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關(guān)于實(shí)驗(yàn)動(dòng)物遺傳學(xué)質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)化第1頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三
實(shí)行實(shí)驗(yàn)動(dòng)物遺傳學(xué)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)化的重要意義
(1)可以增加動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可比性和可重復(fù)性
(2)根據(jù)模擬動(dòng)物基因組與人類基因組的異同,可以在遺傳限定的動(dòng)物身上復(fù)制出更多的人類疾病動(dòng)物模型。
(3)標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有利于動(dòng)物基因的作圖。(4)對實(shí)驗(yàn)動(dòng)物遺傳學(xué)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)化的深入研究,可以建立一系列相關(guān)的生物信息數(shù)據(jù)庫。第2頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三實(shí)驗(yàn)動(dòng)物按遺傳學(xué)分類第3頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三品種、品系的概念
品種(breed)和品系(strain)是基本分類單位。品種:人們根據(jù)不同需要而對動(dòng)物進(jìn)行改良、選擇,即定向培育,并具有某種特定外形和生物學(xué)特性的動(dòng)物群體,其特性能較穩(wěn)定地遺傳。品系:即“株”,為實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)的專用名詞,指來源明確,并采用某種交配方法繁殖,而具有相似的外貌、獨(dú)特的生物學(xué)特征和穩(wěn)定的遺傳特性,可用于不用實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡膭?dòng)物群體。第4頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三品種、品系的概念
作為一個(gè)品種、品系,應(yīng)具備以下條件:(1)相似的外貌特征:如:C57BL/6小鼠的毛色是黑色的,昆明小鼠的毛色是白色的,DBA/2小鼠的毛色是灰色的。(2)獨(dú)特的生物學(xué)特性:如:C3H小鼠的乳腺癌發(fā)生率極高。(3)穩(wěn)定的遺傳性能(4)具有共同遺傳來源和一定的遺傳結(jié)構(gòu)通常稱近交系動(dòng)物為品系,稱封閉群動(dòng)物為品種。第5頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三按基因組成特點(diǎn)分近交系突變系雜交F1代封閉群相同基因類型不同基因類型按基因純合程度分第6頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物
(inbredstrain)第7頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物的概念
有意識(shí)地從一個(gè)動(dòng)物群體中選用血緣關(guān)系比較接近的雌雄個(gè)體,即有共同祖先的兄弟、母子、父女進(jìn)行交配,此種近親交配的方式叫做近交。
經(jīng)至少連續(xù)20代的全同胞兄妹之間或親代與子代之間交配培育而成的動(dòng)物,稱為近交系。近交系內(nèi)所有個(gè)體都可追溯到起源于第20代或以后代數(shù)的一對共同祖先。
近交系的近交系數(shù)(Inbreedingcoefficient)應(yīng)大于98.6。第8頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物的概念
亞系和支系
亞系:
1、同一品系在兄妹交配40代之前分離,很可能由于殘余雜合性而導(dǎo)致形成亞系
2、同一品系長期處于分離狀態(tài),可能由于突變而形成亞系
3、已發(fā)現(xiàn)有遺傳差異的品系,可能由于殘余雜合基因、基因突變、遺傳污染引起。
支系:
1、引種到另一實(shí)驗(yàn)室;2、經(jīng)過某種技術(shù)處理第9頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物的命名
近交系一般以1-4個(gè)大寫英文字母命名,如:DBA小鼠亦可以用大寫英文字母加阿拉伯?dāng)?shù)命名,如:C57BL、C3H
還有些品系的代碼在此規(guī)定制定前已廣為人知,如:615
