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文檔簡介
牛乳中A2型β-酪蛋白(A2奶)檢測技術(shù)規(guī)程范圍本標準規(guī)定了牛奶和奶粉中A2型β-酪蛋白(A2奶)的檢測方法。本標準適用于牛奶和奶粉中A2型β-酪蛋白(A2奶)的檢測。規(guī)范性引用文件下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和實驗方法GB/T19495.2—2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測實驗室技術(shù)要求GB/Z35959—2018液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析方法通則術(shù)語和定義下列術(shù)語和定義適用于本文件。A2型β-酪蛋白A2β-casein;A2CSN2β-酪蛋白由224個氨基酸(含有15個氨基酸的信號肽)組成,具有不同的變體型(A1、A2、A3、B、C、E、F、H1、I),當?shù)?1位、52位、82位、103位、108位、121位、137位、167位氨基酸分別為谷氨酸、谷氨酸、脯氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸、組氨酸、絲氨酸、脯氨酸時,稱為A2型β酪蛋白。A2奶A2milk所含β酪蛋白為A2型的牛奶稱為A2奶。質(zhì)譜法Massspectrometry;MS試樣被電離后,形成不同質(zhì)荷比的離子,根據(jù)這些離子的質(zhì)量數(shù)和相對豐度分析試樣的方法。質(zhì)荷比Mass-to-chargeratio離子的質(zhì)量m與其所帶的電荷數(shù)z之比,以m/z表示。檢測原理β-酪蛋白變體型對應(yīng)不同的氨基酸突變位點(p.51E>K、p.52E>K、p.82P>H、p.103L>I、p.108M>L、p.121H>Q、p.137S>R、p.167P>L)(參考序列:GenBankAAA30431.1),而不同氨基酸之間存在分子量差異。利用質(zhì)譜分析技術(shù),根據(jù)質(zhì)荷比差異將樣品蛋白質(zhì)中存在氨基酸突變的肽段鑒定出來,從而確定氨基酸突變位點,實現(xiàn)對不同變體型β-酪蛋白檢測的目的。主要試劑配制實驗所用水為符合GB/T6682規(guī)定的雙蒸水;高壓滅菌條件為121℃,1.034×105Pa壓力,蒸汽滅菌20min。試劑配制見附錄A。主要儀器設(shè)備見附錄B。質(zhì)譜檢測及數(shù)據(jù)處理參數(shù)見附錄C。檢測方法樣本采集待檢測的新鮮牛奶每頭奶牛采集新鮮牛奶(排除頭奶或末乳)50mL,充分混勻后,-80℃保存。待檢測的商品化奶粉包裝未XX,常溫儲存。蛋白提取從-80℃取出牛奶樣本,常溫解凍后充分混勻,取樣50μL,或稱取奶粉樣本30mg。向上述樣品中加入500μL裂解液【8M尿素,30mM4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)】。冰上裂解10min。離心,4℃,20000g,30min。取上清,避免吸到油脂。加入二硫蘇糖醇(DTT)至終濃度10mM。56℃水浴1h。取出后,迅速加入碘乙酰胺(IAM)至終濃度55mM,暗室靜置1h。使用考馬斯藍染色法(bradford法)對蛋白質(zhì)進行定量。對定量后的蛋白質(zhì)進行十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)鑒定(如附錄C.1)。蛋白質(zhì)的消化每個樣品取20μg蛋白,加入到10K超濾管中,14000g,4℃,離心40min,棄廢液。加入200μL的25mM碳酸氫銨(NH4HCO3),14000g,4℃,離心40min,棄廢液。重復(fù)上述步驟兩遍。加入1μg/μL的胰蛋白酶(Trypsin)和V8蛋白酶(Glu-C)各1μL,37℃水浴24h。離心收集消化后的肽段。真空抽干消化后的肽段。0.1%甲酸(FA)復(fù)溶肽段。質(zhì)譜鑒定將肽段上機檢測。使用Q-Exactive四級桿-靜電場軌道阱質(zhì)譜儀檢測肽段信號,液相及質(zhì)譜檢測參數(shù)詳見附錄C表C.1、表C.2、表C.3。