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文檔簡介

1、實驗室常用技術(shù)資料Lab. experiment technologyLQ細(xì)胞凍存1. 實驗前準(zhǔn)備:細(xì)胞室及工作臺紫外線照射30min;吹打管、中槍頭、中槍、培養(yǎng)液、PBS、胰酶、小牛血清、DMSO、;收集對數(shù)生長期細(xì)胞,在凍存前一天最好換液2用吸管吸出培養(yǎng)瓶中的細(xì)胞培養(yǎng)液,PBS清洗2遍吸出沖洗液,加入1.5ml胰蛋白酶消化。3. 適時去掉胰蛋白酶,加入少量新培養(yǎng)液。吸管吸取培養(yǎng)液吹打瓶壁上的細(xì)胞,使其成為均勻分散的細(xì)胞懸液。4. 用吸管將培養(yǎng)液加入凍存管中,離心1000r/min,8分鐘。(可以留下一部分細(xì)胞懸液在培養(yǎng)瓶中繼續(xù)培養(yǎng))5. 用中槍吸去上清液直至凍存管內(nèi)剩余1ml培養(yǎng)液,加入1

2、10ulDMSO(二甲基亞楓),用槍頭輕輕吹打使細(xì)胞均勻。6. 冷存管置于430min-2030min-801618小時(或隔夜)-液氮槽長期儲存。(-20不可超過1h,以防止胞內(nèi)冰晶過大,造成細(xì)胞大量死亡,亦可跳過此步驟直接放入-80冰箱中,惟存活率稍微降低一些)。7記錄每一個冷凍管的位置以確保在以后應(yīng)用時能夠找到每一個冷凍管。細(xì)胞復(fù)蘇冷凍細(xì)胞之活化原則為快速解凍,以避免冰晶重新結(jié)晶而對細(xì)胞造成傷害,導(dǎo)致細(xì)胞之死亡。細(xì)胞活化后,約需數(shù)日,或繼代一至二代,其細(xì)胞生長或特性表現(xiàn)才會恢復(fù)正常。1 材料:37 恒溫水浴箱,新鮮培養(yǎng)基,無菌吸管/ 離心管/ 培養(yǎng)瓶 2 步驟: 1、操作人員應(yīng)戴防護面罩

3、及手套,防止冷凍管可能爆裂之傷害。 2、自液氮或干冰容器中取出冷凍管,檢查蓋子是否旋緊,由于熱脹冷縮過程,此時蓋子易松掉。 3、取出冷凍管,立即放入37 C 水槽中快速解凍,輕搖冷凍管使其在1分鐘內(nèi)全部融化。4、常溫離心1000rpm,5min,以70% 酒精擦拭保存管外部,移入無菌操作臺內(nèi),去除上清夜,加入新鮮培養(yǎng)基,重懸細(xì)胞。5、取出細(xì)胞懸浮液,緩緩加入有培養(yǎng)基之培養(yǎng)瓶,混合均勻,放入CO2 培養(yǎng)箱培養(yǎng)。G418和篩選1、篩選之前由于每種細(xì)胞對G418的敏感性不同,而且不同的廠家生產(chǎn)的相同濃度的G418的活性不盡相同,所以在篩選之前,一定要確定G418的最佳篩選濃度。1.G418的配制:取

4、1g G418溶于1ml 1M的HEPES液中,加蒸餾水至10ml,過濾消毒,4度保存。2.細(xì)胞培養(yǎng):取待測培養(yǎng)細(xì)胞,制備成細(xì)胞懸液,按等量(10000個/ml)接種入24孔培養(yǎng)板中,過夜培養(yǎng),開始加藥。3.制備篩選培養(yǎng)基:在100ug/ml1000ug/ml范圍內(nèi)確定幾個梯度,比如先做個100ug/ml、200ug/ml、 300ug/ml、400ug/ml。1000ug/ml,按梯度濃度用培養(yǎng)基稀釋G418制成篩選培養(yǎng)基。4.加G418篩選:吸除培養(yǎng)孔中培養(yǎng)基,PBS洗滌一次,每孔中加入不同濃度的篩選培養(yǎng)基。5.換液:根據(jù)培養(yǎng)基的顏色和細(xì)胞生長情況,每35天更換一次篩選培養(yǎng)基。方法同4。6

5、.確定最佳篩選濃度:在篩選1014天內(nèi)能夠殺死所有細(xì)胞的最小G418濃度即為最佳篩選濃度。一般400-左右,篩選時比該濃度再高一個級別,維持使用篩選濃度的一半。2、確定了最佳篩選濃度后做穩(wěn)定轉(zhuǎn)染1、轉(zhuǎn)染:選取對數(shù)生長期細(xì)胞,接入平皿(4X105個/ml,5ml),轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)24小時或者更長,到細(xì)胞增長接近匯合時按1:4密度傳代,接入12孔板,繼續(xù)培養(yǎng),待細(xì)胞密度增至5070匯合。2、加G418:去掉培養(yǎng)液,PBS洗一次,加入按最佳篩選濃度配制好的G418篩選培養(yǎng)基。3、換液:根據(jù)培養(yǎng)基的顏色和細(xì)胞生長情況,每35天更換一次篩選培養(yǎng)基。當(dāng)有大量細(xì)胞死亡時,可以把G418濃度減半維持篩選。篩選10

6、14天后,可見有抗性的克隆出現(xiàn),停藥培養(yǎng),待其逐漸增大。4、挑單克?。猴@微鏡下觀察單克隆,加入胰酶消化,將單克隆吸入96孔板(每孔接1個克?。?,加培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)。待其逐漸增大后轉(zhuǎn)入到48孔中增殖。(及早凍存)5、單克隆鑒定:細(xì)胞大量擴增后,提取總RNA,做RT-PCR檢測目的基因是否存在。Lf2000轉(zhuǎn)染:質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染轉(zhuǎn)染前應(yīng)篩選合適的DNA:Lf2000轉(zhuǎn)染比例。一般按照1:1,2:1,3:1進行篩選。選擇轉(zhuǎn)染比率最高者為合適比例。篩選合適的細(xì)胞匯合度,看高匯合度還是低匯合度轉(zhuǎn)染效率高。篩選時注意觀察最佳轉(zhuǎn)染時間。以下操作以24孔板為例:1、 貼壁細(xì)胞: 轉(zhuǎn)染前一天,去不含抗生素的培養(yǎng)液5

