凝膠成像軟件使用說明書_第1頁
凝膠成像軟件使用說明書_第2頁
凝膠成像軟件使用說明書_第3頁
凝膠成像軟件使用說明書_第4頁
凝膠成像軟件使用說明書_第5頁
已閱讀5頁,還剩60頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)

文檔簡介

1、目 錄一 樣品拍攝指南1 拍攝界面簡介 4 2 瓊脂糖電泳凝膠拍攝方法 93 蛋白質(zhì)電泳凝膠拍攝方法 134 藍光樣品的拍攝方法 165 化學(xué)發(fā)光樣品的拍攝方法 196 RGB熒光樣品的拍攝方法 24二 軟件分析指南 1 系統(tǒng)進入 282 功能介紹 293 圖像分析 293.1 1D凝膠分析3.1.1 打開圖像 333.1.2 旋轉(zhuǎn) 333.1.3 圖像調(diào)整 343.1.4 圖像增強 353.1.5 分析設(shè)置 363.1.6 泳道識別 363.1.7 初始井 373.1.8 條帶識別 373.1.9 背景校準(zhǔn) 383.1.10 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 393.1.11 傾斜 403.1.12 結(jié)果 4

2、13.1.13 遺傳樹分析 423.1.14 VNTRs分析 433.1.15 視圖選擇 443.1.16 報告 453.1.17 保存實驗 46 3.2 ECL Western Blot分析3.2.1 打開圖像 473.2.2 圖像旋轉(zhuǎn) 473.2.3 圖像調(diào)整 473.2.4 圖像增強 473.2.5 噪點去除 473.2.6 合并MAKER泳道 473.2.7 分析設(shè)置 483.2.8 泳道識別 483.2.9 條帶識別 483.2.10 背景校準(zhǔn) 483.2.11 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 483.2.12 傾斜 493.2.13 結(jié)果 493.2.14 視圖選擇 49 3.2.15 報告的生成

3、 493.3 圖像合并 493.4 染料數(shù)據(jù)庫和偽彩 503.5 PCR密度分析3.5.1 打開圖像 523.5.2 圖像旋轉(zhuǎn) 523.5.3 圖像調(diào)整 523.5.4 圖像增強 523.5.5 分析設(shè)置 523.5.6 強度校準(zhǔn) 533.5.7 保存實驗 543.6 菌落/克隆計數(shù)分析3.6.1 打開圖像 553.6.2 圖像旋轉(zhuǎn) 553.6.3 圖像調(diào)整 553.6.4 圖像增強 553.6.5 分析設(shè)置 553.7 斑點雜交分析3.7.1 打開圖像 583.7.2 圖像旋轉(zhuǎn) 583.7.3 圖像調(diào)整 583.7.4 圖像增強 583.7.5 分析設(shè)置 583.7.6 強度校準(zhǔn) 593.7

4、.7 保存實驗 593.8 距離測量分析3.8.1 打開圖像 603.8.2 分析設(shè)置 613.8.3 標(biāo)準(zhǔn)線更改 62三 附錄3.1 儀器的保養(yǎng)要求 633.2 售后服務(wù) 63樣 品 拍 攝 指 南1 拍攝界面簡介:主頁面 模式選擇部分根據(jù)不同樣品的需要,軟件包含兩種不同的拍攝模式:普通模式和ECL模式。普通模式:用于DNA/RNA、蛋白質(zhì)凝膠電泳、微孔板、雜交膜、瓶皿、菌落、切片、熒光二抗Western Blot等樣品的拍攝。(在本模式下,開啟不同的燈光,濾光輪會自動轉(zhuǎn)到對應(yīng)的濾光鏡位)ECL模式:用于ECL等化學(xué)發(fā)光底物樣品的拍攝。本模式下,分辨率自動進行像素合并從而提高靈敏度。(在本模

