ncbi站點(diǎn)的一般介紹

NCBI站點(diǎn)的一般介紹及其它資源庫(kù)的介紹GenBankOverview生物信息學(xué)站點(diǎn)地圖其它資源庫(kù)的介紹國(guó)際核苷苷酸序列列數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)合作組組織GenBank由位于于馬里蘭蘭州Bethesda的美國(guó)國(guó)國(guó)立衛(wèi)衛(wèi)生研究究院下屬屬國(guó)立生生物技術(shù)術(shù)信息中中心建立立，與日日本DNA數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)（DNADataBankofJapan,DDBJ）以及及歐洲生生物信息息研究所所的歐洲洲分子生生物學(xué)實(shí)實(shí)驗(yàn)室核核苷酸數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)（（EuropeanMolecularBiologyLaboratory,,EMBL））一起起，都是是國(guó)際核核苷酸序序列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)合作作的成員員。GenBank，DDBJ，，andEMBL,,所有這這3個(gè)中中心都可可以獨(dú)立立地接受受數(shù)據(jù)提提交，而而3個(gè)中中心之間間則逐日日交換信信息，并并制成相相同的充充分詳細(xì)細(xì)的數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)向公公眾開放放。因此此他們是是相等的的。什么是GenBank？GenBank是美國(guó)國(guó)國(guó)立衛(wèi)衛(wèi)生研究究院維護(hù)護(hù)的基因因序列數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)，，匯集并并注釋了了所有公公開的核核酸序列列。GenBank屬屬于一個(gè)個(gè)序列數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)的的國(guó)際合合作組織織，包括括EMBL和DDBJ。每個(gè)記錄錄代表了了一個(gè)單單獨(dú)的、、連續(xù)的的、帶有有注釋的的DNA或RNA片段段。這些文件件按類別別分為幾幾組：有有些按照照系統(tǒng)發(fā)發(fā)生學(xué)劃劃分，另另外一些些則按照照生成DNA序序列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)的直直接提交交。這些些作者將將序列數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)作作為論文文的一部部分來發(fā)發(fā)表，或或?qū)?shù)據(jù)據(jù)庫(kù)直接接公開。。GenBankGenBank是一個(gè)有有13億億堿基，，來自于于100,000多種種生物的的核苷酸酸序列的的數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)。每條條紀(jì)錄都都有編碼碼區(qū)（CDS））特征的的注釋，，還包括括氨基酸酸的翻譯譯。遺傳密碼碼-15個(gè)遺傳傳密碼的的概要。。用來確確保GenBank中中紀(jì)錄的的編碼序序列被正正確的翻翻譯。訪問GenBank通過EntrezNucleotides來查詢。。用accessionnumber，作作者姓名名，物種種，基因因/蛋白白名字，，還有許許多其他他的文本本術(shù)語來來查詢。。關(guān)于Entrez更多多的信息息請(qǐng)看下下文。用BLAST來來在GenBank和和其他數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)中中進(jìn)行序序列相似似搜索。。用E-mail來訪問問Entrez和BLAST可以通通過Query和BLAST服務(wù)器器。另外外一種選選擇是可可以用FTP下下載整個(gè)個(gè)的GenBank和和更新數(shù)數(shù)據(jù)。紀(jì)錄樣本本每個(gè)記錄錄代表了了一個(gè)單單獨(dú)的、、連續(xù)的的、帶有有注釋的的DNA或RNA片段段。這些文件件按類別別分為幾幾組：有有些按照照系統(tǒng)發(fā)發(fā)生學(xué)劃劃分，另另外一些些則按照照生成DNA序序列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)的直直接提交交。這些些作者將將序列數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)作作為論文文的一部部分來發(fā)發(fā)表，或或?qū)?shù)據(jù)據(jù)庫(kù)直接接公開。。關(guān)于GenBank的的各個(gè)字字段的詳詳細(xì)描述述，以及及同Entrez搜索索字段的的交叉索索引。DDBJ/EMBJ//GenBank特性性表（（見講義義或網(wǎng)絡(luò)絡(luò)課件））特性表格格式和標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)被合合作數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)用在在序列記記錄的注注釋上，，使得數(shù)數(shù)據(jù)共享享成為可可能，包包括詳細(xì)細(xì)的描述述生物特特性和特特性限定定語的附附錄，以以及IUPAC規(guī)定的的核苷酸酸和氨基基酸的代代號(hào)。數(shù)據(jù)紀(jì)錄錄的格式式和搜索索方式可可能會(huì)不不一樣，，但是accessionnumber，序列列數(shù)據(jù)和和注解都都是一模模一樣的的。即，，你可以以用accessionnumberU12345在GenBank，，DDBJ或EMBL中查找找相應(yīng)紀(jì)紀(jì)錄，得得到的結(jié)結(jié)果是完完全一樣樣的序列列數(shù)據(jù)，，參考內(nèi)內(nèi)容等等等。GenBank普通文文件格式式參見GenBank記記錄樣本本和在GenBank公布通通知中的的詳細(xì)描描述，下下載大多多數(shù)最近近的完全全公告和和日常積積累或非非積累更更新數(shù)據(jù)據(jù)。ASN..1格式式—摘摘要句句法記號(hào)號(hào)1，國(guó)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)準(zhǔn)組織（（ISO）數(shù)據(jù)據(jù)表示格格式，下下載大多多數(shù)最近近的完全全公告和和日常積積累或非非積累更更新數(shù)據(jù)據(jù)。分子數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)概覽覽核酸序列列Entrez核核酸——用accessionnumber,作者者姓名，，物種，，基因//蛋白名名字，以以及很多多其它的的文本術(shù)術(shù)語來搜搜索核酸酸序列記記錄（在在GenBank++PDB中）。更更多的關(guān)關(guān)于Entrez的信信息見下下。如果果要檢索索大量數(shù)數(shù)據(jù)，也也可使用用BatchEntrez（批量量Entrez）。

