中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南_第1頁(yè)
中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南_第2頁(yè)
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1、附件:中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南(試行)1組織實(shí)施管理101.1概述101.2實(shí)施保障101.3建設(shè)組織與分工101.4條件建設(shè)要求111.4.1硬件要求111.4.2 軟件要求112 中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)112.1技術(shù)要求112.2實(shí)施要求122.2.1 技術(shù)路線122.2.2 實(shí)施方案122.3考核與驗(yàn)收133 數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)133.1 技術(shù)要求133.1.1基本要求133.2實(shí)施要求133.2.1實(shí)施籌備133.2.2實(shí)施步驟153.3考核與驗(yàn)收163.3.1模板驗(yàn)收163.3.2系統(tǒng)驗(yàn)收163.3.3數(shù)據(jù)質(zhì)量要求174. 數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析174.1技術(shù)要求174.1.1基本要求

2、174.1.2 擴(kuò)展要求194.2實(shí)施要求194.2.1遵循原則194.2.2基礎(chǔ)設(shè)施要求204.2.3實(shí)施步驟204.2.4任務(wù)分工234.3考核與驗(yàn)收244.3.1 平臺(tái)驗(yàn)收244.3.2 成果驗(yàn)收244.4基礎(chǔ)設(shè)施要求244.4.1 硬件254.4.2 軟件254.4.3 數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)軟件部署251組織實(shí)施管理1.1概述“中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)”(以下簡(jiǎn)稱“共享系統(tǒng)”)是基于臨床科研一體化理念,利用現(xiàn)代信息技術(shù),在標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化的基礎(chǔ)上,充分整合計(jì)算機(jī)、數(shù)理統(tǒng)計(jì)、數(shù)據(jù)挖掘、人工智能等方法構(gòu)建的中醫(yī)臨床研究的技術(shù)平臺(tái)。根據(jù)中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)指導(dǎo)意見(jiàn)和中醫(yī)臨床研究基地業(yè)務(wù)建設(shè)要求,構(gòu)建

3、中醫(yī)臨床與科研信息共享系統(tǒng)是中醫(yī)臨床研究基地業(yè)務(wù)建設(shè)的重要任務(wù),是落實(shí)國(guó)家中醫(yī)藥管理局關(guān)于基地建設(shè)“一體兩翼”建設(shè)任務(wù)的重要舉措。為了指導(dǎo)、規(guī)范和推進(jìn)各基地中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)建設(shè),特制定中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南(簡(jiǎn)稱“指南”)。1.2實(shí)施保障國(guó)家組織開(kāi)展共享系統(tǒng)的規(guī)范研究,制定相關(guān)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范和建設(shè)要求;基地在國(guó)家統(tǒng)一指導(dǎo)和協(xié)調(diào)下,按照相關(guān)要求開(kāi)展共享系統(tǒng)建設(shè)。國(guó)家中醫(yī)藥管理局與各基地所在省級(jí)管理部門,定期對(duì)各基地共享系統(tǒng)建設(shè)進(jìn)度與質(zhì)量進(jìn)行檢查?;貞?yīng)當(dāng)把共享系統(tǒng)建設(shè)納入基地建設(shè)總體方案,統(tǒng)籌規(guī)劃,與基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)、學(xué)科??平ㄔO(shè)等協(xié)同推進(jìn),一并落實(shí)。1.3建設(shè)組織與

4、分工(1)國(guó)家中醫(yī)藥管理局建立國(guó)家中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)專家指導(dǎo)小組,負(fù)責(zé)基地共享系統(tǒng)建設(shè)中相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)的制定、數(shù)據(jù)共享協(xié)調(diào)、運(yùn)行管理咨詢和科研方法指導(dǎo);搭建中醫(yī)臨床科研信息學(xué)術(shù)交流平臺(tái),定期組織開(kāi)展中醫(yī)臨床研究的相關(guān)學(xué)術(shù)活動(dòng)與技術(shù)交流,培養(yǎng)高素質(zhì)中醫(yī)臨床研究人才。(2)基地要成立共享系統(tǒng)建設(shè)領(lǐng)導(dǎo)小組,設(shè)置相應(yīng)機(jī)構(gòu),配備專職負(fù)責(zé)人員。領(lǐng)導(dǎo)小組組長(zhǎng)由醫(yī)院主要領(lǐng)導(dǎo)擔(dān)任,成員應(yīng)當(dāng)包括重點(diǎn)研究病種負(fù)責(zé)人以及科研、信息、醫(yī)務(wù)等職能科室負(fù)責(zé)人。領(lǐng)導(dǎo)小組負(fù)責(zé)制定基地共享系統(tǒng)建設(shè)規(guī)劃;協(xié)調(diào)、組織重點(diǎn)研究病種技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)體系制定、人員技術(shù)培訓(xùn)、硬件建設(shè)、軟件系統(tǒng)安裝、信息系統(tǒng)整合及運(yùn)行調(diào)試等方面建設(shè)任務(wù)。(3)

