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文檔簡介
一、蛋白質(zhì)通論二、肽三、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定四、蛋白質(zhì)的氨基酸序列與生物學(xué)功能現(xiàn)在是1頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)、多肽、寡肽蛋白質(zhì)與多肽可以通用有時也以胰島素(51個氨基酸,MW=5807)作為一個分界線,大于稱為蛋白質(zhì),小于為多肽寡肽通常指2-10個氨基酸的小分子肽現(xiàn)在是2頁\一共有91頁\編輯于星期一一、蛋白質(zhì)通論(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次(二)蛋白質(zhì)的形狀和大?。ㄒ唬┑鞍踪|(zhì)的分類現(xiàn)在是3頁\一共有91頁\編輯于星期一N末端C末端牛核糖核酸酶現(xiàn)在是4頁\一共有91頁\編輯于星期一一、蛋白質(zhì)通論蛋白質(zhì)的分類依據(jù)蛋白質(zhì)的外形分類球狀蛋白質(zhì):globularprotein,外形接近球形或橢圓形,溶解性較好,能形成結(jié)晶,大多數(shù)蛋白質(zhì)屬于這一類。球狀蛋白的長度與直徑之比一般小于10現(xiàn)在是5頁\一共有91頁\編輯于星期一纖維狀蛋白質(zhì):fibrousprotein,分子類似纖維或細(xì)棒。它又可分為可溶性纖維狀蛋白質(zhì)和不溶性纖維狀蛋白質(zhì)?,F(xiàn)在是6頁\一共有91頁\編輯于星期一依據(jù)蛋白質(zhì)的組成分類結(jié)合蛋白(conjugatedprotein)簡單蛋白(simpleprotein)單純蛋白質(zhì):這類蛋白質(zhì)只含由-氨基酸組成的肽鏈,不含其它成分清蛋白和球蛋白albuminandglobulin由簡單蛋白與其它非蛋白成分結(jié)合而成現(xiàn)在是7頁\一共有91頁\編輯于星期一含量57-672-54-96.2-1212-20抗體(丙種球蛋白)注意等電點(diǎn)及分子量1937年Tiselius和Kabat的電泳方法現(xiàn)在是8頁\一共有91頁\編輯于星期一色蛋白:由簡單蛋白與色素物質(zhì)結(jié)合而成。如血紅蛋白、葉綠蛋白和細(xì)胞色素等。糖蛋白:由簡單蛋白與糖類物質(zhì)組成。如細(xì)胞膜中的糖蛋白等。脂蛋白:由簡單蛋白與脂類結(jié)合而成。如血清-,-脂蛋白等。核蛋白:由簡單蛋白與核酸結(jié)合而成。如DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶、病毒的DNA或RNA復(fù)制過程中等。結(jié)合蛋白共價(jià)通過絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸的側(cè)鏈羥基經(jīng)磷酸二酯鍵連接到DNA或RNA的3′或5′端現(xiàn)在是9頁\一共有91頁\編輯于星期一(二)蛋白質(zhì)的形狀和大小纖維蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)、膜蛋白質(zhì)長度/直徑>10現(xiàn)在是10頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)分子量變化范圍很大,從大約6000到1,000,000道爾頓甚至更大。(二)蛋白質(zhì)的形狀和大小現(xiàn)在是11頁\一共有91頁\編輯于星期一(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次化學(xué)結(jié)構(gòu)(construct,構(gòu)造
):是指組成分子的原子種類+數(shù)量以及它們之間的鍵合(化學(xué)鍵)形式
C2H5OH乙醇 CH3OCH3乙醚
