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文檔簡介
1、丙型肝炎檢測丙型肝炎檢測目前丙型肝炎檢測;一、HCV抗體檢測二、HCV抗原檢測三、HCV核酸檢測 四、HCV基因型檢測五、HCV細(xì)胞培養(yǎng)丙型肝炎病毒抗體檢測一、抗-HCV檢測的目的意義 1、抗-HCV檢測可用于診斷、血液篩查、流行病監(jiān)測等。 2、以診斷為目的的檢測是為了確定個(gè)體HCV感染狀況。 3、以血液篩查為目的的檢測是為了防止輸血傳播HCV,包括獻(xiàn)血員篩查和原料血漿篩查。4、以流行病監(jiān)測為目的的檢測是為了解不同人群HCV感染率及其變化趨勢,包括各類高危人群、重點(diǎn)人群和一般人群。 二、抗-HCV檢測的方法 抗-HCV檢測分為篩查試驗(yàn)(酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)、膠體金法快速試驗(yàn)、化學(xué)發(fā)光試驗(yàn)、免疫熒光
2、試驗(yàn))和補(bǔ)充試驗(yàn)(免疫印跡試驗(yàn))。 (一)篩查試驗(yàn)1、抗-HCV酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) 間接法酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)是抗-HCV檢測常用的篩查方法。其基本原理 是以HCV抗原包被固相載體,用辣根過氧化物酶標(biāo)記的抗人IgG與被檢樣品中的抗-HCV反應(yīng),以鄰苯二胺(OPD)或3,3,5,5四甲基聯(lián)苯胺 (TMB)等底物顯色后,利用酶標(biāo)儀等儀器進(jìn)行陰陽性結(jié)果判斷。其主要 反應(yīng)過程如下:加入經(jīng)樣本稀釋液稀釋的被檢樣品,樣品中的抗-HCV與抗原結(jié)合,形成固相抗原抗體復(fù)合物;固相載體上只留下抗-HCV,其他免疫球蛋白及樣品中的雜質(zhì)由于不能與固相抗原結(jié)合,在洗滌過程中被洗去;加酶標(biāo)抗抗體與固相復(fù)合物中的抗體結(jié)合,從而使
3、該抗體間接地標(biāo)記上酶;洗滌后,固相載體上的酶量就顯示特異性抗體的量;加底物顯色及終止液,利用酶標(biāo)儀等儀器分析結(jié)果。2、化學(xué)發(fā)光試驗(yàn) 化學(xué)發(fā)光免疫分析(CLIA)是將具有高度敏度的化學(xué)發(fā)光測定技術(shù)與高特異性的免疫反應(yīng)相結(jié)合,用于各種抗原、半抗原、抗體、激素酶、脂肪酸、維生素和藥物等的檢測分析技術(shù)?;瘜W(xué)發(fā)光免疫分析法以標(biāo)記方法的不同而分為兩種: (1) 化學(xué)發(fā)光標(biāo)記免疫分析法:化學(xué)發(fā)光標(biāo)記免疫分析又稱化學(xué)發(fā)光免疫分析(CLIA),是用化學(xué)發(fā)光劑直接標(biāo)記抗原或抗體的免疫分析法。常用于標(biāo)記的化學(xué)發(fā)光物質(zhì)有吖啶酯類化合物,是有效的發(fā)光標(biāo)記物,通過起動(dòng)發(fā)光試劑作用而發(fā)光,強(qiáng)烈的直接發(fā)光在一秒鐘內(nèi)完成,為快
4、速的閃爍發(fā)光。吖啶酯作為標(biāo)記物用于免疫分析,其化學(xué)反應(yīng)簡單、快速、無須催化劑;檢測小分子抗原采用競爭法,大分子抗原則采用夾心法,非特異性結(jié)合少,本底低;與大分子的結(jié)合不會(huì)減少所產(chǎn)生的光量,從而增加靈敏度。(2) 化學(xué)發(fā)光酶免疫分析法:從標(biāo)記免疫分析角度,化學(xué)發(fā)光酶免疫分析(CLEIA)應(yīng)屬酶免疫分析,只是反應(yīng)的底物是發(fā)光劑,操作步驟與ELISA分析完全相同。以酶標(biāo)記生物活性物質(zhì)(如酶標(biāo)記的抗原或抗體)進(jìn)行免疫反應(yīng),免疫反應(yīng)復(fù)合物上的酶再作用于發(fā)光底物,在信號(hào)試劑作用下發(fā)光,用發(fā)光信號(hào)測定儀進(jìn)行發(fā)光測定。該方法又分為如下幾類: HRP (辣根過氧化物酶)標(biāo)記的CLEIA:常用的底物為魯米諾或其衍
