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文檔簡介
1、CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列CiteSpace 中文指南李 杰上海海事大學(xué) 安全科學(xué)與工程系 上海海事大學(xué) 安全科技趨勢研究中心上海海事大學(xué) 科技情報研究所博客:/u/jerrycueb郵件:lijie_2017 年 7 月 19 日北京參考文獻格式:李杰. CiteSpace 中文指南. /blog-554179-1066981.html 尊重版權(quán),合理使用。1CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列目錄寫在前面5CiteSpace 等學(xué)習(xí)資源5CiteSpace 使用流程6CiteSpace 菜單功能概覽7CiteSpace 案例圖片9第 0 講 CiteSpace 獲取及基本術(shù)語140.1
2、軟件的獲取140.2 重要術(shù)語20第 1 講 CiteSpace 主要科學(xué)計量功能概覽231.1 CiteSpace 的經(jīng)典文獻和實例文獻231.2 主要功能總述241.3 合作網(wǎng)絡(luò)分析舉例251.4 主題、關(guān)鍵詞或 WoS 分類的共現(xiàn)分析261.5 共被引分析281.6 文獻的耦合分析301.7 期刊 Overlay 分析30第 2 講 中文 CNKI 數(shù)據(jù)的分析實踐312.1 CiteSpace 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能區(qū)312.2 CNKI 數(shù)據(jù)分析32第 3 講 中文 CSSCI 數(shù)據(jù)的分析實踐403.1 登錄 CSSCI(中國社會科學(xué)引文索引)403.2 檢索結(jié)果及其基本信息403.3 選擇并下
3、載數(shù)據(jù)413.4 數(shù)據(jù)導(dǎo)出413.5 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換423.6 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換結(jié)果433.7 案例分析43第 4 講 文獻的共被引分析以研究為例464.1 運行軟件464.2 可視化結(jié)果472CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列4.3 布局調(diào)整474.4 共被引網(wǎng)絡(luò)進行聚類484.4 網(wǎng)絡(luò)的調(diào)整484.5 文獻共被引分析的原理514.4 案例結(jié)果54第 5 講 CiteSpace 的地理可視化575.1 運行 Citespace575.2 打開地理可視化功能575.3 相關(guān)參數(shù)設(shè)置585.4 結(jié)果的展示595.5 結(jié)果的編輯605.6 使用其他程式可視化 KML 文件62第 6 講 Derwent 專利數(shù)據(jù)分
4、析656.1 Web of Science 數(shù)據(jù)的收集656.1 Derwent Innovations Index 數(shù)據(jù)庫采集67第 7 講網(wǎng)絡(luò)的 Overlay 分析727.1 對數(shù)據(jù)整體網(wǎng)絡(luò)的初步分析727.2 構(gòu)建新圖層727.3 Overlay 分析步驟737.4 Overlay 分析結(jié)果747.5 時間維度的網(wǎng)絡(luò)分析75第 8 講 結(jié)合 Carrot2+Jigsaw 進行分析768.1 數(shù)據(jù)及軟件準備768.2 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換768.3 WoS to Carrot2778.4 WoS to Jigsaw80第 9 講 期刊的雙圖疊加分析849.1 軟件及數(shù)據(jù)準備849.2 功能界面849
5、.3 分析步驟859.4 初步結(jié)果展示86第 10 講 文獻導(dǎo)出和引用893CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列10.1 說明8910.2 步驟演示89參考文獻93附錄 1 常用資源94科學(xué)計量工具鏈接94免費期刊查詢系統(tǒng)95科學(xué)計量學(xué)類期刊96普賴斯獎獲得者99重要組織和機構(gòu)101主要作者的全球分布102附錄 2 常見問題解答104CiteSpace 常見問題解答之一104CiteSpace 常見問題解答之二1104CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列寫在前面CiteSpace 等學(xué)習(xí)資源科學(xué)計量學(xué)暑期學(xué)校Chinese Summer School for Scientometrics圖 0. 1
6、科學(xué)知識圖譜學(xué)習(xí)微信學(xué)習(xí)社區(qū)QQ 群 A 303640837QQ 群 B 535200942科學(xué)計量與知識圖譜指南系列物圖 0. 2 已計劃待R 科學(xué)計量數(shù)據(jù)可視化(首都經(jīng)濟貿(mào)易大學(xué)-2018)科學(xué)知識圖譜原理及應(yīng)用-VOSviewer 與 CitNetExplorer(高等教育-2017)已分享在線指南CiteSpace 中文版指南/blog-554179-1027923.html如何使用 CiteSpace 的一組示范及常見問題解答 /blog- 554179-838345.htmlCiteSpace 操作文件分享 /blog-554179-1020871.html知識圖譜學(xué)習(xí)推薦博客:陳
7、超美教授:/u/ChaomeiChen李杰博士:/u/jerrycueb5CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列CiteSpace 使用流程準備數(shù)據(jù)儲存文件夾并啟動CiteSpace數(shù)據(jù)命名為download_xx,并復(fù)制一份到建立的 data 文件夾中。地6結(jié)果分析及撰寫通過專家調(diào)查法來檢驗Cite Space得到的結(jié)果是否與實際一致網(wǎng)絡(luò)圖,時間Density密度線圖,時區(qū)圖Modularity 模塊化值Silhouette剪影值視圖顯示網(wǎng)絡(luò)聚類參數(shù)判讀網(wǎng)絡(luò)疊加快速聚類g 聚類命名(T,K,A)g 聚保存圖層網(wǎng)絡(luò)類命名算法調(diào)整和分析綜合圖譜結(jié)果進行初步解讀是否滿是否意確定時間跨度,Cosine,T
