我的生物化學(xué)筆記

20蛋白質(zhì)含量=含氮量*6.25.（16%）三級(jí)結(jié)構(gòu)：一條多肽鏈中所有原子在三的整體排布為三級(jí)結(jié)構(gòu)。主要通過(guò)非共α－螺旋：1.3.60.54nm2.相鄰螺旋圈之間形成許多氫鍵3.右手螺旋4.側(cè)鏈基團(tuán)位于螺旋的外側(cè)9N1C1DNA）：DNA（ATCG）及其排列順序。脫氧核苷DNA1）兩條鏈方向相反、相互平行、主鏈?zhǔn)橇姿嵛焯擎?，處于螺旋外?cè)。2）堿基在螺旋內(nèi)側(cè)并配對(duì)存在，ATGC對(duì)，AT（A-T），GC（G-C）。3）螺旋直徑2nm，0.34mm，10bp3.4nm4）穩(wěn)定因素主要是堿1．tRNA（分子量最小）：1.含較多稀有堿基；2.mRNA（含量最少，原核生物不需要進(jìn)行加工即帽子結(jié)構(gòu)和尾構(gòu)）tRNA四個(gè)環(huán)的作用？見237頁(yè)真核生物的mRNA（最短）結(jié)構(gòu)特點(diǎn)：1、帽尾結(jié)構(gòu)：5'-末端（首部）有m7-Gppp的帽子，3'-末端（尾部）有20-200多聚A的尾巴（polyA）2、.子：mRNA從5'-端起rRNA（5SRNA多）真核生物（5s、5.8s、18s、23s）原核生物（5s、16s、23s）素：加熱或化學(xué)處理（如尿素、甲酰胺等）260nm收值增加。變性溫度：也稱（用Tm表示），紫外吸收值達(dá)最大增加值一半時(shí)的溫度。DNADNAG-C，TmDNA，Tm時(shí)，TmDNATm260nmDNADNARNADNADNA-RNA（分子雜1.RNA23’，DNA2.假尿苷中糖苷C-C3.DNAB-DNAC-DNAA-DNA。(Z-DNADNA1）ATP、UTP、CTP2）輔酶類：NADH、FAD、COA）第二信使：cAMP、CGMP酶的作用特點(diǎn):1.2.．高度的特異性(結(jié)構(gòu)專一性又分絕對(duì)專一性和相對(duì)專一性。1.氧化還原酶。2．轉(zhuǎn)移酶。34.5.異6．合成酶（必需基團(tuán)—--結(jié)合基團(tuán)、催化酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)是研究酶促反應(yīng)的速率和影響此速率的各種因素：1.2.3.pH4.激活劑對(duì)反應(yīng)速5.H4）二）Km1．當(dāng)V=1/2VmaxKm=[S],KmvV3．Km無(wú)關(guān)。KmKm》[s]呈線性關(guān)系，km《[s]零級(jí)反應(yīng)。4.對(duì)底物的親和力，Km（一）（二）3Km，Vmax2）KmVmx（3）KmVmax也變。1.較酶制的純度用比，2最適溫度（H）不酶的特性常1.發(fā)生部位：胞液2.兩次低位水平磷酸化：磷酸烯醇式酸-- 酸1，3-二磷酸甘油酸- - 1，6-二磷酸果糖，磷酸烯醇式酸- 葡萄糖-----6-磷酸葡萄糖-6-磷酸果糖--- 1，6-二磷酸果糖--2分子磷酸丙-----1，3-二磷酸甘油酸------3-磷酸甘油酸--------2-磷酸甘油酸-酸烯醇式酸--酸1.糖酵解的生理意義：1.2.正常情況如紅細(xì)胞下3.糖酵解是糖有氧氧化的前段過(guò)程，其一些中間代謝物是脂的反應(yīng)。它們是糖無(wú)氧酵解途徑的三個(gè)調(diào)節(jié)點(diǎn)，其中以6-磷酸果糖激酶1的活性是該途徑中的主要調(diào)節(jié)點(diǎn).F-2，6-BP是6-磷酸果糖激酶1最激活劑.酸的去路：1.在無(wú)氧條件下生成乳酸、乙醇2.在有氧條件下生成乙酰COA進(jìn)入TCA循3.4.轉(zhuǎn)氨基生成氨基酸酶有TPP，硫辛酸，F(xiàn)AD，NAD+，輔酶A。酸最后接受脫去的氫的是NAD+此過(guò)程也可TCA循環(huán)：1.發(fā)生部位：粒體，2.消耗一的乙酰COA3.