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文檔簡介

一、找基因1、鎖定酶NDPK-D、RRM2B2、登陸GCBI網(wǎng)站,選擇詞典,檢索NDPK-D,第一個(gè)詞條及編碼此酶的基因。詞典tNDPK-D找到1個(gè)親目Q:卵也] MUE4.NMEJMW23nucleosidediphosphatekinasei[Hernesapiens(human)]莖因ID:4933r更新于2CM5」ulOS最舊類型:prolein-ooding物神:Homosapiens(hurnan)別若:NDPK-D:NM23H+;nR123-H+其自采靠:vlb'JzOI&IS:£nsemD:ENSGO0OOOlO320ZHPRD:0S4S9;\/e<;aCIrHUMG000000479953、在pubmed中,Gene欄輸入NDPK-D,輸出的結(jié)果可查到NME4是編碼NDPK-D的基因,編碼RRM2B的酶基因是RRMAB、找位點(diǎn)1、登陸Hapmap網(wǎng)站,輸入rs號(hào),選擇CHB(中國人)篩選出MAF大于0.1的rs。

2、 登陸GCBI網(wǎng)站,在詞典選項(xiàng)下輸入基因(NME4/RRM2B)得到的結(jié)果中選擇MAF大于0.1的rs位點(diǎn),點(diǎn)開后,選擇群體多樣性,若發(fā)現(xiàn)有HCB,則為中國漢族北京人種,則納為待測位點(diǎn)。3、 登陸Pubmed網(wǎng)站,選擇SNP欄。輸入輸入基因(NME4/RRM2B)4、登陸千人基因組網(wǎng)站(/index.html)下載candidateregion的數(shù)據(jù),輸入基因(NME4/RRM2B),進(jìn)入,選擇符合該基因位置的位點(diǎn)進(jìn)入,左邊選擇VCF文件下載,保存期間有population的篩選項(xiàng),可自選,下載下來后再選VCFtoPED格式,兩個(gè)文件都下載下來,導(dǎo)入haploview后即可使用。TheGr-niomrsRmvi'firr加hePi-flM!JWTOwsiU-nhthe iictmtisdKTFmtDGV-swhr*CMildilb心晰KgEilS^YlUdFElUHLhtadlgMbMJJiildSATUiMdVUTheGr-niomrsRmvi'firr加hePi-flM!JWTOwsiU-nhthe iictmtisdKTFmtDGV-swhr*CMildilb心晰KgEilS^YlUdFElUHLhtadlgMbMJJiildSATUiMdVU;:Th苗dsniwl+dhMM?akom—id*th?vIUGflitkS?EnaariUcar**id ddatuaaaTimhJied-igetwMnm加iOIM >atflnls

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