外源基因在酵母菌中表達講義課件

1、外源基因在酵母菌中的表達外源基因在酵母菌中的表達a a 酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征b b 酵母菌的宿主系統(tǒng)酵母菌的宿主系統(tǒng)c c 酵母菌的載體系統(tǒng)酵母菌的載體系統(tǒng)d d 酵母菌的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)酵母菌的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)e e 酵母菌的表達系統(tǒng)酵母菌的表達系統(tǒng)f f 利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗1外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征酵母菌的分類學(xué)特征酵母菌的分類學(xué)特征酵母菌（yeast）是一群以芽殖或裂殖方式進行無性繁殖的單細胞真核生物，分屬于子囊菌綱（子囊酵母菌）、擔(dān)子菌綱（擔(dān)子酵母菌）、半

2、知菌類（半知酵母菌），共由56個屬和500多個種組成。如果說大腸桿菌是外源基因最成熟的原核生物表達系統(tǒng)，則酵母菌是最成熟的真核生物表達系統(tǒng)。2外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征酵母菌作為表達外源基因受體菌的特征酵母菌表達外源基因的優(yōu)勢酵母菌表達外源基因的優(yōu)勢全基因組測序，基因表達調(diào)控機理比較清楚，遺傳操作簡便能將外源基因表達產(chǎn)物分泌至培養(yǎng)基中具有原核細菌無法比擬的真核蛋白翻譯后加工系統(tǒng)大規(guī)模發(fā)酵歷史悠久、技術(shù)成熟、工藝簡單、成本低廉不含有特異性的病毒、不產(chǎn)內(nèi)毒素，美國fda認定為安全的基因工程受體系統(tǒng)（generally recognized as safe gras

3、）酵母菌是最簡單的真核模式生物3外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的宿主系統(tǒng)酵母菌的宿主系統(tǒng)提高重組蛋白表達產(chǎn)率的突變宿主菌提高重組蛋白表達產(chǎn)率的突變宿主菌抑制超糖基化作用的突變宿主菌抑制超糖基化作用的突變宿主菌減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌廣泛用于外源基因表達的酵母宿主菌廣泛用于外源基因表達的酵母宿主菌4外源基因在酵母菌中表達講義廣泛用于外源基因表達的酵母宿主菌廣泛用于外源基因表達的酵母宿主菌目前已廣泛用于外源基因表達和研究的酵母菌包括：酵母屬如釀酒酵母（酵母屬如釀酒酵母（saccharomyces cerevisiaesaccharomyces

4、cerevisiae）克魯維酵母屬如乳酸克魯維酵母（克魯維酵母屬如乳酸克魯維酵母（kluyveromyces lactiskluyveromyces lactis）畢赤酵母屬如巴斯德畢赤酵母（畢赤酵母屬如巴斯德畢赤酵母（pichia pastorispichia pastoris）裂殖酵母屬如非洲酒裂殖酵母（裂殖酵母屬如非洲酒裂殖酵母（schizosaccharoyces pombeschizosaccharoyces pombe）漢遜酵母屬如多態(tài)漢遜酵母（漢遜酵母屬如多態(tài)漢遜酵母（hansenula polymorphahansenula polymorpha）其中釀酒酵母酒酵母的遺傳學(xué)和分

5、子生物學(xué)研究最為詳盡，但巴斯巴斯德畢赤酵母德畢赤酵母表達外源基因最理想。5外源基因在酵母菌中表達講義提高重組蛋白表達產(chǎn)率的突變宿主菌提高重組蛋白表達產(chǎn)率的突變宿主菌能導(dǎo)致釀酒酵母中重組蛋白產(chǎn)量提高或質(zhì)量改善的突變類型能導(dǎo)致釀酒酵母中重組蛋白產(chǎn)量提高或質(zhì)量改善的突變類型6外源基因在酵母菌中表達講義抑制超糖基化作用的突變宿主菌抑制超糖基化作用的突變宿主菌許多真核生物的蛋白質(zhì)在其天門冬酰胺側(cè)鏈上接有寡糖基團，它們常常影響蛋白質(zhì)的生物活性。整個糖單位由糖基核心和外側(cè)糖鏈兩部分組成。酵母菌普遍擁有蛋白質(zhì)的糖基化系統(tǒng)，但野生型釀酒酵母對異源蛋白的糖基化反應(yīng)很難控制，呈超糖基化傾向，因此超糖基化缺陷株非常重

