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文檔簡介
GraphPad菜鳥教程:手把手帶大家做個(gè)column圖我雖然也只會(huì)用幾個(gè)簡單的功能(數(shù)了數(shù)大概也就四五個(gè)工具按鈕而已),然而這基本就已經(jīng)足夠應(yīng)付論文了(等我發(fā)了paper就能加一句應(yīng)付雜志了)。如果你只會(huì)用Excel做統(tǒng)計(jì)圖,強(qiáng)烈推薦學(xué)習(xí)一下GraphPad,用的溜絕對(duì)秒殺Excel(裝逼能力專業(yè)水準(zhǔn)一下子就蹭蹭蹭上去了)。所以大神們看到這兒就可以不用看下去了。小白們,讓我這個(gè)高級(jí)菜鳥將畢生所學(xué)手把手傳授給你們吧。由于內(nèi)容太長,這期首先講一講最簡單的column做圖。為什么說最簡單呢?因?yàn)樗挥袉蝹€(gè)坐標(biāo)軸,不牽涉到分組。也就是說,比較適合用來處理大量樣本的單次實(shí)驗(yàn)結(jié)果。我用的是GraphPadPrism6,其他版本大同小異。(一)新建表格,輸入數(shù)據(jù)打開軟件會(huì)出現(xiàn)選擇界面,選擇column,這里會(huì)出現(xiàn)幾個(gè)選項(xiàng),對(duì)菜鳥來說只要選擇第一個(gè)就可以了(如圖)。新建表格的最上一行是名稱,下面豎著輸入(復(fù)制粘貼)相應(yīng)數(shù)據(jù)。我這里統(tǒng)計(jì)了一下萬事屋三月份的帖子閱讀量,并將內(nèi)容分為硬貨、灌水、廣告、搞笑四類(如下圖所示),所以你們也可以看到GraphPad有一個(gè)致命弱點(diǎn),就是不能顯示中文(原諒我用拼音代替)。第二列有一個(gè)高出天際的數(shù)值,這時(shí)候你可以點(diǎn)擊下圖說明框上面那個(gè)123舍棄按鈕,數(shù)字變成斜杠加*后統(tǒng)計(jì)結(jié)果和統(tǒng)計(jì)圖會(huì)自動(dòng)更改。用這個(gè)按鈕的好處是你依舊可以看到原始數(shù)據(jù),將來想添加回來只需要再按一次那個(gè)按鈕就行。(二)統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)算GraphPad可以自動(dòng)生成很多數(shù)據(jù),除了傳統(tǒng)的mean和SD,還有大家最愛的T-test和顯著性P值。點(diǎn)擊工具欄Analysis里的Analyze按鈕,會(huì)出現(xiàn)如下選擇框:如果選擇T-test,注意每次只能兩兩比較,選擇兩個(gè)比較的欄目后會(huì)出現(xiàn)下一個(gè)選擇框,不用管什么都別改直接OK就行了。出來的結(jié)果如下圖。如果覺得兩兩比較太麻煩,可以選擇之前對(duì)話框里t-test下面那個(gè)One-wayANOVA,出現(xiàn)的對(duì)話框第一選卡不用改,第二個(gè)選卡MultipleComparisons點(diǎn)擊第二個(gè)選項(xiàng)comparethemeanofeachcolumnwiththemeanofeveryothercolumn,然后OK。你會(huì)得到包含了所有列之間兩兩比較的結(jié)果,如下圖。大家注意一下,左側(cè)的工具欄里one-way下面有兩個(gè)子文件,第一個(gè)對(duì)應(yīng)選卡一,第二個(gè)對(duì)應(yīng)選卡二(也就是說如果選卡二不選擇就只會(huì)出現(xiàn)第一個(gè)子文件)。另外,同一份數(shù)據(jù)可以選擇幾個(gè)統(tǒng)計(jì)方式,只要不停的按Analyze,所以你可以同時(shí)看到t-test和one-way的結(jié)果(可能某個(gè)方法能做出更好的顯著性,你懂得~~~)。(三)做圖及美化點(diǎn)擊左側(cè)工具欄里的graphs目錄下的子文件,會(huì)跳出選擇圖表類型的選框(見下圖)。Column的特色是可以做散點(diǎn)圖(選項(xiàng)的最后一個(gè)),相比柱狀圖不僅能看到平均值的差別還能直觀看到樣本的聚集位置和離散程度,所以我以散點(diǎn)圖為例繼續(xù)往下。(柱狀圖差不多可自行摸索,或關(guān)注后續(xù)教程)點(diǎn)擊OK生成統(tǒng)計(jì)圖后雙擊每個(gè)柱子(散點(diǎn)那一條),會(huì)出現(xiàn)修改框(如下圖),用以修改顏色、粗細(xì)等樣式。推薦大家不要選擇可愛粉冰魄藍(lán)等奇怪的顏色,就用最鮮艷的紅綠藍(lán)紫,因?yàn)檫@些顏色最貼近顯示器的RGB呈色,你在全世界任何國家任何一臺(tái)電腦和彩色打印機(jī)上出的效果都有保障。添加顯著性的線條在上方工具欄的Draw里,添加*就是旁邊T那個(gè)選項(xiàng)手打幾個(gè)*。做到這兒,差不多能得到這樣一張圖:(請(qǐng)無視線條沒對(duì)齊的問題)如果你覺得errorbar太大有點(diǎn)丑,還有一個(gè)補(bǔ)救方法,點(diǎn)擊上方Change工具的第一個(gè)圖標(biāo),會(huì)出現(xiàn)之前那個(gè)選擇統(tǒng)計(jì)圖類型的選項(xiàng)(如果你突然想換一個(gè)樣式也是按這個(gè)),之后選擇如下圖鼠標(biāo)位置,meanwithSEM,這時(shí)你會(huì)看到下面的預(yù)覽圖發(fā)生了改變。當(dāng)當(dāng)當(dāng)當(dāng)!是不是瞬間就覺得bar小多了!不過也別太高興,這樣并不改變統(tǒng)計(jì)結(jié)果,你的*并不會(huì)因此變多,而且備注統(tǒng)計(jì)方法的時(shí)候?qū)I(yè)人士一看就秒懂了。(四)導(dǎo)出及后期處理做完這些后,在統(tǒng)計(jì)圖頁面選擇最上方的file,export,導(dǎo)出成TIF格式。拿到的圖片已經(jīng)可以用了。如果有更高級(jí)的需要,比如想要中文字,那就需要去photoshop進(jìn)行進(jìn)一步加工。具體的就不多說了,直接上結(jié)果。扒完萬事屋的老底后,我深深的覺得為大家寫點(diǎn)干貨還是很重要的啊!今天就策到這里吧。
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