質(zhì)譜掃描完畢,得到質(zhì)譜原始文件。將質(zhì)譜原始文件輸入到PD(ProteomeDiscoverer1.3,Thermo)軟件后,篩選質(zhì)譜譜圖。篩選參數(shù)見附錄C表C.4。PD提取后的譜圖用Mascot軟件進行搜索,搜索結(jié)束后,PD軟件根據(jù)Mascot軟件搜索結(jié)果輸出鑒XX果。檢索參數(shù)見附錄C表C.5,鑒定的肽段見附錄C表C.6。結(jié)果判定SDS鑒定將從樣品中提取的蛋白質(zhì)進行SDS分離鑒定,檢測蛋白條帶是否清晰無降解。條帶清晰,表示可用于后續(xù)檢測,否則重新取樣鑒定。見附錄C.1。A2型β-酪蛋白的判定根據(jù)質(zhì)譜鑒XX果,當待測樣品的8個氨基酸突變位點分別為p.51E、p.52E、p.82P、p.103L、p.108M、p.121H、p.137S、p.167P時,檢測結(jié)果表述為“A2奶”(如圖1)。下劃線標出的氨基酸為不同變體型β-酪蛋白中存在突變的位點,實線框內(nèi)為氨基酸突變類型A2型β-酪蛋白對應(yīng)的氨基酸序列廢棄物的處理按照GB/T19495.2—2004的規(guī)定執(zhí)行。檢測過程中防止交叉污染的措施按照GB/T19495.2—2004的規(guī)定執(zhí)行。
(資料性附錄)
主要試劑配制樣品裂解液將480.4g尿素,7.1gHEPES溶于800mL蒸餾水中,充分溶解后,定容至1L。10%SDS將10g的SDS粉末溶于80mL蒸餾水中,充分溶解后,定容至100mL。30%丙烯酰胺將29g丙烯酰胺和1gN,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為60mL的蒸餾水中,充分溶解后,定容至100mL。1.5MTris-HCl(pH8.8)將181.65gTris溶于800mL蒸餾水中,加濃鹽酸調(diào)pH至8.8,定容至1000mL。1MTris-HCl(pH=6.8)將121.1gTris溶于800mL蒸餾水中,加濃鹽酸調(diào)pH至6.8,定容至1000mL。10%過硫酸銨將10g過硫酸銨粉末溶于80mL蒸餾水中,充分溶解后,定容至100mL??捡R斯亮藍染色液準確量取甲醇45mL,蒸餾水45mL,冰乙酸10mL,加入0.25g考馬斯亮藍R-250??既久撋?0mM碳酸氫銨/乙腈=1:1。1μg/μL胰蛋白酶將100μg胰蛋白酶溶解到100μL50mM乙酸中,-70℃儲存。25mM碳酸氫銨將2.0g碳酸氫銨溶于800mL蒸餾水中,充分溶解后,定容至1L。
(資料性附錄)
主要儀器設(shè)備單道可調(diào)移液器2μL,10μL,20μL,100μL,200μL,1000μL。離心機最高轉(zhuǎn)速12000r/min,最大容量24×1.5mL。電子天平量程0.001~100g,感量0.001g。凝膠成像分析系統(tǒng)有效像素1280×1024,檢測靈敏度DNA≥0.05ng。穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀輸出電壓0~600V,輸出電流0~100mA。垂直電泳槽外形尺寸15cm×12cm×13cm,凝膠板面積10cm×10cm。高壓滅菌鍋使用溫度范圍45~135℃,最高使用壓力0.255Mpa。自動雙重純水蒸餾器功率3000W,出水量2500mL/h。微波爐功率700W,容積20L,尺寸262mm×452mm×365mm。冰箱4℃,-20℃。電熱恒溫水浴鍋RT+5~70℃。
(資料性附錄)
蛋白檢測參數(shù)及結(jié)果SDS鑒XX果SDS檢測結(jié)果(實線框內(nèi)條帶為β-酪蛋白)質(zhì)譜檢測主要儀器參數(shù)質(zhì)譜儀:ThermoQ-Exactive納升液相:Dionexultimate3000nanoLCsystem質(zhì)譜檢測-納升液相色譜柱及流動相項目參數(shù)NanoLCtrapAcclaimPePmap100150μm×2cmnanoviperC185μm100?NanoLCcolumnC185μm75μm×15cm孔徑300?SolventA0.1%formicacid2%ACN98%waterSolventBFlowrate0.1%formicacid2%water98%ACN0.4μL/min