7、00ul接于培養(yǎng)板(細(xì)胞密度0.5-2X105個/ml),轉(zhuǎn)染時細(xì)胞融合可到90-95%。懸浮細(xì)胞:準(zhǔn)備轉(zhuǎn)染前取即可,取500ul細(xì)胞懸液(4-8X105個/ml),培養(yǎng)液不含抗生素。2、 準(zhǔn)備混合物:A:將DNA稀釋于50ulOpti中,輕柔混勻。B:使用前輕柔混勻Lf2000,取合適劑量用50ulOpti 稀釋,室溫放置20min(注意:到stepC時要在25min內(nèi)完成)。C:加入A和B,輕柔混勻,室溫放置20min.3、 每孔中加入100ul混合物,前后晃動培養(yǎng)板,輕柔混勻。4、 培養(yǎng)箱培養(yǎng)18-48h,轉(zhuǎn)然后4-6h換液。PBS配制500ml NaCl 4g KCl 0.1g Na2

8、HPO4.12H2O 1.7907gKH2PO4 0.12g用400ml蒸餾水溶化,HCL/NaOH調(diào)PH至7.3-7.4,加水至500ml,高壓滅菌。胰酶配制 1、PBS 500ml 胰酶 1.25g EDTA 0.1g 攪拌4h2、濾膜、濾紙用雙蒸水浸泡2h,3、裝好濾器,勿按緊,包好,晾干后高壓。4、略烤干5、層流室過濾6、分裝到高壓過的小瓶7、-20C保存?zhèn)溆茫瑫r做無菌試驗。CuSO4配制 2% CuSO4 1500ml 硫酸銅 30g 雙蒸水 1500ml 高壓滅菌后,將液體倒入37C恒溫箱。雙抗配制 青霉素 100u/ml培養(yǎng)液,鏈霉素100ug/ml培養(yǎng)液 青霉素 100萬單位

9、 鏈霉素 1g PBS 100ml配制后濃度為10000u/ml,使用時取10ul/ml培養(yǎng)液。電泳緩沖液TAE配制 貯存液(50X),1 L Tris 堿 242g 冰乙酸 57.1ml 0.5mol/l EDTA(PH8.0) 100ml 加水定容至1L ALB培養(yǎng)基配制(400ml)細(xì)菌培養(yǎng)用蛋白胨 4g細(xì)菌培養(yǎng)用酵母提取物 2g氯化鈉 4g預(yù)先在三角燒瓶中加入200ml雙蒸水,將上述配方加入其中,攪拌。5mol/L NaOH調(diào)PH至7.4.,加入雙蒸水定容至400ml。取200ml做固體培養(yǎng)基裝入A瓶,200ml做液體培養(yǎng)基。稱取3g瓊脂加入A瓶。另取一小瓶,加入100ml雙蒸水(配氨

10、芐)。將以上三瓶液體高壓,15psi,20min。配氨芐,過濾除菌。待A、B瓶冷卻至50oC,照100ug/ml濃度的氨芐,每瓶加入200ul,之后將A瓶液體倒入培養(yǎng)皿中,將B瓶和培養(yǎng)皿(倒置)貯存于4 oC。注:溶液尚未冷卻時,輕輕轉(zhuǎn)動,使溶解的瓊脂均勻分布,應(yīng)避免產(chǎn)生氣泡。使用前1-2小時應(yīng)取出貯存的平皿。細(xì)胞組織RNA提?。ㄕ麄€過程在冰上進行)一、 溶解細(xì)胞(1) 貼壁細(xì)胞:吸去瓶內(nèi)培養(yǎng)液,PBS沖洗兩遍,加入胰酶消化,吸去胰酶加入PBS吹打,制成細(xì)胞懸液,將懸液移入EP管,離心1000 rpm,10min,棄上清。加入Trizol 1ml。反復(fù)吹打,使沉淀溶解。(可以先加上500ul吹

11、打,再加500ul充分混勻)(2) 懸浮細(xì)胞:將細(xì)胞離心,加入Trizol反復(fù)吹打,使沉淀溶解。Trizol量為1ml/5-10X106個細(xì)胞(動植物及酵母)或1ml/1X107個細(xì)菌。(3) 組織:將組織切成小塊(100mg),PBS沖洗干凈,裝入EP管,剪碎(非常碎,剪成組織懸液,時間可稍長些),加入上500ulTrizol吹打使組織溶解,再加500ul充分混勻。二、 水相與有機相的分離 將上述所得液體于室溫放置5min以使蛋白體解離,加入氯仿(0.2ml/ml Trizol),蓋上管 蓋,劇烈震蕩(不要用振蕩器)15s,室溫放置2-3min。2-8OC下離心12000rpmX15min,

12、離心后液體分三相:下層紅色的酚-氯仿相,中間及上層水相。RNA全部位于水相,體積約占加入Trizol的60%。三、 沉淀RNA將水相移入新的EP管(若要是提取DNA或蛋白質(zhì)保留有機相)加入異丙醇(0.5ml/ ml Trizol),-20OC放置90min(可過夜),2-8OC離心12000rpmX10min,可見管底部凝膠狀沉淀,即為RNA。四、 洗滌RNA用75%酒精(1ml/ml Trizol)沖洗沉淀,2-8OC離心7500rpmX5min,棄上清。將所得沉淀置于空氣或真空(操作臺內(nèi))中,干燥(注意不要過干,過干RNA難以溶解)。加入不含Rnase的水或0.5%SDS溶液溶解RNA。瓊