5、重點(diǎn)研究病種須配備參與病種研究且熟悉術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)制定規(guī)范的固定人員,負(fù)責(zé)梳理歸集與本病種相關(guān)的名詞術(shù)語(yǔ),提出和更新重點(diǎn)病種相關(guān)的術(shù)語(yǔ)字典,制定、維護(hù)和更新重點(diǎn)病種的病歷模板。(4)基地科研管理或醫(yī)務(wù)部門須建立科研數(shù)據(jù)質(zhì)量控制體系,規(guī)范和監(jiān)督重點(diǎn)病種的數(shù)據(jù)采集過(guò)程;指導(dǎo)重點(diǎn)病種術(shù)語(yǔ)、模板和標(biāo)準(zhǔn)體系的建立。配備熟練掌握中醫(yī)理論、具有臨床科研數(shù)據(jù)的分析、挖掘能力的臨床科研方法學(xué)研究人員,開(kāi)展重點(diǎn)病種療效評(píng)價(jià)、診療方案優(yōu)化與評(píng)價(jià)、名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)總結(jié)和傳承研究等工作。(5)基地信息管理部門須有熟練掌握醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)安全運(yùn)行與維護(hù)的專職人員;配備掌握delphi語(yǔ)言等軟件編程語(yǔ)言和oracl

6、e等專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)開(kāi)發(fā)應(yīng)用能力的固定人員,負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)審核、系統(tǒng)維護(hù)、傳輸數(shù)據(jù)以及數(shù)據(jù)導(dǎo)出等。(6)基地可根據(jù)實(shí)際需要,設(shè)立共享系統(tǒng)建設(shè)專家技術(shù)組,為共享系統(tǒng)建設(shè)提供技術(shù)咨詢、方案審查和質(zhì)量評(píng)定等。(7)中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院深入研究共享系統(tǒng)關(guān)鍵技術(shù)問(wèn)題,為基地提供共性產(chǎn)品及技術(shù)服務(wù),參加項(xiàng)目的整體部署和人員培訓(xùn),指導(dǎo)制定建設(shè)規(guī)劃與方案。1.4條件建設(shè)要求1.4.1硬件要求共享系統(tǒng)是在整合醫(yī)院lis,pace,his,ris等信息集成網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上的應(yīng)用系統(tǒng)。醫(yī)院的硬件系統(tǒng)如中心機(jī)房配置、綜合布線系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)建設(shè)、數(shù)據(jù)庫(kù)及應(yīng)用服務(wù)器、存儲(chǔ)系統(tǒng)等的配置應(yīng)符合國(guó)家(或國(guó)際)相關(guān)建設(shè)規(guī)范及技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),核心設(shè)備需滿足中醫(yī)臨

7、床研究的需求,并保證基地信息平臺(tái)的安全運(yùn)行。1.4.2 軟件要求共享系統(tǒng)建設(shè)的應(yīng)用軟件主要包括:臨床數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)、數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)、數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及分析軟件、集成軟件等。臨床數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)是基于結(jié)構(gòu)化的中醫(yī)電子病歷系統(tǒng),執(zhí)行國(guó)家中醫(yī)藥管理局關(guān)于中醫(yī)醫(yī)院信息化建設(shè)功能規(guī)范和電子病歷的各項(xiàng)規(guī)定。其他應(yīng)用系統(tǒng)根據(jù)實(shí)際需要為共享系統(tǒng)的接入提供開(kāi)放接口,符合中醫(yī)臨床研究的需求,保證基地共享系統(tǒng)的正常運(yùn)行。2 中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集是中醫(yī)、西醫(yī)規(guī)范術(shù)語(yǔ)有機(jī)匯集,是臨床術(shù)語(yǔ)字典、臨床數(shù)據(jù)挖掘利用的基礎(chǔ)和規(guī)范術(shù)語(yǔ)的主要來(lái)源和支撐。術(shù)語(yǔ)字典是在數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)中,中醫(yī)臨床規(guī)范術(shù)語(yǔ)應(yīng)用的工具,是臨床數(shù)據(jù)采集模板與病歷書寫的

8、術(shù)語(yǔ)來(lái)源。共享系統(tǒng)建設(shè),要求采用統(tǒng)一的中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集和主要來(lái)自中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集的術(shù)語(yǔ)字典。2.1技術(shù)要求重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典為共享系統(tǒng)提供支撐服務(wù)。主要體現(xiàn)在四個(gè)方面:支持?jǐn)?shù)據(jù)采集、支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索、支持挖掘模型的形成、支持病歷模板的生成。(1)支持?jǐn)?shù)據(jù)采集提供臨床數(shù)據(jù)采集的便捷性及靈活性,同時(shí)排除冗余信息。(2)支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索調(diào)用,可以根據(jù)實(shí)際需要檢索術(shù)語(yǔ),能將所需術(shù)語(yǔ)及術(shù)語(yǔ)的各種屬性包括同義術(shù)語(yǔ)、編碼等檢索出來(lái)。(3)支持挖掘模型的形成支持?jǐn)?shù)據(jù)挖掘模型的形成,為后期數(shù)據(jù)整理、臨床數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)建立以及數(shù)據(jù)挖掘研究提供服務(wù),保證數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果的真實(shí)性及準(zhǔn)確性。(4)支持病歷模板的生成病歷模板是采