5、生物如異魯米諾。是一類重要的發(fā)光試劑。魯米諾的氧化反應(yīng)在堿性緩沖液中進(jìn)行,在過氧化物酶及活性氧(過氧化陰離子O2-,單線態(tài)氧O2,羥自由基OH-,過氧化氫H2O2)存在下生成激發(fā)態(tài)中間體,當(dāng)其回到基態(tài)時(shí)發(fā)光,其波長為425nm。早期用魯米諾直接標(biāo)記抗原或抗體,但標(biāo)記后發(fā)光強(qiáng)度降低而使靈敏度收到影響。近來用過氧化物酶標(biāo)記抗體,進(jìn)行免疫反應(yīng)后利用魯米諾作為發(fā)光底物,在過氧化物酶和起動(dòng)發(fā)光試劑(NaOH2H2O2)作用下,魯米諾發(fā)光,發(fā)光強(qiáng)度依賴于酶免疫反應(yīng)物中酶的濃度。 增強(qiáng)發(fā)光酶免疫分析(enhanced luminescence enzyme immunoassayELEIA)在發(fā)光系統(tǒng)中加入
6、增強(qiáng)發(fā)光劑以增強(qiáng)發(fā)光信號(hào), 并在較長時(shí)間內(nèi)保持穩(wěn)定, 便于重復(fù)測量, 從而提高分析靈敏度和準(zhǔn)確性。 ALP(辣根過氧化物酶)標(biāo)記的CLEIA 所用底物為環(huán)1,22二氧乙烷衍生物,用于化學(xué)發(fā)光酶免分析底物而 設(shè)計(jì)的分子結(jié)構(gòu)中包含起穩(wěn)定作用的基團(tuán)金剛烷基,其分子中發(fā)光基團(tuán) 為芳香基團(tuán)和酶作用的基團(tuán),在酶及起動(dòng)發(fā)光試劑作用下引起化學(xué)發(fā)光。 3 膠體金法快速試驗(yàn) (1) 免疫滲濾試驗(yàn):斑點(diǎn)免疫膠體金快速試驗(yàn)以硝酸纖維膜為載體, HCV抗原點(diǎn)狀固定在膜上,加待檢樣品。陽性結(jié)果在膜上抗原部位顯示出有色斑點(diǎn)。反應(yīng)時(shí)間在10分鐘以內(nèi)。有效試驗(yàn)的質(zhì)控點(diǎn)必須顯色。 (2)免疫層析試驗(yàn):以硝酸纖維膜為載體,HCV抗
7、原線狀固定在膜 上,待檢樣品沿著固相載體遷移,陽性結(jié)果在膜上抗原部位顯示出有色條帶。有效試驗(yàn)的質(zhì)控線必須顯色。 (二)抗體補(bǔ)充試驗(yàn) 抗體補(bǔ)充試驗(yàn)?zāi)壳俺S玫臑槊庖哂≯E試驗(yàn)。 免疫印跡法試劑一般將 HCV不同編碼區(qū)抗原多種成分噴涂在硝酸纖維薄膜條上,并設(shè)置了兩種不同濃度的人IgG對照帶和一條hSOD對照帶,用于內(nèi)部對照和結(jié)果判斷。其 診斷HCV感染的敏感性高、特異性強(qiáng),可檢測針對HCV不同編碼區(qū)抗原的抗體,且不需要特殊的儀器設(shè)備。 (三)抗-HCV檢測策略及結(jié)果報(bào)告 1、 疫情監(jiān)測相關(guān)的檢測策略及結(jié)果報(bào)告 先用篩查試劑-1進(jìn)行初篩試驗(yàn),結(jié)果呈陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陰性”,不再進(jìn)行復(fù)檢試驗(yàn);結(jié)果
8、呈陽性反應(yīng),進(jìn)入復(fù)檢試驗(yàn)。 所有初篩陽性反應(yīng)的樣品使用篩查試劑-2進(jìn)行復(fù)檢,結(jié)果呈陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陰性”;結(jié)果呈陽性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陽性”。 2、臨床診斷相關(guān)的檢測策略及結(jié)果報(bào)告 篩查試驗(yàn) 用篩查試劑進(jìn)行初篩,結(jié)果成陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陰性”;結(jié)果成陽性反應(yīng),不能出具陽性報(bào)告,必須進(jìn)入復(fù)檢試驗(yàn)。