13、脂糖凝膠電泳檢測。-20OC保存。反轉(zhuǎn)錄RNA 3ul(量可改變) OLIGO 1ul 65OC水浴,5minH2O 5ul(量可變)冰上靜置1min5Xbuffer 4ulRninhibitor 1ulDNTP 2ul 全部取好混勻后再分加M-MVLV 1ul混勻,瞬離,42OC水浴60min70OC水浴5min,終止反應(yīng)PCRH2O 12.2ulBuffer 2.5ul 19.2ulDNTP 2.5ulMgCL2 2ul上游引物 0.75ul 25ul下游引物 0.75ulTAQ 0.3ulcDNA 4ul 石蠟封口,用PCR儀器,設(shè)定PCR條件。待反應(yīng)結(jié)束后,瓊脂糖凝膠電泳檢測基因表達。

14、 ATF5PCR條件:94OC 5min94OC 30s55OC 30s 35cycle72OC 30s72OC 10min瓊脂糖凝膠電泳1、 制膠:稱取1.2g瓊脂糖(跑PCR產(chǎn)物時膠的濃度可大些1.5-1.8g),加入100ml 0.5X TAE,加熱融化后冷卻至60OC左右,加入5ulEB,混勻。倒入膠板,除去氣泡。冷卻30min。硬化后放入電泳槽。(用不完可用保鮮膜包好放入4OC保存)。電泳槽內(nèi)加電泳緩沖液0.5X TAE,使液面高出凝膠表面1-2mm。2、 上樣:取5ul樣品與上樣緩沖液按4:1混勻,用微量加樣器小心加入凝膠樣品孔內(nèi),注意勿溢出孔外。3、 電泳、紫外光檢測和分析接通電

15、源,電壓為5v/cm。電泳完成后,切斷電源,紫外燈下觀察條帶。 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化(操作過程需嚴(yán)格在無菌罩內(nèi)操作)1XTSS兩步轉(zhuǎn)化法1、 菌種的復(fù)蘇:用無菌鉑絲直接挑取凍存的大腸桿菌菌株,在LB瓊脂平板表面劃線,(同時在ALB固體培養(yǎng)基劃板,驗證大腸桿菌,正常不生長)置37oC培養(yǎng)12-16小時。2、 從培養(yǎng)板中挑取單個菌落轉(zhuǎn)到3ml LB液體培養(yǎng)基中,于37oC搖床震搖,培養(yǎng)過夜直到OD值約0.6再轉(zhuǎn)入含有10mlLB(按比例1:100接)液體培養(yǎng)基的燒瓶中劇烈震搖4h,200rpm/min。3、 取1ml細(xì)菌培養(yǎng)物轉(zhuǎn)移到EP管中,冰上靜置10min,離心3500rpmX5min,棄上清。(注意分組

16、)4、 加入100ulTSS溶液,反復(fù)輕柔吹打以重懸菌液(打開細(xì)胞壁)。5、 加入連接產(chǎn)物1ul(體積不能超過10ul),輕輕混勻后水浴40min。6、 42oC熱休克90s。7、 冰浴2min,以冷卻細(xì)胞。8、 于EP管中加入100ul 37預(yù)熱的LB培養(yǎng)液,37oC震搖30min。9、 將100ul菌液均勻涂在含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基上。37oC培養(yǎng)12-16h。若所轉(zhuǎn)化質(zhì)粒可用a-互補篩選重組陽性克隆,則加入80ul/40ul X-Gal(20mg/ml)和8ul/4ul IPTG(20mg/ml),混勻后涂板。10、 將平板置4oC數(shù)小時后,觀察培養(yǎng)結(jié)果(若非藍白斑選擇質(zhì)粒無需此

17、步)。實驗設(shè)計1、 轉(zhuǎn)化時設(shè)對照組(不轉(zhuǎn)染任何質(zhì)粒)和轉(zhuǎn)化組(轉(zhuǎn)化目的質(zhì)粒)2、 第9步時,對照組分別在LB固體培養(yǎng)基和ALB固體培養(yǎng)基上涂板,轉(zhuǎn)化組只需用ALB固體培養(yǎng)基3、 預(yù)期結(jié)果:對照組在LB固體培養(yǎng)基生長旺盛,在ALB固體培養(yǎng)基上不生長;轉(zhuǎn)化組在ALB固體培養(yǎng)基生長。質(zhì)粒DNA的分離與純化 堿裂解法小量提取質(zhì)粒材料 LB液體培養(yǎng)基 STE溶液(0.1M NaCl,10mM Tris-HCl PH8.0,1mM EDTA) Solution I溶液(50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl PH8.0,10mM EDTA) Solution溶液(0.2M NaOH,1%SDS,現(xiàn)用現(xiàn)

18、配) Solution溶液(5M乙酸鉀60ml,冰乙酸11.5ml,H2O 28.5ml) 3M乙酸鈉溶液pH 5.2、純水、無水乙醇、70%乙醇 苯酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)、TE緩沖液(10mM Tris-HCl pH 7.5,1mM EDTA)方法 1、挑取含質(zhì)粒的宿主菌單個菌落接種于5ml ALB液體培養(yǎng)基,37振蕩培養(yǎng)20小時以上,至OD600約為0.5。 2、將1.53ml菌液轉(zhuǎn)入EP管中,12000rpm離心2分鐘沉淀菌斑,棄上清,倒置于吸水紙上是液體流盡。 3、加入預(yù)放置于4的STE溶液100ul重懸菌斑,12000rpm離心1分鐘,棄上清,倒置于吸水紙上是液體流盡。