9、集系統(tǒng)的核心,重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典應(yīng)支持病歷模板的生成。2.2實(shí)施要求2.2.1 技術(shù)路線2.2.2 實(shí)施方案(1)中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集的補(bǔ)充中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院已研制了中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集,作為共同的資源提供給各基地應(yīng)用(各基地只有使用權(quán),版權(quán)屬于中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院)。在實(shí)施過(guò)程中將根據(jù)各基地的使用情況進(jìn)行術(shù)語(yǔ)的補(bǔ)充。(2)重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典的形成根據(jù)基地重點(diǎn)病種研究的典型病歷與相關(guān)文獻(xiàn),收集病種常用的中醫(yī)術(shù)語(yǔ),建立統(tǒng)一的重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典表結(jié)構(gòu)。將各重點(diǎn)病種的臨床常用術(shù)語(yǔ)及其屬性從中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集抽取到重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典。重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典的術(shù)語(yǔ)應(yīng)主要來(lái)源中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集,若需增加可根據(jù)規(guī)范納入。(3)重點(diǎn)

10、病種臨床術(shù)語(yǔ)字典的維護(hù) 重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典新增術(shù)語(yǔ)的審核。新增術(shù)語(yǔ)進(jìn)入術(shù)語(yǔ)審核表。審核表內(nèi)設(shè)有術(shù)語(yǔ)增加的時(shí)間、審核人、審核的時(shí)間、審核的結(jié)果。審核人員必須是是給予權(quán)限的重點(diǎn)病種研究專家。對(duì)納入到重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典的新術(shù)語(yǔ)給予標(biāo)識(shí)。重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典的刪改及修訂 。該字典的刪改及修訂必須是給予權(quán)限的重點(diǎn)病種研究專家,同時(shí)保留刪改及修訂的痕跡。2.3考核與驗(yàn)收重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)字典主要來(lái)自中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集,形成術(shù)語(yǔ)字典增加、刪除、修訂的機(jī)制與模式。3 數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)3.1 技術(shù)要求3.1.1基本要求(1)提供滿足臨床科研病歷數(shù)據(jù)采集工具采集系統(tǒng)以結(jié)構(gòu)化電子病歷為主要工具,能夠滿足中醫(yī)臨床醫(yī)療業(yè)務(wù)和

11、科研數(shù)據(jù)的同步采集需求。(2)符合電子病歷規(guī)范要求采集系統(tǒng)必須符合衛(wèi)生部電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)、國(guó)家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)等規(guī)范的要求。(3)具備全面實(shí)時(shí)采集臨床信息功能采集系統(tǒng)支持全面、規(guī)范、實(shí)時(shí)采集多源、多媒體、多格式的臨床信息(文字、表格、圖片、音頻、視頻等)。(4)與其他醫(yī)療系統(tǒng)間數(shù)據(jù)共享采集系統(tǒng)能夠與醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)集成融合,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。(5)與數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)有機(jī)結(jié)合采集系統(tǒng)數(shù)據(jù)能安全導(dǎo)出,應(yīng)與數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)儲(chǔ)、數(shù)據(jù)挖掘工作有機(jī)結(jié)合,融為一體。(6)科研病歷監(jiān)測(cè)功能具備科研病歷質(zhì)量監(jiān)測(cè)功能,有效的核查、核對(duì)科研病歷數(shù)據(jù)信息。3.2實(shí)施要求3.2.

12、1實(shí)施籌備(1)系統(tǒng)實(shí)施范圍確定確定基地重點(diǎn)病種研究的科室。(2)功能模塊選擇各基地對(duì)采集系統(tǒng)提出應(yīng)用需求,項(xiàng)目實(shí)施組對(duì)需求進(jìn)行合理分析,選用適合該單位采集系統(tǒng)實(shí)施的功能模塊。(3)基礎(chǔ)設(shè)施要求基地軟硬件設(shè)備到位及網(wǎng)絡(luò)的暢通是結(jié)構(gòu)化電子病歷實(shí)施最基本要求,項(xiàng)目實(shí)施組入場(chǎng)前基地單位必須保證軟硬件設(shè)備到位,各部門科室網(wǎng)絡(luò)暢通。提供用于采集系統(tǒng)、數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng)專用服務(wù)器各一臺(tái),滿足臨床、科研病歷數(shù)據(jù)采集、挖掘的實(shí)際應(yīng)用需求。應(yīng)選用當(dāng)前主流數(shù)據(jù)庫(kù)管理軟件如oracle等。(4)人員要求基地單位需要建立專職團(tuán)隊(duì)配合采集系統(tǒng)實(shí)施組完成實(shí)施工作。實(shí)施期間以實(shí)施組人員為主,醫(yī)院工作人員協(xié)助,基地科研人員逐步

