生物信息學(xué)名詞解釋

1、1 .計(jì)算生物信息學(xué)(ComputationalBioinformatics)是生命科學(xué)與計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)理科學(xué)、化學(xué)等領(lǐng)域相互交叉而形成的一門新興學(xué)科,以生物數(shù)據(jù)作為研究對(duì)象,研究理論模型和計(jì)算方法,開發(fā)分析工具,進(jìn)而到達(dá)揭示這些數(shù)據(jù)蘊(yùn)含的生物學(xué)意義的目的.2 .油包水PCR(EmulsionPCR):1)DNA段和捕獲磁珠混合；2)礦物油和水相的劇烈震蕩產(chǎn)生油包水環(huán)境；3)DNA片段在油包水環(huán)境中擴(kuò)增;4)破油并富集有效擴(kuò)增磁珠.3 .雙堿基編碼技術(shù)：在測(cè)序過程中對(duì)每個(gè)堿基判讀兩遍,從而減少原始數(shù)據(jù)錯(cuò)誤,提供內(nèi)在的校對(duì)功能.代表測(cè)序方法：solid測(cè)序.4 .焦磷酸測(cè)序法：焦磷酸測(cè)序技術(shù)是由

2、4種酶催化的同一反響體系中的酶級(jí)聯(lián)化學(xué)發(fā)光反響,適于對(duì)的短序列的測(cè)序分析,其可重復(fù)性和精確性能與SangerDNA測(cè)序法相媲美,而速度卻大大的提升.焦磷酸測(cè)序技術(shù)不需要凝膠電泳也不需要對(duì)DNA樣品進(jìn)行任何特殊形式的標(biāo)記和染色,具備同時(shí)對(duì)大量樣品進(jìn)行測(cè)序分析的水平.在單核甘酸多態(tài)性、病原微生物快速鑒定、病因?qū)W和法醫(yī)鑒定研究等方面有著越來越廣泛的應(yīng)用.例如：454測(cè)序儀:用蛋白質(zhì)序列查找核甘酸序列.:STS是序列標(biāo)記位點(diǎn)(sequence-taggedsite的縮寫,是指染色體上位置已定的、核甘酸序列的、且在基因組中只有一份拷貝的DNA短片斷,一般長(zhǎng)200bp500bp.它可用PCR方法加以驗(yàn)證.

3、將不同的STS®照它們?cè)谌旧w上的位置依次排列構(gòu)建的圖為STS圖.在基因組作圖和測(cè)序研究時(shí),當(dāng)各個(gè)實(shí)驗(yàn)室發(fā)表其DNA測(cè)序數(shù)據(jù)或構(gòu)建成的物理圖時(shí),可用STS來加以鑒定和驗(yàn)證,并確定這些測(cè)序的DNA片段在染色體上的位置；還有利于聚集分析各實(shí)驗(yàn)室發(fā)表的數(shù)據(jù)和資料,保證作圖和測(cè)序的準(zhǔn)確性.:表達(dá)序列標(biāo)簽技術(shù)(ESTExpressedSequenceTagsES儂術(shù)直接起源于人類基因組方案.:生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫.UniGene試圖通過計(jì)算機(jī)程序?qū)eneBank中的序列數(shù)據(jù)進(jìn)行適當(dāng)處理,剔除冗余局部,將同一基因的序列,包括EST序列片段搜集到一起,以便研究基因的轉(zhuǎn)錄圖譜.UniGene除了包括人

4、的基因外,也包括小鼠、大鼠等其它模式生物的基因.:開放閱讀框(ORF,openreadingframe)是基因序列的一局部,包含一段可以編碼蛋白的堿基序列,不能被終止子打斷.編碼一個(gè)蛋白質(zhì)的外顯子連接成為一個(gè)連續(xù)的ORE10.分子鐘檢驗(yàn)：只有分子鐘的,沒聽過分子鐘檢驗(yàn).一種關(guān)于分子進(jìn)化的假說,認(rèn)為兩個(gè)物種的同源基因之間的差異程度與它們的共同祖先的存在時(shí)間(即兩者的分歧時(shí)間)有一定的數(shù)量關(guān)系一家之言,僅供參考1什么是生物信息學(xué)所謂的根本數(shù)據(jù)庫,你所知的核酸、蛋白質(zhì)、結(jié)構(gòu)根本數(shù)據(jù)庫有哪些答：生物信息學(xué)中的數(shù)據(jù)是指生物分子的信息,具體表現(xiàn)為DNA序列數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)、生物分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)、生物分子功

