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文檔簡介
1、1. SDS-PAGE檢測蛋白質(zhì)純度電泳的基本原理許多生物分子都帶有電荷,其電荷的多少取決于分子性質(zhì)及其所在介質(zhì)的pH及其組成。由于混合物中各組分所帶電荷性質(zhì)、電荷數(shù)量以及分子量的不同,在同一電場的作用下,各組分泳動(dòng)的方向和速度也各異,因此,在一定時(shí)間內(nèi),由于各組分移動(dòng)距離的不同,而達(dá)到分離鑒定各組分的目的。2.影響電泳的主要因素電泳介質(zhì)的pH當(dāng)介質(zhì)的pH等于某種兩性物質(zhì)的等電點(diǎn)時(shí),該物質(zhì)處于等電狀態(tài),即不向正極或負(fù)極移動(dòng)。當(dāng)介質(zhì)pH小于其等電點(diǎn)時(shí),則呈正離子狀態(tài),移向負(fù)極;反之,介質(zhì)pH大于其等電點(diǎn)時(shí),則呈負(fù)離子狀態(tài),移向正極。因此,任何一種兩性物質(zhì)的混合物電泳均受介質(zhì)pH的影響,即決定兩性
2、物質(zhì)的帶電狀態(tài)及其量,為了保持介質(zhì)pH的穩(wěn)定性,常用一定pH的緩沖液,如分離血清蛋白質(zhì)常用pH8.6的巴比妥或三羥甲基氨基甲烷(Tris)緩沖液。緩沖液的離子強(qiáng)度離子強(qiáng)度對(duì)電泳的影響是:離子強(qiáng)度低,電泳速度快,分離區(qū)帶不易清晰;離子強(qiáng)度高,電泳速度慢,但區(qū)帶分離清晰。如離子強(qiáng)度過低,緩沖液的緩沖量小,不易維持pH的恒定;離子強(qiáng)度過高,則降低蛋白質(zhì)的帶電量(壓縮雙電層)使電脈速度減慢。所以常用離子強(qiáng)度為0.02-0.2之間。電場強(qiáng)度電場強(qiáng)度和電泳速度成正比關(guān)系。電場強(qiáng)度以每厘米的電勢差計(jì)算,也稱電勢梯度。如紙電泳的濾紙長15cm,兩端電壓(電勢差)為150V,則電場強(qiáng)度為150/15=10V/c
3、m,電場強(qiáng)度愈高,則帶電粒子的移動(dòng)愈快。電壓增加,相應(yīng)電流也增大,電流過大時(shí)易產(chǎn)生熱效應(yīng)可使蛋白質(zhì)變性而不能分離。電滲作用在電場中,液體對(duì)固體的相對(duì)移動(dòng),稱為電滲。如濾紙中含有表面帶負(fù)電荷的短基,溶液則向負(fù)極移動(dòng)。由于電滲現(xiàn)象與電泳同時(shí)存在,所以電泳的粒子移動(dòng)距離也受電滲影響,如紙上電泳蛋白質(zhì)移動(dòng)的方向與電滲現(xiàn)象相反,則實(shí)際上蛋白質(zhì)泳動(dòng)的距離,等于電泳移動(dòng)距離減去電滲距離。如電泳方向和電滲方向一致,其蛋白質(zhì)移動(dòng)距離,等于二者相加。電滲現(xiàn)象所造成的移動(dòng)距離可用不帶電有色染料或有色葡聚糖點(diǎn)在支持物的中間,觀察電滲方向和距離。對(duì)支持物的選擇一般要求支持物均勻,吸附力小,否則電場強(qiáng)度不均勻,影響區(qū)帶的
