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第10單元生物技術(shù)與工程第7講基因工程的基本操作程序和應(yīng)用及蛋白質(zhì)工程構(gòu)|建|網(wǎng)|絡(luò)|情境試題規(guī)范作答|閱讀下列材料,回答下列問題:基因的魔剪——CRISPR/Cas系統(tǒng)二倍體馬鈴薯存在自交不親和的現(xiàn)象,導(dǎo)致無法運(yùn)用種子種植馬鈴薯①。二倍體馬鈴薯的自交不親和是由核糖核酸酶基因(S-RNase)限制的,科研人員通過基因編輯技術(shù)敲除了馬鈴薯的S-RNase基因,獲得自交親和的二倍體馬鈴薯②,為馬鈴薯雜交育種供應(yīng)了新的技術(shù)。如圖是科研人員用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)定點(diǎn)敲除S-RNase基因的示意圖。(1)用于編輯不同基因的CRISPR/Cas9復(fù)合物中向?qū)NA堿基序列不同,因此首先要確定S-RNase基因中的待編輯序列,可以通過PCR技術(shù)擴(kuò)增S-RNase基因③,作為編碼特定向?qū)NA的模板。擴(kuò)增時(shí)須要依據(jù)S-RNase基因的脫氧核苷酸序列設(shè)計(jì)引物,引物的作用是使DNA聚合酶能夠從引物的3′端起先連接脫氧核苷酸。(2)CRISPR/Cas9系統(tǒng)能精準(zhǔn)識(shí)別相關(guān)基因,依據(jù)的原理是向?qū)NA與目標(biāo)DNA發(fā)生堿基互補(bǔ)配對(duì);Cas9蛋白可催化磷酸二酯鍵(填化學(xué)鍵名稱)水解,剪切特定DNA片段。(3)欲檢測(cè)經(jīng)上述基因編輯技術(shù)得到的植株是否已具有自交親和性狀,最簡(jiǎn)便的方法是讓該植株自交,視察能否產(chǎn)生種子。【解題策略】真|題|再|(zhì)現(xiàn)1.(2024·浙江卷)紫外線引發(fā)的DNA損傷,可通過“核苷酸切除修復(fù)(NER)”方式修復(fù),機(jī)制如圖所示。著色性干皮癥(XP)患者的NER酶系統(tǒng)存在缺陷,受陽光照射后,皮膚出現(xiàn)炎癥等癥狀?;颊哂啄臧l(fā)病,20歲后起先發(fā)展成皮膚癌。下列敘述錯(cuò)誤的是(C)A.修復(fù)過程須要限制酶和DNA聚合酶B.填補(bǔ)缺口時(shí),新鏈合成以5′到3′的方向進(jìn)行C.DNA有害損傷發(fā)生后,在細(xì)胞增殖后進(jìn)行修復(fù),對(duì)細(xì)胞最有利D.隨年齡增長(zhǎng),XP患者幾乎都會(huì)發(fā)生皮膚癌的緣由,可用突變累積說明解析:由圖可知,修復(fù)過程中須要將損傷部位的序列切斷,因此須要限制酶的參與;同時(shí)修復(fù)過程中,單個(gè)的脫氧核苷酸須要依次連接,要借助DNA聚合酶,A正確;填補(bǔ)缺口時(shí),新鏈即子鏈的延長(zhǎng)方向?yàn)?′到3′的方向進(jìn)行,B正確;DNA有害損傷發(fā)生后,在細(xì)胞增殖中進(jìn)行修復(fù),保證DNA復(fù)制的正確進(jìn)行,對(duì)細(xì)胞最有利,C錯(cuò)誤;癌癥的發(fā)生是多個(gè)基因累積突變的結(jié)果,隨年齡增長(zhǎng),XP患者幾乎都會(huì)發(fā)生皮膚癌的緣由,可用突變累積說明,D正確。故選C。2.(2024·浙江卷)某探討小組利用轉(zhuǎn)基因技術(shù),將綠色熒光蛋白基因(GFP)整合到野生型小鼠Gata3基因一端,如圖甲所示。試驗(yàn)得到能正常表達(dá)兩種蛋白質(zhì)的雜合子雌雄小鼠各1只,交配以期獲得Gata3-GFP基因純合子小鼠。為了鑒定交配獲得的4只新生小鼠的基因型,設(shè)計(jì)了引物1和引物2用于PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖乙所示。下列敘述正確的是(B)A.Gata3基因的啟動(dòng)子無法限制GFP基因的表達(dá)B.