對初篩呈陽性反應(yīng)的樣品用原有試劑雙孔或原有試劑加另一種不同原理(或廠家)試劑進(jìn)行復(fù)檢試驗(yàn),如均呈陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陰性”;如均呈陽性反應(yīng)或一陰一陽反應(yīng),進(jìn)行補(bǔ)充試驗(yàn)。臨床診斷篩查檢測流程見圖4 (2)補(bǔ)充試驗(yàn) 臨床診斷補(bǔ)充試驗(yàn)方法-1 復(fù)檢試驗(yàn)陽性反應(yīng)樣品,進(jìn)行免疫印跡試驗(yàn)
9、。結(jié)果陰性者,報(bào)告 “抗-HCV陰性”;結(jié)果陽性者,報(bào)告“抗-HCV陽性”;結(jié)果不確定者, 報(bào)告“抗-HCV不確定”,并進(jìn)行隨訪。臨床診斷補(bǔ)充試驗(yàn)檢測方法一流程見圖5。 臨床診斷補(bǔ)充試驗(yàn)方法-2 此方法僅限于檢測方法/試劑給出了特定閾值(與抗體補(bǔ)充試驗(yàn)比較,其陽性的預(yù)測值95%)時(shí)使用。高S/CO比值:當(dāng)S/CO比值特定的閾值時(shí);低S/CO比值:其S/CO比值特定的閾值。 初篩和復(fù)檢 初篩和復(fù)檢均為陽性,且有樣品OD值與臨界值(Cutoff)的比值(S/CO)試劑說明書中給出的特定閾值,可報(bào)告“抗-HCV陽性”,無需再做免疫印跡試驗(yàn);否則,還應(yīng)進(jìn)一步作免疫印跡試驗(yàn)。免疫印跡試驗(yàn)結(jié)果陽性者,報(bào)告
10、“抗-HCV陽性”;結(jié)果不確定者,報(bào)告“抗-HCV不確定”并進(jìn)行隨訪。3、血液篩查相關(guān)的檢測策略及結(jié)果報(bào)告 獻(xiàn)血/漿員體檢合格后抽血檢驗(yàn)。用抗體篩查試劑進(jìn)行初篩,結(jié)果呈陽性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陽性待查”,獻(xiàn)血/漿員暫停獻(xiàn)血,如果需要進(jìn)一步診斷獻(xiàn)血/漿員感染狀況,執(zhí)行臨床診斷策略;結(jié)果呈陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV初篩陰性”,獻(xiàn)血/漿員獻(xiàn)血,進(jìn)入復(fù)檢試驗(yàn)。 對初篩呈陰性反應(yīng)的樣品用另一種抗體篩查試劑進(jìn)行復(fù)檢試驗(yàn)。如呈陰性反應(yīng),報(bào)告“抗-HCV陰性”,血液供應(yīng)臨床;如呈陽性反應(yīng),則報(bào)告“抗-HCV陽性待查”,血液報(bào)廢,如果需要進(jìn)一步診斷獻(xiàn)血/漿員感染狀況,執(zhí)行臨床診斷策略。 4. 檢測結(jié)果的解釋
11、丙型肝炎病毒抗原檢測 HCV抗原檢測的目的意義1、HCV血清陽轉(zhuǎn)前的早期急性丙型肝炎輔助診斷,尤其有助于HCV感染窗口期患者、抗-HCV檢測結(jié)果不確定患者或HCV陽性母親所生嬰兒是否罹患丙型肝炎的輔助診斷。2、免疫受損或先天性免疫缺陷群體如HIV感染者、長期透析的腎病患者、器官移植患者或先天性免疫功能缺陷患者等HCV感染的篩查。3、抗-HCV陽性感染者的病毒血癥分析。4、HCV感染者治療前后病毒血癥追蹤分析。(二)HCV抗原檢測的方法 目前抗原檢測ELISA試劑采用雙抗體夾心法定性或定量檢測樣品中游離的HCV核心抗原(包括抗原抗體復(fù)合物和游離核心抗原)。基本原理:以基因工程核心抗原免疫小鼠后所
12、獲得的純化抗-HCV核心抗原單克隆抗體作為固相包被物,用與固相包被物有不同抗原決定簇的抗-HCV核心抗原單克隆抗體作為辣根過氧化物酶標(biāo)記物,與樣品中總的或游離的HCV核心抗原反應(yīng),OPD顯色后進(jìn)行定性或定量測定。 大部分HCV抗原檢測試劑檢測的是樣品中游離核心抗原以及和抗-HCV結(jié)合的核心抗原,因此在進(jìn)行檢測之前需要加入尿素、鹽酸及去垢劑等,以解離樣品中的核心抗原-核心抗體免疫復(fù)合物。其它操作程序與一般的ELISA或發(fā)光技術(shù)操作基本相同,即:第一步加入待測樣品,孵育后,洗 去未結(jié)合的成分,加入酶標(biāo)記或發(fā)光物質(zhì)的抗核心抗原的二抗,孵育后顯 色,再加入終止液終止顯色,用酶標(biāo)儀比色計(jì)算s/co值,來