4、分離,實(shí)驗(yàn)結(jié)果及掃描圖譜均無法重復(fù)。如紙電泳時(shí),濾紙厚薄不均勻或吸附力過大,則蛋白質(zhì)或其他膠體顆粒在它們泳動(dòng)過程中有一部分被濾紙吸附,造成分離區(qū)帶蛋白含量相對(duì)量降低。因此,電泳前應(yīng)事先處理濾紙,以減低濾紙的吸附能力,可取得較好的分離效果。若選用WhatwanNo.1號(hào)濾紙或國產(chǎn)新華濾紙,一般不需要進(jìn)行預(yù)處理。溫度對(duì)電泳的影響電泳過程中由于通電產(chǎn)生焦?fàn)枱?,熱?duì)電泳有很大的影響。溫度升高時(shí),介質(zhì)粘度下降,分子運(yùn)動(dòng)加劇,引起自由擴(kuò)散變快,遷移率增加。溫度每升高1度,遷移率約增加2.4%。為降低熱效應(yīng)對(duì)電泳的影響,可控制電壓或電流,也可在電泳系統(tǒng)中安裝冷卻散熱裝置。電泳的分類3.1按分離原理分類可分為
5、區(qū)帶電泳、移界電泳、等速電泳和聚焦電泳4種。1)區(qū)帶電泳電泳過程中,不同的離子成分在均一的緩沖液中分離成獨(dú)立的區(qū)帶,這是當(dāng)前應(yīng)用最廣泛的電泳技術(shù)。2)移界電泳是Tiselius最早建立的電泳,它是在U型管中進(jìn)行的,由于分離效果較差,已為其它電泳技術(shù)所取代。3)等速電泳需專用電泳儀,當(dāng)電泳達(dá)到平衡后,各區(qū)帶相隨分成清晰的界面,并以等速移動(dòng)。等電聚焦由于具不同等電點(diǎn)的兩性電解質(zhì)載體在電場中,自動(dòng)形成pH梯度,使分離物移動(dòng)至各自等電點(diǎn)的pH處聚集成很窄的區(qū)帶,且分辨率較高。從表面看與區(qū)帶電泳相似,但原理不同。3.2區(qū)帶電泳的分類1)按支持物物理性狀分類1. 濾紙及其他纖維素膜如乙酸纖維膜、玻璃纖維膜
6、、聚胺纖維膜電泳。2. 粉末電泳,如纖維素粉、淀粉、玻璃粉電泳。3. 凝膠電泳,如瓊脂糖、瓊脂、硅膠、淀粉膠、聚丙烯酰胺凝膠電泳。4. 絲線電泳,如尼龍絲、人造絲電泳。2) 按支持物的裝置形式不同分類1. 平板式電泳,支持物水平放置,是最常用的電泳方式。2. 垂直板式電泳。3. 連續(xù)流動(dòng)電泳,首先應(yīng)用于紙電泳,將濾紙垂直豎立,兩邊各放一電極,緩沖液和樣品自頂端下流,與電泳方向垂直??煞蛛x較大量的蛋白質(zhì)。以后有用淀粉、纖維素粉、玻璃粉等代替濾紙,分離效果更好。3) 按pH的連續(xù)性不同分類1. 連續(xù)pH電泳:電泳全部過程中緩沖液pH保持不變。如紙電泳、乙酸纖維膜電泳。不連續(xù)pH電泳:緩沖液與支持物
7、之間有不同的pH,如聚丙烯酰胺凝膠圓盤電泳、等電聚焦電泳、等速電泳等,能使分離物質(zhì)區(qū)帶更加清晰,并可作ng級(jí)微量物質(zhì)的分離。不連續(xù)電泳與連續(xù)電泳的主要區(qū)別在于前者有兩層不同孔徑的凝膠系統(tǒng);電極槽中及兩層凝膠中所用的緩沖液pH值不同;電泳過程中形成的電位梯度亦不均勻。而后者在這三個(gè)方面都是單一或是均勻的。幾種常見的電泳方法4.1聚丙烯酰胺凝膠電泳聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegelelectrophoresis)是以聚丙烯酰胺凝膠作為載體的一種區(qū)帶電泳,這種凝膠由丙烯酰胺(acrylamide,簡稱Acr)和交聯(lián)劑N,N-COIMH:8呻CWHOOKOilCBCHjinCHjC
8、h+CH|CMJ4Hkhch=Chs律IfcSU(Ry)CONHjcodtiCHj-CWCHtCH-CH,CTisHHOONH_CH.QiqOOWH,COHHCON%if-CH,-in-CH,-CK-ch:-inCOhHI?'CONHjCtlNHdDtlHchcwtciCHjchcklchCMtcjr(Jonht.I甲叉基(亞甲基)雙丙烯酰胺(N,N-methylene-bis-acrylamide,簡稱Bis)聚合而成。聚丙烯酰胺凝膠具有機(jī)械強(qiáng)度好,彈性大,透明,化學(xué)穩(wěn)定性高,無電滲作用,設(shè)備簡單,用樣量少(1-100四)和分辨率高等優(yōu)點(diǎn),并可通過控制單體濃度或單體與交聯(lián)劑的比例聚合