19、4、加入4的100ul的Sol I重懸菌斑,必要時可振蕩重懸,4放置510分鐘。 5、加入200ul新鮮配制的Sol,倒置混勻510次,冰上放置23min(勿振),使細(xì)菌裂解。 6、加入150ul預(yù)置4的Sol,溫和顛倒數(shù)次混勻5sec,冰上放置5min,使質(zhì)粒DNA復(fù)性。然后15000rpm離心10分鐘,上清入新EP管,勿吸沉淀。 7、加入等體積(約450ul)的苯酚/氯仿/異戊醇振蕩混勻,15000rpm離心5min,將上層水相入新EP管,再加等體積的氯仿,振蕩混勻,15000rpm離心5min,將上層水相入新EP管。 8、上清入新管,加入二倍體積的預(yù)置于20的無水乙醇,再加入原液1/10

20、體積的3M NaAc,顛倒混勻,20放置1小時,以沉淀質(zhì)粒DNA。 9、15000rpm離心10min,將上清去掉,再加入1ml 70%的乙醇,沿管壁加入,8000rpm離心10min,小心將上清棄去。 10、在空氣中完全干燥后加入純水或TE緩沖液30ul溶解沉淀,37水浴30min后放置20保存?zhèn)溆谩Y|(zhì)粒提取試劑的配制Solution:50mmol/L 葡萄糖;25mmol/L Tris-HCL(pH8.0);10mmol/L EDTA配制方法:200mmol/L 葡萄糖 25ml (葡萄糖 0.99085g) 0.5 mmol/L EDTA(pH8.0) 2ml 1mmol/L Tris-

21、HCL(pH8.0) 2.5ml 加ddH2O定容至100ml, 高壓蒸汽滅菌15min, 貯存于4。Solution :200mmol/L NaOH;1% SDS(現(xiàn)用現(xiàn)配)配制方法: 5mmol/L NaOH 40ul 10% SDS 100ul ddH2O 860ulSolution :5mol/L乙酸鉀 60ml;冰乙酸11.5ml;ddH2O 28.5ml;PH4.8配制方法: 乙酸鉀 29.442g 冰乙酸 11.5ml 加ddH2O定容至100ml,貯存于4。STE緩沖液:10mmol/L Tris-HCL(pH8.0); 0.1mol/L NaCL;10mmol/L EDTA

22、(pH8.0)配制方法:NaCL 0.5844g1mmol/L Tris-HCL(pH8.0) 1ml0.5 mmol/L EDTA(pH8.0) 0.2ml加ddH2O定容至100ml, 高壓蒸汽滅菌15min, 貯存于4。10% SDS(十二烷基磺酸鈉) SDS 10g ddH2O 80ml 加入幾滴濃鹽酸調(diào)節(jié)溶液的pH值為7.2,加ddH2O定容至100ml。 (注:SDS為表面活性劑,稱量時要戴面罩。10% SDS無須滅菌。) 1mmol/L Tris-HCL(pH8.0) Tris 堿 12.114g 濃鹽酸 5.03ml ddH2O 80ml 用濃鹽酸調(diào)節(jié)溶液的pH值為8.0,補d

23、dH2O定容至100ml。0.5 mmol/L EDTA(pH8.0) EDTA- Na 18.61g ddH2O 80ml 在磁力攪拌器上劇烈攪拌,用NaOH調(diào)節(jié)溶液的pH值為8.0(約需2gNaOH)ddH2O 定容至100ml,高壓滅菌備用。 (注:EDTA二鈉鹽需加NaOH將pH至調(diào)至接近8.0時才能完全溶解。)3mol/L 乙酸鈉(pH5.2) 冰乙酸鈉 40.81g ddH2O 80ml 用冰乙酸調(diào)節(jié)pH至5.2,ddH2O定容至100ml,高壓滅菌備用。 質(zhì)粒小提試劑盒(所有過程在室溫下進行)E.Z.N. ATM Plasmid Mini Kit I自 備 物品:13000

24、15;g轉(zhuǎn)離心機 無菌1.5ml離心管(4個)實驗前準(zhǔn)備:將RNaseA加入到Solution瓶中,并置于4保存。 用無水乙醇稀釋DNA Wash Buffer。 使用前檢查SolutionII,SolutionIII有無結(jié)晶析出,如果有將其37溫育,使其溶解。1、 挑取凍存的含有質(zhì)粒的大腸桿菌接種ALB固體培養(yǎng)基,37培養(yǎng)至長出單菌落。 挑取含有質(zhì)粒的大腸桿菌(DH5、JM109)單克隆,接種于1-5ml的ALB中,37,300rpm活化12-16h 。2、 取1.5-5ml菌液,10000g,室溫離心1min,棄上清。3、 加入250ul Solution I/RNaseA,吹打或渦旋重懸

25、菌斑(吹打至看不到固體顆粒)。<充分重懸有利于提高產(chǎn)量>4、 加入250ul Solution II,輕柔顛倒混勻數(shù)次,清洗裂解產(chǎn)物<禁用振蕩器,用力過猛會導(dǎo)致染色體DNA斷裂,Solution II蓋子要擰緊>,可室溫靜置2min(管中拉絲,水膜形成)。5、 加入350ul Solution III,輕柔顛倒混勻數(shù)次,直至白色絮狀沉淀生成。<加入Solution III后立即混勻,必須完全混勻 > 6、 13000×g,室溫離心10min。(迅速進行下一步)7、 準(zhǔn)備柱子,向柱內(nèi)加入100-200ul BufferGPS, 10000g離心2mi

26、n,去除 BufferGPS8、 將上層清夜小心加入干凈的 HiBind Miniprep Column(1)將HiBind Miniprep Column(1)套入2ml收集管注意不要混入沉淀,確保沒有細(xì)菌通過柱子。10000g室溫離心1min,使液體完全通過柱子。9、 棄濾液,重新使用離心管。<將濾液暫存于另一離心管>向柱子中加500ul Buffer HB,10000×g,室溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。10、 向柱子中加入700ul無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,10000×g,室溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。11、 向