5、式下,濾光輪會自動轉(zhuǎn)至空位,并且在選擇自動曝光、規(guī)則積分和不規(guī)則積分拍攝功能時均會自動關(guān)閉所有燈光并將鏡頭光圈值放到最大,從而減少操作步驟) 鏡頭控制部分鏡頭的控制功能包括:光圈、焦距、聚焦的調(diào)整。 圖像區(qū)域可顯示圖像預(yù)覽和拍攝的效果。 燈光控制部分燈光控制包括:反射白光、紫外光、紅綠藍三色光源;透射紫外、白光等。(在普通模式下,濾光輪聯(lián)動。當(dāng)選擇紫外、紅綠藍反射光時,濾光輪將自動轉(zhuǎn)到對應(yīng)的濾鏡位置。) 濾光輪調(diào)整部分濾光輪孔位的調(diào)整控制,通過自動旋轉(zhuǎn)來切換不同的濾光鏡復(fù)位按鈕用來修正基準(zhǔn)位(5位濾光輪校準(zhǔn)位:5號位; 7位濾光輪校準(zhǔn)位:7號位)。 分辨率選擇與相機啟動部分分辨率選擇功能僅部分

6、型號支持。 參數(shù)選擇與自動曝光部分參數(shù)選擇:可設(shè)置和保存相機各種參數(shù),便于今后調(diào)用。自動曝光:程序?qū)⒆詣佑嬎愠霎?dāng)前狀態(tài)下的最佳曝光值。 曝光時間設(shè)置部分100毫秒:將相機轉(zhuǎn)為預(yù)覽狀態(tài)的快捷鍵。自由設(shè)置:可自己設(shè)置任意的曝光時間。 拍攝方法選擇部分單禎拍攝:適用于普通模式和ECL模式自動曝光后的圖像捕獲。規(guī)則積分:指ECL模式下等分時間間隔的積分圖像拍攝。不規(guī)則積分:指 ECL模式下不等分時間間隔的積分圖像拍攝??扇我庠O(shè)置每禎圖像的間隔時間。 圖片拍攝按鈕及分析快捷鍵拍攝:進行圖像的捕獲。圖像管理:每次拍攝完后,圖像將自動保存至Lane 1D文件夾下的“拍照”子文件夾中。分析:可直接將拍攝后圖像

7、導(dǎo)入分析界面,進行分析。子頁面參數(shù)設(shè)置子頁面: 相機類型和控制類型設(shè)置設(shè)置相機的類型與控制的類型(相機類型請參照儀器型號進行選擇) RGB和濾光輪RGB三原色激發(fā)光源和濾光輪僅部分機型配置,請根據(jù)儀器配置清單進行選擇 存放路徑設(shè)置設(shè)置拍攝圖片存放路徑,點擊功能按鈕 進行設(shè)置 參數(shù)設(shè)置調(diào)整調(diào)整相機的增益,對比度及伽瑪值 參數(shù)保存名稱可對當(dāng)前設(shè)置進行保存,方便下次實驗直接調(diào)用自動曝光設(shè)置出廠時均設(shè)置有默認值明 場:指白光或自然光環(huán)境UV場:紫外光和熒光環(huán)境暗 場:ECL等無激發(fā)光源的密閉環(huán)境自動曝光積分單位:用于暗場模式自動曝光的時間單位。 鏡頭設(shè)置電動鏡頭的光圈、焦距和聚焦三個值的數(shù)值化顯示設(shè)置

8、??騼?nèi)時間是三可變對應(yīng)的全程可調(diào)整范圍的時間,精確到毫秒,自動對應(yīng)到1-100的調(diào)整范圍。 規(guī)則積分用于等分時間間隔的積分拍攝,可設(shè)定拍攝張數(shù)和間隔的時間。 不規(guī)則積分用于不規(guī)則時間間隔的積分拍攝,可任意設(shè)定每張圖片的間隔時間,利于對未知特性發(fā)光底物樣品的拍攝條件的摸索。拍攝數(shù)量最多10張。 濾光輪設(shè)置可進行濾光輪每個孔位的信息輸入。 2 瓊脂糖電泳凝膠拍攝方法:提 示:本指南所例舉為:EB或GoldView染色的DNA凝膠。其它染料的樣品請根據(jù)激發(fā)和吸收波長選擇光源和濾光鏡。2.1 打開拍攝界面,軟件將自動開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機啟動,在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置紫外臺中央