6、要。7外源基因在酵母菌中表達講義減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解作用泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解作用8外源基因在酵母菌中表達講義減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌酵母菌泛素依賴型蛋白降解系統(tǒng)的編碼基因 酵母菌共有四個泛素編碼基因酵母菌共有四個泛素編碼基因ubi 1 編碼泛素-羧基延伸蛋白52（cep52） 對數(shù)生長期表達穩(wěn)定期關(guān)閉ubi 2 編碼泛素-羧基延伸蛋白52（cep52） 對數(shù)生長期表達穩(wěn)定期關(guān)閉ubi 3 編碼泛素-羧基延伸蛋白76（cep76） 對數(shù)生長期表達穩(wěn)定期關(guān)閉ubi 4 編

7、碼泛素五聚體對數(shù)生長期關(guān)閉穩(wěn)定期表達 酵母菌共有七個泛素連接酶基因：ubc 1、ubc 2、ubc 3、ubc 4、ubc 5、ubc 6、ubc 79外源基因在酵母菌中表達講義減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌減少泛素依賴型蛋白降解作用的突變宿主菌泛素降解途徑衰減的釀酒酵母泛素降解途徑衰減的釀酒酵母ubi ubi 4 4缺陷型：缺陷型： 在釀酒酵母菌中，泛素主要由ubi 4基因表達，ubi 4- -突變株能正常生長，但細胞內(nèi)游離泛素分子的濃度比野生株要低得多，因此ubi 4缺陷突變株是外源基因表達理想的受體uba uba 1 1缺陷型：缺陷型： uba1編碼泛素激活酶e1，uba1突變株

8、是致死性的，但其等位基因缺陷是非致死性的，而且也能削弱泛素介導(dǎo)的蛋白降解ubc4 - ubc5 ubc4 - ubc5 雙突變型：雙突變型： 七個泛素連接酶基因的突變對衰減蛋白降解作用同樣有效10外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的載體系統(tǒng)酵母菌的載體系統(tǒng)酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建酵母菌中的野生型質(zhì)粒酵母菌中的野生型質(zhì)粒11外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌中的野生型質(zhì)粒酵母菌中的野生型質(zhì)粒釀酒酵母中的2環(huán)狀質(zhì)粒幾乎所有的釀酒酵母中都含有2雙鏈環(huán)狀質(zhì)粒，拷貝數(shù)達50至100個。irs 反向重復(fù)序列，600 bp，重組flp 編碼產(chǎn)物驅(qū)動irs的同源重組rep 編碼產(chǎn)物控制質(zhì)粒

9、的穩(wěn)定性stb rep的結(jié)合位點接合酵母屬中的psr1和psb1，以及克魯維酵母屬中的pkd1等均與2質(zhì)粒類似。12外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌中的野生型質(zhì)粒酵母菌中的野生型質(zhì)粒乳酸克魯維酵母中的線狀質(zhì)粒乳酸克魯維酵母中含有兩種不同的雙鏈線狀質(zhì)粒pkl1和pkl1,拷貝數(shù)為50-100個，分別攜帶k1k2兩種能使多種酵母菌致死的毒反向重復(fù)序列素蛋白編碼基因（），同時含有毒素蛋白抗性基因。13外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建含有ars的yrpp質(zhì)粒的構(gòu)建ars為酵母菌中的自主復(fù)制序列，0.8-1.5kb，染色體上每30-40kb就有一個ars元件。酵

