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文檔簡介

1、基因的概念和結(jié)構(gòu),復(fù)等位基因(multiple alleles) 順反子(cistron) 超基因(super gene) 假基因 (pseudo gene) 斷裂基因和重疊基因 可動基因( mobile gene) 染色體外基因,第一節(jié) 基因的概念與發(fā)展,一、發(fā)展歷程 1.1865年 Mendel遺傳因子 最初由孟德爾的雜交試驗提出“遺傳因子”,此時為一邏輯推理產(chǎn)物,是一種與生物狀狀相應(yīng)的符號,無實質(zhì)內(nèi)容。 2.1909年 丹麥Johanssen基因,3.1910年40年代 Morgan等認(rèn)為基因是三合一體,即基因既是一個功能單位,也是一個突變單位和一個交換單位。 摩爾根通過對果繩的研究,闡

2、明了連鎖交換規(guī)律和伴性遺傳,并進(jìn)一步推理出基因在染色體上呈直線排列,基因是一種化學(xué)實體并決定性狀?;蚴峭蛔兒椭亟M的最小單位,4.1944年Avery首次證實基因是由DNA構(gòu)成,及1953年DNA雙螺旋模型的提出,人們認(rèn)為基因是具有一定遺傳效應(yīng)的DNA片段 5.1944年Beadle研究脈胞菌突變提出一基因一酶學(xué)說,后來研究血紅蛋白時發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)可由不同肽鏈組成,而突變只影響一條肽鏈提出了一基因一多肽學(xué)說,6.1955年,Benzer通過順反互補實驗發(fā)現(xiàn)一個基因內(nèi)部的許多位點上可以發(fā)生突變,并且可能在這些位點間發(fā)生交換,說明一個基因并不是一個突變單位和一個交換單位 7.60年代,Jacod和Mo

3、nod研究細(xì)菌基因調(diào)控時發(fā)現(xiàn)基因是可分的,功能上是有差別的,結(jié)構(gòu)基因決定合成某種蛋白質(zhì) 調(diào)節(jié)基因編碼阻遏或激活結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)基因,無翻譯產(chǎn)物的基因 8.新的發(fā)現(xiàn)斷裂基因,重疊基因,跳躍基因,基因是實體,它的物質(zhì)基礎(chǔ)是DNA(或RNA); 基因是具有一定遺傳效應(yīng)的DNA分子中的特定核苷酸序列; 基因是遺傳信息傳遞和性狀分化發(fā)育的依據(jù) 基因是可分的,基因的分子生物學(xué)定義,基因是編碼有功能的蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA所必需的全部核苷序列。 包含:編碼蛋白質(zhì)肽鏈或RNA的核酸序列,轉(zhuǎn)錄所必須的調(diào)控元件,編碼區(qū)上游的非編碼序列,內(nèi)含子,編碼區(qū)下游的非編碼序列。,基因結(jié)構(gòu),基因的不同類型,結(jié)構(gòu)基因: 為蛋

4、白質(zhì)或RNA編碼的基因,其產(chǎn)物為酶促反應(yīng)的有關(guān)的功細(xì)胞組分,它不影響其它基因的表達(dá) 調(diào)節(jié)基因:不編碼RNA或蛋白質(zhì)的基因,其主要作用是調(diào)節(jié)其它基因的表達(dá),功能性基因:基因家族中,仍然為蛋白質(zhì)或RNA編碼的家族成員稱 假基因(Pseudo gene):基因家族中已不為蛋白質(zhì)或RNA編碼的家族成員,第二節(jié) 復(fù)等位基因(multiple alleles),復(fù)等位基因: 一個群體中,一對同源染色體的同一基因座上存在著2個以上的等位基因,這就是復(fù)等位基因(multiple gene) 復(fù)等位基因是生物遺傳多態(tài)性在遺傳上的直接原因,復(fù)等位基因間的互作效應(yīng),互補基因:某性狀只有在二個以上的非等位基因共存時才

