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基因表達(dá)調(diào)控第一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第一節(jié)
基因的結(jié)構(gòu)與功能第二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日1.基因的分子基礎(chǔ)現(xiàn)代分子生物學(xué)研究已經(jīng)證實(shí)DNA是遺傳信息的主要載體,基因的化學(xué)本質(zhì)就是一段DNA分子片段。Watson和Crick提出的DNA分子雙螺旋結(jié)構(gòu)模型為遺傳信息傳遞提供了物質(zhì)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。根據(jù)這個(gè)模型,DNA分子是由2條互補(bǔ)的多核苷酸鏈相互纏繞而成,2條鏈之間通過(guò)堿基配對(duì)結(jié)合在一起。第三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日基因作為一個(gè)遺傳功能單位,它所對(duì)應(yīng)的一段核苷酸序列被稱為順?lè)醋樱╟istron)。顯然,一個(gè)順?lè)醋泳幋a一種完整多肽鏈。因此,順?lè)醋邮且粋€(gè)功能單位?;蚝晚?lè)醋舆@兩個(gè)術(shù)語(yǔ)常被等同使用,但仔細(xì)分析,兩者是有區(qū)別的:在原核細(xì)胞和低等真核細(xì)胞中,基因和順?lè)醋邮堑葍r(jià)的;而在高等真核細(xì)胞中,由于基因中內(nèi)含子的存在,此時(shí)順?lè)醋拥葍r(jià)于真核基因的外顯子。第五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2.基因的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)上,基因由多個(gè)不同的區(qū)域組成。無(wú)論是原核基因還是真核基因,都可劃分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩個(gè)基本組成部分。編碼區(qū)是可以被轉(zhuǎn)錄的區(qū)域,由連續(xù)的密碼子組成,其中包括起始密碼(通常是AUG)和終止密碼(UAA、UAG和UGA)。編碼區(qū)中包含5’端的非翻譯區(qū)(5’UTR)和3’端的非翻譯區(qū)(3’UTR)第六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日啟動(dòng)子(promoter):是位于基因5’端上游緊靠轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)的一段非編碼序列,其功能是引導(dǎo)RNA聚合酶與基因相應(yīng)部位的正確結(jié)合,啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄。一般來(lái)說(shuō),原核基因的啟動(dòng)子比較簡(jiǎn)單,只有數(shù)十個(gè)堿基組成,而真核基因的啟動(dòng)子較大,可能涉及數(shù)千個(gè)堿基。終止子(terminator):基因3’端下游外側(cè)與終止密碼子相鄰的一段非編碼的核苷酸短序列,具有終止轉(zhuǎn)錄的功能。即一旦RNA聚合酶完全通過(guò)了基因的轉(zhuǎn)錄單位后,聚合酶就不能繼續(xù)向前移動(dòng),使轉(zhuǎn)錄活動(dòng)終止。第九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日3.原核生物基因結(jié)構(gòu)與調(diào)控模式——操縱子(operon)
機(jī)制編碼序列
啟動(dòng)序列
操縱序列
其他調(diào)節(jié)序列(promoter)(operator)第十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日由P序列、O序列和CAP結(jié)合位點(diǎn)共同構(gòu)成lac操縱子的調(diào)控區(qū),他們相互協(xié)調(diào),共同控制著信息區(qū)中三個(gè)酶的編碼基因的表達(dá)第十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日3.真核生物基因結(jié)構(gòu)與調(diào)控模式1)順式作用元件(cis-actingelement)——可影響自身基因表達(dá)活性的DNA序列BADNA編碼序列轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)不同真核生物的順式作用元件中也會(huì)發(fā)現(xiàn)一些共有序列,如TATA盒、CAAT盒等,這些共有序列是RNA聚合酶或特異轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。
第十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2)
真核基因的調(diào)節(jié)蛋白還有蛋白質(zhì)因子可特異識(shí)別、結(jié)合自身基因的調(diào)節(jié)序列,調(diào)節(jié)自身基因的表達(dá),稱順式作用。由某一基因表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)因子,通過(guò)與另一基因的特異的順式作用元件相互作用,調(diào)節(jié)其表達(dá)。反式作用因子(trans-actingfactor)
