主要糧食作物骨干親本遺傳效應(yīng)和利用的基礎(chǔ)研究

1、項目名稱：主要糧食作物骨干親本遺傳效應(yīng)和利用的基礎(chǔ)研究首席科學(xué)家：李立會 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所起止年限：2011.1至2015.8依托部門：農(nóng)業(yè)部二、預(yù)期目標(biāo)（一）總體目標(biāo)針對骨干親本在育種實踐中作用突出以及新時期育種目標(biāo)的需求，在我們通過前一個973項目的研究，已基本明確了骨干親本第一個關(guān)鍵科學(xué)問題“遺傳構(gòu)成”的基礎(chǔ)上，本項目圍繞骨干親本的第二個關(guān)鍵科學(xué)問題“遺傳與利用效應(yīng)”，以水稻、小麥、玉米等主要糧食骨干親本親本及其衍生的大面積推廣品種為基本研究材料，應(yīng)用表型組學(xué)、基因組學(xué)、作物育種學(xué)、生物信息學(xué)等學(xué)科的理論和方法，闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米骨干親本中重要基因組區(qū)

2、段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜，為基于全基因組分子設(shè)計育種提供依據(jù)；闡明水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的遺傳與育種效應(yīng)；發(fā)掘?qū)崿F(xiàn)水稻、小麥、玉米未來育種目標(biāo)具有重要價值的關(guān)鍵基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因；闡明水稻、玉米的穗粒數(shù)、粒重等產(chǎn)量性狀一般配合力的遺傳學(xué)基礎(chǔ)，并揭示一般配合力對骨干親本形成的作用以及骨干親本能夠衍生出大量主栽品種的生物學(xué)基礎(chǔ)；闡明控制一般配合力基因組區(qū)段與骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的關(guān)系；建立水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型；提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，指

3、導(dǎo)并提高親本組配和育種效率；篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐驗證，為創(chuàng)立骨干親本育種理論、培育新時期需求的新品種提供理論和物質(zhì)支撐。通過該項目的實施，將進(jìn)一步強化我國在農(nóng)作物骨干親本基礎(chǔ)理論和應(yīng)用研究方面的原始創(chuàng)新，并通過創(chuàng)建圍繞農(nóng)作物骨干親本的新的育種理論與技術(shù)體系，以及創(chuàng)造的符合新時期育種目標(biāo)需求的候選骨干親本的應(yīng)用，繼續(xù)提高我國在雜交稻等作物育種領(lǐng)域的國際領(lǐng)先地位，最終為我國的糧食安全提供科學(xué)保障與技術(shù)和物質(zhì)支撐。（二）五年預(yù)期目標(biāo)1、闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇

4、/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜各1個，為基于全基因組分子設(shè)計育種提供依據(jù)。2、闡明水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的遺傳與育種效應(yīng)；分析重要基因和基因序列變異1520個，闡明58個基因/等位基因的功能；發(fā)掘?qū)崿F(xiàn)水稻、小麥、玉米未來育種目標(biāo)具有重要價值的關(guān)鍵基因組區(qū)段/基因簇/基因各23個。3、闡明水稻、玉米的穗粒數(shù)、粒重等產(chǎn)量性狀一般配合力的遺傳學(xué)基礎(chǔ)，并揭示一般配合力對骨干親本形成的作用以及骨干親本能夠衍生出大量主栽品種的生物學(xué)基礎(chǔ)；闡明控制一般配合力基因組區(qū)段與骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的關(guān)系。4、建立水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本

5、組配的分子設(shè)計模型；提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，指導(dǎo)并提高親本組配和育種效率。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本68個，并通過育種實踐驗證，為創(chuàng)立骨干親本育種理論奠定基礎(chǔ)。6、培養(yǎng)博士研究生3040名，碩士研究生5060名。7、發(fā)表SCI論文5060篇（累計影響因子150以上）；申請專利910項。三、研究方案（一）學(xué)術(shù)思路為了進(jìn)一步強化我國在農(nóng)作物基礎(chǔ)理論和應(yīng)用研究方面的原始創(chuàng)新，針對作物遺傳育種基礎(chǔ)研究中的關(guān)鍵問題之一，骨干親本在育種中效果顯著但其形成與利用的遺傳基礎(chǔ)不明的客觀現(xiàn)實，以水稻、小麥、玉米等主要糧食作

