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文檔簡介
2、組:泛指一個有生命體、或細胞器的全部遺傳物質;在真核生物,組是指一套(單倍體3、組學:指從組水平研究遺傳的學科4、C值:通常是指一種生物單倍體組DNA的總量,在真核生物中,C值一般隨著生物的進化而增加,高等生5、C值:指一個有機體的C值和其編碼能力缺乏相關性6、RNA組學對細胞中全部RNA分子的結構與功能進行系統(tǒng)的研體水平闡明RNA的生物學意義即為RNA組8、轉錄組學:就是在組學后新興的一門學科,即研究細胞在某能狀態(tài)下所含mRNA的類型與拷貝數(shù)。即研,10酶的活性單位:在特定的條件下,111為1個酶的單位(國際單位IU)。11、酶的比:酶的與蛋白質的量相聯(lián)系的1種單位。如每mg酶蛋白所具有的酶(單位/mg蛋白),每ml酶制劑含有的酶(單位/m1),或每g酶制劑具有的單位(單位/g)等。對同一種酶來講,比12、PH:pHpH 蛋白質組:由一個組所表達的全部相應的蛋白質,同一組在不同細胞、不同組織中的表達情況各不相同;在空間和時間上動態(tài)變化。16、蛋白質組學:從整體的角度分析細胞內動態(tài)變化的蛋白質組成、結構、表達水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質功能與細胞生命活動規(guī)律。應用各種技術來研究蛋白質組的一門新興科、電場下對蛋白質進行等電聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上進行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳SDS)。 生物:通過將大量的特異性分子固定到固相支持物上,再與標記的樣品分子進行雜交,通過檢每個分子19、技術:通過微陣列技術,將高密度DNA片段陣列通過高速機器人或原位合成方式以一定的順序使20、生物信息學:是一門交叉科學,它包含了生物信息的獲取、加工、、分配、分析、解釋等在內的所有(HGP,21、RFLP:用于分析相關多態(tài)性的技術。即用同一種限制性內切酶,完全酶切來源于同一物種不同的基DNA,DNA22、SNP:DNADNA的某一位點處的核苷酸,A、T、G、C都有可能出現(xiàn)而且概率均大于1%,稱之。SNP最多四種,但人類組很大,平均每1000對就有一個。SNPDNA EST:從互補DNA(cDNA)分子所測得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)?;驹恚旱鞍踪|推測mRNA的序列,mRNA反轉錄為cDNA,然后利用其與所列進行雜交,鑒別出與轉錄有關的。組可由DNA組成,也可由RNA組成,但不能共存于同一。DNA:多數(shù)為雙鏈(ds)、環(huán)狀或線性;RNAmRNA。二、試述原核組結構與功能的特點色體。細菌DNA在胞內形成一個致密區(qū)域,即類核(nucleoid,類核無核膜將之與胞漿分開。結 無現(xiàn)象 在原核生物組中含有編碼同工酶的在不同原核生物組中GC含量變化很大除細菌外,還有能自主的雙鏈環(huán)狀DNA分子,稱為質粒。3、不存在子結構,功能相關分散在不同的上。都由一個結構與相關的調控區(qū)組成,轉mRNA<103子使外顯子拼接,才能形成成mRNA。7、功能相關的構成各種,它們可串聯(lián)在一起,亦可相距很遠,但即使串聯(lián)在一起的成簇的也是分8、組中也存在一些可移動的遺傳因素,這些DNA順序并無明顯生物學功能,似乎為自己的目的而組織,故有自私DNA之稱,其移動多被RNA介導(如在哺乳動物及人類組中發(fā)現(xiàn)的逆轉座子,也有被DNA介導的(如在果蠅DNA。四、試述人類組結構特點3、編碼序列只占組總DNA量的5%以下,非編碼區(qū)占95%以上,大量為重復序列。構建BAC克隆;限制性酶處理獲得;根據(jù)方法組建BAC克隆群;根據(jù)STS標記,將BAC克隆群標定在物理圖上;每個BAC克隆內部采用鳥槍法,組裝;將BAC插入順序與BAC克隆 群六、試述RNA研究領域有何新發(fā)現(xiàn)完全沒有蛋白質的電子云存在。說明肽健的形成是由rRNA2、RNAФ29RNA(pRNA)裝配成分子馬達,依賴此分子馬達的轉動,將噬菌體DNA裝入外殼。3、RNA具調控功能:①女性Xist編碼不表達蛋白質的RNA,它與2條X中的一條結合,使其失活。②細胞時,DNA每一次,端粒DNA縮短點,直到端粒全部。此時細胞再也不能,。可說是端粒RNA,控制了細胞的和的發(fā)生。