翻譯時(shí)先合成Gata3蛋白,再合成GFP蛋白C.2號(hào)條帶的小鼠是野生型,4號(hào)條帶的小鼠是Gata3-GFP基因純合子D.若用引物1和引物3進(jìn)行PCR,能更好地區(qū)分雜合子和純合子解析:分析圖中可知,啟動(dòng)子在左側(cè),GFP基因整合在Gata3基因的右側(cè),啟動(dòng)子啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄后,可以使GFP基因轉(zhuǎn)錄,Gata3基因的啟動(dòng)子能限制GFP基因的表達(dá),A錯(cuò)誤;因啟動(dòng)子在左側(cè),轉(zhuǎn)錄的方向向右,合成的mRNA從左向右為5′→3′,剛好是翻譯的方向,所以翻譯時(shí)先合成Gata3蛋白,再合成GFP蛋白,B正確;整合GFP基因后,核酸片段變長(zhǎng),2號(hào)個(gè)體只有大片段,所以是Gata3-GFP基因純合子,4號(hào)個(gè)體只有小片段,是野生型,C錯(cuò)誤;用引物1和引物3進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增出的片段大小差異較小,無法較好的區(qū)分片段,D錯(cuò)誤。故選B。3.(2024·山東卷)科研人員構(gòu)建了可表達(dá)J-V5融合蛋白的重組質(zhì)粒并進(jìn)行了檢測(cè),該質(zhì)粒的部分結(jié)構(gòu)如圖甲所示,其中V5編碼序列表達(dá)標(biāo)簽短肽V5。(1)與圖甲中啟動(dòng)子結(jié)合的酶是_RNA聚合酶__。除圖甲中標(biāo)出的結(jié)構(gòu)外,作為載體,質(zhì)粒還需具備的結(jié)構(gòu)有_限制酶切割位點(diǎn)、標(biāo)記基因、復(fù)制原點(diǎn)等__(答出2個(gè)結(jié)構(gòu)即可)。(2)構(gòu)建重組質(zhì)粒后,為了確定J基因連接到質(zhì)粒中且插入方向正確,需進(jìn)行PCR檢測(cè),若僅用一對(duì)引物,應(yīng)選擇圖甲中的引物_F2與R1或F1與R2__。已知J基因轉(zhuǎn)錄的模板鏈位于b鏈,由此可知引物F1與圖甲中J基因的_a鏈__(填“a鏈”或“b鏈”)相應(yīng)部分的序列相同。(3)重組質(zhì)粒在受體細(xì)胞內(nèi)正確表達(dá)后,用抗J蛋白抗體和抗V5抗體分別檢測(cè)相應(yīng)蛋白是否表達(dá)以及表達(dá)水平,結(jié)果如圖乙所示。其中,出現(xiàn)條帶1證明細(xì)胞內(nèi)表達(dá)了_J-V5融合蛋白__,條帶2所檢出的蛋白_不是__(填“是”或“不是”)由重組質(zhì)粒上的J基因表達(dá)的。解析:(1)基因表達(dá)載體中啟動(dòng)子是RNA聚合酶識(shí)別和結(jié)合的部位,有了它才能驅(qū)動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄出mRNA。作為運(yùn)載體必需具備的條件:①要具有限制酶的切割位點(diǎn);②要有標(biāo)記基因(如抗性基因),以便于重組DNA分子的篩選;③能在宿主細(xì)胞中穩(wěn)定存在并復(fù)制;④是平安的,對(duì)受體細(xì)胞無害,而且要易從供體細(xì)胞分別出來,圖中甲有啟動(dòng)子和終止子等,因此質(zhì)粒還需具備的結(jié)構(gòu)有限制酶的切割位點(diǎn)、標(biāo)記基因、復(fù)制原點(diǎn)等。(2)據(jù)圖甲可知,引物F2與R1或F1與R2結(jié)合部位包含J基因的堿基序列,因此推想為了確定J基因連接到質(zhì)粒中且插入方向正確,進(jìn)行PCR檢測(cè)時(shí),若僅用一對(duì)引物,應(yīng)選擇圖甲中的引物F2與R1或F1與R2。