構(gòu)型(configuration):在給定的化學(xué)結(jié)構(gòu)下,分子中原子在鍵合時所形成的不同的空間排列(可分離)旋光異構(gòu)順反異構(gòu)現(xiàn)在是12頁\一共有91頁\編輯于星期一構(gòu)象(conformation):在化學(xué)結(jié)構(gòu)和configuration相同的分子中,其原子由于單鍵的內(nèi)旋轉(zhuǎn)(internaltotation)而在空間形成的不同的構(gòu)象體可以相互轉(zhuǎn)化
一種物質(zhì)它的構(gòu)造和構(gòu)型只有一種,但它的構(gòu)象可以有許多種!現(xiàn)在是13頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次分一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu)在二、三級結(jié)構(gòu)之間又分出二個亞層次:超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域??臻g結(jié)構(gòu)=三維結(jié)構(gòu)=蛋白質(zhì)的構(gòu)象現(xiàn)在是14頁\一共有91頁\編輯于星期一現(xiàn)在是15頁\一共有91頁\編輯于星期一二、肽
1、肽的基本概念2、肽命名3、動植物體內(nèi)重要的肽4、肽的物理和化學(xué)性質(zhì)現(xiàn)在是16頁\一共有91頁\編輯于星期一1、肽的基本概念一分子氨基酸的α-羧基與另一分子氨基酸α-氨基脫水縮合的化合物叫做肽,氨基酸之間通過酰胺鍵(蛋白質(zhì)化學(xué)中將這類酰胺鍵專稱為肽鍵)連接而成。指示:
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組成肽鍵的原子(4+2)處于同一平面-肽平面?,F(xiàn)在是18頁\一共有91頁\編輯于星期一現(xiàn)在是19頁\一共有91頁\編輯于星期一
-H2O二肽:丙氨酰甘氨酸
N——C2、肽命名
現(xiàn)在是20頁\一共有91頁\編輯于星期一寡肽——少數(shù)幾個氨基酸
組成的肽絲氨酸甘氨酸酪氨酸丙氨酸亮氨酸現(xiàn)在是21頁\一共有91頁\編輯于星期一多肽鏈、蛋白質(zhì)就是由幾十個到幾百個甚至幾千個氨基酸分子借肽鍵相互連接起的多肽鏈肽鏈中的氨基酸不是原來完整的分子,多肽鏈中的氨基酸單位稱為氨基酸殘基現(xiàn)在是22頁\一共有91頁\編輯于星期一
無論肽鏈有多長,在鏈的兩端一端有游離的氨基(-NH2),稱為N端;鏈的另一端有游離的羧基(-COOH),稱為C端。
多肽化合物的名稱,通常按照肽內(nèi)氨基酸殘基的排列順序,以殘基名稱(如某某氨酰)從N端依次閱讀到C端,并以C端殘基全名結(jié)束肽的名稱?,F(xiàn)在是23頁\一共有91頁\編輯于星期一命名舉例氨基末端羧基末端下列五肽命名為:丙氨酰谷氨酰亮氨酰纈氨酰組氨酸現(xiàn)在是24頁\一共有91頁\編輯于星期一注意:在開鏈肽的N端和C端可以有游離的α氨基和α羧基,而有的開鏈肽的N端或C端的游離的α氨基或α羧基被別的基團(tuán)結(jié)合(如烷基化、?;龋┗騈端殘基自身環(huán)化。現(xiàn)在是25頁\一共有91頁\編輯于星期一例如促甲狀腺素釋放激素的N端殘基是谷氨酸,此殘基易于自身環(huán)化成焦谷氨?;é涟被c谷氨酸的γ羧基脫水縮和而成)。現(xiàn)在是26頁\一共有91頁\編輯于星期一在生物體中,多肽最重要的存在形式是作為蛋白質(zhì)的亞單位。但是,也有許多分子量比較小的多肽以游離狀態(tài)存在。這類多肽通常都具有特殊的生理功能,常稱為活性肽。如:腦啡肽;激素類多肽;抗生素類多肽;谷胱甘肽;蛇毒多肽等?;钚噪摹に仉幕蛏窠?jīng)肽3、動植物體內(nèi)重要的肽現(xiàn)在是27頁\一共有91頁\編輯于星期一
1)、谷胱甘肽
γ-肽鍵
GSH容易氧化,二分子GSH脫氫以二硫鍵相連成氧化型的谷胱甘肽(GSSG)谷胱甘肽是某些酶的輔酶,在體內(nèi)氧化還原過程中起重要作用?,F(xiàn)在是28頁\一共有91頁\編輯于星期一2)、促腎上腺皮質(zhì)激素(ACTH)大腦分泌的ACTH參與意識行為的調(diào)控;腺垂體分泌的ACTH主要作用于腎上腺皮質(zhì)
現(xiàn)在是29頁\一共有91頁\編輯于星期一3)、腦啡肽
Leu-腦啡肽
Met-腦啡肽