13、進(jìn)行陰性和陽性 反應(yīng)的判斷。 將HCV抗原的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)稀釋成不同濃度的系列標(biāo)準(zhǔn),還可進(jìn)行HCV抗原的定量檢測。以橫坐標(biāo)為HCV抗原的濃度(pg/ml ),縱坐標(biāo)為OD值,繪制出標(biāo)準(zhǔn)曲線。測出待測樣品的OD值以后,在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出抗原的濃度。如果待測樣品的OD值超出標(biāo)準(zhǔn)曲線上最高抗原濃度的OD值,則需用陰性血清將樣品稀釋以后再行檢測。 (三)檢測策略及結(jié)果報(bào)告 初次檢測抗原陰性樣品,報(bào)告為“HCV抗原陰性”;初次檢測抗原陽 性反應(yīng)樣品,需要雙孔復(fù)檢。如果雙孔復(fù)檢結(jié)果均為陰性,報(bào)告為“HCV 抗原陰性”;如果雙孔檢測結(jié)果至少有一孔結(jié)果為陽性反應(yīng),則報(bào)告為 “HCV抗原陽性”。 丙型肝炎病毒核酸檢測
14、(一)HCV核酸檢測的目的意義1、HCV RNA定性檢測可用于血液篩查領(lǐng)域,可使用單份樣品或多樣品集合的方法,對獻(xiàn)血員血液及單采血漿站的原料血漿進(jìn)行核酸檢測,降低輸血?dú)堄嚯U(xiǎn)度。2、 HCV RNA定性檢測可用于對HCV抗體陰性的高危人群樣品進(jìn)行集合核酸檢測,及時(shí)發(fā)現(xiàn)窗口期感染。3、HCV RNA定量檢測的意義主要體現(xiàn)在作為抗病毒治療療效的判斷指標(biāo),指導(dǎo)抗病毒治療及療效判定。(四)檢測結(jié)果的解釋 1、陰性結(jié)果的解釋 由于目前抗原檢測試劑的靈敏度較低,最靈敏的檢測試劑只能達(dá)到相當(dāng)于500 IU/ml水平的HCV RNA,因此陰性的結(jié)果并不能排除HCV現(xiàn)癥感染的可能。2、陽性結(jié)果的解釋 現(xiàn)階段,HC
15、V抗原陽性僅作為HCV感染的輔助診斷依據(jù),不能據(jù)此確診。特別是對處于“灰區(qū)”的陽性結(jié)果,需要結(jié)合臨床表現(xiàn)及HCV RNA、抗-HCV等檢測結(jié)果來解釋。監(jiān)測病程進(jìn)展或抗病毒治療效果應(yīng)進(jìn)行HCV抗原的定量檢測 。(二)HCV核酸檢測的方法1、RT-PCR檢測技術(shù) 傳統(tǒng)PCR定性檢測HCV RNA需要三個(gè)步驟:對待測樣品進(jìn)行處理:通過裂解、純化,提取樣品中的HCV RNA作為PCR擴(kuò)增的模板;采用逆 轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)技術(shù)對提取到的HCV RNA進(jìn)行擴(kuò)增;檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,檢測方法包括凝膠電泳和PCR-酶聯(lián)免反應(yīng)(PCR-ELISA)等。 2、TMA檢測技術(shù) TMA是一種利用MMLV逆轉(zhuǎn)錄
16、酶和T7 RNA聚合酶2種酶的共同作用,在等溫條件下來擴(kuò)增RNA的反應(yīng)系統(tǒng)。TMA使用的引物含有T7 RNA聚合酶 結(jié)合位點(diǎn),使得反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA可以作為T7 RNA聚合酶的模板,在T7 RNA聚合酶的作用下合成大量的RNA拷貝。擴(kuò)增出來的RNA重新進(jìn)入TMA 循環(huán),成為下一輪復(fù)制的模板。TMA優(yōu)點(diǎn)在于特異性強(qiáng)、靈敏度高,反應(yīng)條件簡單、擴(kuò)增只需一個(gè)溫度,無需專門的熱循環(huán)儀器,且因整個(gè)反應(yīng)在一個(gè)試管中進(jìn)行,擴(kuò)增產(chǎn)物RNA易于降解,從而大大減少了污染的可能。 基于TMA技術(shù)的VERSANT HCV RNA定性檢測可檢測到極低水平的HCV RNA,甚至可低至5IU/ml。 3、實(shí)時(shí)熒光定量PCR
