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關(guān)于原核基因的表達(dá)與調(diào)控第一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
物質(zhì)代謝調(diào)控與基因表達(dá)調(diào)控的關(guān)系物質(zhì)代謝調(diào)控的實(shí)質(zhì)就是對(duì)酶的調(diào)節(jié)。調(diào)節(jié)水平:細(xì)胞水平激素水平:激素調(diào)節(jié)整體調(diào)節(jié):神經(jīng)體液調(diào)節(jié)酶分子結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)酶的分隔分布酶分子降解調(diào)節(jié)酶含量的調(diào)節(jié)第二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日ControlofGeneExpressioninProkaryotesE.colihasabout4,000genes.Somegenesareonlyactiveundercertainconditions.Howdoesthecellregulatewhichgenesare“on”andwhichgenesare“off”?Transcriptionalcontrol第三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日在細(xì)胞內(nèi)有許多種蛋白質(zhì)其數(shù)量幾乎不受外界環(huán)境的影響,這些蛋白質(zhì)稱為組成蛋白質(zhì)(constitutiveproteins);另一類型則被稱為適應(yīng)型或調(diào)節(jié)型,因?yàn)檫@類蛋白蛋白質(zhì)的合成明顯受環(huán)境的影響而改變。第四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日組成型表達(dá)(constitutiveexpression):幾乎不受環(huán)境變動(dòng)影響的一類基因表達(dá),其中某些基因表達(dá)產(chǎn)物是細(xì)胞或生物體整個(gè)生命過程中都持續(xù)需要而必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeepinggene)。適應(yīng)型表達(dá)(adaptiveexpression):環(huán)境的變化容易使其表達(dá)水平變動(dòng)的一類基因表達(dá)。第五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第一節(jié)
原核基因表達(dá)調(diào)控總論基因表達(dá)調(diào)控的水平:轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控包括:mRNA加工水平調(diào)控;
翻譯水平的調(diào)控第六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日原核生物基因表達(dá)調(diào)控的各個(gè)水平第七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日原核生物基因調(diào)控與外部信號(hào):營(yíng)養(yǎng)狀況和環(huán)境因素
除光合自養(yǎng)細(xì)菌外,一般細(xì)菌如大腸桿菌所需的碳源首先是葡萄糖,利用葡萄糖發(fā)酵獲得能量,維持生存。在缺乏葡萄糖時(shí),細(xì)菌也可以利用其它糖類如乳糖作為碳源,維持生活。第八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日應(yīng)環(huán)境條件變化基因表達(dá)水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(dǎo)(induction),這類基因被稱為可誘導(dǎo)的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達(dá)水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應(yīng)的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。第九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日一、原核基因調(diào)控機(jī)制的類型和特點(diǎn)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控,負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控調(diào)節(jié)蛋白(regulatoryprotein)是一些特殊蛋白質(zhì),它們決定著其他蛋白質(zhì)的合成。有兩種基本類型:即正調(diào)節(jié)蛋白(positiveregulator)及負(fù)調(diào)節(jié)蛋白(negativeregulator)。負(fù)調(diào)節(jié)蛋白或稱阻遏蛋白(repressor),會(huì)使其靶蛋白的合成受到抑制,即不表達(dá)。正調(diào)節(jié)蛋白是激活蛋白(activator)。對(duì)靶蛋白的合成有促進(jìn)作用。因此,激活蛋白存在時(shí)被控制的基因可表達(dá)。第十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Regulationcanbenegativeorpositive NegativeControl–mRNA在不存在調(diào)控因素的時(shí)候合成較快PositiveControl–mRNA的合成需要調(diào)控因素的存在第十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日負(fù)控下的基因的表達(dá)可以由阻遏蛋白所關(guān)閉。通常阻遏蛋白可以與DNA結(jié)合以阻止轉(zhuǎn)錄發(fā)生,也可以與mRNA結(jié)合阻止翻譯起始。Structuralgeneclustersarecoordinatelycontrolled.第十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日正控下的基因的表達(dá)只能發(fā)生在調(diào)節(jié)蛋白有活性的情況下。阻遏蛋白可以與DNA結(jié)合以阻止轉(zhuǎn)錄發(fā)生。正調(diào)節(jié)蛋白與DNA及RNA聚合酶相互作用,協(xié)助轉(zhuǎn)錄起始的發(fā)生。正調(diào)控蛋白通常稱為激活蛋白(activator)。