四次脫氫、兩次脫羧、一次底物水平磷酸化(琥珀酰COA—>琥珀酸)4.生成一FADH2.三NADH+H、2分子co2、1GTP，5.關(guān)鍵酶：檸檬酸合酶、異檸檬酸脫氫酶、α6.1COA10ATP7.三步不可逆反應(yīng)：檸檬酸的生成、α-酮戊二酸的生COATCATCA循環(huán)的生理意義：（1）三是糖、脂和蛋白質(zhì)三大物質(zhì)代謝的最終代謝通路。糖、脂和蛋白質(zhì)在體內(nèi)代謝都最終生成乙酰輔酶A，然后進(jìn)入三徹底氧化分解成水、CO2和產(chǎn)生能量。（2）三是糖、脂和蛋白質(zhì)三大物質(zhì)代謝的樞紐。(3) 一5-磷酸核糖糖異生：1.由非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^(guò)程稱為糖異生。2酸和生糖氨基酸等。3.4.反應(yīng)特點(diǎn)：酸羧激酶。2.磷酸烯醇式酸、酸、草酰乙酸三者之間的反應(yīng)構(gòu)成酸羧化支路。3.此途徑克服了兩大，能量的及膜的。使糖酵解進(jìn)行逆轉(zhuǎn)，非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變成糖。如乳酸、甘油糖異生的生理意義：1.維持血糖水平恒定。糖異生的主要原料為2.GUDPGG3.UDPG 2.COA（為限速酶，生物素為其輔酶，長(zhǎng)鏈脂肪酰COACOACOA）和脂肪酸合酶（ACP）的限速步驟，丙二酸COA抑制脂酰肉堿脂酰轉(zhuǎn)移酶I活性，酯酰coA進(jìn)入線粒體進(jìn)行β—氧化）Iβ4步連續(xù)反應(yīng)后，生成少2個(gè)碳原子的脂酰CoA?！?.每次β氧化生成1分子NADH，1分子FADH21CoA2CoA軟脂酸：106ATP奇數(shù)碳原子最后生成乙酰COA和丙酰COA(丙酰COA羧化酶)珀酰COA 乙酰COA的去路：1.生成脂肪酸2.生成膽固醇3進(jìn)入TCA.氧化供能4.生成（并不是脂肪代謝的物質(zhì)）是脂肪酸在肝臟不完全氧化的中間產(chǎn)物1,。包括：乙酰乙酸，β-羥丁酸和2.原料：乙酰CoA3.部位：肝4.關(guān)鍵酶：HMG-CoA合成酶5利乙酰COA-乙酰乙酰COA+乙酰 HMG-CoA-乙酰乙酸-- 氨的去向1.重新利用合成氨基酸、核酸。2.Gln，Asn高等植物將氨基氮以Gln，Asn的形式在體內(nèi)。（3）排出體外排氨動(dòng)物以氨的形式排出。排尿酸動(dòng)物：鳥類、爬蟲類，以尿酸形式排出。排尿動(dòng)物：以尿素形式排N5N10，SAM1.轉(zhuǎn)氨偶聯(lián)氧化脫氨基（主要在肝、腎）2.AMP（主要在天冬氨酸脫羧生成βGABA(神經(jīng)性抑制劑)；組氨酸脫羧生成組胺（過(guò)敏、血壓下降）；5-羥色胺（血壓升高）氨的轉(zhuǎn)運(yùn)：12、谷氨酰胺轉(zhuǎn)運(yùn)（氨甲酰磷酸是高能化合物）I的。（I：II：存NI、II（鳥氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶）成瓜氨酸。瓜氨酸形成后就離開線粒體，進(jìn)入細(xì)胞液。（總結(jié)：形成一分子尿素可清除2分子氨（一來(lái)自游離的氨，一來(lái)自天冬氨酸）及CO23ATP4TCA（包括尿素）也是嘌呤代謝的終產(chǎn)苷酸還原酶）；dUMPTMPN5，N10-甲烯四氫葉酸。CO2PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)IMP（次黃嘌呤核苷酸）XMP（黃嘌呤核苷酸GMP一、在細(xì)胞內(nèi)，DNA的合成方式有兩種：1.DNA2.逆轉(zhuǎn)錄３．ＰＣＲ（擴(kuò)增）二、DNA（一）DNA的半保留：每個(gè)子代DNA分子的一條鏈來(lái)自親代，另一條則是新合成的，這樣的合成方式稱為半保留。①解鏈酶結(jié)合于起始區(qū)，開DNA雙鏈。