5、會表現(xiàn)出來,這種由于互相補充而使一個性狀得以表現(xiàn)的非等位基因,稱為互補基因 抑制基因:某一突變基因的表型效應(yīng)由于第二個突變基因的出現(xiàn)而恢復(fù)正常時,稱后一突變基因為前者的抑制基因,相關(guān)概念,上位效應(yīng):一對顯性基因的表現(xiàn)受到另一對非等位基因的作用,這種非等位基因間的抑制或遮掩作用叫上位效應(yīng)。起抑制作用的基因稱為上位基因,被抑制的基因稱為下位基因,一個2倍體細(xì)胞最多只能有復(fù)等位基因的2個拷貝 2個等位基因,可以組成3種基因型 3個等位基因,可以組成6種基因型 4個等位基因,可以組成10種基因型 n個等位基因,可以組成 n + n(n-1)/2種基因型 其中純合體為n 個,雜合體為n(n-1)/2個,

6、第三節(jié) 順反子(cistron),早期的基因概念:基因是一個功能單位,重組單位,突變單位(三位一體)。 發(fā)展的基因概念:基因是一個功能單位,基因內(nèi)部可突變和重組。一個基因就是一個順反子。 基因的順式和反式排列,順反子概念的提出,1955年,S.Benzer通過對T4噬菌體精細(xì)結(jié)構(gòu)的研究提出了順反子(Cistron),突變子(muton)和重組子(recon)的概念 順反子:編碼一種多肽鏈的核苷酸序列,是一個功能單位 突變子和重組子均為一核苷酸對,順反子學(xué)說否定了一個基因一個酶的假說 單順反子是真核基因的轉(zhuǎn)錄形式。一個啟動子后僅具有一個編碼序列。 多順反子出現(xiàn)于原核生物,即若干個基因由一個啟動子

7、控制,轉(zhuǎn)錄在一條mRNA上,Fig 15.10 The arrangement of genetic markers in cis and trans heterozygotes., 2003 John Wiley and Sons Publishers,兩個相鄰的等位基因,基因型均為m1+m2+,但是在染色體上的排列方式不一樣,因而表型也不相同,Fig 15.11 The cis-trans position effect observed by Edward Lewis with the apr and w mutations of Drosophila.,apr:杏色眼 w:白色眼,順式

8、排列表現(xiàn)為紅色,反式排列表現(xiàn)為杏色,如何判斷突變是在一個順反子內(nèi)還是2個不同的非等位基因,a1a1 x a2a2 突變型 突變型 a1a2 突變型 突變型 野生型 如果F1代是突變型,說明a1,a2位于同一順反子的不同位點,如果F1代是野生型,說明 a1,a2 是兩個非等位基因。,順反子: 是一個遺傳單位,一個順反子決定一個多肽鏈 突變子: 是DNA中構(gòu)成基因的一個或若干個核苷酸 重組子: 重組子代表一個空間單位,它有起點和終點,可以是若干個密碼子的重組,也可以是單個核苷酸的互換,順反子進(jìn)一步發(fā)展了基因的概念,第四節(jié) 操縱子(Operon),由操縱基因操縱的幾個結(jié)構(gòu)基因連鎖在一起,由一個啟動子

9、轉(zhuǎn)錄成為一個mRNA分子,然后翻譯成為幾種蛋白質(zhì),這樣的結(jié)構(gòu)稱為一個操縱子 乳糖操縱子:包括3個結(jié)構(gòu)基因-半乳糖苷酶、乳糖透性酶、乙?;?2020/10/13,26,1.操縱子的提出,大腸桿菌可以利用葡萄糖、乳糖、麥芽糖、阿拉伯糖等作為碳源而生長繁殖 當(dāng)培養(yǎng)基中含有葡萄糖和乳糖時,細(xì)菌優(yōu)先利用葡萄糖 當(dāng)葡萄糖耗盡,細(xì)菌停止生長,經(jīng)過短時間的適應(yīng),就能利用乳糖,細(xì)菌繼續(xù)呈指數(shù)式繁殖增長,2020/10/13,27,大腸桿菌利用乳糖至少需要兩個酶:促使乳糖進(jìn)入細(xì)菌的半乳糖透過酶(lactose permease)和催化乳糖分解第一步的 半乳糖苷酶( -galactosidase),2020/10

