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文檔簡介
代謝(Xie)組學(xué)的研究方法和研究流程演示文稿第一頁,共二十二頁。代謝組學(xué)的研究方法和研究流(Liu)程第二頁,共二十二頁。
第三頁,共二十二頁。主要內(nèi)(Nei)容定義概(Gai)述特點(diǎn)研究方法研究流程第四頁,共二十二頁。定(Ding)義代謝組學(xué)(metabonomics)是指通過組群指標(biāo)分析,進(jìn)行高通量檢測和數(shù)據(jù)處理,研究生物體整體或組織細(xì)胞系統(tǒng)的動(dòng)態(tài)代謝變化,特(Te)別是對內(nèi)源代謝、遺傳變異、環(huán)境變化乃至各種物質(zhì)進(jìn)入代謝系統(tǒng)的特(Te)征和影響的學(xué)科。第五頁,共二十二頁。概(Gai)述代謝組學(xué)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對生物體內(nèi)所(Suo)有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。其研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。先進(jìn)分析檢測技術(shù)結(jié)合模式識別和專家系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。其樣品主要是動(dòng)植物的細(xì)胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR)、質(zhì)譜(MS)、色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主第六頁,共二十二頁。特(Te)點(diǎn)關(guān)注內(nèi)源化合物對生物體系的小分子化合物進(jìn)行定量定性研究上述化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與(Yu)疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響上述內(nèi)源性化合物的知識可以被用于疾病的診斷和藥物篩選。第七頁,共二十二頁。代謝組(Zu)學(xué)的研究方法
第八頁,共二十二頁。真正意義的代謝組學(xué)(Xue)研究。預(yù)處理和檢測技術(shù)需滿足高靈敏度、高選擇性和高通量的要求。需要對獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行解析。代謝產(chǎn)物(Wu)分析4個(gè)層次代謝物靶標(biāo)分析。對個(gè)別特定組分分析。代謝輪廓分析。對預(yù)設(shè)組分的分析。代謝組學(xué)。特定樣品中所有代謝物分析。代謝指紋分析。比較代謝物指紋圖譜。第九頁,共二十二頁。
目前最常用的分離分析手段是:氣相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(GC—MS)液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(LC—MS)毛(Mao)細(xì)管電泳與質(zhì)譜聯(lián)用(CE—MS)核磁共振(NMR)第十頁,共二十二頁。
GC-MS第十一頁,共二十二頁。氣相色譜原理:氣相色譜的流動(dòng)向?yàn)槎栊詺怏w,氣-固色譜法中以表面積大且具有一定活性的吸附劑作為固定相。當(dāng)多組分的混合樣品進(jìn)入色譜柱后,由于吸附劑對每個(gè)組分的吸附力不同,經(jīng)過一定時(shí)間后,各組分在色譜柱中的運(yùn)行速度也就不同。吸附力弱的組分容易被解吸下來,最先離開色譜柱進(jìn)入檢測器,而吸附力最強(qiáng)的組分最不容易被解吸下來,因此(Ci)最后離開色譜柱。如此(Ci),各組分得以在色譜柱中彼此(Ci)分離,順序進(jìn)入檢測器中被檢測、記錄下來。
第十二頁,共二十二頁。
質(zhì)譜原理:質(zhì)譜分析是一種測量離子荷質(zhì)比(電荷-質(zhì)量比)的(De)分析方法,其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的(De)帶正電荷的(De)離子,經(jīng)加速電場的(De)作用,形成離子束,進(jìn)入質(zhì)量分析器。在質(zhì)量分析器中,再利用電場和磁場使發(fā)生相反的(De)速度色散,將它們分別聚焦而得到質(zhì)譜圖,從而確定其質(zhì)量。第十三頁,共二十二頁。GC-MS的基本流(Liu)路圖GC接(Jie)口MS數(shù)據(jù)處理真空系統(tǒng)第十四頁,共二十二頁。GC-MS聯(lián)(Lian)用儀器
SampleSample
58901.0DEG/MINHEWLETTPACKARDHEWLETTPACKARD5972AMassSelectiveDetectorDCBA
ABCDGasChromatograph(GC)MassSpectrometerSeparationIdentificationBACDADBCMS第十五頁,共二十二頁。
優(yōu)點(diǎn):集色(Se)譜法的高分離能力和質(zhì)譜法的結(jié)構(gòu)鑒定能力于一體,靈敏度高,可檢測到大量低含量的小分子代謝產(chǎn)物。缺點(diǎn):無法分析熱不穩(wěn)定性的物質(zhì)和分子量較大的代謝產(chǎn)物。第十六頁,共二十二頁。
NMR第十七頁,共二十二頁。
核磁共振基本原理:當(dāng)以射頻(Pin)照射外磁場中的自旋核,且射頻(Pin)的能量正好等于核磁矩不同取向的能級差時(shí),低能級的核將吸收射頻(Pin)躍遷致高能態(tài)—核磁共振現(xiàn)象。第十八頁,共二十二頁。
共振條件:(1)核有自旋(磁(Ci)性核)(2)外磁場,能級裂分;(3)照射頻率與外磁場的比值0/B0=/(2)第十九頁,共二十二頁。
優(yōu)點(diǎn):能夠?qū)悠穼?shí)現(xiàn)非破壞性、非選擇性分析。它是唯一既能定性,又能在微摩爾范圍定量(Liang)有機(jī)化合物的技術(shù)。缺點(diǎn):靈敏度相對
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