9、,關(guān)閉暗箱門。 白光反射燈2.2 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。2.3 調(diào)整焦距,直至樣品達到屏幕的滿幅面。 焦距調(diào)整 2.4 調(diào)整聚焦,直至加樣孔清晰。聚焦調(diào)整2.5 關(guān)閉白光反射燈,開啟紫外透射光源。注 意:如果您購買的為多波長紫外臺,請選擇302nm波長.(波長切換開關(guān))紫外透射燈 2.6 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。注 意:通常情況下,只要在白光下將加樣孔調(diào)整清楚,切換到紫外時條帶就能清晰的看到。但是,如果膠非常厚,加樣孔和條帶將不在同一景深,所以白光時加樣孔雖然能聚清晰,但是紫外時條帶仍會有些模糊,這時,可以再微調(diào)一下“聚

10、焦”,讓條帶變清晰。點擊“拍攝”按鈕: 2.7 單擊功能按鈕,進入圖像管理界面(該界面里能直接對圖片進行打印、保存、刪除或分析)。如需進行下一次拍攝,單擊功能按鈕返回至拍攝界面3 蛋白質(zhì)電泳凝膠拍攝方法: 3.1 ChampGel,ChampChemi:將折疊白光透射板從機箱內(nèi)折下.SmartGel,SmartChemi: 將白光透射板放入機箱內(nèi),并與12V電源連接. 3.2 打開拍攝界面,軟件將自動開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機啟動,在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置白光透射板中央,關(guān)閉暗箱門。關(guān)閉白光反射燈,打開白光透射燈 白光透射燈3.3 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽

11、圖片達到最佳效果。3.4 調(diào)整焦距,直至樣品達到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整3.5 調(diào)整聚焦,直至條帶清晰。聚焦調(diào)整單擊“拍攝”按鈕: 3.6 單擊功能按鈕,進入圖像管理界面(該界面里能直接對圖片進行打印、保存、刪除或分析)如需進行下一次實驗,單擊功能按鈕返回至拍攝界面注 意:同樣的操作方法可拍攝其它類型的樣品,如下圖所示:菌落斑點雜交膜X光膠片抑菌圈4 藍光樣品的拍攝方法: 提 示:請按照樣品中染料的吸收波長選擇合適的濾光鏡。4.1 將藍光透射臺放入機箱內(nèi),并與12V電源連接。打開拍攝界面,自動開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機啟動,在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置藍光透射臺中央,關(guān)閉白光反射

12、燈,開啟透射白光(藍光透射臺與白光透射共用一個開關(guān)按鈕),關(guān)閉暗箱門。藍光透射燈4.2 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。 4.3 調(diào)整焦距,直至樣品達到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整4.4 調(diào)整聚焦,直至條帶清晰。聚焦調(diào)整單擊“拍攝”按鈕: 4.5 單擊功能按鈕,進入圖像管理界面(在該界面里能直接對圖片進行打印、保存、刪除或分析),如需進行下一次拍攝,單擊功能按鈕返回至拍攝界面提 示:藍光樣品主要用藍光臺或反射藍光作為激發(fā)光源。藍光臺跟白光板共用一根電源線,均為12V。5 化學(xué)發(fā)光樣品的拍攝方法:5.1 打開拍攝界面,自動開啟白光反射燈。選擇ECL模式,濾光輪自動轉(zhuǎn)到5號空

13、位,負片功能自動啟動。單擊功能按鈕相機啟動,在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將未加入發(fā)光液的樣品放置化學(xué)發(fā)光樣品板中央,關(guān)閉暗箱門。白光反射燈5.2 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。5.3 調(diào)整焦距,直至樣品達到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整5.4 根據(jù)樣品上的MAKER或標(biāo)記的數(shù)字調(diào)整聚焦,直至樣品清晰。聚焦調(diào)整5.5 選擇拍攝方法,靈活的更改拍攝時間和張數(shù)。(一般濃度高的樣品使用單幀拍攝方法,即自動曝光后的圖像捕獲;濃度低的樣品使用規(guī)則積分拍攝或不規(guī)則積分拍攝方法,即長時間積分曝光拍攝)5.6 將發(fā)光液加在樣品上,關(guān)閉暗箱門,點擊功能按鈕5.7 軟件自動拍攝,直至完成所設(shè)置