13、熟悉工作流程和方法,為以后其它科室實(shí)施做好基礎(chǔ)和準(zhǔn)備。(5)系統(tǒng)接口設(shè)計(jì)要求系統(tǒng)接口方式采集系統(tǒng)接口方案根據(jù)醫(yī)院的實(shí)際情況或地區(qū)的要求制定,但方案需求要在實(shí)施組入場(chǎng)前明確。組織協(xié)調(diào)醫(yī)院應(yīng)協(xié)調(diào)該院信息系統(tǒng)(his/lis/pacs/ris等)與采集系統(tǒng)間的數(shù)據(jù)交換工作。采集系統(tǒng)能夠與醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)集成融合,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。(6)系統(tǒng)實(shí)施方案與實(shí)施計(jì)劃調(diào)研報(bào)告項(xiàng)目實(shí)施組進(jìn)行基地項(xiàng)目調(diào)研報(bào)告書準(zhǔn)備,包括醫(yī)院項(xiàng)目領(lǐng)導(dǎo)小組成員、醫(yī)院信息化現(xiàn)狀、醫(yī)院硬件建設(shè)情況(如機(jī)房、服務(wù)器等)、醫(yī)院重點(diǎn)科室及臨床科室情況、病歷結(jié)構(gòu)及模板格式、工作場(chǎng)所情況等。接口標(biāo)準(zhǔn)方案確定采集系統(tǒng)與his/lis/

14、pacs等系統(tǒng)的接口方案制定實(shí)施方案與實(shí)施計(jì)劃項(xiàng)目實(shí)施組根據(jù)調(diào)研書、接口工作方案,制定基地單位整體實(shí)施方案與實(shí)施計(jì)劃。3.2.2實(shí)施步驟(1)項(xiàng)目啟動(dòng)會(huì)準(zhǔn)備會(huì)議議程、參加人員、會(huì)議通知、會(huì)議地點(diǎn)等。(2)環(huán)境檢查檢查服務(wù)器、客戶端環(huán)境基礎(chǔ)搭建環(huán)境(如操作系統(tǒng)、殺毒軟件等)工作是否完成、客戶端及網(wǎng)絡(luò)環(huán)境等是否能連通。(3)接口開(kāi)發(fā)工作討論討論接口開(kāi)發(fā)的方案及細(xì)節(jié)內(nèi)容,確定接口開(kāi)發(fā)計(jì)劃。(4)項(xiàng)目啟動(dòng)會(huì)召開(kāi)領(lǐng)導(dǎo)小組組織,動(dòng)員相關(guān)各個(gè)部門配合項(xiàng)目實(shí)施組進(jìn)行工作,明確下一步的工作計(jì)劃。(5)科室調(diào)研對(duì)醫(yī)院的情況進(jìn)行初步調(diào)研,對(duì)科室進(jìn)行調(diào)研,收集重點(diǎn)病種及臨床科室病歷模板資料。(6)接口開(kāi)發(fā)與測(cè)試根據(jù)商

15、定的接口方案及計(jì)劃進(jìn)行接口開(kāi)發(fā)工作。環(huán)境搭建與接口開(kāi)發(fā)工作完成后,進(jìn)行實(shí)際聯(lián)調(diào)測(cè)試。(7)模板制作重點(diǎn)病種臨床術(shù)語(yǔ)的準(zhǔn)備參照中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)部分模板生成嚴(yán)格按照衛(wèi)生部發(fā)布電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)及國(guó)家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)等規(guī)范的要求進(jìn)行模板制作。模板維護(hù)成立模板維護(hù)小組,專門負(fù)責(zé)重點(diǎn)病種科研模板及其它病種模板的整理制作與維護(hù)工作。負(fù)責(zé)增加、刪改調(diào)整病歷模板中元素內(nèi)容,達(dá)到臨床與科研應(yīng)用要求。(8)實(shí)施計(jì)劃確認(rèn)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人對(duì)實(shí)施整體計(jì)劃和階段計(jì)劃進(jìn)行確認(rèn),共同配合執(zhí)行計(jì)劃(9)環(huán)境搭建安裝服務(wù)器、客戶端環(huán)境,并進(jìn)行調(diào)試(10)科室模板整理根據(jù)科室提供病歷模板需求及格式進(jìn)行模

16、板制作、整理、調(diào)整、測(cè)試工作,并與科室及院方負(fù)責(zé)人進(jìn)行模板確認(rèn)(11)培訓(xùn)準(zhǔn)備好培訓(xùn)環(huán)境、材料,對(duì)科室進(jìn)行采集系統(tǒng)應(yīng)用培訓(xùn)。包括各功能模塊應(yīng)用、常見(jiàn)問(wèn)題處理、科研數(shù)據(jù)分析等培訓(xùn)內(nèi)容。采取循環(huán)式培訓(xùn)。(12)系統(tǒng)使用正式運(yùn)行采集系統(tǒng),將實(shí)際入院病人的病歷內(nèi)容按照電子病歷書寫規(guī)范要求填寫。重點(diǎn)病種數(shù)據(jù)采集關(guān)鍵點(diǎn),按照病歷模板設(shè)定內(nèi)容進(jìn)行結(jié)構(gòu)化采集,病歷采集信息根據(jù)結(jié)構(gòu)化程度定期進(jìn)行解析并審核,審核內(nèi)容為前臺(tái)采集數(shù)據(jù)與解析后數(shù)據(jù)的一致性?;?cái)?shù)據(jù)中心承擔(dān)基地臨床與科研數(shù)據(jù)匯總、解析任務(wù),負(fù)責(zé)向國(guó)家中醫(yī)臨床研究數(shù)據(jù)中心上傳采集數(shù)據(jù)信息。(13)系統(tǒng)維護(hù)對(duì)電子病歷應(yīng)用常見(jiàn)問(wèn)題進(jìn)行收集并整理。定期檢查服務(wù)