6、物骨干親本及其衍生的大面積推廣品種系譜分析為出發(fā)點，在已解決了骨干親本的第一個關(guān)鍵科學(xué)問題“遺傳構(gòu)成”的工作基礎(chǔ)上，綜合利用表型組學(xué)、基因組學(xué)、作物育種學(xué)、生物信息學(xué)等學(xué)科的理論與技術(shù)，從骨干親本重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因組合方式及其演變趨勢、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)、候選骨干親本的分子設(shè)計與創(chuàng)制等多層次進(jìn)行系統(tǒng)研究，闡明骨干親本研究中的第二個關(guān)鍵科學(xué)問題“遺傳效應(yīng)”，為創(chuàng)建骨干親本育種理論與技術(shù)體系，以及我國糧食安全提供科學(xué)保障與技術(shù)和物質(zhì)支撐。（二）技術(shù)途徑衍生品種骨干親本候選骨干親本篩選與創(chuàng)制候選骨干親本的分子設(shè)計理論重要基因組區(qū)段因組區(qū)域QTL定位、關(guān)聯(lián)分

7、析等精細(xì)QTL分析QTL、eQTL分析等一般配合力測序、表達(dá)分析等精細(xì)定位、圖位克隆測序、生物信息學(xué)等優(yōu)異等位基因優(yōu)異基因簇關(guān)鍵基因近等基因?qū)胂抵亟M近交系等遺傳效應(yīng)利用 （三）創(chuàng)新點和特色1、項目創(chuàng)新點（1）從表型組學(xué)、基因組學(xué)、作物育種學(xué)、生物信息學(xué)等多學(xué)科、多層次對水稻、小麥和玉米三種主要糧食作物骨干親本形成與利用的遺傳基礎(chǔ)進(jìn)行系統(tǒng)研究，在國內(nèi)外尚屬首次；有關(guān)問題的解決，有利于進(jìn)一步強化我國在農(nóng)作物基礎(chǔ)理論和應(yīng)用研究方面的原始創(chuàng)新。（2）預(yù)測、篩選與改良對未來510年主要糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，將為保障我國糧食安全做出貢獻(xiàn)。（3）將骨干親本的內(nèi)涵由經(jīng)驗升華為科學(xué)規(guī)律和

8、理論，建立圍繞農(nóng)作物骨干親本的親本選配理論與技術(shù)體系2、項目特色（1）農(nóng)作物骨干親本的概念是由我國科學(xué)家率先提出的，并得到了國際同行的普遍認(rèn)同，而且近年來成為作物育種基礎(chǔ)理論研究的主攻方向之一。由我國科學(xué)家完成有關(guān)的基礎(chǔ)研究，具有明顯的原始創(chuàng)新特色。（2）本項目的研究對象是骨干親本，其上游是利用育種材料篩選、創(chuàng)制骨干親本的過程，下游是利用骨干親本培育主栽品種的過程，我國的育種學(xué)家已在上述兩個方面積累了大量的材料和豐富的經(jīng)驗。本項目通過解析骨干親本形成與利用規(guī)律，將豐富和完善農(nóng)作物品種高效改良理論，架起從育種材料/種質(zhì)資源有效利用到作物高效育種的橋梁。（3）對不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉

9、米共4050個骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢進(jìn)行分析，并篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，使得本項目的研究結(jié)果在很大程度上具有指導(dǎo)未來的特色。（四）取得重大突破的可行性分析本項目將在以下兩個方面取得重大突破： 闡明骨干親本與其它親本組配能夠衍生出眾多主栽品種的遺傳基礎(chǔ)，將為創(chuàng)立骨干親本育種理論、提高育種效率、培育突破性新品種奠定基礎(chǔ)； 從基因組和基因兩個層次揭示水稻、玉米骨干親本一般配合力的分子基礎(chǔ)和調(diào)控機制，可以將作物一般配合力由統(tǒng)計學(xué)和育種學(xué)的概念提升到遺傳學(xué)概念。（1）工作基礎(chǔ)保障：通過執(zhí)行國家973計劃項目