10、/13,28,在環(huán)境中沒有乳糖時,大腸桿菌合成-半乳糖苷酶量極少,加入乳糖2-3分鐘后,細(xì)菌大量合成-半乳糖苷酶,其量可提高千倍以上 二階段生長細(xì)菌利用乳糖再次繁殖前,也能測出細(xì)菌中-半乳糖苷酶活性顯著增高 這種誘導(dǎo)現(xiàn)象,法國的Jocob和Monod等人通過研究,于1961年提出乳糖操縱子(lac operon)學(xué)說,編碼阻礙基因的I位點 啟動子區(qū)域P位點 操縱基因O位點 三個結(jié)構(gòu)基因:ZYA,當(dāng)乳糖缺乏是,I基因表達(dá)阻遏物,阻礙物與操縱基因結(jié)合,啟動子的活性收到阻礙,ZYA基因轉(zhuǎn)錄起始受到抑制 在乳糖存在是,乳糖與阻遏物結(jié)合,改變阻遏物構(gòu)象使之不能與操縱基因結(jié)合因此起始ZYA基因的合成,Re

11、pressor maintains the lac operon in the inactive condition by binding to the operator; addition of inducer releases the repressor, and thereby allows RNA polymerase to initiate transcription.,第五節(jié) 超基因,超基因(super gene):是指作用于一種性狀或作用于一系列相關(guān)性狀的幾個緊密連鎖的基因 基因家族:真核生物中由同一祖先基因在進(jìn)化過程中經(jīng)突變,重復(fù)和倒位等演變而成的具有相同或相似作用的所有基因,

12、稱基因家族,血紅蛋白超基因,超基因家族或成員可位于同一染色體上或不同染色體上 如脊椎動物的血紅蛋白基因,為四聚體,由兩條a鏈和兩條鏈組成,在不同發(fā)育階段血紅蛋白的組成不同 發(fā)育階段 血紅蛋白的組成 胚胎期(8周) 22 22 22 胎兒期(3-9月) 22 成人期(出生后) 22 22,類基因包括:、1、2、 類基因包括:、Gr、Ar、 類和類基因在染色體上,緊密連鎖,呈直線排列,形成一個超基因 Gr Ar ,基因簇:指基因家族的成員以串聯(lián)重復(fù)方式排列在一起或不同家族的成員構(gòu)成一重復(fù)單位,以串聯(lián)重復(fù)方式排列在一起。 原核;5 S RNA, 16SRNA,23SRNA 真核:5.8 S RNA,

13、18 S RNA,28 S RNA tRNA簇,假基因(pseudo gene):在基因家族中與功能基因相似的序列,但有許多突變以致于失去了原有的功能,假基因是沒有功能的基因。 在爪蟾5S基因、珠蛋白基因簇、免疫球蛋白基因簇及組織相容性抗原基因簇中都發(fā)現(xiàn)有假基因。,第六節(jié) 真核生物的斷裂基因,斷裂基因的發(fā)現(xiàn) 1977年Flavell 和Jeffreys兔球蛋白基因cDNA與DNA雜交實驗 同年Chambon 雞卵清蛋白的雜交實驗 真核生物的基因是斷裂的,基因的不連續(xù)性,在1977年以前,都認(rèn)為基因是一種為蛋白質(zhì)編碼的連續(xù)的核苷酸序列,因為當(dāng)時對基因的研究都是從原核生物開始的,而在原核基因中很少