14、的拍攝張數(shù)。5.8 單擊功能按鈕,進入圖象管理界面(該界面里能直接對圖片進行打印、保存、刪除或分析),如需進行下一次拍攝,單擊功能按鈕返回至拍攝界面。積分拍攝模式下保存的圖像格式為多頁式TIFF文件,一個文件中可保存多張圖像,您可以使用對多頁式TIFF文件進行查看。6 RGB反射光源激發(fā)樣品拍攝方法6.1 打開拍攝界面,自動開啟白光反射燈。單擊功能按鈕相機啟動,在圖像預(yù)覽區(qū)域顯示圖片效果。將樣品放置紫外透射臺中央,關(guān)閉暗箱門。白光反射燈6.2 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。6.3 調(diào)整焦距,直至樣品達到屏幕的滿幅面。焦距調(diào)整6.4 調(diào)整聚焦,直至樣品清晰。焦距調(diào)整

15、關(guān)閉白光反射燈,打開相對應(yīng)的RGB熒光燈,這時濾光輪自動轉(zhuǎn)到相對應(yīng)的濾鏡孔位。(圖例中樣品的激發(fā)光源是藍色熒光光源)藍色熒光光源6.6 單擊功能按鈕 ,軟件自動計算曝光值,使預(yù)覽圖片達到最佳效果。單擊“拍攝”按鈕: 6.6 單擊功能按鈕,進入圖像管理界面(該界面里能直接對圖片進行打印、保存、刪除或分析),如需進行下一次拍攝,單擊功能按鈕返回至拍攝界面軟 件 分 析 指 南 1 系統(tǒng)進入雙擊桌面圖標(biāo)出現(xiàn)新的對話框在對話框內(nèi)輸入用戶名和密碼,進入系統(tǒng)。管理員初始密碼:。請盡快設(shè)置和更改此密碼。管理員為最高級用戶,擁有最高權(quán)限,可以修改其他用戶的密碼,請注意保管好密碼。2 功能介紹打開圖像后,所有應(yīng)

16、用程序窗口便處于激活狀態(tài)。應(yīng)用程序窗口包括菜單欄、工具欄、圖像窗口、工作區(qū)以及狀態(tài)欄。下圖顯示了LANE 1D應(yīng)用程序窗口的上述及其它特征。菜單欄工具欄圖像窗口菜單欄: 菜單欄包含了所有LANE 1D命令,這些命令可從菜單欄上的菜單列表來選擇。同大多數(shù)應(yīng)用程序一樣,在選擇命令之前,您必須確定命令的應(yīng)用對象(例如,在選擇命令之前,應(yīng)確定已選擇了此命令將要應(yīng)用的圖像數(shù)據(jù))。工具欄: 工具欄是位于屏幕頂端的按鈕條。應(yīng)用程序窗口的此位置包含了LANE 1D最常用到的基本強度控制和成像工具當(dāng)光標(biāo)移到按鈕上時,將出現(xiàn)淺黃色簡短的描述該按鈕功能的提示信息。如果未出現(xiàn)提示信息,則表面該按鈕/功能不可應(yīng)用于當(dāng)前

17、圖像。本指南對工具欄上的26個按鈕進行了解述。這些按鈕的說明及其用途見下:在默認狀態(tài)下,下面的工具欄應(yīng)緊位于菜單欄之下。 圖標(biāo)位圖名稱打開文件保存圖像數(shù)據(jù)庫圖像多幀管理掃描圖像打印撤消旋轉(zhuǎn)清除興趣區(qū)域矩形興趣區(qū)域橢圓興趣區(qū)域任意興趣區(qū)域或魔棒注釋放大圖像拖動圖像對比度調(diào)整圖像優(yōu)化圖像重置自定義染色噪點消除泳道分析斑點分析菌落分析密度分析距離測量對比度增強工具:對比度增強工具按鈕可顯示或隱藏對比度增強控制面板。 可通過該面板方便地調(diào)整當(dāng)前活動圖像的亮度、對比度和伽瑪值(BCG)。每個特征由單獨的滑塊控制。可使用亮度控制來改變圖像的整體亮度。可使用對比度控制來改變圖像中明暗部分的亮度差異程度。可使