第十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日1、負(fù)控誘導(dǎo)和負(fù)控阻遏在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應(yīng)物(誘導(dǎo)物)結(jié)合時(shí),阻遏蛋白失效,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄;在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時(shí),調(diào)節(jié)基因不轉(zhuǎn)錄。阻遏蛋白作用的部位是操縱區(qū)。第十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日2、正轉(zhuǎn)錄調(diào)控調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白??梢愿鶕?jù)激活蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導(dǎo)系統(tǒng)和正控阻遏系統(tǒng)在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,效應(yīng)物的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài);在正控阻遏系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)第十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日調(diào)節(jié)蛋白
阻遏蛋白激活蛋白游離時(shí)無活性(正控誘導(dǎo))游離時(shí)有活性(正控阻遏)游離時(shí)無活性(負(fù)控阻遏)游離時(shí)有活性(負(fù)控誘導(dǎo))負(fù)誘活正誘死第十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日ThelacoperonisanexampleThelacgenesarecontrolledbyarepressor.Thelacoperoncanbeinduced.3、可誘導(dǎo)調(diào)節(jié):是指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來的關(guān)閉狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。第十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日aregulatorysysteminE.colithatcontrolsthesynthesisofenzymesrequiredforthemetabolismoflactoseLacoperonwasdiscoveredbyFrancoisJacobandJaquesMonodinthe1960'sdisaccharideFirstmodelforcontrolofgeneexpression-thelacoperoninE.coli-第十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日E.coligrowingonglucoseCellsstopgrowingwhenallglucoseisusedup第二十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日E.coligrowingonglucoseandlactoseCellsstopgrowingwhenallglucoseisusedupAftera
"lagperiod",
thecellsstartto
growon
lactoseLagperiod第二十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日4、可阻遏調(diào)節(jié):這類基因平時(shí)是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將關(guān)閉。Tryptophan
operonisanexampleHistidineoperon
第二十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日二、弱化子對(duì)基因活性的影響大腸桿菌:trp操縱子,phe操縱子,thr操縱子,ile操縱子,ala操縱子沙門氏菌:his操縱子,嘧啶合成操縱子弱化子:第二十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日三、降解物對(duì)基因活性的影響葡萄糖效應(yīng)(降解物抑制作用):有葡萄糖存在的情況下,即使在細(xì)菌培養(yǎng)基中加入乳糖、半乳糖、阿拉伯糖或麥芽糖等誘導(dǎo)物,與其相對(duì)應(yīng)的操縱子也不會(huì)啟動(dòng),不會(huì)產(chǎn)生出代謝這些糖的酶類。降解物基因激活蛋白(CAP,cataboliteactivatorprotein,or,cyclicAMPreceptorprotein,環(huán)腺苷酸受體蛋白,CRP):葡萄糖降解物抑制腺苷酸環(huán)化酶活性,cAMP-CAP對(duì)細(xì)菌糖代謝發(fā)揮正調(diào)控作用。第二十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日四、細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)細(xì)菌在面臨營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)(如氨基酸)全面匱乏時(shí),細(xì)菌會(huì)啟動(dòng)一個(gè)應(yīng)急反應(yīng),包括生產(chǎn)各種RNA、糖、脂肪和蛋白質(zhì)在內(nèi)的幾乎全部生物化學(xué)反應(yīng)過程均停止。這一過程要有鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)作為信號(hào)。第二十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Whatisthestringentresponse?Aminoacidstarvation(stringentconditions)leadstorapiddropinstableRNA(tRNAandrRNA)synthesis(10-20fold)Total[mRNA]alsodrops(~3fold)SomemRNAsincrease–e.g.aminoacidoperons第二十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Whatstimulatesthestringentresponse?AnunchargedtRNAenteringtheacceptor(A)sitecausingtheribosometostallAsitemRNAaminoacylatedtRNAAsitemRNAunchargedtRNAstallAminoacidstringentSignaltoshutdownstableRNAsynthesis第二十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)pppGpp、ppGpp等幾種鳥苷多磷酸,可降低rRNA和tRNA合成的速度,這是在氨基酸缺乏時(shí)細(xì)菌的一種適應(yīng)性反應(yīng),稱為嚴(yán)謹(jǐn)反應(yīng)。