8、opN選擇時間切片Jaccard,Pruning尋徑,TopN%DiceMST最小樹c,cc,ccv時間切片網(wǎng)絡(luò)類型關(guān)聯(lián)強度網(wǎng)絡(luò)裁剪節(jié)點閾值篩選文獻共被引,作者共被引,期刊共被引,文獻耦合其他功能補充合作網(wǎng)絡(luò),Google Earth合作網(wǎng)絡(luò)共詞網(wǎng)絡(luò),科學(xué)領(lǐng)域共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)疊加分析、全文本挖掘等點擊 GO 并可視化結(jié)果理可視化期刊雙圖疊加結(jié)構(gòu)變異分析建立項目并進行參數(shù)設(shè)置(第3講)數(shù)據(jù)源及其數(shù)據(jù)下載通過想要回答的問題來確定收集數(shù)據(jù)的策略CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列CiteSpace 菜單功能概覽功能參數(shù)區(qū)7CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列可視化界面8CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列CiteSpa
9、ce 案例圖片9CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列10CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列11CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列12CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列13CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 0 講 CiteSpace 獲取及基本術(shù)語0.1軟件的獲取小提示:CiteSpace 的使用條件為 Java+CiteSpace,因此要確保兩個軟件都已經(jīng)正確安裝。第一步:登陸 CiteSpace 的網(wǎng)站下載。Data 對應(yīng)軟件版本釋放的時間Version 軟件的版本Download Citespace 對應(yīng) CiteSpace 的下載鏈接 ZipDownload Java JRE 對應(yīng) Java 程
10、序的下載鏈接 64-bit / Windows x64 Notes 為對應(yīng)版本的說明圖 1 CiteSpace 的下載頁面這里我們建議沒有安裝 Java 程序的用戶,通過 CiteSpace 下載界面提供鏈接, 先下載并安裝 Java。已經(jīng)安裝 Java 程序的用戶從第一步直接進入第三步。第二步:Java 下載。點擊 CiteSpace 下載頁面中的 Java 鏈接 64-bit / Windows x64,進入 Java 下載界14CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列面。圖 2 點擊進入 Java 下載界面在Java 下載頁面的底端,提供了最近兩個版本的Java 程序包。此時用戶需要判斷以下載適
11、合自己電腦的 Java 程序。對于 Windows 系統(tǒng)的用戶來講,需要區(qū)分自己的電腦位數(shù)。在確定好下載的Java 版本后,選中 Accept License Agreement,并點擊要下載的 Java 程序鏈接。圖 3 Java 下載界面15CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列雙擊Java安裝包點擊“install”等待Java安裝完成圖 4 Java 的安裝過程確定電腦位數(shù)的方法 1: 我的電腦(右擊)g系統(tǒng)窗口中查看電腦位數(shù)右擊我的電腦并選擇“屬性”確定電腦位數(shù)的方法 2:打開控制面板g系統(tǒng)和安全g系統(tǒng)g查看電腦位數(shù)圖 5 確定電腦位數(shù)的方法一16CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第三步:C
12、iteSpace 下載點擊圖中 Zip 下載最新版的 CiteSpace,此時顯示軟件下載后自動保存的文件夾。下載后的 CiteSpace 安裝文件是一個壓縮包,安裝 CiteSpace 僅僅需要解壓該壓縮包即可。解壓 CiteSpace 壓縮文件后,里面共包含了 4 個小文件。點擊 CiteSpaceIII.jar 即可運行 CiteSpace 軟件。圖 6 軟件的保存位置17CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 7 解壓安裝 CiteSpace 文件圖 8 CiteSpace 程序文件18CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 9 打開 CiteSpace 軟件圖 10 運行 CiteSpace
13、 軟件后出現(xiàn)的第一個窗口點擊 Agree 后進入 CiteSpace 參數(shù)功能區(qū)19CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 11 進入 CiteSpace 參數(shù)功能區(qū)若是首次使用 CiteSpace,可以直接點擊 Go 來運行 CiteSpace 自帶的案例。這里不需要用戶做任何的參數(shù)設(shè)置。0.2 重要術(shù)語CiteSpace:引文空間是一款著眼于分析科學(xué)分析中蘊含的潛在知識,是在科學(xué)計量學(xué)、數(shù)據(jù)可視化背景下逐漸發(fā)展起來的一款引文可視化分析軟件。由于是通過可視化的手段來呈現(xiàn)科學(xué)知識的結(jié)構(gòu)、規(guī)律和分布情況,因此也將通過此類方法分析得到的可視化圖形稱為“科學(xué)知識圖譜”。Betweenness centr
14、ality:中介中心性是測度節(jié)點在網(wǎng)絡(luò)中重要性的一個指標(此外還有度中心性、接近中心性等)。CiteSpace 中使用此指標來發(fā)現(xiàn)和衡量文獻的重要性,并用紫色圈對該類文獻(或作者、期刊以及機構(gòu)等)進行重點進行標注。20CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列Burst 檢測:突發(fā)主題(或文獻、作者以及期刊引證信息等)。在 CiteSpace 中使用 Kleinberg, J(2002)年提出的算法進行檢測。Citation tree-rings :引文年環(huán)代表著某篇文章的引文歷史。引文年輪的顏色代表相應(yīng)的引文時間,一個年輪厚度和與相應(yīng)時間分區(qū)內(nèi)引文數(shù)量成正比。CiteSpace圖例Thresholds
15、 :閾值TOP NTOP N%21CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列引文數(shù)量、共被引頻次和共被引系數(shù)三個層次上, 按前中后三個時區(qū)分別設(shè)定閾值,其余的由線性內(nèi)插值來決定使用軟件分析步驟211數(shù)據(jù)收集38456722CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 1 講 CiteSpace 主要科學(xué)計量功能概覽1.1 CiteSpace 的經(jīng)典文獻和實例文獻1.1.1 基礎(chǔ)研究論文Chen, C. (2004) Searching for intellectual turning points: Progressive Knowledge Domain Visualization.Proceedings of