這種調(diào)節(jié)作用稱為反式作用。第十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日cDNAaDNA反式調(diào)節(jié)C順式調(diào)節(jié)mRNAC蛋白質(zhì)CBAmRNA蛋白質(zhì)AA第十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日啟動(dòng)子啟動(dòng)子是RNA聚合酶特異性識(shí)別和結(jié)合的DNA序列。啟動(dòng)子有方向性,位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,本身并不被轉(zhuǎn)錄。TATA盒(TATAbox)是主要的真核生物的啟動(dòng)子元件,它位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-25bp處,幾乎所有已發(fā)現(xiàn)的真核生物基因的啟動(dòng)子都有此序列。TATA盒與一種稱為TATA因子的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合后即成為完整的啟動(dòng)子,精確地決定RNA合成的起始位點(diǎn)第十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日上游啟動(dòng)子元件上游啟動(dòng)子元件(upstreampromoterelements)是TATA盒上游的一些特定的DNA序列。反式作用因子可與這些元件結(jié)合,通過(guò)調(diào)節(jié)TATA因子與TATA盒的結(jié)合、RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合及轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成(轉(zhuǎn)錄起始因子與RNA聚合酶結(jié)合)來(lái)調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄效率。包括CAAT盒、CACA盒及GC盒等。第十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日反應(yīng)元件(responseelements)是一類能介導(dǎo)基因?qū)?xì)胞外的某種信號(hào)產(chǎn)生反應(yīng)的DNA序列。反應(yīng)元件都具有較短的保守序列。這些元件通常位于啟動(dòng)子附近和增強(qiáng)子內(nèi),如熱休克反應(yīng)元件(heatshockresponseelement,HSE)糖皮質(zhì)激素反應(yīng)元件(glucocorticoidresponseelement,GRE)。第十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日增強(qiáng)子(enhancer)增強(qiáng)子是一段DNA序列,其中含有多個(gè)能被反式作用因子識(shí)別與結(jié)合的順式作用元件。反應(yīng)作用因子與這些元件結(jié)合后能夠調(diào)控(通常為增強(qiáng))鄰近基因的轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子一般位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-100~-300bp處,但在基因之外或某些內(nèi)含子也有增強(qiáng)子序列。第十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日轉(zhuǎn)位基因,也稱轉(zhuǎn)位因子(transposableelements),是指可以從染色體基因組上的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置,甚至在不同的染色體之間躍遷的基因成分,因此有些文獻(xiàn)形象地稱之為跳躍基因(jumpinggenes)。轉(zhuǎn)位基因最早由美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室的女科學(xué)家B.McClintock,于上世紀(jì)40年代晚期在玉米中首次發(fā)現(xiàn)。4.特殊結(jié)構(gòu)與功能的基因第十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日原核生物的轉(zhuǎn)位因子分三種不同的類型:插入序列:分子量小于2000bp
轉(zhuǎn)座子:大于2000bp
可轉(zhuǎn)座的噬菌體:如,噬菌體Mu和D108。第二十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日假基因(pseudogene):因堿基順序發(fā)生某些突變而失去功能,不能表達(dá)或表達(dá)異常,生成無(wú)生物活性多肽的基因。假基因4個(gè)顯著特點(diǎn):①?zèng)]有內(nèi)含子;②具有與mRNA的poly(A)尾的相應(yīng)結(jié)構(gòu);③兩側(cè)有順向重復(fù)序列;④隨機(jī)出現(xiàn)在非正常的位置。第二十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日重疊基因(overlappinggenes),或嵌套基因(nestedgenes):基因的核苷酸序列是彼此重疊。第二十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日基因家族(genefamily)就是指核苷酸序列或編碼產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)具有一定程度同源性的一組基因。(1)核酸序列相同即多拷貝基因。如rRNA基因,tRNA基因等。(2)核酸序列高度同源如人類生長(zhǎng)激素基因家族:人生長(zhǎng)激素(hGH)、人胎盤促乳素(hCS)和催乳素(prolactin)。第二十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(3)編碼產(chǎn)物具有同源功能區(qū):如src癌基因家族,基因產(chǎn)物都含有250個(gè)氨基酸順序的同源蛋白激酶結(jié)構(gòu)域。(4)編碼產(chǎn)物具有小段保守基序:如DEAD盒基因家族的產(chǎn)物都具有解旋酶的功能,其結(jié)構(gòu)特征是8個(gè)氨基酸序列,內(nèi)含DEAD序列:Asp-Glu-Ala-Asp。第二十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日基因超家族(genesuperfamily)是指一組由多基因家族及單基因組成的更大的基因家族。它們可能起源于相同的祖先基因,但是它們的功能并不一定相同(區(qū)別于多基因家族)。第二十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第二節(jié)基因組的結(jié)構(gòu)與功能一、病毒基因組的結(jié)構(gòu)與功能特點(diǎn)二、原核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能特點(diǎn)三、真核生物基因組結(jié)構(gòu)與功能的特點(diǎn)四、線粒體基因組五、人類基因組*基因組(genome)一個(gè)細(xì)胞或病毒所攜帶的全部遺傳信息或整套基因。第二十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日一、病毒基因組的結(jié)構(gòu)與功能特點(diǎn)1.不同病毒基因組大小相差較大乙肝病毒(HBV)DNA為3.2