b是模板鏈,而依據(jù)圖上啟動(dòng)子和終止子的位置可知轉(zhuǎn)錄方向是圖上從左向右,對(duì)應(yīng)的模板鏈方向應(yīng)當(dāng)是3′-5′,非模板鏈(也就是a鏈)是5′-3′;考慮到DNA復(fù)制的方向是子鏈的5′-3′,引物延長(zhǎng)的方向確定是5′-3′,所以引物結(jié)合的單鏈其方向是3′-5′;圖中F1是前引物,在左側(cè),所以其配對(duì)的單鏈?zhǔn)?′-5′的b鏈,故其序列應(yīng)當(dāng)與a鏈相應(yīng)部分的序列相同。(3)據(jù)圖乙可知,用抗J蛋白抗體和抗V5抗體分別檢測(cè),均出現(xiàn)條帶1,說明條帶1是J-V5融合蛋白??笿蛋白抗體檢測(cè)出現(xiàn)條帶2,抗V5抗體檢測(cè)不出條帶2,說明條帶2所檢出的蛋白不是由重組質(zhì)粒上的J基因表達(dá)的。4.(2024·廣東卷)種子大小是作物重要的產(chǎn)量性狀。探討者對(duì)野生型擬南芥(2n=10)進(jìn)行誘變篩選到一株種子增大的突變體。通過遺傳分析和測(cè)序,發(fā)覺野生型DAI基因發(fā)生一個(gè)堿基G到A的替換,突變后的基因?yàn)殡[性基因,據(jù)此推想突變體的表型與其有關(guān),開展相關(guān)試驗(yàn)?;卮鹣铝袉栴}:(1)擬接受農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法將野生型DAI基因轉(zhuǎn)入突變體植株,若突變體表型確由該突變?cè)斐?,則轉(zhuǎn)基因植株的種子大小應(yīng)與野生型植株的種子大小相近。(2)用PCR反應(yīng)擴(kuò)增DAI基因,用限制性內(nèi)切核酸酶對(duì)PCR產(chǎn)物和運(yùn)載體進(jìn)行切割,用DNA連接酶將兩者連接。為確保插入的DAI基因可以正常表達(dá),其上下游序列需具備啟動(dòng)子和終止子。(3)轉(zhuǎn)化后,T-DNA(其內(nèi)部基因在減數(shù)分裂時(shí)不發(fā)生交換)可在基因組單一位點(diǎn)插入也可以同時(shí)插入多個(gè)位點(diǎn)。在插入片段均遵循基因分別及自由組合定律的前提下,選出單一位點(diǎn)插入的植株,并進(jìn)一步獲得目的基因穩(wěn)定遺傳的植株(如圖),用于后續(xù)驗(yàn)證突變基因與表型的關(guān)系。①農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化T0代植株并自交,將T1代種子播種在選擇培育基上,能夠萌發(fā)并生長(zhǎng)的陽性個(gè)體即表示其基因組中插入了DAI基因和卡那霉素抗性基因。②T1代陽性植株自交所得的T2代種子按單株收種并播種于選擇培育基,選擇陽性率約75%的培育基中幼苗接著培育。③將②中選出的T2代陽性植株自交(填“自交”“與野生型雜交”或“與突變體雜交”)所得的T3代種子按單株收種并播種于選擇培育基,陽性率達(dá)到100%的培育基中的幼苗即為目標(biāo)轉(zhuǎn)基因植株。為便于在后續(xù)探討中檢測(cè)該突變,探討者利用PCR擴(kuò)增野生型和突變型基因片段,再運(yùn)用限制性內(nèi)切核酸酶X切割產(chǎn)物,通過核酸電泳即可進(jìn)行突變檢測(cè),相關(guān)信息見下,在電泳圖中將酶切結(jié)果對(duì)應(yīng)位置的條帶涂黑。答案:(3)③解析:(1)依據(jù)題干信息可知,突變后的基因?yàn)殡[性基因,則野生型DAI基因?yàn)轱@性基因,因此接受農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法將野生型DAI基因轉(zhuǎn)入突變體植株,若突變體表型確由該突變?cè)斐?,則轉(zhuǎn)基因植株的種子大小應(yīng)與野生型植株的種子大小相近。(2)利用PCR技術(shù)擴(kuò)增DAI基因后,應(yīng)當(dāng)用同種限制性內(nèi)切核酸酶對(duì)DAI基因和運(yùn)載體進(jìn)行切割,再用DNA連接酶將兩者連接起來;在基因表達(dá)載體中,啟動(dòng)子位于目的基因的首端,終止子位于目的基因的尾端,因此為確保插入的DAI基因可以正常表達(dá),其上下游序列需具備啟動(dòng)子和終止子。