Entrez基基因組提供了一一個(gè)編碼碼區(qū)的概概要和各各種物種種的分類類表（TaxTable）。。編碼區(qū)概概要列出出了在基基因組中中所有的的的蛋白白，并提提供鏈接接到FASTA文件和和BLAST。。分類表總總結(jié)了蛋蛋白BLAST分析的的結(jié)果，，建議他他們的可可能功能能，并用用顏色編編碼的圖圖來顯示示物種同同其它物物種之間間的關(guān)系系。BLAST將你的序序列同核核酸庫(kù)中中的的序序列比較較，檢索索相似的的序列。。（更詳詳細(xì)的信信息見下下面Tools/Sequence相似搜搜索部分分）BLAST查找BLAST指南BLAST程序?qū)?shù)數(shù)據(jù)庫(kù)搜搜索進(jìn)行行大量的的改良，，提高了了搜索速速度，同同時(shí)把數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)搜搜索建立立在了嚴(yán)嚴(yán)格的統(tǒng)統(tǒng)計(jì)學(xué)基基礎(chǔ)上。。局部比對(duì)對(duì)的限制制條件不不包括空空位。這這個(gè)限制制條件對(duì)對(duì)應(yīng)用Karlin—Altschul統(tǒng)計(jì)學(xué)極極為有利利，另一一方面，，既然空空位沒有有明確地地放在模模型中，，結(jié)果就就不會(huì)像像人們期期望的那那樣接近近于期望望的比對(duì)對(duì)。這并并不是說說插入確確實(shí)會(huì)妨妨礙匹配配，在大大多數(shù)情情況下，，比對(duì)僅僅僅會(huì)被被分解為為若干個(gè)個(gè)明顯的的HSPs。無論如如何，老老版本的的BLAST程序（1.4以前）的的局限性性在新版版本中已已經(jīng)被取取消了，，新版本本在對(duì)待待空位問問題上有有著明確確的作法法。BLAST程序的修修訂版最近發(fā)布布的BLAST程序的修修訂版提提高了搜搜索速度度，敏感感度和實(shí)實(shí)用性。。這個(gè)完全全重新寫寫過的軟軟件包指指定為2.0版本（避避免同WU—BLUST混淆，這這個(gè)軟件件是由華華盛頓大大學(xué)設(shè)計(jì)計(jì)的，有有時(shí)稱為為BLAST2）應(yīng)該注注意到，，在發(fā)布布的2.0版本中，，命令行行的參數(shù)數(shù)有很大大改變。。序列相似似性搜索索通過計(jì)算算機(jī)網(wǎng)絡(luò)絡(luò)或調(diào)制制解調(diào)器器登陸到到Internet上上并把含含有你的的序列的的e-mail發(fā)送到到NCBI。DATALIB認(rèn)準(zhǔn)你你將搜索索的數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)，可可選擇下下列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)：nr““非豐余余的”蛋蛋白或核核酸序列列數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)，它包包括來自自PDB，GenBank（（R），，更新的的GenBank（r），EMBL的最新新情報(bào)；；gbGenBank（R））核酸序序列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)；embEMBL數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)；Entrez基基因組（（各種物物種）Entrez是NCBI的一個(gè)計(jì)計(jì)劃，它它包含了了GenBank數(shù)據(jù)。