27、柱子中加入700ul無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,10000×g,室 溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。12、13000×g,室溫離心2min,離心空柱子以除去柱子內(nèi)的酒精。13、將柱子放入干凈的1.5ml離心管,加入30-50ul Elution Buffer(10Mm Tris-HCl,PH8.5)或高壓過的雙蒸水到柱子上,室溫靜置1-2min, 13000×g,室溫離心1min,洗滌DNA,將所得DNA分裝入EP管,-20保存。(可以進行第二次離心,將殘余的質(zhì)粒洗脫,但是濃度很低)14、用瓊脂糖凝膠電泳測提取質(zhì)粒大小,用紫外分光光度計檢

28、測質(zhì)粒濃度。DNA濃度=A260 X 50 ug/mlMTT材料: 培養(yǎng)液、0.25%胰蛋白酶、MTT(5mg/ml,濾過除菌)、培養(yǎng)板、大、中槍和槍頭、EP管、5ml離心管、細(xì)胞計數(shù)板、DMSO步驟:1、 吸掉細(xì)胞培養(yǎng)瓶中的舊培養(yǎng)液。2、 加入適量的預(yù)溫PBS,輕輕晃動培養(yǎng)瓶,吸掉PBS。3、 加入0.25%胰酶,以剛好覆蓋瓶底為宜,輕輕左右搖動培養(yǎng)瓶。4、 鏡下觀察,待細(xì)胞消化變圓豎起培養(yǎng)瓶,吸掉胰酶。5、 加入含10%胎牛血清的1640,輕輕反復(fù)吹打,使細(xì)胞脫落形成單細(xì)胞懸液。6、 將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至EP管中,吹打混勻。7、 倒置顯微鏡計數(shù)。8、 調(diào)整細(xì)胞數(shù)為5×104個/ml,(取

29、部分懸液于一新的5ml離心管,家培養(yǎng)液)9、 轉(zhuǎn)移細(xì)胞于96孔板,每孔200ul,每接一空混勻5ml管。(每種藥物3塊板,以得3 個平行測定結(jié)果)10、 37培養(yǎng)24h。(細(xì)胞進入對數(shù)生長期時開始加藥)11、 換為不含血清的164012、 繼續(xù)培養(yǎng)24h。13、 取8個新EP管,做好標(biāo)記,每管加入相應(yīng)量的無血清培養(yǎng)基14、 向EP管中加藥,從最高濃度到最低濃度稀釋(最高濃度下多數(shù)細(xì)胞被殺死,最低濃度下不會殺死細(xì)胞,5倍一列稀釋,共制備8個濃度),充分混勻。15、 取出96孔板中的細(xì)胞,以每一濃度重復(fù)3個復(fù)孔,按不同濃度做好標(biāo)記。16、 吸棄孔中培養(yǎng)液(可傾斜平板),每孔加入200ul含有藥物的

30、培養(yǎng)基。17、 放入培養(yǎng)箱,按要求培養(yǎng)一定時間(SKOV3一般作用48小時)18、 藥物作用結(jié)束后,取出細(xì)胞培養(yǎng)板,加入5mg/ml MTT(錫紙包裹的1.5ml離心管中),每孔20ul。19、 37孵育4-8h(錫箔包板),以形成藍色甲贊結(jié)晶。20、 取出細(xì)胞培養(yǎng)板,小心吸掉上清。21、 每孔加入150ulDMSO,溶解MTT-甲贊結(jié)晶。22、 待結(jié)晶充分混合后即可上機檢測(分光光度計490nm) 調(diào)零孔(培養(yǎng)基、MTT、DMSO) 對照孔(細(xì)胞、藥物、培養(yǎng)基、MTT、DMSO) 以藥物濃度為橫坐標(biāo)(x軸)、吸光值為縱坐標(biāo)(y軸),平均吸光值作為對照吸光值。 對照組吸光值減少一半時所需藥物濃

31、度為IC50濃度 試驗孔吸光值/對照組吸光值×100=抑制百分率 以抑制百分率為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。 Guava Nexin Reagent標(biāo)記早期凋亡細(xì)胞并描述早期凋亡與晚期凋亡細(xì)胞/死亡細(xì)胞間的差異步驟:1、 培養(yǎng)細(xì)胞:包括陽性和陰性對照組(適當(dāng)時間誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡)2、 將Guava Nexin Reagent 從冰箱取出,恢復(fù)至室溫3、 準(zhǔn)備用Guava Nexin Reagent孵育的所有細(xì)胞標(biāo)本,保證準(zhǔn)備的細(xì)胞樣本中至少含 1%BSA、1%FBS或10%NHS 將細(xì)胞上清和脫落細(xì)胞轉(zhuǎn)移到15ml離心管中。 用胰酶消化平皿內(nèi)的細(xì)胞,吸出絕大多數(shù)胰酶,加入含10%血清的1640

32、中和胰酶,并輕柔吹打至單細(xì)胞懸液。 將平皿內(nèi)的單細(xì)胞懸液移植15ml離心管內(nèi),再次吹打均勻。 1500rpm,離心10min,棄上清。 加100ul 5%1640重懸細(xì)胞并移入1.5ml EP管中(細(xì)胞濃度在2×104-1×105/sample或2×105-1×106/ml),<李老師:取每孔細(xì)胞量的1/3-1/4,則加入300ul1640重懸細(xì)胞,吹打均勻取100ul加入EP管>4、 每管加入100ul Guava Nexin Reeagant (若PS表達多可加125ul甚至150ul,同時減少培養(yǎng)液的量,100-50ul)5、 室溫下避