(3)①依據(jù)題干信息和圖形分析,將T0代植株的花序浸沒在農(nóng)桿菌(T-DNA上含有DAI基因和卡那霉素抗性基因)液中轉(zhuǎn)化,再將獲得的T1代種子播種在選擇培育基(含有卡那霉素)上,若在選擇培育基上有能夠萌發(fā)并生長(zhǎng)的陽性個(gè)體,則說明含有卡那霉素抗性基因,即表示其基因組中插入DAI基因和卡那霉素抗性基因。②T1代陽性植株都含有DAI基因,由于T-DNA(其內(nèi)部基因在減數(shù)分裂時(shí)不發(fā)生交換)可在基因組單一位點(diǎn)插入也可以同時(shí)插入多個(gè)位點(diǎn),所以不確定是單一位點(diǎn)插入還是多位點(diǎn)插入,若是單一位點(diǎn)插入,相當(dāng)于一對(duì)等位基因的雜合子,其自交后代應(yīng)當(dāng)出現(xiàn)3∶1的性狀分別比,而題干要求選出單一位點(diǎn)插入的植株,因此應(yīng)當(dāng)選擇陽性率約75%的培育基中幼苗接著培育。③將以上獲得的T2代陽性植株自交,再將得到的T3代種子按單株收種并播種于選擇培育基上,若某培育基上全部為具有卡那霉素抗性的植株即為須要選擇的植株,即陽性率達(dá)到100%的培育基中的幼苗即為目標(biāo)轉(zhuǎn)基因植株。依據(jù)圖形分析,野生型和突變型基因片段的長(zhǎng)度都是150bp,野生型的基因沒有限制酶X的切割位點(diǎn),而突變型的基因有限制酶X的切割位點(diǎn),結(jié)合圖中的數(shù)據(jù)分析可知電泳圖中,野生型只有150bp,突變型有50bp和100bp,如圖:5.(2024·遼寧卷)PHB2蛋白具有抑制細(xì)胞增殖的作用。為初步探究某動(dòng)物PHB2蛋白抑制人宮頸癌細(xì)胞增殖的緣由,探討者從基因數(shù)據(jù)庫中獲得了該蛋白的基因編碼序列(簡(jiǎn)稱phb2基因),大小為0.9kb(1kb=1000堿基對(duì)),利用大腸桿菌表達(dá)該蛋白。回答下列問題:(1)為獲得phb2基因,提取該動(dòng)物肝臟組織的總RNA,再經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄過程得到cDNA,將其作為PCR的模板,并設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物來擴(kuò)增目的基因。(2)圖1為所用載體圖譜示意圖,圖中限制酶的識(shí)別序列及切割位點(diǎn)見下表。為使phb2基因(該基因序列不含圖1中限制酶的識(shí)別序列)與載體正確連接,在擴(kuò)增的phb2基因兩端分別引入EcoRⅠ和PstⅡ兩種不同限制酶的識(shí)別序列。經(jīng)過這兩種酶酶切的phb2基因和載體進(jìn)行連接時(shí),可選用T4_DNA連接酶(填“E.coliDNA連接酶”或“T4DNA連接酶”)。相關(guān)限制酶的識(shí)別序列及切割位點(diǎn)名稱識(shí)別序列及切割位點(diǎn)名稱識(shí)別序列及切割位點(diǎn)HindⅢA↓AGCTTTTCGA↑AEcoRⅠG↓AATTCCTTAA↑GPstⅡCAG↓CTGGTC↑GACPstⅠCTGC↓AGGA↑CGTCKpnⅠG↓GTACCCCATG↑GBamHⅠG↓GATCCCCTAG↑G注:箭頭表示切割位點(diǎn)(3)轉(zhuǎn)化前需用CaCl2處理大腸桿菌細(xì)胞,使其處于感受態(tài)的生理狀態(tài),以提高轉(zhuǎn)化效率。(4)將轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌接種在含氨芐青霉素的培育基上進(jìn)行培育,隨機(jī)挑取菌落(分別編號(hào)為1、2、3、4)培育并提取質(zhì)粒,用(2)中選用的兩種限制酶進(jìn)行酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)電泳分別,結(jié)果如圖2,3號(hào)菌落的質(zhì)粒很可能是含目的基因的重組質(zhì)粒。