近交系的近交代數(shù)用大寫英文字母F表示。通常在品系代碼后加括號(hào),先寫“F”,后寫代數(shù),如615(F25)表示615小鼠,近交代數(shù)為第25代。第10頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三亞系和支系的命名
亞系命名原則是在品系名稱后加斜線號(hào),斜線后表明亞系的符號(hào):1、數(shù)字,如:DBA/12、培養(yǎng)或產(chǎn)生亞系的單位或個(gè)人的縮寫英文名稱,第一個(gè)字母用大寫,以后的字母用小寫。如:CBA/J表示由美國杰克遜研究所保持的CBA的亞系。3、當(dāng)一個(gè)保持著保持的一個(gè)近交系具有兩個(gè)以上的亞系時(shí),可在數(shù)字后再加保持者的縮寫英文名稱來表示亞系。如:C57BL/6L和C57BL/10J表示美國杰克遜研究所所保持的C57BL的兩個(gè)亞系。
支系命名是在品系(亞系)名稱后面加一斜線或雙斜線,再加上保持者名稱縮寫。C57BL/6J//Lac表示英國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心維持的支系。
品系經(jīng)過技術(shù)處理,應(yīng)該用小寫英文字母作為相應(yīng)的符號(hào)來表示,如C3HfC57BL,表示C3H品系由C57BL代乳。第11頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物的特性
(1)基因純和性(homozygosity)(2)同基因性(isogeneicity)(3)均一性(uniformity)(4)遺傳穩(wěn)定性(geneticstability)(5)可分辨性(identification)
(6)個(gè)體性(individuality)(7)分布的廣泛性(extensivedistribution)(8)背景資料可查性(retrievalablebackgrounddate)第12頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三近交系動(dòng)物的應(yīng)用(1)與封閉群相比,近交系動(dòng)物個(gè)體之間極其一致,可以消除雜合遺傳背景對實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,因此在實(shí)驗(yàn)中,實(shí)驗(yàn)組和對照組都只需少量的動(dòng)物。(2)在某些涉及組織細(xì)胞或腫瘤移植的實(shí)驗(yàn)中,個(gè)體之間組織相容性一致與否,是實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵,在這里,近交系動(dòng)物成為必不可少的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。(3)由于近交,隱性基因純合性狀得以暴露,可以獲得大量先天性畸形及先天性疾病的動(dòng)物模型,如糖尿病、高血壓等,是進(jìn)行基因連鎖分析、比較遺傳學(xué)、生理學(xué)和發(fā)育生物學(xué)研究的理想實(shí)驗(yàn)材料。(4)某些近交系具有一定的自發(fā)或誘發(fā)腫瘤發(fā)病率,并可以使許多腫瘤細(xì)胞株在活體動(dòng)物上傳代。這些品系成為腫瘤病因?qū)W、腫瘤藥理學(xué)研究的重要模型。(5)多個(gè)近交系同時(shí)使用,可使不同研究者分析不同遺傳基因?qū)δ稠?xiàng)實(shí)驗(yàn)的影響,或者觀察結(jié)果是否具有普遍意義。第13頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三特殊近交系同源突變近交系同源導(dǎo)入近交系分離近交系重組近交系第14頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三特殊近交系的概念●同源突變近交系:是某個(gè)近交系在某基因位點(diǎn)上發(fā)生突變而分離、培育出來的新的近交系。兩個(gè)近交系,除了在一個(gè)指明位點(diǎn)等位基因不同外,其他遺傳基因全部相同?!裢磳?dǎo)入近交系:通過雜交-互交(Cross-intercross)或回交(Backcross)等方式將一個(gè)基因?qū)氲浇幌抵?,由此形成的一個(gè)新的近交系與原來的近交系只是在一個(gè)很小的染色體片段上的基因不同,稱為同源導(dǎo)入近交系(同類近交系),簡稱同源導(dǎo)入系(同類系)。
●分離近交系:是在培育近交系的同時(shí),采取一定的交配方法,迫使個(gè)別基因位點(diǎn)上的基因處于雜合狀態(tài)?!裰亟M近交系由兩個(gè)近交系雜交后,經(jīng)連續(xù)20代以上兄妹交配成的近交系。第15頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三特殊近交系的命名同源突變近交系:由發(fā)生突變的近交系名稱后加突變基因符號(hào)(用英文斜體印刷體)組成,二者之間以連接號(hào)分開,如:C57BL/6J-bg.