17、器、客戶端系統(tǒng)運(yùn)行情況。3.3考核與驗(yàn)收3.3.1模板驗(yàn)收應(yīng)遵循如下原則:(1)模板格式完全符合國(guó)家電子病歷書寫規(guī)范的標(biāo)準(zhǔn)。(2)病歷模板內(nèi)容遵循科研目的及需求,可有效完成科研病歷數(shù)據(jù)采集。(3)病歷模板中標(biāo)準(zhǔn)化術(shù)語(yǔ)來(lái)源于術(shù)語(yǔ)標(biāo)準(zhǔn)知識(shí)庫(kù),可實(shí)現(xiàn)病歷內(nèi)容與后臺(tái)術(shù)語(yǔ)庫(kù)間的關(guān)聯(lián)。(4)保證病歷模板由五類基本元素組成:數(shù)值型、日期型、選擇型、字典型、文本型。(5)重點(diǎn)病種的病歷數(shù)據(jù)需測(cè)試幾十份,病歷解析完成后進(jìn)行病歷數(shù)據(jù)字段結(jié)構(gòu)核查。3.3.2系統(tǒng)驗(yàn)收系統(tǒng)在重點(diǎn)病種數(shù)據(jù)采集方面已達(dá)到目標(biāo)要求,同時(shí)也完成了本地化的改造工作,運(yùn)行穩(wěn)定,系統(tǒng)驗(yàn)收合格。3.3.3數(shù)據(jù)質(zhì)量要求病歷模板在臨床實(shí)際操作中高效、精確

18、的完成病人從入院記錄、病程記錄、手術(shù)記錄、量表、出院記錄等信息的書寫,其中重點(diǎn)病種臨床研究目標(biāo)涉及的關(guān)鍵信息以及病歷內(nèi)容中包括主訴、現(xiàn)病史、舌象、脈象、實(shí)驗(yàn)室檢查、中醫(yī)診斷、西醫(yī)診斷、辨病辨證依據(jù)等體現(xiàn)中醫(yī)診治特色的病歷內(nèi)容要求全結(jié)構(gòu)化采集。4. 數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析臨床診療數(shù)據(jù)是符合中醫(yī)理論的中醫(yī)診療方法和療效的直接證據(jù),采用結(jié)構(gòu)化采集系統(tǒng)完成數(shù)據(jù)采集之后,進(jìn)行面向臨床研究的數(shù)據(jù)利用研究是基地臨床科研信息共享的核心內(nèi)容和任務(wù)。在該階段,基地臨床研究人員需要基于臨床診療和研究積累,提出新穎合理的分析目標(biāo)。同時(shí)也需要根據(jù)臨床研究需求進(jìn)行數(shù)據(jù)清理、數(shù)據(jù)整理與轉(zhuǎn)換,以達(dá)到可靠數(shù)據(jù)分析的數(shù)據(jù)質(zhì)量要求。本

19、階段的研究過(guò)程分兩個(gè)交叉的研究步驟:數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)的構(gòu)建與臨床數(shù)據(jù)利用分析研究。本技術(shù)與實(shí)施要求用于結(jié)構(gòu)化臨床診療數(shù)據(jù)形成后,進(jìn)行數(shù)據(jù)利用和挖掘分析時(shí),在實(shí)施步驟和任務(wù)安排方面提供指導(dǎo)與參考。4.1技術(shù)要求參照國(guó)家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)醫(yī)院信息化建設(shè)基本規(guī)范中的中醫(yī)臨床研究分析分系統(tǒng),名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)傳承分系統(tǒng)和中醫(yī)輔助診療分系統(tǒng)的功能規(guī)范,結(jié)合國(guó)家中醫(yī)臨床研究基地臨床科研信息共享的要求,數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析須達(dá)到的技術(shù)要求如下。4.1.1基本要求(1)數(shù)據(jù)抽取、轉(zhuǎn)換與導(dǎo)入(etl)數(shù)據(jù)清理對(duì)結(jié)構(gòu)化病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行清理,去除關(guān)鍵信息如大病歷癥狀體征、診斷、中藥處方等與關(guān)鍵療效指標(biāo)缺失的患者記錄;數(shù)據(jù)抽

20、取與轉(zhuǎn)換從結(jié)構(gòu)化病歷數(shù)據(jù)庫(kù)中抽取適合科研分析的數(shù)據(jù),設(shè)定抽取和代碼轉(zhuǎn)換規(guī)則,實(shí)現(xiàn)對(duì)來(lái)源病歷數(shù)據(jù)的篩選,并到數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)數(shù)據(jù)的自動(dòng)轉(zhuǎn)換;數(shù)據(jù)導(dǎo)入支持大規(guī)模病歷數(shù)據(jù)到數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)數(shù)據(jù)的自動(dòng)批量導(dǎo)入與匯總處理。(2)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)模型建立囊括中醫(yī)病歷數(shù)據(jù)中患者人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息、大病歷、病程、方藥、理化檢查等信息,面向科研分析的關(guān)系數(shù)據(jù)模型,主要用于從病歷數(shù)據(jù)導(dǎo)入?yún)R總的大規(guī)模數(shù)據(jù)存儲(chǔ);細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)的規(guī)范模型具有與細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)模型類似但較為簡(jiǎn)化的數(shù)據(jù)模型結(jié)構(gòu),用于存儲(chǔ)規(guī)范整理后的科研分析數(shù)據(jù)集;大規(guī)模數(shù)據(jù)管理以大型數(shù)據(jù)庫(kù)管理軟件如oracle為依托,建立數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的安全訪問(wèn)、結(jié)構(gòu)化查詢、增刪改處理的客戶端軟件環(huán)境與機(jī)制。