注:M為指示分子大小的標(biāo)準(zhǔn)參照物;小于0.2kb的DNA分子條帶未出現(xiàn)在圖中解析:(1)利用RNA獲得cDNA的過程稱為逆轉(zhuǎn)錄。(2)依據(jù)啟動(dòng)子和終止子的作用可知,目的基因應(yīng)導(dǎo)入啟動(dòng)子和終止子之間,從圖中看出,兩者之間存在三種限制酶切點(diǎn),但是由于KpnⅠ在質(zhì)粒上不止一個(gè)酶切位點(diǎn),所以應(yīng)當(dāng)選擇EcoRⅠ和PstⅡ兩種不同限制酶;依據(jù)PstⅡ的酶切序列可知,其酶切產(chǎn)物為平末端,所以構(gòu)建基因表達(dá)載體時(shí),應(yīng)當(dāng)用T4DNA連接酶連接質(zhì)粒和目的基因。(3)轉(zhuǎn)化時(shí)用CaCl2處理大腸桿菌細(xì)胞,使其處于感受態(tài)的生理狀態(tài),以提高轉(zhuǎn)化效率。(4)由于這些菌落都可以生長(zhǎng)在含有氨芐青霉素的培育基中,因此都含有質(zhì)粒,重組質(zhì)粒包含了目的基因和質(zhì)粒,假如用EcoRⅠ和PstⅡ兩種酶切割重組質(zhì)粒,電泳后將獲得含有質(zhì)粒和目的基因兩條條帶,由于phb2基因大小為0.9kb,所以對(duì)應(yīng)電泳圖中的菌落3。6.(2024·山東卷)某種類型的白血病由蛋白P引發(fā),蛋白UBC可使P被蛋白酶識(shí)別并降解,藥物A可通過影響這一過程對(duì)該病起到治療作用。為探究藥物A治療該病的機(jī)理,需構(gòu)建重組載體以獲得融合蛋白FLAG-P和FLAG-P△。P△是缺失特定氨基酸序列的P,F(xiàn)LAG是一種短肽,連接在P或P△的氨基端,使融合蛋白能與含有FLAG抗體的介質(zhì)結(jié)合,但不影響P或P△的功能。(1)為構(gòu)建重組載體,需先設(shè)計(jì)引物,通過PCR特異性擴(kuò)增P基因。用于擴(kuò)增P基因的引物需滿足的條件是兩種引物分別與兩條模板鏈3′端的堿基序列互補(bǔ)配對(duì)。為使PCR產(chǎn)物能被限制酶切割,需在引物上添加相應(yīng)的限制酶識(shí)別序列,該限制酶識(shí)別序列應(yīng)添加在引物的5′端(填“3′端”或“5′端”)。(2)PCR擴(kuò)增得到的P基因經(jīng)酶切連接插入載體后,與編碼FLAG的序列形成一個(gè)融合基因,如圖甲所示,其中“ATGTGCA”為P基因編碼鏈起始序列。將該重組載體導(dǎo)入細(xì)胞后,融合基因轉(zhuǎn)錄出的mRNA序列正確,翻譯出的融合蛋白中FLAG的氨基酸序列正確,但P基因?qū)?yīng)的氨基酸序列與P不同。據(jù)圖甲分析,出現(xiàn)該問題的緣由是在轉(zhuǎn)錄出的mRNA中,限制酶識(shí)別序列對(duì)應(yīng)的最終兩個(gè)堿基與P基因?qū)?yīng)的第一個(gè)堿基構(gòu)成一個(gè)密碼子,導(dǎo)致讀碼框變更,翻譯出的氨基酸序列變更。修改擴(kuò)增P基因時(shí)運(yùn)用的帶有EcoRⅠ識(shí)別序列的引物來解決該問題,具體修改方案是在EcoRⅠ識(shí)別序列前后增加堿基,使其堿基數(shù)目加上FLAG的堿基數(shù)目為3的倍數(shù)。(3)融合蛋白表達(dá)成功后,將FLAG-P、FLAG-P△、藥物A和UBC依據(jù)圖乙中的組合方式分成5組。各組樣品混勻后分別流經(jīng)含F(xiàn)LAG抗體的介質(zhì),分別出與介質(zhì)結(jié)合的物質(zhì)并用UBC抗體檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果如圖丙所示。已知FLAG-P和FLAG-P△不能降解UBC,由①②③組結(jié)果的差異推想,藥物A的作用是促進(jìn)UBC與FLAG-P的結(jié)合;由②④組或③⑤組的差異推想,P△中缺失的特定序列的作用是P△中缺失的特定序列是與U
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