10、主要農(nóng)作物骨干親本遺傳構(gòu)成和利用效應(yīng)的基礎(chǔ)研究（2006CB101700），我們不僅建立了骨干親本研究的完整學(xué)術(shù)思路，而且基本明確了骨干親本的第一個關(guān)鍵科學(xué)問題“遺傳構(gòu)成”，并在技術(shù)方法、研究材料（如遺傳分析群體、品種群體、近等基因系或?qū)胂等后w等）以及人才等方面，為本項目的實施奠定了堅實的基礎(chǔ)。（詳見工作基礎(chǔ)部分）。（2）技術(shù)保障：本項目集中了我國水稻、小麥和玉米三大糧食作物遺傳育種、分子遺傳學(xué)、基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、生物信息學(xué)研究的優(yōu)勢單位，具有雄厚的學(xué)科基礎(chǔ)，在本領(lǐng)域已取得同行認(rèn)可的學(xué)術(shù)貢獻(xiàn)，從技術(shù)上能保障本課題的實施。（3）技術(shù)路線保障：本項目所采用的技術(shù)路線充分反映了本學(xué)科領(lǐng)域的研究特

11、色和前沿研究趨勢，具有雄厚的研究基礎(chǔ)，又體現(xiàn)了研究思路的創(chuàng)新，能夠保障獲得原始創(chuàng)新性成果。（4）人才保障：本項目涉及到多個學(xué)科，在項目組織上強調(diào)學(xué)科的交叉融合，項目組匯集了國內(nèi)重要科研機構(gòu)的優(yōu)秀研究人才，不僅包括中國工程院院士朱英國、榮廷昭、程順和、劉旭等育種家和種質(zhì)資源學(xué)家，而且擁有一批近年來活躍于農(nóng)作物育種學(xué)、基因組學(xué)、分子生物學(xué)、生物信息學(xué)等不同學(xué)科和研究領(lǐng)域的中青年專門人才，特別是通過上一期973項目的實施，培養(yǎng)了一批從事本研究的青年杰出人才，這支由老、中、青組成的科研隊伍是本項目取得重大突破的人才保障。（5）條件保障：骨干親本研究涉及到很多高技術(shù)的手段，要求有較先進(jìn)的儀器設(shè)備、大田和

12、溫室設(shè)施。本項目的參加單位擁有1個國家重大科學(xué)工程，7國家重點實驗室，1個國家小麥改良中心和7個省部級重點實驗室，整合了骨干親本相關(guān)研究領(lǐng)域的優(yōu)勢單位和力量，擁有國內(nèi)一流的儀器設(shè)備和技術(shù)儲備，完全能夠滿足本項目研究的技術(shù)和設(shè)備需求。四、年度計劃第一年度：研究內(nèi)容：1、骨干親本關(guān)鍵基因組區(qū)段構(gòu)成的解析與演變趨勢以骨干親本（包括已有的骨干親本和正在形成的骨干親本）及其衍生品種為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以系統(tǒng)研究不同時期骨干親本中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的構(gòu)成及其組合方式，闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨

13、勢，構(gòu)建骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜。2、骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其組合方式的遺傳效應(yīng)分析以典型骨干親本為基礎(chǔ)構(gòu)建不同類型遺傳分析群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以對骨干親本中與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因及其組合方式進(jìn)行系統(tǒng)的功能分析，闡明其選擇與遺傳效應(yīng)，重點闡明骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜內(nèi)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因的育種效應(yīng)。3、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)以骨干親本與典型非骨干親本構(gòu)建的測交群體或完全雙列雜交群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以定位與產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力密切相

14、關(guān)的基因組區(qū)段，研究相關(guān)產(chǎn)量性狀一般配合力的傳遞規(guī)律。4、候選骨干親本的分子設(shè)計采用計算機模擬技術(shù)，系統(tǒng)分析骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其等位基因不同組合方式，在不同遺傳背景下對株型、產(chǎn)量三要素等目標(biāo)性狀的遺傳效應(yīng)與協(xié)調(diào)表達(dá)，研究利用骨干親本基因型數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)開展水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的算法和發(fā)展綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、候選骨干親本篩選、創(chuàng)制與利用根據(jù)不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本遺傳構(gòu)成特點，結(jié)合骨干親本基礎(chǔ)遺傳圖譜以及重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因變異類型及其不同組合方式的遺傳效應(yīng)，篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等主要糧食作

