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畢業(yè)論文(設(shè)計)任務(wù)書及成績評定表 題 目 湖南石門雄黃礦礦坑水的生物多樣性分析 學(xué)生姓名 向 小 明 指導(dǎo)教師 楊 宇 學(xué) 院 資源加工與生物工程學(xué)院 專業(yè)班級 生 物 技 術(shù) 0801 班 本科生院制中 南 大 學(xué)畢業(yè)論文(設(shè)計)任務(wù)書畢業(yè)論文(設(shè)計)題目 湖南石門雄黃礦礦坑水的生物多樣性分析題目類型 實驗研究 題目來源 教師科研題 畢業(yè)論文(設(shè)計)時間從 2012.3.1 至 2012.6.10 1. 畢業(yè)論文(設(shè)計)內(nèi)容要求:1) 了解微生物浸礦的意義、現(xiàn)狀、發(fā)展和研究方向。2) 查閱中英文文獻,完成與研究內(nèi)容有關(guān)的約3000-5000字的英文翻譯。完成實驗研究的方案設(shè)計。3) 掌握試驗準(zhǔn)備,試驗操作及相關(guān)檢測儀器的使用,掌握基本的科研方法。4) 掌握菌種采樣、收藏、取樣、接種等操作方法。掌握實驗準(zhǔn)備、培養(yǎng)基配制的操作方法。掌握菌種的液體培養(yǎng)、固體培養(yǎng)的實驗方法和技術(shù)。 5) 完成以下實驗:a)樣品的采集和保存:b)提取細(xì)菌基因組DNA,瓊脂糖凝膠電泳,及16s DNA序列的PCR擴增。 c)完成目的16S DNA序列在大腸桿菌感受態(tài)中的克隆。 d)獲得單克隆子后,進行序列分析。 e)分析數(shù)據(jù),繪制系統(tǒng)發(fā)育樹。 f)通過實驗研究,掌握科學(xué)研究的基本方法,培養(yǎng)綜合運用專業(yè)知識分析 和解決問題的能力。 g)整理實驗數(shù)據(jù),完成畢業(yè)論文。 h)準(zhǔn)備論文答辯。 1題目類型:(1)理論研究(2)應(yīng)用研究(3)工程設(shè)計(4)工業(yè)藝術(shù)設(shè)計(5)其它2題目來源:(1)教師科研題(2)生產(chǎn)實際題(3)其它2. 主要參考資料:1楊宇,錢森,代沁蕓,萬民熙,黃芝英,師舞陽,邱冠周。湖南岳陽洞庭湖3 個樣點的表層水體細(xì)菌多樣性研究J生命科學(xué)研究,2005,12(4)2楊宇等,嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化酶基因多態(tài)性研究。J遺傳,2005,27 (5)生物群落多樣性簡介.上海市檢測中心.3王獻華. 生物多樣性保護與利用的主要研究方向.資源科學(xué).1994,4:16.4林先貴.胡君科土壤微生物多樣性的科學(xué)內(nèi)涵及其生態(tài)服務(wù)功能J.土壤學(xué) 報,2008.45 (5):892-900.5姚曉華.土壤微生物群落多樣性研究療法及進展J.廣西農(nóng)業(yè)生物科學(xué).2008,27 (SI):8488.6鄭璐,尹華群,劉學(xué)端等,德興銅礦酸性礦坑水水樣與底泥中微生物群落多 樣性及其群落結(jié)構(gòu)變化J.生態(tài)學(xué)報,2008.28(10).7陳平,李輝,牟伯中,油藏水樣細(xì)菌群落16S rRNA基因的RFLP分析,微生 物雜志,2005.25(6).8揭雨成,邢虎成,魯雁偉,康萬利等,湖南石門、冷水江、瀏陽3個礦區(qū)的 苧麻重金屬含量及累積特征J.生態(tài)學(xué)報.2011,31 (3).9王振剛,何海燕,嚴(yán)于倫,楊云等,石門雄黃礦地區(qū)居民砷暴露研究J.衛(wèi)生 研究.1999,28(1).10李蓮芳,曾希柏,白玲玉,李樹輝,石門雄黃礦周邊地區(qū)土壤砷分布及農(nóng)產(chǎn) 品健康風(fēng)險評估J.應(yīng)用生態(tài)學(xué)報.2010,21 (11).11曾敏,廖柏寒,曾清如,歐陽彬等,湖南郴州、石門、冷水江3個礦區(qū)As 污染狀況的初步調(diào)查J.農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報.2006,25(2).12劉許生,石門雄黃采礦史,J.國土資源導(dǎo)刊.2009,6(6).13郭騰飛,毛海霞,微生物多樣性研究技術(shù)進展,J.山西師范大學(xué)學(xué)報, 2010,24(zl).14 Akihiro Ohnishi*,Shinko Abe,Shiho Nashirozawa,Sayaka Shimada,Development of a 16S rDNA primer and PCR-RFLP method for the rapid detection of genus Megasphaera and species level identification,JApplied and Environmental M2011, doi: 10.1128/AEM.00359-11 AEM.00359-11 15 Kornelia Smallaa,Miruna Oros-Sichlera,Annett Millinga.ect.Bacterial diversity of soils assessed by DGGE, T-RFLP ,SSCP fingerprints of PCR-amplified 16S rRNA gene fragments: Do the different methods provide similar results?JJournal of Microbiological Methods, 2007,7,69(3): 47047916 Kathrin Euringer,Tillmann Lueders.,An optimised PCR/T-RFLP fingerprinting approach for the investigation of protistan communities in groundwater environments.JJournal of Microbiological Methods,2008,10,75(2):262-2683. 畢業(yè)論文(設(shè)計)進度安排階段階 段 內(nèi) 容起止時間文獻查閱資料,翻譯與研究相關(guān)的論文一篇2012.3.12012.3.10實驗準(zhǔn)備實驗方案設(shè)計,實驗試劑儀器及樣品的準(zhǔn)備2012.3.112012.3.20實驗研究樣品的采集; 細(xì)菌總DNA的提取及目的基因的克隆;目的基因在大腸桿菌感受態(tài)中的克??;單克隆子的獲得及16sDNA的序列分析;數(shù)據(jù)處理和系
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