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文檔簡介
1、第二章,發(fā)酵工業(yè)菌種,本章內(nèi)容,1 菌種篩選,2 菌種改良,一、常用的工業(yè)微生物 二、發(fā)酵工業(yè)菌種分離篩選,1 菌種篩選,一、常用的工業(yè)微生物 p13,1、細(xì)菌 醋桿菌屬的醋化醋桿菌、弱氧化醋桿菌 乳酸桿菌 枯草桿菌,乳酸桿菌,醋化醋桿菌,枯草桿菌,1、細(xì)菌 丙酮丁醇梭菌 大腸桿菌 谷氨酸棒狀桿菌,丙酮丁醇梭菌,谷氨酸棒狀桿菌,2、酵母菌 釀酒酵母 假絲酵母屬 產(chǎn)朊假絲酵母 解脂假絲酵母 熱帶假絲酵母 畢赤酵母屬、漢遜酵母屬,一、常用的工業(yè)微生物,釀酒酵母,熱帶假絲酵母,熱帶假絲酵母,產(chǎn)朊假絲酵母,3、霉菌 曲霉屬 米曲霉 黑曲霉 青霉屬 青霉菌:點(diǎn)青霉、產(chǎn)黃青霉 桔青霉,一、常用的工業(yè)微生物
2、,青霉屬,產(chǎn)黃青霉,曲霉屬,米曲霉,黑曲霉,3、霉菌 根霉屬: 德氏根霉 米根霉、小麥曲根霉 紅曲霉屬 紫紅曲霉,根霉屬,米根霉,4、放線菌 鏈霉菌屬 小單孢菌屬 地中海諾卡氏菌,一、常用的工業(yè)微生物,5、未培養(yǎng)微生物p14,定義:指迄今所采用的微生物純培養(yǎng)分離及培養(yǎng)方法還未獲得純培養(yǎng)的微生物。 其在自然環(huán)境微生物群落中占有非常高的比例,約為99。,一、常用的工業(yè)微生物,二、發(fā)酵工業(yè)菌種分離篩選P15,菌株分離:將混雜著各種微生物的樣品按照實(shí)際需要和菌株的特性采取迅速、準(zhǔn)確、有效的方法對(duì)它們進(jìn)行分離、篩選,進(jìn)而得到所需微生物的過程。,(一)、 菌種選擇的要求p15,培養(yǎng)基原料來源廣、產(chǎn)物易回收
3、 發(fā)酵周期較短; 條件易控制; 抗病毒(噬菌體)、雜菌能力強(qiáng); 菌種不易變異退化; 對(duì)放大設(shè)備的適應(yīng)性強(qiáng); 菌種不是病原菌,(二)、菌種分離的一般過程 P15,標(biāo)本采集, 預(yù)處理, 富集培養(yǎng), 菌種分離(初篩、復(fù)篩), 發(fā)酵性能鑒定,如何使樣品中所含微生物的可能性大?,如何在后續(xù)的操作中使這種可能性實(shí)現(xiàn)?,目的:高效地獲取一株高產(chǎn)目的產(chǎn)物的微生物,問題:, 菌種保藏,1、樣品的采集p15,樣品來源越廣泛,獲得新菌種的可能性越大。 采樣時(shí)應(yīng)注意的問題: A、土壤的有機(jī)質(zhì)含量和通風(fēng)狀況 B、土壤的酸堿度和植被狀況 C 、地理?xiàng)l件 D 、季節(jié)條件,A、土壤的有機(jī)質(zhì)含量和通風(fēng)狀況 P16,耕地、菜園、
4、近郊土壤:土質(zhì)通氣保水性能好,微生物生長旺盛,數(shù)量多,尤其細(xì)菌和放線菌較多,山坡上的森林土壤:有機(jī)質(zhì)豐富,微生物生陰暗潮濕,適合霉菌和酵母菌生長,沙土、貧瘠的土地:細(xì)菌數(shù)量少,果園:樹根土壤中酵母菌含量較高(偏酸),豆科植物根系土壤:根瘤菌較多,B、土壤的酸堿度和植被狀況,腐殖土:霉菌較多,油田土壤:分解石油的微生物較多,自然環(huán)境中的天然菌群,可因人類的生產(chǎn)或生活而改變。 如在土壤中加去莠津(2-氯-4-乙胺基-6-異丙胺基-1,3,5-三嗪 ),會(huì)導(dǎo)致放線菌群的增加;在殺真菌劑存在下,諾卡氏菌屬的菌更容易分離到。,C、地理?xiàng)l件,南方溫度高、溫暖季節(jié)長、雨水多、相對(duì)濕度高、植被覆蓋面廣、土壤有
