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關(guān)于蛋白質(zhì)的化學(xué)第一章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能
StructureandFunctionofProtein蛋白質(zhì)(protein)是由氨基酸為單位組成的一類重要的生物大分子,是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)。
第2頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)幾乎參與了生命活動(dòng)的全部過(guò)程其功能包括①酶的生物催化作用
②調(diào)控作用
③協(xié)調(diào)運(yùn)動(dòng)作用
④參與運(yùn)輸、貯存作用
⑤免疫保護(hù)作用
⑥其他作用
第3頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月
第一節(jié)蛋白質(zhì)的分子組成蛋白質(zhì)分子中主要的元素組成是:C、H、O、N、S等。其中N元素的含量相對(duì)穩(wěn)定,約為16%,故每克氮相當(dāng)于6.25克蛋白質(zhì)。
第4頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月一、氨基酸(aminoacid)組成蛋白質(zhì)的基本單位是氨基酸。如將天然的蛋白質(zhì)完全水解,產(chǎn)物為氨基酸。被遺傳密碼編碼的氨基酸約二十種。除脯氨酸和甘氨酸外,其余均屬于L-α-氨基酸。第5頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月L-α-氨基酸的基本結(jié)構(gòu)CHH2NCOOHRα碳原子,不對(duì)稱碳原子側(cè)鏈二十種氨基酸除Gly外全是L-型。Pro呢?殘基:在肽鏈中每個(gè)氨基酸都脫去一個(gè)水分子,脫水后的殘余部分叫殘基(residue),因此蛋白質(zhì)肽鏈中的氨基酸統(tǒng)統(tǒng)是殘基形式。氨基酸的基本結(jié)構(gòu)第6頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月“黃氏”判斷法
(看CAR的走向)
將H原子靠近自己,觀察CAR的走向,逆時(shí)針(左轉(zhuǎn))為L(zhǎng)型,順時(shí)針(右轉(zhuǎn))為D型。
D:dextro
右C:carboxylgroup;
L:
levo
左A:aminogroup;
R:residue;CCARRAL型D型L和D型氨基酸的判斷拉丁語(yǔ)中第7頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(一)氨基酸的分類:根據(jù)R側(cè)鏈基團(tuán)解離性質(zhì)的不同,將氨基酸進(jìn)行分類:1.酸性氨基酸——Glu,Asp;側(cè)鏈基團(tuán)在中性溶液中解離后帶負(fù)電荷的氨基酸。2.堿性氨基酸——His,Arg,Lys;側(cè)鏈基團(tuán)在中性溶液中解離后帶正電荷的氨基酸。3.中性氨基酸——側(cè)鏈基團(tuán)在中性溶液中不發(fā)生解離,因而不帶電荷的氨基酸。可分為:(a)極性氨基酸:Tyr,Cys,Ser,Thr,Asn,Gln,Met,
Trp;(b)非極性氨基酸:Gly,Ala,Val,Leu,Ile,Pro,Phe。第8頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(二)氨基酸的理化性質(zhì):1.兩性解離及等電點(diǎn):氨基酸分子是一種兩性電解質(zhì)。通過(guò)改變?nèi)芤旱膒H可使氨基酸分子的解離狀態(tài)發(fā)生改變。氨基酸分子帶有相等正、負(fù)電荷時(shí),溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點(diǎn)(pI)。第9頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算氨基酸a碳上的氨基及羧基各是一帶電基團(tuán),故有兩個(gè)pK,這兩個(gè)pK平均值即為該氨基酸的pI(等電點(diǎn)),即(pK1+pK2)÷2=pI。第10頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算若一個(gè)氨基酸有3個(gè)可解離的基團(tuán),寫(xiě)出它們的電離式后取兼性離子兩邊的pK值的平均值,即為此氨基酸的等電點(diǎn)。如天冬氨酸的pI計(jì)算如下:其中Asp±為兼性離子,因而其等電點(diǎn)的計(jì)算取其兩側(cè)的pK值的平均值,即(pK1+pK3)÷2=pI(2.09+3.86)÷2=2.97即天冬氨酸的pI為2.97。第11頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算氨基酸的等電點(diǎn)計(jì)算第12頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月2.紫外吸收性質(zhì):組成天然蛋白質(zhì)分子的20種氨基酸中,只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸對(duì)紫外光有光吸收。其吸收峰在280nm左右,以色氨酸吸收最強(qiáng)。可利用此性質(zhì)采用紫外分分光度法測(cè)定蛋白質(zhì)的含量。(二)氨基酸的理化性質(zhì):第13頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月3.茚三酮反應(yīng):氨基酸可與茚三酮縮合產(chǎn)生藍(lán)紫色化合物,其最大吸收峰在570nm。可利用此性質(zhì)測(cè)定氨基酸的含量。(二)氨基酸的理化性質(zhì):第14頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月二、肽(peptide)