但但Entrez和GenBank從本質(zhì)上上是不同同的，前前者是一一個(gè)信息息檢索系系統(tǒng)，而而后者是是一個(gè)Entrez從中檢索索的數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)。Entrez基基因組——超超過800種在在GenBank中被被完整測(cè)測(cè)序的物物種，包包括大于于500種病毒毒，〉25種細(xì)細(xì)菌，酵酵母，和和許多viroids，質(zhì)粒粒，和細(xì)細(xì)胞器。。還包括括正在進(jìn)進(jìn)行中的的基因組組，比如如人，小小鼠，線線蟲，瘧瘧原蟲，，果蠅，，利什曼曼原蟲，，水稻，，和玉米米。EntrezMapViewerEntrez基基因組FASTAFASTA程序序是第一一個(gè)廣泛泛使用的的數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)相似性性搜索程程序。程序引用用取代矩矩陣實(shí)行行局部比比對(duì)以獲獲得最佳佳搜索。。但眾所所周知，，使用這這種策略略會(huì)非常常耗費(fèi)工工作時(shí)，，為了提提高速度度，在實(shí)實(shí)施耗時(shí)時(shí)的最佳佳搜索之之前，程程序使用用已知的的字串檢檢索出可可能的匹匹配。在在速度和和敏感度度之間權(quán)權(quán)衡選擇擇依賴于于ktup參數(shù)數(shù)。它決決定了字字串的大大小。增增大ktup參參數(shù)就會(huì)會(huì)減少字字串命中中的數(shù)目目，也就就會(huì)減少少所需要要的最佳佳搜索的的數(shù)目和和搜索的的速度。。從2.0版本開始始，F(xiàn)ASTA對(duì)每一個(gè)個(gè)檢索的的比對(duì)都都提供一一個(gè)統(tǒng)計(jì)計(jì)學(xué)顯著著性的評(píng)評(píng)估。Ftp：：///pub/fasta/FASTA格式式定義行號(hào)號(hào)后只跟跟隨序列列數(shù)據(jù)，，參見描描述數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)的readme文文件，包括nt.Z（（每天更更新的非非冗余BLAST核酸酸數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)，包括GenBank++EMBL+DDBJ+PDB序列列，不包括EST,,STS,GSS,orHTGS序列）），nr.Z（（每日更更新的非非冗余蛋蛋白質(zhì)）），est.Z,gss..Z,htg.Z,,sts.Z,和其其它文件件。FTPGenPept下載“genpept.fsa.Z”文件件，這個(gè)個(gè)文件包包含了從從GenBank/EMBL/DDBJ記記錄中翻翻譯過來來的FASTA格式的的氨基酸酸序列，，這些記記錄都有有一到兩兩個(gè)CDS特性性的描述述。

