分子診斷技術在感控中的應用

1、分子診斷技術在感控中的應用分子生物學診斷技術檢測DNA、RNA或蛋白質等物質對疾病進行診斷或 輔助診斷分析基因或蛋白的存在、變異或表達為疾病提供更直接的證據(jù)常見分子診斷技術核酸檢測核酸擴增技術測序技術核酸雜交技術基因芯片技術生物傳感技術蛋白質檢測光譜技術蛋白芯片技術標記免疫分析技術質譜技術醫(yī)院感染暴發(fā)調查Sivertsen A, Billstrom H, Melefors O , Liljequist BO, Wisell KT, et al. (2014) A Multicentre Hospital Outbreak in Sweden Caused by Introduction of

2、a vanB2 Transposon into a Stably Maintained pRUM-Plasmid in an Enterococcus faecium ST192 Clone. PLoS ONE 9(8): e103274. doi:10.1371/journal.pone.0103274屎腸球菌ST192Baier et al. Molecular characteristics and successful management of a respiratory syncytial virus outbreak among pediatric patients with h

3、emato-oncological disease Antimicrobial Resistance and Infection Control (2018) 7:21RSV感染 暴發(fā)Sanger測序病原體診斷關于測序技術Sanger測序新一代測序（next genome sequencing, NGS）第三代測序genome-wide association study, GWASwhole-genome sequencing ,WGS耐藥基因/耐藥突變葡萄球菌：mecA、SCCmec腸球菌：VanA、 VanB、 VanC結核分枝桿菌：ropB腸桿菌科：NDM-1、KPC、 mcr-1HB

4、V、HCV、HIVCRE：CPE？NO-CP-CRE?孔蛋白缺失+ 產ESBL / AmpC水解厄他培南臨床反應可能與MIC一 致較低的傳播可能產碳青霉烯酶（如KPC，NDM）可能是交叉耐藥較高的暴發(fā)可能緊急感染控制Zhan L, et al.(2017) Outbreak by Hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae ST11 Isolates with Carbapenem Resistance in a Tertiary Hospital in China. Front. Cell. Infect. Microbiol. 7:182. doi: 10

5、.3389/fcimb.2017.00182多種技術聯(lián)合應用PFGEPCR擴增測序血清分型MLST從經驗治療到直接干預快速：24小時內報告分子診斷實驗結果質譜（MALDI-TOF）核酸擴增/檢測（NAAT）：多重PCR、微陣列（mecA, vanA, KPC； MRSA/SA, carbapenemases,C difficile）PNA-FISH（Enterococcus, Candida, Staphylococcus, EC/PSA/KP，mecA）T2MR： 用核磁信號檢測，目前僅用于念 珠菌二代測序：宏基因組學，但不快！ 全自動顯微鏡+ FISH：快速表型檢測Adapted from

6、 Chan, et al. Nature Biotechnology 30:1068-71CLSI AST News Update.2018,3(1).技術的局限性表型診斷實驗（MIC）與臨床結果非常相關MIC升高，耐藥基因表達任何微生物實驗室都可 以使用這種方法基因型診斷實驗（機制）更好地預測傳播風險和 暴發(fā)可能表型方法差（例如MHTNAAT僅在參考/研究實 驗室中可用納入醫(yī)院感染實時監(jiān)測和暴發(fā)預警系統(tǒng)Du et al.: Real-time automatic hospital-wide surveillance of nosocomial infections and outbreaks in a large Chinese tertiary hospital. BMC Medical Informatics a