(一)肽鍵與肽鏈:蛋白質(zhì)是由若干氨基酸的氨基與羧基經(jīng)脫水縮合而連接起來(lái)形成的長(zhǎng)鏈化合物。一個(gè)氨基酸分子的α-羧基與另一個(gè)氨基酸分子的α-氨基在適當(dāng)?shù)臈l件下經(jīng)脫水縮合即生成肽。第15頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月兩氨基酸單位之間的酰胺鍵,稱為肽鍵。多肽鏈中的氨基酸單位稱為氨基酸殘基。多肽鏈具有方向性,頭端為氨基端(N端),尾端為羧基端(C端)。第16頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(二)生物活性肽:生物體內(nèi)具有一定生物學(xué)活性的肽類物質(zhì)稱生物活性肽。重要的有谷胱甘肽、神經(jīng)肽、肽類激素等。第17頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月全稱為γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。其巰基可氧化、還原,故有還原型(GSH)與氧化型(GSSG)兩種存在形式。
谷胱甘肽的生理功用:解毒作用:與毒物或藥物結(jié)合,消除其毒性作用;參與氧化還原反應(yīng):作為重要的還原劑,參與體內(nèi)多種氧化還原反應(yīng);保護(hù)巰基酶的活性:使巰基酶的活性基團(tuán)-SH維持還原狀態(tài);維持紅細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定:消除氧化劑對(duì)紅細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的破壞作用。谷胱甘肽(GSH):第18頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第19頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第二節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)是由許多氨基酸單位通過(guò)肽鍵連接起來(lái)的,具有特定分子結(jié)構(gòu)的高分子化合物。蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)可人為劃分為一、二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)。除一級(jí)結(jié)構(gòu)外,蛋白質(zhì)的二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)均屬于空間結(jié)構(gòu),即構(gòu)象。構(gòu)象是由于有機(jī)分子中單鍵的旋轉(zhuǎn)所形成的。蛋白質(zhì)的構(gòu)象通常由非共價(jià)鍵(次級(jí)鍵)來(lái)維系。第20頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)分子中的非共價(jià)鍵(次級(jí)鍵)1.氫鍵:氫鍵(hydrogenbond)的形成常見(jiàn)于連接在一電負(fù)性很強(qiáng)的原子上的氫原子,與另一電負(fù)性很強(qiáng)的原子之間。2.疏水鍵:非極性物質(zhì)在含水的極性環(huán)境中存在時(shí),會(huì)產(chǎn)生一種相互聚集的力,這種力稱為疏水鍵或疏水作用力。3.離子鍵(鹽鍵):離子鍵(saltbond)是由帶正電荷基團(tuán)與帶負(fù)電荷基團(tuán)之間相互吸引而形成的化學(xué)鍵。4.范德華氏(vanderWaals)引力:原子之間存在的相互作用力。第21頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月一、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈中通過(guò)肽鍵連接起來(lái)的氨基酸的排列順序及二硫鍵的連接方式,即多肽鏈的線狀結(jié)構(gòu)。維系蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵為肽鍵。牛胰島素一級(jí)結(jié)構(gòu)第22頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月二、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈主鏈原子局部的空間結(jié)構(gòu),但不包括與其他肽段的相互關(guān)系及側(cè)鏈構(gòu)象的內(nèi)容。維系蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵是氫鍵。第23頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(一)蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)原則:1.