15、物育種與生產(chǎn)具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐予以驗證。預(yù)期目標(biāo)：1、獲得不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本及其衍生品種的基因型鑒定數(shù)據(jù)和1年多點表型鑒定數(shù)據(jù)。2、分析重要基因和基因序列變異23個。3、獲得水稻和玉米一般配合力研究中所需的基因型數(shù)據(jù)和1年多點的表型數(shù)據(jù)。4、初步提出利用骨干親本基因型數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)開展水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的算法；初步提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本1個，并通過育種實踐驗證。6、培養(yǎng)博士研究生

16、35名，碩士研究生68名。7、發(fā)表SCI論文57篇；申請專利1項。第二年度：研究內(nèi)容：1、骨干親本關(guān)鍵基因組區(qū)段構(gòu)成的解析與演變趨勢以骨干親本（包括已有的骨干親本和正在形成的骨干親本）及其衍生品種為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以系統(tǒng)研究不同時期骨干親本中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的構(gòu)成及其組合方式，闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜。2、骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其組合方式的遺傳效應(yīng)分析以典型骨干親本為基礎(chǔ)構(gòu)建不同類型遺傳分析群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基

17、因型鑒定，以對骨干親本中與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因及其組合方式進(jìn)行系統(tǒng)的功能分析，闡明其選擇與遺傳效應(yīng)，重點闡明骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜內(nèi)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因的育種效應(yīng)。3、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)以骨干親本與典型非骨干親本構(gòu)建的測交群體或完全雙列雜交群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以定位與產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力密切相關(guān)的基因組區(qū)段，研究相關(guān)產(chǎn)量性狀一般配合力的傳遞規(guī)律。4、候選骨干親本的分子設(shè)計采用計算機模擬技術(shù)，系統(tǒng)分析骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其等位基因不同組合方式，在不同遺傳背

18、景下對株型、產(chǎn)量三要素等目標(biāo)性狀的遺傳效應(yīng)與協(xié)調(diào)表達(dá)，研究利用骨干親本基因型數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)開展水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的算法和發(fā)展綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、候選骨干親本篩選、創(chuàng)制與利用根據(jù)不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本遺傳構(gòu)成特點，結(jié)合骨干親本基礎(chǔ)遺傳圖譜以及重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因變異類型及其不同組合方式的遺傳效應(yīng)，篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等主要糧食作物育種與生產(chǎn)具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐予以驗證。預(yù)期目標(biāo)：1、獲得不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本及其衍生品種的基因型鑒定數(shù)據(jù)和1年

19、多點表型鑒定數(shù)據(jù)。2、分析重要基因和基因序列變異23個，闡明1個基因/等位基因的功能。3、獲得水稻和玉米一般配合力研究中所需的基因型數(shù)據(jù)和1年多點的表型數(shù)據(jù)。4、提出利用骨干親本基因型數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)開展水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的算法；提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，并付諸實踐。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本1個，并通過育種實踐驗證。6、培養(yǎng)博士研究生57名，碩士研究生810名。7、發(fā)表SCI論文68篇；申請專利1項。第三年度：研究內(nèi)容：1、骨干親本關(guān)鍵基因組區(qū)段構(gòu)成的解析與演變趨勢以骨干親本

20、（包括已有的骨干親本和正在形成的骨干親本）及其衍生品種為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以系統(tǒng)研究不同時期骨干親本中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的構(gòu)成及其組合方式，闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜。2、骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其組合方式的遺傳效應(yīng)分析以典型骨干親本為基礎(chǔ)構(gòu)建不同類型遺傳分析群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以對骨干親本中與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因及其組合方式進(jìn)行系統(tǒng)的功能分析，闡明其選擇與遺傳效應(yīng)，

21、重點闡明骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜內(nèi)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因的育種效應(yīng)。3、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)以骨干親本與典型非骨干親本構(gòu)建的測交群體或完全雙列雜交群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以定位與產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力密切相關(guān)的基因組區(qū)段，研究相關(guān)產(chǎn)量性狀一般配合力的傳遞規(guī)律。4、候選骨干親本的分子設(shè)計在解析骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜和一般配合力遺傳的基礎(chǔ)上，輔助以計算機模擬，系統(tǒng)分析骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其等位基因不同組合方式，在不同遺傳背景下對株型、產(chǎn)量三要素等目標(biāo)性狀的遺傳效應(yīng)與協(xié)調(diào)表達(dá)，研究候選骨干親本選育以及最佳親本組配