14、有基因是間斷的 后來在對真核生物基因進(jìn)行研究時經(jīng)常發(fā)現(xiàn),真核基因比其相應(yīng)的mRNA長得多,開始以為基因的一端或兩端存在一些不轉(zhuǎn)錄的序列 但從核RNA(hnRNA)和mRNA的大小進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),核RNA比相應(yīng)的mRNA長,而與真核基因的大小相似,因此有一部分序列在初始轉(zhuǎn)錄中存在,而在mRNA從核轉(zhuǎn)運到胞質(zhì)之前被除去了 真核基因中存在著一些可能被轉(zhuǎn)錄但不為蛋白質(zhì)或多肽編碼的序列真核基因是間斷的。隨著對真核基因的深入研究,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn),絕大多數(shù)真核基因都是間斷的,包括外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)兩個大的部分,基因的可變剪切,黑腹果蠅tra基因 果蠅的dsx基因 肌鈣蛋白T基因 基因的可變剪

15、切現(xiàn)象在真核生物中普遍存在,同一DNA序列可編碼多種蛋白質(zhì) 利用不同的啟動子:有時基因不止一個啟動子,或啟動子中的不同成分可獨立起始轉(zhuǎn)錄,只是效率不同,因此可轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生不同的mRNA 利用不同的終止子:與啟動子的情況類似 改變拼接方式:將不同的外顯子拼接在一起,可產(chǎn)生不同mRNA(抗原、抗體,可變剪接的意義,promoter exon 1 exon2 exon3 exon 4 exon5 terminator A: 利用不同的啟動子(例:雞的強心肌和砂囊?。?B:利用不同的終止子(鼠降鈣素基因) C: 改變拼接方式(例鼠雞鈣蛋白T) 1 2 3 4 5 1 2 3 5,第七節(jié) 重疊基因(over

16、lapping gene),1973年 Weiner 研究RNA病毒時的發(fā)現(xiàn) 1977年 Sanger 研究X 174 Phage時發(fā)現(xiàn)5387bp的基因組,編碼的蛋白質(zhì)比預(yù)期要多 重疊基因概念:基因轉(zhuǎn)錄起始點不同,但是共用同一段DNA序列或幾個核苷酸的不同基因 除了RNA病毒和噬菌體,SV40病毒中也有重疊基因,原核生物重疊基因的類型,一個基因的核苷酸序列完全包含在另一個基因的核酸序列當(dāng)中,只是由于讀碼框不同而編碼不同蛋白質(zhì) 兩個基因核酸序列末端密碼子相互重疊,例如終止密碼TGA與起始密碼ATG重疊 某些核苷酸區(qū)段重疊,真核生物也有重疊基因,果蠅、人、秀麗新小桿線蟲中都有發(fā)現(xiàn) 一個基因的編碼

17、序列完全寓居于另一個基因的內(nèi)含子當(dāng)中 套嵌基因:一個基因的互補鏈編碼另外一個基因,第八節(jié) 可動基因( mobile gene),可動基因的概念:在染色體體上的位置是可以移動的基因被稱為可移動基因,也可以稱為轉(zhuǎn)座元件或轉(zhuǎn)座因子(Transposable element)。,易位:染色體發(fā)生斷裂,然后通過斷裂末端的重接,使染色體斷片連接在同一條染色體的新位置,或是連接轉(zhuǎn)移到另一條染色體上。此時,染色體斷片上的基因也隨著染色體的重接而移動到新的位置 轉(zhuǎn)座:在轉(zhuǎn)座酶的作用下,轉(zhuǎn)座子直接從原來位置切離下來,插入染色體的新位置;或者從自身的DNA序列轉(zhuǎn)錄出RNA,RNA逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cDNA再插入染色體上新的

18、位置,轉(zhuǎn)座同易位的概念區(qū)別,McClintock的貢獻(xiàn),原始發(fā)現(xiàn):1951年,McClintock B,在基因組中發(fā)現(xiàn)可以移動的基因,1984年獲諾貝爾獎 玉米粒顏色的遺傳。 正常:有色 有色 異常:有色 色斑 有色 無色,1932年,美國遺傳學(xué)家B. McClintock 發(fā)現(xiàn)玉米籽粒色斑不穩(wěn)定遺傳現(xiàn)象。1951年首次提出轉(zhuǎn)座子的概念,認(rèn)為在基因組的不同區(qū)域存在可移動的控制因子, controlling element。1983年獲諾貝爾獎。,玉米色粒調(diào)控元件 Ac-Ds系統(tǒng) 第9染色體短臂,有色基因C附近 C基因, 色素合成基因。 Ac基因,自主移動的調(diào)節(jié)因子,4.5 kb 5個exon,