神經(jīng)遞質(zhì),有鎮(zhèn)痛作用而又不會像嗎啡那樣使病人上癮的藥物現(xiàn)在是30頁\一共有91頁\編輯于星期一嗎啡是鴉片中最主要的生物堿(含量約10-15%),1806年法國化學(xué)家F·澤爾蒂納首次從鴉片中分離出來。分離得到的白色粉末在狗和自己身上進(jìn)行實(shí)驗(yàn),結(jié)果狗吃下去后很快昏昏睡去,用強(qiáng)刺激法也無法使其興奮蘇醒;他本人吞下這些粉末后也長眠不醒。據(jù)此他用希臘神話中的睡眠之神嗎啡斯(Morphus)的名字將這些物質(zhì)命名為“嗎啡”。現(xiàn)在是31頁\一共有91頁\編輯于星期一腦啡肽(endorphin),是一種內(nèi)成性(腦下垂體分泌)的類嗎啡生物化學(xué)合成物激素。它能與嗎啡受體結(jié)合,產(chǎn)生跟嗎啡、鴉片劑一樣有止痛和欣快感。等同天然的鎮(zhèn)痛劑。runner'shigh
1975年,兩個小組分別自豬腦和牛腦中發(fā)現(xiàn)2008年3月《Science》現(xiàn)在是32頁\一共有91頁\編輯于星期一4)、胰高血糖素——29肽
現(xiàn)在是33頁\一共有91頁\編輯于星期一4、肽的物理和化學(xué)性質(zhì)離子晶體,熔點(diǎn)高,兩性離子。1、雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)是肽和蛋白質(zhì)所特有的一個反應(yīng)。一般含有兩個或兩個以上的肽鍵的化合物與CuSO4堿性溶液都能發(fā)生雙縮脲反應(yīng)面生成紫紅色或蘭紫色復(fù)合物利用這個反應(yīng)可以以分光光度計(jì)法測定蛋白質(zhì)含量(非蛋白質(zhì)特異性)現(xiàn)在是34頁\一共有91頁\編輯于星期一現(xiàn)在是35頁\一共有91頁\編輯于星期一肽的等電點(diǎn)如何求出?2、兩性離子現(xiàn)在是36頁\一共有91頁\編輯于星期一+H3N—His—Glu—Val—COO-COO-查P133pK9.17pK6.00pK4.25pK2.322.324.256.009.17+-+2+10-1-2pK=4.25*6/2=5.125現(xiàn)在是37頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)分子的一級結(jié)構(gòu)及其測定
一級結(jié)構(gòu)組成多肽鏈的氨基酸殘基的連接方式和排列順序二硫鍵現(xiàn)在是38頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):(Primarystructure)組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目多肽鏈的氨基酸順序多肽鏈內(nèi)或鏈間二硫鍵的數(shù)目和位置現(xiàn)在是39頁\一共有91頁\編輯于星期一1,樣品必需純(>97%以上);2,知道蛋白質(zhì)的分子量;3,知道蛋白質(zhì)由幾個亞基組成;4,測定蛋白質(zhì)的氨基酸組成;并根據(jù)分子量計(jì)算每種氨基酸的個數(shù)。5,測定水解液中的氨量,計(jì)算酰胺的含量。測定蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)的要求現(xiàn)在是40頁\一共有91頁\編輯于星期一三、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定1.氨基酸組成分析
2.氨基酸末端分析
3.蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離4.肽鏈的部分降解及肽片斷的分離5.肽段氨基酸順序測定及肽段重疊6.二硫鍵與酰胺基的定位