18、用伽瑪控制來增強圖像中很暗或很亮區(qū)域的對比度,而對圖像中間區(qū)域的對比度不會有明顯的影響。向右移動滑塊按鈕將增強該屬性。向左移動則降低該屬性。 點擊反相按鈕,圖片會發(fā)生相應(yīng)的變化。比如:亮條帶暗背景會變成暗條帶亮背景。暗條帶亮背景會變成亮條帶暗背景。點擊此按鈕將把BCG滑塊重置至默認值。點擊此按鈕,圖片會自動進行設(shè)置3 圖像分析3.1 1D凝膠分析(適用于DNA/RNA和蛋白質(zhì)凝膠電泳):3.1.1打開圖像:點擊功能按鈕 或者 出現(xiàn)對話框,在對話框內(nèi)打開需要分析的圖片3.1.2 圖像旋轉(zhuǎn):點擊對話框中的功能按鈕 ,可對傾斜的圖像進行校正進行校正。方法如圖:快捷調(diào)整方法:直接將鼠標(biāo)移至圖像上,將出

19、現(xiàn)旋轉(zhuǎn)符號,旋轉(zhuǎn)網(wǎng)格,讓網(wǎng)格橫軸與樣品條帶呈水平即可。提 示:在拍攝前,最好將凝膠在紫外臺或白光透射板中放正,從而可省去旋轉(zhuǎn)這一步驟直接進行下一步分析操作。3.1.3 圖像調(diào)整: 點擊功能按鈕 對圖片的有效分析區(qū)域進行矩形裁剪。 然后在工具欄中點擊編輯中的復(fù)制、粘貼并新建或者直接生成新圖像。出現(xiàn)裁剪的圖片后,可關(guān)閉原始圖片。提 示:拍攝圖片之前,最好把樣品盡量放大到整個屏幕,以確保剪切后的圖片有足夠多的像素。 3.1.4 圖像增強:點擊功能按鈕 ,將出現(xiàn)對比增強對話框:可手動對圖像進行后期增強或者點擊自動對圖像進行增強。另可點擊取消增強。3.1.5 分析設(shè)置: 點擊功能按鈕 將出現(xiàn)右側(cè)對話框3

20、.1.6 泳道識別:點擊對話框中的泳道,程序?qū)⒆詣幼R別泳道,并生成泳道輪廓圖。 如果有的泳道未能識別,或者識別錯誤,可以在對話框中進行刪除或者添加。另外,可統(tǒng)一修改泳道寬度,可直接在圖像上調(diào)整單一泳道的寬度,也在圖像上直接調(diào)整泳道識別區(qū)域的上下沿。3.1.7 初始井設(shè)置: 通過初始井可自行定義每個泳道的起點。3.1.8 條帶識別:點擊對話框中的條帶進行條帶自動識別。點擊尋找條帶,軟件將進行自動查找。通過最小條帶高度可自動添加和刪除條帶;也可通過添加條帶和刪除條帶的功能進行手動操作。對于微笑條帶,可通過彎曲條帶的功能進行調(diào)整。可用鼠標(biāo)直接在圖像上調(diào)整條帶的識別范圍可用鼠標(biāo)在泳道輪廓上調(diào)整條帶的識

21、別范圍,準(zhǔn)確度高于在圖像上調(diào)整的方法。3.1.9 背景校準(zhǔn):點擊對話框中的背景進行背景校準(zhǔn)??蛇x擇不同的背景扣除方法生成新圖像,新圖像的質(zhì)量將有所提高。選擇扣背景方法后,請點擊對話框中的顯示校準(zhǔn)圖像,程序?qū)⑸梢粡埧鄢尘暗男聢D像 。3.1.10 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇:點擊對話框中的標(biāo)準(zhǔn)分子量進行MAKER泳道的選擇與分子量標(biāo)準(zhǔn)的選擇。程序默認的MAKER泳道為1號泳道,如果樣品的MAKER不是1號泳道,可在對話框中點擊重置,再點擊選擇/取消選擇,然后在圖片單擊MAKER泳道。對話框中將顯示正確為MARKER泳道。另外,如果樣品中有兩個或兩個以上的MARKER泳道,請在選擇時進行多選??稍诜肿恿繕?biāo)準(zhǔn)