4、RNA調控遺傳信息:通過"再編碼"的方式或不同方式的RNA剪接,-種可在不同的發(fā)育分化階段、不同的生理病理條件或不同的細胞、組織中合成不同的蛋白質。RNA編輯是以另一RNA為模板來修飾mRNA前體,可以給mRNA前6、RNA攜帶遺傳信息:HIV(、丙肝(肝癌)等是RNA8、組研究中的“”可能是RNA七、試從結構特點及作用機制比較siRNA和miRNA的差異前 內源或外源長雙鏈RNA誘導內源發(fā)夾環(huán)結構的轉產 產結 雙鏈分功 降解 八、試比較轉錄組和組的區(qū)別40%左右。代謝物的種類要遠小于和蛋白的數(shù)目,每個生物體中代謝產物大103數(shù)量級,細菌組中幾千導致代謝物的化學復雜性。技術難題:代謝組學中的主要技術難點在于分析物濃度的動態(tài)范圍?(ml2)提高的倍數(shù):是表示提純方法有效的程度,比較每一步純化的效率。純化倍數(shù)是指提純前后比之比,pH十二、試述酶測定中常用的對照方法。測定管中產物量須減去照管中產物量是正由酶促應所生的產物白管和照管易空管”“”。制劑與酶接觸時間而增大。按照抑制劑對酶作用時選擇性不同,又將不可逆的抑制劑分為專一性和非專一性的。Ks型不可逆抑制劑;是根據(jù)底物的結構設計的,具有和底物相似的結構,可和相應的酶結合,同時還帶有一Kcat型不可逆抑制劑;是根據(jù)酶催化過程設計的,具有和底物相似的被酶結合和被酶催化反應的性質,還1、競爭性抑制劑(competitiveIESVmKm增大低,KmESISEII和E,Vm,Km一.表達調控的基本方式1、組成型表達(constitutivegene:組蛋白、核糖體蛋白、糖酵解酶(基原表答、基原;持續(xù)性、恒定表達誘導表達(induction):在特定環(huán)境因素下,激活蛋白被激活,表達產物水平增高的表達。阻遏表達(repression):在特定環(huán)境因素下,阻遏蛋白被激活,表達產物水平減少的表達。組突變:DNA調控序列突變,使適應性表達轉變?yōu)榻M表達,這種突變稱之。3(coordinate順式調節(jié):調控蛋白結合自身的DNA調控序列,調節(jié)自身的表達,為分子內調節(jié)方式,稱為順式(cis)反式調節(jié):調控蛋白特異識別、結合另一的DNA調控序列,調節(jié)另一的開啟和關閉,為分子間的調節(jié)二.乳糖子表達調控機制CAPGAC↓→cAMP↓→CAPGAC↑→cAMP↑→CAP↑→CAPCAPsite協(xié)調調節(jié):低乳糖,低G:CAP能與CAPsite結合,促進表達,但阻遏蛋白與結合—不表達;低乳糖,高G:CAP與CAPsite結合少,基礎表達,且阻遏蛋白與結合—不表達;高乳糖,高G:CAPCAPsite結合少,基礎表達,阻遏蛋白與別乳糖結合——基礎表達;高乳糖,低G:CAPCAPsitetrpO色氨酸濃度高:前導序列延長到終止子,核糖體通過1區(qū),終止2區(qū)前,覆蓋2區(qū)。不能形成2/3發(fā)夾結構??梢孕纬?/4發(fā)夾結構,轉錄終止。Trp結構不表達。色氨酸濃度低:前導序列翻譯終止在Trp子核糖體不能覆蓋2區(qū)形成2/3發(fā)夾結構,不能形成3/4發(fā)夾結構,轉錄不終止。Trp結構表達。四.順式作用元件分類及其在真核表達調控中的作用::啟動子轉錄起始點及其上游200bp。啟動子元件:7~20bp。分為啟動子、啟動子上游元件UPE。前者結合通用轉錄因子和RNA聚合酶,決定轉錄起點。UPE與轉錄因子結合,調節(jié)啟動子與通用轉錄因子的結合,影響RNA聚合酶作用,增強轉錄效率。::(enhancer點:序列長度:在100~200bp之間多個短序列組成:對堿基順序有嚴格要求序列:8~12bp組成回文結構:部分序列的特征。間。③無定位(silncer淋巴細胞T抗原受體T淋巴細胞輔助受體CD4/CD8等③有些DNA序列既有增強子作用也有沉默子作用,(insulator沒有正或負的調控作用。絕緣子增強子活性五.增強子及其結構和作用特點序列長度:100~200bp多個短序列組成:對堿基順序有嚴格要求序列:8~12bp組成?;匚慕Y構:部分序列的特征。具有組織特異性或細胞特異性,一個可以受一個以上的增強子調控?;A轉錄因子:每一RNApol啟動子都需要的調控蛋白,又稱通用轉錄因子,參與RNApolⅡ轉錄的是通用轉錄Ⅱ(TFⅡ強子要求有不同的激活蛋白。激活蛋白與增強子結合的遠距離作用:DNA鏈結構發(fā)生變化,或成環(huán),使各種(coactivatorsa.活化蛋白(轉錄因子)結合;c.ATPATP,提供能量;甲基化程度與表達活性呈反比關系DNADNADNADNADNAH3-H4H3-H4八、siRNAmiRNAsiRNARNaseⅢ(DicerdsRNAsiRNAcomplexRISC5、RISC的解旋酶解開siRNA雙鏈,靶mRNA與正義siRNA進行交換,與反義siRNA特異識別結合。