16、 the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), 101 (Suppl. 1), 5303-5310.Chen, C. (2006) CiteSpace II: Detecting and visualizing emerging trends and transient patterns in scientific literature. Journal of the American Society for Information Science and Technology, 57(3),
17、359-377. 中譯本該論文為 CiteSpace 的經(jīng)典論文,被引上千次Chen, C. et al. (2010) The structure and dynamics of co-citation clusters: A multiple-perspective co-citation analysis. Journal of the American Society for Information Science and Technology. (10.1002/asi.21309)筆者專門對 CiteSpace 的經(jīng)典文獻進行了可視化分析,參見CiteSpace 經(jīng)典文獻的統(tǒng)計分析
18、 /blog-554179-831518.html CiteSpace 經(jīng)典文獻的統(tǒng)計分析(補充一:共被引) /blog-554179-831634.html CiteSpace 經(jīng)典文獻的統(tǒng)計分析(補充二:文獻耦合) /blog-554179-831638.html1.1.2 近期很有學(xué)習(xí)意義的實例論文Chen, C., Dubin, R., & Kim, M. C. (2014). Emerging trends and new developments in regenerative medicine: a scientometric update (2000-2014).Expert
19、opinion on biologicaltherapy, 14(9),/doi/pdf/10.1517/14712598.2014.9208131295-1317.23CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列Chen C, Dubin R, Kim M C. Orphan drugs and rare diseases: a scientometric review(2000-2014)J.ExpertOpiniononOrphanDrugs,2014(0):1-16./profile/Chaomei_Chen/scholar?hl=en&q=CiteSpace&btnG=&as_sdt=1%2C5
20、&as_sdtp=1.1.3 學(xué)習(xí)科學(xué)計量分析的推薦論文Peters, H. P., & Van Raan, A. F. (1991). Structuring scientific activities by co-author analysis. Scientometrics, 20(1), 235-255.White, H. D., & McCain, K. W. (1998). Visualizing a discipline: An author co-citation analysis of information science, 1972-1995. Journal of th
21、e American Society for information science, 49(4), 327-355.Culnan, M. J. (1987). Mapping the intellectual structure of MIS, 1980-1985: a co- citation analysis. Mis Quarterly, 341-353.Kessler, M. M. (1963). Bibliographic coupling between scientific papers.American documentation, 14(1), 10-25.Boyack,
22、K. W., & Klavans, R. (2010). Co-citation analysis, bibliographic coupling, and direct citation: Which citation approach represents the research front most accurately?. Journal of the American Society for Information Science and Technology, 61(12), 2389-2404.1.2 主要功能總述節(jié)點類型決定了使用 CiteSpace 分析的目的作者、機構(gòu)或者
23、國家的合作網(wǎng)絡(luò)分析主題、關(guān)鍵詞或 WoS 分類的共現(xiàn)分析文獻的共被引分析、作者的共被引分析以及期刊的共被引分析文獻的耦合分析24CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1.3 合作網(wǎng)絡(luò)分析舉例 作者合作網(wǎng)絡(luò)圖 12 作者合作網(wǎng)絡(luò) 作者、機構(gòu)或者國家的合作網(wǎng)絡(luò)分析,在網(wǎng)中節(jié)點的大小反映的是作者、國家/地區(qū)或者機構(gòu)的發(fā)文量。 國家-地區(qū)合作網(wǎng)絡(luò) 圖 13 國家-地區(qū)合作網(wǎng)絡(luò) 25CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列 機構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò) 圖 14 機構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò) 數(shù) 據(jù) 來 源 參 見 : /cchen/citespace/doc/tutorial/how_to/1.download_from_WOS. pdf1.4
24、主題、關(guān)鍵詞或 WoS 分類的共現(xiàn)分析主題、關(guān)鍵詞或 WoS 分類的共現(xiàn)分析,節(jié)點大小反映的是主題、關(guān)鍵詞或者領(lǐng)域的頻次。26CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 15 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析 圖 16 主題詞共現(xiàn)分析 27主題共現(xiàn)分析關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 17 領(lǐng)域的共現(xiàn)分析 1.5 共被引分析文獻的共被引分析、作者的共被引分析以及期刊的共被引分析,節(jié)點的大小代表文獻、期 刊或者作者的被引次數(shù),連線的顏色代表首次共被引的時間。圖 18 作者的共被引分析 28作者共被引分析領(lǐng)域共現(xiàn)分析CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列圖 19 文獻共被引分析 圖 20 期刊的共被引分析 29期