現(xiàn)在是41頁\一共有91頁\編輯于星期一1.氨基酸組成分析現(xiàn)在是42頁\一共有91頁\編輯于星期一N-末端分析C-末端分析2.氨基酸末端分析N末端測定方法比C末端更加成熟、可靠和準(zhǔn)確,現(xiàn)在是43頁\一共有91頁\編輯于星期一N-末端分析二硝基氟苯法(FDNB法)二甲基氨基萘磺酰氯法(DNS-Cl法)異硫氰酸苯酯法(Edman法)氨基酸末端分析2.氨基酸末端分析N-末端分析現(xiàn)在是44頁\一共有91頁\編輯于星期一二硝基氟苯法(FDNB法)1945年由Sanger發(fā)明此法曾用此方法測定了胰島素的N-末端。2.氨基酸末端分析現(xiàn)在是45頁\一共有91頁\編輯于星期一二甲基氨基萘磺酰氯法(DNS-Cl法)1956年hartley等提出靈敏度較高(比FDNB法提高100倍)樣品量小于1毫微摩爾DNS-氨基酸穩(wěn)定性較高2.氨基酸末端分析現(xiàn)在是46頁\一共有91頁\編輯于星期一異硫氰酸苯酯法(Edman法)2.氨基酸末端分析生成PTH-氨基酸非常穩(wěn)定,在268nm處有強(qiáng)吸收峰現(xiàn)在是47頁\一共有91頁\編輯于星期一C-末端分析肼解法還原法羧肽酶法2.氨基酸末端分析現(xiàn)在是48頁\一共有91頁\編輯于星期一可與苯甲醛作用形成不溶的二亞芐基衍生物而除去溶于上清中現(xiàn)在是49頁\一共有91頁\編輯于星期一2.還原法2.氨基酸末端分析硼氫化鋰還原成α-氨基醇。完全水解后分析α-氨基醇現(xiàn)在是50頁\一共有91頁\編輯于星期一3.羧肽酶法主要方法
根據(jù)不同的反應(yīng)時間測出酶水解所釋放的氨基酸種類和數(shù)量,從而知道蛋白質(zhì)的C末端殘基順序。實(shí)際應(yīng)用時,由于羧肽酶對不同的C末端氨基酸作用的速度不同,而且反應(yīng)是連續(xù)的,不能停在某一步上,因此給正確判斷氨基酸的順序造成了一定的困難。2.氨基酸末端分析肽鏈外切酶自多肽鏈的C端逐個的水解氨基酸現(xiàn)在是51頁\一共有91頁\編輯于星期一現(xiàn)在是52頁\一共有91頁\編輯于星期一4種常用羧肽酶:羧肽酶來源專一性CpA胰臟能釋放除pro、Arg和Lys以外的所有C端氨基酸CpB胰臟主要水解C端為Arg或Lys的肽鍵CpC植物或微生物相當(dāng)廣泛,幾乎能釋放C端的所有氨基酸CpY面包酵母可釋放C端所有氨基酸羧肽酶A、B均不作用于C-末端第二位為Pro的C-末端的殘基的肽鍵現(xiàn)在是53頁\一共有91頁\編輯于星期一-AA-AA-Lys-AA-AA-Arg-AA-AA-Pro-AA-AA-pro-AA羧肽酶A不作用-AA-AA-Lys-AA-AA-Arg羧肽酶B只作用羧肽酶A、B均不作用羧肽酶Y設(shè)計(jì)自動化序列儀return現(xiàn)在是54頁\一共有91頁\編輯于星期一肽鏈間的結(jié)合非共價(jià)鍵血紅蛋白(四聚體)烯醇化酶(二聚體)共價(jià)鍵結(jié)合胰島素免疫球蛋白等3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離現(xiàn)在是55頁\一共有91頁\編輯于星期一非共價(jià)鍵連接的多肽鏈溫和條件下可以解離通過二硫鍵連接的多肽鏈需要較強(qiáng)的條件將二硫鍵切斷3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離現(xiàn)在是56頁\一共有91頁\編輯于星期一拆分二硫鍵結(jié)構(gòu)是半胱氨酸殘基經(jīng)氧化作用而形成胱氨酸殘基。還原法氧化法3、蛋白質(zhì)中肽鏈的拆離現(xiàn)在是57頁\一共有91頁\編輯于星期一主要二種方法:1.過甲酸氧化法巰基(-SH)和二硫鍵(-S-S-)同時氧化成磺基,生成的磺酸基很穩(wěn)定,肽鏈不再重新形成二硫鍵,便于肽鏈分離二硫橋的斷裂現(xiàn)在是58頁\一共有91頁\編輯于星期一巰基乙醇8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍二硫橋的斷裂2.巰基化合物還原法蛋白質(zhì)變性二硫鍵暴露現(xiàn)在是59頁\一共有91頁\編輯于星期一可以用碘乙酸等烷基化試劑保護(hù)生成的半胱氨酸的-SH+HI+巰基保護(hù)試劑現(xiàn)在是60頁\一共有91頁\編輯于星期一
由于氨基酸順序測定多數(shù)采用Edman降解法,它一次能分析肽鏈長度約10余個氨基酸殘基,所以分離得到的單鏈如果太長,須將長的肽鏈斷裂成易分析的較短肽鏈。
肽鏈部分降解的方法要求選擇性強(qiáng)、裂解點(diǎn)少、反應(yīng)率高,一般采用化學(xué)裂解和酶解法兩種。4.肽鏈的部分降解及肽片斷的分離現(xiàn)在是61頁\一共有91頁\編輯于星期一1).化學(xué)裂解法