5、能數(shù)據(jù)包括蛋白質(zhì)功能的定性描述、蛋白質(zhì)之間的相互作用描述、基因表達(dá)數(shù)據(jù)、代謝路徑、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等.所有類型的數(shù)據(jù)中,序列與結(jié)構(gòu)是根本的數(shù)據(jù),儲(chǔ)存這些數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫,就是生物信息學(xué)中的根本數(shù)據(jù)庫.核酸序列數(shù)據(jù)庫：EBI的EMBL數(shù)據(jù)庫、NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫、日本國(guó)立遺傳學(xué)研究所的DDBJ數(shù)據(jù).這三者間數(shù)據(jù)共享,每天更新.蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫：SWISS-PROT®白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、PDB生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、HSSP蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫.以上這些數(shù)據(jù)庫是全世界分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究人員獲取生物分子的序列、結(jié)構(gòu)和其他信息的根本來源,而且是發(fā)表自己序列或結(jié)構(gòu)測(cè)定結(jié)果的重要媒體.圍繞這三大核心數(shù)據(jù)庫

6、還有眾多面向各種特定應(yīng)用的衍生數(shù)據(jù)庫和分析軟件,這些數(shù)據(jù)庫分別從不同角度、以不同方式對(duì)各類生物信息學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸納、總結(jié)和注釋,而各種分析軟件為挖掘這些數(shù)據(jù)提供了有力的工具.2什么是生物信息學(xué)所謂的二次數(shù)據(jù)庫,你所知的核酸、蛋白質(zhì)、結(jié)構(gòu)二次數(shù)據(jù)庫有哪些答：根據(jù)生命科學(xué)不同研究領(lǐng)域的實(shí)際需要,對(duì)基因組圖譜、核酸和蛋白質(zhì)序列、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)以及文獻(xiàn)等數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、整理、歸納、注釋而構(gòu)建的具有特殊生物學(xué)意義和專門用途的數(shù)據(jù)庫就是生物信息學(xué)中的二次數(shù)據(jù)庫.二次數(shù)據(jù)庫種類繁多,以核酸數(shù)據(jù)庫為根底構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫有基因調(diào)捽轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫TransFac,真核生物啟動(dòng)子數(shù)據(jù)庫EPD,克隆載體數(shù)據(jù)庫Vector,密

7、碼子使用表數(shù)據(jù)庫CUTG等.以蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫為根底構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫有蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫Prosite,蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)序列片段數(shù)據(jù)庫Prints,同源蛋白家族數(shù)據(jù)庫Pfam,同源蛋白結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫Blocks.以具有特殊功能的蛋白為根底構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫有免疫球蛋白數(shù)據(jù)庫Kabat,蛋白激酶數(shù)據(jù)庫PKinase等.以三維結(jié)構(gòu)原子坐標(biāo)為根底構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫如蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)構(gòu)象參數(shù)數(shù)據(jù)庫DSSP空間結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫FSSP空間結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)及其同源蛋白數(shù)據(jù)庫HSSP等.3什么是生物信息學(xué)所謂的演繹數(shù)據(jù)庫或知識(shí)庫,你所知道的著名演繹數(shù)據(jù)庫或知識(shí)庫有哪些,分別解決那些生物學(xué)問題答：生物信息學(xué)中的演繹數(shù)據(jù)

8、庫DeductiveDatabase或知識(shí)庫Knowledgebase是指能對(duì)已有的生物大分子根本信息進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的數(shù)據(jù)庫,它建立在根本數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)根底之上.比擬著名的演繹數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)有：KEGG京都基因與基因組百科全書,里面包括代謝途徑、生物系統(tǒng)功能等級(jí)、生物大分子互作等等信息,它可以從基因組及相關(guān)分子的信息預(yù)測(cè)細(xì)胞代謝過程與生物行為.Swiss-Prot,它是一個(gè)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫,在整合其他數(shù)據(jù)庫信息的根底上以較低的冗余度實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的評(píng)注功能,如功能描述、結(jié)構(gòu)域、譯后修飾、變體等等.4什么是生物信息學(xué)所謂的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫,你所知道的著名的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫是什么,如何運(yùn)用文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫查找生物科學(xué)文獻(xiàn)答：

9、生物信息學(xué)中的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫bibliographicdatabase含有大量的生命科學(xué)領(lǐng)域的文獻(xiàn)資料,其來源為各種的雜志及期刊,是生命科學(xué)研究者的重要資料庫.其中一個(gè)著名的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫是PubMed,其主要信息來源于Medline.PubMed是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館中生物醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)雜志文獻(xiàn)的電子文檔庫,可在NCBI或PMC上通過用關(guān)鍵字及關(guān)鍵字間的各種邏輯組合與/或/非根據(jù)標(biāo)題、作者、雜志名稱及日期等檢索相關(guān)的文獻(xiàn)資料摘要及全文.5） EMBOSS的全稱是什么,它包含那幾組生物信息功能,目前的版本有多少個(gè)程序可供選擇運(yùn)用答：EMBOSS全稱EuropeanMolecularBiologyOpen