33、光孵育20min(錫紙包裹)6、 按Guava系統(tǒng)獲取標(biāo)本。<取未加處理的正常細(xì)胞做gate> 理想結(jié)果:左下象限:活細(xì)胞 AnnexinV-PE(-) 7-AAD(-) 右下象限:凋亡早中期細(xì)胞 AnnexinV-PE(+) 7-AAD(-) 右上象限:凋亡晚期細(xì)胞 AnnexinV-PE(+) 7-AAD(+) 左上象限:絕大多數(shù)為核碎片AnnexinV-PE(-) 7-AAD(+)無內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒(室溫)TM Endo-FreePlasmid Maxi Kit (6)自備物品:30005000×g轉(zhuǎn)離心機 無菌50ml離心管(4-6個) 無水乙醇 42水浴鍋

34、無菌吸水紙實驗前準(zhǔn)備: Buffer N3提前置于冰上。 將RNaseA加入到Solution瓶中,并置于2-8保存。 用160ml無水乙醇稀釋DNA Wash Buffer。 若質(zhì)粒大于10kb,70預(yù)熱Elution Buffer(分裝出3-4ml用5ml離心管預(yù)熱)。 調(diào)節(jié)65烤箱。步驟: 細(xì)菌培養(yǎng)1、 挑取凍存的含有質(zhì)粒的大腸桿菌接種于ALB固體培養(yǎng)基,37培養(yǎng)至長出 單菌落。 挑取含有質(zhì)粒的大腸桿菌(DH5、JM109)單克隆,接種于2-5ml的ALB中,37,300rpm活化8h 。 取適量(1:500)接入200ml提前溫育的ALB培養(yǎng)基(氨芐50ug/ml),37搖床培養(yǎng)12-

35、16h(OD達到1.5-2.0為好)<高copy接入200ml ALB,低copy接入400ml ALB> 堿性SDS裂解2、 將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)入50ml離心管,30005000×g,室溫離心10min。<重復(fù)將所有培養(yǎng)液離心完>3、 棄盡上清,用無菌吸水紙吸干容器的余液,加入10ml Solution I/RNaseA,吹打或渦旋重懸菌斑(吹打至看不到固體顆粒)。<充分重懸有利于提高產(chǎn)量>4、 加入10ml Solution II,輕柔顛倒混勻10-15次,清洗裂解產(chǎn)物<禁用振蕩器,用力過猛會導(dǎo)致染色體DNA斷裂,Solution II蓋子要擰緊

36、>,可室溫靜置2min(管中拉絲,水膜形成)。5、 加入5ml 冰浴的Buffer N3(沉淀菌體蛋白),輕柔顛倒混勻數(shù)次,直至白色絮狀沉淀生成。(過程中室溫孵育2-3min,時常顛倒混勻)<必須完全混勻,不能呈褐色并粘稠> 準(zhǔn)備Lysate Clearance ,將注射器活塞拔出,放到試管架上。6、 準(zhǔn)備HiBind Maxi Column,將柱子放入50ml收集管(提取盒提供),柱內(nèi)加入5ml BufferGPS,室溫放置3-10min。30005000×g,室溫離心5min,棄洗脫液將柱子在放回50ml收集管。 Lysate Clearance Filter

37、Syringe 清洗溶解產(chǎn)物7、 立即將菌液倒入Lysate Clearance Filter Syringe,靜置5min(可多靜置一會),白色沉淀飄到頂部(不完全到頂),用一個新的50ml離心管收集溶解產(chǎn)物,將活塞放回注射器筒。8、 繼續(xù)將注射氣筒保持在50ml離心管上,緩緩?fù)苿踊钊?,將裂解液打入試管中,殘余白色沉淀不要強制通過濾器。 ETR Solution 去除內(nèi)毒素9、 加入0.1倍體積的ETR Solution(藍色)到過濾后的溶液中,顛倒混勻7-10次,冰上靜置10-20min,放置時不斷顛倒(液體加入ETR后變渾濁,冰上靜置后變澄清)。10、 42孵育5min ,溶液重新變渾濁

38、,30005000×g,室溫離心5min,ETR在管底形成藍色層(若ETR懸浮在溶液中,則將試管室溫放置5-10min)。11、 小心地將上層水相轉(zhuǎn)移到新的50ml離心管中,加入0.5倍體積的室溫?zé)o水乙醇,輕柔顛倒混勻5-6次,室溫孵育2min。 HiBind Maxi Column 純化質(zhì)粒DNA 12-18步用水平轉(zhuǎn)頭可提高產(chǎn)出率,室溫離心。12、 從11步的上清溶液中取20ml加入HiBind DNA Maxi Column。柱子放在50ml離心管上,30005000×g,室溫離心3-5min,棄濾液,重新使用離心管。<將濾液暫存于另一離心管>13、 重復(fù)

39、12步直到所有清夜通過柱子,棄濾液,重新使用離心管。14、 向柱子中加入10ml Buffer HB,30005000×g,室溫離心3-5min,棄濾液,重新使用離心管。15、 向柱子中加入15ml無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,30005000×g,室溫離心3-5min,棄濾液,重新使用離心管。16、 向柱子中加入10ml無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,30005000×g,室溫離心3-5min,棄濾液,重新使用離心管。17、 6000×g,室溫10-15min,離心空柱子以除去柱子內(nèi)的酒精。 從 DNA Maxi Colu

40、mn中洗滌質(zhì)粒DNA(為了快速洗滌18步可省略)18、 干燥柱子:65烤10-15min(用錫紙包住柱子)19、 將柱子放入干凈的50ml離心管,加入3ml(第一次加2ml,第二次加1ml)Endotoxin-Free Elution Buffer 到柱子上,室溫靜置2min, 6000×g,室溫離心5min,洗滌DNA,將所得DNA分裝入EP管,-20保存。20、 用瓊脂糖凝膠電泳測提取質(zhì)粒大小,用紫外分光光度計檢測質(zhì)粒濃度。QIAGEN質(zhì)粒大提提取前準(zhǔn)備:1. RNase A加入Buffer P1,終濃度100ug/ml,2-8保存。2. 檢查Buffer P2中SDS狀態(tài)(低溫

