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文檔簡介
1、第二十二章基因表達調(diào)控 概 述一、基因(gene)(一)概念 基因 是核酸分子中貯存遺傳信息的遺傳單位,是指貯存有功能的蛋白質多肽鏈或RNA序列信息及表達這些信息所必需的全部核苷酸序列.(二)分類 基因可以分為結構基因和調(diào)節(jié)基因。結構基因(structural gene) 指能轉錄成為mRNA、rRNA或tRNA的DNA順序。二、基因表達(gene expression)(里外)(一)概念 基因產(chǎn)生功能的過程,稱基因表達,也稱編碼(code)。 DNA RNA protein基因表達的過程是信息分子(DNA或RNA)轉變成功能分子(protein)的過程。這一過程在體內(nèi)受到精密的調(diào)控,以保證功
2、能的有序性。這一調(diào)控稱為基因表達的調(diào)控,簡稱基因調(diào)控。mRNAtRNArRNAtranscriptiontranslationreplicationreverse transcription三、基因表達調(diào)控的要點(了解)原核生物真核生物無真核結構的單細胞生物。包括細菌、藍綠藻等。其DNA、protein、組成1個相當致密的類核,但無核膜與胞質分開。因為無核膜,基因受環(huán)境影響大。單或多細胞生物,有核膜將染色體等有關物質包圍在內(nèi)與胞質分開,細胞有有絲分裂和減數(shù)分裂2種形式,具有這些特征的生物稱真核生物。其細胞稱為真核細胞。(一)調(diào)控的細胞學基礎(二)調(diào)控最大特點 調(diào)控直接受環(huán)境及營養(yǎng)狀況的影響。調(diào)
3、控是為了適應環(huán)境獲取營養(yǎng)達到生存即分裂繁殖的最優(yōu)化(原核既無充足的能源貯備,又無高等植物制造有機物的本領)。所以調(diào)控體現(xiàn)1個“快”字,快速適應環(huán)境,獲取營養(yǎng),合成必需蛋白質、降解不必要成分。這是長期進化,獲得的適應應變能力。激素水平和發(fā)育階段是基因表達調(diào)控的最主要手段。遺傳程序調(diào)控、按“既定方針辦”如動物1個受精卵,按遺傳程序開開關關基因,發(fā)育成成熟個體,該遺傳程序是構成胚胎發(fā)育和組織分化的基礎。僅極少基因間接或直接受環(huán)境因素的影響。這一特點使真核在千變?nèi)f化的環(huán)境下,主要組織或器官仍能維持正常功能。(三)調(diào)控主要水平 真原核調(diào)控的主要水平(主調(diào))都在轉錄水平。因為:1.任何連鎖反應控制第一步是
4、最經(jīng)濟和最有效的(既不需要,何必轉錄)。2.RNA pol 沒有糾錯功能(DNA pol 有)微調(diào) DNA水平 轉錄后水平 原核調(diào)控余步不大,因其轉錄翻譯同一個compt進行。 翻譯水平 是原核次要調(diào)控水平。 翻譯后水平(四)調(diào)控的基本方式 真原核調(diào)控的基本方式都是通過調(diào)控因子:1.蛋白質(主)2.核酸 和 3.小分子化合物之間的識別和相互作用對基因表達實現(xiàn)正控制或負控制(也稱正調(diào)控和負調(diào)控)。 (五)調(diào)控物質的化學本質 蛋白質、核酸、小分子化合物。(六)調(diào)控模式 原核有操縱子調(diào)控模型,已發(fā)現(xiàn)100多種。真核有Britten-Davidsen(法)模型尚未為實驗所證實。 病毒基因表達調(diào)控 各種