kb痘病毒基因組DNA長(zhǎng)達(dá)300kb第二十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2.不同病毒的基因組可以是不同結(jié)構(gòu)的核酸腺病毒基因組為線性雙鏈DNA第二十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日3.病毒基因組有連續(xù)的也有不連續(xù)的流感病毒由8條單鏈RNA分子構(gòu)成第二十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日4.病毒基因組的編碼序列大于90%
病毒基因組的大部分是用來(lái)編碼蛋白質(zhì)的,只有很小的一部分不編碼蛋白質(zhì)。第三十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日5.單倍體基因組除逆轉(zhuǎn)錄病毒基因組有兩個(gè)拷貝外,至今發(fā)現(xiàn)的病毒基因組都是單倍體,每個(gè)基因在病毒顆粒中只出現(xiàn)一次。第三十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日6.基因有連續(xù)的和間斷的感染細(xì)菌的病毒(噬菌體)基因組與細(xì)菌基因組結(jié)構(gòu)特征相似,基因是連續(xù)的;而感染真核細(xì)胞的病毒基因組與真核生物基因組結(jié)構(gòu)特征相似,有的基因含有內(nèi)含子,基因是間斷的。第三十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日7.相關(guān)基因叢集如腺病毒晚期基因編碼表達(dá)的12種外殼蛋白,在晚期基因轉(zhuǎn)錄時(shí)是在1個(gè)啟動(dòng)子作用下生成多順?lè)醋觤RNA,然后加工成各種mRNA,編碼病毒的各種外殼蛋白,它們?cè)诠δ苌隙际窍嚓P(guān)的。第三十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日8.基因重疊有些病毒核酸分子很小,又需要裝入盡可能多的基因,因此在進(jìn)化過(guò)程中形成了重疊基因,即同一段核酸序列能夠編碼2種或2種以上蛋白質(zhì)。第三十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日9.病毒基因組含有不規(guī)則結(jié)構(gòu)基因主要類型有:①幾個(gè)結(jié)構(gòu)基因的編碼區(qū)無(wú)間隔,而是連續(xù)的、不間斷的。②mRNA沒(méi)有5端的帽結(jié)構(gòu)。③結(jié)構(gòu)基因本身沒(méi)有翻譯起始序列第三十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日二、原核生物基因組的結(jié)構(gòu)與功能特點(diǎn)1.具有操縱子結(jié)構(gòu)這是原核基因組的一個(gè)突出的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。所謂操縱子由信息區(qū)和調(diào)控區(qū)組成,前者包括數(shù)個(gè)編碼蛋白質(zhì)的序列,后者包括啟動(dòng)子、操縱基因,以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)。2.編碼序列在基因組中約占50%
原核生物基因的編碼序列在基因組中約占50%,遠(yuǎn)大于真核基因組,但又小于病毒基因組;編碼順序不重疊,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物多為多順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu)。第三十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日3.多順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu),無(wú)內(nèi)含子原核基因是多順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu),同時(shí)基因內(nèi)無(wú)內(nèi)含子,是連續(xù)的,因此轉(zhuǎn)錄后不需要剪切。4.基因組中重復(fù)序列很少原核基因很少重復(fù)序列,其結(jié)構(gòu)基因多為單拷貝,只有編碼rRNA的基因往往是多拷貝的,這有利于核糖體的快速組裝。5.存在移動(dòng)基因原核基因組中存在著可移動(dòng)的DNA序列,包括插入序列和轉(zhuǎn)座子。第三十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日三、真核生物基因組結(jié)構(gòu)與功能的特點(diǎn)
真核基因組結(jié)構(gòu)龐大哺乳類動(dòng)物基因組DNA
約3×109