10、母菌自主復(fù)制型質(zhì)粒的構(gòu)建組成包括復(fù)制子、標記基因、提供克隆位點的大腸桿菌質(zhì)粒dna。 以ars為復(fù)制子的質(zhì)粒稱為yrp 以22質(zhì)粒上的復(fù)制元件為復(fù)制子的質(zhì)粒稱為yep上述兩類質(zhì)粒在釀酒酵母中的拷貝數(shù)最高可達200個，但培養(yǎng)幾代后，質(zhì)粒的丟失率高達50%-70%，主要是由于分配不均勻所致。14外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建含有cen的ycp質(zhì)粒的構(gòu)建cen為酵母菌染色體dna上與染色體均勻分配有關(guān)的序列將cen dna插入含ars的質(zhì)粒中，獲得的新載體稱為ycpycp質(zhì)粒具有較高的有絲分裂穩(wěn)定性，但拷貝數(shù)只有1 - 5個含有tell的yac質(zhì)粒的構(gòu)建1

11、5外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建酵母菌克隆表達質(zhì)粒的構(gòu)建含有酵母菌染色體dna同源序列的yip質(zhì)粒的構(gòu)建在大腸桿菌質(zhì)粒上組裝酵母菌染色體dna特定序列和標記基因，構(gòu)建出來的質(zhì)粒稱為yip。目的基因表達盒通常插在染色體dna特定序列中，這樣目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色體dna區(qū)域.16外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)酵母菌的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)轉(zhuǎn)化質(zhì)粒在酵母細胞中的命運轉(zhuǎn)化質(zhì)粒在酵母細胞中的命運酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌的轉(zhuǎn)化程序用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因17外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法酵母菌原生質(zhì)體

12、轉(zhuǎn)化法早期酵母菌的轉(zhuǎn)化都采用在等滲緩沖液中穩(wěn)定的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法，在ca2+2+和peg的存在下，轉(zhuǎn)化細胞可達原生質(zhì)體總數(shù)的1-2%。但該程序操作周期長，而且轉(zhuǎn)化效率受到原生質(zhì)再生率的嚴重制約原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法的一個顯著特點是，一個受體細胞可同時接納多個質(zhì)粒分子，而且這種共轉(zhuǎn)化的原生質(zhì)體占轉(zhuǎn)化子總數(shù)的25-33%18外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌的轉(zhuǎn)化程序 堿金屬離子介導(dǎo)的酵母菌完整細胞的轉(zhuǎn)化堿金屬離子介導(dǎo)的酵母菌完整細胞的轉(zhuǎn)化釀酒酵母的完整細胞經(jīng)堿金屬離子（如li+ +等）、peg、熱休克處理后，也可高效吸收質(zhì)粒dna，而且具有下列特性：吸收線型dna的能力明顯大于環(huán)狀dna，兩

13、者相差80倍共轉(zhuǎn)化現(xiàn)象極為罕見19外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌的轉(zhuǎn)化程序酵母菌電擊轉(zhuǎn)化法酵母菌電擊轉(zhuǎn)化法酵母菌原生質(zhì)體和完整細胞均可在電擊條件下吸收質(zhì)粒dna，但在此過程中應(yīng)避免使用peg，它對受電擊的細胞具有較很大的負作用。電擊轉(zhuǎn)化的優(yōu)點是不依賴于受體細胞的遺傳特征及培養(yǎng)條件適用范圍廣，而且轉(zhuǎn)化率可高達105 5 / gdna。20外源基因在酵母菌中表達講義轉(zhuǎn)化質(zhì)粒在酵母細胞中的命運轉(zhuǎn)化質(zhì)粒在酵母細胞中的命運單雙鏈dna均可轉(zhuǎn)化酵母菌，但單鏈的轉(zhuǎn)化率是雙鏈的10-30倍；含有復(fù)制子的單鏈質(zhì)粒進入細胞后，能準確地轉(zhuǎn)化為雙鏈并復(fù)制；不含復(fù)制子的單鏈質(zhì)粒進入細胞后，能高效地同源