21、(3)數(shù)據(jù)整理與數(shù)據(jù)導(dǎo)出數(shù)據(jù)整理結(jié)合中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)和臨床信息標(biāo)準(zhǔn)詞典,具有對(duì)癥狀體征、診斷、方藥和理化檢查等進(jìn)行規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)化處理的功能;數(shù)據(jù)審核支持對(duì)規(guī)范處理前后數(shù)據(jù)的人工審核,并對(duì)規(guī)范處理后數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)補(bǔ)充與修改;數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換將整理后數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成適合挖掘分析的數(shù)據(jù)格式;數(shù)據(jù)導(dǎo)出將規(guī)范整理后的數(shù)據(jù)導(dǎo)出為常用挖掘分析軟件能夠識(shí)別的數(shù)據(jù)輸入格式。(4)多維查詢檢索分別對(duì)癥狀體征、診斷、方藥和理化指標(biāo)等從時(shí)間、患者人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息、醫(yī)生等不同維度進(jìn)行即席查詢(由用戶自定義條件的查詢),實(shí)現(xiàn)面向病種研究需求的臨床數(shù)據(jù)探索性分析。(5)數(shù)據(jù)挖掘分析專用挖掘分析平臺(tái)具備基于實(shí)際臨床診療數(shù)據(jù),面向重點(diǎn)病種臨床

22、研究分析需求的專用挖掘分析功能,能夠?qū)崿F(xiàn)辨證經(jīng)驗(yàn)、有效處方和隨癥加減規(guī)律等分析,支持進(jìn)行基于臨床數(shù)據(jù)的有效方藥發(fā)現(xiàn)、臨床優(yōu)化治療方案形成和名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)傳承研究等各種臨床研究的數(shù)據(jù)挖掘分析任務(wù);適宜挖掘分析算法以中醫(yī)臨床癥證治-效為分析主線,具備數(shù)據(jù)預(yù)處理、混淆因素檢驗(yàn)、分類、聚類、相關(guān)分析、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析等適宜挖掘分析算法。4.1.2 擴(kuò)展要求(1)多維主題數(shù)據(jù)模型需要構(gòu)建面向主題的多維數(shù)據(jù)模型,以支持高效的多維查詢檢索功能。多維數(shù)據(jù)模型以rolap或molap模式實(shí)現(xiàn),對(duì)主題以事實(shí)表和維表形式進(jìn)行建模。(2)多源動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)整合除結(jié)構(gòu)化電子病歷數(shù)據(jù)源之外,在數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)平臺(tái)建立針對(duì)醫(yī)院其他信息來(lái)源如h

23、is,lis和現(xiàn)代臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)庫(kù)的動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)匯總和整合技術(shù),整合基地個(gè)性化科研分析數(shù)據(jù)源到數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中。(3)臨床決策與循證支持在數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)平臺(tái)基礎(chǔ)上,構(gòu)建面向特定病種診療的輔助決策支持功能,實(shí)現(xiàn)從臨床診療中尋找證據(jù)、分析證據(jù)和提煉證據(jù)的方法,輔助形成初步的臨床證據(jù)鏈。(4)高級(jí)數(shù)據(jù)挖掘分析多階段序貫治療方案的分析方法基于臨床實(shí)際診療數(shù)據(jù),利用內(nèi)隱對(duì)照和馬爾可夫決策過(guò)程模型,分析確認(rèn)較優(yōu)的動(dòng)態(tài)序貫治療方案;有效核心處方與癥藥隨癥加減規(guī)律的分析方法研制發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)有效的核心處方的層次復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析方法,以及隨癥用藥加減的藥癥關(guān)系知識(shí)的聚類分析方法。4.2實(shí)施要求數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)的實(shí)施包括平臺(tái)構(gòu)建和數(shù)

24、據(jù)分析利用研究?jī)蓚€(gè)主要階段。本部分闡述實(shí)施過(guò)程中需要遵循的原則、步驟和基本要求。4.2.1遵循原則以基地信息條件和基于實(shí)際臨床數(shù)據(jù)的病種臨床研究需求為基礎(chǔ),將數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)構(gòu)建和病種臨床研究有機(jī)結(jié)合,以基地臨床研究和專職人員為主導(dǎo),進(jìn)行臨床倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)的建設(shè)和示范應(yīng)用研究。注意在平臺(tái)構(gòu)建時(shí)的擴(kuò)展性,支持院內(nèi)的管理決策。4.2.2基礎(chǔ)設(shè)施要求除基本的局域網(wǎng)絡(luò)環(huán)境之外,數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)相關(guān)的硬軟件環(huán)境如下。(1)硬件要求數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)服務(wù)器用于分析用數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和管理。在保證運(yùn)行性能如cpu和內(nèi)存的基礎(chǔ)上,重點(diǎn)需要保證大容量的磁盤存儲(chǔ)(最好配置相應(yīng)的盤陣)。多維分析服務(wù)器用于分析報(bào)表的