41、析出),必要的話37預(yù)熱。3. 4遇冷Buffer P3。準(zhǔn)備材料:1. 標(biāo)準(zhǔn)的細(xì)菌培養(yǎng)物品(接種環(huán)、培養(yǎng)皿、搖床等)。2. 架子(垂直放置柱子。)3. 冰4. 70%酒精5. 異丙醇6. 質(zhì)粒溶解液(TE,PH8.0或Tris.Cl,PH8.5)7. 1.5-2.0ml離心管8. 4離心機提取步驟:A)細(xì)菌培養(yǎng)、收獲和裂解1.新鮮培養(yǎng)板中挑取單克隆于2-5ml ALB培養(yǎng)基,37,300rpm培養(yǎng)8h。(使用的培養(yǎng)器皿體積需大于四倍的培養(yǎng)基體積)2.按1/500-1/1000比例接種于ALB培養(yǎng)基,37,300rpm培養(yǎng)14-16h。高拷貝質(zhì)粒:取100-200ul接種于100ml ALB培

42、養(yǎng)基。低拷貝質(zhì)粒:取250-500ul接種于500ml ALB培養(yǎng)基。(使用的培養(yǎng)器皿體積需大于四倍的培養(yǎng)基體積。培養(yǎng)的細(xì)菌密度達到3-4X109個/ml,這樣得到的菌斑重量為3g/L培養(yǎng)基)3.將獲得的菌液4,6000g離心15min。(如果此時你想停止提取,可將菌斑凍于-20)4.加入10ml Buffer P1充分重懸菌斑。(確保使用的容器足夠裝下裂解液,確保使用前加入RNase A,如果Buffer P1內(nèi)加入LyseBlue,使用前輕柔晃動瓶身以確保LyseBlue混勻,必須確保菌斑充分混勻)5.加入10ml Buffer P2,輕柔顛倒4-6次混勻徹底,室溫(15-25)孵育5mi

43、n。(不能渦旋混勻,這樣會使基因斷裂。此時溶液變粘稠。不要使裂解反應(yīng)過程超過5min。加入Buffer P2后立即扣上蓋子,避免空氣中的CO2使其酸化。如果Buffer P1內(nèi)加入LyseBlue,那么加入Buffer P2后細(xì)菌懸液變藍,如果懸液不變藍或仍可見棕色斑塊,則繼續(xù)混勻直到顯色)6.加入10ml Buffer P3,立刻輕柔顛倒4-6次徹底混勻,冰上孵育20min。(使用預(yù)冷的Buffer P3和冰浴可以加快沉降,加入Buffer P3后可見白色絮狀沉淀,沉淀中含有基因組DNA,蛋白質(zhì),細(xì)菌碎片和KDS。裂解液需徹底混勻以確保鉀、硫酸鹽沉淀。如果混合物依然有粘性,那么繼續(xù)混勻徹底中

44、和溶液。如果使用LyseBlue,藍色溶液變清。)B)提取上清7.以4,不低于20000g離心30min,立刻取含有質(zhì)粒的上清。(離心前,需再次混勻樣品。離心需要在非玻璃器皿中進行,例如聚丙烯。離心后上清液清透。)8.以4,不低于20000g離心15min再次離心,取上清。移取120ul上清作為樣品1,用于分析以確定生長和裂解的條件是否合適C)用QIAGEN-tip連接、清洗和洗提質(zhì)粒DNA9.向QIAGEN-tip 500中加入10mlBuffer QBT平衡柱子,通過重力使其自然流空。(QIAGEN-tip需要徹底流干,此過程不需要看守,當(dāng)液面達到柱子上部時自然會停止。)10.將從第8步獲

45、取的上清移入柱子,使其自然流下通過濾膜。(上清應(yīng)該立刻移入柱子。如果時間停滯過長或者因為蛋白的繼續(xù)沉降使其渾濁,在放入柱子之前需要重新離心。)移取120ul濾液作為樣品2. 11.用2X30ml Buffer QC沖洗柱子。(Buffer QC自然通過柱子,第一遍沖洗足以將絕大多數(shù)質(zhì)粒污染物洗脫,但是當(dāng)提取量大時,第二遍就非常重要。)移取240ul濾液作為樣3。12.用15ml Buffer QF洗脫DNA。(用15ml或50ml離心管收集洗脫液。不推薦使用聚碳酸酯離心管,因為不能耐受后續(xù)步驟使用的酒精。注:如果產(chǎn)物大于45-50Kb,65預(yù)熱洗脫Buffer有助于提高產(chǎn)量。) 移取120ul

46、濾液作為樣品4,用于分析。D)沉淀、清洗、溶解DNA13.加入10.5ml(0.7倍體積)室溫異丙醇到洗脫液中沉淀DNA。立刻混勻,4,不低于15000g離心30min。小心棄上清。(一次性錐形底離心管可以選擇4,5000g離心60min。異丙醇沉淀具有玻璃外觀,比酒精沉淀的絮狀含鹽沉淀難發(fā)現(xiàn)。異丙醇沉淀貼壁不牢,棄上清時要非常小心。)14.加入5ml室溫70%酒精,不低于15000g離心10min。小心棄上清避免碰到沉淀。(一次性錐形底離心管可以選擇4,5000g離心60min。70%酒精用來洗脫沉淀的鹽,并且揮發(fā)的乙醇可以移走殘余的異丙醇,是DNA提取更容易。)15.空氣中干燥沉淀5-10

