模型的外部驗證環(huán)節(jié)中我們利用測試集進(jìn)行評價，測試集testset從研究的化合物中挑選出合理數(shù)量和結(jié)構(gòu)特征的樣本組成預(yù)測集，預(yù)測集中的樣本不參加模型的構(gòu)建。

A:對B:錯答案:對Out-of-train（OOT法）和Bootstrapping的區(qū)別在于，在抽取M個化合物作為測試集后，OOT會隨機(jī)在N-M個化合物中選擇一些化合物進(jìn)行重復(fù)以保證訓(xùn)練集化合物數(shù)目保持不變，而不是用N-M個化合物直接建立QSAR模型并進(jìn)行活性預(yù)測。

A:對B:錯答案:錯CoMFA字段列中每個標(biāo)稱列可能代表數(shù)千個變量，字段中的每個格點對應(yīng)一個變量。

A:對B:錯答案:對多序列比對能夠揭示雙序列比對所不能發(fā)現(xiàn)