由于C=O雙鍵中的π電子云與N原子上的未共用電子對(duì)發(fā)生“電子共振”,使肽鍵具有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。2.與肽鍵相連的六個(gè)原子構(gòu)成剛性平面結(jié)構(gòu),稱為肽單元或肽鍵平面。但由于α-碳原子與其他原子之間均形成單鍵,因此兩相鄰的肽鍵平面可以作相對(duì)旋轉(zhuǎn)。第24頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第25頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(二)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的類型:蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要包括:α-螺旋,β-折迭,β-轉(zhuǎn)角及無(wú)規(guī)卷曲等幾種類型。第26頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月α-螺旋是多肽鏈的主鏈原子沿一中心軸盤(pán)繞所形成的有規(guī)律的螺旋構(gòu)象,其結(jié)構(gòu)特征為:⑴為一右手螺旋;⑵螺旋每圈包含3.6個(gè)氨基酸殘基,螺距為5.44埃;⑶螺旋以氫鍵維系。α-螺旋第27頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月肌紅蛋白第28頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月α螺旋特性氫鍵取向與主軸基本平行右旋,3.6個(gè)氨基酸一個(gè)周期,螺距0.54nm第n個(gè)AA(NH)與第n-4個(gè)AA(CO)形成氫鍵,環(huán)內(nèi)原子數(shù)13。α螺旋的特性第29頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月影響α-螺旋穩(wěn)定的因素有:⑴極大的側(cè)鏈基團(tuán)(存在空間位阻);⑵連續(xù)存在的側(cè)鏈帶有相同電荷的氨基酸殘基(同種電荷的互斥效應(yīng));⑶有Pro等亞氨基酸存在(不能形成氫鍵)。α-螺旋第30頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月β-折迭β-折迭是由若干肽段或肽鏈排列起來(lái)以α-C為轉(zhuǎn)折點(diǎn),形成的扇面狀片層構(gòu)象,其結(jié)構(gòu)特征為:⑴由若干條肽段或肽鏈平行或反平行排列組成片狀
結(jié)構(gòu);⑵主鏈骨架伸展呈鋸齒狀;⑶借相鄰主鏈之間的氫鍵維系。第31頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第32頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第33頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月β-轉(zhuǎn)角β-轉(zhuǎn)角是多肽鏈180°回折部分所形成的一種二級(jí)結(jié)構(gòu),其結(jié)構(gòu)特征為:⑴主鏈骨架本身以大約180°回折;⑵回折部分通常由四個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成;⑶構(gòu)象依靠第一殘基的-CO基與第四殘基的-NH基之間形成氫鍵來(lái)維系。第34頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月兩種常見(jiàn)的β—轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)
第35頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月無(wú)規(guī)卷曲無(wú)規(guī)卷曲是指多肽鏈主鏈部分形成的無(wú)規(guī)律的卷曲構(gòu)象。第36頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月
RNase的分子二級(jí)結(jié)構(gòu)示意圖結(jié)構(gòu)
第37頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月在蛋白質(zhì)分子中,若干具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段在空間上相互接近,形成具有特殊功能的結(jié)構(gòu)區(qū)域,稱模體(序)(motif)或超二級(jí)結(jié)構(gòu)。模體(序)(motif)第38頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月鋅指結(jié)構(gòu)(螺旋-折迭-折迭模序)鋅指結(jié)構(gòu)第39頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月βαβ在蛋白質(zhì)中(Rossmann折疊)βαβ在蛋白質(zhì)中第40頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月螺旋-環(huán)-螺旋模序螺旋-環(huán)-螺旋模序第41頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的層次
一級(jí)結(jié)構(gòu):氨基酸序列
二級(jí)結(jié)構(gòu):α螺旋,β折疊
超二級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)域(domain)
三級(jí)結(jié)構(gòu):所有原子空間位置