溴化氰(CNBr)與肽鏈中Met殘基側(cè)鏈的硫醚基發(fā)生反應(yīng),生成環(huán)化的溴化亞氨內(nèi)酯,此產(chǎn)物水解后,產(chǎn)生高絲氨酸內(nèi)酯,使蛋氨酸羧基端的肽鍵斷裂。這一方法的優(yōu)點(diǎn)是產(chǎn)率高(可達(dá)85%)、專一性強(qiáng),故實(shí)際應(yīng)用較多。甲硫氨酸,人體唯一的含硫必需AA現(xiàn)在是62頁\一共有91頁\編輯于星期一氰化物,帶有氰基(CN)的化合物cyanide['sai?,naid]叁鍵給予氰基以相當(dāng)高的穩(wěn)定性,使之在通常的化學(xué)反應(yīng)中都以一個整體存在。該基團(tuán)具有和鹵素類似的化學(xué)性質(zhì),常被稱為擬鹵素。
有機(jī)氰化物可分類為腈jīng(C-CN)異腈(C-NC)
現(xiàn)在是63頁\一共有91頁\編輯于星期一苦杏仁中毒機(jī)理主要是由于苦杏仁苷被腸道菌群中的β-葡萄糖苷酶水解,產(chǎn)生氫氰酸而被吸收。氰離子能與細(xì)胞色素氧化酶的三價(jià)鐵(Fe3+)結(jié)合,阻斷了氧化呼吸過程中電子的傳遞,致使血紅蛋白喪失攜氧能力,最后組織細(xì)胞因缺氧而窒息。有報(bào)道,成人一次口服生苦杏仁40-60粒可中毒,50-100粒可致死。亦有文獻(xiàn)報(bào)道,小兒口服5粒引起中毒,服10余粒致死的?,F(xiàn)在是64頁\一共有91頁\編輯于星期一產(chǎn)生片段的C端是Met現(xiàn)在是65頁\一共有91頁\編輯于星期一
2).酶解法
酶解法相對化學(xué)裂解法而言,有許多優(yōu)點(diǎn),如專一性強(qiáng)、裂解條件溫和、副反應(yīng)少等,再則蛋白水解酶對肽鏈的水解率也比較高;不同的蛋白水解酶對不同氨基酸形成的肽鍵水解專一性不同。廣泛使用現(xiàn)在是66頁\一共有91頁\編輯于星期一胰蛋白酶胰凝乳(糜)蛋白酶葡萄球菌V8蛋白酶胃蛋白酶溴化氰梭菌蛋白酶(Arg蛋白酶)pH2-3Arg(C)現(xiàn)在是67頁\一共有91頁\編輯于星期一胰蛋白酶現(xiàn)在是68頁\一共有91頁\編輯于星期一胰蛋白酶:R1=賴氨酸Lys和精氨酸Arg側(cè)鏈(專一性較強(qiáng),水解速度快)。肽鏈水解位點(diǎn)現(xiàn)在是69頁\一共有91頁\編輯于星期一胰凝乳蛋白酶或糜蛋白酶:R1=苯丙氨酸Phe,色氨酸Trp,酪氨酸Tyr(速度快);亮氨酸Leu,蛋氨酸Met和組氨酸His水解速度稍慢。肽鏈水解位點(diǎn)現(xiàn)在是70頁\一共有91頁\編輯于星期一5、肽段的分離提純
肽鏈經(jīng)部分裂解得到肽片段必須分離提純,才能進(jìn)一步測定其氨基酸順序。先采用凝膠過濾,得到不同相對分子質(zhì)量的肽片段組分肽片段組分可用離子交換層析進(jìn)一步提純,也可應(yīng)用雙相高壓紙電泳和層析相結(jié)合的方法,HPLC或FPLC具有更高的分辨率?,F(xiàn)在是71頁\一共有91頁\編輯于星期一6.肽段氨基酸序列的測定主要Edman降解法現(xiàn)在主要由氨基酸序列推定法7.肽段在多肽鏈中次序的決定重疊肽段拼湊法重建多肽鏈序列8.二硫橋位置的確定——對角線電泳現(xiàn)在是72頁\一共有91頁\編輯于星期一
取少量的樣品,首先用碘代乙酰胺將肽鏈中未參與二硫鍵形成的巰基保護(hù)起來,然后用胃蛋白酶水解。肽水解后,可用Brown和Hartlay提出的對角線法電泳分離。8.二硫橋位置的確定——對角線電泳現(xiàn)在是73頁\一共有91頁\編輯于星期一對角線電泳圖譜混合肽段點(diǎn)到濾紙中央,兩個方向的電泳條件完全相同第一向第二向過甲酸蒸氣處理2小時,使-S-S-斷裂,此時含-S-S-肽段的靜電荷發(fā)生了改變現(xiàn)在是74頁\一共有91頁\編輯于星期一序列分析中的重要方法和技術(shù)測定N-末端基的異硫氰酸苯酯(PITC)法;分析C-末端基的羧肽酶法;用于多肽鏈局部斷裂的酶裂解和CNBr化學(xué)裂解;斷裂二硫橋的疏基乙醇處理;測定肽段氨基酸序列的Edman化學(xué)降解和電噴射串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù);重建多肽鏈一級序列的重疊肽拼湊法用于二硫橋定位的對角線電泳等。現(xiàn)在是75頁\一共有91頁\編輯于星期一蛋白質(zhì)順序測定基本戰(zhàn)略將肽段順序進(jìn)行疊聯(lián)以確定完整的順序?qū)㈦亩畏蛛x并測出順序?qū)R恍粤呀饽┒税被釡y定二硫鍵拆開純蛋白質(zhì)現(xiàn)在是76頁\一共有91頁\編輯于星期一9.蛋白質(zhì)測序舉例