14、整合入染色體,這對于體內(nèi)定點突變酵母基因組極為有利；克隆在yip整合型質(zhì)粒上的外源基因，如果含有受體細胞的染色體dna的同源序列，會發(fā)生高頻同源整合，整合子占轉(zhuǎn)化子總數(shù)的50-80%。21外源基因在酵母菌中表達講義用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因營養(yǎng)缺陷型的互補基因營養(yǎng)缺陷型的互補基因用于酵母菌轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因主要有營養(yǎng)缺陷型互補基因和顯性基因兩大類營養(yǎng)缺陷型互補基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因，如：leu、trp、his、lys、ura、ade但對于多倍體酵母來說，篩選營養(yǎng)缺陷型的受體非常困難22外源基因在酵母菌中表達講義用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基因用于轉(zhuǎn)化子篩選的標記基

15、因顯性標記基因顯性標記基因23外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌的表達系統(tǒng)酵母菌的表達系統(tǒng)外源基因在酵母菌中表達的限制因素外源基因在酵母菌中表達的限制因素酵母菌啟動子的可控性酵母菌啟動子的可控性酵母菌表達系統(tǒng)的選擇酵母菌表達系統(tǒng)的選擇24外源基因在酵母菌中表達講義25外源基因在酵母菌中表達講義26外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌啟動子的可控性酵母菌啟動子的可控性超誘導(dǎo)型啟動子超誘導(dǎo)型啟動子釀酒酵母的半乳糖利用酶系由gal1gal7和gal10基因編碼27外源基因在酵母菌中表達講義外源基因在酵母菌中表達的限制因素外源基因在酵母菌中表達的限制因素外源基因穩(wěn)態(tài)外源基因穩(wěn)態(tài)mrnamrna的濃度的濃度外

16、源基因外源基因mrnamrna的翻譯活性的翻譯活性酵母菌對密碼子的偏愛性酵母菌對密碼子的偏愛性 在釀酒酵母中，高豐度的蛋白質(zhì)（如甘油 醛-3-磷酸脫氫酶gapdh、磷酸甘油激酶 pkg、乙醇脫氫酶adh）中96%以上的 氨基酸是由25個密碼子編碼的28外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌表達系統(tǒng)的選擇酵母菌表達系統(tǒng)的選擇釀酒酵母表達系統(tǒng)釀酒酵母表達系統(tǒng)釀酒酵母的基因表達系統(tǒng)最為成熟，包括轉(zhuǎn)錄活性較高的甘油醛-3-磷酸脫氫酶基因gapdh、磷酸甘油激酶基因pkg、乙醇脫氫酶基因adh所屬的啟動子，多種重組外源蛋白獲得成功表達。釀酒酵母表達系統(tǒng)的最大問題在于其超糖基化能力，往往使得有些重組蛋白（如人血

17、清白蛋白等）與受體細胞緊密結(jié)合，而不能大量分泌。這一缺陷可用非釀酒酵母型的表達系統(tǒng)來彌補29外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌表達系統(tǒng)的選擇酵母菌表達系統(tǒng)的選擇乳酸克魯維酵母表達系統(tǒng)乳酸克魯維酵母表達系統(tǒng)乳酸克魯維酵母的雙鏈環(huán)狀質(zhì)粒pkd1已被廣泛用作重組異源蛋白生產(chǎn)的高效表達穩(wěn)定性載體，即便在無選擇壓力的條件下，也能穩(wěn)定遺傳40代以上。乳酸克魯維酵母表達分泌型和非分泌型的重組蛋白，性能均優(yōu)于釀酒酵母表達系統(tǒng)。30外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌表達系統(tǒng)的選擇酵母菌表達系統(tǒng)的選擇巴斯德畢赤酵母表達系統(tǒng)巴斯德畢赤酵母表達系統(tǒng)巴斯德畢赤酵母是一種甲基營養(yǎng)菌，能在低廉的甲醇培養(yǎng)基中生長，甲醇可高效誘導(dǎo)