FTP基基因組蛋蛋白從ftp站點(diǎn)的的genbank/genomes目錄下下下載各各種物種種的FASTA格式的的氨基酸酸序列**.faa和蛋蛋白表文文件*..ptt。參見見readme文件。。蛋白表表也可以以在Entrez基因因組中看看到。

向GenBank提交交數(shù)據(jù)Sequin提交軟件件程序，，用于一一條或者者很多條條的提交交，長(zhǎng)序序列，完完整基因因組，alignments，人群群/種系系/突變變研究的的提交。?？梢元?dú)立立使用，，或者用用基于TCP//IP的的“networkaware””模式，，可以鏈鏈接到其其他NCBI的的資源和和軟件，，比如Entrez和和PowerBLAST。GenBankESTs-表達(dá)達(dá)序列標(biāo)標(biāo)簽，短短的、單單次（測(cè)測(cè)序）閱閱讀的cDNA序列。。也包括括來自于于差異顯顯示和RACE實(shí)驗(yàn)的的cDNA序列列。STSs序列列標(biāo)簽位位點(diǎn)GSSs基因組調(diào)調(diào)查序列列，短的的、單次次（測(cè)序序）閱讀讀的cDNA序序列，exontrap獲獲得的序序列，cosmid//BAC/YAC末端端，及其其他。HTGs來自于大大規(guī)模測(cè)測(cè)序中心心的高通通量基因因組序列列，未完完成的（（階段0，1，，2）和和完成的的（階段段3）序序列。注意：完完成的人人類的HTG序序列可以以同時(shí)在在GenBank和HumanGenomeSequencing頁面上訪訪問。RefSeqNCBI數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)的參考考序列。。校正的的，非冗冗余集合合，包括括基因組組DNAcontigs，，已知基基因的mRNAs和蛋蛋白，在在將來，，整個(gè)的的染色體體。Accessionnumbers用NT_xxxxxx,,NM_xxxxxx,NP__xxxxxx,和和NC__xxxxxx的形式式來表示示。dbEST——表達(dá)達(dá)序列標(biāo)標(biāo)簽數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)，短短的、單單次（測(cè)測(cè)序）閱閱讀的cDNA序列。。也包括括來自于于差異顯顯示和RACE實(shí)驗(yàn)的的cDNA序列列。dbGSS——基因組組調(diào)查序序列的數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)，，短的、、單次（（測(cè)序））閱讀的的cDNA序列列，exontrap獲得得的序列列，cosmid/BAC//YAC末端，，及其他他。dbSTS序列標(biāo)簽簽位點(diǎn)的的數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)，短的的在基因因組上可可以被唯唯一操作作的序列列，用于于產(chǎn)生作作圖位點(diǎn)點(diǎn)。

dbSNP——單核核苷酸多多態(tài)性數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)，，包括SNPs，小范范圍的插插入/缺缺失，多多態(tài)重復(fù)復(fù)單元，，和微衛(wèi)衛(wèi)星變異異。UniGene數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)把GenBank中同同某個(gè)基基因有關(guān)關(guān)的非冗冗余序列列聚集成成組(或或整理成成簇的EST和和全長(zhǎng)mRNA序列庫(kù)庫(kù))，每每一個(gè)代代表一種種特定已已知的或或假設(shè)的的物種基基因，有有定位圖圖和表達(dá)達(dá)信息以以及同其其它資源源的交叉叉參考。。序列數(shù)數(shù)據(jù)可以以以cluster形形式在Unigene網(wǎng)頁下下載，完完整的數(shù)數(shù)據(jù)可以以從FTP站點(diǎn)點(diǎn)repository/UniGene目錄下下下載。。人類UniGene小鼠UniGene大鼠UniGene斑馬魚UniGene完整的基基因組參見下面面Genome和Maps部部分，包包括各種種物種資資源，人人，小鼠鼠，大鼠鼠，酵母母，線蟲蟲，瘧原原蟲，細(xì)細(xì)菌，病病毒，viroids，質(zhì)粒粒。

人OMIM：在線人人類孟德德爾遺傳傳經(jīng)常更新新的人類類基因和和遺傳失失調(diào)的目目錄，有有鏈接到到其它相相關(guān)的文文獻(xiàn)參考考，序列列記錄，，和相關(guān)關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)。

蛋白序列列Entrez蛋蛋白——用accessionnumber,,作者姓姓名，物物種，基基因/蛋蛋白名字字，以及及很多其其它的文文本術(shù)語語來搜索索蛋白序序列記錄錄（在GenPept+Swiss--Prot++PIR++RPF++PDB中））。更多多的關(guān)于于Entrez的信息息見下。。如果要要檢索大大量數(shù)據(jù)據(jù)，也可可使用BatchEntrez（（批量Entrez））。

PROWWeb上上的蛋白白資源，，關(guān)于大大約200種人人類的CD細(xì)胞胞表面分分子的簡(jiǎn)簡(jiǎn)短官方方向?qū)?。?；ハ鄼z檢索，為為每個(gè)CD抗原原提供大大約20中標(biāo)準(zhǔn)準(zhǔn)信息的的分類（（生化功功能，配配體，等等等）