四級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)多聚體蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)層次第42頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月三、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)分子或亞基內(nèi)所有原子的空間排布,也就是一條多肽鏈的完整的三維結(jié)構(gòu)。維系三級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵主要是非共價(jià)鍵(次級(jí)鍵),如疏水鍵、氫鍵、鹽鍵、范氏引力等,但也有共價(jià)鍵,如二硫鍵等。第43頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月磷酸丙糖異構(gòu)酶和丙酮酸激酶的三級(jí)結(jié)構(gòu)第44頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月結(jié)構(gòu)域:在一級(jí)結(jié)構(gòu)上相距較遠(yuǎn)的氨基酸殘基,通過(guò)三級(jí)結(jié)構(gòu)的形成,多肽鏈的彎折,彼此聚集在一起,從而形成一些在功能上相對(duì)獨(dú)立的,結(jié)構(gòu)較為緊湊的區(qū)域,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)。
蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)第45頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月結(jié)構(gòu)域(domain)在空間上相對(duì)獨(dú)立免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域第46頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月分子伴侶有些蛋白質(zhì)被合成以后,自己不能獨(dú)立形成自由能最低的立體結(jié)構(gòu),而需要一類蛋白質(zhì)來(lái)催化,這類蛋白質(zhì)稱為分子伴侶(molecularchaperone)。它們普遍存在于真核生物和原核生物中,一般使用ATP的能量幫助其它蛋白質(zhì)形成自由能最低的立體結(jié)構(gòu),但不改變自己。一大部分被稱為熱休克蛋白(heatshockprotein)。第47頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月作用機(jī)制可逆與蛋白質(zhì)結(jié)合,使其松散,形成正確空間結(jié)構(gòu)。1.防止新合成的蛋白質(zhì)由于疏水基團(tuán)的暴露而產(chǎn)生的聚集;2.打開(kāi)已聚集的蛋白質(zhì);3.形成正確的二硫鍵。第48頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月四、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)就是指蛋白質(zhì)分子中亞基的立體排布,亞基間的相互作用與接觸部位的布局。亞基(subunit)就是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)的、每條具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈。維系蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)的是氫鍵、鹽鍵、范氏引力、疏水鍵等非共價(jià)鍵。第49頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月血紅蛋白(Hemoglobin)的四級(jí)結(jié)構(gòu)第50頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月DNA和蛋白質(zhì)的相互作用也是四級(jí)結(jié)構(gòu)DNA和蛋白質(zhì)的結(jié)合第51頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(三)蛋白質(zhì)的分類
(1)按組成成分:?jiǎn)渭兊鞍祝▋H含氨基酸)結(jié)合蛋白(單純蛋白+輔基)(2)按形狀分:纖維蛋白球蛋白第52頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第三節(jié)
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(一)一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)蛋白質(zhì)特定的三級(jí)結(jié)構(gòu)是以氨基酸順序?yàn)榛A(chǔ)的。第53頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定其高級(jí)結(jié)構(gòu)。換言之,蛋白質(zhì)的三維立體結(jié)構(gòu)完全取決于其氨基酸的序列。蛋白質(zhì)的天然立體結(jié)構(gòu)一般是自由能最低的狀態(tài)。Anfinsen(諾貝爾獎(jiǎng)獲得者)用極其簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)證明了蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定其高級(jí)結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)決定立體結(jié)構(gòu)第54頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月牛核糖核酸酶一級(jí)結(jié)構(gòu)與空間結(jié)構(gòu)的關(guān)系第55頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(二)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系1、一級(jí)結(jié)構(gòu)相似的多肽或蛋白質(zhì),其空間構(gòu)象以及功能也相似。