5、機(jī)質(zhì)豐富:許多工業(yè)微生物菌種,如抗生素產(chǎn)生菌,尤其是霉菌、酵母菌,大都從南方獲取,北方:秋季采土樣最為理想,D 、季節(jié)條件,上節(jié)知識(shí)回顧,一、常用的工業(yè)微生物 二、發(fā)酵工業(yè)菌種分離篩選 1、樣品的采集 A、土壤的有機(jī)質(zhì)含量和通風(fēng)狀況 B、土壤的酸堿度和植被狀況 C 、地理?xiàng)l件 D 、季節(jié)條件,采土樣的方法,南方:用取樣鏟,將表層5cm(陽光直射,蒸發(fā)量大水分少,而且受紫外線照射)左右的浮土除去,取525cm處的土樣1025g,裝入事先準(zhǔn)備好的塑料袋內(nèi)扎好。 北方:土壤干燥,可在1030cm處取樣。給塑料袋編號(hào)并記錄地點(diǎn)、土壤質(zhì)地、植被名稱、時(shí)間及其他環(huán)境條件。 一般樣品取回后應(yīng)馬上分離,以免微
6、生物死亡。,目的:提高菌種分離的效率。 物理方法:加熱(55,6min;100,1h;40 2-6h)、膜過濾法、離心法、空氣攪拌法 化學(xué)方法:含1%幾丁質(zhì)培養(yǎng)基、用CaCO3提高pH值進(jìn)行培養(yǎng)(鏈霉菌屬) 誘餌法:用涂石蠟的棒置于碳源培養(yǎng)基中(諾卡氏菌)、花粉(游動(dòng)放線菌)、蛇皮(小瓶菌屬)、人頭發(fā)(角質(zhì)菌屬),2、樣品的預(yù)處理 p16,富集的目的:讓目的微生物在種群中占優(yōu)勢,使篩選變得可能。,富集培養(yǎng)是在目的微生物含量較少時(shí),根據(jù)微生物的生理特點(diǎn),設(shè)計(jì)一種選擇性培養(yǎng)基或創(chuàng)造有利生長條件,使目的微生物數(shù)量增加,由原來自然條件下的劣勢種變成人工環(huán)境下的優(yōu)勢種,以利于分離得到所需要的菌株。,3、
7、富集培養(yǎng) p17,富集的基本方法: 1、控制營養(yǎng):如以唯一碳源或氮源作底物; 2、控制培養(yǎng)條件:如pH、溫度、通氣量等; 3、抑制不需要的種類。,富集培養(yǎng)方法: 1、分批式富集培養(yǎng)(P17):指將富集培養(yǎng)物轉(zhuǎn)接到新的同一種培養(yǎng)基中,重新建立選擇性壓力,如此重復(fù)幾次后,再取此富集培養(yǎng)物接種至固體培養(yǎng)基上,以獲得單菌落。轉(zhuǎn)種是關(guān)鍵。 2、連續(xù)培養(yǎng)(P17):通過改變限制性基質(zhì)濃度,來控制兩類不同菌株的比生長速率。 3、半連續(xù)培養(yǎng)(P18):即分批補(bǔ)料培養(yǎng),4、菌種分離P18,從產(chǎn)物角度出發(fā),在培養(yǎng)時(shí)以產(chǎn)物的形成有目的的設(shè)計(jì)培養(yǎng)基;,利用簡單、快速的鑒定方法,如抗生素。,從形態(tài)的角度,菌落的外觀形態(tài)