9、成孔徑大小不同的凝膠,可用于蛋白質(zhì)、核酸等物質(zhì)的分離、定性和定量分析。還可結(jié)合去垢劑十二烷基硫酸鈉(SDS),以測定蛋白質(zhì)亞基分子量。聚丙烯酰胺的聚合反應(yīng)及其結(jié)構(gòu)如下:圖APS引發(fā)TEMED催化Acr與Bis的聚合反應(yīng)Acr或Bis無論單獨(dú)存在或混合在一起都是穩(wěn)定的,一旦出現(xiàn)自由基團(tuán)時(shí),就會(huì)發(fā)生聚合反應(yīng)。自由基團(tuán)的引發(fā)有化學(xué)和光合兩種方法,化學(xué)法的引發(fā)劑是過硫酸胺(簡稱Aps),催化劑為四甲基乙二胺(簡稱TEMED);光化學(xué)法是在光線照射下,由光敏感物質(zhì)核黃素來引發(fā),催化劑也是TEMED。由于單體及交聯(lián)劑、引發(fā)劑和催化劑的濃度、比例、聚合條件等的不同,便可產(chǎn)生不同孔徑的凝膠。一般而言,凝膠濃度
10、愈大,交聯(lián)度愈大孔徑愈小。凝膠濃度的選擇與被分離物分子量及其性質(zhì)有關(guān),其大致選用范圍如下表:表:分子量范圍與凝膠濃度的關(guān)系分子量范圍適用的凝膠濃度(%)蛋白質(zhì)<104203014X104152015X1041X10510151X1055-10>5X1052-5核酸(RNA)<10415201041055-101052X10622.6根據(jù)凝膠形狀可分為盤狀電泳和板狀電泳。盤狀電泳是在直立的玻璃管內(nèi),利用不連續(xù)的緩沖液的pH值進(jìn)行電泳,同時(shí),由于樣品混合物被分開后形成的區(qū)帶非常窄,呈圓盤狀(discoidshape),故而得名。板狀電泳(垂直或水平)是將丙烯酰胺聚合成方形或長方形
11、平板狀,平板大小和厚度視實(shí)驗(yàn)需要而定。垂直平板電泳有如下優(yōu)點(diǎn):表面積大,易于冷卻,便于控制溫度;能在同一凝膠板上,相同操作條件下,同時(shí)點(diǎn)加多個(gè)樣品,便于相互比較;一個(gè)樣品在第一次電泳后,可將平板轉(zhuǎn)90度進(jìn)行第二次電泳即雙向電泳;便于用各種方法鑒定(如放射自顯影等)。其缺點(diǎn)是制備凝膠時(shí)操作較復(fù)雜,電壓較高,電泳時(shí)間較長。凝膠的機(jī)械性能,彈性、透明度和粘著度取決于凝膠總濃度。通常用T%表示總濃度,即100mL凝膠溶液中含有Acr及Bis的總克數(shù)。Acr和Bis的比例常用交聯(lián)度C%表示,即交聯(lián)劑Bis占單體Acr和Bis總量的百分?jǐn)?shù)。凝膠的孔徑主要受總濃度T%的控制。通常T%越大,平均孔徑越小,凝膠
12、的機(jī)械強(qiáng)度增加。實(shí)驗(yàn)表明,當(dāng)T%值固定時(shí),Bis濃度在5%時(shí)孔徑最小,高于或低于5%時(shí),孔徑卻相應(yīng)變大。為了在使用凝膠做實(shí)驗(yàn)時(shí)有較高的重現(xiàn)性,制備凝膠所用的Bis濃度,Bis和Acr的比例,催化劑的濃度,聚合反應(yīng)的溶液pH值,聚膠所需時(shí)間等,凡能影響泳動(dòng)率的因子都必須保持恒定。欲將蛋白質(zhì)或核酸類大分子混合物很好地分離,并在凝膠上形成明顯的區(qū)帶,選擇一定孔徑的凝膠是關(guān)鍵。文獻(xiàn)中常見的標(biāo)準(zhǔn)凝膠是指濃度為7.5%,凝膠孔徑平均為5nm。大多數(shù)生物體內(nèi)蛋白質(zhì)在此標(biāo)準(zhǔn)凝膠中電泳均能得到滿意結(jié)果。不連續(xù)凝膠電泳的支持體由樣品膠、分離膠和濃縮膠組成。樣品膠為最上層;中層為濃縮膠,一般Acr為2%-3%,緩沖
