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第三章遺傳作圖和基因定位基因定位genemapping:將基因定位于某一特定染色體詳細位置,以及測定基因在染色體上線性排列次序與距離。遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第1頁遺傳作圖、基因定位意義展開基因功效研究需要;說明發(fā)育分子機制、分子標識輔助育種工作基礎(chǔ);對于農(nóng)作物等基因組序列冗長物種,作圖定位是基因克隆必備步驟。
遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第2頁3.1基因定位基本方法兩點測驗:經(jīng)過一次雜交和一次測交來確定兩對基因重組率,然后依據(jù)重組率確定距離。首先將三對性狀兩兩組合成三組,進行三次雜交和三次測交,求算每兩對相對性狀基因重組率,推出三個基因排列次序。遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第3頁ShShCCshshcc同源染色體ShCshcShcshCShCCShshshccc(交換)同源染色體同源染色體(交換后)CCccshshShSh(后期II染色單體分開)同源染色體配對、交換重組示意圖交換都發(fā)生在同源染色體相靠近非姊妹染色體之間遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第4頁ShCshc二分體ShCShCShCShCShCshcshcshcshcshcshCShcCShCShCShcShCshcshcshcsh全部親本型1/2親型1/2重組型F1交換交換F1新新一部分染色體交換發(fā)生在連鎖基因之內(nèi),→重組配子1/2重組、1/2親型配子所以重組型配子自然少于50%交換發(fā)生在連鎖基因之外→非重組配子遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第5頁玉米兩點測驗數(shù)據(jù)試驗類別親本和后代表現(xiàn)型及基因型種子粒數(shù)重組型配子(%)種類親本組合或重新組合第一相個引試組驗P1P2有色、飽滿(CCShSh)無色、凹陷(ccshsh)測交(Ft)后代有色、飽滿(CcShsh)有色、凹陷(ccShsh)有色、凹陷(Ccshsh)無色、凹陷(ccshsh)親新新親403215214940353.6T=8368第二相個斥試組驗P1P2糯性、飽滿(wxwxShSh)非糯性、凹陷WxWxshsh)測交(Ft)后代非糯性、飽滿WxwxShsh)非糯性、凹陷Wxwxshsh)糯性、飽滿(wxwxShsh)糯性、凹陷(wxwxshsh)親新新親588515311488599120.0T=14985第三相個引試組驗P1P2非糯性、有色WxWxCC)糯性、無色(wxwxcc)測交(Ft)后代非糯性、有色(WxwxCc)非糯性、無色(Wxwxcc)糯性、有色(wxwxCc)糯性、無色(wxwxcc)親新新親2542739717271622.0T=6714遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第6頁由第一、二試驗測得C-Sh間重組率為3.6%,Wx-Sh間重組率為20.0%,據(jù)此初步推測3個基因排列次序可能是:Wx20.0Sh3.6C23.6①Wx20.0Sh②C3.616.4由第三組試驗測得Wx-C之間重組率為22.0%,與23.6%較為靠近,所以能夠推斷3個基因排列次序為第一個排列方式。Wx-C重組率為23.6%Wx-C重組率為16.4%兩點測驗繁雜,確定三個基因位置需要進行三次雜交和測交;以重組率代替交換值,未將雙交換預(yù)計在內(nèi),在距離超出5個遺傳單位時,可發(fā)生雙交換,所以準確性較差。遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第7頁三點測驗(一定要掌握?。┦侨龑B鎖基因定位最慣用方法,首先用三對相對性狀都有差異兩純合親本雜交,然后用雜種F1與純隱性個體進行測交,依據(jù)測交子代不一樣類型占總類型百分數(shù),確定F1所產(chǎn)生配子類型和百分比,用于預(yù)計雙交換值、推出基因排列次序,并估算基因之間距離。三點測驗經(jīng)過一次雜交和一次測交,同時確定3對基因在染色體上位置,將雙交換包含在交換值中,因而對距離估算愈加準確。又因只做一次雜交、一次測交,所以更便于控制環(huán)境影響。遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第8頁玉米三點測驗(+表示顯性基因型)P
凹陷、非糯、有色×飽滿、糯性、無色
sh+++wxcF1×凹陷、糯性、無色
遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第9頁玉米三點測驗數(shù)據(jù)測交子代表現(xiàn)型由測交子代表現(xiàn)型推知F1配子類型粒數(shù)F1配子起源飽滿、糯性、無色+wxc2708親型凹陷、非糯性、有色sh++3538親型飽滿、非糯性、無色++c626單交換Ⅰ型凹陷、糯性、有色shwx+601單交換Ⅰ型凹陷、非糯性、無色sh+c113單交換Ⅱ型飽滿、糯性、有色+wx+116單交換Ⅱ型飽滿、非糯性、有色+++4雙交換型凹陷、糯性、無色shwxc2雙交換型8種類型Ft子代,4種百分比,經(jīng)典3對基因連鎖遺傳表現(xiàn),可用于推斷3對基因在染色體上次序,并計算距離。遺傳學(xué)遺傳圖的制作和基因定位專家講座第10頁確定三對基因次序
依據(jù)測交子代表現(xiàn)型,推測F1雜合體3對連鎖基因次序:雙交換配子中,沒有改變基因決定性狀在中間。
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