結(jié)構(gòu)（（Structure）結(jié)構(gòu)主頁頁—關(guān)關(guān)于NCBI結(jié)構(gòu)小小組的一一般信息息和他們們的研究究計(jì)劃，，另外也也可以訪訪問分子子模型數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)（（MMDB）和和用來搜搜索和顯顯示結(jié)構(gòu)構(gòu)的相關(guān)關(guān)工具。。MMDB：分子子模型數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)MMDBMMDB的記錄錄以ASN.1格式存存儲(chǔ)，可可以用Cn3D,Rasmol,,或Kinemage來來顯示。。另外，，數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)中類似似的結(jié)構(gòu)構(gòu)已經(jīng)被被用VAST確確認(rèn)，新新的結(jié)構(gòu)構(gòu)可以用用VASTsearch來同同數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)進(jìn)行比比較。

Cn3D與MMDB配套套的一個(gè)個(gè)三維分分子結(jié)構(gòu)構(gòu)和NMR模型型顯示程程序“Seein3-D”。。Cn3D：一個(gè)個(gè)用于NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)構(gòu)和序列列相似顯顯示工具具，它允允許觀察察3-D結(jié)構(gòu)和和序列——結(jié)構(gòu)或或結(jié)構(gòu)——結(jié)構(gòu)同同源比較較。Cn3D用起來來就象你你瀏覽器器上的一一個(gè)幫助助工具。?？稍贜CBI的網(wǎng)址址直接使使用或下下載到PC機(jī)上上執(zhí)行。。RasMol

VAST矢量同源源比較搜搜索工具具一個(gè)在NCBI開發(fā)的的計(jì)算算算法，用用于確定定相似的的蛋白三三維結(jié)構(gòu)構(gòu)。每一一個(gè)結(jié)構(gòu)構(gòu)的“結(jié)結(jié)構(gòu)鄰居居”都是是預(yù)先計(jì)計(jì)算好的的，而且且可以通通過MMDB的的結(jié)構(gòu)概概要頁面面的鏈接接訪問。。這些鄰鄰居可以以用來確確認(rèn)那些些不能被被序列比比較識(shí)別別的遠(yuǎn)的的同源性性。VAST搜索索—結(jié)結(jié)構(gòu)——結(jié)構(gòu)相相似搜索索服務(wù)。。比較一一個(gè)新解解出的蛋蛋白結(jié)構(gòu)構(gòu)和在MMDB/PDB數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)中的的結(jié)構(gòu)的的三維坐坐標(biāo)。VAST搜索計(jì)計(jì)算一系系列可能能會(huì)被交交互瀏覽覽的結(jié)構(gòu)構(gòu)鄰居，，用分子子圖形來來觀察重重疊和同同源相似似。

分類學(xué)NCBI的分類類數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)主頁——關(guān)關(guān)于分類類計(jì)劃的的一般信信息，包包括分類類資源和和同NCBI分分類學(xué)家家合作的的外部管管理者的的列表。。分類瀏覽覽器——搜索索NCBI的分分類數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)，包包括大于于70000個(gè)個(gè)物種的的名字和和種系，，這些物物種都至至少在遺遺傳數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)中有有一條核核酸或蛋蛋白序列列?？梢砸詸z索一一個(gè)特定定種或者者更高分分類（如如屬，科科）的核核酸，蛋蛋白，和和結(jié)構(gòu)記記錄。如如果有新新物種的的序列數(shù)數(shù)據(jù)被放放到數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)中，，這個(gè)物物種就被被加到（（分類））數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)中。NCBI的分類類數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)的目的的是為序序列數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)建立立一個(gè)一一致的種種系發(fā)生生分類學(xué)學(xué)。分類學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)據(jù)庫(kù)概要要PubMed—一個(gè)個(gè)關(guān)于生生物醫(yī)藥藥科學(xué)的的檢索系系統(tǒng)，包包括引用用，摘要要，和雜雜志的索索引術(shù)語語。它包包括直接接由出版版商提供供給NCBI的的文獻(xiàn)引引用以及及鏈接到到在出版版商網(wǎng)址址上的全全文的URLs。PubMed包包括MEDLINE和和PREMEDLINE的完完整內(nèi)容容。它還還包括一一些被MEDLINE認(rèn)為超超出范圍圍的文章章和雜志志，（這這些文章章或雜志志）由于于內(nèi)容或或在某一一時(shí)期不不在索引引范圍內(nèi)內(nèi)。因此此PubMed是比MEDLINE的更大大的集合合。