5、病毒、噬菌體等除部分帶有RNA pol或逆轉錄酶外主要是利用宿主的基因表達調(diào)控系統(tǒng)。原核病毒適應原核生物遺傳策略,真核病毒適應真核生物遺傳策略。(七)基因表達的時間性和空間性 (1)時間特異性:按功能需要,某一特定基因表達嚴格按特定的時間順序發(fā)生。多細胞生物基因表達的時間特異性又稱階段特異性。 (2)空間特異性:在個體生過程中,某種基因產(chǎn)物在個體按不同組織空間順序出現(xiàn),這實際是由細胞在器官的分布決定的,因此又稱細胞特異性或組織特異性。(八)基因表達的方式 (1)組成性的基因表達:細胞對不同蛋白質的需要是不一樣的,一些基因產(chǎn)物對生命全過程都是必需的,這類基因的表達水平在所有細胞或組織中幾乎是不變
6、的,如三羧酸循環(huán)這個中心代謝途徑的酶類,它們的基因表達就屬于這一類,這類基因稱為管家基因(house keeping gene)。這類穩(wěn)定的幾乎不用調(diào)節(jié)的表達方式稱為組成性的基因表達或基本性的表達(constitute expression)。 (2)誘導和阻遏表達:某些基因表達產(chǎn)物數(shù)量隨著外界環(huán)境信號變化而變化,這類基因稱為調(diào)節(jié)基因。有些基因對環(huán)境信號應答時被激活,基因表達增加的過程稱為誘導(indution),被誘導才表達的基因稱為可誘導基因(inducible genes),反過來有些基因對環(huán)境信號應答時被抑制,基因表達產(chǎn)物水平降低,這種基因表達方式稱為阻遏,這類基因稱作可阻遏基因。例如
7、,當色氨酸供給豐富的情況下,細菌中有關色氨酸合成酶的基因表達就會受到阻遏。 原核生物基因表達的調(diào)控 從調(diào)控方式來看,原核生物調(diào)控最重要的特點是操縱子模式。 從調(diào)控水平來看,主調(diào)在轉錄水平,翻譯水平次之。如果每個基因等同翻譯,每一個多肽應有相同的拷貝數(shù)。結論是否定的,基因的表達是被控制的。有些蛋白質的數(shù)目相當固定,另一些則變化很大。一種是組成性、固定的:50種核糖體蛋白數(shù)量十分穩(wěn)定。糖酵解體系的酶數(shù)目也極恒定。DNA聚合酶、RNA聚合酶等代謝過程中十分必需的酶或蛋白質(組成型合成蛋白)的合成速率不受環(huán)境變化或代謝狀態(tài)的影響。而另一種類型則被稱為適應型或調(diào)節(jié)型(adaptive or regula
8、ted),這類蛋白質的合成速率明顯地受環(huán)境的影響而改變。例如,一般情況下,一個大腸桿菌細胞中只有15個分子的-半乳糖苷酶,但若將細胞培養(yǎng)在只含乳糖的培養(yǎng)基中,每個細胞中這個酶的量可高達幾萬個分子。其他參與糖代謝的酶,氨基酸、核苷酸合成系統(tǒng)的酶類,其合成速度和總量都隨培養(yǎng)條件的變化而改變。一、 原核基因表達調(diào)控總論細菌中的基本調(diào)控機制有如下規(guī)律:一個體系在需要時被打開,不需要時被關閉。這種“開-關”(on-off)活性是通過調(diào)節(jié)轉錄來建立的,即通過調(diào)節(jié)mRNA的合成來實現(xiàn)的。一個系統(tǒng)處于“off”狀態(tài)時可能是本底水平的基因表達,常常是每世代每個細胞合成12個mRNA分子和極少量的蛋白質分子。必須
9、明白所謂“關”實際的意思是基因表達量特別低,或者無法檢測。原核基因表達調(diào)控的基本類型: 1、轉錄水平的調(diào)控 起始階段-主要 延伸階段-通常不受調(diào)控 終止階段-可能受到調(diào)控2、翻譯水平的調(diào)控 主要發(fā)生在起始和終止階段二、操縱子(operon) 1961年 Jacob and Monod -乳糖操縱子模型 細菌轉錄調(diào)控的最初概念(一) 概念: 在原核生物中,若干結構基因可串聯(lián)在一起,其表達受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子。lacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacI(二)類型與結構 不同的操縱子結構區(qū)(結構基因串)不同,調(diào)控區(qū)(P-O)也不一樣,因而調(diào)控的方式也不