25、應(yīng)用服務(wù),需要保證并發(fā)服務(wù)能力。etl數(shù)據(jù)處理和挖掘分析工作站用于數(shù)據(jù)導(dǎo)入的etl軟件的運(yùn)行和挖掘分析功能,鑒于etl的大規(guī)模數(shù)據(jù)導(dǎo)入和挖掘分析的高計(jì)算量,需要配置高端性能的服務(wù)器。(2)軟件要求oracle數(shù)據(jù)庫(kù)管理軟件(oracle 9i以上)bo中間件軟件(3)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)軟件部署在oracle數(shù)據(jù)庫(kù)環(huán)境中構(gòu)建ods數(shù)據(jù)表、細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)表、多維數(shù)據(jù)表、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析數(shù)據(jù)表以及系統(tǒng)運(yùn)行所需的元信息表等。 bo軟件的安裝和部署,元信息數(shù)據(jù)庫(kù)的導(dǎo)入和報(bào)表文件的導(dǎo)入處理。 etl和復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析系統(tǒng)的部署。4.2.3實(shí)施步驟(1)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)及挖掘分析平臺(tái)構(gòu)建臨床研究平臺(tái)由數(shù)據(jù)前處理、數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)、專用數(shù)據(jù)挖掘和多

26、維檢索與展示等四部分功能系統(tǒng)構(gòu)成。數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)分析用數(shù)據(jù)的抽取、轉(zhuǎn)換和導(dǎo)入處理;數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)分析用數(shù)據(jù)按照臨床研究?jī)?nèi)容涉及的數(shù)據(jù)元素及其關(guān)系進(jìn)行組織和管理,支持結(jié)構(gòu)化查詢、篩選和高效的數(shù)據(jù)分析服務(wù);專用數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng)在數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)數(shù)據(jù)組織模式的基礎(chǔ)上,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)挖掘分析算法和面向統(tǒng)計(jì)分析的數(shù)據(jù)導(dǎo)出接口;多維檢索與展示系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)直接基于數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)數(shù)據(jù)的多維檢索與展示,對(duì)臨床數(shù)據(jù)中顯性的數(shù)據(jù)關(guān)系從不同維度(證-癥-治-效)進(jìn)行展示。數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)構(gòu)建在大型數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)如oracle已經(jīng)安裝的基礎(chǔ)上,創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫(kù),并生成數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)關(guān)系數(shù)據(jù)表。針對(duì)臨床研究問(wèn)題所對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)內(nèi)容,采用數(shù)據(jù)模型設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)

27、多維數(shù)據(jù)模型,并基于該模型生成數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中相應(yīng)的多維數(shù)據(jù)表;數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的安裝與運(yùn)行測(cè)試在相應(yīng)的硬件服務(wù)器環(huán)境中進(jìn)行數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的部署,針對(duì)采集形成的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)入配置,形成并進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)入運(yùn)行測(cè)試,確保處理前后數(shù)據(jù)的一致性;專用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)安裝與運(yùn)行測(cè)試安裝專用數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng),完成與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)的連接配置,聯(lián)機(jī)篩選數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)數(shù)據(jù)形成數(shù)據(jù)集或采用測(cè)試數(shù)據(jù)樣例,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析功能運(yùn)行測(cè)試;多維檢索與分析系統(tǒng)安裝與分析設(shè)計(jì)安裝多維檢索與分析系統(tǒng),在多維數(shù)據(jù)模型和臨床分析問(wèn)題的基礎(chǔ)上,采用分析設(shè)計(jì)工具(如水晶報(bào)表)進(jìn)行分析報(bào)表的設(shè)計(jì)和發(fā)布。平臺(tái)構(gòu)建實(shí)施流程(2) 臨床數(shù)據(jù)利用分析臨床數(shù)

28、據(jù)分析利用階段主要任務(wù)包括:利用中醫(yī)臨床中采集的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),根據(jù)重點(diǎn)病種和重點(diǎn)科室確定的臨床分析目標(biāo),完成對(duì)中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)的前處理、數(shù)據(jù)挖掘分析和臨床研究成果總結(jié)等科研任務(wù)?;谇捌谕诰蚍治鼋?jīng)驗(yàn)和平臺(tái)構(gòu)建流程,數(shù)據(jù)利用分析的具體實(shí)施流程分成兩部分內(nèi)容:基于測(cè)試平臺(tái)的預(yù)分析和基于基地平臺(tái)的挖掘分析?;跍y(cè)試階段的預(yù)分析目的是解決針對(duì)基地特定目標(biāo)挖掘分析的所有技術(shù)環(huán)節(jié),并由基地專有挖掘分析人員參與進(jìn)行平臺(tái)功能操作的學(xué)習(xí)和實(shí)踐,完成對(duì)其的初步培訓(xùn)任務(wù);基于基地平臺(tái)的挖掘分析則由基地專有挖掘分析人員和臨床研究人員為主導(dǎo)進(jìn)行常規(guī)挖掘分析應(yīng)用研究,平臺(tái)研究組人員提供技術(shù)指導(dǎo)和協(xié)助,并對(duì)挖掘分析過(guò)程平臺(tái)相關(guān)的