47、min,用合適體積的質(zhì)粒溶解液(TE,PH8.0或Tris.Cl,PH8.5)溶解DNA。(溶解DNA時清洗側(cè)壁,充分收集,特別是使用玻璃器皿時。應(yīng)避免使用移液器反復(fù)吹打促進DNA混勻,這可能會導(dǎo)致DNA斷裂。沉淀過于干燥會導(dǎo)致DNA難以溶解。DNA溶液最好保存在微堿性環(huán)境中,酸性Buffer難以溶解DNA。)質(zhì)粒小提試劑盒(所有過程在室溫下進行)E.Z.N. ATM Plasmid Mini Kit I自 備 物品:13000×g轉(zhuǎn)離心機 無菌1.5ml離心管(4個)實驗前準(zhǔn)備:將RNaseA加入到Solution瓶中,并置于4保存。 用無水乙醇稀釋DNA Wash Buffer。

48、 使用前檢查SolutionII,SolutionIII有無結(jié)晶析出,如果有將其37溫育,使其溶解。1、 挑取凍存的含有質(zhì)粒的大腸桿菌接種ALB固體培養(yǎng)基,37培養(yǎng)至長出單菌落。 挑取含有質(zhì)粒的大腸桿菌(DH5、JM109)單克隆,接種于1-5ml的ALB中,37,300rpm活化12-16h 。2、 取1.5-5ml菌液,10000g,室溫離心1min,棄上清。3、 加入250ul Solution I/RNaseA,吹打或渦旋重懸菌斑(吹打至看不到固體 顆粒)。<充分重懸有利于提高產(chǎn)量>4、 加入250ul Solution II,輕柔顛倒混勻數(shù)次,清洗裂解產(chǎn)物<禁用振蕩

49、器, 用力過猛會導(dǎo)致染色體DNA斷裂,Solution II蓋子要擰緊>,可室溫靜置2min(管中拉絲,水膜形成)。5、 加入350ul Solution III,輕柔顛倒混勻數(shù)次,直至白色絮狀沉淀生成。<加入Solution III后立即混勻,必須完全混勻 > 6、 13000×g,室溫離心10min。(迅速進行下一步) (柱子使用前加100-200ul Buffer GPS,室溫10000g 離心2min,去除GPS)7、 將上層清夜小心加入干凈的 HiBind Miniprep Column(1)將HiBind Miniprep Column(1)套入2ml收

50、集管注意不要混入沉淀,確保沒有細(xì)菌通過柱子。10000g室溫離心1min,使液體完全通過柱子。8、 棄濾液,重新使用離心管。<將濾液暫存于另一離心管>向柱子中加500ul Buffer HB,10000×g,室溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。9、 向柱子中加入700ul無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,10000×g,室溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。10、 向柱子中加入700ul無水乙醇稀釋的DNA Wash Buffer,10000×g,室溫離心1min,棄濾液,重新使用離心管。11、 13000×g,室溫離心

51、2min,離心空柱子以除去柱子內(nèi)的酒精。12、 將柱子放入干凈的1.5ml離心管,加入30-50ul Elution Buffer(10Mm Tris-HCl,PH8.5)或高壓過的雙蒸水到柱子上,室溫靜置1-2min, 13000×g,室溫離心1min,洗滌DNA,將所得DNA分裝入EP管,-20保存。(可以進行第二次離心,將殘余的質(zhì)粒洗脫,但是濃度很低)13、 用瓊脂糖凝膠電泳測提取質(zhì)粒大小,用紫外分光光度計檢測質(zhì)粒濃度。14、 DNA濃度=A260 X 50 ug/mlWestern blot的原理、操作及注意事項原理:通過電泳區(qū)分不同的組分,并轉(zhuǎn)移至固相支持物,通過特異性試劑

52、(抗體)作為探針,對靶物質(zhì)進行檢測,蛋白質(zhì)的Western印跡技術(shù)結(jié)合了凝膠電泳的高分辨率和固相免疫測定的特異敏感等多種特點,可檢測到低至15ng(最低可到10100pg)中等大小的靶蛋白。 一、抗原的選擇和制備A:樣品的制備1 組織: 組織的處理方法:組織洗滌后加入3倍體積預(yù)冷的PBS,0研磨,加入5×STOP buffer,180W,6mins,0超聲波破碎,5000rpm,5mins 離心,取上清。加入-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚藍(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分裝后于-20保存,用時取出,直接溶解上樣。2 細(xì)胞:細(xì)胞的處理方法: 離心收集細(xì)胞或者直接

53、往細(xì)胞培養(yǎng)瓶內(nèi)加入5×STOP buffer,收集,180W,6mins,0超聲波破碎,5000rpm,5mins 離心,取上清。加入-ME(9.5ml加入0.5ml),溴酚藍(9.5ml加入0.5ml)煮沸10min,分裝后于-20保存,用時取出,直接溶解上樣。3 分泌蛋白的提?。ㄌ乩褐苯邮占置谝海尤?ME、溴酚藍制樣。B:蛋白的定量方法及影響蛋白定量原因1.雙縮脲法:雙縮脲法是第一個用比色法測定蛋白質(zhì)濃度的方法。在需要快速,但不很準(zhǔn)確的測定中,常用此法。硫銨不干擾顯色,這對蛋白質(zhì)提純的早期階段是非常有利的。雙縮脲法的原理是Cu2+與蛋白質(zhì)的肽鍵,以及酪氨酸殘基絡(luò)合,形成紫藍色絡(luò)合物,此物在540nm波長處有最大吸收。雙縮脲法常用于0.5g/L10g/L含量的蛋白質(zhì)溶液測定。干擾物有硫醇,以及具有肽性質(zhì)緩沖液,如Tris、Good緩沖液等??捎贸恋矸ǔジ蓴_物,即用等體積10%冷的三氯醋酸沉淀蛋白質(zhì),然后棄去上清液,再用已知體積的1m NaOH溶解沉淀的蛋白質(zhì)進行定量測定。2.Lowry法:此法是雙縮脲法的進一步發(fā)展。他的第一步就是雙縮脲反應(yīng),即Cu+與蛋白質(zhì)在堿性溶液中形成絡(luò)合物,然后這個絡(luò)合物還原

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