畢業(yè)論文任務(wù)書2.doc

畢業(yè)論文(設(shè)計(jì))任務(wù)書及成績(jī)?cè)u(píng)定表 題 目 湖南石門雄黃礦礦坑水的生物多樣性分析 學(xué)生姓名 向 小 明 指導(dǎo)教師 楊 宇 學(xué) 院 資源加工與生物工程學(xué)院 專業(yè)班級(jí) 生 物 技 術(shù) 0801 班 本科生院制中 南 大 學(xué)畢業(yè)論文（設(shè)計(jì)）任務(wù)書畢業(yè)論文（設(shè)計(jì)）題目 湖南石門雄黃礦礦坑水的生物多樣性分析題目類型 實(shí)驗(yàn)研究 題目來源 教師科研題 畢業(yè)論文（設(shè)計(jì)）時(shí)間從 2012.3.1 至 2012.6.10 1. 畢業(yè)論文（設(shè)計(jì)）內(nèi)容要求：1） 了解微生物浸礦的意義、現(xiàn)狀、發(fā)展和研究方向。2） 查閱中英文文獻(xiàn)，完成與研究?jī)?nèi)容有關(guān)的約3000-5000字的英文翻譯。完成實(shí)驗(yàn)研究的方案設(shè)計(jì)。3） 掌握試驗(yàn)準(zhǔn)備，試驗(yàn)操作及相關(guān)檢測(cè)儀器的使用，掌握基本的科研方法。4） 掌握菌種采樣、收藏、取樣、接種等操作方法。掌握實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備、培養(yǎng)基配制的操作方法。掌握菌種的液體培養(yǎng)、固體培養(yǎng)的實(shí)驗(yàn)方法和技術(shù)。 5） 完成以下實(shí)驗(yàn)：a)樣品的采集和保存:b)提取細(xì)菌基因組DNA，瓊脂糖凝膠電泳，及16s DNA序列的PCR擴(kuò)增。 c)完成目的16S DNA序列在大腸桿菌感受態(tài)中的克隆。 d)獲得單克隆子后，進(jìn)行序列分析。 e)分析數(shù)據(jù)，繪制系統(tǒng)發(fā)育樹。 f)通過實(shí)驗(yàn)研究，掌握科學(xué)研究的基本方法，培養(yǎng)綜合運(yùn)用專業(yè)知識(shí)分析 和解決問題的能力。 g)整理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，完成畢業(yè)論文。 h)準(zhǔn)備論文答辯。 1題目類型：(1)理論研究(2)應(yīng)用研究(3)工程設(shè)計(jì)(4)工業(yè)藝術(shù)設(shè)計(jì)(5)其它2題目來源：(1)教師科研題(2)生產(chǎn)實(shí)際題(3)其它2. 主要參考資料:1楊宇，錢森，代沁蕓，萬民熙，黃芝英，師舞陽，邱冠周。湖南岳陽洞庭湖3 個(gè)樣點(diǎn)的表層水體細(xì)菌多樣性研究J生命科學(xué)研究，2005,12（4）2楊宇等，嗜酸氧化亞鐵硫桿菌亞鐵氧化酶基因多態(tài)性研究。J遺傳，2005,27 （5）生物群落多樣性簡(jiǎn)介.上海市檢測(cè)中心.3王獻(xiàn)華. 生物多樣性保護(hù)與利用的主要研究方向.資源科學(xué).1994,4:16.4林先貴.胡君科土壤微生物多樣性的科學(xué)內(nèi)涵及其生態(tài)服務(wù)功能J.土壤學(xué) 報(bào),2008.45 (5):892-900.5姚曉華.土壤微生物群落多樣性研究療法及進(jìn)展J.廣西農(nóng)業(yè)生物科學(xué).2008,27 (SI):8488.6鄭璐，尹華群，劉學(xué)端等，德興銅礦酸性礦坑水水樣與底泥中微生物群落多 樣性及其群落結(jié)構(gòu)變化J.生態(tài)學(xué)報(bào),2008.28(10).7陳平，李輝，牟伯中，油藏水樣細(xì)菌群落16S rRNA基因的RFLP分析，微生 物雜志,2005.25(6).8揭雨成，邢虎成，魯雁偉，康萬利等，湖南石門、冷水江、瀏陽3個(gè)礦區(qū)的 苧麻重金屬含量及累積特征J.生態(tài)學(xué)報(bào).2011,31 (3).9王振剛，何海燕，嚴(yán)于倫，楊云等，石門雄黃礦地區(qū)居民砷暴露研究J.衛(wèi)生 研究.1999,28(1).10李蓮芳，曾希柏，白玲玉，李樹輝，石門雄黃礦周邊地區(qū)土壤砷分布及農(nóng)產(chǎn) 品健康風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估J.應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào).2010,21 (11).11曾敏，廖柏寒，曾清如，歐陽彬等，湖南郴州、石門、冷水江3個(gè)礦區(qū)As 污染狀況的初步調(diào)查J.農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào).2006,25(2).12劉許生，石門雄黃采礦史，J.國(guó)土資源導(dǎo)刊.2009,6(6).13郭騰飛，毛海霞,微生物多樣性研究技術(shù)進(jìn)展，J.山西師范大學(xué)學(xué)報(bào)， 2010,24(zl).14 Akihiro Ohnishi*,Shinko Abe,Shiho Nashirozawa,Sayaka Shimada,Development of a 16S rDNA primer and PCR-RFLP method for the rapid detection of genus Megasphaera and species level identification,JApplied and Environmental M2011, doi: 10.1128/AEM.00359-11 AEM.00359-11 15 Kornelia Smallaa,Miruna Oros-Sichlera,Annett Millinga.ect.Bacterial diversity of soils assessed by DGGE, T-RFLP ，SSCP fingerprints of PCR-amplified 16S rRNA gene fragments: Do the different methods provide similar results?JJournal of Microbiological Methods, 2007,7,69(3): 47047916 Kathrin Euringer,Tillmann Lueders.,An optimised PCR/T-RFLP fingerprinting approach for the investigation of protistan communities in groundwater environments.JJournal of Microbiological Methods,2008,10,75(2):262-2683. 畢業(yè)論文（設(shè)計(jì)）進(jìn)度安排階段階 段 內(nèi) 容起止時(shí)間文獻(xiàn)查閱資料，翻譯與研究相關(guān)的論文一篇2012.3.12012.3.10實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)，實(shí)驗(yàn)試劑儀器及樣品的準(zhǔn)備2012.3.112012.3.20實(shí)驗(yàn)研究樣品的采集； 細(xì)菌總DNA的提取及目的基因的克?。荒康幕蛟诖竽c桿菌感受態(tài)中的克?。粏慰寺∽拥墨@得及16sDNA的序列分析；數(shù)據(jù)處理和系