25、刊共被引分析文獻共被引分析CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1.6 文獻的耦合分析 文獻的耦合分析 數(shù)據(jù)來源參見:/blog-554179-831518.html 1.7 期刊 Overlay 分析30CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 2 講中文 CNKI 數(shù)據(jù)的分析實踐2.1 CiteSpace 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能區(qū)CiteSpace可用于分析的數(shù)據(jù)庫名稱31CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2.2 CNKI 數(shù)據(jù)分析2.2.1 登錄 CNKI,進入檢索頁面, 以下以收集 2013 年中國安全科學(xué)學(xué)報的文獻數(shù)據(jù)為例.2.2.2 數(shù)據(jù)檢索策略11選擇“期刊”22選擇“來源期刊檢索”334來源期刊輸入“
26、中國安全科學(xué)學(xué)報”,匹配方式選擇“精確”4時間選擇“2013”32CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列11可以點擊“學(xué)科”、“發(fā)表年度”、“基金”以及研究層次等,對數(shù)據(jù)進行初步的分析。可以對每頁顯示的記錄進行設(shè)置,這里推薦選擇每頁顯示50條,以便于手工刪除不符合的文獻條目。22一共檢索到374條文獻記錄,但是需要注意的是CNKI檢索的結(jié)果中新聞、會議要在數(shù)據(jù)收集是刪除。等信息,因此需為了方便進行手工刪除,筆者建議可以在下載時逐頁檢查。2.2.3 數(shù)據(jù)選擇12點擊選擇本頁的50條記錄,然后點擊下一頁,直到選中374條記錄(注:CNKI允許一次下載500條記錄)12這里的(50)代表你已經(jīng)選擇的文獻量
27、點擊“下一頁”逐頁選定文獻2.2.4 數(shù)據(jù)導(dǎo)出選定374條記錄后,點擊“導(dǎo)出/參考文獻”,進入數(shù)據(jù)導(dǎo)出界面。33CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列點擊選擇本頁所有的374條結(jié)果。此時需要逐條對數(shù)據(jù)進行檢查,取消無效的記錄。2.2.5 無效記錄刪除取消無效的記錄2.2.6 導(dǎo)出選擇繼續(xù)點擊“導(dǎo)出/參考文獻”,進入文獻輸入界面。此時需要選擇輸入數(shù)據(jù)的類型。34CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1使用CiteSpace進行分析的文獻類型輸入為“Refworks” 。這里筆者建議輸入“Refworks”和“Endnote”兩種格式。前者可以進行文獻可視化分析, 而后者可以用于進行論文寫作時使用。22點擊“
28、導(dǎo)出”下載文獻12.2.7 數(shù)據(jù)保存12下載時對文獻命名為CiteSpace需要的格式“Download_XXXX”2.2.8 數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換選擇“CNKI(Refworks)”選擇“原始數(shù)據(jù)文件夾”12建立一個空的文件夾用于保存轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)最好自己建立一個input文件夾保存原始數(shù)據(jù),output保存轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)35CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1點擊“Format Conversion”,完成轉(zhuǎn)換后會顯示“Finished”1轉(zhuǎn)換前轉(zhuǎn)換后36CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2.2.9 數(shù)據(jù)分析建立空文件data和project,復(fù)制轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)文件到data文件Project文件夾仍然為空
29、(主要用于保存分析后的結(jié)果)37CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1. 工程名稱為:中國安全科學(xué)學(xué)報2. Project和data分別對應(yīng)到相應(yīng)的文件夾3. Language選擇Chinese對相關(guān)參數(shù)進行設(shè)置2013 年學(xué)報關(guān)鍵詞分析結(jié)果38CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2013 年學(xué)報作者合作網(wǎng)絡(luò)39CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 3 講中文 CSSCI 數(shù)據(jù)的分析實踐3.1 登錄 CSSCI(中國社會科學(xué)引文索引)3.2 檢索結(jié)果及其基本信息1檢索的基本條件以及返回的記錄數(shù)。 共檢索到2013年發(fā)表于管理科學(xué)學(xué)報的94篇論文可以進一步對檢索的結(jié)果進行精煉,也可以作為基本的統(tǒng)計信息來使
30、用12返回的文獻記錄結(jié)果33240CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列3.3 選擇并下載數(shù)據(jù)1點擊選擇本頁的50條記錄,然后點擊下一頁,直到選中94條記錄點擊“下載”保存文件如下頁23.4 數(shù)據(jù)導(dǎo)出1保存記錄2打開所下載的文本,并另存在UTF-8格式41CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列3.5 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換選擇“CSSCI”選擇“原始數(shù)據(jù)文件夾”12建立一個空的文件夾用于保存轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)建 議 使 用 最 新 版 的 數(shù) 據(jù) 轉(zhuǎn) 換 插 件 : /cchen/citespace/utilities/CSS CIREC(new).jar最好自己建立一個input文件夾保存原始數(shù)據(jù),output保存轉(zhuǎn)換后的