質(zhì)譜檢測-NanoLC液相梯度時間(分)B液比例01040454855586565.015%5%30%60%80%80%5%5%STOP質(zhì)譜檢測-Q-E質(zhì)譜儀參數(shù)參數(shù)名稱參數(shù)值離子模式(Polarity)正離子模式母離子掃描范圍(MSScanrange)350-2000m/z二級分辨率(Resolution)17500毛細管溫度(Capillarytemperature)320度離子源電壓(Ionsourcevoltage)碎裂模式(MS/MSacquisitionmodes)1800VHighercollisionenergydissociation(HCD)碰撞能量歸一化(normalizedcollisionenergy(NCE))28質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理參數(shù)譜圖篩選參數(shù)參數(shù)名稱實驗選項母離子質(zhì)量范圍350-6000Da二級質(zhì)譜圖中最小峰數(shù)10信噪比S/N域值1.5鑒定檢索參數(shù)參數(shù)名稱Parameter實驗選項Mascot版本號(MascotVersion)固定修飾(Fixedmodification)Carbamidomethyl(C)可變修飾(Variablemodification)Oxidation(M),Gln→Pyro-Glu(N-termQ)Phospho(ST),Ser→Arg(S),Ser→Lys(S),Arg→Cys(R),Gln→Glu(Q),Glu→Lys(E),Met→Leu(M),Pro→His(P),Pro→Leu(P),His→Gln(H)一級質(zhì)量偏差(peptidetol.)15ppm二級質(zhì)量偏差(MS/MStol)最大允許漏切數(shù)(Maxmissedcleavages)20mmu1酶的類型(Enzyme)Trypsin數(shù)據(jù)庫(Database)Uniprot_Bostaurus(序列數(shù):32205)蛋白肽段質(zhì)譜圖以檢測到的肽段VMGVSKVKE(107位-115位)為例,肽段中N端碎片離子為b離子模式,C端碎片離子為y離子模式,b2代表肽段中N端前兩個氨基酸組成的碎片離子,上、下質(zhì)譜圖(圖C.2)中b2分子量差值18也是甲硫氨酸(149.2)和亮氨酸(131.2)的分子量差值,因此根據(jù)二級質(zhì)譜圖分析,上圖為含氨基酸突變(p.108M>L)的肽段。其它肽段質(zhì)譜圖略。蛋白肽段質(zhì)譜圖肽段鑒XX果靶標蛋白肽段鑒定列表(其中小寫字母代表修飾/突變位點)肽段序列修飾/突變FQsEEQQQTEDELQDKS3(Phospho)FQSEEQQQTEDELQDKDMPIQAFLLYQEPVLGPVRFQsEEQqQTEDELQDKS3(Phospho);Q7(Gln->Glu)KIEKFqsEEQQqtEDELQDKQ6(Gln->Glu);S7(Phospho);Q12(Gln->Glu);T13(Phospho)DMPIqAFLLYQEPVLGPVRQ5(Gln->Glu)FqsEEqQqtEDELQDKQ2(Gln->Glu);S3(Ser->Arg);Q6(Gln->Glu);Q8(Gln->Glu);T9(Phospho)IEKFQsEEQQQTEDELQDKS6(Phospho)表C.6靶標蛋白肽段鑒定列表(其中小寫字母代表修飾/突變位點)(續(xù))肽段序列修飾/突變IEKFqsEEQqQtEDELQDKQ5(Gln->Glu);S6(Phospho);Q10(Gln->Glu);T12(Phospho)VLPVPQKAVPYPQRDMPIqAFLLYqEPVLGPVRQ5(Gln->Glu);Q11(Gln->Glu)DMPIQAFLLYQEPVLGPVRGPFPIIVIHPFAqTqsLVYPFPGPIPNSLPQNIPPLTQTPVVVPPFLqPEVMGVSKQ6(Gln->Glu);Q8(Gln->Glu);S9(Ser->Lys);Q41(Gln->Glu)IHPFAQTQSLVYPFPGPIPNsLPqNIPPLTQT
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