13、液為不同濃度的Tris-HCl、pH為6.7左右;分離膠為最下層,Acr為5%-10%,緩沖液常用Tris-HCl,pH為8.9。上下電泳槽盛有pH為8.3的Tris-甘氨酸緩沖液,上電泳槽接電源的負(fù)極,下電泳槽接正極。不連續(xù)凝膠電泳的分離原理如下:1. 樣品的濃縮效應(yīng)1)凝膠層的不連續(xù)性:濃縮膠與分離膠中所用原料總濃度和交聯(lián)度不同,孔徑大小就不同。前者孔徑大,后者孔徑小。帶電荷的蛋白質(zhì)離子在濃縮膠中泳動(dòng)時(shí),因受阻力小,泳動(dòng)速度快。當(dāng)泳動(dòng)到小孔徑的分離膠時(shí),遇到阻力大,移動(dòng)速度逐步減慢,使樣品濃縮成很窄的區(qū)帶。2)緩沖液離子成分的不連續(xù)性,最上層電極緩沖液中甘氨酸在pH8.3時(shí),可部分解離為N
14、H2CH2COO-。三層膠中的緩沖液都是Tris-HCl,HCl在各自pH條件下均被全部解離為Cl-,而在pH6.7時(shí)蛋白質(zhì)被解離帶負(fù)電(因大部分蛋白質(zhì)pl值為5.0左右,通電后,電極緩沖液中的甘氨酸進(jìn)入濃縮膠緩沖液,pH由8.3變?yōu)?.7),使甘氨酸解離度降低,負(fù)電荷減少,遷移率明顯下降(稱慢離子),相反Cl-處于解離狀態(tài),且顆粒和摩擦力最小,其遷移率最大(稱快離子),結(jié)果在濃縮膠中,離子遷移率為Cl->蛋白質(zhì)->甘氨酸-。由于Cl-的快速移動(dòng),使在Cl-后面膠層中的離子濃度驟然降低,形成一個(gè)低電導(dǎo)或稱高電位梯度(電位差)區(qū)域(電勢梯度£=電流強(qiáng)度I/電導(dǎo)率可),因?yàn)殡?/p>
15、泳速度取決于電位差和有效遷移率,所以在此區(qū)域中,使蛋白質(zhì)離子及甘氨酸離子加速向陽極移動(dòng)。當(dāng)快離子、慢離子和蛋白質(zhì)的遷移率與電位梯度的乘積彼此相等時(shí),則3種離子移動(dòng)速度相同。在快離子和慢離子的移動(dòng)速度相等的穩(wěn)定狀態(tài)建立之后,則在快離子和慢離子之間形成一個(gè)穩(wěn)定而又不斷向陽極移動(dòng)的界面。也就是說,在高電位梯度和低電位梯度之間形成一個(gè)迅速移動(dòng)的界面(見圖24)。由于蛋白質(zhì)離子的有效遷移率恰好介于快、慢離子之間,因此就聚集在這個(gè)移動(dòng)的界面附近,被濃縮成很窄的薄層。此濃縮效應(yīng)使蛋白質(zhì)濃縮了數(shù)百倍。在分離膠層中,因緩沖液pH為8.9,甘氨酸進(jìn)入此膠層后,其解離度大大增加,它的遷移率幾乎與Cl-接近。此外,分
16、離膠孔徑小,蛋白質(zhì)在泳動(dòng)時(shí),所受阻力較濃縮膠中大,移動(dòng)緩慢。由于這兩個(gè)原因,使甘氨酸離子在分離膠中有效遷移率超過蛋白質(zhì)離子,導(dǎo)致分離膠不具備濃縮膠效應(yīng),而只有分離效應(yīng)。分子篩效應(yīng)由于在凝膠電泳中,凝膠濃度不同,其網(wǎng)的孔徑大小也不同,可通過的蛋白質(zhì)分子量范圍也就不同。在分離膠中孔徑較小,分子量和構(gòu)型不同的蛋白質(zhì)分子,通過一定孔徑的凝膠時(shí)所受阻力不同,從而引起泳動(dòng)速度的變化,所以多種蛋白質(zhì)即使所帶電荷相同,遷移率相等,在聚丙烯酰胺中經(jīng)一定時(shí)間泳動(dòng)后,也能彼此分開。大分子受阻程度大,走在后面,小分子受阻小,走在前面。電荷效應(yīng)由于各種蛋白質(zhì)所帶電荷不同,有效遷移率也不同,它們?cè)跐饪s膠和分離膠交界處被濃