22、的分子設(shè)計模型，發(fā)展綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、候選骨干親本篩選、創(chuàng)制與利用根據(jù)不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本遺傳構(gòu)成特點，結(jié)合骨干親本基礎(chǔ)遺傳圖譜以及重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因變異類型及其不同組合方式的遺傳效應(yīng)和分子設(shè)計模型，篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等主要糧食作物育種與生產(chǎn)具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐予以驗證。預(yù)期目標(biāo)：1、獲得不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本及其衍生品種的基因型鑒定數(shù)據(jù)和1年多點表型鑒定數(shù)據(jù)。2、分析重要基因和基因序列變異34個，闡明12個基因/等位基因的功能。3、獲得水稻和玉米一般配合力研究

23、中所需的基因型數(shù)據(jù)和1年多點的表型數(shù)據(jù)。4、初步建立水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型；提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，并付諸實踐。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本1個，并通過育種實踐驗證。6、培養(yǎng)博士研究生57名，碩士研究生1012名。7、發(fā)表SCI論文810篇；申請專利2項。第四年度：研究內(nèi)容：1、骨干親本關(guān)鍵基因組區(qū)段構(gòu)成的解析與演變趨勢以骨干親本（包括已有的骨干親本和正在形成的骨干親本）及其衍生品種為材料，采用表型組學(xué)、遺傳學(xué)和基因組學(xué)等分析技術(shù)，研究不同時期骨干親本中發(fā)揮關(guān)鍵作用

24、的基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的構(gòu)成及其組合方式，初步闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜，為基于全基因組分子設(shè)計育種提供依據(jù)。2、骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其組合方式的遺傳效應(yīng)分析在解析骨干親本形成中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段的基礎(chǔ)上，以典型骨干親本為基礎(chǔ)構(gòu)建不同類型遺傳分析群體為材料，對骨干親本中與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因及其組合方式進(jìn)行功能分析，初步闡明其選擇與遺傳效應(yīng)，重點闡明骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜內(nèi)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因的育種效應(yīng)，發(fā)掘?qū)?/p>

25、實現(xiàn)未來育種目標(biāo)具有重要價值的關(guān)鍵基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因。3、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)以骨干親本與典型非骨干親本構(gòu)建的測交群體或完全雙列雜交群體為材料，開展多個生態(tài)環(huán)境下的表型鑒定和基因型鑒定，以定位與產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力密切相關(guān)的基因組區(qū)段，研究相關(guān)產(chǎn)量性狀一般配合力的傳遞規(guī)律。4、候選骨干親本的分子設(shè)計在解析骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜和一般配合力遺傳的基礎(chǔ)上，輔助以計算機模擬，系統(tǒng)分析骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其等位基因不同組合方式，在不同遺傳背景下對株型、產(chǎn)量三要素等目標(biāo)性狀的遺傳效應(yīng)與協(xié)調(diào)表達(dá)，研究候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型，發(fā)展

26、綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、候選骨干親本篩選、創(chuàng)制與利用根據(jù)不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本遺傳構(gòu)成特點，結(jié)合骨干親本基礎(chǔ)遺傳圖譜以及重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因變異類型及其不同組合方式的遺傳效應(yīng)和分子設(shè)計模型，篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等主要糧食作物育種與生產(chǎn)具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐予以驗證，為創(chuàng)立骨干親本育種理論奠定基礎(chǔ)。預(yù)期目標(biāo)：1、初步闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，構(gòu)建水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜各1個。2、初步闡明水稻、小麥、玉米骨干親本

27、的基礎(chǔ)遺傳圖譜的遺傳與育種效應(yīng)；分析重要基因和基因序列變異34個，闡明12個基因/等位基因的功能。3、獲得水稻和玉米一般配合力研究中所需的基因型數(shù)據(jù)和1年多點的表型數(shù)據(jù)；初步闡明水稻、玉米的穗粒數(shù)、粒重等產(chǎn)量性狀一般配合力的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。4、建立水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型；提出綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，并付諸實踐。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本12個，并通過育種實踐驗證，為創(chuàng)立骨干親本育種理論奠定基礎(chǔ)。6、培養(yǎng)博士研究生79名，碩士研究生1214名。7、發(fā)表SCI論文1315篇；