堿基對(duì)編碼基因約有40000個(gè),占總長(zhǎng)的6%rDNA等重復(fù)基因約占5%~10%第三十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日1.多條染色體,兩份同源的基因組配子(精子和卵子)為單倍體,體細(xì)胞一般為雙倍體,即含兩份同源的基因組,而原核生物的基因組則是單拷貝的。2.基因組龐大、復(fù)雜真核基因組遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于原核生物的基因組,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,基因數(shù)龐大,具有許多復(fù)制起點(diǎn)。3.單順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu)(monocistron)即一分子mRNA只能翻譯成一種蛋白質(zhì)。第三十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日4.非編碼順序占絕大部分,含有大量重復(fù)順序真核生物基因組內(nèi)非編碼的順序占90%以上。這是與細(xì)菌、病毒的重要區(qū)別,且在一定程度上也是生物進(jìn)化的標(biāo)尺。6.具有內(nèi)含子結(jié)構(gòu),普遍存在選擇性剪接大多數(shù)真核生物的結(jié)構(gòu)基因具有內(nèi)含子結(jié)構(gòu),是斷裂基因。7.有基因家族功能相關(guān)的基因可串聯(lián)在一起,構(gòu)成各種基因家族。第四十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日四、線粒體基因組一個(gè)細(xì)胞里有許多個(gè)線粒體,而且一個(gè)線粒體里也有幾份基因組拷貝,所以一個(gè)細(xì)胞里也就有許多個(gè)線粒體基因組。真核細(xì)胞內(nèi)存在兩個(gè)遺傳系統(tǒng),一個(gè)在細(xì)胞核內(nèi),一個(gè)在細(xì)胞質(zhì)內(nèi),各自合成一些蛋白質(zhì)和基因產(chǎn)物,造成了細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)對(duì)遺傳的相互作用;但是,核基因在生物體的遺傳控制中仍起主宰作用。第四十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日五、人類基因組(一)人類基因組DNA的多態(tài)性
DNA序列存在著多態(tài)性(polymorphism),這種多態(tài)性可以分為兩類,即DNA位點(diǎn)多態(tài)性和長(zhǎng)度多態(tài)性。第四十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(二)人類基因組的重復(fù)序列
1.反向重復(fù)序列是指兩個(gè)順序相同的拷貝在DNA鏈上呈反向排列。人類基因組約含5%的反向重復(fù)序列,散布于整個(gè)基因組中,常見(jiàn)于基因組調(diào)控區(qū)內(nèi),可能與復(fù)制的調(diào)控有關(guān)。第四十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2.串聯(lián)重復(fù)序列(tandemrepeats)其特點(diǎn)是具有一個(gè)固定的重復(fù)單位,該重復(fù)單位頭尾相連形成重復(fù)順序片段,約占整個(gè)人類基因組的10%。第四十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日第三節(jié)基因的表達(dá)與調(diào)控
第四十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日一、基因表達(dá)的概念基因經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生具有特異生物學(xué)功能的蛋白質(zhì)分子的過(guò)程。*基因表達(dá)(geneexpression)基因表達(dá)是受調(diào)控的第四十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日二、基因表達(dá)的時(shí)間性及空間性(一)時(shí)間特異性按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,稱之為基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporalspecificity)。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱階段特異性(stagespecificity)。第四十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(二)空間特異性基因表達(dá)伴隨時(shí)間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實(shí)際上是由細(xì)胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱細(xì)胞或組織特異性(cellortissuespecificity)。在個(gè)體生長(zhǎng)全過(guò)程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱之為基因表達(dá)的空間特異性(spatialspecificity)。第四十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日三、基因表達(dá)的方式按對(duì)刺激的反應(yīng)性,基因表達(dá)的方式分為:(一)組成性表達(dá)某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá),通常被稱為管家基因(housekeepinggene)。第四十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日無(wú)論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長(zhǎng)階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類基因表達(dá)被視為組成性基因表達(dá)(constitutivegeneexpression)。第五十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(二)誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,相應(yīng)的基因被激活,基因表達(dá)產(chǎn)物增加,這種基因稱為可誘導(dǎo)基因??烧T導(dǎo)基因在特定環(huán)境中表達(dá)增強(qiáng)的過(guò)程,稱為誘導(dǎo)(induction)。