19、編碼轉(zhuǎn)座酶 Ds基因, 非自主移動的受體因子 0.5-4.0 kb,與Ac有同源序列 插入引起色素不能合成,玉米的轉(zhuǎn)座因子,可動基因( mobile gene),玉米粒顏色的遺傳(C基因決定有色)。 C Ac 有色 C Ds Ac 花斑 C Ds 無色,Ac與Ds因子的結(jié)構(gòu),Ac因子:4.563kb;有5個外顯子,產(chǎn)物是轉(zhuǎn)座酶,兩端有11個bp的反向重復(fù)序列 5 CAGGGATGAAA.TTTCATCCCTG 3 3 GT CCCTACTTT.AAAGTAGGGAC 5 Ds因子(解離因子):與Ac序列具有很大的相似性,但是中間缺失序列。有0.5-4.0kb,兩端有11個bp的反向重復(fù)序列,在

20、插入位點上有6-8bp的正向重復(fù)序列,Ac與Ds因子的轉(zhuǎn)座機制,Ac與Ds因子的轉(zhuǎn)座屬于非復(fù)制機制,即不是先進(jìn)行拷貝后將拷貝轉(zhuǎn)移,而是直接從原位置消失,轉(zhuǎn)座作用的機制,轉(zhuǎn)座時發(fā)生的插入作用有一個普遍的特征,那就是受體分子中有一段很短的(3-12bp)、被稱為靶序列的DNA會被復(fù)制,使插入的轉(zhuǎn)座子位于兩個重復(fù)的靶序列之間 轉(zhuǎn)座酶交錯切開靶位點,插入序列插入與宿主的單鏈末端相連接,余下缺口由DNA聚合酶和連接酶填補,插入的兩端形成正向重復(fù),轉(zhuǎn)座引起的遺傳效應(yīng),插入突變 插入失活 插入帶來新的基因 非精確解離形成突變(缺失,重復(fù),到位) 插入激活,第九節(jié) 染色體外基因,染色體外基因(extra ch

21、romosomal gene):在真核和原核生物細(xì)胞中有一些位于染色體外的基因叫染色體外基因,一、質(zhì) 粒(plasmid),細(xì)菌中除了染色體外,還有大量的小環(huán)狀分子,就是質(zhì)粒(plasmid) 質(zhì)粒上有抗生素基因,二、線粒體基因組,線粒體是真核細(xì)胞中的細(xì)胞器。每個細(xì)胞中含有幾十至數(shù)千個線粒體。每個線粒體有多個線粒體基因組拷貝 線粒體是非孟德爾式遺傳,在高等生物中具有母性遺傳的特征,線粒體基因組變化很大,可相差兩個數(shù)量級,動物細(xì)胞的線粒體基因組較小,在人類、老鼠、牛等細(xì)胞中約為16.5kb。酵母線粒體基因組較大,但在不同菌株亦有變化,釀酒酵母約為84kb,每一細(xì)胞約有22個線粒體每一線粒體約有4個拷貝DNA,但在生長的細(xì)胞中有很大變化,第七節(jié) 基因的相互作用,互補基因(conplementary genes) 修飾基因(modifiers) 上位效應(yīng)(epistasis),基因的相互作用,互補基因(complementary genes):不同對基因相互作用,出現(xiàn)了新的性狀。這兩個基因稱為互補基因。 雞冠的遺傳: 玫瑰冠 X 豌豆冠 RRpp rrPP 胡桃冠 RrPp 胡桃冠 玫瑰冠 豌豆冠 單冠 R-P- R-pp rrP- rrpp 9 : 3 : 3 : 1,Fig 4.13 Comb shapes in chickens of

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