17、技術(shù) 熒光定量PCR基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(Fluorescence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)的原理,當(dāng)某個(gè)熒光基團(tuán)的發(fā)射譜與另一熒光基團(tuán)的吸收光譜發(fā)生重疊,且兩個(gè)基團(tuán)距離足夠近時(shí),能量可以從短波長(高能量)的熒光基團(tuán)傳遞到長波長(低能量)的熒光基團(tuán),這個(gè)過程稱為FRET?;贔RET原理,出現(xiàn)了不同種類的熒光PCR,主要體現(xiàn)在探針設(shè)計(jì)的不同,如TaqMan探針、分子信標(biāo)和熒光雜交探針。以目前我國應(yīng)用最廣泛的TaqMan熒光標(biāo)記探針的定量PCR為例,是在探針(probe)的兩端偶聯(lián)一個(gè)短波長的熒光基團(tuán)(報(bào)告基團(tuán))和一個(gè)長波長的熒光淬滅基團(tuán),這兩個(gè)基團(tuán)位置靠近
18、,熒光基團(tuán)不發(fā)熒光;Taq酶在發(fā)揮53方向聚合酶活性的同時(shí),還具有53方向的外切酶活性,可使探針降解,熒光淬滅基團(tuán)從而解離、遠(yuǎn)離熒光基團(tuán),熒光基團(tuán)發(fā)出熒光,熒光的強(qiáng)度與PCR產(chǎn)物的量相關(guān),通過計(jì)算可得出具體的量值。 熒光定量PCR檢測HCV RNA的操作程序包括:RNA提取、PCR擴(kuò)增、熒光檢測及結(jié)果分析。目前一般的熒光定量PCR儀都帶有相應(yīng)的分析軟件,輔助設(shè)定閾值及Ct值,也允許操作者在合理的范圍內(nèi)自行調(diào)整。一個(gè) 良好的PCR反應(yīng)反映到標(biāo)準(zhǔn)曲線上,就是標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)性良好,(r2通常0.99),斜率(反映擴(kuò)增的效率)在指定的范圍內(nèi)。但采用外標(biāo)法定量的試劑盒標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增良好也不一定意味著樣品一定
19、擴(kuò)增良好,因?yàn)檫€涉及RNA提取質(zhì)量的問題,因此特別要注意考察陽性質(zhì)控和陰性質(zhì)控的結(jié)果,陰性結(jié)果必須沒有擴(kuò)增曲線,而陽性質(zhì)控必須擴(kuò)增曲線良好,結(jié)果落入指定的區(qū)間 內(nèi) 。4、b-DNA技術(shù) 分支DNA(bDNA)技術(shù)基于其獨(dú)特的信號(hào)放大系統(tǒng),即bDNA信號(hào)放大系統(tǒng),這是一個(gè)人工合成的bDNA, bDNA的分枝可結(jié)合多個(gè)酶標(biāo)記物,從而將病毒的信號(hào)放大,以便進(jìn)行檢測。利用序列特異的寡聚核苷酸探針雜交捕捉HCV RNA, HCV RNA隨后與支鏈DNA(bDNA)二級(jí)探針雜交, bDNA再與酶聯(lián)三級(jí)探針結(jié)合,隨后加入酶底物,產(chǎn)生的化學(xué)發(fā)光信號(hào)強(qiáng)度與靶DNA的量成正比。 操作程序包括:首先激昂血漿樣品離心