在大腸桿菌,當(dāng)氨基酸貧乏時(shí),ppGpp與RNA聚合酶結(jié)合,形成ppGpp—RNA聚合酶復(fù)合物,并使RNA聚合酶構(gòu)象改變,活性降低,rRNA和tRNA合成減少或停止第二十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)作用范圍十分廣泛,超級(jí)調(diào)控因子AminoacidstarvationinducessynthesisofphosphorylatedguaninenucleotidespppGppandppGppGTPATPpppGppppGppmajorpathwayminorpathwayGDPATP++(p)ppGppsynthetaseUnchargretRNA(+)RNApolymeraseppGpp-RNApolymerasecomplex(inactived)(+)第二十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第二節(jié)
操縱子和負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)操縱子學(xué)說:是法國(guó)巴斯德研究所Jacob和Monod在研究E.coli乳糖代謝調(diào)節(jié)時(shí)被發(fā)現(xiàn)的。JacquesMonod
FrancoisJacob第三十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Operonisaunitofbacterialgeneexpressionandregulation,includingstructuralgenesandcontrolelementsinDNArecognizedbyregulatorgeneproduct(s).OperatoristhesiteonDNAatwhicharepressorproteinbindstopreventtranscriptionfrominitiatingattheadjacentpromoter.RepressorproteinbindstooperatoronDNAorRNAtopreventtranscriptionortranslation,respectively.StructuralgenecodesforanyRNAorproteinproductotherthanaregulator.第三十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日SUGARMETABOLISMINE.coliTheoperonsforthegal,lacandaragenesareorganizedinthesamefashion,intandem.第三十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日ProkaryoticGeneRegulation第三十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Duringthelagperiod,newenzymesaresynthesised
?-galactosidase
(lacZ)-splitslactoseintoglucoseandgalactoselactosepermease
(lacY)-transportslactoseacrossthecellmembranelactosetransacetylase
(lacA)-inactivatestoxicgalactosides乳糖操縱子控制細(xì)菌對(duì)碳源乳糖的利用第三十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Howdoesthecellknowlactoseispresent?Howdoesitswitchonenzymeproduction?Howdoesitswitchontheproductionofallthreeenzymescoordinately?Thethreeenzymesareproducedonlywhenthecellneedstouselactoseasacarbonsource.酶的誘導(dǎo)合成第三十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:Thelacoperonoccupies~6000bpofDNA.AttheleftthelacIgenehasitsownpromoterandterminator.TheendofthelacIregionisadjacenttothepromoter,P.Theoperator,O,occupiesthefirst26bpofthelonglacZgene,followedbythelacYandlacAgenesandaterminator.Structuralgeneclustersarecoordinatelycontrolled第三十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:RepressorandRNApolymerasebindatsitesthatoverlaparoundthestartpointofthelacoperon.第三十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日大腸桿菌乳糖操縱子(lactoseoperon)包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:lacZ、lacY和lacA,以及啟動(dòng)子、控制子和阻遏子等。第三十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日LACTOSEOPERONINE.coliThelactoseoperontranscribesapolycistronicmRNA.ItistranscribedasasinglemRNAchainthatissubjectedtocoordinateregulationi.e.thatallgenesareexpressedatthesametime.第三十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日β-半乳糖苷酶:β-半乳糖苷鍵的專一性酶,能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。β-半乳糖苷透過酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶:把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。第四十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
誘導(dǎo)
Definition:resultsinsynthesisofanenzymeifE.coliis grownontheappropriatesubstrate.