然后，單鏈結(jié)合蛋白（ＳＳＢ）結(jié)合到發(fā)體結(jié)合于被打開的DNA單鏈上，合成出小段RNA引物。③DNA旋轉(zhuǎn)酶在叉前面特定位點(diǎn)解旋，以釋放叉前進(jìn)過(guò)程中產(chǎn)生的張力。④DNA聚合酶Ⅲ進(jìn)入起點(diǎn)，它識(shí)別3′-OHdNTP5′3′-OH長(zhǎng)。⑤聚合反應(yīng)繼續(xù)到新鏈與前一個(gè)片段的RNA引物5'-端相遇時(shí)，DNA聚合酶Ⅲ脫離。⑥D(zhuǎn)NA聚合酶Ⅰ以其5′→3′外切酶切除RNA引物，產(chǎn)生的空缺也由DNA聚合酶ⅠRNADNA指導(dǎo)的RNA由RNA聚合酶催化，以NTP為底物DNA模板不需要引rRNA、mRNA、tRNARNA。1：RNADNA1、轉(zhuǎn)錄開始，RNA聚合酶σ因子識(shí)別啟動(dòng)子－35堿基序列，導(dǎo)致RNA聚合酶全酶與啟動(dòng)子特定部位緊密結(jié)合，并在－10序列局部打開DNA雙螺旋，第一個(gè)G或A核苷三磷酸底物插入轉(zhuǎn)錄起始部位，與模板配對(duì)結(jié)合使轉(zhuǎn)錄開始。2、RNARNARNA5′3′-OH3′，5′-RNANTPRNA3、RNA到一定程度，σ因子從全酶脫落，由酶催化繼續(xù)延伸4、剛合成的RNA與模板DNA之間形成雜交雙鏈，但這種雙螺旋不穩(wěn)定，酶移過(guò)一段后，雜交雙螺旋解開，兩條DNARNA當(dāng)酶沿模板3′→5′方向移動(dòng)到終止信號(hào)區(qū)域時(shí)，轉(zhuǎn)錄終止。提供終止信號(hào)的DNA序列終止子在終止位點(diǎn)之前有一個(gè)二重對(duì)稱序列(即回文序列)，當(dāng)這段序列被轉(zhuǎn)錄，RNA由RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄生成的RNA分子往往是，不具有生物活性的分子量較大的前體RNA。前體RNA一般需經(jīng)加工才能變成具有生物活性的RNA。不同RNA分子加工過(guò)程有所不同，常ｍＲＮＡ的加工有１．內(nèi)含子被切除，并將外顯子連接起來(lái)２．３’端加尾巴（起緩沖答○1在中，DNA鏈解開，兩條鏈分別作為模板；而轉(zhuǎn)錄則是不對(duì)稱的，只有一條鏈作為模板②時(shí)兩條鏈保持分開，DNA-DNA子螺旋穩(wěn)定；而轉(zhuǎn)錄時(shí)形成的DNA-RNA雜種雙鏈不穩(wěn)定，RNA鏈很快從雜交鏈釋放出來(lái)。③DNA時(shí)，子代DNA分子大小與親代相DNARNADNA得多。④原料不同：RNANTPDNAdA－U，dG－C，dT－A，dC－G的互補(bǔ)原則合成出rRNA、mRNA、tRNA三類RNA。DNA的：四種dNTP（以四種脫氧核苷三磷酸(dNTP)5′-3′-OHDNA結(jié)合蛋白，DNA，DNA（原核生物主要聚合酶），DNA（修復(fù)3'模板，在其上也是從5'→3'合成DNA新鏈，但新鏈合成的方向與叉移動(dòng)的方向正好相反，所以隨叉的移動(dòng)只能合成出許多不連續(xù)的DNA片段，該片段稱為片段。片段在DNA連接酶的作用下，連成一條完整的DNA鏈，該鏈稱為滯后鏈。先導(dǎo)鏈的是連續(xù)的而滯后鏈的是不連續(xù)的，故這種模式稱為半不連續(xù)。⑧RNA3→5′5→3′Mg2Mn2+參與1．遺傳2.三聯(lián)體３．開放閱讀框架4.遺傳的特性１．通用性２連續(xù)性、３蛋白質(zhì)的合成方向從N C,原核生物其實(shí)氨基酰-tRNA是甲硫氨酰-ｔＲＮＡ,氨基酸與tRNA的3’-OH形成酯鍵為子所特定的氨基酸t(yī)RNA結(jié)合到白體的A位，稱為進(jìn)位。氨基酰tRNA在進(jìn)位前GTPEF-TuGTPtRNAAGTPGDP，EF-TuGDPAtRNAACP:?；d體蛋白AMP:腺嘌呤核苷一磷酸ATP：腺嘌呤核苷三磷酸B:生物素羧基載體蛋白：環(huán)化腺苷酸