31、數(shù)據(jù)1點擊“Format Conversion”,完成轉(zhuǎn)換后會顯示“Finished”142CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列3.6 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換結(jié)果轉(zhuǎn)換前轉(zhuǎn)換后建立空文件 data 和 project,復(fù)制轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)文件到 data 文件Project 文件夾仍然為空(主要用于保存分析后的結(jié)果)3.7 案例分析工程名稱為:管理科學(xué)學(xué)報Project 和 data 分別對應(yīng)到相應(yīng)的文件夾43CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列Language 選擇 Chinese對相關(guān)參數(shù)進行設(shè)置44CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2013 年在管理科學(xué)學(xué)報發(fā)表論文的機構(gòu)共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)2013 年在管理科學(xué)學(xué)報發(fā)表論文的作
32、者共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)45CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 4 講 文獻的共被引分析以研究為例當(dāng)前文獻圖譜軟件有十余種之多,各個軟件都有其不同的優(yōu)勢。如 VOSviewer在主題聚類方面清晰詳細;SCI2 在主題詞分析時更加靈活;HistCite 則對所下載數(shù)據(jù)集的文獻互引按照時間以形式呈現(xiàn)(目前作者認為將很快被 CitNetExplorertool 代替);BibExcel 則以數(shù)據(jù)集原始數(shù)據(jù)的 Tag 為依據(jù),提供了多種多樣的文獻分析功能(需要外部的軟件協(xié)助完成可視化,如 Gephi,VOSviewer,Pajek 等);CiteSpace以其強大的文獻共被引分析而知名(發(fā)展算法和功能不斷優(yōu)化。研究
33、和生物大),且隨著不斷的當(dāng)前 CiteSpace 已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于計算機科學(xué)、信息科學(xué)以及醫(yī)學(xué)等 60 多個領(lǐng)域(根據(jù) WoS 分類統(tǒng)計,參見下頁)4.1 運行軟件12首次運行取消去網(wǎng)絡(luò)進行的任何裁剪運算點擊“Agree”進入軟件界面46CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列運行結(jié)束后點擊“Visualize”進入可視化界面344結(jié)果按照預(yù)設(shè)條件運行的情況網(wǎng)絡(luò)基本參數(shù)及其運行基本參數(shù)554.2 可視化結(jié)果66網(wǎng)絡(luò)時時運動的,當(dāng)網(wǎng)絡(luò)布局穩(wěn)定后背景會轉(zhuǎn)成白色4.3 布局調(diào)整由于結(jié)果視圖很小,因此要放大原圖47CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列7調(diào)整圖形上下位置調(diào)整圖形左右位置7向右側(cè)拖動放大工具條,并及時
34、調(diào)整圖形的二維位置4.4 共被引網(wǎng)絡(luò)進行聚類點擊聚類圖標此時節(jié)點的屬性將發(fā)生變化,聚類結(jié)果后點擊(從施引文獻的標題中提取聚類命名術(shù)語)結(jié)果如右圖。為了增加結(jié)果的可讀性,特別是顯示重要的信息。可以進一步使用相關(guān)功能對圖譜進行優(yōu)化和調(diào)整。4.4 網(wǎng)絡(luò)的調(diào)整對聚類的標簽進行調(diào)整(按照聚類規(guī)模進行顯示)48CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列對共被引網(wǎng)絡(luò)聚類進行調(diào)整拖動對連線的 拖動對聚類標簽進行調(diào)整進行調(diào)整進行調(diào)整 點擊對節(jié)點屬性進行調(diào)整49CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列對聚類的輪廓顯示進行調(diào)整對共被引網(wǎng)絡(luò)聚類進行調(diào)整得到較為滿意的圖譜后,使用不同的方法對聚類進行命名。通常情況下陳教授推薦使用 LLR
35、 算法得到的結(jié)果,下面給出三種算法得到結(jié)果的比較。TF*IDFMILLR對聚類詳細信息的查詢,以下將對(右側(cè))三個重要的窗口進行解釋50CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列4.5 文獻共被引分析的原理對聚類詳細信息的查詢,CiteSpace 概念模型與軟件提供的信息查詢比較12321351CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列對聚類詳細信息的解釋該窗口顯示的是通過三種方法得到的聚類命名(筆者認為這些屬于反映的是研究前沿領(lǐng)域)此外,該窗口信息還可以通過菜單“Cluster”,“4 summarization of cluster”得到。該窗口顯示的施引文獻(筆者認為這些文獻代表了研究前沿)。標題中著重標識
36、的詞匯正是通過相關(guān)方法提取的聚類命名該窗口顯示的是被引文獻(筆者認為這些文獻反映的是知識基礎(chǔ)),這些文獻也是直接在圖譜中顯示的節(jié)點信息52CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列其他功能:自動生成研究報告其他功能:突發(fā)性文獻信息其他功能:不同的呈現(xiàn)方式53CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列Timeline 呈現(xiàn)方式(共被引聚類僅僅可以選擇兩種呈現(xiàn)方式,主題詞分析可以選擇Time zone 來呈現(xiàn)結(jié)果,如右圖)4.4 案例結(jié)果注釋:根據(jù)聚類)提供的例子數(shù)據(jù)繪制,數(shù)據(jù)再首次運行時自帶(文獻共被引CiteSpace54CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列55CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列注釋:本數(shù)據(jù) Loet
37、Leydesdorff 被 Web of Science 收錄的論文繪制(文獻共被引) 更多結(jié)果參見 Bibliometrics analysis of Loet Leydesdorffs publication /home.php?mod=space&uid=554179&do=blog&id=77770056CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 5 講 CiteSpace 的地理可視化數(shù)據(jù)來源于 Web of Science數(shù)據(jù)的格式與進行文獻共被引的格式一樣(不需要重新下載數(shù)據(jù))本文使用 1991-2013 年發(fā)表在 Safety Science(Articles 形式)的論文為案例軟件準