8、,是微生物的一個(gè)重要表征。如多糖產(chǎn)生菌在適當(dāng)?shù)呐囵B(yǎng)基上生長,從具有粘液性的菌落外觀上就可以初步識(shí)別。,(1)、常規(guī)分離法:,平板劃線法 稀釋分離法 涂布法,A 分區(qū)劃線法 B 連續(xù)劃線法,將樣品分散到最低濃度,倒平板,培養(yǎng),挑取單菌落,后面3個(gè)稀釋度各取0.1 ml涂布,透明圈法 變色圈法 抑菌圈法 生長圈法,(2)、生化反應(yīng)分離法:,在平板培養(yǎng)基中加入溶解性較差的底物,使培養(yǎng)基混濁,這樣能分解該底物的微生物便會(huì)在菌落周圍產(chǎn)生透明圈。,圈的大小可初步反映該菌株利用底物的能力,完全可以作為菌種初篩的判斷標(biāo)準(zhǔn)。如脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶及核酸酶產(chǎn)生菌的分離,產(chǎn)有機(jī)酸菌的初篩。,透明圈法,例1:分離某
9、種產(chǎn)生有機(jī)酸的菌株時(shí),在培養(yǎng)基中添加碳酸鈣。,例2:分離淀粉酶產(chǎn)生菌時(shí),培養(yǎng)基以淀粉為唯一碳 源,待樣品涂布到平板上,經(jīng)過培養(yǎng)形成單個(gè)菌落 后,再用碘液浸涂,根據(jù)菌落周圍是否出現(xiàn)透明的水 解圈來區(qū)別產(chǎn)酶菌株。,對(duì)于一些不易產(chǎn)生透明圈產(chǎn)物的產(chǎn)生菌,可在底物平板中加入指示劑或顯色劑,使所需微生物能被快速鑒別出來。,變色圈法,例1:分離果膠酶產(chǎn)生菌,用含0.2%果膠為唯一碳源,菌落長成后加入0.2%的剛果紅溶液染色4h,具有分解果膠能力的菌落周圍便會(huì)出現(xiàn)降紅色的變色圈。 例2:分離內(nèi)肽酶產(chǎn)生菌,除了用酪蛋白作底物平板產(chǎn)生透明圈進(jìn)行鑒別外,還可用吲羥乙酸酯為底物加到分離培養(yǎng)基內(nèi),產(chǎn)生蛋白酶的菌落由于水
10、解吲羥乙酸酯為3-羥基吲哚,后者能氧化生成藍(lán)色產(chǎn)物,根據(jù)變色圈便可選出平板上產(chǎn)蛋白酶菌株。,若被檢菌能分泌某些抑制工具菌生長的物質(zhì),如抗生素等,便會(huì)在該菌落的周圍形成工具菌不能生長的抑菌圈,被鑒別出來。,抑菌圈法:,常用于抗生素產(chǎn)生菌的分離。工具菌的選擇是關(guān)鍵,工具菌采用抗生素的敏感菌。 傳統(tǒng)上常用金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌作為工具菌檢驗(yàn)抗生素的抗性,現(xiàn)采用聯(lián)合工具菌如枯草芽孢桿菌和綠色產(chǎn)色鏈霉菌或巴氏梭狀芽孢桿菌,可分離出抗菌活性低,對(duì)其它試驗(yàn)菌活性高的新抗生素,如黃色霉素族的抗生素,而這些抗生素在單獨(dú)使用枯草芽孢桿菌作工具菌時(shí)無法檢出。,抑菌圈自動(dòng)測量分析儀,如,嘌呤營養(yǎng)缺陷型大腸桿菌與