17、縮成狹窄區(qū)帶,仍以一定程序排列成各自的小圓盤狀,緊接在一起。當(dāng)它們進(jìn)入分離膠時(shí),由于電泳體系已處于一個(gè)均一的連續(xù)狀態(tài)中,故此時(shí)以電荷效應(yīng)為主,帶不同電荷的蛋白質(zhì)離子按其移動(dòng)速度大小順次分離。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)PAGE電泳是根據(jù)蛋白質(zhì)分子(或其它生物大分子)所帶電荷的差異及分子大小的不同所產(chǎn)生的不同遷移率而分離成若干條區(qū)帶。然而有時(shí)兩個(gè)分子量不同的蛋白質(zhì),由于其分子大小的差異、被它們所帶電荷的差別補(bǔ)償而以相同的速度向陽極移動(dòng),因而不能達(dá)到分離的目的。SDS-PAGE就是設(shè)法將電荷差異這一因素除去或減小到可以略而不計(jì)的程度。SDS是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵
18、、疏水鍵打開,并結(jié)合蛋白質(zhì)疏水部分,形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。在一定條件下,SDS與大多數(shù)蛋白質(zhì)的結(jié)合比為1.4gSDS/1g蛋白質(zhì)。由于SDS帶有負(fù)電荷,使各種SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物都帶上相同密度的負(fù)電荷,它的量大大超過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,因而掩蓋了不同蛋白質(zhì)分子原有的電荷差別。這樣的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物在凝膠電泳中的遷移率不再受蛋白質(zhì)原有的電荷和形狀的影響,而只與蛋白質(zhì)的分子量有關(guān)。4. 染色方法經(jīng)醋酸纖維薄膜、瓊脂(糖)、聚丙烯酰胺電泳分離的各種生物分子需用染色法使其在支持物相應(yīng)位置上顯示出譜帶,從而檢測其純度、含量及生物活性。蛋白質(zhì)、糖蛋白、脂蛋白、核酸及酶等均有不同的染色方法,現(xiàn)
19、分別介紹如下:5.1蛋白質(zhì)染色染色液種類繁多,各種染色液染色原理不同,靈敏度各異。使用時(shí)可根據(jù)需要加以選擇。常用的染色液有:1. 氨基黑10B氨基黑10B分子式為C22Hi3N6S3Na3,MW=715,入max=620-630nm,是酸性染料。其磺酸基與蛋白質(zhì)反應(yīng)構(gòu)成復(fù)合鹽,是最常用的蛋白質(zhì)染料之一,但對(duì)SDS-蛋白質(zhì)染色效果不好。另外,氨基黑10B染不同蛋白質(zhì)時(shí),著色度不等、色調(diào)不一(有藍(lán)、黑、棕等);作同一凝膠柱的掃描時(shí),誤差較大,需要對(duì)各種蛋白質(zhì)作出本身的蛋白質(zhì)-染料量(吸收值)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,更有利于定量測定。2. 考馬斯亮藍(lán)R250考馬斯亮藍(lán)R250的分子式為C14H44O7H3S2N