當(dāng)突變基因必須以雜合子形式保持時(shí),用“+”號(hào)代表野生型基因,如:A/Fa-+/c。C57BL/6J-bg(F58+M+F25)同源導(dǎo)入近交系:在品系(亞系)的名稱(或名稱縮寫)后面加“·”和供體品系名稱縮寫,然后加連字號(hào)和目的基因稱號(hào)。例如:B10·129-H-12b表示以C57BL/10品系為遺傳背景,攜帶來自129品系H-12b基因的同源導(dǎo)入近交系。分離近交系:在品系名稱后加連字號(hào)和雜合基因符號(hào)。如:DW-dw/+DW-dw/+(FH26)
重組近交系:是在兩個(gè)祖系名稱縮寫中間加上大寫英文字母X。作母系的祖系名稱放在前,作父系的祖系名稱放在后。同一系列中不同的近交系可在其后面加連字號(hào),再加數(shù)字表示。例如:雌性AKR和雄性C57BL雜交培育的一系列重組近交系可命名為AKXB-1、AKXB-2、AKXB-3等。第16頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三特殊近交系的應(yīng)用同源突變近交系、同源導(dǎo)入近交系、分離近交系:(1)在同一遺傳背景下比較某基因位點(diǎn)上不同等位基因的遺傳效應(yīng)。(2)在不同遺傳背景中研究同一基因與遺傳背景及其他基因的關(guān)系,消除雜合遺傳背景對某些突變基因表達(dá)的影響,以獲得更為穩(wěn)定的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型。(3)對復(fù)雜的多基因性狀進(jìn)行遺傳分析。重組近交系:(1)分離分析(2)連鎖分析(3)功能分析第17頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三封閉群動(dòng)物第18頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三封閉群動(dòng)物概念
以非近親交配方式進(jìn)行繁殖生產(chǎn)的一個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物種群,在不從其外部引入新個(gè)體的條件下,至少連續(xù)繁殖4代以上,稱為一個(gè)封閉群,或叫遠(yuǎn)交群。
封閉群動(dòng)物的關(guān)鍵是不從外部引入任何新的基因,同時(shí)進(jìn)行隨機(jī)交配,不讓群體內(nèi)基因丟失,以保持封閉群一定的雜合性。
突變種是指攜帶個(gè)別突變基因的封閉群。第19頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三封閉群動(dòng)物命名
例如:N:NIH表示由美國國立衛(wèi)生研究院(N)保持的NIH封閉群小鼠。Lac:LACA表示由英國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心(Lac)保持的LACA封閉群小鼠。
某些命名較早,又廣為人知的封閉群動(dòng)物,名稱與上述規(guī)則不一致時(shí),仍可沿用其原來的名稱。如Wistar大鼠封閉群,日本的ddy封閉群小鼠等。
突變種的命名是在遠(yuǎn)交種命名的基礎(chǔ)上加上適當(dāng)?shù)幕蚍?hào),并且用連字號(hào)相連。如:N:NIH-nu/nu。
封閉群由2-4個(gè)大寫英文字母命名,種群名稱前標(biāo)明保持者的英文縮寫名稱,第一字母須大寫,后面的字母小寫,一般不超過4個(gè)字母。保持者與種群名稱之間用冒昧號(hào)分開。第20頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三封閉群動(dòng)物特性及應(yīng)用(1)封閉群動(dòng)物的遺傳組成具有很高的雜合性(2)封閉群動(dòng)物具有較強(qiáng)的繁殖力和生活力(3)封閉群動(dòng)物沒有引進(jìn)新的個(gè)體,其遺傳特性及反應(yīng)性可保持相對穩(wěn)定;但群內(nèi)個(gè)體具有雜合性,因而其反應(yīng)性有差異。所以封閉群動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性較差。(4)突變種所攜帶的突變基因通常導(dǎo)致動(dòng)物在某些方面的異常,從而可成為生理學(xué)、胚胎學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的模型。第21頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三雜種F1代動(dòng)物第22頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三雜種F1代動(dòng)物概念