11、不含嘌呤的瓊脂混合倒平板,在其上涂布含菌樣品進(jìn)行保溫培養(yǎng),周圍出現(xiàn)生長圈的菌落即為 。,常用于分離篩選氨基酸、核苷酸和維生素等產(chǎn)生菌。其工具菌是一些相對(duì)應(yīng)的營養(yǎng)缺陷型菌株,由于得到所需的營養(yǎng),凡是目的微生物周圍便會(huì)出現(xiàn)一個(gè)混濁生長圈。,生長圈法:,2 發(fā)酵工業(yè)菌種改良,一、誘變育種 二、航天育種,自然選育,一般習(xí)慣上將自然選育稱為菌種的分離純化。,單細(xì)胞(孢子)懸液的制備,平板分離,挑選單菌落 (注意形態(tài)的觀察),發(fā)酵試驗(yàn),自然選育是一種簡單易行的方法,可達(dá)到純化菌種、防止菌種退化、穩(wěn)定生產(chǎn)、提高產(chǎn)量的目的。但其突變率很低,因而要采用新方法進(jìn)行菌株的改良。,改良的具體目標(biāo)p23,提高目標(biāo)產(chǎn)物的
12、產(chǎn)量 提高目標(biāo)產(chǎn)物的純度,減少副產(chǎn)物 改良菌種性狀,改善發(fā)酵過程 改變生物合成途徑,以獲得高產(chǎn)的新產(chǎn)品,改良的方法,常規(guī)育種(誘變育種) 細(xì)胞工程育種 基于代謝調(diào)節(jié)的育種技術(shù) 基因工程育種 蛋白質(zhì)工程育種 代謝工程育種,一、誘變育種,人工利用各種誘變劑誘發(fā)基因突變,再通過適當(dāng)?shù)暮Y選方法獲得所需要的優(yōu)良菌種的育種方法,稱為誘變育種。,誘變劑:能夠提高生物體突變頻率的物質(zhì),從青霉素產(chǎn)量看誘變育種,效價(jià):指有效成分的濃度。1g/ l稱為1 單位,化學(xué)誘變劑都具毒性,其中90%以上是致癌物質(zhì)或極毒藥品,使用時(shí)要格外小心,不能宜接用口吸,避免與皮膚直接接觸,不僅要注意自身安全,也要防上污染環(huán)境,造成公害
13、。,(一)、化學(xué)誘變劑使用過程的安全性,是一種強(qiáng)烈致癌物質(zhì),操作時(shí)要帶橡皮手套,穿工作服,帶口罩,用稱量瓶稱量,最好在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。凡接觸過NTG的器皿必須及時(shí)、單獨(dú)處理,例用自來水大量沖洗或用1-2N的NaOH浸泡過夜,洗凈。,NTG(N-甲基-N-硝基-N-亞硝基胍),是劇毒的誘變劑,在整個(gè)誘變過程,包括配制藥品、操作處理、保存等都要嚴(yán)守安全,不能接觸皮膚,所有接觸過EMS的器皿,單獨(dú)用大量水沖洗洗滌,或用10NaS2O3溶液浸泡過夜,再用清水沖洗干凈。,EMS(甲基磺酸乙酯),(二)誘變育種應(yīng)考慮的因素P25,1、選擇合適的出發(fā)菌株,合適的出發(fā)菌株就是通過育種能有效地提高目標(biāo)產(chǎn)物產(chǎn)量的菌
14、株。,定義:出發(fā)菌株指用于誘變育種的最初菌株或每代誘變的試驗(yàn)菌株,也稱親株。,(1)選擇出發(fā)菌株的要求, 對(duì)菌株產(chǎn)量,形態(tài)、生理等情況了解; 生長繁殖快,營養(yǎng)要求低,產(chǎn)孢子多且早; 對(duì)誘變劑敏感; 菌株要有一定的生產(chǎn)能力; 多出發(fā)菌株:一般采用34個(gè)出發(fā)菌株,在逐代處理后,將產(chǎn)量高、特性好的菌株留作繼續(xù)誘變的出發(fā)菌株。,出發(fā)菌株及生理狀態(tài):真菌、酵母106個(gè)/ml,放線菌孢子106107個(gè)/ml,細(xì)菌108個(gè)/ml, 細(xì)菌選擇對(duì)數(shù)生長期,真菌和放線菌使用幼年孢子,芽孢細(xì)菌也可以用芽孢進(jìn)行誘變處理。 力求90%以上為單孢子,制菌懸液用生理鹽水或緩沖溶液。,(2)出發(fā)菌株的選擇,2、復(fù)合誘變劑的使