18、甲醇代謝途徑中各酶編碼基因的表達，因此生長迅速、乙醇氧化酶基因aox11所屬強啟動子、表達的可誘導(dǎo)性是巴斯德畢赤酵母表達系統(tǒng)的三大優(yōu)勢。由于巴斯德畢赤酵母沒有合適的自主復(fù)制型載體，所以外源基因的表達序列一般整合入受體的染色體dna上。在此情況下，外源基因的高效表達在很大程度上取決于整合拷貝數(shù)的多寡。目前已有20余種具有經(jīng)濟價值的重組蛋白在巴斯德畢赤酵母系統(tǒng)中獲得成功表達。31外源基因在酵母菌中表達講義酵母菌表達系統(tǒng)的選擇酵母菌表達系統(tǒng)的選擇多型漢遜酵母表達系統(tǒng)多型漢遜酵母表達系統(tǒng)多型漢遜酵母也是一種甲基營養(yǎng)菌。其自主復(fù)制序列hars已被克隆，并用于構(gòu)建克隆表達載體，但與巴斯德畢赤酵母相似，這種

19、載體在受體細胞有絲分裂時顯示出不穩(wěn)定性。所不同的是，hars質(zhì)粒能高頻自發(fā)地整合在受體的染色體dna上，甚至可以連續(xù)整合100多個拷貝目前，包括乙型肝炎表面抗原在內(nèi)的數(shù)種外源蛋白在該系統(tǒng)中獲得成功表達。 ，因此重組多型漢遜酵母的構(gòu)建也是采取整合的策略。32外源基因在酵母菌中表達講義f f利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗由乙型肝炎病毒（hbv）感染引起的急慢性乙型肝炎是一種嚴重的傳染病，每年約有220000萬病人死亡，并有33億人成為hbv攜帶者，其中相當一部分人可能轉(zhuǎn)化為肝硬化或肝癌患者。目前對乙型肝炎病毒還沒有一種有效的治療藥物，因此高純度乙型疫苗的生產(chǎn)對預(yù)防病毒感染具有重大

20、的社會效益，而利用重組酵母大規(guī)模生產(chǎn)乙型疫苗為其廣泛應(yīng)用提供了可靠的保證。33外源基因在酵母菌中表達講義利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗利用重組酵母生產(chǎn)乙肝疫苗乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)產(chǎn)乙肝表面抗原的重組釀酒酵母產(chǎn)乙肝表面抗原的重組釀酒酵母產(chǎn)乙肝表面抗原的重組巴斯德畢赤酵母產(chǎn)乙肝表面抗原的重組巴斯德畢赤酵母34外源基因在酵母菌中表達講義乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙肝病毒是一種蛋白包裹型的雙鏈dna病毒，具有感染力的病毒；乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)顆粒呈球面狀，直徑為42 nm，基因組僅為3.2 kb。病毒顆粒的主要結(jié)構(gòu)蛋白是病毒的表面抗原多肽（hbsag）或s多肽，它具有糖基化和非糖基化兩種形式。顆粒內(nèi)的蛋白成份包括核心抗原（ hbcag ）和病毒dna聚合酶、微量病毒蛋白；除此之外，被乙肝病毒感染的人的肝臟還能合成并釋放大量的22nm的空殼亞病毒顆粒，其免疫原性是未裝配的各種包裝蛋白組份的1000倍。包裝蛋白共有三種轉(zhuǎn)膜糖蛋白：s、m、l多肽。35外源基因在酵母菌中表達講義乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙型肝炎病毒的包裝蛋白編碼基因乙型肝炎病毒的包裝蛋白編碼基因36外源基因在酵母菌中表達講義乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)乙型肝炎病毒的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)傳統(tǒng)乙肝疫苗的制備傳統(tǒng)乙肝疫苗的制備乙肝病毒在體外細胞培養(yǎng)基中并不能繁殖，因此