ifE.coligrowsonglucose
nob-galactosideinthemedium noneedfortheb-galactosidaseenzyme <5molecules/cell ifE.coliisswitchedfromglucosetolactose (lactoseisab-galactosidemadeupofglucose+galactose) rapidsynthesisofb-galactosidase in2-3min.>5000molecules/cell 5-10%oftotalproteinsinthecell一、酶的誘導(dǎo)-lac體系受調(diào)控的證據(jù)第四十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日誘導(dǎo)物INDUCERDefinition:smallmoleculethatcausesthesynthesisof enzymesabletometabolizeit.第四十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日在不含乳糖及β-半乳糖苷的培養(yǎng)基中,lac+基因型每個(gè)大腸桿菌細(xì)胞內(nèi)大約只有1-2個(gè)酶分子。如果在培養(yǎng)基中加入乳糖,酶的濃度很快達(dá)到細(xì)胞總蛋白量的6%或7%,每個(gè)細(xì)胞中可有超過105個(gè)酶分子。第四十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日INDUCERATTHEMOLECULARLEVEL
discoveredbyJacobandMonodin1960usingbacteriawithmutationsinthelacZ,lacYandlacIgenes.1.Therepressoristranslatedfromtheinducibilitygene(I).Itisatetramericprotein.2.Therepressorbindswithgreataffinitytotheoperator(O)regionofthepromoter.3.Oncebound,itpreventsthebindingoftheRNApolymeraseandtranscriptionofthedownstream
genes.1.Ifasmallmoleculesuchaslactose(THEINDUCER)ispresent,itbinds
withgreataffinitytotherepressor.2.Thecomplexedrepressorcannolongerbindtotheoperatorregion.3.RNApolymerasebindstothe
promoterandtranscribesthegenes.EXCELLENTEXAMPLEOFNEGATIVEREGULATION第四十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日ORGANIZATIONOFTHEPROMOTERREGION第四十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日LABORATORYEXPERIMENTSGrowthofE.coliwithandwithoutinduction.Youwillmakeuseofainduceri.e.IPTG:IPTGcaninduce
galactosidasesynthesisbutwillnotmetabolizeit,since
galactosidasecannotcleavea-S-linkage.第四十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
乳糖操縱子在現(xiàn)代分子生物學(xué)試驗(yàn)技術(shù)的應(yīng)用galactosidase可以用作一些實(shí)驗(yàn)的指示物Inmolecularcloning:bacteriaaregrownonmedium+IPTGandX-gal(chromophore).ThegalactosidaseactivitybreaksdowntheX-gal.Noinsert:bacteriaareblue+insert:
itwillinterruptthecodingregionofthe
-galactosidase,thereforenoenzymewillbeproduced.Thebacteriawillremainwhite.第四十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日載體帶有一個(gè)大腸桿菌的DNA的短區(qū)段,其中有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的調(diào)控序列和前146個(gè)氨基酸的編碼信息。在這個(gè)編碼區(qū)中插入了一個(gè)多克隆位點(diǎn)(MCS),它并不破壞讀框,但可使少數(shù)幾個(gè)氨基酸插入到β-半乳糖苷酶的氨基端而不影響功能,這種載體適用于可編碼β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主細(xì)胞。因此,宿主和質(zhì)粒編碼的片段雖都沒有酶活性,但它們同時(shí)存在時(shí),可形成具有酶學(xué)活性的蛋白質(zhì)。這樣,lacZ基因在缺少近操縱基因區(qū)段的宿主細(xì)胞與帶有完整近操縱基因區(qū)段的質(zhì)粒之間實(shí)現(xiàn)了互補(bǔ),稱為α-互補(bǔ)。由α-互補(bǔ)而產(chǎn)生的LacZ+細(xì)菌在誘導(dǎo)劑IPTG的作用下,在生色底物X-Gal存在時(shí)產(chǎn)生藍(lán)色菌落,因而易于識(shí)別。然而,當(dāng)外源DNA插入到質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)后,幾乎不可避免地導(dǎo)致無α-互補(bǔ)能力的氨基端片段,使得帶有重組質(zhì)粒的細(xì)菌形成白色菌落。這種重組子的篩選,又稱為藍(lán)白斑篩選。如用藍(lán)白斑篩選則經(jīng)連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化的鈣化菌平板37℃溫箱倒置培養(yǎng)12-16hr后,有重組質(zhì)粒的細(xì)菌形成白色菌落。第四十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日安慰誘導(dǎo)物第四十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日二、操縱子模型及影響因子Jacob與Monod所提出的關(guān)于基因表達(dá)調(diào)控的操縱子學(xué)說可以簡(jiǎn)述如下:有一個(gè)專一的阻遏分子(蛋白質(zhì))結(jié)合在靠近β半乳糖苷酶基因上面,這段DNA他們稱之為操縱基因。由于阻遏分子結(jié)合在DNA的操縱基因上,從而阻止了RNA聚合酶合成β半乳糖苷酶的mRNA。乳糖為誘導(dǎo)物,當(dāng)乳糖結(jié)合到阻遏分子上時(shí),即阻止阻遏分子與操縱基因的結(jié)合,mRNA就可以轉(zhuǎn)錄出來。如果去掉乳糖時(shí),阻遏分子又恢復(fù)其活力,與操縱基因DNA結(jié)合,將乳糖基因關(guān)閉。第五十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日1、lac