20、a,MW=824,入max=560-590nm。染色靈敏度比氨基黑高5倍。該染料是通過范德瓦爾鍵與蛋白質(zhì)結(jié)合,尤其適用于SDS電泳微量蛋白質(zhì)染色,但蛋白質(zhì)濃度超過一定范圍時(shí),對(duì)高濃度蛋白質(zhì)染色不合乎Beer定律,作定量分析時(shí)要注意這點(diǎn)。3. 考馬斯亮藍(lán)G250考馬斯亮藍(lán)G250比R250多二個(gè)甲基。MW=854,Amax=590-610nm。染色靈敏度不如R250,但比氨基黑高3倍。其優(yōu)點(diǎn)是在三氯乙酸中不溶而成膠體,能選擇地使蛋白質(zhì)染色而幾乎無本底色,所以常用于需要重復(fù)性好和穩(wěn)定的染色,適于作定量分析。4. 固綠固綠分子式為C37H31N2O10S3Na2,MW=808,入max=625nm,
21、酸性染料。染色靈敏度不如考馬斯亮藍(lán),近似于氨基黑,但卻可克服考馬斯亮藍(lán)在脫色時(shí)易溶解出來的缺點(diǎn)。熒光染料略5. 銀染色法此法較考馬斯亮藍(lán)靈敏100倍。但染色機(jī)制尚不清楚,可能與攝影過程中Ag+的還原相似。5.2 廣譜染料(stains-all)染色法糖蛋白染色1. 過碘酸-Schiff試劑5.3 阿爾山藍(lán)染色脂蛋白染色1. 油紅O染色2. 蘇丹黑B實(shí)驗(yàn)一SDS-PAGE凝膠電泳法測定蛋白質(zhì)的純度目的要求學(xué)習(xí)SDS-PAGE測定蛋白質(zhì)純度的原理和方法;掌握SDS-PAGE的其他應(yīng)用原理SDS-PAGE是PAGE的一種特殊形式,有關(guān)理論如上所述。SDS是帶負(fù)電荷的陰離子去污劑。用SDS-PAGE測
22、定蛋白質(zhì)分子量時(shí),蛋白質(zhì)需經(jīng)樣品溶解液處理。在樣品溶解液中含有疏基乙醇及SDS,各種蛋白質(zhì)樣品在疏基乙醇作用下還原成單鏈,再進(jìn)一步與SDS結(jié)合形成帶大量負(fù)電荷的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。因此各種蛋白質(zhì)分子在SDSPAGE中,只能按其分子量大小而分離。SDSPAGE有連續(xù)體系及不連續(xù)體系兩種,這兩種體系有各自的樣品溶解液及緩沖液,但加樣方式,電泳過程及固定、染色與脫色方法完全相同。操作步驟一、安裝夾心式垂直板電泳槽1. 裝上貯槽和固定螺絲釘,仰放在桌面上。2. 將長、短玻璃板分別插到硅橡膠框的凹形槽中,注意勿用手接觸灌膠面的玻璃。3 .將已插好玻璃板的凝膠模平放在上貯槽上,短玻璃板應(yīng)面對(duì)上貯槽。4
23、.將下貯槽的銷孔對(duì)準(zhǔn)以裝好螺絲釘?shù)纳腺A槽,雙手以對(duì)角線的方式旋緊螺絲帽。.豎直電泳槽,在長玻璃板下端與硅膠??蚪唤绲目p隙內(nèi)加入已融化的1%瓊脂,以封住空隙,加瓊脂溶液時(shí),應(yīng)防止氣泡進(jìn)入。二、配膠及凝膠板的制備1.配膠根據(jù)所測蛋白質(zhì)分子量范圍,選擇適宜的分離膠濃度。由于SDS-PAGE有連續(xù)系統(tǒng)及不連續(xù)系統(tǒng)兩種,兩者間有不同的緩沖系統(tǒng),因而有不同的配制方法,見表1、2。表1SDS-不連續(xù)體系凝膠配制試劑名稱20mL分離膠所需試劑用量(mL)濃縮膠試劑用量5%7.5%10%15%5%分離膠貯液30%Acr-0.8%Bis3.335.006.6610.000.65ml分離膠緩沖液pH8.9Tris-