22、數(shù)據(jù)庫中調(diào)用已存有的MARKER.如果數(shù)據(jù)庫中沒有所需的分子量標(biāo)準(zhǔn),就點擊新建對話框。輸入當(dāng)前使用的MARKER分子量標(biāo)準(zhǔn),包括名稱、單位的選擇、遺傳物質(zhì)的選擇、擴散的選擇、分子量的數(shù)據(jù)的輸入。最后:必須點擊自動定位。注意:敏感度的數(shù)值調(diào)整將影響AFLP/RFLP及遺傳樹分析的結(jié)果。3.1.11 傾斜(雙MAKER或多MARKER校準(zhǔn)):如果樣品中有兩個以上MARKER的:請點擊傾斜來進行MAKER校正,可在對話框中選擇自動傾斜校準(zhǔn),也可通過手動方式添加傾斜線。如果樣品是單MARKER的話:無需使用傾斜功能,可直接進入結(jié)果分析。3.1.12 結(jié)果:程序?qū)⒆詣佑嬎愠鏊袟l帶的分子量、IOD、最大

23、OD值、百分比等數(shù)據(jù)??勺孕羞x擇顯示的方式。在文件中有多種數(shù)據(jù)導(dǎo)出方式供選擇。如需計算條帶含量,請在結(jié)果中點擊校準(zhǔn),選擇校準(zhǔn)質(zhì)量, 用鼠標(biāo)選擇MARKER泳道上的條帶進行點擊。然后在對話框中質(zhì)量一欄中輸入該條帶的質(zhì)量,在單位一欄中輸入單位,如:ug、mg、ng、pg等。(最少輸入3個已知質(zhì)量才能畫出標(biāo)準(zhǔn)曲線),最后點擊確定??杀4婧壳€,今后只需點擊載入調(diào)用。在結(jié)果中選擇把條帶含量,表格中將顯示所有條帶的含量。3.1.13 遺傳樹分析:點擊對話框中遺傳樹分析,可選擇遺傳樹分析方法??稍趫蟾嬷休斎雽嶒炐畔⒅苯由蓪嶒瀳蟾?,并可打印3.1.14 VNTRs分析:VNTRs多態(tài)性分析是一種常用的遺

24、傳分析方法,可用于群體間遺傳關(guān)系的研究親緣相關(guān)程度的分析,群體近交程度的分析等等。本軟件中VNTRs功能用于對數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)位點(Variable number of tandem repeats,VNTRs)進行分析和計算,此功能可以根據(jù)電泳軟件分析PCR產(chǎn)物各條帶的分子量大小,再根據(jù)每一個特異位點重復(fù)單元的大小以及特異引物擴增產(chǎn)物邊緣序列的長短,進一步確定每個實驗樣品VNTR特異位點重復(fù)單元的重復(fù)次數(shù)。點擊對話框中的VNTRs,調(diào)整重復(fù)單元大小和側(cè)翼序列大小,可直接計算出遺傳基因的頻率??稍趫蟾嬷休斎雽嶒炐畔⒅苯由蓪嶒瀳蟾?,并可打印3.1.15 視圖選擇:點擊對話框中的選擇視圖可對泳道

25、、條帶、輪廓圖等顯示、指示的方式進行選擇。比如:泳道顏色、條帶顏色、字體顏色和大小、數(shù)據(jù)顯示等。3.1.16 報告的生成:點擊對話框中的報告,選擇報告輸出的方式,并輸入實驗信息。泳道圖像報告輪廓圖報告結(jié)果報告泳道-條帶報告3.1.17 保存實驗:點擊保存,對當(dāng)前的實驗及數(shù)據(jù)進行存儲3.2 Western Blot分析3.2.1 打開圖像: 請查看3.1.13.2.2 圖像旋轉(zhuǎn): 請查看 3.1.23.2.3 圖像調(diào)整: 請查看 3.1.33.2.4 圖像增強: 請查看3.1.43.2.5 噪點去除: ECL Western Blot拍攝是積分拍攝,拍攝出的圖片會有噪點,這時需要去除噪點之后進行