雜種F1代動(dòng)物是由兩個(gè)不同的近交品系雜交而繁殖的第一代動(dòng)物,各個(gè)體個(gè)有相同的表型和基因型。
第23頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三雜種F1代動(dòng)物命名
雜種F1代動(dòng)物的命名習(xí)慣上是在括號(hào)內(nèi)把親代母系名稱寫在前邊,后邊是親代父系名稱,以大寫英文字母X連接,再寫上F1。例如:(C57BL/6XDBA/2)F1表示雌性C57BL/6J與雄性DBA/2交配的F1代動(dòng)物。第24頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三雜種F1代動(dòng)物特點(diǎn)(1)雜交優(yōu)勢雜種一代具有較強(qiáng)的生命力,對疾病的抵抗力強(qiáng),壽命較長,容易飼養(yǎng),繁殖旺盛,在很大程度上可克服近交系繁殖引起的各種近交衰退現(xiàn)象。(2)具有與近交系動(dòng)物基本相似的遺傳均質(zhì)性。(3)采用雜交群動(dòng)物所作的各種實(shí)驗(yàn),其結(jié)果的重復(fù)性好。(4)具有親代雙親的特點(diǎn)。(5)國際分布廣,廣泛用于各類實(shí)驗(yàn)研究,其研究結(jié)果易于重復(fù),便于國際交流。第25頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三雜種F1代動(dòng)物的應(yīng)用(1)干細(xì)胞研究(2)免疫學(xué)研究(3)細(xì)胞動(dòng)力學(xué)研究(4)單克隆抗體研究第26頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三突變系動(dòng)物第27頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三基因突變概念
基因突變是指染色體上的一個(gè)位點(diǎn)內(nèi)的遺傳物質(zhì)的變化,或者說是DNA分子鏈中堿基對的改變,也稱突變。簡言之,基因突變是一個(gè)基因變?yōu)樗牡任换?。?8頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三
突變后出現(xiàn)的表現(xiàn)型是多種多樣的,根據(jù)突變對表現(xiàn)型的最明顯效應(yīng),可分為:(1)可見突變:突變的效應(yīng)可在生物的表現(xiàn)型上看出來,即用肉眼能觀察出來,如形態(tài)的變異(2)生化突變:突變的效應(yīng)導(dǎo)致一個(gè)特定的生化功能的喪失。肉眼無法鑒別。須借助特殊方法檢測第29頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三(3)致死突變:分為顯性致死和隱形致死。顯性致死在雜合態(tài)即有致死效應(yīng),隱形致死突變較常見,如鐮形紅細(xì)胞貧血癥的基因就是隱形致死突變(4)條件致死突變:在某些條件下是能成活的,而在另一些條件下是致死的。第30頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三
遺傳學(xué)家常使用突變型推斷未知基因的存在,觀察基因突變的產(chǎn)生,主要是檢測是否偶產(chǎn)生新的表現(xiàn)型效應(yīng)的不同等位基因。如:小鼠毛色基因中,A為野鼠色,a為黑色。當(dāng)A突變?yōu)閍時(shí),其毛色則由野鼠色變?yōu)楹谏?1頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三基因和性狀的關(guān)系(1)一個(gè)基因決定一個(gè)性狀,一般帶有定性的特征,如毛色為定性的,為單基因決定(2)一個(gè)基因決定幾個(gè)性狀,稱為基因的多形性,如帶W基因的小鼠,毛色表現(xiàn)為花色和含鐵紅細(xì)胞性貧血,裸鼠的無胸腺、無毛也是由基因決定的,這可能是由于一個(gè)基因決定兩個(gè)性狀,也可能是靠近的兩個(gè)基因不分離的緣故第32頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三(3)幾個(gè)基因決定一個(gè)性狀,一般帶有定量的特征,如身高、體重是可定量的,為多基因所決定,小鼠6周齡時(shí)體重由30個(gè)基因決定,兔子的高血壓由3-4個(gè)基因決定。第33頁,共39頁,2023年,2月20日,星期三突變系動(dòng)物概念
突變系動(dòng)物是指正常染色體的基因發(fā)生了變
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