20、,濃縮其中的病毒顆粒,HCV RNA釋放后加入微孔板中,板孔中包被有可與病毒載體特異結(jié)合的一系列靶探針,另一系列靶探針的一端可標(biāo)記在游離的病毒核酸鏈上,另一端可與bDNA結(jié)合,加入酶標(biāo)記物對結(jié)合的bDNA進(jìn)行標(biāo)記,經(jīng)過清洗后加入底物進(jìn)行反應(yīng),測定反應(yīng)強(qiáng)度。本方法定量系統(tǒng)中沒有內(nèi)標(biāo)記物,每次實(shí)驗(yàn)設(shè)定實(shí)驗(yàn)樣品的病毒拷貝數(shù)。(三)檢測策略及結(jié)果報(bào)告 1、 HCV核酸定性檢測用于血液篩查策略及結(jié)果報(bào)告 對血液抗-HCV初篩呈陰性反應(yīng)的樣品可用集合NAT(Pooling NAT)進(jìn)行復(fù)檢試驗(yàn)。如呈陽性反應(yīng),做單人份NAT檢測,陽性結(jié)果報(bào)告“陽性待查”,血液報(bào)廢,如果需要進(jìn)一步診斷獻(xiàn)血/漿員感染狀況,執(zhí)行
21、臨床診斷策略;如呈陰性反應(yīng),報(bào)告“HCV復(fù)檢陰性”,血液供應(yīng)臨床。2 HCV核酸定性檢測用于臨床診斷策略及結(jié)果報(bào)告 抗-HCV復(fù)檢試驗(yàn)陽性反應(yīng)樣品,進(jìn)行定性NAT試驗(yàn)。結(jié)果陽性者,報(bào)告“HCV陽性”;定性NAT結(jié)果陰性的樣品,須做免疫印跡試驗(yàn)確證。檢測流程見圖8。3 HCV核酸定量檢測用于臨床治療策略及結(jié)果報(bào)告 現(xiàn)階段對HCV RNA定量檢測的單位尚未完全統(tǒng)一,有的報(bào)告拷貝/ ml,有的報(bào)告國際單位IU/ml,不同的試劑所用的標(biāo)準(zhǔn)不一樣,造成IU和拷貝之間的轉(zhuǎn)換系數(shù)不同。國產(chǎn)HCV RNA定量檢測試劑盒的檢測范圍一般在103108拷貝/ml。 HCV RNA定量檢測報(bào)告單應(yīng)該具備如下內(nèi)容:檢測
22、方法(如熒光定量PCR)、檢測試劑名稱、單位及檢測范圍。 臨床樣品的結(jié)果報(bào)告可能有幾種情況:結(jié)果在檢測范圍內(nèi),則按檢測的結(jié)果直接發(fā)報(bào)告,如每毫升3.2105拷貝/ml(有的臨床實(shí)驗(yàn)室表示為3.20E+05拷貝/ml );結(jié)果高于檢測上限,則應(yīng)用HCV陰性的混合血漿(清)將樣本進(jìn)行101000稀釋后再重新檢測,直到結(jié)果落入檢測范圍內(nèi);樣本未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,則應(yīng)重新進(jìn)行檢測,若在檢測限內(nèi),按照實(shí)際數(shù)發(fā)報(bào)告,若仍低于檢測下限,則報(bào)告為“低于檢測下限”。目前很多實(shí)驗(yàn)室對這部分樣品不進(jìn)行復(fù)檢就直接發(fā)出報(bào)告,會(huì)造成相當(dāng)部分陽性樣品的漏檢。 丙型肝炎病毒基因型檢測 一、HCV基因型 1993年Simmonds
23、等提出的分型方法得到了大多數(shù)學(xué)者的認(rèn)同。 Simmonds等分析不同毒株編碼非結(jié)構(gòu)蛋白5(NS5)區(qū)域核苷酸序列的同源性,按照發(fā)現(xiàn)的先后將HCV主要分為16個(gè)型,每個(gè)型有若干亞型,以a,b,c等表示。這樣,HCV被分為6個(gè)型和70多個(gè)亞型。Simmonds分型方法對臨床慢性丙型肝炎的抗病毒治療具有重要指導(dǎo)意義,美國肝病學(xué)會(huì)、歐洲肝病學(xué)會(huì)、亞太肝病學(xué)會(huì)和中國制定的系列丙型肝炎防治指南都采用了該法進(jìn)行分型。在我國,最主要的基因型為1b(66%),其次為2a(14%),還有 其他較少見的型別,如西南地區(qū)的3型和廣東等地區(qū)的6型等。 二、HCV基因型檢測方法與試劑 傳統(tǒng)的HCV血清學(xué)分型與分子生物學(xué)分