38、備1. CiteSpace /cchen/citespace/2. Google Earth /earth/download/ge/agree.html5.1 運行 Citespace打開 CiteSpace5.2 打開地理可視化功能地圖制作步驟在 CiteSpace 的菜單中,選擇 Geographical 功能57CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列5.3 相關(guān)參數(shù)設(shè)置1. 時間設(shè)置2. 選擇需要分析的數(shù)據(jù)3. 地圖規(guī)模選擇(默認即可)4. 其他選項,可以“默認”關(guān)于不同選項得到的地圖有什么差異?讀者可以自己嘗試著制作幾幅圖進行比較58CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列5.4 結(jié)果的展示點擊“M
39、ake Map”得到一個 Google Earth 可以打來的 KMZ 文件。執(zhí)行完后,對話框會提示你 KMZ 文件的保存位置。59CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列打開結(jié)果5.5 結(jié)果的編輯在 Google Earth 中可以對節(jié)點和連線進行修改(顏色、以及線寬)60CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列結(jié)果展示:修改后的結(jié)果在 Google Earth 中點擊節(jié)點可以獲取相對應(yīng)的地址處的文獻鏈接,點擊可進入該文獻頁面(在圖書館可以直接下載)61CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列5.6 使用其他程式可視化 KML 文件使用其他應(yīng)用程式可視化 KML 結(jié)果 /maps /62CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜
40、系列 / /fusiontables63CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列 64CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 6 講 Derwent 專利數(shù)據(jù)分析6.1 Web of Science 數(shù)據(jù)的收集該數(shù)據(jù)需要付費,在收集數(shù)據(jù)之前保證單位已經(jīng)購買,進入數(shù)據(jù)庫后確保是在 Web of Science 下下載數(shù)據(jù)。為了保證數(shù)據(jù)采集的精確性,可以采用自己數(shù)量的檢索策略。下面以采集 safety science 期刊上的數(shù)據(jù)為例進行說明65CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列在界面上選擇數(shù)據(jù)保存功能66CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列每次只能保存 500 條數(shù)據(jù),因此當(dāng)記錄數(shù)量大于 500 條時需要多次下載
41、。You can type newname for the saved file500 records saved in the file,which you want.6.1 Derwent Innovations Index 數(shù)據(jù)庫采集第一步:登錄 Derwent Innovations Index 數(shù)據(jù)庫 可以通過登錄 Web of science 后,選擇專利數(shù)據(jù)庫 Derwent Innovations Index67CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列1第二部:檢索結(jié)果與數(shù)據(jù)采集 2368CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2134此處僅僅下載前500條記錄作為案例數(shù)據(jù)。第三步:數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換
42、12轉(zhuǎn)換前轉(zhuǎn)換后69CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第四步:數(shù)據(jù)分析 分析步驟與分析 Web of Science 的文獻數(shù)據(jù)一致,一些基礎(chǔ)步驟請參考:如何使用CiteSpace 的一組示范及常見問題解答/cchen/citespace/doc/tutorial/how_to/2.co-citation-analysis.pdf結(jié)果:共詞(Keywords)網(wǎng)絡(luò)主題(terms)網(wǎng)絡(luò)70CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列作者(authors)-機構(gòu)(institutions)網(wǎng)絡(luò)71CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 7 講 網(wǎng)絡(luò)的 Overlay 分析7.1 對數(shù)據(jù)整體網(wǎng)絡(luò)的初步分析此處的數(shù)據(jù)
43、采用軟件自帶的“terrorism”案例數(shù)據(jù)。文獻 Overlay 分析的關(guān)鍵點是在時間維度上的圖層疊加,首先選擇的時間切片為 1996-2003,得到的絡(luò)如右圖。得到了 N=309,E=1107 的網(wǎng)絡(luò)。研究的文獻共被引網(wǎng)7.2 構(gòu)建新圖層network216.layer213圖層1: 1996-2000年的文獻472CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列network123.layer2134圖層2: 2001-2003年的文獻7.3 Overlay 分析步驟選擇時間切片 1996-2003 重新制作并調(diào)整顏色使其顏色變淺。研究的整個數(shù)據(jù)時間段內(nèi)的文獻共被引網(wǎng)絡(luò),2173CSSS 科學(xué)計量與知識
44、圖譜系列36457.4 Overlay 分析結(jié)果74CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列7.5 時間維度的網(wǎng)絡(luò)分析75CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 8 講結(jié)合 Carrot2+Jigsaw 進行分析8.1 數(shù)據(jù)及軟件準備按照以下鏈接準備數(shù)據(jù)(Safety Science 1991-2013 年文獻數(shù)據(jù))/cchen/citespace/doc/tutorial/how_to/1.download_from_WOS.pdf數(shù)據(jù)下載好后,保存到新建的文件夾“Safety Science ”的 input 中.CiteSpace 軟件下載:/cchen/citespace/download.htm