10、完全相同,據(jù)操縱子對于能調(diào)節(jié)它們表達的小分子應答的性質可將操縱子分為二大類。(1)可誘導的操縱子(inciduble operon)加入調(diào)節(jié)小分子開啟基因轉錄活性,這種作用及其過程稱誘導(induction)產(chǎn)生誘導作用的小分子稱誘導物(inducer)。誘導物一般為操縱子編碼的酶蛋白分解的底物。如:乳糖操縱子(乳糖)。(2)可阻遇的操縱子(repressible operon)加入調(diào)節(jié)小分子,關閉基因轉錄活性這種作用及過程稱阻遏(repression),產(chǎn)生阻遏的小分子物質稱輔阻遏物(corepressor)。輔阻遏物一般為操縱子編碼的酶合成的物質(產(chǎn)物)如:色氨酸操縱子(色氨酸)。(三)操
11、縱子(operon)的基本組成結構基因、調(diào)節(jié)基因、操縱元件(操縱基因)、啟動子、終止子lacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacIlacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacI三、乳糖操縱子(一)組成:5種元件由1個調(diào)節(jié)基因,3個結構基因、操縱基因(控制元件)、啟動子和終止子組成。1、結構基因(1)lacZ:編碼b 半乳糖苷酶 (使乳糖水解)(2)lacY:編碼b 半乳糖苷透過酶 (使b 半乳糖苷透過細胞壁、質膜進入細胞內(nèi))(3)lacA:編碼b 半乳糖苷乙酰轉移酶 (將乙?;D移到b 半乳糖苷上)2、啟動子: Plac:控制 lacZ, lacY, lacA;多順反
12、子的mRNA3、終止子4、調(diào)節(jié)基因lacI:編碼阻遏蛋白(repressive protein)亞基 四聚體存在時具有活性,與 Olac具有 很強的親和力lacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacI5、控制元件 操縱基因Olac (1)28bp的回文結構,可形成十字形結構 (2)這種結構正好與由四個相同亞基組成的阻遏 蛋白相匹配。lacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacIPlac / RNA polymeraseOlac / repressor-50-30-1010130-20-4020mRNAstartpoint(二)乳糖操縱子的負調(diào)控培養(yǎng)基不含乳糖 lacZ、
13、 lacY 、 lacA低表達(二)乳糖操縱子的負調(diào)控1、阻遏蛋白與操縱基因結合2、阻礙了RNA聚合酶與啟動子Plac的結合 3、轉錄不能進行4、lacZ, lacY 、lacA低表達lacZlacYlacAPlacIPlacOlaclacImRNA Inducer(異構乳糖)lactose分解lactose(三)乳糖操縱子與負控誘導系統(tǒng)培養(yǎng)基含乳糖 -lacZ 等高表達(三)乳糖操縱子與負控誘導系統(tǒng)1、阻遏蛋白與異構乳糖結合2、阻遏蛋白構象變化,不能與操縱子序列結合3、RNA聚合酶與lac啟動子結合4、lacZ, lacY , lacA的轉錄可順利進行本底水平的組成性表達無誘導物存在時仍有少
14、量lac mRNA合成五、色氨酸操縱子(了解)調(diào)節(jié)基因(一)組成1、結構基因(1)基因E、D、C、B、A(2)編碼色氨酸合成所需要酶類 (3)頭尾相接串連排列組成結構基因群(4)組成一個轉錄單元(5)多順反子mRNA2、調(diào)節(jié)基因trpR(1)位置:遠離P-結構基因群(2)編碼調(diào)控蛋白R(3)R沒有與操縱元件結合的活性(4)當環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結合后構象變化而活化(5)R與特異性結合,抑制結構基因的轉錄3、操縱元件(1)18bp的回文結構(2)與色氨酸啟動子Ptrp序列在21 and +3 堿基之間重疊(3)與Trp-R特異性結合,阻遏結構基因的轉錄現(xiàn)象:培養(yǎng)基中Trp 濃