英國Sanger等人在1953年首次完成了牛胰島素(bovineinsulin)的全部化學(xué)結(jié)構(gòu)的測定工作——這是一個里程碑性的工作FrederickSanger1918,8,13-1958年、1980年兩度獲得諾貝爾化學(xué)獎現(xiàn)在是77頁\一共有91頁\編輯于星期一A鏈B鏈過甲酸產(chǎn)物分離現(xiàn)在是78頁\一共有91頁\編輯于星期一用胰蛋白酶用糜蛋白酶分離肽片段,測定肽序列現(xiàn)在是79頁\一共有91頁\編輯于星期一用重疊肽重建多肽鏈序列現(xiàn)在是80頁\一共有91頁\編輯于星期一胰島素中二硫橋位置的確定糜蛋白酶溫和酸水解現(xiàn)在是81頁\一共有91頁\編輯于星期一由于蛋白質(zhì)序列測定技術(shù)先于DNA序列測定技術(shù)問世,蛋白質(zhì)序列的搜集也早于DNA序列。60年代中期到80年代初,美國國家生物醫(yī)學(xué)研究基金會(簡稱NBRF)Dayhoff領(lǐng)導(dǎo)的研究組將搜集到的蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)信息以“蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)地圖集”(AtlasofProteinSequenceandStructure)的形式發(fā)表,主要用來研究蛋白質(zhì)的進(jìn)化關(guān)系。1984年,“蛋白質(zhì)信息資源”(ProteinInformationResource,簡稱PIR)計(jì)劃正式啟動,蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫PIR也因此而誕生。
10.蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫現(xiàn)在是82頁\一共有91頁\編輯于星期一10.蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫蛋白數(shù)據(jù)庫
SWISS-PROTSWISS-PROT蛋白序列數(shù)據(jù)庫,由日內(nèi)瓦大學(xué)醫(yī)學(xué)生物化學(xué)系與EMBL(歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室)共同維護(hù),是歐洲最主要的蛋白序列數(shù)據(jù)庫,世界兩大蛋白序列數(shù)據(jù)庫之一。PIRPIR(ProteinInformationResource)蛋白信息數(shù)據(jù)庫,由美國國家生物醫(yī)學(xué)研究基金會(NationalBiomedicalResearchFoundation)維護(hù)。是美國最主要的蛋白序列數(shù)據(jù)庫,為世界兩大蛋白序列數(shù)據(jù)庫之一。PDBBrookhaven蛋白序列三維立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫。PROSITE蛋白特征序列字典。ENZYME蛋白酶數(shù)據(jù)庫。REBASE限制酶數(shù)據(jù)庫。HSSP同類二級結(jié)構(gòu)蛋白(Homology-derivedsecondarystructureofproteins)數(shù)據(jù)庫。BLOCKS蛋白序列塊數(shù)據(jù)庫(ProteinBlocksDatabase)。KABAT具有免疫學(xué)重要性的蛋白數(shù)據(jù)庫(DatabaseofProteinsofimmunologicalinterest)。
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