2、蛋白質(zhì)分子中起關(guān)鍵作用的氨基酸殘基缺失或被替代,都會(huì)嚴(yán)重影響空間構(gòu)象乃至生理功能,如分子病。第56頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(一)肌紅蛋白和血紅蛋白的結(jié)構(gòu)第57頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系(二)血紅蛋白的構(gòu)象變化與結(jié)合氧協(xié)同效應(yīng):一個(gè)亞基與其配體(Hb中的配體為O2)結(jié)合后,能影響此寡聚體中另一亞基與配體的結(jié)合能力。如果是促進(jìn)作用則稱為正協(xié)同效應(yīng)(positivecooperativity);反之則為負(fù)協(xié)同效應(yīng)(negativecooperativity)。當(dāng)血紅蛋白的一個(gè)α亞基與氧分子結(jié)合以后,可引起其他亞基的構(gòu)象發(fā)生改變,對(duì)氧的親和力增加,從而導(dǎo)致整個(gè)分子的氧結(jié)合力迅速增高,使血紅蛋白的氧飽和曲線呈“S”形。這種由于蛋白質(zhì)分子構(gòu)象改變而導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子功能發(fā)生改變的現(xiàn)象稱為變構(gòu)效應(yīng)。第58頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月血紅蛋白與結(jié)合氧的機(jī)制
1.未與O2結(jié)合的4個(gè)亞基靠彼此形成鹽鍵而緊密結(jié)合——緊張肽(T態(tài)tensestate).此時(shí)的血紅蛋白與O2結(jié)合能力?。划?dāng)?shù)谝粋€(gè)亞基與O2結(jié)合而破壞了該亞基與其相鄰亞基間的鹽鍵,結(jié)構(gòu)開(kāi)始松散,便于第二個(gè)亞基與O2結(jié)合,使結(jié)構(gòu)更松散……由T態(tài)轉(zhuǎn)變未R態(tài)。2.脫氧Hb的Fe2+半徑大,結(jié)合氧后其半徑變小,引起相關(guān)肽段的一系列微小的變化,使得亞基間鹽鍵斷裂,Hb結(jié)構(gòu)變松散。第59頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月肌紅蛋白(Mb)與血紅蛋白(Hb)的氧解離曲線第60頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變與疾病由于蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變而引起的疾病稱為蛋白質(zhì)構(gòu)象病。如:當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)由于折疊錯(cuò)誤而相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀??蓪?dǎo)致人類紋狀體脊髓變形病、老年癡呆、亨丁頓舞蹈病(Huntingtondisease)、瘋牛病……第61頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月瘋牛病瘋牛病是阮病毒蛋白(prionprotein,PrP)引起的人和動(dòng)物神經(jīng)退行性病變。這類疾病具有傳染性、遺傳性或散在發(fā)病的特點(diǎn)。PrPc為基因正常編碼產(chǎn)物。PrPsc為致病蛋白。PrPc與PrPsc一級(jí)結(jié)構(gòu)完全相同。第62頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月一條肽鏈對(duì)應(yīng)一個(gè)特定的空間結(jié)構(gòu)這條法則的破壞是災(zāi)難性的。瘋牛病的prion就是一個(gè)例子。正常prion異常prion蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)的特定和唯一的第63頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能:
永遠(yuǎn)的課題結(jié)構(gòu)與功能第64頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月第四節(jié)
蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離純化一、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)(一)蛋白質(zhì)的兩性解離與等電點(diǎn):由于蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的側(cè)鏈上存在游離的氨基和游離的羧基,因此蛋白質(zhì)與氨基酸一樣具有兩性解離的性質(zhì),因而也具有特定的等電點(diǎn)。第65頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的溶解度最小蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的溶解度最小第66頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(二)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì):