RNAi有相當?shù)男?,而且特異性更好,所需有效濃度更低。目前,體外合成的siRNA已成為研miRNA,屬非蛋白質編碼miRNA初級產物(pri-miRNA):發(fā)夾結構RNA前體(porin(p5雙鏈):胞漿mRNA:RISC中miRNAmRNAmRNA⑶對信號轉導分子與細胞信號轉導SHSH:Src蛋白同源區(qū),Src蛋白是src表達的1種膜蛋白,含3個SHSH1:Tyr22二、信號分子:cAMP、cGMP、DAG(二?;视?、IP3(1,4,5Ca2+、NO。GGAC、AC-cAMP-PKA→G蛋白耦聯(lián)受體→G蛋白→腺苷酸環(huán)化酶→cAMP→cAMP的蛋白激酶A→調控蛋白→轉錄PLC-IP3/DAG-PKCII三.參與酶偶聯(lián)受體的酶有那些,介導哪些信號途徑及其轉導基本途徑。 蛋白酪氨酸激酶受體信號傳導途徑EGF→TKR→Ras→MAPKJanus激酶(JAK-STAT途徑) Ras受體酪氨酸激酶(RPTK)結合信號分子,形成二聚體,并發(fā)生自磷酸化而活化,活化的RPTKRAS,由活化的RAS引起蛋白激酶的磷酸化級聯(lián)反應。RasGDPGTP的釋放需要鳥苷酸交換因子(GEF,如Sos)SH3結構域,但沒有SH2結構域,因此不能直接和受體結合,需要接頭蛋白(如Grb2)的連接,接頭蛋白SH2與受體的磷酸酪氨酸殘基結合,再通過SH3SosSosRas接觸,從而活化RasRasGTPGTP酶活化蛋白(GAP)的參與,使RasGTP水解而失活,GAPSH2結構域可直接與活化的受體結合。RasRafN端結構域結合并使其激活,Raf是絲氨酸/蘇氨酸(Ser/Thr)蛋白激酶(又稱活化的Raf結合并磷酸化另一種蛋白激酶MAPKK,使其活化。MAPKKMAPK的蘇氨酸和酪氨酸殘基使之激活。MAPK為有 原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK),屬絲氨酸/蘇氨酸殘激酶?;罨腗APK進入細胞核,可使許多轉錄因子活化,如將Elk-1激活,促進c-fos,c-jun的表達。RPTK-Ras信號通路可概括如下:配體→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(配體→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(MAPKKK)→MAPKK→MAPK表JAK-STATJAK:JAKTyrJAKTyr,STATSTATJAKSTATTyrTGF-βTβR-Ⅱ結絲氨酸/蘇氨酸磷酸化而使TβR-Ⅰ激活,活化的SmadDNA上的Smad結合元件結合,激活特定的靶基因。Smad6和Smad7通過Smad2和Smad3Smads轉錄復合物的形成來抑制TGF-β 進行等電聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上進行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)。10~100kD分子量的蛋白質;高靈敏度和高分辨率;便于計算機進行圖像分析處理;與質MS/MS電泳CE。(M+能提供的信息:12、分子式(樣品的元素組成)345、人機回答,三個基本因素:1、在噬菌體PⅢ和PⅧ衣殼蛋白N端插入外源待篩編碼的蛋白,形成的融合蛋白表達在噬菌體菌體的表面,其編碼、可通過分泌型噬菌體的單鏈DNA推導出來蛋白文庫4、改造和提高蛋白質的生物學和免疫學特性5、研究新型多肽藥物、和抗體6、研究涉及到蛋(三胞裂解液過柱,先用低鹽溶液洗脫下未結合的蛋白質,然后用高鹽溶液或SDS溶液洗脫結合在柱子上的蛋白一.簡述技術的概念和主要特點DNA二.試述生物制作方法和分析過程。制作方法:光刻DNA三.簡述的優(yōu)缺點和主要應用領域。傳統(tǒng)方法檢測眾多要經歷多次實驗而且自動化程度低,因而每次實驗之間是存在系統(tǒng)誤差的可以克。表達檢測擬南芥、酵母表達研究等DNA序列測定人類組計劃、雜交等藥物篩選在水平上尋找藥物靶標等文庫作圖通過確定克隆的次序從而對酵母組進行作圖。四試述原位光蝕刻合成技術 在合成堿基單體的5'羥基末端連上一個光敏保護5'端保護的核苷酸單體連接上去,這個五試述應用Geospiza對表達譜進行數(shù)據(jù)挖掘的主要流程輸入http: 4,QuickLoadWizard、AdvancedUploadMetho
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