15、用 誘變劑復(fù)合處理的效果往往好于單獨(dú)處理。 復(fù)合處理有幾類: 一類是兩種或多種誘變劑的先后使用; 第二類是同一種誘變劑的重復(fù)使用; 第三類是兩種或多種誘變劑的同時(shí)使用。,劑量的大小常以致死率和誘變率來確定。 最適劑量是指能夠提高正突變株變異頻率幅度的誘變劑量。 處理劑量大,致死率高,誘變率也會(huì)提高,但達(dá)到一定程度后,再提高劑量反而會(huì)下降;但誘變劑量也不宜過低,否則很難獲得所需的正突變株。 致死率90%99.9%(過去) 70%80%(現(xiàn)在)。,3、誘變劑劑量的選擇,4、變異菌株的篩選 挑選菌株一般要從菌落形態(tài)變異類型著手,發(fā)現(xiàn)與產(chǎn)量相關(guān)的特征,并根據(jù)這些特征,進(jìn)行篩選、鑒定。一般要經(jīng)過初篩和復(fù)
16、篩兩個(gè)階段。 如:青霉素產(chǎn)生菌高產(chǎn)突變菌種的篩選,初篩:誘變后稀釋涂布平板培養(yǎng)挑單個(gè)菌落到斜面培養(yǎng)將斜面上的菌落逐個(gè)接種到搖瓶振蕩培養(yǎng)測抗生素效價(jià) 超過對(duì)照效價(jià)10%以上的菌種,進(jìn)行復(fù)篩。 復(fù)篩:過程與初篩基本相同,不同的是一般將斜面上的單個(gè)菌落接種到三個(gè)搖瓶中,得出平均效價(jià)。復(fù)篩可進(jìn)行13次。 由此篩選出的高產(chǎn)穩(wěn)定菌種還要經(jīng)過小型甚至中型試驗(yàn),才能用到發(fā)酵生產(chǎn)中。,(三)、誘變劑處理的方式,(1)直接處理:將菌懸液用誘變劑直接處理,然后分離。 (2)生長過程處理:適用于誘變作用強(qiáng)而致死率低的誘變劑,或只在分裂過程中對(duì)DNA起作用的誘變劑,如秋水仙素。這些誘變劑一般都直接加入到培養(yǎng)基中,混勻,
17、倒入平皿制成平板后培養(yǎng),在生長過程中誘發(fā)菌體突變。 (3)振蕩培養(yǎng)處理:即在搖瓶培養(yǎng)基中加入一定量的誘變劑。菌體隨著振蕩培養(yǎng),不斷地和誘變劑接觸,它們之間的作用遠(yuǎn)比平板生長過程處理充分得多,所以誘變劑濃度不宜過高。,(四)、誘變篩選流程 (致死率、突變率、正變率、高產(chǎn)率、投產(chǎn)率),出發(fā)菌種,斜面,或搖瓶培養(yǎng)24h,細(xì)菌懸液,稀釋涂平板,單孢子懸液,誘變處理,挑取單菌落200個(gè),搖瓶初篩50株,挑出高產(chǎn)斜面,留種保 藏菌種,傳種斜面,搖瓶復(fù)篩5株,挑出高產(chǎn)菌株,放大罐試驗(yàn),中試考查,大型投產(chǎn)試驗(yàn),誘變篩選過程 中的致死率、突變率、正變率、高產(chǎn)率、投產(chǎn)率,二、新誘變方法-航天育種,所謂航天育種是利用空間環(huán)境高真空、微重力和強(qiáng)輻射的特
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