操縱子ThreesetsofgenesnexttoeachotheronchromosomePlusDNAtranscriptionalelements第五十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日lac
轉(zhuǎn)錄元件Promoter,aDNAsequencerecognizedandbindedbyRNAPolymeraseTellsitwheretostarttranscriptionoftheDNAOperator,lacO,asequencethathelpsregulatetranscriptionofageneRegulatoryelement,lacI,aseparatetranscriptionunitConstitutively(always)expressed,unregulatedProducesthelacrepressorproteinRegulatesspecificallythelacoperon第五十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日lac
操縱子的功能Whennolactoseispresent:Don'tneedtomakeenzymestometabolizelactoseRepressorproteinsfromlacIgenebindthepromoterandlacO(Operator)DNAsequenceofthelacOperonRNAPolymeraseisunabletobindthelacpromoterDNAsequenceTheexpressionofthelacoperonisrepressedNoPermeaseorβ-galactosidaseenzymesareproduced第五十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Nolactosepresent第五十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日LactosePresentLactosepresent:expressionofoperonisneededNeedtoeliminaterepressorblockingSomeofthelactosebindstherepressorproteinsNolongerbindstheoperatorDNAsequenceTherepressorisanallostericprotein:Changesshapeonbindinganothermolecule第五十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日LactosePresent第五十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日InducibleOperon–NegativeControlTherepressorproteinInhibitstranscriptionandgeneexpressionTheoperonisoffinabsenceofexternalinducerButLactoseactstostimulatetranscriptionandexpressionofthegeneTherefore,TheoperonisinducibleAndthelactoseistheinducer第五十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日AdditionofinducerresultsinrapidinductionoflacmRNA,andisfollowedafterashortlagbysynthesisoftheenzymes;removalofinducerisfollowedbyrapidcessationofsynthesis.Repressoriscontrolledbyasmallmoleculeinducer第五十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Repressoriscontrolledbyasmallmoleculeinducer
第五十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:Repressormaintainsthelacoperonintheinactiveconditionbybindingtotheoperator;additionofinducerreleasestherepressor,andtherebyallowsRNApolymerasetoinitiatetranscription.第六十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Cis-actingandtrans-acting
順式作用與反式作用Cis-acting:affectsgenesonlyonthesameDNAmoleculeDNAsequenceTrans-acting:affectsgenesonsameordifferentDNAmoleculesProtein(diffusible)第六十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Cis-actingDNAsequencesOcLacZ-
/
O+
LacZ+:inducibleEcolioperatormutated第六十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Trans-actingproteinsLacI+
LacZ–
/LacI–