45、lCarrot2 軟件下載: /download.htmlJigsaw 軟件下載(需要提交基本的注冊信息)/gvu/ii/jigsaw/8.2 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換打開 CiteSpace,以此在菜單中打開“Data”,“Import/Export”,“WOS”??梢钥吹皆?CiteSpace 對 WoS 數(shù)據(jù)處理的四種功能,Remove duplicates(數(shù)據(jù)除重)、WoS(Tab)格式向 WoS 格式轉(zhuǎn)換、WoS 格式轉(zhuǎn)換為 Jigsaw 格式以及 WoS 格式轉(zhuǎn)換為Carrot2 可分析的格式。76CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列8.3 WoS to Carrot22135477CSSS 科學(xué)計
46、量與知識圖譜系列12354678CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列7雙擊879CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列8.4 WoS to Jigsaw數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換方式同 Carrot 步驟。使用 Jigsaw 分析數(shù)據(jù)80CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2134581CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列6782CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列83CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 9 講 期刊的雙圖疊加分析9.1 軟件及數(shù)據(jù)準備Dual-map 于 2014 年 10 月 27 日嵌入到最新版的 CiteSpace3.8.R7 (64-bit)中,用戶只需要下載最新版的 CiteSpace 即可。下載地址 /
47、cchen/citespace/current/3.8.R7.64- bit.public.10.26.2014.zip關(guān)于 Dual-map 的基本原理和方法用戶可以參見Chen, C., Leydesdorff, L. (2014) Patterns of connections and movements in dual-map overlays: Anew method of publication portfolio analysis. Journal of the American Society for Information Science and Technology, 65
48、(2), 334-351.電子版下載地址 /profile/Chaomei_Chen最 新 版 的 軟 件 手 冊 8.4.1 /cchen/citespace/CiteSpaceManual.pdf9.2 功能界面本文以筆者收集的“Big Data”的數(shù)據(jù)進行舉例。Top=“big data”,Web of Science 數(shù)據(jù)更新時間 2014-05-07. 共得到 1318 條記錄。12數(shù)據(jù)分析打開軟件后所得到的基礎(chǔ)圖層(Blondel)84CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列數(shù)據(jù)分析 打開軟件后所得到的基礎(chǔ)圖層(VOS)9.3 分析步驟34585CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列69.4 初
49、步結(jié)果展示結(jié)果的調(diào)整86CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列局部放大87CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列陳教授使用最新版對可視化結(jié)果的優(yōu)化結(jié)果如下:88CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列第 10 講 文獻導(dǎo)出和引用CiteSpace 導(dǎo)出文獻信息+鏈接 Google Scholar 獲取文獻信息.此功能可以對照英文本手冊 7.9 How to Export Cited References to RIS or EndNote10.1 說明版本要求:在 CiteSpace 3.9R7(4 月 26 日發(fā)布)的版本中增加的文獻的導(dǎo)出功能。生成的文獻共被引數(shù)據(jù)可以導(dǎo)入到參考文獻管理軟件中,方便在后期寫作中
50、調(diào)用。CiteSpace 3.9.R7 is updated for exporting cited references in a visualized network toRIS/EndNote.See CiteSpace manual Section 7.9 for examples of use.最新版本下載地址:/cchen/citespace/current/3.9.R7.64-bit.public.4.26.2015.zip10.2 步驟演示1. 運行案例數(shù)據(jù)得到結(jié)果2.從 CiteSpace 導(dǎo)出網(wǎng)絡(luò)文件89步驟:1. 點擊菜單欄的“EXPORT”2. Save Cited R
51、eference to an RIS File等待Save To RIS一段時間后得到右側(cè)列表這里提供了三種格式的導(dǎo)出,可以根據(jù)需要選取CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列 Save To RIS 這里提供了三種格式的導(dǎo)出,可以根據(jù)需要選取 等待一段時間后得到右側(cè)列表 保保持持默默認認YYEESS,點點擊擊OOKK 輸入你自己用于標記該輸出的名稱,點擊OK 3.打開 RIS 格式文獻的位置注意:該文件的默認保存的路徑是在你建立項目的 project 文件夾下。如果你的電腦了 Endnote,那么雙擊打開就自動導(dǎo)入了。補充. 實際上用戶在進行數(shù)據(jù)收集的時候可以順便從相關(guān)數(shù)據(jù)庫中直接導(dǎo)出 Endnot
52、e 可以識別的數(shù)據(jù)格式,這樣就更加方便了。示例如下90CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列以下為單個文獻信息的獲取4. 導(dǎo)出單個文獻的格式 Open DOI可以直接獲取全文地址 91下載所需要的格式, 下頁以EnoNote為例得到該文獻的結(jié)果。點擊Cite得到導(dǎo)出文獻界面鼠標選中某節(jié)點,并單擊鼠標右鍵。在點擊Google Scholar即可得到了該文獻的鏈接, 單擊即可(結(jié)果見下 頁)CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列92更多關(guān)于如何使用EndNote進行文獻管理的信息參見李杰等. 安全科學(xué)技術(shù)信息檢索基礎(chǔ)M.首都經(jīng)濟貿(mào)易大學(xué).2014年9月.CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列參考文獻Chen C.