15、度較低時- 基因E、D、C、B、A高表達 Trp 濃度較高時- 基因E、D、C、B、A低表達(二)色氨酸操縱子與轉錄調(diào)控Trp操縱元與負控阻遏系統(tǒng)1、Trp操縱子與負控阻遏系統(tǒng)(一)(1)培養(yǎng)基中Trp 濃度較低(2)調(diào)控蛋白R不能被活化(3)未活化的調(diào)控蛋白R不能與操縱元件結合(4)基因E、D、C、B、A高表達Trp操縱元與負控阻遏系統(tǒng)Trp2、Trp操縱子與負控阻遏系統(tǒng)(二)(1)培養(yǎng)基中Trp 濃度較高(2)調(diào)控蛋白R與Trp結合(3)Trp-R復合物與操縱子結合(4)基因E、D、C、B、A低表達(三)色氨酸操縱元總結1、通常是開放轉錄的,有效應物(色氨酸為阻遏物)作用時則阻遏關閉轉錄。
16、2、負性調(diào)控的、可阻遏的操縱子3、色氨酸可以作為共阻抑物起作用,并通過終產(chǎn)物抑制自身的合成(負反饋調(diào)節(jié))。4、細菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱子都屬于這種類型,其調(diào)控可使細菌處在生存繁殖最經(jīng)濟最節(jié)省的狀態(tài)。實驗觀察表明: 當色氨酸達到一定濃度、但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負相關。這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱子特殊的結構-衰減子有關。一、特點 1、多層次 2、無操縱子和衰減子 3、個體發(fā)育復雜 4、受環(huán)境影響較小激素水平和發(fā)育階段是基因表達調(diào)控的最主要手段, 其調(diào)控最大特點是遺傳程序調(diào)控。 真核生物基因表達的調(diào)控二、真核生物
17、基因表達調(diào)控的層次:1、DNA水平調(diào)節(jié)2、 轉錄水平調(diào)節(jié)3、轉錄后水平的調(diào)節(jié)4、翻譯水平調(diào)節(jié)5、翻譯后加工的調(diào)節(jié)DNA轉錄初產(chǎn)物RNAmRNA蛋白質前體mRNA降解物活性蛋白質DNA水平調(diào)節(jié)轉錄水平調(diào)節(jié)轉錄后水平的調(diào)節(jié)翻譯調(diào)節(jié)mRNA降解的調(diào)節(jié)翻譯后加工的調(diào)節(jié)核細胞質調(diào)控主要水平是轉錄水平。其次為轉錄后水平、DNA水平、翻譯及翻譯后水平等。第二十三章重組DNA技術 一、重組DNA( 基因克隆、分子克?。?通過體外重組技術,將一段目的DNA經(jīng)切割、連接插入適當載體,并導入受體細胞,擴增形成大量子代分子的過程?;蚩寺〉暮诵?體外重組(Recombination) 人工將一段目的DNA插入一個載體的過程。載體DNA(vector)目的DNA(target fragment)重組DNA(recombinant DNA )宿主(host)篩選、擴增克?。╟lone)二、DNA克隆的路線DNA 重組轉化重組DNA操作一般步驟:(1)獲得目的基因;(2)與克隆載體連接,形成新的重組DNA分子;(3)用重組DNA分子轉化受體細胞,并能在受體細胞中復制和遺傳;(4)對轉化子篩選和鑒定;(5)對獲得外源基因的細胞或生物體通過培養(yǎng),獲得所需的遺
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