28、申請專利2項。第五年度：研究內(nèi)容：1、骨干親本關(guān)鍵基因組區(qū)段構(gòu)成的解析與演變趨勢以骨干親本（包括已有的骨干親本和正在形成的骨干親本）及其衍生品種為材料，采用表型組學(xué)、遺傳學(xué)和基因組學(xué)等分析技術(shù)，系統(tǒng)研究不同時期骨干親本中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的構(gòu)成及其組合方式，闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，精細(xì)構(gòu)建骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜，為基于全基因組分子設(shè)計育種提供依據(jù)。2、骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其組合方式的遺傳效應(yīng)分析在解析骨干親本形成中發(fā)揮關(guān)鍵作用的基因組區(qū)段的基礎(chǔ)上，以典型骨干親本為基礎(chǔ)構(gòu)建不同類型遺傳分析群體

29、為材料，對骨干親本中與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因及其組合方式進(jìn)行系統(tǒng)的功能分析，闡明其選擇與遺傳效應(yīng)，重點闡明骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜內(nèi)的基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因和基因序列變異/等位基因的育種效應(yīng)；發(fā)掘?qū)崿F(xiàn)未來育種目標(biāo)具有重要價值的關(guān)鍵基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因。3、一般配合力對骨干親本形成的作用及其遺傳基礎(chǔ)以骨干親本與典型非骨干親本構(gòu)建的測交群體或完全雙列雜交群體為材料，利用分子標(biāo)記、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等技術(shù)，以穗粒數(shù)、粒重等產(chǎn)量性狀形成為主體，定位與產(chǎn)量相關(guān)性狀一般配合力密切相關(guān)的基因組區(qū)段，研究相關(guān)產(chǎn)量性狀一般配合力的傳遞規(guī)律，探討一般配合力對骨干親本形成的

30、作用以及骨干親本能夠衍生出大量主栽品種的遺傳學(xué)基礎(chǔ)；闡明控制一般配合力基因組區(qū)段與骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的關(guān)系。4、候選骨干親本的分子設(shè)計在解析骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜和一般配合力遺傳的基礎(chǔ)上，輔助以計算機模擬，系統(tǒng)分析骨干親本重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因及其等位基因不同組合方式，在不同遺傳背景下對株型、產(chǎn)量三要素等目標(biāo)性狀的遺傳效應(yīng)與協(xié)調(diào)表達(dá)，建立候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型，完善綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法。5、候選骨干親本篩選、創(chuàng)制與利用根據(jù)不同時期、不同生態(tài)區(qū)骨干親本遺傳構(gòu)成特點，結(jié)合骨干親本基礎(chǔ)遺傳圖譜以及重要基因組區(qū)段、關(guān)鍵基因變異類型及其不同組合方

31、式的遺傳效應(yīng)和分子設(shè)計模型，篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等主要糧食作物育種與生產(chǎn)具有重要促進(jìn)作用的候選骨干親本，并通過育種實踐予以驗證，為創(chuàng)立骨干親本育種理論奠定基礎(chǔ)。預(yù)期目標(biāo)：1、闡明不同時期、不同生態(tài)區(qū)的水稻、小麥、玉米共4050個骨干親本中重要基因組區(qū)段/基因簇/基因/等位基因的演變趨勢，精細(xì)構(gòu)建水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜各1個，為基于全基因組分子設(shè)計育種提供依據(jù)。2、闡明水稻、小麥、玉米骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的遺傳與育種效應(yīng)；分析重要基因和基因序列變異56個，闡明23個基因/等位基因的功能；發(fā)掘?qū)崿F(xiàn)水稻、小麥、玉米未來育種目標(biāo)具有重要價值的關(guān)鍵基因組區(qū)段/基因簇/基因各23個。3、闡明水稻、玉米的穗粒數(shù)、粒重等產(chǎn)量性狀一般配合力的遺傳學(xué)基礎(chǔ)，并揭示一般配合力對骨干親本形成的作用以及骨干親本能夠衍生出大量主栽品種的生物學(xué)基礎(chǔ)；闡明控制一般配合力基因組區(qū)段與骨干親本的基礎(chǔ)遺傳圖譜的關(guān)系。4、完善水稻、小麥、玉米候選骨干親本選育以及最佳親本組配的分子設(shè)計模型；完善綜合評估候選骨干親本和改良現(xiàn)有骨干親本的技術(shù)方法，指導(dǎo)并提高親本組配和育種效率。5、篩選、創(chuàng)制對未來510年水稻、小麥、玉米等糧食作物育種具有重要促進(jìn)作用的候選骨