24、HCl2.502.502.502.50一濃縮膠貯液10%Acr-0.5%Bis一一一一一濃縮膠緩沖液pH6.7Tris-HCl一一一一1.00ml10%SDS0.200.200.200.200.08ml1%TEMED2.002.002.002.00TEMED原液5uL雙蒸水11.8710.28.545.2050%甘油2.3mL10%APS0.100.100.100.100.06mL電極緩沖液為pH8.3Tris-甘氨酸緩沖液,內(nèi)含0.1%SDS。表2略2. 凝膠板的制備(1) SDS-不連續(xù)體系凝膠板的制備分離膠的制備:按表1配制20mL7.5%聚丙烯酰胺,混勻后用細(xì)長頭滴管將凝膠液加至長、短
25、玻璃板間的縫隙內(nèi),約8cm高,用1mL移液器取少許水飽和正丁醇,沿長玻璃板板壁緩慢注入,約3-4mm高,以隔離空氣。約30min后,凝膠與水飽和正丁醇層間出現(xiàn)折射率不同的界線,則表示凝膠完全聚合。傾去水飽和正丁醇,再用濾紙條吸去多余水分。濃縮膠的制備:按表1濃縮膠配制方法配制4mL5%聚丙烯酰胺,混勻后用細(xì)長頭滴管將濃縮膠加到已聚合的分離膠上方,直至距離短玻璃板上緣約0.5cm處,輕輕將樣品槽模板插入濃縮膠內(nèi),約30min后凝膠聚合。小心拔去樣品槽模板,用窄條濾紙吸去樣品凹槽中多余的水分,將pH8.3Tris-甘氨酸緩沖液倒入上、下貯槽中,應(yīng)沒過短板約0.5cm以上,即可準(zhǔn)備加樣。三、樣品的處
26、理與加樣1.樣品的處理根據(jù)分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白試劑盒的要求加樣品溶解液;自己配制標(biāo)準(zhǔn)及未知樣品,按0.5-1mg/mL加樣品溶解液,溶解后,將其轉(zhuǎn)移到帶塞小離心管中,輕輕蓋上蓋子(不要塞緊,以免加熱時(shí)迸出),在100C沸水浴中保溫3min,取出冷卻后加樣。如處理好的樣品暫時(shí)不用,可放在-20C冰箱保存較長時(shí)間,使用前在10OC沸水中加熱3min,以除去亞穩(wěn)態(tài)聚合。2.加樣一般每個(gè)凹形樣品槽內(nèi),只加一種樣品或已知分子量的混合標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì),加樣體積要根據(jù)凝膠厚度及樣品濃度靈活掌握,一般加樣體積為1015此(即2-10四蛋白)。如樣品較稀,加樣體積可達(dá)100此。如樣品槽中有氣泡,可用注射器針頭排除。加樣時(shí),
27、將微量注射器的針頭通過電極緩沖液伸入加樣槽內(nèi),盡量接近底部,輕輕推動(dòng)微量注射器,注意針頭勿碰破凹形槽膠面。由于樣品溶解液中含有比重較大的蔗糖或甘油,因此樣品溶液會(huì)自動(dòng)沉降在凝膠表面形成樣品層。四、電泳不連續(xù)系統(tǒng):在電極槽中倒入pH8.3Tris-甘氨酸電極緩沖液,內(nèi)含0.1%SDS即可進(jìn)行電泳。電泳條件:開始時(shí)電流為10mA左右,待樣品進(jìn)入分離膠后,改為20-30mA,當(dāng)染料前沿距硅橡膠框底邊1.5cm時(shí),停止電泳,關(guān)閉電源。五、凝膠板剝離與固定電泳結(jié)束后,取下凝膠模,卸下硅橡膠框,用不銹鋼藥鏟或鑲子撬開短玻璃板,在凝膠板切下一角作為加樣標(biāo)志。將凝膠板放在大培養(yǎng)皿內(nèi)。六、染色與脫色將染色液倒入