蛋白質(zhì)分子的顆粒直徑已達(dá)1~100nm,處于膠體顆粒的范圍。因此,蛋白質(zhì)具有親水溶膠的性質(zhì)。蛋白質(zhì)分子表面的水化膜和表面電荷是穩(wěn)定蛋白質(zhì)親水溶膠的兩個(gè)重要因素。蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)第67頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月疏水區(qū)域蛋白質(zhì)分子上的電荷與疏水區(qū)蛋白質(zhì)分子上的電荷與疏水區(qū)第68頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月(三)蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固:
在某些物理或化學(xué)因素的作用下,蛋白質(zhì)嚴(yán)格的空間結(jié)構(gòu)被破壞(不包括肽鍵的斷裂),從而引起蛋白質(zhì)若干理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)的改變,稱為蛋白質(zhì)的變性(denaturation)。蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)第69頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月引起蛋白質(zhì)變性的因素有:①物理因素:高溫、高壓、紫外線、電離輻射、超聲波等;②化學(xué)因素:強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑、重金屬鹽等。蛋白質(zhì)的變性變性蛋白質(zhì)的性質(zhì)改變:①物理性質(zhì):旋光性改變,溶解度下降,沉降率升高,粘度升高,光吸收度增加等;②化學(xué)性質(zhì):官能團(tuán)反應(yīng)性增加,易被蛋白酶水解。③生物學(xué)性質(zhì):原有生物學(xué)活性喪失,抗原性改變。
第70頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)變性的可逆性:蛋白質(zhì)在體外變性后,絕大多數(shù)情況下是不能復(fù)性的;如變性程度淺,蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象未被嚴(yán)重破壞;或者蛋白質(zhì)具有特殊的分子結(jié)構(gòu),在去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為復(fù)性(renaturation)。蛋白質(zhì)的變性第71頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)的變性與復(fù)性第72頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月
蛋白質(zhì)分子相互聚集而從溶液中析出的現(xiàn)象稱為沉淀。變性后的蛋白質(zhì)由于疏水基團(tuán)的暴露而易于沉淀,但沉淀的蛋白質(zhì)不一定都是變性后的蛋白質(zhì)。加熱使蛋白質(zhì)變性并凝聚成塊狀稱為凝固。因此,凡凝固的蛋白質(zhì)一定發(fā)生變性。蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)第73頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)蛋白質(zhì)的紫外吸收蛋白質(zhì)在紫外光波長(zhǎng)280nm處有最大吸收,這是因?yàn)榉枷阕灏被釟埢?色氨酸及酪氨酸殘基)內(nèi)存在共軛雙鍵引起的,可以280nm光吸收值的檢測(cè)用于蛋白質(zhì)含量的測(cè)定。
第74頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)某些試劑可對(duì)蛋白質(zhì)分子中肽鍵或特殊氨基酸殘基發(fā)生顯色反應(yīng),且產(chǎn)生的有色物質(zhì)量與蛋白質(zhì)濃度相關(guān),可用于蛋白質(zhì)定性、定量檢測(cè)。如雙縮脲反應(yīng),酚試劑、考馬斯亮藍(lán)、茚三酮等顯色反應(yīng)。
第75頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月二、蛋白質(zhì)的分離與純化(一)鹽析與有機(jī)溶劑沉淀:1.鹽析:在蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,以破壞蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì),使蛋白質(zhì)從溶液中沉淀析出,稱為鹽析。常用的中性鹽有:硫酸銨、氯化鈉、硫酸鈉等。鹽析時(shí),溶液的pH在蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)處效果最好。鹽析沉淀蛋白質(zhì)時(shí),通常不會(huì)引起蛋白質(zhì)的變性。第76頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月2.有機(jī)溶劑沉淀蛋白質(zhì):凡能與水以任意比例混合的有機(jī)溶劑,如乙醇、甲醇、丙酮等,均可用于沉淀蛋白質(zhì)。沉淀原理是:①脫水作用;②使水的介電常數(shù)降低,蛋白質(zhì)溶解度降低。
蛋白質(zhì)的分離與純化第77頁(yè),共90頁(yè),星期六,2024年,5月帶電粒子在電場(chǎng)中移動(dòng)的現(xiàn)象稱為電泳(electrophoresis)
。蛋白質(zhì)分子在溶液中可帶凈的負(fù)電荷或帶凈的正電荷,故可在電場(chǎng)中發(fā)生移動(dòng)。不同的蛋白質(zhì)分子所帶電荷量不同,且分子大小也不同,故在電場(chǎng)中的移動(dòng)速度也不同,據(jù)此可互相分離。
(二)電泳:蛋白質(zhì)的分離與純化第78頁(yè),共
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