29、功能進(jìn)行可能的優(yōu)化和完善。挖掘分析需求的提出根據(jù)臨床診療實(shí)踐和研究積累,基地臨床人員根據(jù)病種研究特點(diǎn)提出面向分析的臨床研究需求,該臨床研究需求需要表達(dá)明確的目標(biāo)與內(nèi)容;挖掘分析需求需要具體化到數(shù)據(jù)的納入條件,研究目標(biāo)中可能涉及的主要臨床數(shù)據(jù)內(nèi)容如診斷、病史、癥狀體征、理化指標(biāo)、藥物和結(jié)局指標(biāo)等;從臨床角度,能夠估計(jì)當(dāng)前采集數(shù)據(jù)對(duì)該研究目標(biāo)的支持程度。研究目標(biāo)一定要結(jié)合實(shí)際采集的數(shù)據(jù),充分利用基地?cái)?shù)據(jù)存在的優(yōu)勢(shì)和特點(diǎn),同時(shí)保證與臨床研究核心目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)具有較高的數(shù)據(jù)質(zhì)量;該部分工作由基地臨床研究人員提出,并不需要直接提挖掘分析目標(biāo),僅需要臨床人員熟悉的臨床研究目標(biāo)。平臺(tái)技術(shù)組人員可以參與從挖掘

30、分析和臨床診療數(shù)據(jù)的一般情況的角度提供反饋,以達(dá)到臨床人員修改形成相對(duì)明確而新穎的面向分析的臨床研究需求。數(shù)據(jù)前處理根據(jù)數(shù)據(jù)分析需求,確定和選擇適合的相關(guān)信息,利用數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的數(shù)據(jù)篩選、數(shù)據(jù)整理和數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)出等功能,從中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中提取和篩選符合科研和臨床要求的結(jié)構(gòu)化臨床數(shù)據(jù);把與分析目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)元素或變量進(jìn)行規(guī)范整理,對(duì)整理前后的數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)格的數(shù)據(jù)審核,保證每一例用于分析的數(shù)據(jù)內(nèi)容與臨床病歷內(nèi)容一致,形成用于分析的數(shù)據(jù)集。顯性知識(shí)的探索性分析利用多維檢索與分析系統(tǒng)提供的分析功能,對(duì)與臨床分析目標(biāo)相關(guān)的報(bào)表進(jìn)行即時(shí)檢索和操作,并導(dǎo)出分析結(jié)果,結(jié)合臨床知識(shí)對(duì)導(dǎo)出結(jié)果進(jìn)行解釋與分析。隱性

31、知識(shí)的挖掘分析臨床研究基地應(yīng)能夠根據(jù)分析目標(biāo),基于數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)整理后的數(shù)據(jù)和專用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘建模和分析,選擇合適的數(shù)據(jù)挖掘分析方法,操作完成數(shù)據(jù)挖掘分析任務(wù);利用臨床知識(shí)和理論從分析結(jié)果中總結(jié)中醫(yī)診療規(guī)律和特點(diǎn),形成中醫(yī)專家知識(shí)庫(kù),指導(dǎo)中醫(yī)醫(yī)生的臨床實(shí)踐。結(jié)果闡釋與臨床成果總結(jié)結(jié)果闡釋形成挖掘分析結(jié)果由基地臨床研究人員進(jìn)行解釋,若不能滿足預(yù)期研究目標(biāo),則需要根據(jù)情況回到挖掘分析的各個(gè)步驟進(jìn)行數(shù)據(jù)的重新處理和分析;臨床研究成果總結(jié)結(jié)合中醫(yī)基礎(chǔ)理論和預(yù)期臨床研究目標(biāo),由基地臨床研究人員完成挖掘分析結(jié)果的提煉和理論提升,形成臨床研究成果。數(shù)據(jù)利用分析階段實(shí)施流程4.2.4任務(wù)分工(1)原則在平臺(tái)構(gòu)建階段以技術(shù)組人員為主,基地臨床研究及其專職人員提供條件支持和建設(shè)需求。在數(shù)據(jù)利用分析階段以基地臨床研究及其專職人員為主,技術(shù)組人員提供技術(shù)指導(dǎo)與輔助。(2)具體任務(wù)與要求平臺(tái)構(gòu)建過(guò)程中的任務(wù)基礎(chǔ)設(shè)施準(zhǔn)備與專職人員配置準(zhǔn)備相應(yīng)的軟硬件條件,并配置專職數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)、數(shù)據(jù)處理和挖掘分析人員;示范數(shù)據(jù)準(zhǔn)備與測(cè)試協(xié)助在示范數(shù)據(jù)準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)內(nèi)容確定、數(shù)據(jù)整理和分析報(bào)表瀏覽測(cè)試等步驟提供支持和協(xié)助。數(shù)據(jù)分析利用中的任務(wù)主導(dǎo)并承擔(dān)挖掘分析的主體工作基

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