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文檔簡介
1、指導原則中的臨床統(tǒng)計部分和IVDstatistics程序的指導思想蕓豆莢2013/12一、腫瘤標志物類定量檢測試劑注冊申報資料指導原則(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表卡方或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。定量值相關(guān)性和一致性分析用回歸分析驗證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試
2、劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計學差異。另外考慮到在不同的樣本濃度區(qū)間試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體濃度范圍進行區(qū)間分層統(tǒng)計,對不同濃度區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進行相關(guān)性分析以更好的驗證兩種試劑的相關(guān)性。二、乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸定量檢測試劑注冊技術(shù)審查指導原則(3)統(tǒng)計學分析 數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。 兩組數(shù)據(jù)結(jié)果的相關(guān)性、線性回歸的結(jié)果。對相關(guān)性及線性方程的顯著性檢驗,驗證兩種試劑定量結(jié)果
3、的一致性。陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表卡方或kappa檢驗。另外考慮到對不同樣本類型的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型分別進行統(tǒng)計分析,以對考核試劑的臨床性能進行綜合分析。三、人類免疫缺陷病毒檢測試劑臨床研究注冊技術(shù)審查指導原則3.統(tǒng)計學分析(1)數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或驗證鑒別以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改等。(2)一致性分析和相關(guān)性相關(guān)性主要包括陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。一般可采用
4、四格表卡方檢驗或kappa檢驗對兩種試劑定性檢測結(jié)果的一致性進行分析。對于定量試劑,應(yīng)選用特定的數(shù)據(jù)分析模型(如Bland-Altman模型)對兩種試劑定量分析結(jié)果的一致性進行分析。同時,還應(yīng)采用回歸分析的方法分析兩種試劑檢測結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是對比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),并給出a和b的95%(或99%置信區(qū)間。由于對不同的HIV-1基因型或者不同濃度區(qū)間樣本,試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體樣本,按照濃度范圍和/或基因型進行區(qū)間分層統(tǒng)計,對不同區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進行相關(guān)性和一致性分析,
5、以更好地驗證兩種試劑的相關(guān)性。四、流行性感冒病毒核酸檢測試劑注冊申報資料指導原則(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表卡方或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同年齡段人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同年齡段人群分別進行統(tǒng)計分析,以對考核試劑的臨床性能進行綜合分析。五、流行性感冒病毒抗原檢測試劑注冊申報資
6、料指導原則(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表卡方或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同年齡段人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同年齡段人群分別進行統(tǒng)計分析,以對考核試劑的臨床性能進行綜合分析。六、流式細胞儀配套用檢測試劑注冊技術(shù)審查指導原則(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新