24、型相比,只有62.1%的符合率?,F(xiàn)階段檢測HCV基因型的分子生物學(xué)方法有限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)、測序法及反向線性探針雜交法(reverse hybridization line probe assay,LiPA)等,目前商品化試劑盒所用的方法主要是后兩種。如Bayer的Trugene HCV分型試劑盒和Inno-LiPA HCV基因分型2.0試劑盒。 分型試劑的檢測靶位點(diǎn)主要集中于保守的5端非編碼區(qū),Trugene HCV分型試劑直接對HCV RNA序列測定來分型,LiPA則是基于反向雜交原理PCR擴(kuò)增目的基因(擴(kuò)增的DNA被生物素標(biāo)記),與硝酸纖維膜上線形區(qū)帶上的寡核苷酸探針雜交,
25、再加入標(biāo)記有堿性磷酸酯酶的親和素,與雜交產(chǎn)物上標(biāo)記的生物素結(jié)合,加入顯色底物NBT/BCIP孵育后,顯現(xiàn)紫色或棕色的條帶,不同的條帶組合對應(yīng)不同的基因型。 相比第一代產(chǎn)品,二代LiPA HCV增加了核心區(qū)序列,可準(zhǔn)確地區(qū)分1a和1b型,并可避免東南亞地區(qū)和我國南部地區(qū)較常見的6c-6l型被誤分為l型,但仍約有8%的2a型易被lipa誤判為1a型,而這兩種型別的HCV感染的治療和預(yù)后均存在較大差異。 需要注意,不論是Trugene還是Lipa,均要經(jīng)過PCR擴(kuò)增,對HCV混合感染進(jìn)行分型時(shí),不可避免會(huì)因不同型別RNA擴(kuò)增效率不一造成的劣勢擴(kuò)增毒株的漏檢。三、直接測序法HCV分型操作程序 隨著核酸
26、測序技術(shù)的發(fā)展,直接測序分型成為目前具有推廣潛力的HCV基因型檢測方法。該方法需要對HCV RNA進(jìn)行巢式PCR(nested PCR)擴(kuò)增,套式PCR是PCR衍生技術(shù)中最常用的方法,它使用兩對引物,進(jìn)行兩次PCR反應(yīng),能夠極大地增加PCR擴(kuò)增反應(yīng)的敏感性和特異性。套式PCR第二次反應(yīng)的引物(內(nèi)引物)位于第一次PCR擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)。外引物進(jìn)行第一次PCR擴(kuò)增后,將第一次PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)移至第二次PCR反應(yīng)管內(nèi),使用一對內(nèi)引物進(jìn)行第二次PCR擴(kuò)增反應(yīng),最后用凝膠電泳鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物之后對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,切膠純化回收目的片段,然后測序。 1、引物設(shè)計(jì)原則 除遵循PCR引物設(shè)計(jì)的一般原則以外,H
27、CV分型主要考慮的是選擇哪一段基因序列進(jìn)行分型才能獲得更高的分辨效率。臨床上用于HCV基因分型的方法有多種,最常用的是根據(jù)(5 NCR)序列差異而進(jìn)行的基因分型方法,如INNO-LiPA、 5 NCR序列的直接測序、限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)-PCR等,但一基于5 NCR的基因分型方法對不同亞型的分型準(zhǔn)確率有較大的差異,對1b、1a、2a、2b、2c、3a亞型的分型準(zhǔn)確率分別為76%、91%、20%、50%和96%,幾乎不能對4a和4c亞型進(jìn)行區(qū)分,總準(zhǔn)確率僅有76%,這與5 NCR序列過于保守有關(guān)。因?yàn)橥换蛐?、不同亞型HCV 5 NCR序列的差異度僅為1.0%3.3%,而NS5B基因序列的差異度為16.5%20.1%,NS5B基因更適用于HCV的基因分型。列舉常用的PCR引物: 外側(cè)引物:5-TGGGGATCCCGTATGATACCCGCTG
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