LacZ+:inducible**第六十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第六十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日RepressorblocksthebindingofRNApolymerasetotheadjacentpromoterRNApolymeraseandrepressorcanbindtogethertothelacpromoter.Repressormaylockthepolymeraseintoanonproductivestate(morelikelytoberight)第六十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日DNA-Bindingproteins“Helix-turn-helixmotif”:alpha-helicalregionsseparatedbyaturnintheproteinstructureFitsintomajorgrooveofDNAMostrepressorproteinsareHTHs第六十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日ThecrystalstructureofamonomerofLacrepressorHTHheadpiececoreC-terminalOligomeriationInducerbidingOperatorbiding第六十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第六十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第六十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日DNAbindingbytetramersoflacrepressorThelacoperatorsequenceisanearlyperfectinvertedrepeatcenteredaroundtheGCbasepairatposition+11.第七十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
Figure10.16Whenarepressortetramerbindstotwooperators,thestretchofDNAbetweenthemisforcedintoatightloop.(ThebluestructureinthecenteroftheloopedDNArepresentsCAP,anotherregulatorproteinthatbindsinthisregion).PhotographkindlyprovidedbyMitchellLewis.第七十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日三、乳糖操縱子的其它影響因子葡萄糖對(duì)lac操縱子的影響:讓大腸桿菌生長(zhǎng)在葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上,細(xì)菌生長(zhǎng)曲線如右圖:第七十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Cataboliterepressiondescribesthedecreasedexpressionofmanybacterialoperonsthatresultsfromadditionofglucose.ItiscausedbyadecreaseinthelevelofcyclicAMP,whichinturninactivatestheCAPregulator.
代謝物阻遏效應(yīng)與操縱子的正調(diào)控有關(guān)第七十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
Figure:CyclicAMPhasasinglephosphategroupconnectedtoboththe3¢and5¢positionsofthesugarring.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第七十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日cAMPandCataboliteRepressioncyclicAMP(cAMP)在無葡萄糖時(shí)積累.Adenylcyclase被葡萄糖抑制.cAMP磷酸二酯酶(phosphodiesterase
)可被glucose激活A(yù)TPcAMPAMPAdenylcyclasePhosphodiesteraseGlucose(-)(+)第七十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Whathappenswhenbothglucoseandlactosearepresent?BacteriawillnotactivatelacoperonwhenglucoseisstillavailablecAMPsensesthedepletionofglucoselevelcAMPactsbybindingto
cataboliteactivatorprotein
(CAP)
or
cAMPreceptorprotein
(CRP).Adenylcyclase第七十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:GlucosecausescataboliterepressionbyreducingthelevelofcyclicAMP.
CataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromotercAMP-CAP復(fù)合物,該復(fù)合物與啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合是lacmRNA合成所必需的。cAMP第七十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:TheCAPproteincanbindatdifferentsitesrelativetoRNApolymerase.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第七十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第七十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:TheconsensussequenceforCAPcontainsthewellconservedpentamerTGTGAand(sometimes)aninversionofthissequence(TCANA).第八十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日CooperativebindingofcAMP-CAPandRNAPonthelacpromoter第八十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第八十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日90oC第八十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Figure:
CAPbendsDNA>90°aroundthecenterofsymmetry.