26、分析才不會影響最后的結(jié)果,方法如下:點擊功能按鈕 彈出新對話框,直接點擊確定。原始圖像消除噪點后圖像3.2.6合并MARKER泳道:拍攝ECL樣品時,肉眼可見的MARKER泳道是無法和其它泳道拍攝在同一張圖像中,所以,在分析前,我們需要將MARKER與其它泳道進行圖像合成的操作。 第一步:點擊文件中的新建,建立一幅與原圖像素相當(dāng)?shù)膱D像。第二步:將其它泳道用選擇后復(fù)制,再粘貼到新圖像中。 第三步:將MARKER用選擇后復(fù)制,粘貼到新圖像中。合并完成。3.2.7 分析設(shè)置:請查看3.1.53.2.8 泳道識別:請查看3.1.63.2.9 條帶識別:請查看3.1.83.2.10 背景校準(zhǔn) 請查看 3

27、.1.93.2.11 標(biāo)準(zhǔn)分子量選擇 請查看 3.1.103.2.12 傾斜 請查看 3.1.113.2.13 結(jié)果 請查看 3.1.123.2.14 視圖選擇請查看3.1.153.2.15 報告的生成請查看 3.1.163.3 圖片合并 請查看3.2.53.4 染料數(shù)據(jù)庫和偽彩對于各種染料染色的凝膠,軟件自帶數(shù)據(jù)庫及其它染色功能可使圖像恢復(fù)自身顏色。首先,在圖像上點擊鼠標(biāo)右鍵,選擇“染料數(shù)據(jù)庫”。在數(shù)據(jù)庫中查找所需要的染料名稱。如沒有,可輸入新染料名稱的數(shù)據(jù),并進行保存。最后,將生成染色后的新圖像提 示:也可通過“偽彩色” 的方法進行染色。3.5 PCR密度分析3.5.1 打開圖像:請查看

28、3.1.13.5.2 圖像旋轉(zhuǎn): 請查看 3.1.23.5.3 圖像調(diào)整:請查看 3.1.33.5.4 圖像增強: 請查看 3.1.43.5.5 分析設(shè)置:點擊功能按鈕 出現(xiàn)新的對話框: 在對話框中點擊定義區(qū)域會出現(xiàn)區(qū)域選取對話框,有不規(guī)則、魔術(shù)棒、偽彩三種選取方式,可通過顏色范圍調(diào)整區(qū)域大小。操作通過鼠標(biāo)左鍵來實現(xiàn)。點擊確定后,表格中會顯示出當(dāng)前選擇區(qū)域的數(shù)據(jù)。3.5.6 強度校準(zhǔn):點擊對話框中的強度校準(zhǔn),在已知MARKER的條帶上用鼠標(biāo)點擊,然后在質(zhì)量欄中輸入該條帶的質(zhì)量,在單位一欄中輸入單位,比如:ug、mg、ng、pg等??奢斎雴蝹€或多個已知質(zhì)量。最后在對話框中點擊確定。也可保存含量曲

29、線,今后可點擊載入調(diào)用。顯示校準(zhǔn)值3.5.7 保存實驗:3.6 菌落/克隆計數(shù)分析3.6.1 打開圖像: 請查看 3.1.13.6.2 圖像旋轉(zhuǎn): 請查看 3.1.23.6.3 圖像調(diào)整: 請查看 3.1.33.6.4 圖像增強: 請查看 3.1.43.6.5 分析設(shè)置:點擊功能按鈕 出現(xiàn)新的對話框。對于質(zhì)量高的菌落圖像,可直接點擊全自動計數(shù),進行分析。對于有干擾的圖像,可通過選擇區(qū)域,然后進行全自動計數(shù)??稍跒V鏡中設(shè)置參數(shù),調(diào)整菌落的識別率,可在編輯中用添加菌落、刪除菌落、分割菌落、自動分離的方法提高識別準(zhǔn)確率。點擊數(shù)據(jù)表、統(tǒng)計表、分布圖可獲得各種所需數(shù)據(jù)。3.7 斑點雜交分析3.7.1 打開圖像: 請查看 3.1.13.7.2 圖像旋轉(zhuǎn):請查看 3.1.23.7.3 圖像調(diào)整: 請查看 3.1.33.7.4 圖像增強: 請查看 3.1.43.7.5 分析設(shè)置: 點擊功能按鈕,再點擊點,將出現(xiàn)參數(shù)設(shè)置對話框。可選擇需分析點的形狀、大小、行和列等。對于質(zhì)量高、無干擾的圖像

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論