53、CiteSpace II: Detecting and visualizing emerging trends and transient patterns in scientific literatureJ. Journal of the American Society for information Science and Technology, 2006, 57(3): 359-377. /viewdoc/download?doi=20.6435&rep=rep1&type= pdfChen, Chaomei (2014) The CiteSpace Manual. /cchen/ci
54、tespace/CiteSpaceManual.pdfChen C, Dubin R, Kim M C. Orphan drugs and rare diseases: a scientometric review (2000-2014)J. Expert Opinion on Orphan Drugs, 2014, 2(7): 709-724. /doi/abs/10.1517/21678707.2014.920251Chen C, Chen C. Mapping scientific frontiersM. London, UK: Springer-Verlag, 2014. Chen C
55、, Hu Z, Liu S, et al. Emerging trends in regenerative medicine: a scientometric analysis in CiteSpaceJ. Expert opinion on biological therapy, 2012, 12(5): 593-608. 陳超美教授博客/u/ChaomeiChen如何使用 CiteSpace 的一組示范及常見問題解答 /blog- 554179-843529.html.5.6.7.李杰等編著. 安全科學(xué)技術(shù)信息檢索基礎(chǔ)M.首都經(jīng)濟貿(mào)易大學(xué)014.李杰著. 安全
56、科學(xué)知識圖譜導(dǎo)論M.化學(xué)工業(yè). 2015李杰,陳超美. CiteSpace 科技文本挖掘及可視化M. 首都經(jīng)濟貿(mào)易大學(xué)2017.93CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列附錄 1 常用資源科學(xué)計量工具鏈接1.1CiteSpace/cchen/citespace/1.2VOSviewer/1.3SCI2/user/index.php1.4SciMAThttp:/sci2s.ugr.es/scimat/1.5Loet Tools/software.htm1.6BibExcelhttp:/homepage.univie.ac.at/juan.gorraiz/bibexcel/1.7HistCite/for
57、ms/HistCite/1.8CitNetExplorehttp:/www.citnetexplorer.nl/1.9Publish or Perish/pop.htm1.10 Mapequation/1.11 Gephihttp:/gephi.github.io/1.12 Pajekhttp:/mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/1.13 Netdraw/site/netdrawsoftware/home1.14 Cytoscape94CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列/1.15 Ucinet/site/ucinetsoftware/downloads1.16 BICOMB/b
58、c/1.17 SATI/#sati1.18 Carrot2/1.19 Jigsaw/gvu/ii/jigsaw/1.20 GPS Visualizer/免費期刊查詢系統(tǒng)2.1 學(xué)術(shù)期刊評價/2.2 CWTS 期刊系統(tǒng)/indicators2.3 SJR 期刊系統(tǒng)/index.php95CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列2.4 期刊信息工具/journal-information-tool.htm2.5 中國核心期刊名稱規(guī)范/journalLib/2.6 Journal Metrics/index.php科學(xué)計量學(xué)類期刊3.1Scientometrics/journal/111923.2Journ
59、al of Informetrics96CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列/journal-of-informetrics/3.3Journal of Scientometric Research/contributors.asp3.4COLLNETJournalofScientometricsandInformationManagement97CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列/journals/cjsim/cjsim.htm情報學(xué)報3.5/ch/index.aspx98CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列普賴斯獎獲得者/price.html4.1 1984Eugene Garfield (USA)
60、4.2 1985Michael J. Moravcsik (USA)4.3 1986Tibor Braun (Hungary)4.4 1987Vasily V. Nalimov (Soviet Union)Henry Small (USA)4.5 1988Francis Narin (USA)4.6 1989Bertram C. Brookes (UK)Jan Vlachy (Czechoslovakia)4.7 199399CSSS 科學(xué)計量與知識圖譜系列Andrs Schubert (Hungary)4.8 1995Anthony F. J. Van Raan (The Netherlands)Robert K. Merton (USA)4
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