28、培養(yǎng)皿中,染色1h左右,用蒸儲(chǔ)水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色,直到蛋白質(zhì)區(qū)帶清晰,即可計(jì)算相對(duì)遷移率。七、繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線將大培養(yǎng)皿放在一張坐標(biāo)紙上,量出加樣端距細(xì)銅絲間的距離(cm)以及各蛋白質(zhì)樣品區(qū)帶中心與加樣端的距離(cm)。按下式計(jì)算相對(duì)遷移率mR:相對(duì)遷移率mr=蛋白樣品距加樣端距離/漠酚藍(lán)區(qū)帶中心距加樣端距離以標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的相對(duì)遷移率為橫坐標(biāo),標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)分子量為縱坐標(biāo)在半對(duì)數(shù)坐標(biāo)紙上作圖,可得到一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。根據(jù)未知蛋白質(zhì)樣品相對(duì)遷移率可直接在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出其分子量。注意事項(xiàng)1.SDS純度2.SDS與蛋白的結(jié)合量3.凝膠濃度:應(yīng)根據(jù)未知樣品的估計(jì)分子量,選擇凝膠濃度。分子量在25000200
29、000的蛋白質(zhì)選用終濃度為5%的凝膠;分子量在1000070000的蛋白質(zhì)選用終濃度為10%的凝膠;分子量在1000050000的蛋白質(zhì)選用終濃度為15%的凝膠,在此范圍內(nèi)樣品分子量的對(duì)數(shù)與遷移率呈直線關(guān)系。以上各種凝膠濃度其交聯(lián)度都應(yīng)是2.6%。標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的相對(duì)遷移率最好在0.2-0.8之間均勻分布。用此法測定的分子量只是它們的亞基或單條肽鍵的分子量,而不是完整的分子量。為測得精確的分子量范圍,最好用其他測定蛋白分子量的方法加以校正。此法對(duì)球蛋白及纖維狀蛋白的分子量測定較好,對(duì)糖蛋白,膠原蛋白等分子量測定差異較大。對(duì)樣品的要求:應(yīng)采用低離子強(qiáng)度的樣品。如樣品中離子強(qiáng)度高,則應(yīng)透析或經(jīng)離子交換除鹽。加樣時(shí),應(yīng)保持凹形加樣槽膠面平直。加樣量以1015此為宜,如樣品系較稀的液體,為保證區(qū)帶清晰,加樣量可增加,同時(shí)應(yīng)將樣品溶解液濃度提高二倍或更高。5.由于凝膠中含SDS,直接制備干板會(huì)產(chǎn)生龜裂現(xiàn)象。試劑1.標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)目前國內(nèi)外均有廠商生產(chǎn)低分子量及高分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)成套試劑盒,用于SDSPAGE測定未知蛋白質(zhì)分子量。2.不連續(xù)體系SDSPAGE有關(guān)試劑10%SDS溶液:稱5gSDS,加雙蒸水至50mL,微熱使其溶解,置試劑瓶中,4C貯存。用前微熱,使SDS完全溶解
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