如果基因?qū)Νh(huán)境信號(hào)應(yīng)答是被抑制,這種基因是可阻遏基因??勺瓒艋虮磉_(dá)產(chǎn)物水平降低的過(guò)程稱為阻遏(repression)。第五十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日在一定機(jī)制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無(wú)論其為何種表達(dá)方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達(dá),即為協(xié)調(diào)表達(dá)(coordinateexpression),這種調(diào)節(jié)稱為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)(coordinateregulation)。第五十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖(二)維持個(gè)體發(fā)育與分化第五十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日五、基因表達(dá)調(diào)控的基本原理(一)基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控基因激活轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄后加工mRNA降解蛋白質(zhì)降解等蛋白質(zhì)翻譯翻譯后加工修飾轉(zhuǎn)錄起始第五十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(二)基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素基因表達(dá)的調(diào)節(jié)與基因的結(jié)構(gòu)、性質(zhì),生物個(gè)體或細(xì)胞所處的內(nèi)、外環(huán)境,以及細(xì)胞內(nèi)所存在的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白有關(guān)。1.特異DNA序列和調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)第五十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日原核生物
蛋白質(zhì)因子——操縱子(operon)
機(jī)制特異DNA序列編碼序列
啟動(dòng)序列
操縱序列
其他調(diào)節(jié)序列(promoter)(operator)第五十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日是RNA聚合酶結(jié)合并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的特異DNA序列。1)
啟動(dòng)序列RNA轉(zhuǎn)錄起始-35區(qū)-10區(qū)TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrptRNATyrlacrecAAraBADTTGACATATAAT共有序列第五十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日共有序列(consensussequence)
決定啟動(dòng)序列的轉(zhuǎn)錄活性大小。某些特異因子(蛋白質(zhì))決定RNA聚合酶對(duì)一個(gè)或一套啟動(dòng)序列的特異性識(shí)別和結(jié)合能力。第五十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2操縱序列
——阻遏蛋白(repressor)的結(jié)合位點(diǎn)當(dāng)操縱序列結(jié)合有阻遏蛋白時(shí),會(huì)阻礙RNA聚合酶與啟動(dòng)序列的結(jié)合,或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移動(dòng),阻礙轉(zhuǎn)錄。啟動(dòng)序列編碼序列操縱序列pol阻遏蛋白第五十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日3)
其他調(diào)節(jié)序列、調(diào)節(jié)蛋白例如:激活蛋白(activator)可結(jié)合啟動(dòng)序列鄰近的DNA序列,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動(dòng)序列的結(jié)合,增強(qiáng)RNA聚合酶活性。有些基因在沒(méi)有激活蛋白存在時(shí),RNA聚合酶很少或完全不能結(jié)合啟動(dòng)序列。第六十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(1)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix)這種結(jié)構(gòu)模式具有兩個(gè)較短的α螺旋片段,每個(gè)片段有7至9個(gè)氨基酸殘基,兩個(gè)螺旋片段之間有β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)聯(lián)系。一個(gè)α螺旋被認(rèn)為是識(shí)別螺旋,含有較多能與DNA相互作用的氨基酸殘基,此螺旋進(jìn)入DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的大溝。2.DNA與蛋白質(zhì)之間的相互作用第六十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(2)鋅指(zincfingers)鋅指結(jié)構(gòu)含有約30個(gè)氨基酸殘基,其中4個(gè)氨基酸殘基(兩個(gè)是半脫氨酸兩個(gè)是組氨酸,或4個(gè)都是半脫氨酸)以配位鍵與Zn2+相互作用,如圖2-6所示。鋅指能與DNA雙螺旋大溝結(jié)合。第六十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2.DNA與蛋白質(zhì)之間的相互作用(1)亮氨酸拉鏈(leucinezippers)這種結(jié)構(gòu)是指在一段肽鏈中每隔7個(gè)氨基酸殘基就有一個(gè)亮氨酸殘基,這段肽鏈所形成的α-螺旋就會(huì)出現(xiàn)一個(gè)由亮氨酸殘基組成的疏水面,而另一面則是由親水性氨基酸殘基所構(gòu)成的親水面。第六十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(2)螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix)第六十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日六、原核生物的基因表達(dá)調(diào)控