10、SoftwareSuite.EMBOSS是一個(gè)開放源代碼的序列分析軟件包,支持所有UNIX操作系統(tǒng),是為分子生物學(xué)研究的特別需要而開展起來的.EMBOSS包括了大量蛋白質(zhì)和核酸的分析工具,包括譯、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域搜索、獲取序列、比對(duì)、引物設(shè)計(jì)、限制性酶切譜分析等多種功能的.它整合了一些公共數(shù)據(jù)庫,能夠自動(dòng)識(shí)別處理以不同格式存儲(chǔ)的數(shù)據(jù),甚至可以通過互聯(lián)網(wǎng)提取數(shù)據(jù),并且,由于該軟件包同時(shí)提供了一個(gè)擴(kuò)展庫,它也是允許其他科學(xué)家依據(jù)自由軟件精神編制、發(fā)布軟件的一個(gè)平臺(tái).它同時(shí)將現(xiàn)在可以得到的一系列序列分析工具整合成一個(gè)無縫的整體.EMBOSS套裝包括約100個(gè)序列分析程序、一套核心軟件庫,還整合了其他可用

11、的軟件包,它們涵蓋了如下領(lǐng)域：序列比對(duì)、序列特征的快速數(shù)據(jù)庫搜索、蛋白基序識(shí)別包括結(jié)構(gòu)域分析EST分析、核酸序列特征分析比方識(shí)別CpG島、簡(jiǎn)單的物種特異性重復(fù)的識(shí)別、小基因組的密碼子使用頻率分析、大范圍的序列特征快速識(shí)別以及其他的工具.SCUT_Jason整理6） BLAST的全稱是什么,NCBI的BLAST包含幾個(gè)程序,分別在什么情況下使用答：BLAST全稱BasicLocalAlignmentSearchTool即局部相似性根本查詢工具,是由美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中央NCBI開發(fā)的一個(gè)基于序列相似性的數(shù)據(jù)庫搜索程序.NCBI的BLAST包含以下幾個(gè)程序：程序名查詢序列數(shù)據(jù)庫搜索方法Blast

12、n核酸核酸Blastp蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)Blastx核酸蛋白質(zhì)Tblastn蛋白質(zhì)核酸對(duì).TBlastx核酸核酸蛋白質(zhì)序列逐一進(jìn)行比對(duì).核酸序列搜索核酸數(shù)據(jù)庫中的序列蛋白質(zhì)序列搜索蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列核酸序列譯成蛋白質(zhì)序列后和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列逐一搜索.蛋白質(zhì)序列和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列譯后的蛋白質(zhì)序列逐一比核酸序列譯成蛋白質(zhì)序列,再和核酸數(shù)據(jù)庫中的核酸序列譯成的7全局比對(duì)和局部比對(duì)在算法語言、程序選擇和用途上有什么區(qū)別他們有什么共同點(diǎn)答：全局比對(duì)：可使用Needleman-Wunsch動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法.局部比對(duì)：使用Smith-Waterman算法二者可使用FASTA程序包中的LALIGN程序進(jìn)行.

13、當(dāng)你想比擬兩條序列整體相似性時(shí),可以對(duì)序列進(jìn)行全局比對(duì)；而局部比對(duì)那么可以找出兩條序列間相似度最高的片段.許多蛋白質(zhì)在全局范圍內(nèi)并不具有相似性,但卻似乎是由眾多的模塊結(jié)構(gòu)域搭建而成.由于全局比對(duì)建立時(shí),基因的外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)還沒有被發(fā)現(xiàn),因此全程比對(duì)并沒有顧及到上述現(xiàn)象的重要性是可以理解的.在大多數(shù)情況下,使用局部比對(duì)是較為合理的,這種比對(duì)方法可能會(huì)揭示一些匹配的序列段,如果不恰當(dāng)?shù)厥褂昧巳瘫葘?duì),這些序列段很可能會(huì)被一些完全不相關(guān)聯(lián)的殘基所淹沒.二者的共同之處在于他們的根本思想都是找出序列的相似性.SCUT_Jason整理僅供參考8BLAST中,E值和P值分別是什么,它們有什么意義答：BL