雜志瀏覽覽器允許你去去查找收收錄到PubMed系系統(tǒng)的雜雜志的名名字，MEDLINE的縮寫寫，或ISSN號(hào)碼。。PubRef（（開發(fā)中中）—一一個(gè)關(guān)關(guān)于來自自于廣大大范圍的的科學(xué)雜雜志的數(shù)數(shù)目記錄錄，和鏈鏈接到出出版商網(wǎng)網(wǎng)址的全全文。PubRef包包含了PubMEd，，加上了了來自其其它學(xué)科科的雜志志出版商商提供的的引用和和摘要。。因此它它是比PubMed更更大的集集合。這這個(gè)計(jì)劃劃的啟動(dòng)動(dòng)是因?yàn)闉镹AS要求為為科學(xué)領(lǐng)領(lǐng)域的電電子雜志志提供一一個(gè)“白白皮書””服務(wù)。。

PubMed中中心（開開發(fā)中））PubMed中中心是一一個(gè)無障障礙的NIH資資源，用用于在生生命科學(xué)學(xué)領(lǐng)域中中同業(yè)互互查的基基礎(chǔ)研究究報(bào)告。。從2000年年一月開開始接受受雜志文文章。所所有在PubMed中中心的材材料將由由目前任任一主要要的摘要要和索引引服務(wù)中中列出的的雜志提提供，或或者在編編輯委員員會(huì)中擁擁有3個(gè)個(gè)以上有有主要資資金機(jī)構(gòu)構(gòu)的研究究經(jīng)費(fèi)的的擁有人人的雜志志提供。。PubMed書籍

同書籍出出版商合合作NCBI為為網(wǎng)絡(luò)改改編了教教科書，，并把他他們鏈接接到PubMed—生生物醫(yī)藥藥書目數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)。。這是為為了給PubMed提提供背景景信息，，這樣使使用者可可以探究究在PubMed搜索索結(jié)果中中不熟悉悉的概念念。目前前收錄的的書有：：MolecularBiologyoftheCell,3rded.AlbertsB..,BrayD..,LewisJ.,RaffM.,RobertsK.,WatsonJ..D.,,1994,,GarlandPublishing.

外部鏈接接一個(gè)登記記服務(wù)，，用于建建立從在在Entrez中的特特定的文文章，雜雜志，或或生物數(shù)數(shù)據(jù)到外外部網(wǎng)址址的鏈接接。第三三方可以以提供一一個(gè)URL，資資源名字字，關(guān)于于他們網(wǎng)網(wǎng)址的簡(jiǎn)簡(jiǎn)要的描描述，和和關(guān)于從從NCBI數(shù)據(jù)據(jù)的哪里里他們希希望建立立鏈接的的詳細(xì)說說明。這這個(gè)詳細(xì)細(xì)說明可可以用對(duì)對(duì)Entrez有效的的布爾查查詢來寫寫，也可可以用特特定的文文章或序序列的標(biāo)標(biāo)志列表表來寫。。這樣NCBIPubMed的用用戶將可可以通過過“NCBI小小房間””服務(wù)（（開發(fā)中中）來選選擇哪個(gè)個(gè)外部鏈鏈接在他他們的搜搜索中是是可見的的。

引用匹配配允許你找找到任何何一篇在在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)中的文文章的PubMedID或或MEDLINEUID，，給出書書目信息息（雜志志，卷，，頁碼等等）。單篇文章章的引用用匹配。。許多文章章的批量量引用匹匹配。E-mail引引用匹配配也是可可以的，，也可以以用于單單篇或許許多文章章。如果果要獲得得幫助文文件，給給citation__matcher@寫一封封只有內(nèi)內(nèi)容為HELP的E--Mail。GenomesandMapsOverviewEntrez基基因組（（各種物物種）提供完成成的基因因組/染染色體的的圖形概概覽，并并可以探探究那些些逐步細(xì)細(xì)化的區(qū)區(qū)域。也提供那那些已經(jīng)經(jīng)被NCBI工工作人員員分析過過的物種種的編碼碼區(qū)的摘摘要和TaxTables。。檢索蛋白白或DNA序列列e-mail完完成序列列檢索：：mailretrieve@subjectDATALIB