第六十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日——調(diào)節(jié)的主要環(huán)節(jié)在轉(zhuǎn)錄起始(一)原核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)特點(diǎn)1.σ因子決定RNA聚合酶識(shí)別特異性2.操縱子模型的普遍性3.阻遏蛋白與阻遏機(jī)制的普遍性第六十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日(二)乳糖操縱子調(diào)節(jié)機(jī)制1.乳糖操縱子(lacoperon)的結(jié)構(gòu)
調(diào)控區(qū)CAP結(jié)合位點(diǎn)啟動(dòng)序列操縱序列
結(jié)構(gòu)基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶ZYAOPDNA第六十七頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒(méi)有乳糖存在時(shí)2.阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)阻遏基因第六十八頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時(shí)IDNAZYAOPpol啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶第六十九頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日++++轉(zhuǎn)錄無(wú)葡萄糖,cAMP濃度高時(shí)有葡萄糖,cAMP濃度低時(shí)3.CAP的正性調(diào)節(jié)ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP第七十頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日4.協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)
※
當(dāng)阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP對(duì)該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用;
※
如無(wú)CAP存在,即使沒(méi)有阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,操縱子仍無(wú)轉(zhuǎn)錄活性。單純?nèi)樘谴嬖跁r(shí),細(xì)菌利用乳糖作碳源;若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在時(shí),細(xì)菌首先利用葡萄糖。葡萄糖對(duì)lac操縱子的阻遏作用稱分解代謝阻遏(catabolicrepression)。
第七十一頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日mRNA低半乳糖時(shí)高半乳糖時(shí)
葡萄糖低cAMP濃度高
葡萄糖高cAMP濃度低RNA-polOOOO第七十二頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日TrpTrp高時(shí)Trp低時(shí)mRNAOPtrpR調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶RNA聚合酶?(三)其他轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)機(jī)制1.轉(zhuǎn)錄衰減色氨酸操縱子第七十三頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日UUUU……UUUU……調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因trpROP前導(dǎo)序列衰減子區(qū)域UUUU……前導(dǎo)mRNA1234衰減子結(jié)構(gòu)
第10、11密碼子為trp密碼子終止密碼子14aa前導(dǎo)肽編碼區(qū):
包含序列1形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)能力強(qiáng)弱:序列1/2>序列2/3>序列3/4
trp密碼子
UUUU……第七十四頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日UUUU……34UUUU3’34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA1.當(dāng)色氨酸濃度高時(shí)轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制125’trp密碼子衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導(dǎo)DNAUUUU3’RNA聚合酶終止第七十五頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日UUUU……342423UUUU……核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA15’trp密碼子
結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNARNA聚合酶2.當(dāng)色氨酸濃度低時(shí)Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu)第七十六頁(yè),共八十七頁(yè),2022年,8月28日2.基因重組沙門菌鞭毛素基因的調(diào)節(jié)H2鞭毛素
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