14、AST中使用的統(tǒng)計(jì)值有概率p值和期望e值.E期望值E-value這個(gè)數(shù)值表示你僅僅由于隨機(jī)性造成獲得這一比對(duì)結(jié)果的可能次數(shù).這一數(shù)值越接近零,發(fā)生這一事件的可能性越小.從搜索的角度看,E值越小,比對(duì)結(jié)果越顯著.默認(rèn)值為10,表示比對(duì)結(jié)果中將有10個(gè)匹配序列是由隨機(jī)產(chǎn)生,如果比對(duì)的統(tǒng)計(jì)顯著性值E值小于該值10,那么該比對(duì)結(jié)果將被檢出,換句話說,比擬低的E值將使搜索的匹配要求更嚴(yán)格,結(jié)果報(bào)告中隨機(jī)產(chǎn)生的匹配序列減少.p值表示比對(duì)結(jié)果得到的分?jǐn)?shù)值的可信度.一般說來,p值越接近于零,那么比對(duì)結(jié)果的可信度越大；相反,p值越大,那么比對(duì)結(jié)果來自隨機(jī)匹配的可能性越大.9什么是序列比對(duì)中使用的PAM矩陣和BL

15、OSUM矩陣,它們的作用是什么,一般BLAST選擇使用的矩陣是什么答：PAM矩陣和BLOSUM矩陣都是用于序列相似性的記分矩陣scoringmatrix.記分矩陣中含有對(duì)齊時(shí)具體使用的數(shù)值.一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩陣供選擇,假設(shè)要進(jìn)行突變性質(zhì)的進(jìn)化分析時(shí)可以使用PAM,FASTA缺省推薦BLOSUM50矩陣.PAM矩陣PointAcceptedMutation基于進(jìn)化的點(diǎn)突變模型,如果兩種氨基酸替換頻繁,說明自然界接受這種替換,那么這對(duì)氨基酸替換得分就高.一個(gè)PAM就是一個(gè)進(jìn)化的變異單位,即1%的氨基酸改變,但這并不意味100次PAM后,每個(gè)氨基酸都發(fā)生變化,

16、由于其中一些位置可能會(huì)經(jīng)過屢次突變,甚至可能會(huì)變回到原來的氨基酸.模塊替換矩陣BLOSUMBLOcksSubstitutionMatrix首先尋找氨基酸模式,即有意義的一段氨基酸片斷如一個(gè)結(jié)構(gòu)域及其相鄰的兩小段氨基酸序列,分別比擬相同的氨基酸模式之間氨基酸的保守性某種氨基酸對(duì)另一種氨基酸的取代數(shù)據(jù),然后,以所有60%保守性的氨基酸模式之間的比擬數(shù)據(jù)為根據(jù),產(chǎn)生BLOSUM60;以所有80%保守性的氨基酸模式之間的比擬數(shù)據(jù)為根據(jù),產(chǎn)生BLOSUM80.10多重比對(duì)與雙重比對(duì)有什么異同,最常用的多重比對(duì)工具是什么,它有哪些輸出文檔,分別有什么進(jìn)一步用途答：不同點(diǎn)：雙重比對(duì)是序列分析的根底,是指通過

17、一定算法對(duì)兩個(gè)DNA或蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較,找出兩者之間最大相似性匹配,使多序列比對(duì)和數(shù)據(jù)庫搜索的根底.多重比對(duì)有時(shí)用來區(qū)分一組序列之間的差異,但其主要用于描述一組序列之間的相似性關(guān)系,以便對(duì)一個(gè)基因家族的特征有一個(gè)根本了解.相同點(diǎn)：兩者都建立在某個(gè)數(shù)學(xué)或生物學(xué)模型之上,都不能從他們的結(jié)果得到正確或錯(cuò)誤的簡(jiǎn)單結(jié)論,而只能認(rèn)為所使用的模型在多大程度上反映了序列之間相似性關(guān)系以及他們的生物學(xué)特征.最常用的多重比對(duì)工具是ClustalW,它通過對(duì)序列的精確比對(duì)得出不同序列間相似性和差異度數(shù)據(jù),輸出的結(jié)果可以使用其他軟件進(jìn)行查看,生成直觀的進(jìn)化樹.它還有圖形界面版本ClustalX.ClustalW有如