7、檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。相關(guān)性和一致性分析可以采用線性回歸的方式驗證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式列出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計學差異。另外考慮到某些檢測指標在不同的樣本濃度區(qū)間、不同年齡段人群或不同疾病來源的樣本可能有較明顯的差異,因此,如有必要,建議以上述相關(guān)要素為依據(jù)分組并對各組數(shù)據(jù)分別進行統(tǒng)計分析,以更好的驗證兩種試劑的相關(guān)性。七、病原體特異性M型免疫球蛋
8、白定性檢測試劑注冊技術(shù)審查指導原則(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行四格表卡方或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同人群分別進行統(tǒng)計分析,以對考核試劑的臨床性能進行綜合分析。八、弓形蟲、風疹病毒、巨細胞病毒、單純皰疹病毒2型抗體及IgG抗體親合力檢測試
9、劑注冊申報資料技術(shù)指導原則5.統(tǒng)計學分析對臨床試驗結(jié)果的統(tǒng)計應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計方法,如檢測結(jié)果一致性分析、RO8析和陰性/陽性符合率等。對于本類定性檢測試劑對比實驗的等效性研究,常選擇配對2X2表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進行x2檢驗或kappa檢驗以檢驗兩種檢測試劑檢測的一致性。統(tǒng)計學分析應(yīng)可以證明兩種方法的檢測結(jié)果無明顯統(tǒng)計學差異,并驗證其一致性是否具有統(tǒng)計學意義。以kappa檢驗為例,除應(yīng)計算kappa值外,還應(yīng)對總體kappa值與“0”之間的差別是否具有統(tǒng)計學意義進行假設(shè)檢驗。對于半定量檢測試劑對比實驗的等效性研究,應(yīng)在上述統(tǒng)計分析的基礎(chǔ)上,根據(jù)臨床試驗數(shù)據(jù)分布特點,采
10、用Person相關(guān)系數(shù)等統(tǒng)計方法對考核試劑檢測值與對比試劑檢測值線性相關(guān)關(guān)系進行分析。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計檢驗假設(shè),即評價考核試劑與對比試劑是否等效的標準。對于定量檢測試劑對比實驗的等效性研究,用回歸分析驗證兩種試劑結(jié)果的一致性,建議統(tǒng)計學負責人根據(jù)試驗設(shè)計特點,選擇適用的回歸分析方法,如Deming回歸、Passing-Bablok回歸分析等。(3)臨床研究結(jié)果及分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對灰區(qū)樣本、異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。結(jié)果的一致性分析計算陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。采
11、用適當?shù)慕y(tǒng)計學方法,對定性檢測試劑進行一致性評價,對半定量檢測試劑進行線性相關(guān)性分析,對定量檢測試劑進行一致性分析。另外考慮到對不同樣本類型以及不同人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同人群分別進行統(tǒng)計分析,以對考核試劑的臨床性能進行綜合分析。九、天津市體外診斷試劑(第二類產(chǎn)品)臨床研究技術(shù)審查指導原則五、試驗數(shù)據(jù)分析(一)對臨床試驗結(jié)果的統(tǒng)計應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計方法。1、對定性試劑,應(yīng)分析考核試劑的敏感性、特異性、陽性預(yù)期值、陰性預(yù)期值、陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間、考核試劑和對比試劑的一致性(如kappa值)。2、對定量試劑,應(yīng)分析考核試
12、劑陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間、考核試劑和對比試劑的一致性(如kappa值)等之外,還應(yīng)該分析考核試劑與對比試劑的相關(guān)性、線性回歸、定量準確性及一致性(如Bland-Altman模型),如入選樣本存在不同分型還應(yīng)進行分組分析考核試劑與對比試劑的相關(guān)性、線性回歸、定量準確性及一致性(如Bland-Altman模型)等。3、對于對比實驗的等效性研究,最常用是對考核試劑和對比試劑兩組檢測結(jié)果的相關(guān)及線性回歸分析,應(yīng)重點觀察相關(guān)系數(shù)(r值)、回歸方程斜率及y軸截距等指標。4、對于統(tǒng)計方法的選擇可以選擇多種方法,而不用過于強調(diào)一種方法。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計檢驗假