Cataboliterepressioninvolvespositiveregulationatthepromoter第八十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日CAPCAPRNAP第八十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日葡萄糖通過其某個(gè)代謝產(chǎn)物影響cAMP的形成,cAMP-CAP復(fù)合物可與lac操作子結(jié)合第八十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日葡萄糖+,乳糖-:lacmRNA-第八十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日葡萄糖+,乳糖+:lacmRNA-第八十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日葡萄糖-,乳糖+:lacmRNA+第八十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第三節(jié)
色氨酸操縱子與負(fù)控阻遏體系Tryptophan(trp)operon:合成代謝途徑的調(diào)控
E.coli
可以在需要時(shí)合成tryptophantryptophan存在,trpoperon的表達(dá)下降第九十頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第九十一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日色氨酸操縱子(tryptophaneoperon)負(fù)責(zé)色氨酸的生物合成;當(dāng)培養(yǎng)基中有足夠的色氨酸時(shí),這個(gè)操縱子自動(dòng)關(guān)閉,缺乏色氨酸時(shí)操縱子被打開,trp基因表達(dá);色氨酸或與其代謝有關(guān)的某種物質(zhì)在阻遏過程(而不是誘導(dǎo)過程)中起作用,在這個(gè)意義上講,它是一個(gè)負(fù)調(diào)控阻遏系統(tǒng)。trp體系參與生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CAP的調(diào)控。第九十二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日trpE基因是第一個(gè)被翻譯的基因,和trpE緊臨的是啟動(dòng)子區(qū)和操縱區(qū),前導(dǎo)區(qū)和弱化子區(qū)為trpL和trpa。trp操縱子中產(chǎn)生阻遏物的基因是trpR,該基因距trp基因簇很遠(yuǎn)。第九十三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第九十四頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日阻遏作用使轉(zhuǎn)錄水平下降70倍,但是色氨酸操縱子的調(diào)控能力在700倍左右阻遏機(jī)制對(duì)色氨酸來說是一個(gè)一級(jí)開關(guān),主管轉(zhuǎn)錄是否啟動(dòng),相當(dāng)于粗調(diào)開關(guān)。trp操縱子中對(duì)應(yīng)于色氨酸生物合成的還有另一個(gè)系統(tǒng)進(jìn)行細(xì)調(diào)控,弱化作用。弱化作用是通過轉(zhuǎn)錄達(dá)到第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因之前的過早終止來實(shí)現(xiàn)的,由色氨酸的濃度來調(diào)節(jié)。弱化子與前導(dǎo)肽第九十五頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日L區(qū)編碼了前導(dǎo)肽,當(dāng)有高濃度Trp存在時(shí),由于弱化子a的作用,轉(zhuǎn)錄迅速減弱停止,生成140核苷酸的前導(dǎo)RNA;當(dāng)Trp濃度較低時(shí),弱化子不起作用,轉(zhuǎn)錄得以正常進(jìn)行,生成長(zhǎng)約7kb的mRNA,操縱子中第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因的起始密碼子AUG在+163處.前導(dǎo)肽第九十六頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日前導(dǎo)RNA結(jié)構(gòu)
前導(dǎo)RNA結(jié)構(gòu)包含4個(gè)互補(bǔ)的區(qū)(序列1,2,3,4)第九十七頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第九十八頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第四節(jié)
阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)第九十九頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日Thearabinoseoperonfeaturesasingleproteinwhichactsasbothapositiveandanegativetranscriptionalregulator,dependinguponthebindingofparticularligands(Figure26.39).阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon),在葡萄糖饋乏時(shí),它能利用阿拉伯糖作為能源。阿拉伯糖C基因編碼一種C蛋白,它能激活阿拉伯糖BAD操縱子的轉(zhuǎn)錄,此操縱子由araB,araA及araD基因組成。第一百頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日
第五節(jié)阻遏蛋白LexA的降解與細(xì)菌的SOS應(yīng)答當(dāng)細(xì)菌DNA遭到較大破壞時(shí),細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)會(huì)啟動(dòng)一個(gè)稱為SOS的誘導(dǎo)型DNA修復(fù)系統(tǒng)
。參與SOSDNA修復(fù)系統(tǒng)的許多基因分散在染色體的各個(gè)部位,同時(shí)受LexA阻遏蛋白的抑制,平時(shí)表達(dá)水平很低。SOS體系的誘導(dǎo)表達(dá)過程其實(shí)就是把LexA阻遏蛋白從基因的上游調(diào)控區(qū)移開的過程。第一百零一頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日LexArepressorbindstoasitewhereRNApolymerasebinds,andtherebypreventstranscriptionofSOSgenesLexAbindingsite-35-10mRNARNApol.bindingsitesSOSgene第一百零二頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日第一百零三頁,共一百一十二頁,2022年,8月28日TheSOSregulon30多個(gè)基因由LexA阻遏蛋白調(diào)控.該阻遏蛋白與所有SOS基因啟動(dòng)子區(qū)的–35序列的某個(gè)位點(diǎn)特異結(jié)合.LexA
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