18、下幾個(gè)輸出文檔：Outputfile后綴為.output:顯示該次多重比對(duì)的根本信息如序列名稱、長(zhǎng)度、每?jī)尚蛄兄g比對(duì)的得分,還可依此進(jìn)行排序,找出得分最高的序列對(duì)進(jìn)行進(jìn)一步分析.Alignmentfile后綴為.aln：顯示多重比對(duì)的具體結(jié)果,可從中觀察到序列間相似或保守的區(qū)域.Guidetreefile后綴為.dnd：依據(jù)序列間的相似程度顯示序列間可能的進(jìn)化距離,并以此生成進(jìn)化樹,研究其進(jìn)化關(guān)系.Yourinputfile后綴為.input:里面包含用戶輸入的序列.SCUT_Jason整理11為什么蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)很重要,目前有哪幾條途徑用于從蛋白質(zhì)的氨基酸序列預(yù)測(cè)其空間三維結(jié)構(gòu)答：蛋白

19、質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)很重要.研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),有助于了解蛋白質(zhì)如何行使其生物功能,熟悉蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)或其它分子之間的相互作用,通過分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),確認(rèn)功能單位或者結(jié)構(gòu)域,可以為遺傳操作提供目標(biāo),為設(shè)計(jì)新的蛋白質(zhì)或改造已有蛋白質(zhì)提供可靠的依據(jù),同時(shí)為新的藥物分子設(shè)計(jì)提供合理的靶分子結(jié)構(gòu).目前有三條途徑用于從蛋白質(zhì)一級(jí)序列預(yù)測(cè)其空間三維結(jié)構(gòu)：A、同源建模法.是蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的主要方法.對(duì)于一個(gè)未知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),首先通過序列同源分析找到一個(gè)結(jié)構(gòu)的同源蛋白質(zhì),然后,以該蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)為模板,為未知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)建立結(jié)構(gòu)模型.前提是必須要有一個(gè)結(jié)構(gòu)的同源蛋白質(zhì).B、穿針引線法.需建立核心折疊數(shù)據(jù)庫,在預(yù)測(cè)蛋

20、白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)時(shí)將一個(gè)待預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)序列與數(shù)據(jù)庫中核心折疊進(jìn)行比對(duì),找出比對(duì)結(jié)果最好的核心折疊,作為構(gòu)造待預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型的根據(jù).C、從頭開始法.在既沒有結(jié)構(gòu)的同源蛋白質(zhì)、也沒有結(jié)構(gòu)的遠(yuǎn)程同源蛋白質(zhì)的情況下,直接根據(jù)序列本身來預(yù)測(cè)其結(jié)構(gòu).該方法先對(duì)蛋白質(zhì)及溶劑作近似處理,再建立能量函數(shù),通過對(duì)構(gòu)象空間進(jìn)行快速搜索找到與某一全局最小能量相對(duì)應(yīng)的構(gòu)象.12引物設(shè)計(jì)的根本原那么有哪些,有哪些根本參數(shù)要考慮,最常用的引物設(shè)計(jì)軟件是什么答：引物設(shè)計(jì)的根本原那么：引物與模板的序列要緊密互補(bǔ)；引物與引物之間防止形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu)；引物不能在模板的非目的位點(diǎn)引發(fā)DNA聚合反響即錯(cuò)配.有如下這些根本

21、參數(shù)要考慮：引物長(zhǎng)度,產(chǎn)物長(zhǎng)度,序列Tm值,引物與模板形成雙鏈的內(nèi)部穩(wěn)定性用G值反映,形成引物二聚體及發(fā)夾結(jié)構(gòu)的能值,在錯(cuò)配位點(diǎn)的引發(fā)效率,引物及產(chǎn)物的GC含量,等等.最常用的引物設(shè)計(jì)軟件是：PrimerPremier.13你所知道或?yàn)g覽過的著名系統(tǒng)生物學(xué)網(wǎng)站是什么,包括哪些主要內(nèi)容答：NCBI美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中央.該網(wǎng)站具有NIH遺傳序列數(shù)據(jù)庫Genbank,一個(gè)所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集.GenBank同日本和歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的DNA數(shù)據(jù)庫每天交換數(shù)據(jù).在該網(wǎng)站上,用戶可通過檢索系統(tǒng)Entrez搜索核酸序列,蛋白序列,大分子結(jié)構(gòu),全基因組等數(shù)據(jù)庫,以及通過PubMed檢索雜志文獻(xiàn).另外,該網(wǎng)站本身還帶有一個(gè)序列相似搜索程序BLAST,作為鑒別基因與遺傳特點(diǎn)的手段,它能在短時(shí)間內(nèi)對(duì)Genbank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行序列搜索.在這個(gè)網(wǎng)站上還有其他有用的信息：孟德爾人類遺傳OMIM,三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子模型數(shù)據(jù)庫MMDB,唯一人類基因序列集合UniGene,人類基因組基因圖譜,分類學(xué)瀏覽