13、設(shè),即評價考核試劑與對比試劑是否等效的標準。十、C反應(yīng)蛋白定量檢測試劑盒注冊技術(shù)審查指導原則(征求意見稿)(3)統(tǒng)計學分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定量值相關(guān)性和一致性分析用回歸分析驗證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計學差異。另外考慮到在不同的樣本濃度區(qū)間試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體濃度范圍進行區(qū)
14、間分層統(tǒng)計,對不同濃度區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進行相關(guān)性分析以更好的驗證兩種試劑的相關(guān)性。從以上的原則中可以看出,對于診斷試劑的統(tǒng)計學分析基本是一致的,對于定性試劑,主要是1、陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。2、行四格表卡方或kappa檢驗以驗證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。做完這些統(tǒng)計應(yīng)該是足夠了。這些在IVDstatistics中都有體現(xiàn)。這里探討幾個統(tǒng)計技術(shù)方面的話題:1、95%勺可信區(qū)間:目前有好幾種算法:可參見程序和幫助文件:個人感覺最常用的是二項分布法,這個算法應(yīng)該是最準確的算法,但只能用程序算;另外用比較多的Wald法(點估計,近似正態(tài)分布法?),這個算法最簡單
15、,但準確度較低。2、配對卡方檢驗(McNemar在國內(nèi)的教科書中,都是用傳統(tǒng)的公式,b+c40時用校正公式。但在不同的程序中,并不相同,SPSSR采用精確概率法,MedCalc在25時用精確概率法,而在25時用校正的公式,而SAS好象只用傳統(tǒng)的公式計算。這里我無法認定用哪種算法好,但應(yīng)都有道理,不能認定為錯。我想可能理論上精確概率法最好,但只能用程序算,另外對于很大的數(shù)據(jù),可能出現(xiàn)無法計算的情況。3、一致性檢驗這是指導原則中的必選項之一。然而在一般的教科書中,只對Kappa系數(shù)計算進行了說明,對于其95%的可信區(qū)間和非0檢驗提的很少。統(tǒng)計上Kappa系數(shù)不只應(yīng)用于配對的四格表,對于半定量的有序
16、數(shù)據(jù)同樣適用,反過來可認為四格表是有序數(shù)據(jù)的最簡單的特例。在這里要注意的事Kappa的標準誤有兩個,分別用于可信區(qū)間和非0檢驗,計算公式不同,SPS竽口MedCalc都沒能同時給出計算值,另有限的幾篇中文期刊文章竟然不少用錯了。關(guān)于這兩個Se的計算公式在程序的幫助里可以找到,Se(K)用于計算可信區(qū)間,Se0(K)用于非0的檢驗。定量試劑的臨床統(tǒng)計:1、以上指導原則均指出要進行回歸分析,即計算回歸方程y=a+bx,相關(guān)系數(shù)(R)或R2;從統(tǒng)計學角度,對方程進行檢驗,即a,b的檢測,得出直線相關(guān)關(guān)系是否成立。事實上對方程的檢驗,對比的檢驗,還有對r值的檢驗結(jié)果和意義都是一樣的,該檢驗和算法在方法
17、上沒有什么異義,教科書以及多數(shù)的軟件結(jié)果都是一樣的。在統(tǒng)計上,應(yīng)該同時對這些值的95%CI進行計算,并作散點圖,顯示出更多或更直觀的結(jié)果。注意的是如果數(shù)據(jù)不呈正態(tài)分布,此時r值不應(yīng)采用簡單相關(guān)系數(shù),而應(yīng)計算秩(spearman)相關(guān)系數(shù)。2、Bland-Altman分析:這在部分的指導原則中指出來了。Bland-Altman分析主要是作一個圖,用差值或比值等,一般來說界外值在5%以內(nèi),說明一致性較好,但沒有嚴格的標準。不過從圖上可以直觀的看出數(shù)據(jù)的離散程度。3、t檢驗或秩和檢驗,配對定量的數(shù)據(jù)需不需要t檢驗?從以上的指導原則上看并沒有要求??赡芤驗槭翘晳T了吧,大多數(shù)人都可能會進行t檢驗,在算
18、法上,t檢驗相對簡單,也沒有什么爭議。但如果數(shù)據(jù)差值不呈正態(tài)分布,理論上應(yīng)用秩和檢驗。4、定量數(shù)據(jù)的描述:拿到一組數(shù)據(jù)后,應(yīng)對基本的情況進行描述,描述的量比較多,不過個人覺得太多也沒有必要,在IVDstatistics中,提供均值、標準差、最大值、最小值、偏度、峰度,我想應(yīng)該足夠了,另外一個較為形象的描述是作直方圖。有些指導原則里寫了說樣本應(yīng)盡量均勻分布,我想這一點是很難做到的,非生理的疾病值不會按統(tǒng)計學上理想的狀態(tài)分布,以偏態(tài)分布居多。如果做不到均勻分布,但我想要考察試劑的性能,高、中、低值的相對連續(xù)的分布不能有所缺失,用直方圖可以直觀的表示出來。5、正態(tài)分布:這是進行以上一些檢驗在統(tǒng)計學上的基本要求。正態(tài)分布算法很多,目前認為較好的算法是W檢驗和D'Agostino檢驗。在計算方面,正態(tài)分布的計算很復雜,只有用程序進
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